Βιοπληροφορική και Βιοπληροφορική και ΠολυµέσαΠολυµέσαΕιρήνη ΑυδίκουΕιρήνη ΑυδίκουΑθήνα 1.2.2009Αθήνα 1.2.2009

Ειρήνη ΑυδίκουΕιρήνη Αυδίκου Βιοπληροφορική και ΠολυµέσαΒιοπληροφορική και Πολυµέσα 22

ΠΕΡΙΕΧΟΜΕΝΑΠΕΡΙΕΧΟΜΕΝΑ

1.1. Πως σχετίζεται µε τα ΠολυµέσαΠως σχετίζεται µε τα Πολυµέσα2.2. Τι είναι η ΒιοπληροφορικήΤι είναι η Βιοπληροφορική3.3. ΧρήσειςΧρήσεις4.4. Συµπεράσµατα Συµπεράσµατα 5.5. ΒιβλιογραφίαΒιβλιογραφία

Ειρήνη ΑυδίκουΕιρήνη Αυδίκου Βιοπληροφορική και ΠολυµέσαΒιοπληροφορική και Πολυµέσα 33

1. 1. Τι είναι η ΒιοπληροφορικήΤι είναι η Βιοπληροφορική

Ο τοµέας της επιστήµης που παρέχει τα εργαλεία και τις Ο τοµέας της επιστήµης που παρέχει τα εργαλεία και τις µεθόδους που υποστηρίζουν την ανάγκη για την µεθόδους που υποστηρίζουν την ανάγκη για την εκµετάλλευση της υπολογιστικής ισχύος και την εκµετάλλευση της υπολογιστικής ισχύος και την εξαγωγή γνώσης από βιολογικά δεδοµέναεξαγωγή γνώσης από βιολογικά δεδοµένα

Αποτελεί σύµπραξη των κλάδων της Πληροφορικής και Αποτελεί σύµπραξη των κλάδων της Πληροφορικής και της Βιολογίας και µε χρήση των Μαθηµατικών και της της Βιολογίας και µε χρήση των Μαθηµατικών και της Στατιστικής εξερευνά νέους τρόπους για την προσέγγιση Στατιστικής εξερευνά νέους τρόπους για την προσέγγιση των βιολογικών προβληµάτων καθώς και την αντίληψη των βιολογικών προβληµάτων καθώς και την αντίληψη βασικών αρχών της Βιολογίαςβασικών αρχών της Βιολογίας

Ειρήνη ΑυδίκουΕιρήνη Αυδίκου Βιοπληροφορική και ΠολυµέσαΒιοπληροφορική και Πολυµέσα 44

∆ηµιουργία της Βιοπληροφορικής∆ηµιουργία της ΒιοπληροφορικήςΜοριακή Βιολογία Τεχνολογία Γονιδιωµάτων

Βιολογικές Πληροφορίες

∆ιαχείριση Έλεγχος Ανάλυση

Εξαγωγή Συµπερασµάτων

Ανάπτυξη Λογισµικού

Ειρήνη ΑυδίκουΕιρήνη Αυδίκου Βιοπληροφορική και ΠολυµέσαΒιοπληροφορική και Πολυµέσα 55

Αντικείµενο της Βιοπληροφορικής (1/2)Αντικείµενο της Βιοπληροφορικής (1/2)αποκωδικοποίηση του γονιδιώµατος αποκωδικοποίηση του γονιδιώµατος ((βακτηρίων βακτηρίων & & ανθρώπου)ανθρώπου)

ανάπτυξη βάσεων δεδοµένων (ανάπτυξη βάσεων δεδοµένων (GenBankGenBank, , EMBLEMBL) )

ανάγκη δηµιουργίας εξειδικευµένων φαρµάκων για την ανάγκη δηµιουργίας εξειδικευµένων φαρµάκων για την αντιµετώπιση διαφόρων ασθενειών αντιµετώπιση διαφόρων ασθενειών

διαθεσιµότητα µεγάλων ποσοτήτων δεδοµένων και ανάγκη διαθεσιµότητα µεγάλων ποσοτήτων δεδοµένων και ανάγκη µετατροπής τους σε χρήσιµες πληροφορίες µετατροπής τους σε χρήσιµες πληροφορίες

ανεύρεση λειτουργίας πρωτεϊνών και κατανόηση της ανεύρεση λειτουργίας πρωτεϊνών και κατανόηση της πολυπλοκότητας των βιολογικών συστηµάτωνπολυπλοκότητας των βιολογικών συστηµάτων

αντιµετώπιση διαφόρων ασθενειών µε την ανάπτυξη νέων αντιµετώπιση διαφόρων ασθενειών µε την ανάπτυξη νέων διαγνωστικών µέτρων και θεραπευτικών µεθόδωνδιαγνωστικών µέτρων και θεραπευτικών µεθόδων

Ειρήνη ΑυδίκουΕιρήνη Αυδίκου Βιοπληροφορική και ΠολυµέσαΒιοπληροφορική και Πολυµέσα 66

Αντικείµενο της Βιοπληροφορικής (2/2) Αντικείµενο της Βιοπληροφορικής (2/2) ακαδηµαϊκή έρευνα ακαδηµαϊκή έρευνα βασική έρευνα στην Ιατρική και τη Βιολογίαβασική έρευνα στην Ιατρική και τη Βιολογίαανάπτυξη υπολογιστικών δικτύων µε σκοπό την αποδοτική ανάπτυξη υπολογιστικών δικτύων µε σκοπό την αποδοτική συνεργασία των ερευνητών συνεργασία των ερευνητών δηµιουργία λογισµικών που θα απεικονίζουν τη λειτουργία δηµιουργία λογισµικών που θα απεικονίζουν τη λειτουργία των πρωτεϊνών και την αποκαλούµενη «έκφραση των των πρωτεϊνών και την αποκαλούµενη «έκφραση των γονιδίων» (ασθένειες) γονιδίων» (ασθένειες) δηµιουργία νέων ειδικοτήτων, όπως αυτή του βιολόγουδηµιουργία νέων ειδικοτήτων, όπως αυτή του βιολόγου--λογισµικού, του γιατρούλογισµικού, του γιατρού--προγραµµατιστή, του δικτυακούπρογραµµατιστή, του δικτυακού--οικονοµολόγου οικονοµολόγου κατασκευή υπολογιστών στους οποίους θα έχει κατασκευή υπολογιστών στους οποίους θα έχει αντικατασταθεί η µνήµη µε ζωντανά νευρικά κύτταρααντικατασταθεί η µνήµη µε ζωντανά νευρικά κύτταρα

Ειρήνη ΑυδίκουΕιρήνη Αυδίκου Βιοπληροφορική και ΠολυµέσαΒιοπληροφορική και Πολυµέσα 77

2. Πως σχετίζεται µε τα Πολυµέσα2. Πως σχετίζεται µε τα ΠολυµέσαΣτο πεδίο της απεικόνισηςΣτο πεδίο της απεικόνισηςΤρισδιάστατη δοµή των πρωτεϊνώνΤρισδιάστατη δοµή των πρωτεϊνώνΨηφιακή επεξεργασία ιατρικής εικόνας Ψηφιακή επεξεργασία ιατρικής εικόνας Ψηφιακή επεξεργασία βιοσηµάτων Ψηφιακή επεξεργασία βιοσηµάτων Εικονική πραγµατικότητα στην ιατρική & την υγείαΕικονική πραγµατικότητα στην ιατρική & την υγείααπεικονιστική µικροσκοπίααπεικονιστική µικροσκοπίασυνεστιακή µικροσκοπίασυνεστιακή µικροσκοπίασχηµατισµός και λήψη εικόναςσχηµατισµός και λήψη εικόναςανάλυση εικόναςανάλυση εικόναςόραση υπολογιστών για τη διάγνωση καρκίνουόραση υπολογιστών για τη διάγνωση καρκίνου

Ειρήνη ΑυδίκουΕιρήνη Αυδίκου Βιοπληροφορική και ΠολυµέσαΒιοπληροφορική και Πολυµέσα 88

Προσοµοίωση χειρουργικής επέµβασηςΠροσοµοίωση χειρουργικής επέµβασης

Ειρήνη ΑυδίκουΕιρήνη Αυδίκου Βιοπληροφορική και ΠολυµέσαΒιοπληροφορική και Πολυµέσα 99

Αναπαράσταση όγκωνΑναπαράσταση όγκων

Ειρήνη ΑυδίκουΕιρήνη Αυδίκου Βιοπληροφορική και ΠολυµέσαΒιοπληροφορική και Πολυµέσα 1010

Προσοµοίωση του εγκεφάλουΠροσοµοίωση του εγκεφάλου

Ειρήνη ΑυδίκουΕιρήνη Αυδίκου Βιοπληροφορική και ΠολυµέσαΒιοπληροφορική και Πολυµέσα 1111

Παράδειγµα εφαρµογήςΠαράδειγµα εφαρµογής

Ειρήνη ΑυδίκουΕιρήνη Αυδίκου Βιοπληροφορική και ΠολυµέσαΒιοπληροφορική και Πολυµέσα 1212

Αναπαράσταση Αναπαράσταση HIVHIV

Ειρήνη ΑυδίκουΕιρήνη Αυδίκου Βιοπληροφορική και ΠολυµέσαΒιοπληροφορική και Πολυµέσα 1313

Αναπαράσταση Αναπαράσταση HIVHIV

Ειρήνη ΑυδίκουΕιρήνη Αυδίκου Βιοπληροφορική και ΠολυµέσαΒιοπληροφορική και Πολυµέσα 1414

Αναπαράσταση Αναπαράσταση HIVHIV

Ειρήνη ΑυδίκουΕιρήνη Αυδίκου Βιοπληροφορική και ΠολυµέσαΒιοπληροφορική και Πολυµέσα 1515

3. Χρήσεις3. ΧρήσειςΆτοµα µε ειδικές ανάγκεςΆτοµα µε ειδικές ανάγκεςΤηλεπικοινωνίες (ασφάλεια κεραιώνΤηλεπικοινωνίες (ασφάλεια κεραιών--συσκευών)συσκευών)κλινική µηχανική κλινική µηχανική ιατρική απεικόνιση ιατρική απεικόνιση βιοαισθητήρες βιοαισθητήρες τηλεµατική τηλεµατική ιατρική πληροφορική ιατρική πληροφορική νευρωνικά δίκτυα νευρωνικά δίκτυα αλληλεπιδράσεις ακτινοβολίας αλληλεπιδράσεις ακτινοβολίας -- ιστών ιστών τεχνολογία υπερήχων τεχνολογία υπερήχων εικονική πραγµατικότητα εικονική πραγµατικότητα τεχνολογία αποκατάστασης τεχνολογία αποκατάστασης -- ροµποτικής και αυτοµατισµώνροµποτικής και αυτοµατισµών

Ειρήνη ΑυδίκουΕιρήνη Αυδίκου Βιοπληροφορική και ΠολυµέσαΒιοπληροφορική και Πολυµέσα 1616

4. Συµπεράσµατα4. ΣυµπεράσµαταΠλέον αναπτυσσόµενος κλάδοςΠλέον αναπτυσσόµενος κλάδοςΑπαιτεί τεράστια υποδοµήΑπαιτεί τεράστια υποδοµήΑπαιτεί εξειδικευµένο προσωπικό Απαιτεί εξειδικευµένο προσωπικό Η αποκρυπτογράφηση του Η αποκρυπτογράφηση του DNADNA ήταν µόνο η ήταν µόνο η αρχήαρχήΑνάπτυξη ειδικών βάσεων δεδοµένωνΑνάπτυξη ειδικών βάσεων δεδοµένωνΣχεδιασµός αλγορίθµων ώστε να Σχεδιασµός αλγορίθµων ώστε να προβλέπονται οι ασθένειες προβλέπονται οι ασθένειες

Ειρήνη ΑυδίκουΕιρήνη Αυδίκου Βιοπληροφορική και ΠολυµέσαΒιοπληροφορική και Πολυµέσα 1717

5. Βιβλιογραφία5. Βιβλιογραφίαhttp://artedi.ebc.uu.sehttp://artedi.ebc.uu.sehttp://mmlab.ceid.upatras.gr/Bioinformaticshttp://mmlab.ceid.upatras.gr/Bioinformaticshttp://www.bioacademy.gr/bioinformatics/http://www.bioacademy.gr/bioinformatics/http://www.bat.uoi.gr/http://www.bat.uoi.gr/http://www.biohttp://www.bio--optics.ece.ntua.groptics.ece.ntua.grhttp://www.rcsb.org/http://www.rcsb.org/http://www.bioacademy.gr/bioinformatics/festival/ebdomada_DEhttp://www.bioacademy.gr/bioinformatics/festival/ebdomada_DE

TH.htmTH.htmhttp://www.bioacademy.gr/bioinformatics/meetingOct07.htmhttp://www.bioacademy.gr/bioinformatics/meetingOct07.htmhttp://bioinformatics.biol.uoa.gr/msc/gr/generalhtmlhttp://bioinformatics.biol.uoa.gr/msc/gr/generalhtmlΚοσσίδα Σοφία, Βιοπληροφορική ∆υνατότητες και προοπτικές, Κοσσίδα Σοφία, Βιοπληροφορική ∆υνατότητες και προοπτικές, Ι.Ι.Β.Ε.Α.Α.Ι.Ι.Β.Ε.Α.Α.

Ειρήνη ΑυδίκουΕιρήνη Αυδίκου Βιοπληροφορική και ΠολυµέσαΒιοπληροφορική και Πολυµέσα 1818

Ευχαριστώ πολύΕυχαριστώ πολύ