Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ...
Transcript of Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ...
Διαγονιδιακά ζώα
2 pl σε ένα από
τους δύο
προπυρήνες
10-30%
επιβίωση
Ορισμοί:
ΔΙΑΓΟΝΙΔΙΑΚΑ
ΔΙΑΓΟΝΙΔΙΟ
ΤΥΧΑΙΑ ΕΝΘΕΣΗ
Ορμονική
διέγερση
Διαμόλυνση με μικροέγχυση
40% των
απογόνων έχει
το διαγονίδιο
ΤΕΧΝΙΚΕΣ ΔΙΑΜΟΛΥΝΣΗΣ (Ηλεκτροδιάτρηση και λιποσώματα)
Τα κύτταρα δεν παραλαμβάνουν ελεύθερο DNA, εξαιρούνται κάποια βακτήρια
ΤΕΧΝΙΚΕΣ ΔΙΑΜΟΛΥΝΣΗΣ (ιικοί φορείς)
Ρετροϊοί μολύνουν μόνο
κύτταρα που διαιρούνται
Λεντιιοί, αδενοϊοί και αδενο-
σχετιζόμενοι ιοί μολύνουν και
κύτταρα που δεν διαιρούνται
Απαιτούνται αλληλουχίες LTR
για ενσωμάτωση και
αλληλουχία Ψ για συσκευασία
ΙΣΤΟΕΙΔΙΚΗ ΕΚΦΡΑΣΗ ΔΙΑΓΟΝΙΔΙΩΝ
Εκμετάλλευση των Υποκινητών-
Ενισχυτών
Παράδειγμα:
ΙΣΤΟΕΙΔΙΚΗ ΕΚΦΡΑΣΗ
ΤΟΞΙΝΩΝ ΓΙΑ
ΕΞΟΥΔΕΤΕΡΩΣΗ
ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΕΝΩΝ ΚΥΤΤΑΡΩΝ
Χρήση: ΤΟΞΙΝΗ
ΔΙΦΘΕΡΙΤΙΔΑΣ (Α-ΑΛΥΣΙΔΑ)
Κινάση της Θυμιδίνης (TK1)
ΤΥΧΑΙΑ ΕΝΘΕΣΗ: ΑΠΕΝΕΡΓΟΠΟΙΗΣΗ ΕΝΔΟΓΕΝΩΝ ΓΟΝΙΔΙΩΝ (loss of function
mutation), ΜΕΤΑΒΛΗΤΑ ΕΠΙΠΕΔΑ ΕΚΦΡΑΣΗΣ, ΑΛΛΑΓΗ ΙΣΤΟΕΙΔΙΚΟΤΗΤΑΣ
Mouse in Red: Red Fluorescent Protein Expression in
Mouse ES Cells, Embryos, and Adult Animals
Kristina Vintersten,1 Claudio Monetti,1 Marina Gertsenstein,1
Puzheng Zhang,1 Lajos Laszlo,2
Steffen Biechele,1 and Andras Nagy1,3*
genesis 40:241–246 (2004)
Μπορεί να επιτευχθεί στοχευμένη ένθεση
ΧΡΗΣΗ ΤΩΝ ΕΜΒΡΥΪΚΩΝ ΒΛΑΣΤΙΚΩΝ
ΚΥΤΤΑΡΩΝ
(ΑΠΌ ΕΣΩΤΕΡΙΚΟ ΒΛΑΣΤΟΚΥΣΤΗΣ)
ΔΕΝ ΠΡΕΠΕΙ ΝΑ ΔΙΑΦΟΡΟΠΟΙΗΘΟΥΝ (LIF)
ΕΙΣΑΓΩΓΗ DNA
ΗΛΕΚΤΡΟΔΙΑΤΡΗΣΗ,
ΡΕΤΡΟΪΟΙ,
ΔΙΑΜΟΛΥΝΣΗ
ΕΠΙΛΟΓΗ (G418)
ΟΜΟΛΟΓΟΣ ΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΟΣ: Στόχευση αλλά μικρό ποσοστό επιτυχίας
Αρχικό ποντίκι: ιδρύτης
Απόγονοι: διαγονιδιακή σειρά
ES (embryonic stem) εμβρυικά
βλαστικά κύτταρα τα οποία είναι
ολοδύναμα
KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ ΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ
ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΜΕ ΧΡΗΣΗ
ΜΕΓΑΛΩΝ ΑΚΡΩΝ ΠΟΥ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΥΝ ΤΗΝ ΠΕΡΙΟΧΗ ΠΟΥ
ΜΑΣ ΕΝΔΙΑΦΕΡΕΙ
Συνήθως τα άκρα προκύπτουν από BAC κλώνους
BAC RECOMBINEERING τότε ως και 20%
ΔΥΟ ΜΑΡΤΥΡΕΣ ΕΠΙΛΟΓΗΣ (NEO
ΚΑΙ TK)
ΥΠΟΜΟΡΦΙΚΑ ΑΛΛΗΛΟΜΟΡΦΑ
ΟΜΟΛΟΓΟΣ ΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΟΣ ΕΧΕΙ ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ 1:1000
http://transgenicmice.ku.dk/pictures/Slide2-505.jpg/
ΜΟΝΤΕΛΑ ΑΣΘΕΝΕΙΩΝ
ΠΑΡΑΓΩΓΗ ΠΡΩΤΕΪΝΩΝ
Βακτήρια και ζύμες αλλά δεν
τροποποιούν όπως οι ανώτεροι
οργανισμοί
NCBI » Bookshelf » An Introduction to Genetic
Analysis » Applications of Recombinant DNA
Technology » Recombinant DNA technology in
eukaryotes
ΧΡΗΣΕΙΣ ΤΩΝ ΔΙΑΓΟΝΙΔΙΑΚΩΝ ΖΩΩΝ
A central role of KLKs in Netherton Syndrome
NS: Mutations in Spink5 resulting in truncated protein LEKTI => lower number of protein inhibition domains than
the wild-type
Komatsu et al., J Invest Dermatol 118: 436-443, 2002
K R
K R
R
R
K R
SPINK5 (LEKTI)
K R
K R
K R
K
K K
CPs
Death < 24 h
Newborn After few hours
Time (t)
wt Spink5-/-
Hewett DR et al. Hum Mol Genet 14: 335-346, 2005
Yamasaki K et al. Nature Med 13: 975-980, 2007
Descargues P et al. Nature Genet 37: 56-65, 2005
Yang T et al. Genes Dev 18: 2354-2358, 2004
Sales KU et al. Nature Genet 42: 676-683, 2010
FLPase-mouse
3’ arm (4403 bp)
loxP loxP loxP
5’ arm (4288 bp)
FRT FRT En2
SA IRES lacZ pA hBactP neo pA
Klk5
Cre-mouse
Δημιουργία του Klk5-/- ποντικού
wt Klk5-/-
wt Klk5-/- Spink5-/- Spink5-/-/Klk5-/-
Spink5-/- wt Spink5-/-/Klk5-/- wt Klk5-/-
Διάσωση του φαινοτύπου του Netherton
TALEN (transcription activator-like effector
nucleases) Τεχνητές νουκλεάσες που στηρίζονται στις πρωτεΐνες
TAL effectors (Xanthomonas spp)
2011 METHOD OF THE YEAR
https://tale-nt.cac.cornell.edu/tutorials/talentargeterupdated
70% 7%
TAL TALEN
HD
NN
NI
NG
C
G
A
T
Αμινοξύ Βάση DNA
TALEN (transcription activator-like effector
nucleases)
Nucleic Acids Res. 2011 Jul;39(12):e82. doi:
10.1093/nar/gkr218. Epub 2011 Apr 14.
Efficient design and assembly of custom
TALEN and other TAL effector-based
constructs for DNA targeting.
Cermak T1, Doyle EL, Christian M, Wang
L, Zhang Y, Schmidt C, Baller JA, Somia
NV, Bogdanove AJ, Voytas DF.
CONDITIONAL KNOCKOUT (Ιστοειδική απενεργοποίηση)
Κάποια γονίδια είναι εμβρυικά θανατηφόρα ή
θανατηφόρα αμέσως μετά τη γέννηση του ζώου
http://cre.jax.org/introduction.html
Απαιτείται η ιστοειδική απενεργοποίησή τους
loxP αλληλουχίες
ΧΡΩΜΟΣΩΜΙΚΕΣ ΑΝΑΔΙΑΤΑΞΕΙΣ
ΔΙΠΛΟΣ ΟΜΟΛΟΓΟΣ ΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΟΣ
Μοντέλο για χρωμοσωμικές αναδιατάξεις
ΕΠΑΓΩΜΕΝΑ KNOCKOUT
ΕΠΑΓΩΜΕΝΑ KNOCKOUT
Ευχαριστώ πολύ!!!!