Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ...

20
Διαγονιδιακά ζώα

Transcript of Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ...

Page 1: Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ ΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΜΕ

Διαγονιδιακά ζώα

Page 2: Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ ΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΜΕ

2 pl σε ένα από

τους δύο

προπυρήνες

10-30%

επιβίωση

Ορισμοί:

ΔΙΑΓΟΝΙΔΙΑΚΑ

ΔΙΑΓΟΝΙΔΙΟ

ΤΥΧΑΙΑ ΕΝΘΕΣΗ

Ορμονική

διέγερση

Διαμόλυνση με μικροέγχυση

40% των

απογόνων έχει

το διαγονίδιο

Page 3: Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ ΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΜΕ

ΤΕΧΝΙΚΕΣ ΔΙΑΜΟΛΥΝΣΗΣ (Ηλεκτροδιάτρηση και λιποσώματα)

Τα κύτταρα δεν παραλαμβάνουν ελεύθερο DNA, εξαιρούνται κάποια βακτήρια

Page 4: Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ ΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΜΕ

ΤΕΧΝΙΚΕΣ ΔΙΑΜΟΛΥΝΣΗΣ (ιικοί φορείς)

Ρετροϊοί μολύνουν μόνο

κύτταρα που διαιρούνται

Λεντιιοί, αδενοϊοί και αδενο-

σχετιζόμενοι ιοί μολύνουν και

κύτταρα που δεν διαιρούνται

Απαιτούνται αλληλουχίες LTR

για ενσωμάτωση και

αλληλουχία Ψ για συσκευασία

Page 5: Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ ΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΜΕ

ΙΣΤΟΕΙΔΙΚΗ ΕΚΦΡΑΣΗ ΔΙΑΓΟΝΙΔΙΩΝ

Εκμετάλλευση των Υποκινητών-

Ενισχυτών

Παράδειγμα:

ΙΣΤΟΕΙΔΙΚΗ ΕΚΦΡΑΣΗ

ΤΟΞΙΝΩΝ ΓΙΑ

ΕΞΟΥΔΕΤΕΡΩΣΗ

ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΕΝΩΝ ΚΥΤΤΑΡΩΝ

Χρήση: ΤΟΞΙΝΗ

ΔΙΦΘΕΡΙΤΙΔΑΣ (Α-ΑΛΥΣΙΔΑ)

Κινάση της Θυμιδίνης (TK1)

ΤΥΧΑΙΑ ΕΝΘΕΣΗ: ΑΠΕΝΕΡΓΟΠΟΙΗΣΗ ΕΝΔΟΓΕΝΩΝ ΓΟΝΙΔΙΩΝ (loss of function

mutation), ΜΕΤΑΒΛΗΤΑ ΕΠΙΠΕΔΑ ΕΚΦΡΑΣΗΣ, ΑΛΛΑΓΗ ΙΣΤΟΕΙΔΙΚΟΤΗΤΑΣ

Page 6: Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ ΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΜΕ

Mouse in Red: Red Fluorescent Protein Expression in

Mouse ES Cells, Embryos, and Adult Animals

Kristina Vintersten,1 Claudio Monetti,1 Marina Gertsenstein,1

Puzheng Zhang,1 Lajos Laszlo,2

Steffen Biechele,1 and Andras Nagy1,3*

genesis 40:241–246 (2004)

Page 7: Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ ΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΜΕ

Μπορεί να επιτευχθεί στοχευμένη ένθεση

ΧΡΗΣΗ ΤΩΝ ΕΜΒΡΥΪΚΩΝ ΒΛΑΣΤΙΚΩΝ

ΚΥΤΤΑΡΩΝ

(ΑΠΌ ΕΣΩΤΕΡΙΚΟ ΒΛΑΣΤΟΚΥΣΤΗΣ)

ΔΕΝ ΠΡΕΠΕΙ ΝΑ ΔΙΑΦΟΡΟΠΟΙΗΘΟΥΝ (LIF)

ΕΙΣΑΓΩΓΗ DNA

ΗΛΕΚΤΡΟΔΙΑΤΡΗΣΗ,

ΡΕΤΡΟΪΟΙ,

ΔΙΑΜΟΛΥΝΣΗ

ΕΠΙΛΟΓΗ (G418)

ΟΜΟΛΟΓΟΣ ΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΟΣ: Στόχευση αλλά μικρό ποσοστό επιτυχίας

Αρχικό ποντίκι: ιδρύτης

Απόγονοι: διαγονιδιακή σειρά

ES (embryonic stem) εμβρυικά

βλαστικά κύτταρα τα οποία είναι

ολοδύναμα

Page 8: Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ ΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΜΕ

KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ ΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ

ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΜΕ ΧΡΗΣΗ

ΜΕΓΑΛΩΝ ΑΚΡΩΝ ΠΟΥ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΥΝ ΤΗΝ ΠΕΡΙΟΧΗ ΠΟΥ

ΜΑΣ ΕΝΔΙΑΦΕΡΕΙ

Συνήθως τα άκρα προκύπτουν από BAC κλώνους

BAC RECOMBINEERING τότε ως και 20%

ΔΥΟ ΜΑΡΤΥΡΕΣ ΕΠΙΛΟΓΗΣ (NEO

ΚΑΙ TK)

ΥΠΟΜΟΡΦΙΚΑ ΑΛΛΗΛΟΜΟΡΦΑ

ΟΜΟΛΟΓΟΣ ΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΟΣ ΕΧΕΙ ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ 1:1000

Page 9: Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ ΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΜΕ

http://transgenicmice.ku.dk/pictures/Slide2-505.jpg/

Page 10: Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ ΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΜΕ

ΜΟΝΤΕΛΑ ΑΣΘΕΝΕΙΩΝ

ΠΑΡΑΓΩΓΗ ΠΡΩΤΕΪΝΩΝ

Βακτήρια και ζύμες αλλά δεν

τροποποιούν όπως οι ανώτεροι

οργανισμοί

NCBI » Bookshelf » An Introduction to Genetic

Analysis » Applications of Recombinant DNA

Technology » Recombinant DNA technology in

eukaryotes

ΧΡΗΣΕΙΣ ΤΩΝ ΔΙΑΓΟΝΙΔΙΑΚΩΝ ΖΩΩΝ

Page 11: Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ ΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΜΕ

A central role of KLKs in Netherton Syndrome

NS: Mutations in Spink5 resulting in truncated protein LEKTI => lower number of protein inhibition domains than

the wild-type

Komatsu et al., J Invest Dermatol 118: 436-443, 2002

K R

K R

R

R

K R

SPINK5 (LEKTI)

K R

K R

K R

K

K K

CPs

Death < 24 h

Newborn After few hours

Time (t)

wt Spink5-/-

Hewett DR et al. Hum Mol Genet 14: 335-346, 2005

Yamasaki K et al. Nature Med 13: 975-980, 2007

Descargues P et al. Nature Genet 37: 56-65, 2005

Yang T et al. Genes Dev 18: 2354-2358, 2004

Sales KU et al. Nature Genet 42: 676-683, 2010

Page 12: Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ ΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΜΕ

FLPase-mouse

3’ arm (4403 bp)

loxP loxP loxP

5’ arm (4288 bp)

FRT FRT En2

SA IRES lacZ pA hBactP neo pA

Klk5

Cre-mouse

Δημιουργία του Klk5-/- ποντικού

wt Klk5-/-

Page 13: Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ ΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΜΕ

wt Klk5-/- Spink5-/- Spink5-/-/Klk5-/-

Spink5-/- wt Spink5-/-/Klk5-/- wt Klk5-/-

Διάσωση του φαινοτύπου του Netherton

Page 14: Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ ΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΜΕ

TALEN (transcription activator-like effector

nucleases) Τεχνητές νουκλεάσες που στηρίζονται στις πρωτεΐνες

TAL effectors (Xanthomonas spp)

2011 METHOD OF THE YEAR

https://tale-nt.cac.cornell.edu/tutorials/talentargeterupdated

70% 7%

TAL TALEN

Page 15: Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ ΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΜΕ

HD

NN

NI

NG

C

G

A

T

Αμινοξύ Βάση DNA

TALEN (transcription activator-like effector

nucleases)

Nucleic Acids Res. 2011 Jul;39(12):e82. doi:

10.1093/nar/gkr218. Epub 2011 Apr 14.

Efficient design and assembly of custom

TALEN and other TAL effector-based

constructs for DNA targeting.

Cermak T1, Doyle EL, Christian M, Wang

L, Zhang Y, Schmidt C, Baller JA, Somia

NV, Bogdanove AJ, Voytas DF.

Page 16: Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ ΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΜΕ

CONDITIONAL KNOCKOUT (Ιστοειδική απενεργοποίηση)

Κάποια γονίδια είναι εμβρυικά θανατηφόρα ή

θανατηφόρα αμέσως μετά τη γέννηση του ζώου

http://cre.jax.org/introduction.html

Απαιτείται η ιστοειδική απενεργοποίησή τους

loxP αλληλουχίες

Page 17: Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ ΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΜΕ

ΧΡΩΜΟΣΩΜΙΚΕΣ ΑΝΑΔΙΑΤΑΞΕΙΣ

ΔΙΠΛΟΣ ΟΜΟΛΟΓΟΣ ΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΟΣ

Μοντέλο για χρωμοσωμικές αναδιατάξεις

Page 18: Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ ΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΜΕ

ΕΠΑΓΩΜΕΝΑ KNOCKOUT

Page 19: Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ ΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΜΕ

ΕΠΑΓΩΜΕΝΑ KNOCKOUT

Page 20: Διαγονιδιακά ζα - Aristotle University of Thessaloniki...KNOCKOUT ΠΟΝΤΙΚΙΑ ΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΙ Η ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑ ΜΕ

Ευχαριστώ πολύ!!!!