¿Cuál es la estabilidadrelevante de las proteínas?

R. Godoy-Ruiz, J.M. Sánchez-Ruiz,I.E. Sánchez

Laboratorio defisiología proteica

Sí, pero ¿a quiénle importa?

Dobson and Karplus 1999

Proteínas de 2 estados

E.T.

ΔGunfoldingΔGfolding

ΔGequilibrium

Proteínas de 2 estados

E.T.

ΔGunfoldingΔGfolding

ΔGequilibrium

Estabilidad termodinámica(Steipe 1994)

Proteínas de 2 estados

E.T.

ΔGunfoldingΔGfolding

ΔGequilibrium

Estabilidad termodinámica(Steipe 1994)

Estabilidad cinética(Godoy-Ruiz 2006)

Proteínas de 2 estados

E.T.

ΔGunfoldingΔGfolding

ΔGequilibrium

Estabilidad termodinámica(Steipe 1994)

Estabilidad cinética(Godoy-Ruiz 2006)

Folding(Shakhnovich 1996)

Cómo medir presiones evolutivas(Steipe 1994)

• Las proteínas homólogas compartensimilares requerimientos evolutivos

• Cada posición del alineamiento evoluciona deforma independiente

• Las distribuciones de residuos han alcanzadoel equilibrio

!

""GevoluciónLeu22Ala = #RTln

fracciónFamiliaXAla22

fracciónFamiliaXLeu22

$

% & &

'

( ) )

Proteínas de 2 estados

22 proteínas, 583 mutaciones

Estabilidad Folding Unfolding

Proteínas de 2 estados

22 proteínas, 583 mutaciones

Estabilidad Folding Unfolding

Proteínas de 2 estados

22 proteínas, 583 mutaciones

Estabilidad Folding Unfolding

Fisiológicas No fisiológicas

Unfolding 5 proteínas, 139 mutaciones

Efecto de las mutaciones en distintascondiciones de desplegamiento

Proteínas de 3 estados

ΔGNU

ΔGIU

ΔGNI

Estabilidad termodinámica(Steipe 1994)

Proteínas de 3 estados

ΔGNU

ΔGIU

ΔGNI

Estabilidad respecto al intermedio(Sancho 2002)

Estabilidad termodinámica(Steipe 1994)

Proteínas de 3 estados

N vs. U I vs. U N vs. I

4 proteínas, 61 mutaciones

Proteínas de 3 estados

N vs. U I vs. U N vs. I

4 proteínas, 61 mutaciones

Proteínas de 3 estados

N vs. U I vs. U N vs. I

4 proteínas, 61 mutaciones

Conclusiones

• Proteínas de 2 estados

• Proteínas de 3 estados

• ¡Queda mucho por explorar!

Estabilidad Folding Unfolding

N vs. U I vs. U N vs. I

Laboratorio defisiología proteica

www.proteinphysiologylab.tk

Universidad de Buenos Aires, FCEyN, Departamentode Química Biológica

Diego U. Ferreiro, Ignacio E. Sánchez

Objetivo: integrar información de secuencia, estructuray función para entender cómo las proteínasresponden de forma compleja a estímulos.

Folding