PERCOBAAN II kinetika tripsin - Biochemistry Research...

4
PERCOBAAN II KINETIKA REAKSI ENZIM PENDAHULUAN Enzim adalah protein yang mengkatalisis reaksi-reaksi biologi. Sebagai katalis, enzim mempengaruhi laju pada saat kesetimbangan dicapai, tetapi tidak mempengaruhi kesetimbangan total suatu reaksi. Enzim membantu terjadinya reaksi dengan menurunkan energi aktivasi pembentukan keadaan transisi substrat menjadi produk dibandingkan proses yang tidak dikatalisis. Laju awal (V o ) dari reaksi yang dikatalisis enzim meningkat dengan bertambahnya konsentrasi substrat hingga dicapai keadaan di mana penambahan substrat tidak lagi meningkatkan laju awal reaksi. Keadaan di mana laju awal maksimum (V max ) dicapai pada kondisi substrat jenuh, diilustrasikan dengan Gambar 1. Pengamatan ini, seperti yang terjadi pada reaksi enzimatis atau hidrolisis substrat tunggal, telah dijelaskan dengan postulat reaksi berikut, di mana E adalah enzim, S adalah substrat, dan P adalah produk: E+ S ES E+P Jadi, reaksi berlangsung melalui pembentukan kompleks enzim-substrat (ES). Bila semua enzim adalah dalam keadaan ES (sistem dijenuhkan oleh substrat), maka laju reaksi akan mencapai nilai maksimal (V max ). Gambar 2.1. Hubungan konsentrasi substrat dan laju awal dalam reaksi enzimatis Michaelis dan Menten, dan kemudian Briggs dan Haldane, menggunakan skema reaksi di atas untuk menurunkan persamaan matematik yang menggambarkan hubungan antara laju awal dan konsentrasi substrat. Persamaan Michaelis-Menten tersebut adalah [] [] S K S V M max 0 + = ν k 3 k 1 k 2 Konsentrasi substrat [S] ½ V max v 0 V max k 4 K M

Transcript of PERCOBAAN II kinetika tripsin - Biochemistry Research...

Page 1: PERCOBAAN II kinetika tripsin - Biochemistry Research ...biochem.chem.itb.ac.id/wp-content/uploads/2017/02/PERCOBAAN-II... · VS M max 0+ ν= k 3 k 1 k 2 Konsentrasi substrat [S]

PERCOBAANIIKINETIKAREAKSIENZIM

PENDAHULUAN Enzim adalah protein yang mengkatalisis reaksi-reaksi biologi. Sebagai katalis, enzimmempengaruhi laju pada saat kesetimbangan dicapai, tetapi tidak mempengaruhikesetimbangantotalsuatureaksi.Enzimmembantuterjadinyareaksidenganmenurunkanenergiaktivasipembentukankeadaantransisisubstratmenjadiprodukdibandingkanprosesyangtidakdikatalisis. Laju awal (Vo) dari reaksi yang dikatalisis enzim meningkat dengan bertambahnyakonsentrasi substrat hingga dicapai keadaan di mana penambahan substrat tidak lagimeningkatkan laju awal reaksi. Keadaandimana laju awalmaksimum (Vmax) dicapai padakondisisubstratjenuh,diilustrasikandenganGambar1.Pengamatanini,sepertiyangterjadipada reaksi enzimatis atau hidrolisis substrat tunggal, telah dijelaskan dengan postulatreaksiberikut,dimanaEadalahenzim,Sadalahsubstrat,danPadalahproduk:

E+S ES E+P

Jadi, reaksi berlangsung melalui pembentukan kompleks enzim-substrat (ES). BilasemuaenzimadalahdalamkeadaanES(sistemdijenuhkanolehsubstrat),makalajureaksiakanmencapainilaimaksimal(Vmax).

Gambar2.1.Hubungankonsentrasisubstratdanlajuawaldalamreaksienzimatis MichaelisdanMenten,dankemudianBriggsdanHaldane,menggunakanskemareaksidi atasuntukmenurunkanpersamaanmatematik yangmenggambarkanhubunganantaralajuawaldankonsentrasisubstrat.PersamaanMichaelis-Mententersebutadalah

[ ][ ]SKSV

M

max0 +=ν

k3 k1

k2

Konsentrasi substrat [S]

½ Vmax

v0

Vmax

k4

KM

Page 2: PERCOBAAN II kinetika tripsin - Biochemistry Research ...biochem.chem.itb.ac.id/wp-content/uploads/2017/02/PERCOBAAN-II... · VS M max 0+ ν= k 3 k 1 k 2 Konsentrasi substrat [S]

Dalampersamaan ini, Vmax danV0 adalah lajumaksimumdan laju awal reaksi, [S] adalahkonsentrasi substrat, danKM adalah konstantaMichaelis yangnilainya samadengan (k2 +k3)/k1.PERCOBAANAlat:Stopwatch Tabungreaksi PengadukkecilInkubatorair50oC Pipetukur1mL,5mL,10mL Pipetseukuran1mLSentrifugaklinik Tabungsentrifuga KertassaringKuvet Spektrofotometer Gelaskimia50mLBahan:- LarutanTCA20% -LarutanTripsin

- Larutankasein2%(b/v) -LarutanNaOH0,5M- Buferfosfat0,1M(pH8,0) -ReagenFolinCiocalteuPERHATIAN!!!Hati-hatibekerjadenganTCAkarenabersifatkorosif,hindarikontak langsungdengankulitdanmata. Bila terjadi kontak dengan kulit ataumata, cuci sesegeramungkin dengan airyangbanyak.Prosedur:

No. Tabung Kasein(mL) BuferFosfat(mL) Tripsin(µL)

I t=0t=15

0,10,1

2,92,9

250250

II t=0t=15

0,20,2

2,82,8

250250

III t=0t=15

0,40,4

2,62,6

250250

IV t=0t=15

0,50,5

2,52,5

250250

V t=0t=15

1,01,0

2,02,0

250250

Waktuinkubasit=15menit§ Inkubasi masing-masing tabung yang berisi kasein dan buffer fosfat beserta

pengaduknya selama 5 menit pada inkubator 35 oC. Sambil diaduk perlahan-lahan

Page 3: PERCOBAAN II kinetika tripsin - Biochemistry Research ...biochem.chem.itb.ac.id/wp-content/uploads/2017/02/PERCOBAAN-II... · VS M max 0+ ν= k 3 k 1 k 2 Konsentrasi substrat [S]

(jangansampaiberbusa),selanjutnyatambahkanlarutantripsin(sesuaidengantabeldiatas).

§ Inkubasi tepat 15 menit dalam inkubator 35 oC dihitung mulai tripsin ditambahkan,reaksi diberhentikan dengan penambahan 1,5 mL TCA 20% ke dalammasing-masingtabung disertai pengadukan yang kuat. Diamkan selama 30 menit dalam air es agarpengendapanberlangsungsempurna.

§ Selanjutnyasentrifugaselama10menitkemudiansaringmelaluikertassaring.§ FiltratdikerjakanmenurutcaraANSON(lihatdibawah).

Waktut=0menit§ Dalamtabungreaksiyangberisipengaduk,masukkanlarutanbuferdanlarutantripsin,

tambahkanmasing-masing1,5mLlarutanTCA20%inkubasi30menitdalampenangas35 oC. Terakhir tambahkan larutan kasein (semua pengukuran sesuai tabel). Diamkanselama30menitdalamaires,selanjutnyasentrifuga10menit,kemudiansaringmelaluikertassaring.FiltratdikerjakanmelaluicaraANSON(lihatdibawah).

MetodeANSON§ Campurkan 1 mL TCA-Filtrat (dari percobaan di atas) dengan 2 mL NaOH 0,5 M.

Tambahkan0,5mLreagenFolin-Ciocalteu,aduk.Diamkan10menit,kemudiantetapkanserapannyapada650nm.

TugasdanPertanyaan:1. Buatgrafikyangmenggambarkanhubunganantara1/vterhadap1/S.2. DarigrafiktentukannilaiVmaxdanKM.3. Apa yang harus diperbuat seandainya warna larutan yang hendak diukur dengan

spektrofotormeterituterlalugelap?TUGASPENDAHULUAN1. Faktorapasajayangmempengaruhilajureaksienzim?Jelaskan!2. Turunkan persamaan kinetika enzim Michaelis-Menten dengan pendekatan teori

keadaantunak(steadystate)yangdikemukakanolehBriggsdanHaldane?3. BuktikanbahwanilaiKMsamadengankonsentrasisubstratpadasaatVo=½VMAX4. Apapengertianistilah-istilahberikut:

a. Unitaktivitasb. Aktivitasspesifikc. Aktivitastotal

Page 4: PERCOBAAN II kinetika tripsin - Biochemistry Research ...biochem.chem.itb.ac.id/wp-content/uploads/2017/02/PERCOBAAN-II... · VS M max 0+ ν= k 3 k 1 k 2 Konsentrasi substrat [S]

PUSTAKA:Clark,J.M.andSwitzer,R.L.(1976).ExperimentalBiochemistry,2nded.,W.HFreemanandCompany,SanFransisco,USA