Laboratorio di Microbiologia Aspetti microbiologici nella sepsi: dalla raccolta dei campioni alla...
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Laboratorio di Microbiologia
Aspetti microbiologici nella sepsi:
dalla raccolta dei campioni alla corretta interpretazione dei risultati
7 Novembre 2005 dott.ssa Claudia Venturelli
Batteriemie e sindromi setticheBatteriemie e sindromi settiche
842 episodi di batteriemia
Gram positivi (n=473=55%) sepsi sepsi severaS.aureus 19,3% 19,8% S.coagulasi Θ 11,2% 6%Enterococchi 5,5% 3,6%
Gram negativi (n=407=45%) E.coli 28,1% 22,6%Klebsiella spp 3,4% 5,2% Enterobacter, Citrobacter spp 2,5% 4,4%Ps.aeruginosa 2,7% 5,6%Acinetobacter spp 0,6% 2%Candida ed altri miceti 1,2% 2,4%
Brun-Buisson C
Gram-negative bacteria account for about 60% of cases, Gram-positive for the remainder
The commonest sites of infection are the lungs, abdominal cavity, the urinary tract and primary infections of the blood stream.
A microbiological diagnosis is made in about half the cases
Nature 420, 885 - 891 (19 December 2002); doi:10.1038/nature01326 <> The
immunopathogenesis of sepsis JONATHAN COHEN
Gram-negative septic shock: comprende la metà dei casi totali di sepsi, 115,000 morti/ anno. E’ il gruppo di batteri che causano il maggior numero di morti per sepsi (30-50%).
Gram-positive septic shock: l’incremento di casi di shock settico da gram-positivi è dovuto all’aumento di polmoniti per batteri gram positivi e all’uso di dispositivi intravascolari. La metà dei casi di sepsi è da attribuirsi a gram-positivi.
Nosocomial, late onset sepsis occurs in up to 50% of infants of less than 1000gm at birth. The commonest organism isolated is coagulase negative staphylococcus (CoNS).
The Cochrane Libary, Issue 4, 2001.
The microorganisms most commonly associated with early-onset infection include group B Streptococcus (GBS), Escherichia coli, Haemophilus influenzae, and Listeria monocytogenes
Organisms that have been implicated in causing late-onset sepsis syndrome include coagulase-negative staphylococci, Staphylococcus aureus, E coli, Klebsiella, Pseudomonas, Enterobacter, Candida, GBS, Serratia, Acinetobacter, and anaerobes.
Neonatal Sepsis June 23, 2004 Author: Linda L Bellig, RN, NNP, Neonatal Nurse Practitioner Program, Medical University of South Carolina, College of Nursing
Policlinico di Modena Nido-Neonatologia
N° casi con emocolture positive a 0-7 gg
2001 2002 2003 2004 TOT
Stafilococchi coaug.negativi 17 30 22 14 83
Escherichia coli 2 2 2 4 10
Streptococcus agalactiae 0 2 6 2 10
Serratia marcescens 1 5 6
Staphilococcus aureus 1 2 1 4
Haemophilus influenzae 1 1 2
Enterococcus faecalis 1 1 2
Pseudomonas aeruginosa 2 2
Haemophilus parainfluenzae 1 1
Morganella morganii 1 1
Candida albicans 1 1
Listeria monocitogenes 1 1
Altri 7 12 12 14 45
N° casi con emocolture positive a 8-90 gg
2001 2002 2003 2004 TOT
Stafilococchi coaug.negativi 19 19 17 16 71
Klebsiella spp. 4 1 6 4 15
Staphilococcus aureus 2 3 2 1 8
Escherichia coli 3 2 1 1 7
Candida albicans 1 2 1 3 7
Enterobacter spp. 3 1 2 6
Enterococcus faecalis 4 1 5
Serratia marcescens 2 1 3
Pseudomonas aeruginosa 1 1 1 3
Candida parapsilosis 2 2
Streptococcus agalactiae 1 1
Candida tropicalis 1 1
Listeria monocitogenes 1 1
Altri 3 3 2 2 10
Policlinico di Modena Nido-Neonatologia
precoci 0-7 gg tardive 8-90 ggliquor emocolture TOT N° emo eseg. %POS
1997 0 0 1997 0 0 0 297 0%1998 0 0 1998 0 0 0 237 0%1999 0 0 1999 0 0 0 293 0%2000 0 0 2000 0 0 0 318 0%2001 0 1 2001 0 0 1 528 0,2%2002 0 2 2002 0 0 2 534 0,4%2003 0 6 2003 1 0 7 609 1,1%2004 0 2 2004 0 0 2 577 0,3%
Policlinico di Modena Nido-Neonatologia
Streptococcus agalactiae
The infection site helps in determining the most likely cause of a patient's sepsis Suspected Source of Sepsis
Lung Abdomen Skin/Soft
Tissue Urinary
Tract CNS
Major Community Acquired Pathogens
Streptococcus pneumoniae Haemophilus influenzae Legionella sp. Chlamydia pneumoniae
Escherichia coli Bacteroides fragilis
Streptococcus pyogenes Staphylococcus aureus Clostridium sp.
Polymicrobial infections Aerobic gram negative bacilli Pseudomonas aeruginosa Anaerobes Staphylococcus sp.
Escherichia coli Klebsiella sp. Enterobacter sp. Proteus sp.
Streptococcus pneumoniae Neiserria meningitidis Listeria monocytogenes Escherichia coli Haemophilus influenzae
Major Nosocomial pathogens
Aerobic gram negative bacilli
Aerobic gram negative bacilli Anaerobes Candida sp.
Staphylococcus aureus Aerobic gram negative bacilli
Aerobic gram negative bacilli Enterococcus sp.
Pseudomonas aeruginosa Escherichia coli Klebsiella sp. Staphylococcus sp
CVC
Staphylococcus coaug.neg Aerobic gram negative bacilli
Microbial triggers of disease: gram-negative bacteria= endotoxin, formyl
peptides, exotoxins, and proteases
gram-positive bacteria= exotoxins, superantigens (toxic shock syndrome toxin (TSST), streptococcal pyrogenic exotoxin A (SpeA)), enterotoxins, hemolysins, peptidoglycans, and lipotechoic acid
fungal = cell wall material.
Patogenesi la sintomatologia clinica è di solito dovuta a prodotti
tossici di origine batterica, alla risposta dell’ospite a questi o ad entrambe.
Nei gram-negativi la porzione lipidica A dell’endotossina, sita nella membrana lipopolisaccaridica esterna, innesca una catena di reazioni, comprensivi della produzione del tumor-necrosis factor (TNF), interleuchina1 (IL-1) ed attivazione del complemento.
I gram-positivi (in particolare Streptococcus pneumoniae, Streptococcus pyogenes, Stafilococchi) sono privi di lipopolisaccaride , ma sono dotati di altri componenti della parete batterica, come il peptidoglicano, che producono effetti simili.
Quale è il contributo del Laboratorio di Microbiologia nella diagnosi e trattamento della sepsi?
Quali indagini microbiologiche richiedere, attualmente, nel caso di sospetta sepsi ?
Quando e come raccogliere i campioni?
Diagnosis Appropriate cultures should always be obtained before
antimicrobial therapy is initiated. To optimize identification of causative organisms, at least two blood cultures should be obtained with at least one drawn percutaneously and one drawn through each vascular access device, unless the device was recently (<48 hrs) inserted. Cultures of other sites such as urine, cerebrospinal fluid, wounds, respiratory secretions, or other body fluids should be obtained before antibiotic therapy is initiated as the clinical situation dictates. Grade of Recommendation: D
Diagnostic studies should be performed promptly to determine the source of the infection and the causative organism. Imaging studies and sampling of likely sources of infection should be performed; however, some patients may be too unstable to warrant certain invasive procedures or transport outside of the ICU. Bedside studies, such as ultrasound, may be useful in these circumstances. Grade of Recommendation: E
Antibiotic Therapy Intravenous antibiotic therapy should be started within
the first hour of recognition of severe sepsis, after appropriate cultures have been obtained.
Grade of Recommendation: E Initial empirical anti-infective therapy should include
one or more drugs that have activity against the likely pathogens (bacterial or fungal) and that penetrate into the presumed source of sepsis. The choice of drugs should be guided by the susceptibility patterns of microorganisms in the community and in the hospital.
Grade of Recommendation: D
The antimicrobial regimen should always be reassessed after 48–72 hrs on the basis of microbiological and clinical data with the aim of using a narrow-spectrum antibiotic to prevent the development of resistance, to reduce toxicity, and to reduce costs. Once a causative pathogen is identified, there is no evidence that combination therapy is more effective than monotherapy. The duration of therapy should typically be 7–10 days and guided by clinical response.
Grade of Recommendation: E Some experts prefer combination therapy for patients with
Pseudomonas infections.
Grade of Recommendation: E Most experts would use combination therapy for neutropenic patients
with severe sepsis or septic shock. For neutropenic patients, broad-spectrum therapy usually must be continued for the duration of the neutropenia.
Grade of Recommendation: E If the presenting clinical syndrome is determined to be due to a non-
infectious cause, antimicrobial therapy should be stopped promptly to minimize the development of resistant pathogens and superinfection with other pathogenic organisms.
Grade of Recommendation: E
Every patient presenting with severe sepsis should be evaluated for the presence of a focus on infection amenable to source control measures, specifically the drainage of an abscess or local focus on infection, the debridement of infected necrotic tissue, the removal of a potentially infected device, or the definitive control of a source of ongoing microbial contamination. (See Appendix A in the original guideline document for examples of potential sites needing source control.)
Grade of Recommendation: EThe selection of optimal source control methods must weigh benefits and
risks of the specific intervention. Source control interventions may cause further complications such as bleeding, fistulas, or inadvertent organ injury; in general, the intervention that accomplishes the source control objective with the least physiologic upset should be employed, for example, consideration of percutaneous rather than surgical drainage of an abscess.
Grade of Recommendation: E
SOURCE OF CONTROL
When a focus of infection amenable to source control measures, such as an intra-abdominal abscess, a gastrointestinal perforation, cholangitis, or intestinal ischemia, has been identified as the cause of severe sepsis or septic shock, source control measures should be
instituted as soon as possible following initial resuscitation.
Grade of Recommendation: E
If intravascular access devices are potentially the source of severe sepsis or septic shock, they should be
promptly removed after establishing other vascular access.
Grade of Recommendation: E
Causes: Sepsis or septic shock may be associated with the direct
introduction of microbes into the blood stream via intravenous infusion (eg, IV line, other device-associated infections).
There may be perforations, compromise, or rupture of an intra-abdominal or pelvic structure.
Bacteremia from bacteruria (urosepsis) may complicate cystitis in compromised hosts. Intrarenal infection (pyelonephritis), renal abscess (intrarenal or extrarenal), acute prostatitis, or prostatic abscess may cause urosepsis in immunocompetent hosts.
Sepsis is not a random occurrence and usually is associated with the aforementioned conditions.
In addition, sepsis may be caused by overwhelming pneumococcal infection in patients with impaired/absent splenic function.
Meningococcemia from a respiratory source also may result in sepsis with or without associated meningitis
Le regole generali La raccolta del campione deve avvenire possibilmente
prima della terapia antibiotica La raccolta del campione deve essere effettuata nella sede
anatomica dell’infezione Prelevare una quantità sufficiente di materiale Evitare ogni contaminazione esogena ed endogena Utilizzare appropriati sistemi di raccolta Contrassegnare il contenitore del paziente, il numero di
identificazione, la data e l’ora del prelievo Consegnare prontamente i campioni al laboratorio Adottare, quando possibile idonee alternative alla consegna
immediata Richiedere adeguate notizie cliniche
Obiettivo Garantire la sopravvivenza e l’isolamento dei
microrganismi patogeni, prevenendo la
sovracrescita di batteri resistenti con cinetica
di crescita piu’rapida e garantendo la vitalità
dei microrganismi fastidiosi per riprodurre in-
vitro l’ecosistema batterico del sito di
sospetta infezione, al fine di fornire al clinico
risultati attendibili e non inutili o dannosi per il
paziente
Criticità del prelievo per le indagini microbiologiche
Preparazione del paziente Ora del prelievo rispetto all’ora
dell’accettazione Modalità di prelievo Modalita di conservazione Tempo impiegato per il trasporto
EMOCOLTURE
BACTEC 9000
BACTEC AUTOMAZIONE COMPLETA
Lo strumento è: Lettore in continuo Incubatore Agitatore Tecnologia di lettura
La tecnologia di lettura del Sistema Bactec è basata su un metodo fluorimetrico sensibile alla produzione di CO2 da parte del microrganismo presente.Il Sensore, posto sul fondo del flacone all’interno di una matrice protettiva, contiene composti fluorescenti che reagiscono in presenza di CO2 prodotta dal microrganismo. Tale matrice consente la diffusione selettiva della CO2 dal brodo di coltura.
Perché l’emocoltura puo’ essere falsamente positiva?
I principali fattori sono:-Contaminazione al momento del prelievo per batteri presenti sulla cute del paziente-Contaminazione al momento del prelievo per batteri presenti sulla mani di chi esegue il prelievo-Contaminazione al momento dell’inoculo per batteri posti sulla membrana di protezione del flacone
-”Contaminazione” al momento dell’inoculo per batteri transitoriamente in circolo, ma non responsabili della sepsi
.,
Blood culture is the criterion standard for identifying patients with bacteriemia. However, elevated false positive rates are common and are associated with substantial health care costsIn the real world of clinical microbiology laboratories, nearly half of all positive blood cultures represent contamination.Complete laboratory workup of contaminant isolates is associated with increased technologist workload and institutional cost.
Weinstein M.P., et al. Clin Infect Dis. 1997;24:584-602
Indicatore di qualità del prelievorilevabile nella fase post-analitica:
% di Stafilococchi coaug.negativiisolati da emocoltura,
Dati della letteratura attestano che gli Stafilococchi coaug.negativi sono responsabili di batteriemie/sepsi significative per il 10% - 30%, variabilmente in relazione alla casistica dell’ospedale (paziente con accessi vascolari, immunodepressi etc….).In questi microrganismi la meticillino resistenza varia dal 34% al 90%
Il problema maggiore del prelievo riguarda la possibilità di contaminazioni esogene del campione con:
conseguenti difficoltà interpretative del risultato
Trattamenti antibiotici inutili
Impossibilità di continuare l’iter diagnostico di quel stesso prelievo di emocoltura.
.
Perché l’emocoltura puo’ essere falsamente negativa ?
I principali fattori sono:
-Volume insufficiente -Numero di serie -Timing -Trattamento antibiotico prima del prelievo-Momento del prelievo rispetto al rialzo termico
L’efficacia ed il significato clinico dell' emocoltura dipendono da diversi fattori metodologici ed interpretativi, dipendenti soprattutto dalla fase pre-analitica, fra cui principalmente:
1) il volume del campione,
2) il momento del prelievo,
3) l'intervallo ed il numero dei prelievi,
4) l'accuratezza del prelievo
5) le caratteristiche del mezzo di coltura
Procedura per la gestione delle emocolture dal paziente al laboratorio
Lab di Microbiologia-Rev.05
Oggetto e scopo...................................................................................................................... 2 Indicatori applicabili: ................................................................................................................ 2 Responsabilità:........................................................................................................................ 2 Premessa................................................................................................................................ 2 Suggerimenti per una corretta esecuzione dell’esame ............................................................ 3 Modalità di esecuzione dell’emocoltura ................................................................................... 4 Preparazione dell’operatore e del paziente.............................................................................. 6 Tipologia di flaconi da utilizzare............................................................................................... 8 Volumi raccomandati............................................................................................................... 8 Invio e Conservazione ............................................................................................................. 9 Protocolli di prelievo ................................................................................................................ 9 Protocollo. 1 = Pazienti Neutropenici /Oncologici ....................................................................9 Protocollo .2 = Unità Intensiva .................................................................................................9 Protocollo 3 = Pazienti Oncologici ........................................................................................... 9 Protocollo 4 = Malattie Infettive ............................................................................................... 9 Protocollo 5 = Chirurgia Trapianti ............................................................................................ 9 Protocollo 6 = Nefrologia ........................................................................................................9 Protocollo 7 = Nido-Neonatologia. ........................................................................................... 9 Protocollo 8 =Tab riepilogo......................................................................................................9 Principali modalità diverse dalla routine................................................................................... 9 Trasmissione dei risultati .........................................................................................................9 Interpretazione dei risultati (criteri per escludere i contaminanti) ........................................... 10
M.Barbieri (Uff.Infezioni Ospedaliere) P.Scannavini (Uff.Infezioni Ospedaliere) A.Berardi, S.Cattani (Nido -Neonatologia)
M.Codeluppi (Ch.Trapianti; TIPO)
A.Donelli (Unita’ Trapianti Midollo) G.Guaraldi (Mal.Infettive ) A. Semeraro (Malattie Infettive) M.Luppi (Ematologia) P. Bevini G.Longo ( Cure Palliative Hospice) P.Marchegiano (dir.Sanitaria) L.Lucchi (Nefrologia-Dialisi)
E.Rubbiani (Nefrologia Intensiva) R. Sabbatini (Oncologia ) B:Petocchi (Farmacia) C.Vaccari (Rianimazione)
O. Fratti (Rianimazione/TIPO) I. Generali (Rianimazione/TIPO)
C.Venturelli (Microbiologia) Referente Gruppo di Lavoro
Gruppo di lavoro
Suggerimenti per una corretta esecuzione dell’esame
Effettuare il prelievo il prima possibile e prima dell’inizio di eventuali terapie antibiotiche.
Nel corso di malattia acuta febbrile (meningite, polmonite batterica) che rende necessaria la terapia empirica non mirata, o in pazienti con malattie infettive (osteomielite, artriti suppurative), per i quali è necessario un intervento chirurgico d’urgenza, occorre eseguire subito due prelievi in entrambe le braccia.
Quando il paziente è in trattamento antibiotico eseguire l’emocoltura prima della somministrazione dell’antibiotico
Il momento del prelievo puo’ non essere critico nelle batteriemie di tipo continuo (es. Endocardite, brucellosi, febbre tifoide…) perchè sono caratterizzate da crescita e moltiplicazione dei microrganismi direttamente nel corrente circolatorio, dove si ritrovano in carica discretamente alta.
Il momento del prelievo risulta fondamentale nei casi di batteriemia intermittente (situazione piu’frequente) perchè I batteri entrano nel torrente circolatorio ad intervalli, da un sito di infezione (polmoni, vie genito-urinarie, tratto gastro-intestinale, ascessi, …..): occorre effettuare il prelievo prima del rialzo febbrile in quanto la batteriemia (maggiore concentrazione di batteri nel sangue) puo’ precedere di oltre un’ora il rialzo termico E’ importante studiare la curva termica ed effettuare il prelievo prima di tale rialzo.
Se questo non è prevedibile allora prelevare all'inizio del picco.
nel caso di endocardite eseguire i prelievi durante il picco (LG sulla prevenzione, diagnosi, e terapia dell’edocardite infettiva: Task-force sull’endocardite infettiva della Società europea di Cardiologia 2004)
Il volume di sangue posto in coltura rappresenta l’elemento piu’ critico nel rilevamento di una infezione del torrente circolatorio.IL N° di microrganismi presenti in una batteriemia dell’adulto e frequentemente circa 1 x103 UFC/L. Esiste una correlazione diretta fra volume di sangue e positività con un incremento diapprossimativo del 3% di riscontro per ml di sangue inoculato. Si raccomanda l’inoculo di 20-30 ml di sangue. Nei neonati e nei bambini l’entità della batteriemia è di solito maggiore di quella degli adulti, sebbene possono riscontrarsi livelli ridotti di batteriemia (circa 4x103 UFC/L.). Per i neonati si raccomanda un volume di 1-2 ml
Il volume di sangue
La maggior parte delle batteriemie, ad eccezione di quelle ricorrenti deibambinipresentano bassa carica microbica, per cui dovr à essere raccolto per ogni set di emocolture un adeguato volume di sangue
• Da uno studio condotto su pazienti con fungemia, fu dimostrato che la sensibilit à del test aumentava del 3% per ogni mL di sangue prelevato in più
• Attualmente c’è la tendenza ad effettuare un minor numero diprelievi, ciascuno costituito da una quantit à congrua di sangue, piuttosto che un maggior numero di prelievi, ciascuno costituito da pochi mL di sangue
Quantità di sangue consigliata per ogni prelievo in base all’età:
• Adulti 10-30 mL (meglio se 20-30mL)
• Adolescenti 10-20 mL
• Dai 2 ai 12 anni 3-5 mL
• Da 1 mese a 2 anni 2-3 mL
• Neonati 1-2 mL
Si consiglia di solito che il sangue sia inoculato nel brodo di coltura nel rapporto 1:10 per proteggere i microrganismi dall’attacco
battericida del siero umano
• E’ comunque soddisfacente anche un rapporto di 1:5 in pazienti che non siano sottoposti ad un’adeguata terapia antibiotica
Se il rialzo febbrile è
preceduto da brividi
bisognerebbe eseguire il prelievo
al momento del brivido.
Il momento del prelievo e il Numero di set Il momento ideale per
il prelievo è circa 30 minuti dopo la puntata
febbrile, poiché in questo periodo sembra essere
maggiore la concentrazione di
microrganismi in circolo.
Emocoltura dovrebbe essere raccolta prima del rialzo termico.
TEMPERATURA
BATTERIEMIA
TEMPO
In corso di endocardite infettiva pare non vi sia alcun vantaggio nell’effettuare prelievi in corrispondenza di particolari variazioni della temperatura corporea, essendovi, di fatto, una batteriemia continua anche in presenza di fasi di apiressia.
In corso di endocardite infettiva acuta è consigliabile eseguire tre prelievi in una o due ore, nelle prime 24 ore.
In corso di endocardite batterica subacuta occorre effettuare 3 prelievi in 24 ore, oppure…
… se persiste negatività dopo 48 ore, bisogna eseguire altre 3 emocolture nello spazio di 24-48 ore
Un solo prelievo può non evidenziare una batteriemia intermittente e rende difficile interpretare il significato clinico dell’isolamento di certi microrganismi
Raramente è giustificato il prelievo di piu’ di tre set di emocolture, in quanto la sensibilità del metodo non è ulteriormente aumentata.
Quando il prelievo viene eseguito da sangue periferico, nel caso di sospetta sepsi e di febbre di origine sconosciuta, i prelievi vanno eseguiti da siti separati
Modalità di esecuzione dell’emocoltura
E' necessario il rigoroso rispetto delle norme di asepsi durante il prelievo: emocolture falsamente positive comportano interpretazioni diagnostiche erronee, con conseguenti terapie inutili.
Prima di procedere con manovre per l’esecuzione del prelievo è opportuno predisporre il materiale occorrente verificando l’integrità delle confezioni e le relative date di scadenza
Arcella pulita Laccio emostatico Cerotto di tela o di carta a seconda del paziente Disinfettante Guanti sterili Agocannula e butterfly per prelievo di diverse dimensioni eventuale doppia via o microgocciolatore Flaconi per emocolture
BACTEC 9000/F
Soluzione chiave per la sicurezza dell’operatore:Compatibilità con sistema VACUTAINER
BACTEC è l’UNICOcompatibile con ilVACUTAINER
Safety-Lok Blood Collection Set
Effettuare un lavaggio sociale delle mani (secondo le linee guida) Indossare la mascherina Reperire la vena ed effettuare, solo se necessario una tricotomia
localizzata applicare il laccio lontano dal punto di inserzione dell’ago cannula Indossare i guanti sterili Dopo aver identificato la sede da raggiungere si esegue una asepsi
della cute per un’area di 5 cm, strofinando in maniera circolare per almeno 2’ con cotone imbevuto in una soluzione alcolica di clorexidina gluconata 0,5% (tipo neoxinal alc.0,5%) il sito cutaneo viene poi disinfettato con una soluzione di iodio povidone al 10% o tintura di iodio al 2% con movimento circolare. Evitare di toccare la cute, dopo la disinfezione, nel punto di introduzione dell’ago.
Lasciare asciugare completamente prima di eseguire la venipuntura (1-2 min) avendo l’accortezza di non toccare nuovamente col dito la sede da pungere.
Evitare per quanto possibile l’introduzione dell’agocannula negli arti inferiori o in quelli plegici.
In caso di presenza di dispositivi di accessi venosi o centrali il prelievo deve essere eseguito in tale sede e in altra sede periferica. Nel caso in cui si sia intenzionati all ’inserimento di una nuova ago-cannulla per accesso venoso periferico seguire le indicazioni precedenti già procedurate.
Eseguire la venipuntura (l’accesso alla vena deve essere distale rispetto al punto definitivo)
Fermare l’ago cannulla o il butterfly con cerotto, raccordarlo in asespi con un raccordo a due vie con camicia per prelievo vacutainer, rimuovere il tappo metallico dal flacone anaerobio dell’emocoltura e inserirlo all’interno della camicia.
verificare l’aspirazione del sangue all’interno del flacone per emocoltura e prelevare 10 ml
Rimuovere prontamente il flacone dall’apposito contenitore di plastica collegare al set di prelievo il flacone aerobio prelevare 10 ml di sangue Rimuovere il secondo flacone dal connettore di prelievo estrarre l’ago dalla vena e scartare il set in contenitore per rifiuti
sanitari a rischio infettivo attaccare su ogni flacone il barcode del nosologico del paziente
verticalmente e senza coprire il codice a barre del flacone. Indicare su ogni flacone la tipologia di prelievo (sangue da vena
periferica o sangue da catetere) e l’ora del prelievo Non scrivere assolutamente e non attaccare cerotti, etichette o altri
adesivi nella zona del flacone occupata dal codice a barre.
non si raccomanda il cambio degli aghi fra la puntura venosa e l’inoculo dei flaconi in quanto cio’comporta il rischio di punture ed inoltre dagli studi di una meta-analisi la pecentuale di contaminazione sarebbe ridotta in modo moderato.
Tutti i flaconi sono addizionati con CO2. I flaconi anaerobi sono preridotti ed addizionati con CO2 e N2.
• L’SodioPolianetolSulfonato è un’ anticoaugulante che risulta tossico per alcuni tipi di microrganismi:
• Nei flaconi Bactec la concentrazione di SPS è pari allo 0,025% sufficientemente corrispondente al minimo valore possibile di tossicità per gli eventuali microrganismi presenti.
• Nel caso di liquidi biologici diversi dal sangue occorre aggiungere FOS o fattore di arricchimento utile per migliorare la crescita di microrganismi esigenti come Neisseria, Haemophilus ecc…
• Contiene anche fattori che neutralizzano l’effetto tossico dell’SPS. I flaconi contengono resine che sono le uniche sostanze ad avere
proprietà mirata alla neutralizzazione specifica degli antibiotici
Tipologia di flaconi da utilizzare BACTEC · TAPPO BLU (aerobi) · TAPPO ARANCIONE (anaerobi) · TAPPO BIANCO (micobatteri / miceti particolari) Volumi raccomandati Adulti aerobio / anaerobio Adeguato da 3 a 10 ml. per flacone Ottimale da 8 a 10 ml per flacone Adulti MicoLytic Adeguato/Ottimale da 3 a 5 ml per flacone Pediatrico Adeguato/Ottimale da 1 a 3 ml. per flacone L’uso di volumi più bassi puo’ prolungare il tempo di
rilevamento / isolamento dei microrganismi.
Penetrazione del microrganismo attraverso una porta d’entrata
Formazione di un focolaio sepsigeno, in vicinanza della porta d’entrata, ove i microrganismi si moltiplicano (tromboflebitico o linfangitico)
Immissione di gittate batteriemiche in circolo
Eventuali localizzazioni metastatiche, da cui possono originare altre gittate batteriemiche
Invio e ConservazioneDopo il prelievo inviare i flaconi in laboratorio (dalle 8 alle ore 16 dal lunedi’ al venerdi’ e dalle 8 alle ore 13 del sabato). Al di fuori di questo orario le emocolture vanno conservate a temperatura ambiente fino al momento dell’invio.
Protocolli di prelievo : Protocollo. 1 = Pazienti Neutropenici /Oncologici Protocollo 2 = Unità Intensiva Protocollo 3 = Pazienti Oncologici Protocollo 4 = Malattie Infettive Protocollo 5 = Chirurgia Trapianti Protocollo 6 = Nefrologia Protocollo 7 = Nido-Neonatologia. Protocollo 8 =Tab riepilogo
INDICAZIONI ALLA SCELTA DEI VIALS DA EMOCOLTURA BACTEC IN FUNZIONE DELLE VARIE SITUAZIONI EPIDEMIOLOGICHE e/o CLINICHE
Protocollo N°1
•Pazienti neutropenici e trapiantati midollo
•N° di venipunture
•Intervallo di tempo
•Volume totale di sangue (ml)
per singola venipuntura
Bactec PLUS
AEROBIC•3-10 ML
Bactec PLUS
ANAEROBIC
•3-10 ML
Myco-Lytic
•3-5 ml ML
1.SOSPETTA SEPSI2.POLMONITE
•2 •T1= 0•T2 =10’ circa
•15-20 ml •X •X •su indicazione del medico
•(2 serie)
1.FEBBRE DI ORIGINE•SCONOSCIUTA in paziente con catetere•FEBBRE DA SOSPETTA INFEZIONE DA CATETERE INTRAVASCOLARE•PAZIENTE CON • DIFFICOLTÀ DI ACCESSO PERIFERICO
•1 prelievo •da catetere•+•1prelievo da periferico•(quando possibile)•+•1 prelievo •da catetere•+•1 prelievo •da catetere
•T1= 0 •+
•T2 = 0’•+
•T3 = 30’•+
•T4, = dopo 24 ore
se non vi è segnalazione della
positività dalla microbiologia
•15-20 ml •X •X
1.FEBBRE DI ORIGINE SCONOSCIUTA
•1 prelievo da periferico
•+•1 prelievo da
periferico•+
•2 prelievi da periferico
•T1= 0 •+
•T2 = 60’•+
•T3, , T4 = dopo 24
ore con le stesse modalità se non
vi è segnalazione della positività
dalla
•microbiologia •su indicazione del medico
•(2 serie)
Protocollo N°2 N° di venipunture Intervallo di tempo Volume totale di sangue (ml) per singola venipuntura
Bactec PLUSAEROBIC3-10 ML
Bactec PLUSANAEROBIC 3-10 ML
Myco-Lytic 3-5 ml ML
Unità intensiva medica
1. SOSPETTA SEPSI2. POLMONITE
• 2• prima della
terapia antibiotica
• T1= 0• T2 =10’ circa
• 15-20 ml
• X • X
1. FEBBRE DI ORIGINE
• SCONOSCIUTA
• 2• +• 2
• T1= 0• T2 = 60’
• +• T3, T4 = dopo
24 ore se non vi è
segnalazione della positività
dalla microbiologia
• 15-20ml
• X • X • su indicazione del medico
• (2 serie)
1. FEBBRE DA SOSPETTA INFEZIONE DA CATETERE INTRAVASCOLARE
• 1 Periferico• +• 1 CV
• T1= 0 • +
• T2 = 0’
• 15-20 ml
• X • X
Protocollo 3
N° di venipunture (in sedi venose
distinte)
Intervallo di tempo
Volume totale di sangue (ml) per singola venipuntura
Bactec PLUS AEROBIC 3-10 ML
Bactec PLUS ANAEROBIC 3-10 ML
Myco- Lytic 8-10 ML
Pazienti oncologici SOSPETTA SEPSI POLMONITE
2 prima della terapia
antibiotica
T1= 0 T2 =10’ circa
15-20 ml X X
FEBBRE DI ORIGINE SCONOSCIUTA
2-3
+ 2
T1= 0 T2= 30’ T3 = 60’
+ T4 T5= dopo 24
ore se non vi è segnalazione della positività
dalla microbiologia
15-20ml X X su indicazione del medico
(2 serie)
FEBBRE DA SOSPETTA INFEZIONE DA CATETERE INTRAVASCOLARE
da valutare il ruolo della positività del sangue da catetere di un lume rispetto ad un altro al fine del non utilizzo e/o rimozione di un catetere
1 prelievo da catetere (1°lume)
+ 1prelievo da
periferico +
1 prelievo da catetere (2°lume)
+ 1prelievo da
periferico +
1 prelievo da catetere
T1= 0
+ T2 = 0’
+
T3 = 0’
+ T4, T5= dopo 24
ore se non vi è segnalazione della positività
dalla microbiologia
15-20 ml X X
Protocollo 4
N° di venipunture
Intervallo di tempo Volume totale di sangue (ml) per singola venipuntura
Bactec PLUS AEROBIC 3-10 ML
Bactec PLUS ANAEROBIC 3-10 ML
Myco- Lytic 3-5 ML
Malattie Infettive SOSPETTA SEPSI POLMONITE MENINGITE
2 prima della
terapia antibiotica
T1= 0 T2 =10’ circa
15-20 ml X X su indicazione del medico
(2 serie)
FEBBRE DI ORIGINE SCONOSCIUTA
2
+ 2
T1= 0 T2 = 60’
+ T3, T4 = dopo 24 ore se
non vi è segnalazione della positività dalla
microbiologia
15-20ml X X su indicazione del medico
(2 serie)
ENDOCARDITE ACUTA ENDOCARDITE SUBACUTA
3 sets in siti separati
3 sets. in siti
separati
3 sets. in siti
separati
0 <T 1, 2, 3 <2 ore prima dell’inizio della
terapia
3 sets in siti separati distanziate da almeno
15 minuti
T4 = dopo 24 ore se non vi è segnalazione della
positività dalla microbiologia
15-20ml X X
FEBBRE DA SOSPETTA INFEZIONE DA CATETERE INTRAVASCOLARE
1 Periferico +
1 CV
T1= 0
T2 = 0’
15-20 ml X X
Protocollo N° 5
N° di venipunture
Intervallo di tempo
Volume totale di sangue (ml) per singola venipuntura
Bactec PLUS AEROBIC 3-10 ML
Bactec PLUS ANAEROBIC 3-10 ML
Myco- Lytic 3-5 ML
Chirurgia dei Trapianti di fegato
SOSPETTA SEPSI POLMONITE
2 prima della
terapia antibiotica
T1= 0 T2 =10’ circa
15-20 ml X X su indicazione del medico
(2 serie)
FEBBRE DI ORIGINE SCONOSCIUTA
2
+ 2
T1= 0 T2 = 60’
+ T3, T4 = dopo 24
ore se non vi è segnalazione della
positività dalla microbiologia
15-20ml X X su indicazione del medico
(2 serie)
FEBBRE DA SOSPETTA INFEZIONE DA CATETERE INTRAVASCOLARE
2 Periferico
+ 1 CV
+ 1 Periferico
+ 1 CV
T1= 0 T2 = 15’
+
T3 = 0’
+
T3,= 0’ T4 = 0’
dopo 24 ore se non vi è
segnalazione della positività dalla microbiologia
15-20 ml X X
Protocollo N° 6
N° di venipunture
Intervallo di tempo
Volume totale di sangue (ml) per singola venipuntura
Bactec PLUS AEROBIC 3-10 ML
Bactec PLUS ANAEROBIC 3-10 ML
Myco- Lytic 3-5 ML
Nefrologia/Dialisi SOSPETTA SEPSI POLMONITE
2 prima della
terapia antibiotica
T1= 0 T2 =10’ circa
15-20 ml X X
FEBBRE DI ORIGINE SCONOSCIUTA
2
+ 2
T1= 0 T2 = 60’
+ T3, T4 = dopo 24
ore se non vi è segnalazione della
positività dalla microbiologia
15-20ml X X su indicazione del medico
(2 serie)
FEBBRE DA SOSPETTA INFEZIONE DA CATETERE INTRAVASCOLARE
2 Periferico
+ 1 CV
+ 1 Periferico
+ 1 CV
T1= 0 T2 = 15’
+
T3 = 0’
+
T3,= 0’ T4 = 0’
dopo 24 ore se non vi è
segnalazione della positività dalla microbiologia
15-20 ml X X
Protocollo N° 7
N° di venipunture
Intervallo di tempo
Volume totale di sangue (ml) per singola venipuntura
Bactec PEDIATRICO AEROBIC 3-10 ML
Nido -Neonatologia SOSPETTA SEPSI
1 prima della
terapia antibiotica
T1= 0
1-3 ml X
FEBBRE DA SOSPETTA INFEZIONE DA CATETERE INTRAVASCOLARE
1 Periferico
+
1 CV
T1= 0
+ T2 = 0’
2-6 ml X
INDICAZIONI ALLA SCELTA DEI VIALS DA EMOCOLTURA BACTEC NELLE VARIE SITUAZIONI CLINICHE TAB 8.RIEPILOGO Patologia
Numero di set per paziente, al giorno
Bactec PLUS AEROBIC 3-10 ML
Bactec PLUS ANAEROBIC 3-10 ML
Bactec MYCO F/LYTIC 3-5 ML
Sepsi 2-(3) sets in tempi ravvicinati, prima dell’inizio della terapia
X X (X) a giudizio del medico
Meningite 2 sets in tempi ravvicinati, prima dell’inizio della terapia
X X (X) a giudizio del medico
Endocarditi acute 3 sets in siti separati ad intervalli di 1-2 ore prima dell’inizio della terapia
X X
Endocarditi subacute
3 sets in siti separati ad intervalli di 15-30 minuti. Se il risultato è negativo dopo le prime 24 ore, ripetere
3 sets con la stessa modalità.
X X
Febbre di origine sconosciuta (FUO)
2 sets in siti separati, distanziate da almeno 1 ora di intervallo. Se il risultato è negativo dopo le prime 24-36 ore,
ripetere 2 prelievi con la stessa modalità.
X X (X) a giudizio del medico
Pazienti con
osteomieliti, artriti. Patologie ostetrico-
ginecologiche. Sepsi a partenza
sotto diaframmatica Polmoniti
2 sets nell’arco di 1-2 ore prima dell’inizio della terapia
X
X
(X) a giudizio del medico
In altre situazioni cliniche non menzionate (es. gastroenteriti,); circa l’opportunità dell’esecuzione delle emocolture e la scelta dei set si rimanda al giudizio del medico in funzione delle varie situazioni epidemiologiche (es. età del soggetto, ecc.)
Principali modalità diverse dalla routine Brucellosi, Istoplasmosi, Endocardite. Segnalare il sospetto clinico sulla richiesta
in modo che venga prolungata l'incubazione per 3 settimane
Consegna al laboratorioI flaconi per l’emocoltura devono essere
trasportati in laboratorio nel piu’ breve tempo possibileSe non possono essere consegnati in tempi rapidi devono essere tenuti a T amb.
in caso di: segni o segnali di positività
PREPARATO MICROSCOPICO (gram) : comunicazione telefonica e nel referto
Semina :Flacone aerobio: su agar sangue, agar cioccolato, mk
conkeyFlacone anaerobio: su su agar sangue, agar cioccolato,
mk conkey, schaedlerIdentificazione di specie secondo i metodi in uso in
laboratorio allestimento prove di sensibilità secondo i metodi in
uso in laboratorio
EMOCOLTURA in caso di: segni o segnali di segni o segnali di
positivitàpositivitàANTIBIOGRAMMA DIRETTOMetodi più utilizzati manuali Metodi più utilizzati manuali
Evidenziare i principali meccanismi di resistenzaEvidenziare i principali meccanismi di resistenza Attualmente non esistono metodi standardizzati Attualmente non esistono metodi standardizzati
e/o approvatie/o approvati IDENTIFICAZIONE DIRETTA DEI
MICRORGANISMI Attualmente non esistono metodi standardizzati Attualmente non esistono metodi standardizzati
e/o approvatie/o approvatiNO
Sensibilità delle emocolture
Nella sepsi da polmonite da Staphylococcus aureus le emocolture sono spesso falsamente negative (80%) per trattamento antibiotico in atto.
Nella sepsi da osteomielite da Staphilococcus aureus le emocolture sono positive nel 50% dei casi
Solo il 3-8% delle colture dimostrano la sepsi nei neonati
EMOCOLTURA interpretazione risultati : come come identificare i falsi
positivi (aspetti clinici)
Decorso clinico non tipico Non riscontrata l’infezione primaria con lo stesso
isolato Assenti i fattori di rischio per batteriemia
correlata al microrganismo isolato I segni/sintomi dell’infezione non regrediscono
con trattamento antibiotico adeguato rispetto al
profilo di sensibilità altro
Interpretazione dei risultati (1)
Virtualmente qualunque microrganismo , compreso i batteri della normale flora, possono essere causa di infezione del sangue
Un risultato negativo non esclude necessariamente una batteriemia: risultati falsamente negativi si hanno quando i patogeni falliscono di crescere
Un risultato positivo non necessariamente indica l’isolamento del patogeno: risultati falsi-positivi si hanno quando crescono i contaminanti
I batteri gram-negativi, gli anaerobi e i miceti dovrebbero essere considerati patogeni, fino a dimostrazione del contrario
I maggiori problemi interpretativi di hanno se si isola un microrganismo che normalmente colonizza la flora cutanea:
dove: Gli isolati sono considerati “lo stesso ceppo” se le
prove biochimiche e il pattern di sensibilità sono gli stessi
tecniche molecolari sarebbero richieste per confermare che isolati multipli sono veramente “identici”o la % di omologia
Raramente ci sono pazienti che hanno vera batteriemia con specie di Stafilococchi coaug.negativi diverse. Nei casi di pazienti con sepsi clinica e a cui non è stata trovata altra eziologia, è appropiato riportare l’antibiogramma
References:
Weinstein MP. Blood culture contamination: Persisting problems and partial progress. J Clin Micro. 2003; 41: 2275-2278.
Aspetti clinici e laboratoristici proposti per aiutare il microbiologo ed il clinico nella talora difficile interpretazione di un'emocoltura positiva, nel decidere se il microrganismo
isolato dal sangue è da considerarsi patogeno o contaminante.
l’identificazione del microrganismo; l’identificazione del microrganismo;
gli aspetti clinici quali la febbre, la leucocitosi, i risultati di gli aspetti clinici quali la febbre, la leucocitosi, i risultati di indagini radiologiche (disponibili per il clinico ma solitamente indagini radiologiche (disponibili per il clinico ma solitamente non per il microbiologo); non per il microbiologo);
il numero di set positivi di emocolture rispetto al numero di il numero di set positivi di emocolture rispetto al numero di set prelevati; set prelevati;
il tempo necessario per la rivelazione della crescita dal il tempo necessario per la rivelazione della crescita dal momento del ricevimento del campione in laboratorio;momento del ricevimento del campione in laboratorio;
il numero di flaconi positivi all’interno di un unico set di il numero di flaconi positivi all’interno di un unico set di emocolture. emocolture.
Interpreting a “Positive” Blood Culture
True Bacteremia: Unlikely Uncertain Likely
• S. aureus• S. pneumoniae• Enterobacteriaceae• P. aeruginosa• C. albicans
• Corynebacterium spp.• Non-anthracis Bacillus spp.• Propionibacterium acnes
• coagulase-negative staphylococci
Source: Kim SD, et al: Infect Control Hosp Epidemiol 2000;21:213-7
pre-test probabilitypatient risk factorsprosthetic devicesclinical evidence
post-test probability# positive / # cultures compare antibiograms compare genotypes
12 Steps to Prevent Antimicrobial Resistance: Hospitalized Adults
Step 7: Treat infection, not contamination
Una corretta identificazione del microrganismo isolato da un’emocoltura può fornire importanti informazioni per
l’interpretazione.
Microrganismi che sempre o spesso (>90% ) sono responsabili Microrganismi che sempre o spesso (>90% ) sono responsabili di una vera batteriemia o fungemia includono:di una vera batteriemia o fungemia includono:
Staphylococcus aureusStaphylococcus aureus Streptococcus Streptococcus pneumoniaepneumoniae Escherichia coliEscherichia coli ed altri membri delle ed altri membri delle EnterobacteriaceaeEnterobacteriaceae Pseudomonas aeruginosaPseudomonas aeruginosa Candida albicansCandida albicans Microrganismi che sempre o virtualmente sempre sono Microrganismi che sempre o virtualmente sempre sono
responsabili di una vera batteriemia o fungemia includonoresponsabili di una vera batteriemia o fungemia includono:: Streptococcus Streptococcus pyogenespyogenes Streptococcus Streptococcus agalactiaeagalactiae ListeriaListeria monocytogenesmonocytogenes NeisseraNeissera meningitidismeningitidis NeisseriaNeisseria gonorrhoeaegonorrhoeae HaemophylusHaemophylus influenzaeinfluenzae Membri delMembri del BacteroidesBacteroides fragilisfragilis groupgroup CandidaCandida speciesspecies diversa da diversa da Candida albicansCandida albicans Cryptococcus neoformansCryptococcus neoformans
Altri microrganismi, al contrario, sono Altri microrganismi, al contrario, sono responsabili responsabili di vere batteriemie solo raramente ed di vere batteriemie solo raramente ed includono:includono: CorynebacteriumCorynebacterium spp. spp. BacillusBacillus spp. diversi da spp. diversi da B. anthracisB. anthracis Propionibacterium acnesPropionibacterium acnes
L’isolamento di L’isolamento di Stafilococchi coagulasi-Stafilococchi coagulasi-negativinegativi, i microrganismi più frequentemente , i microrganismi più frequentemente isolati da emocolture, può rappresentare un difficile isolati da emocolture, può rappresentare un difficile problema interpretativo. problema interpretativo.
Questi batteri sono spesso contaminanti, ma sono Questi batteri sono spesso contaminanti, ma sono anche stati riconosciuti come agenti eziologici di anche stati riconosciuti come agenti eziologici di batteriemie catetere-correlate e batteriemie in batteriemie catetere-correlate e batteriemie in pazienti con protesi vascolari o altri tipi di protesi. pazienti con protesi vascolari o altri tipi di protesi.
Una corretta identificazione del microrganismo isolato da un’emocoltura può fornire importanti informazioni per
l’interpretazione.
Per gli Per gli Stafilococchi coagulasi-negativiStafilococchi coagulasi-negativi il il significato clinico non può essere basato solo sulla significato clinico non può essere basato solo sulla loro corretta identificazione, e questo vale anche loro corretta identificazione, e questo vale anche per altri microrganismi.per altri microrganismi.
EnterococchiEnterococchi e e Streptococchi del gruppo Streptococchi del gruppo viridansviridans che in recenti studi sono stati considerati che in recenti studi sono stati considerati patogeni nel 78% e 38% delle volte rispettivamente.patogeni nel 78% e 38% delle volte rispettivamente.
Clostridium perfrigensClostridium perfrigens che spesso (77%) è che spesso (77%) è
stato considerato un contaminante, mentrestato considerato un contaminante, mentre ClostridiumClostridium spp. diversi da spp. diversi da C. perfrigensC. perfrigens molto spesso (80%) sono stati considerati come molto spesso (80%) sono stati considerati come patogeni.patogeni.
Weinstein M.P. et al. CID. 1997; 24:584-602 Weinstein M.P. et al. CID. 1997; 24:584-602
Una corretta identificazione del microrganismo isolato da un’emocoltura può fornire importanti informazioni per
l’interpretazione.
SCN: storia
1958: prime osservazioni di sepsi causate da SCN (Smith)
1962: Pereira ipotizza il ruolo patogeno di S. saprophyticus nelle infezioni delle vie urinarie
1965: Wilson e Stuart segnalano l’isolamento di SCN da infezioni di ferita nel 4,4% dei casi (1200 campioni, 53 colture pure)
1965: Pulverer tenta di pubblicare il primo lavoro relativo alle endocarditi causate da SCN. Il lavoro verrà accettata solo nel 1967
1971: prima descrizione della colonizzazione di shunt ventricolo-atriali da SCN (Holt)
anni ‘80: SCN prima causa di endocarditi su valvola protesica
anni 1990-oggi: SCN prima causa di sepsi nosocomiali in reparti critici. Prime descrizioni di cassetti genici di resistenza. Evidenza di ceppi con diminuita suscettibilità ai glicopeptidi.
E.C., 2004
SCN: studi di patogenicità Gli SCN causano infezioni per la loro capacità di aderire a
biomateriali. La patogenicità di SCN è stata valutata nel modello animale, valutando la capacità di produrre ascessi dopo cateterizzazione con dispositivi infettati
S. schleiferi è risultato in grado di causare infezione in tempi brevissimi, altri studi successivamente hanno dimostrato che questo microrganismo può causare infezione anche indipendentemente dal biomateriale
S. epidermidis e S. lugdunensis causano ascessi di grado severo o di media gravità; il primo può causare infezione indipendentemente dal biomateriale
S. hominis, S. warneri e S. capitis sembrano essere dotati di minori patogenicità; S. epidermidis e S. capitis sono quelli in grado di colonizzare per maggior tempo la cute sana (oltre due mesi)
Alcuni SCN sono correlati a peculiari problemi di resistenza agli antibiotici: il 20% dei ceppi di S. haemolyticus, ad esempio, presenta una ridotta sensibilità alla teicoplanina
E.C., 2004
SCN: meccanismi di patogenicità
Più frequentemente infezioni associate a biomateriali
Adesina polisaccaridica/capsulare (PS/A): è un polimero di galattosio e arabinosio, 1:1). Sintesi assai precoce (entro 15 minuti dopo il contatto con il biomateriale)
PS/A altamente immunogena MA in infezioni sperimentali NO risposta immune (probabilmente per gli effetti immunomodulanti degli acidi teicoici)
Altre adesine: matrice proteica, tardive
Adesività mediata da fibronectina, fibrinogeno, collagene, vitronectina. Il meccanismo patogenetico non è dissimile rispetto a SA, con produzione finale di ESS (extracellular slime substance)
E.C., 2004
SCN: significato clinico intrinseco
SCN per i quali è stato riconosciuto un possibile ruolo patogeno: S. epidermidis, S. capitis, S. sacchorolyticus, S. warneri, S. haemolyticus, S. hominis, S. lugdunensis, S. auricolaris, S. cohnii, S. saprophyticus, S. xylosus, S. simulans, S. schleiferi, S. pasteuri, S. caprae.
Una significatività clinica sembra correlarsi agli isolamenti di: S. epidermidis, S. haemolyticus, S. lugdunensis, S. simulans, S. schleiferi, S. saprophyticus (+++ distretto urinario)
E.C., 2004
Interpretazione dei risultati (4)
il numero di set di emocolture puo’ altresì essere utilizzato per interpretare il significato di un emocoltura positiva:
I contaminanti spesso crescono in 1solo set su 2/3 set prelevati: il numero dei set positivi/set eseguiti è predittivo del significato clinico. (Weinsten1983-1997)
Nei pazienti con endocardite o altre infezioni ematiche Nei pazienti con endocardite o altre infezioni ematiche tutte le emocolture o la maggioranza di queste risultano tutte le emocolture o la maggioranza di queste risultano positive.positive.I pazienti le cui emocolture sviluppano contaminanti I pazienti le cui emocolture sviluppano contaminanti solitamente hanno una singola emocoltura positiva solitamente hanno una singola emocoltura positiva (quando 2 o più emocolture sono eseguite).(quando 2 o più emocolture sono eseguite).
Se 1 singola emocoltura viene eseguita quanto detto Se 1 singola emocoltura viene eseguita quanto detto precedentemente non ha più senso. precedentemente non ha più senso. Eccellente ragione per cui almeno 2 set di emocolture Eccellente ragione per cui almeno 2 set di emocolture devono essere raccomandati come pratica standard.devono essere raccomandati come pratica standard.
Eseguire > 1 set di emocolture aiuta nell’interpretazione Eseguire > 1 set di emocolture aiuta nell’interpretazione del significato clinico di un’emocoltura in virtù del del significato clinico di un’emocoltura in virtù del seguente calcolo: seguente calcolo: in un’istituzione con % di contaminazione baseline delle in un’istituzione con % di contaminazione baseline delle emocolture del 3%, la probabilità di ritrovare lo stesso emocolture del 3%, la probabilità di ritrovare lo stesso microrganismo (come contaminante) in 2 set di microrganismo (come contaminante) in 2 set di emocolture dello stesso paziente è < 1 su 1000 (0.03 x emocolture dello stesso paziente è < 1 su 1000 (0.03 x 0.03 = 0.0009).0.03 = 0.0009).
N° di set di emocolture positive valutato in funzione del N° di set di emocolture
eseguite
Altri studi recentemente pubblicati
(Mirrett J.Clin.microbiol.2001) dimostrano che il numero di flaconi positivi non è un’informazione utile per distinguere un microrganismo da patogeno a contaminante
I Dati pubblicati, almeno per gli Stafilococchi coagulasi-I Dati pubblicati, almeno per gli Stafilococchi coagulasi-negativi (CoNS), dimostrano che questa tecnica non è negativi (CoNS), dimostrano che questa tecnica non è utile clinicamente.utile clinicamente. CoNS clinicamente significativi possono crescere più CoNS clinicamente significativi possono crescere più spesso in flaconi multipli all’interno di un set di spesso in flaconi multipli all’interno di un set di emocolture, mentre i contaminanti più spesso crescono emocolture, mentre i contaminanti più spesso crescono in un solo flacone del set, tuttavia il grado di in un solo flacone del set, tuttavia il grado di sovrapposizione è tale che per una data coltura questa sovrapposizione è tale che per una data coltura questa informazione non è in grado di predirne in modo informazione non è in grado di predirne in modo attendibile il significato clinico. attendibile il significato clinico.
Valutazione del numero di flaconi positivi all’interno di un set di emocolture
Algoritmo di Weinstein
Weinstein MP et al. J Clin Microbiol 2003, 41: 2275-2278
1 solo campione positivo su 1 inviato: “significato indeterminato” (se SCN) (il reparto deve contattare il laboratorio per ulteriori
approfondimenti diagnostici) 2-3 inviati ‘probabile contaminante’ (se SCN) (no identificazione di specie, no antibiogramma)
Weinstein MP et al. J Clin Microbiol 2003, 41: 2275-2278
2 o più campioni positivi per un probabile contaminante diverso da CoNS entro 48 ore: identificazione a livello di specie:identificazione a livello di specie: stessa specie - Test di sensibilità (AST) specie diverse - probabili contaminanti - No AST
2 o più campioni positivi per CoNS Identificazione a livello di specie AST Isolati con = profilo biochimico e = test di sensibilità Probabile siano identici (conferma solo con tipizzazione molecolare), aumenta il loro probabile significato clinico Identificazione e test di sensibilità riportato al clinico
Isolati con ≠ profilo biochimico o ≠ test di sensibilità Probabili contaminanti Riportata al clinico l’identificazione di 2 diversi CoNS, No AST
Tokars J.I. - CDCs Atlanta.Predictive value of blood cultures positive for coagulase-negative staphylococcci: implication for patient care and health care quality assurance. CID 2004; 39:333-41Coagulase negative staphylococci (CoNS) are the pathogens most commonly reported to cause central vascular line-associated bloodstream infections, accounting for 38% of such infections reported to the CDC’s National Nosocomial Infections Surveillance system during 1995-2002 (CDC unpublished data). However, CoNS are also common skin commensals that frequently contaminate blood cultures.A mathematical model to assist in the interpretation of blood culture results is presented. Although this model could be used for any organism or patient population, input parameter values were selected to apply to CoNS-positive blood cultures in patients with a central vascular line in place. Patients did not have an infection with a known source (e.g., endocarditis and surgical wound infection) other than a central vascular line. These results represent the first systematic calculation for various number of positive culture results among samples obtained either by vein or through a central vascular line.
Sensitivity and positive predictive value (PPV) of blood culture positive for coagulase-negative staphylococci among patients with central vascular lines (CVLs) in placeN° of culture performed
N° of positive culture results
All culture of sample obtained by vein
Sensitivity %a PPV
PPV by no. of culture of samples obtained by CVC
%1 2 3
1223
33
3
1121
32
2 or 3
80.431.564.69.3
52.038.0
90.0
55.419.998.04.7
100.090.9
95.9
38.714.296.23.6
99.985.8
93.5
…19.949.84.7
97.635.9
56.9
………4.7
4590.9
56.9NOTE. Initial parameter values (bacteriemia rate, 3%; contamination rate, 2%; detection rate, 80%; catheter colonizationn rate, 2%; risk ratio, 1; see Parameter Definitions and Values) were used for all calculation.
a: Equivalent to the percentage of true cases of bacteremia that will show the number of positive culture results among the number of cultures performed.
Source: Tokars J.I. - CDCs Atlanta. CID 2004; 39:333-41
Tokars J.I. - CDCs Atlanta.Predictive value of blood cultures positive for coagulase-negative staphylococcci: implication for patient care and health care quality assurance. CID 2004; 39:333-41
These results suggest the following rules for interpreting cultures positive fo CoNS:
for 1 positive result of 1 culture performed, the result is indeterminate;
for 1 positive result of 2 cultures performed, CoNS bacteremia is unlikely;
if 2 of 2 or 2-3 of 3 culture results are positive, CoNS bacteremia is very likely if at most 1 culture sample was obtained through a central vascular line.
If local rates of contamination and bacteremia are available, estimates of predictive value could be routinely provided along with blood culture results, thus assisting in both clinical decision-making and hospital quality assurance.
Question #2:(October 2002) Should antimicrobial susceptibility tests be performed routinely on
coagulase-negative staphylococci (CoNS) isolated from a single set of blood cultures?.
Answer:No. When only one set of multiple draws of blood cultures is positive with
CoNS, antimicrobial susceptibility tests need not be performed, sincethe organisms likely represent contaminants. Reporting antimicrobial susceptibility testing results for CoNS blood culture isolates sends themessage that the laboratory feels that the isolates are clinically significant. This may encourage the physician to treat the patient with vancomycin. In an effort to discourage inappropriate use ofantimicrobial agents, such as vancomycin, the prevailing practice is torefrain from testing CoNS isolated from a single set of blood cultures,unless specifically requested to do so by the physician.
Responses to these questions have been provided by J anet Hindler and Dr. Fred Tenover. These represent one strategy for dealing with the issues presented
Necessaria premessa: la crescita dei patogeni, che Necessaria premessa: la crescita dei patogeni, che normalmente sono presenti in grandi quantità, dovrebbe normalmente sono presenti in grandi quantità, dovrebbe essere rivelata in tempi più brevi rispetto ai essere rivelata in tempi più brevi rispetto ai contaminanti, che solitamente sono presenti in quantità contaminanti, che solitamente sono presenti in quantità più piccole.più piccole.
Tuttavia, pur avendo questo concetto una certa validità, Tuttavia, pur avendo questo concetto una certa validità, il grado di sovrapposizione del tempo di rilevazione tra i il grado di sovrapposizione del tempo di rilevazione tra i veri patogeni ed i contaminanti è tale che questa veri patogeni ed i contaminanti è tale che questa variabile non può essere utilizzata come fattore variabile non può essere utilizzata come fattore predittivo di una coltura vera-positiva.predittivo di una coltura vera-positiva.
Inoltre, con il largo utilizzo dei sistemi colturali Inoltre, con il largo utilizzo dei sistemi colturali automatici a monitoraggio continuo dei flaconi di automatici a monitoraggio continuo dei flaconi di emocolture e la concomitante riduzione dei tempi di emocolture e la concomitante riduzione dei tempi di rivelazione della crescita, le differenze di tempo tra la rivelazione della crescita, le differenze di tempo tra la rivelazione dei veri patogeni e dei contaminanti risultano rivelazione dei veri patogeni e dei contaminanti risultano talvolta poco significative.talvolta poco significative.
Il tempo necessario perchè l’emocoltura venga rilevata come positiva
EMOCOLTURAgiudizio di positività
giorni di positività e positività multiple
1 giorno 2 giorni 3 giorni 4 o più giorni
Il Tempo di positivizzazione puo’ essere inversamente proporzionale al ruolo patogeno del microrganismo
Più di un flacone positivo > probabilità di vera batteriemia
Interpretazione dei risultati (2)In caso di isolamento dello stesso stipite di Stafilococchi
coaugulasi negativi, Corinebatteri, Streptococcus viridans, Micrococcus spp, Bacillus spp.’si propone il seguente algoritmo
Caso 11 sangue da periferico POS *possibile patogeno, valutare la clinica e se
necessario eseguire ulteriori prelievi nelle 24 ore1 sangue da periferico POS
Caso 21 sangue da periferico POS Probabile contaminante valutare la clinica e se
necessario eseguire ulteriori prelievi nelle 24 ore1 sangue da periferico NEG
Caso 31 sangue da catetere POS
*Significativo, patogeno 1 sangue da periferico POS
Se l’intervallo tempo di positivizzazione dei 2 flaconi è > 120 min. è altamente probabile infezione correlata a catetere.
Caso 41 sangue da catetere NEG
*Probabile contaminante/colonizzante, valutare la clinica e il rischio per il paziente;
se necessario ripetere I prelievi nelle 24 ore.
1 sangue da periferico POS
N.B. Per interpretare correttamente il risultato, è fondamentale poter risalire esattamente alla tipologia di prelievo e all’ora del prelievo(da catetere o da vena periferica), mediante la sigla scritta sul flacone, al momento del inoculo in reparto.
Interpretazione dei risultati (5)
Casistica “altamente suggestiva” per considerare un CONS contaminante:
1 emocoltura pos seguita da emocolture neg 1 set pos su 2 ottenute simultaneamente 2 set pos, ma separati da un intervallo di
tempo con piu’ di un set negativo solo un flacone pos (aerobio o anaerobio)
di un set
Interpretazione dei risultati (6)
Possibili Criteri di laboratorio per assistere il clinico nell’ assegnare un significato di patogeno o contaminante ad un microrganismo che appartiene alla flora cutanea.
1) CNS, P.acnes, Corynebacterium spp. o Bacillus spp. isoalti da 1 di parecchie colture
2) crescita di piu’ di un microrganismo da parecchie colture
3)isolamento da emocolture di un microrganismo che differisce dall’organismo causa dell’infezione nel sito primario dell’infezione stessa.
4)tempo di positivizzazione
interpretazione risultati : falsi negativi
Terapia antimicrobica (60% dei negativi) UremiaPrincipali cause legate a microrganismi cosidetti
“difficili” Batteri del gruppo HACEK Abiotrophia :”Nutritionally variant streptococci” Miceti Nocardia spp Bartonella spp Altri batteri a lento o lentissimo sviluppo
Principali cause legate a microrganismi coltivabili solo conmetodiche specifiche e quindi da prelevare ed inviare al laboratorio con modalità diverse:
Micobatteri Leptospira spp Legionella spp. Borellia sppPrincipali cause legate a microrganismi non coltivabili nei
comuni terreni da emocoltura e pertanto evidenziabili mediante prove sierologiche, colture cellulari o, se disponibili, tecniche molecolari
Chlamydia spp. Coxiella burneti (febbre Q) Altre Rickettsie Tropherina whippleri (Whipple disease bacillus
diagnosi di laboratorio delle diagnosi di laboratorio delle micosi invasive : isolamento da micosi invasive : isolamento da
sanguesangue Isolamento da sangue diagnosi di micosi invasiva
58% lisi centrifugazione/pcr Scarsa sensibilità ( 50%) per i lieviti
50-
58%automatizzati
Scarsissima sensibilità ( 0%) per Aspergillus
Criteri per la diagnosi di endocardite infettiva (1)(“Duke criteria” di Durak et al., - modificati da Li et al., 2000)
Endocardite certa
Criteri Criteri anatomoanatomo--patologicipatologici Criteri cliniciCriteri clinici
• Microrganismi dimostrati mediante coltura o esame istologico in una vegetazione o in un embolo originato da una vegetazione o da un ascesso intracardiaco
• Documentazione istopatologica di endocardite attiva su di una vegetazione o ascesso intracardiaco
oppureoppure
• 2 criteri maggiori
• 1 criterio maggiore e 3 minori
oppureoppure
• 5 criteri minori
oppureoppure
Criteri per la diagnosi di endocardite infettiva (2)(“Duke criteria” di Durak et al., - modificati da Li et al., 2000)
Endocardite possibileEndocardite possibile Endocardite esclusaEndocardite esclusa
• Nessuna evidenza di E.I. all’intervento chirurgico o all’autopsia di un pz. che ha ricevuto terapia antibiotica per 4 giorni
• Sicura diagnosi alternativa.
• Risoluzione della malattia con una terapia antibiotica di durata 4 giorni
• Non soddisfazione dei criteri di “endocardite possibile”
• 1 criterio maggiore e 1 criterio minore
• 3 criteri minori
oppureoppure
Criteri per la diagnosi di endocardite infettiva (3)(“Duke criteria” di Durak et al., - modificati da Li et al., 2000)
1) Emocolture positive per endocardite infettivaa) Microrganismi tipici di E.I. isolati da 2 emocolture
separate (streptococchi viridanti, Str. bovis, Staph. aureus, HACEK group, enterococchi acquisiti in comunità in assenza di un focolaio infettivo primario).
b) Isolamento ripetuto di microrganismi potenzialmente responsabili di E.I.:
– almeno 2 emocolture prelevate a più di 12 ore di distanza;
– 3 emocolture o la maggioranza di 4 o più emocolture prelevate in un intervallo di tempo di almeno 1 ora tra la prima e l’ultima;
c) per Coxiella burnetii un titolo di anticorpi IgG > 1/800.
oppureoppure
oppureoppure
CRITERI CLINICI MAGGIORICRITERI CLINICI MAGGIORI
Criteri per la diagnosi di endocardite infettiva (4)(“Duke criteria” di Durak et al., - modificati da Li et al., 2000)
2) Evidenza di interessamento endocardicoa) Ecocardiogramma significativo per E.I. (quello
transesofageo è raccomandato nei pz. con valvole protesiche o classificati come “endocardite possibile” in base a criteri clinici o affetti da complicazioni – es.: ascesso paravalvolare) definito come segue:
– massa intracardiaca oscillante su valvola, su strutture di supporto o entro un flusso di rigurgito o su materiale impiantato, in assenza di una spiegazione anatomica alternativa
– ascesso
– nuova deiscenza parziale di valvola protesica
b) Comparsa di nuovo rigurgito valvolare (l’aumento o la modificazione di un soffio preesistente non è un criterio sufficiente).
CRITERI CLINICI MAGGIORICRITERI CLINICI MAGGIORI
Criteri per la diagnosi di endocardite infettiva (5)(“Duke criteria” di Durak et al., - modificati da Li et al., 2000)
1) Fattori cardiaci predisponenti o tossicodipendenza e.v.
2) Febbre 38°C.
3) Fenomeni vascolari (emboli arteriosi, infarti polmonari settici, aneurisma micotico, emorragia cerebrale o congiuntivale, lesioni di Janeway).
4) Fenomeni immunologici (glomerulonefrite, noduli di Osler, macchie di Roth, fattore reumatoide).
5) Evidenza microbologica (emocolture positive* che non soddisfano i criteri maggiori, evidenza sierologica di un’infezione attiva dovuta a microrganismi potenzialmente responsabili di E.I.).
** Escluso singole emocolture positive per stafilococchi Escluso singole emocolture positive per stafilococchi coagulasi-negativi o per microrganismi che non causano E.I.coagulasi-negativi o per microrganismi che non causano E.I.
CRITERI CLINICI MINORICRITERI CLINICI MINORI
Endocarditi a emocoltura negativa (1)
CAUSE PRINCIPALI: uso terapia antibiotica durante o prima dei prelievi
colturali presenza di microrganismi che non crescono nei
terreni convenzionali
INOLTRE: infezioni che durano da oltre tre mesi uremia endocarditi murali o da “pace-maker” endocarditi non infettive diagnosi errata di E.I.
Endocarditi infettiveInfezioni setticemiche a focolaio sepsigeno endocardico
Agenti eziologici: schizomiceti, miceti, rickettsie, clamidie
Streptococcus viridans ( ~ 40%) Streptococcus faecalis (~ 25-30%) Staphylococcus aureus o epidermidis (~ 20%) Batteri gram-negativi Candida spp. C. burneti, R. prowazeki ecc., ecc.
Endocarditi a emocoltura negativa (10%)
Eziologia delle E.I.
Valvola nativa Valvola protesica (%) (%)
Streptococcus spp. 45 - 65 1 - 33Staph. aureus 30 - 40 10 - 24 Staf. coagulasi-negativo 4 - 8 10 - 35Enterococcus spp. 5 - 8 5 - 15Batteri gram-negativi 4 - 10 2 - 15HACEK 3 - 10 3 - 8Miceti 1 - 3 1 - 15
(New Engl J Med 2001; 345: 1318-30)
Unusual causes of bacterial endocarditis
Gram-positive bacilli Gram-negative bacilliListeria LegionellaCorynebacterium CoxiellaBacillus BrucellaErysipelothrix NeisseriaLactobacillus BranhamellaClostridium VibrioPropionibacteria VeillonellaRothia Bartonella
Arachnia OtherActinomyces ChlamydiaMycobacteria MycoplasmaNocardia
Diagnostica biomolecolare (PCR)
• L’amplificazione genica eseguita con PCR a largo spettro (es.: 16S rRNA gene), seguita dal sequenziamento diretto dell’amplicone, è una tecnica che ha dato buoni risultati se applicata alle valvole rimosse chirurgicamente di pz. con E.I.
• Non è ancora chiaro se essa può essere applicata, negli stadi iniziali della malattia, sulle cellule mononucleate del sangue periferico o sul siero di pazienti con emocolture negative.
Criteri di duke per la diagnosi di E.B.La diagnosi è definita se vi sono 2 criteri maggiori o 1
criterio maggiore e 3 minori o 5 criteri minori.
CRITERI MAGGIORI • Emocolture positive ( 2/2)• Interessamento endocardico (nuovo soffio o
ecocardiogramma positivo)
CRITERI MINORI 1) Fattori predisponenti cardiaci o tossicodipendenza2) Febbre3) Fenomeni immunologici (glomerulonefrite, Osler,
Roth spots, fattore reumatoide)4) Ecocardiogramma compatibile ma non diagnostico5) Fenomeni vascolari: emboli, petecchie, ecc.6) Emocolture positive ma non diagnostiche o evidenza
sierologica di infezione batterica
• 13 % delle infezioni ospedaliere
• 20 % di tutte le sepsi
• 50 - 100.000 casi anno negli USA
Sepsi da CVC
Sintomi aspecifici
Febbre / SIRSFebbre dopo l’infusione
Il CVC può essere la fonte ?
Batteriemia CVC correlata
Rimozione del CVC
… ma siamo sicuri che fosse una batteriemia CVC-correlata davvero ?
- CVC-BSI nel 15 – 25 % dei casi
- 75 – 85 % dei CVC sono rimossi inutilmente !
Batteriemia CVC correlata
- Coltura del CVC solo se sospetto CVC batteriemia BII
- Coltura semiquantitava/quantitativa della punta AII
- Coltura qualitativa in brodo: no EII
- Segmenti di CVC: punta o segmento BIII
- Arancio di acridina BII
- Due set di emocolture, almeno una periferica AII
- Emocolture - Tempo differenziale di crescita AII
Differential Time to PositivityOf Hub vs Peripheral Blood Culture
Study SettingN°
patients
Blood culture system
Golden standard
Reynders, 2001
Bussy, 2001
Seifert, 2003
Gaur, 2003
Blot, 1999
Blot, 1998
Med-surg. ICU
Cancer Centres
Hemato-onco dept.
Pediatric Cancer
Centre
ICU, Cancer Centre
Cancer Center
10
30
51
33
28
64
BacT/Alert
BacT/Alert
Bactec Plus A/AnaBactec Plus A/Ana
Vital
Vital
Quantitative KT (Sherertz)
Paired Isolator > 5H/P
Quantitative KT (Brun-Buisson)
Quantitative KT (Brun-Buisson)
Paired Isolator > 5H/P
Paired Isolator > 5H/P
Differential Time to PositivityOf Hub vs Peripheral Blood Culture
Study SettingSignificant
DTPSensitivity
%Specificity
%
Reynders, 2001
Bussy, 2001
Seifert, 2003
Gaur, 2003
Blot, 1999
Blot, 1998
Med-surg. ICU
Cancer Centres
Hemato-onco dept.
Pediatric Cancer
Centre
ICU, Cancer Centre
Cancer Center
No
Yes (3 ore)
Yes (2 ore)
Yes (2 ore)
Yes (2 ore)
Yes (2 ore)
25
81
82
89
94
97
43
100
100
91
88
100
Conclusione: Sepsi correlata catetere
la diagnosi si avvale di: isolamento dello stesso microrganismo dal
sangue da vena periferica e da catetere differenza del tempo di positivizzazione tra Sg
e SgCV > 120 min. se le emocolture sono state eseguite alla stessa ora di prelievo.
isolamento dello stesso microrganismo da emocoltura e da coltura semi-quantitativa o quantitativa del catetere.
Unresolved Question
Difference in Time to Positivity (DTP) in paired blood cultures: short-term percutaneous catheter? patients with prior antibiotic therapy?
Discrimination of contaminant from infecting CoNS serodiagnosis (lipid S, other antigens ?) biofilm determinants ?? molecular typing ? Frequency of polyclonal infection ?
Use of collection method that increase the chances for sterility: Obtaining blood via venipuncture rather than from an intravascular catheter Using a two-needle rather than a single-needle technique
Some antiseptic preparations may be more efficacious than other in reducing contamination rates.
Trained phlebotomists or blood culture teams can reduce contamination rates in individual institutions
REDUCING THE NUMBER OF REDUCING THE NUMBER OF CONTAMINATED BLOOD CULTURES CONTAMINATED BLOOD CULTURES
Although is not possible to achieve contamination rates of zero or even close to zero, there are potential means by which contamination can be reduced
TABLE 1. Clinical significance of results of concurrent intravascular catheter-drawn and direct venipuncture
blood cultures
Clinical significance of blood culture results
No. of samples (%)
Catheter-drawn
Direct venipuncture
True bloodstream infection 203 (14.4) 193 (13.7)
Contamination 54 (3.8) * 26 (1.8) *
Indeterminate 23 (1.6) 12 (0.9)
Negative 1,128 (80.1)
1,177 (83.6)
Total 1,408 (100)
1,408 (100)
Everts R.J., E.N. Vinson, P. O. Adholla, and L.b. Reller.gContamination of Catheter-Drawn Blood CulturesJCM 2001. 39:3393-3394
* P = 0.001
Norberg A., Christopher N.C., Ramundo M.L., Bower J.R, Berman S.A.Norberg A., Christopher N.C., Ramundo M.L., Bower J.R, Berman S.A.Contamination rates of blood culture obtained by dedicated phlebotomy vs Contamination rates of blood culture obtained by dedicated phlebotomy vs intravenous catheter intravenous catheter JAMAJAMA 2003;289:726-729 2003;289:726-729
Objective: to compare contamination rates in blood culture specimens obtained from separated sites vs through newly inserted intravenous
catheters among patients age 18 years or younger
Contaminants
Coagulase-negative staphylococci
Streptococcus viridans
Corynebacterium species
Micrococcus species
Bacillus species
Propionibacterium acnes
Neisseria species
Others
Total No. of Organisms
Catheter-drawn* Direct venipuncture**
No. of organisms(% of Total contaminated specimens)
140 (73)
57 (30)
13 (7)
13 (7)
3 (1.6)
4 (2)
3 (1.6)
10 (5)
243
37 (67)
8 (14)
7 (12)
5 (8)
3 (5)
0
0
5 (8)
65
Conclusion: The false positive blood culture rate decreased from 9.1% to 2.8% (P<0.001)
Contamination rates in percent of blood cultures drawn by phlebotomy team vs. nonphlebotomy
teamFacilities in which
most cultures were drawn by a team of
phlebotomists
Facilities in which most cultures were
drawn by nonphlebotomists
Weinbaum, et al. (Unit A)
1.2% 8.4%
Weinbaum, et al. (Unit B)
1.0% 4.8%
Schifman, et al. 2.2% 3.9%
Weinbaum FI., Lavie S., Danek M., Sixsmith D., Hainrich G., Mills S. Doing it right the first time. Quality improvement and the contaminant blood culture. J Clin Microbiol. 1997;35(9):563-565
Schifman R., Strand C., Meier F., Hawanitz P. Blood culture contamination. Arch Pathol Lab Med. 1998; 122:216-220
Criticità del prelievo per le indagini microbiologiche
Preparazione del paziente Ora del prelievo rispetto all’ora
dell’accettazione Modalità di prelievo Modalita di conservazione Tempo impiegato per il trasporto
Attualmente controllare sistematicamente questo processo non è possibile:
Monitoraggio dell’ora del prelievo(limite della compilazione manuale delle richieste)
Identificazione, nella fase post-analitica, di indicatori di qualità del prelievo
Nel 90% dei campioni è stata segnalata la data del prelievoNel 40% dei campioni è stata segnalata l’ora del prelievo
mar-03 in giornatagiorno prima dopo le ore
11
il sabato per il lunedì
3 gg prima
4 gg prima
TOT
CP NON note
AMB 12 (100%)
DH 25 (100%)
RICOV 74 (66%) 55 10 2 1
TOT 111 55 10 2 1 179
% 62% 30,7% 5,6% 1,1% 0,6%
Nel 12,2% dei campioni per coprocoltura è nota l’ora /data del prelievoNel 34,1% dei campioni di ricoverati è segnalata l’ora/data del prelievo per coprocoltura
gen-05NON specific
in giornatagiorno prima dopo le ore
11
il sabato per il lunedì
TOT
CP tutti
AMB
DH
RICOV 169 39 13 5 226
TOT 410 39 13 5 467
241 241
Indicatore di qualità del prelievo rilevabile nella fase post-analitica:
% di urinocolture con flora da probabile contaminazione
La raccolta và eseguita seguendo le corrette modalità di prelievo indicate dal Manuale dei Laboratori 2) Devono essere processate entro 2 ore dal prelievo3) La conservazione è prevista a 4-8 ° per un massimo di 12-24 ore , oppure 4) la raccolta và eseguita in appositi contenitori con stabilizzante (acido borico o altri sistemi disponibili in commercio) fino a 48 ore a T.amb4) Le urine raccolte con sacchetto, nell’età pediatrica, sono attendibili solo se il risultato è negativo
Perché è importante raccogliere l’urina del primo mattino ?
Perché si ha la massima concentrazione di batteri.
L’urinocoltura è un’esame quali-quantitativo
e l’espressione della carica batterica è inversamente proporzionale al grado d’idratazione.
Basse cariche batteriche possono comportare un risultato falsamente negativo
Percentuale di urincolture con esito di flora mista da prob.contaminazione
2003 N°URINOCOLTURE N° FMPC % FMPC
RICOVERATI 6625 1166 18%
Centro Prelievi 5591 755 14%
DH 1266 165 13%
AMB 1018 94 9%
TOT 14500 2180 15%
Percentuale di urinocolture con esito di flore miste da probl.contaminazione
2004 N° URINOCOLTURE N° FMPC % FMPC Diff %
RICOVERATI 6417 798 12% -6%
Centro prelievi 5110 602 12% 2%
DH 1404 147 10% -3%
AMB 1506 100 7% 2%
altri 228 25 11% nc
TOT 14665 1672 11% -4%
Urina dopo T >2 ore circa del prelievo a T amb.
Urina appena raccolta
Urina dopo T > 4 ore dal prelievo a T amb.
Urina dopoT > 6 ore dal prelievo a T amb
(Very) major error
……una urinocoltura negativa ……
viene refertata PositivaCon conseguente: Identificazione ed antibiogramma eseguiti
inutilmente su “tracce” di un microrganismo colonizzante
Possibile trattamento antibiotico non necessario
Table 2. Generation times for some common bacteria under optimal conditions of growth.
Bacterium Generation Time (minutes)
Escherichia coli 17
Bacillus megaterium 25
Streptococcus lactis 26
Streptococcus lactis 48
Staphylococcus aureus 27-30
Lactobacillus acidophilus 66-87
Rhizobium japonicum 344-461
Mycobacterium tuberculosis 792-932
Treponema pallidum 1980
L’isolamento di un microrganismo da un’ emocoltura di un neonato con sintomi clinici di infezione costituisce la comune definizione di sepsi.
In caso di Stafilococchi coaug.neg., molti studi recenti richiedono l’isolamento dello stesso microrganismo da due emocolture o da una singola emocoltura con altre evidenze di laboratorio di sepsi, come un elevato valore di PCR.
Lo schema di classificazione adottato per pazienti pediatrici ed adulti, con le quattro categorie di sepsi, non puo’ essere adottato per i neonati. Lo sviluppo di “neonatal sepsis scale” richiede una piu’ rigorosa definizione di sepsi clinica nei neonati con una miglior correlazione con l’outcome e una piu’ consistente interpretazione degli studi di ricerca clinici ed epidemiologici.
Infezione delle vie urinarie:
è generalmente definita come la crescita di almeno 100 CFU /ml da un campione ottenuto da puntura sovrapubica o di almeno 10.000 CFU/ml da un prelievo mediante cateterizzazione sterile. Conte inferiori possono essere indicative di infezione in bambini pre-termine, in particolare se viene isolato Candida spp. O un gram-negativo.
L’urinocoltura non è indicata nella valutazione delle EONS dal momento che l’urina è sterile nelle prime 48-72 ore di vita. Tuttavia, l’urinocoltura dovrebbe essere ottenuta in tutte le valutazioni di sepsi oltre 3 gg di vita, dal momento che la manifestazione clinica di UTI e sepsi sono simili.
Diagnosi di meningite:
L’isolamento di un microrganismo da liquor in un bambino pretermine è generalmente considerato evidenza di meningite. La diagnosi di meningite è problematica nei bambini VLBW dal momento che il prelievo lombare viene spesso eseguito dopo la somministrazione di antibiotici. Inoltre dal momento che la meningite puo’ decorrere senza setticemia e che le emocolture possono essere falsamente negative , questo puo’ sottostimare il trattamento per meningite nei VLBW.
Diagnosi di polmonite:
La polmonite rimane la piu’ difficile infezione da diagnosticare nei bambini pre-termine. I microrganismi coltivati dal tubo endotracheale spesso rappresentano colonizzanti piuttosto che responsabili di polmonite. La coltura quantitativa puo’ essere d’aiuto.
Il “gold standard” per la diagnosi di sepsi neonatale rimangono le emocolture, sebbene in molti casi siano negative . In uno studio condotto nel 1999 sulle autopsie di ELBW bambini, con infezione considerata la prima causa di decesso, nel 61% dei neonati le emocolture eseguite prime della morte erano negative. L’antibiotico somministrato alla madre nella maggior parte dei parti pre-termine puo’ sopprimere la crescita batterica dalle emocolture. Risultati falsi negativi in neonati con sospetta sepsi , si possono avere a causa di insufficiente inoculo di sangue . In uno studio prospettico di circa 300 emocolture, il volume prelevato era meno di 0,5 ml di sangue. Le difficoltà tecniche di prelievo nei bambini pretermine decresce la sensibilità dell’emocoltura per la diagnosi di sepsi.
Non culture microbiological method for predicting bloodstream infection
Antigen detection : usato in passato su liquor e urine per la presenza di GBS, ha una sensibilità che và dal 72 al 89 % per il liquor e debolmente piu’ bassa per le urine.
Diagnostica molecolare: la determinazione di batteri nel sangue avviene mediante PCR del gene 16S rRNA, presente nei batteri ma assente nell’uomo. Il rilevamento di meno di 10 microrganismi per ml da sangue intero è stato riportato e ricerche per migliorare la sensibilità del metodo e per automatizzare il processo sono in corso.
Studio di Jordan et coll. 548 campioni appaiati di sangue/emocolture da bambini in NICU con sospetta sepsi: di 25 prelievi con emocolture positive, 24 erano positive con PCR con risultato disponibile in 9 ore con possibilità di discriminare tra gram positivi e gram negativi.
Sensibilità, specificità, VPP, VPN, = 96, 99,4, 88,9 , 99,8 %
La determinazione della fungemia mediante PCR è un’importante area di studio:
confrontata con le emocolture la PCR ha una sensibilità e specificità del 100% e 98%.
Studio Jordan et al: 9 positivi sia con PCR che con emocoltura,
44 negativi con entrambi i metodi,
3 positivi con panfungal e negativi alle emocolture con evidenza di infezione invasiva da miceti (segni di sepsi ed in 2 casi candiduria, 1 caso con peritonite da Candida).
Tra le nuove metodiche vi è la real time PCR quantitativa. Che necessita di trials clinici per stabilirne l’utilità nel predire la presenza o assenza di infezione disseminata da miceti o da batteri.
•Endotoxin Activity Assay (EAA) approved FDA•i risultati sono disponibili in 1-2 ore•Utilità clinica è oggetto di studi•alto V.P.N. (>98%) da studio multicentrico-internazionale di 529 pz.
dell’ICU (MEDIC study)
• Le colture microbiologiche rappresentano il gold-standard, ma presentano limiti dovuti alla sensibilità, ai tempi per la disponibilità dei risultati e alla contaminazione dei campioni.
• inoltre mentre esistono dei criteri interpretativi per valutare i risultati positivi,non esistono tutt’ora criteri standardizzati per valutare le colture con esito negativo, in caso di elevato sospetto di infezione.
• L’EAA potrebbe rappresentare un nuovo test diagnostico nell’algoritmo decisionale del clinico nell’iniziale sospetto di sepsi da gram-negativi.
Vantaggi: rilevare la presenza del prodotto del microrganismo patogeno anche quando il microrganismo non è in circolo per azione dell’antibiotico o per traslocazione dall’intestino nei pazienti a rischio. Ci sono molte evidenze che l’endotossina è il principale iniziatore nella patogenesi della sepsi, con possibilità di diagnosi precoce.
Svantaggi: dosaggio limitato ai gram negativi.
La presenza in circolo dell’endotossina in circolo puo’ avvenire per cause diverse dall’infezione.
La molecola dell’endotossina complessata ad una proteina carrier del siero , nota come lipopolysaccharide-binding protein (LPS), si lega alle cellule dell’ospite attraverso un specifico recettore CD14. Il legame con CD14 e l’attivazione di un recettore noto come toll-likereceptor 4 (tlr4) risulta nell’attivazione cellulare, con la sintesi e il rilascio di mediatori che producono la sindrome clinica della sepsi.
Il saggio è stato sviluppato per dosare l’endotossina da sangue intero; si basa sulla formazione dell’immuno-complesso endotossina-IgM che viene completamente opsonizzato e successivamente sottoposto all’attività di “burst” respiratoria dei neutrofili. Questo processo è incrementato dalla sostituzione del neutrofilo con zymosan e viene misurato il rilascio di acido ipocloro mediante le sua reazione con luminol e con conseguente chemioluminescenza nella reazione con il buffer. L’intensità del “respiratory burst” è correlata con la bio-attività dell’endotossina mediante una curva iperbolica di risposta. I valori di cut-off di EA sono espressi, in associazione con il consensus conference della definizione di sepsi, in <0,4 neg; 0,40-0,60 borderline; > 0,60 pos.
Marcatori bioumorali e rischio di evoluzione Marcatori bioumorali e rischio di evoluzione
IL-6
TNF-α
Procalcitonina
Adrenomedullina
CD4 solubile
Proteina 1α macrofagica
Fosfolipasi A2 extracellulare
Le manifestazioni cliniche della SIRS sono proteiformi, gli aspetti biochimici possono essere più consistenti
Polimorfismo genetico delle molecole Polimorfismo genetico delle molecole infiammatorieinfiammatorie
IL-1α e IL-1β
IL-6
IL-10
IFN-γ
TNF-α
TGF-β
L’allele TNF2, meno comune, è associato ad incrementato rischio di morte nelle popolazioni settiche
Mira JP / Wax RS / Vincent JL
Abstract: Purpose of review: The purpose of this review is to indicate recent developments in biomarkers of sepsis and to evaluate their impact on clinical use. According to the 'surviving sepsis campaign,' diagnosis of sepsis and infection is urgent; early and specific treatment is most effective to reduce complications and to decrease mortality.
Recent findings: A variety of biomarkers of sepsis is presently available. The diagnostic spectrum of the various markers, however, is different. Some primarily indicate severity of inflammation (e.g. interleukin-6), others respond to infection, but do not indicate the host response well (endotoxin, lipoprotein binding protein, triggering receptor on myeloid cells). There are new markers with limited clinical experience, for example triggering receptor on myeloid cells or mid-pro atrial natriuretic peptide (Seristra, Brahms AG, Hennigsdorf, Germany). Procalcitonin is a well-established biomarker of sepsis that fulfills several criteria of clinical needs: it responds both to infection and severity of inflammation and thus has an impact on therapy. Recent studies indicate that antibiotic treatment can also be guided by procalcitonin. Further indications, including diagnosis of invasive bacterial infections and diagnosis of sepsis in neonates and children have been reported recently.
Biomarkers of sepsis: clinically useful? Current Opinion in Critical Care. 11(5):473-480, October 2005.Meisner, Michael
Summary: Recent data and cumulative analyses indicate that biomarkers of sepsis improve diagnosis of sepsis. However, only a few markers have impact on therapy and fulfill the clinical requirements. Procalcitonin is a well-established marker, indicating infection, sepsis, and progression to the more severe stages of the disease. Today, this biomarker should be in the diagnostic portfolio of an intensive care unit or emergency ward.
2005 Lippincott Williams & Wilkins, Inc.
Nuovi scenari nella diagnosi microbiologica di
sepsi
Rapid Diagnosis of Bacterial Sepsis with PCR Amplification and Microarray Hybridization
in 16S rRNA Gene SHIQIANG SHANG, GUOXIAN CHEN, YIDONG WU, LIZHONG DU and ZHENGYAN ZHAO Lab Center [S.S., Y.W.], Department of Neonatology [L.D., Z.Z.], Affiliated Children's Hospital of Medical College, Zhejiang University, Hangzhou 310003, P.R. China, Department of Burn Injuries [G.C.], The Second Affiliated Hospital of Medical College, Zhejiang University, Hangzhou 310009, P.R. China
Lab-on-Chip enables rapid bacterial diagnosis.
September 29, 2005 - Designed for DNA-based detection of sepsis-causing bacteria, lab-on-chip is based on In-Check platform with diagnostic panel from Mobidiag. In-Check has integrated low-density microarray and amplifies clinically relevant DNA samples by PCR analysis. Microreactors buried in MEMS chip carry mixture of sample and reagents, while on-chip heating elements perform temperature cycling. Chip interfaces to thermal control system that actuates, monitors, and adjusts parameters of reaction.
News Story
Release date: September 14, 2005STMicroelectronics and Mobidiag Unveil Lab-on-
Chip for Rapid Bacterial Diagnosis
Boston, September 14, 2005 - STMicroelectronics (NYSE: STM) and Mobidiag today introduced a new lab-on-chip application for DNA-based detection of sepsis-causing bacteria, using a diagnostic panel from Mobidiag that runs on ST's In-Check platform. Providing faster and more reliable results at a fraction of cost and complexity of conventional laboratory systems, the miniaturized compact solution enables early detection of disease, resulting in better treatment choices for patients and lower overall costs to the healthcare systems.
The In-Check platform hosts a pathogen panel developed by Mobidiag to identify ten sepsis-causing bacterial species as well as methicillin-resistant strains of Staphylococcus aureus from positive blood culture samples. The diagnostic panel has been designed to optimize the choice of antibiotic therapy in combination with results from Gram-staining, an empirical comparative method of differentiating bacterial species. As a result, highly accurate and rapid results from the ST/Mobidiag solution will reduce the risks of antibiotic misuse and help physicians select the right treatment as early as possible.
ST In-Check lab-on-chip platform amplifies clinically relevant DNA samples by Polymerase Chain Reaction (PCR) and has an integrated custom low-density microarray. Microreactors buried in the micro-electro-mechanical-system (MEMS) chip carry the mixture of sample and reagents, while on-chip heating elements perform the temperature cycling. Silicon's low thermal capacity and the In-Check design features significantly reduce reaction times and costs, compared with standard laboratory Advertisement equipment. The risks of cross-contamination inherent in conventional analysis methods are minimized, too, as the PCR and analysis is performed on chip in an encapsulated, self-contained unit.The lab-on-chip interfaces to the Thermal Control System (TCS) that actuates, monitors, and adjusts the parameters of the reaction. The TCS unit comprises five
The lab-on-chip interfaces to the Thermal Control System (TCS) that actuates, monitors, and adjusts the parameters of the reaction. The TCS unit comprises five control modules with independent thermal protocols and random access capability. Optical signal acquisition is performed by a dedicated portable reader and processed by ST's specialized bioinformatics software, which can be installed on any PC and operates with Mobidiag's clinical reporting user interface. This software package allows users to easily monitor and control the reaction processes, analyze the results, and generate reports compliant with MIAME (Minimum Information About a Microarray Experiment) standards for unambiguous interpretation of data from DNA tests.
"The unique combination of ST's leading-edge semiconductor and MEMS expertise with Mobidiag's know-how in microbiological diagnostics opens new possibilities for effective detection and treatment of infectious diseases at the point of need," said Anton Hofmeister, Group Vice-President and General Manager for ST's Microfluidic Division. "We believe that affordable, user-friendly, and portable devices like the In-Check are set to make a critical difference in a growing number of diagnostic applications."
"Early detection of systemic bacterial infections is essential for the successful management of antibiotic therapy, and we look forward to addressing the needs of laboratories that perform millions of blood cultures every year in our target markets," added Jaakko Pellosniemi, CEO of Mobidiag. "The In-Check platform is ideally suited to exploit the advantages of Mobidiag's unique diagnostic microbiological panels. Our product will markedly improve the quality of treatment choices, leading to better patient outcomes and reduced healthcare costs."
After one year of joint development based on early prototypes, first units of In-Check lab-on-chips together with the control instruments are now shipping to Mobidiag for validation. Clinical trials are planned for early 2006, with the final product including validated controls, assay optimization, and diagnostic reporting software to be launched later next year .
About MobidiagMobidiag, based in Helsinki, Finland, develops proprietary biochip assays for common infectious diseases, such as sepsis, pneumonia, and meningitis. In addition to bacterial pathogens the company has also developed methods to identify antibiotic resistance markers with biochip technology. In the longer term, Mobidiag will focus on providing rapid point-of-care (POC) solutions for diagnosing high-incidence outpatient diseases, including respiratory and urinary infections. Further information on Mobidiag can be found at www.mobidiag.com.
STMicroelectronics and Mobidiag Unveil Lab-on-Chip for Rapid Bacterial Diagnosis
Wednesday September 14, 6:00 am ET Faster, Less Expensive, and More Accurate Detection of
Infectious Diseases Will Lead to Better Treatment Choices ST at Chips-to-Hits,
Boston Convention & Expo Center, 12-15 September,
The Prove It™ products are based on biochip technology combining an optimized broad-range PCR method and DNA microarrays in a miniaturized, integrated format. Mobidiag has partnered with STMicroelectronics to provide a complete diagnostic solution including biochip assays, instrumentation as well as analysis software for the interpretation of results.
In a conventional laboratory the complete analysis process requires bulky and costly equipment and often takes 2-3 days. With the Prove It™ biochip system, the whole process can be completed in 2.5 hours, including all sample preparation steps. In addition, the Prove It™ tests require only very small quantities of the costly reagents used for DNA tests.
One platform - multiple applications The Prove It™ product family offers unprecedented speed and accuracy for microbial diagnostics. The first Prove It™ biochips are targeted at life-threatening bacterial infections such as sepsis and pneumonia. The test panels are designed to include the most common pathogens causing these bacterial infections worldwide as well as clinically relevant antibiotic resistance markers.
Key advantages of Prove It™ products Simultaneous detection of a large number of
disease markers Results in 2.5 hours Suitable for several sample types and
different applications Increased accuracy and reliability compared
to currently available diagnostic methods Compact and affordable equipment
Mobidiag develops the innovative Prove It™ DNA diagnostic solution for the detection of microbes and antibiotic resistance. The key benefits of Mobidiag’s new biochip technology for clinical laboratories are speed, accuracy, and ease of use. The first biochips, developed in collaboration with platform partners, will be available in Europe in 2006.The mission of Mobidiag is to improve the quality of healthcare and fight antimicrobial resistance by providing rapid and reliable molecular diagnostic assays and devices for infectious disease testing. The company’s products provide fast and accurate information about infections to enable more enlightened treatment decisions and better patient outcomes.News:September 15, 2005 - Mobidiag and STMicroelectronics unveil Lab-on-Chip for Rapid Bacterial Diagnosis [Read More] 15.9.2005 - Mobidiag ja STMicroelectronics julkistavat uuden biosirun bakteerien diagnosointiin [Lue Lisää]
Products
Lab-Arraytor(R) human 60-1 Lab-Arraytor(R) human 60-2 Lab-Arraytor(R) human 60-3 Lab-Arraytor(R) human 60-4 Lab-Arraytor(R) human 60-5 Lab-Arraytor(R) human 60-6 Lab-Arraytor(R) human 60-Inflammation Lab-Arraytor(R) Training Trademarks: Lab-Arraytor(R) ; Sep-Arraytor(R); Immun-Araytor(R); SepNet(R
Cooperation Partner Clinical Centre FSU Jena Hans-Knöll-Institute Jena German Sepsis Society
Trend % SENSIBI LI TA' microrganismi isolati da emocolture
2002- 2003 2004- ott2005 2002- 2003 2004- ott2005rianimazione rianimazione TI PO TI PO
Staphilococcus aureus
oxacillina 58% 58% 57% 50%teicoplanina 100% 100% 100% 100%vancomicina 100% 100% 100% 100%Pseudomonas aeruginosa
cef tazidime 41% 65% 75% 40%piperacillina 45% 96% 88% 40%amikacina 100% 100% 88% 80%ciprofloxacina 41% 73% 100% 20%imipenem 77% 80% 50% 60%meropenem 77% 81% 63% 80%Enteococcus faecium
ciprofloxacina 50% 40% 0% 0%vancomicina 100% 100% 100% 60%Enterobacteriaceae
ciprofloxacina 93% 68% 78% 92%ampicillina/ sulbactam 21% 28% 44% 25%cef triaxone 90% 64% 67% 75%piperacillina 90% 45% 11% 69%piperacillina/ tazobactam 98% 75% 78% 100%meropenem 100% 100% 100% 100%gentamicina 90% 68% 89% 62%
ESTERNI Data prenotazione da 01/01/2004 a 30/09/2005Germe: Streptococcus pneumoniae Antibiotici Sensibili Intermedi Resistenti TOT %SAmoxicillina 5 0 0 5 100%Cloramfenicolo 20 0 2 22 91%Ceftriaxone 3 0 0 3 100%Ceftriaxone (Meningite) 11 0 0 11 100%Ceftriaxone (NON-meningite) 12 0 0 12 100%Eritromicina 14 2 6 22 64%Gatifloxacina 2 0 0 2 100%Imipenem 20 0 0 20 100%Levofloxacin 6 0 0 6 100%Linezolid 4 0 0 4 100%moxifloxacina 4 0 0 4 100%Ofloxacina 18 1 1 20 90%Penicillina G 17 5 1 23 74%Chinupristin/Dalfopr 4 0 0 4 100%Rifampicina 4 0 0 4 100%Sparfloxacin 4 0 0 4 100%Trimetoprim/Sulfam. 18 2 1 21 86%Cefotaxime 5 0 0 5 100%Cefotaxime (Meningite) 10 1 0 11 91%Cefotaxime (NON-meningite) 12 0 0 12 100%Tetraciclina 13 2 7 22 59%Vancomicina 21 0 0 21 100%
INTERNI Data prenotazione da 01/01/2004 a 30/09/2005 Streptococcus pneumoniae Antibiotici Sensibili Intermedi Resistenti TOT %S
Amoxicillina 16 0 0 16 100%
Cloramfenicolo 70 0 4 74 95%
Clindamicina 6 0 2 8 75%
Ceftriaxone 22 0 0 22 100%
Ceftriaxone (Meningite) 30 2 0 32 94%
Ceftriaxone (NON-meningite) 34 0 0 34 100%
Eritromicina 43 11 24 78 55%
Gatifloxacina 6 0 0 6 100%
Imipenem 66 0 0 66 100%
Levofloxacin 17 0 0 17 100%
Linezolid 7 0 0 7 100%
moxifloxacina 7 0 0 7 100%
Ofloxacina 64 2 0 66 97%
Penicillina G 62 15 2 79 78%
Chinupristin/Dalfopr 7 0 0 7 100%
Rifampicina 7 0 0 7 100%
Rokitamicina 1 0 0 1 100%
Sparfloxacin 7 0 0 7 100%
Trimetoprim/Sulfam. 54 9 10 73 74%
Cefotaxime 26 0 0 26 100%
Cefotaxime (Meningite) 31 1 0 32 97%
Cefotaxime (NON-meningite) 34 0 0 34 100%
Tetraciclina 50 1 26 77 65%
Vancomicina 79 0 0 79 100%
Newest breakpoints NCCLS;M2-A8for Streptococcus pneumoniae vs B-lattamici
S I R Penicillin < 0,06 0,12-1 > 2
S I R
Amoxicillin or < 2 4 > 8
amoxicillin-clav.ac < 2/1 4/2 8/4
Cefepime < 1 2 > 4
(nonmeningitidis)There is not a U.S.FDA-approved indication for the use of cefepime for
meningitidis
Cefepime < 0,5 1 > 2
(meningitidis)
S I R Cefotaxime or < 0,5 1 > 2
ceftriaxone < 0,5 1 > 2
(meningitidis)Use of cefotaxime or ceftriaxone in meningitidis requires therapy with
maximum doses
Cefotaxime or < 1 2 > 4
ceftriaxone
(nonmeningitidis)For cefotaxime, use of interpretative criteria for nonmeningitidis requires
doses appropriate for serious pneumococcal infections :at least 1 g (adult) or 50 mg/kg (children) every eight hours or more frequently
Volume 11, Number 6, June 2005
Integrating Escherichia coli Antimicrobial Susceptibility Data from Multiple Surveillance Programs
John M. Stelling,*† Karin Travers,* Ronald N. Jones,‡§ Philip J. Turner,¶ Thomas F. O'Brien,*† and Stuart B. Levy*§*Alliance for the Prudent Use of Antibiotics, Boston, Massachusetts, USA; †Brigham and Women's Hospital, Boston, Massachusetts, USA; ‡The Jones Group, North Liberty, Iowa, USA; §Tufts University, Boston, Massachusetts, USA; and ¶AstraZeneca, Macclesfield, Cheshire, United Kingdom