Enzyme Regulation Slides 2007-2008

49
ΡΥΘΜΙΣΗ ΤΗΣ ΕΝΖΥΜΙΚΗΣ ∆ΡΑΣΤΙΚΟΤΗΤΑΣ . Καρδάσης ∆ιαλέξεις Βιοχημείας Α 2007-2008

description

Uploaded from Google Docs

Transcript of Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Page 1: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

ΡΥΘΜΙΣΗ ΤΗΣ ΕΝΖΥΜΙΚΗΣ∆ΡΑΣΤΙΚΟΤΗΤΑΣ

∆. Καρδάσης∆ιαλέξεις Βιοχηµείας Α

2007-2008

Page 2: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

ΤρόποιΤρόποι ρύθµισηρύθµιση τηςτης ενζυµικήςενζυµικήςδραστικότηταςδραστικότητας

• Αντιστρεπτή µη-οµοιοπολικήτροποποίηση (αλλοστερικός έλεγχος)

• Αντιστρεπτή οµοιοπολική τροποποίηση• Μη-αντιστρεπτή ενεργοποίηση

(πρωτεόλυση)• Ενεργοποίηση ή καταστολή από άλλεςπρωτεϊνες

Page 3: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Ρύθµιση της ενζυµικής δραστικότητας µεαντιστρεπτή µη-οµοιοπολική τροποποίηση

(αλλοστερικά ένζυµα)

Page 4: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Ρύθµιση ενζυµικήςδραστικότητας µεεπανατροφοδοτική

αναστολή

Page 5: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Αντίδραση που καταλύεται από τηνΑσπαρτική Τρανσκαρβαµυλάση (ATCase)

Page 6: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Η σύνθεση του καρβαµυλοασπαρτικού είναι το πρώτοκαι καθοριστικό βήµα στην

βιοσύνθεση των πυριµιδινών

ATCase

Page 7: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Αναστολή της δραστικότητας της ΑσπαρτικήςΤρανσκαρβαµυλάσης από την CTP (το τελικόπροϊόν του µονοπατιού βιοσύνθεσης των

πυριµιδινών)

Page 8: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Το π-υδροξυ-υδραργυρο βενζοϊκό αντιδρά µεκατάλοιπα κυστεϊνών της Ασπαρτικής

Τρανσκαρβαµυλάσης

Page 9: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Το π-υδροξυ υδραργυρο βενζοϊκό διαχωρίζει τηνΑσπαρτική Τρανσκαρβαµυλάση σε ρυθµιστικές (r)

και καταλυτικές (c) υποµονάδες

Ταχύτητα καταβύθισης σε υπερφυγοκέντρηση

Page 10: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

ΥποµονάδεςΥποµονάδες τηςτης ΑΤΚάσηςΑΤΚάσης

• Η αποµονωµένη καταλυτική υποµονάδα (c) είναι καταλυτικά ενεργή αλλά δεναναστέλλεται από την CTP

• Η αποµονωµένη ρυθµιστική υποµονάδα (r) προσδένει την CTP αλλά δεν είναι καταλυτικάενεργή.

• Οταν αναµειγνύονται καταλυτικές καιρυθµιστικές υποµονάδες γίνεται ανασύστασητου φυσιολογικού, αλλοστερικά ρυθµιζόµενουενζύµου που έχει σύσταση c6r6.

Page 11: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Η δοµή της Ασπαρτικής Τρανσκαρβαµυλάσης

∆άκτυλοςψευδαργύρου

C

ZnC C

C

Το π-υδροξυ υδραργυρο βενζοϊκόαντικαθιστά τον Zn µε Hg καιαποσταθεροποιεί τον δάκτυλοψευδαργύρου

Page 12: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Εντοπισµός των ενεργών κέντρων: Χρήση τουPALA (ανάλογο ενός ενδιαµέσου της σύνθεσης του

καρβαµυλο ασπαρτικού)

ΙσχυρόςΙσχυρός συναγωνιστικόςσυναγωνιστικόςαναστολέαςαναστολέαςΤηςΤης ATKATKάσηςάσης

Page 13: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Το PALA προκαλεί µετάβαση από την κατάσταση Τστην R στην Ασπαρτική Τρανσκαρβαµυλάση

ΤαΤα 2 2 καταλυτικάκαταλυτικά τριµερήτριµερή: : αα) ) αποµακρύνονταιαποµακρύνονται κατάκατά 12 12 ÅÅ καικαιββ) ) περιστρέφονταιπεριστρέφονται γύρωγύρω απόαπό τοντον κοινόκοινό άξοναάξονα συµµετρίαςσυµµετρίας κατάκατά 1010οο

γγ) ) τατα ρυθµιστικάρυθµιστικά διµερήδιµερή ανταποκρίνονταιανταποκρίνονται περιστρεφόµεναπεριστρεφόµενα καικαι αυτάαυτάκατάκατά 10 10 ÅÅ

Page 14: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Η CTP σταθεροποιεί την κατάσταση Τ στηνΑσπαρτική Τρανσκαρβαµυλάση

Page 15: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Ισορροπία µεταξύ των καταστάσεων Τ και R στηνΑσπαρτική Τρανσκαρβαµυλάση

ΕναρµονισµένοΕναρµονισµένο µοντέλοµοντέλο αλλοστερικήςαλλοστερικής ρύθµισηςρύθµισης: : ΟιΟιαλλαγέςαλλαγές στοστο ένζυµοένζυµο είναιείναι ««όλεςόλες ηη καµίακαµία»»

Page 16: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Η Ασπαρτική Τρανσκαρβαµυλάση εµφανίζεισιγµοειδή κινητική

Page 17: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

H CTP καταστέλλει ενώ η ΑΤΡ ενεργοποιεί τηνΑΤΚάση

Page 18: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Ρύθµιση της ενζυµικής δραστικότητας µεαντιστρεπτή οµοιοπολική τροποποίηση

Page 19: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Συνήθεις οµοιπολικές τροποιήσεις που µεταβάλουντην δραστικότητα των πρωτεϊνών

Page 20: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Οµοιοπολικές τροποποιήσεις που συµβαίνουν στιςπρωτεϊνες

Page 21: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

ΦωσφορυλίωσηΦωσφορυλίωση πρωτεϊνώνπρωτεϊνών

Page 22: Enzyme Regulation Slides 2007-2008
Page 23: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

ΑποφωσφορυλίωσηΑποφωσφορυλίωση πρωτεϊνώνπρωτεϊνών απόαπόειδικέςειδικές πρωτεϊνικέςπρωτεϊνικές φωσφατάσεςφωσφατάσες

Page 24: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Ρύθµιση της δραστικότητας της φωσφορυλάσης τουγλυκογόνου µε φωσφορυλίωση-

αποφωσφορυλίωση

Page 25: Enzyme Regulation Slides 2007-2008
Page 26: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Γιατί φωσφορυλίωση;• Πρόσθεση 2 επιπλέον αρνητικών φορτίων, σχηµατισµόςνέων ενδοµοριακών αλληλεπιδράσεων, αλλαγή στηνστερεοδιαµόρφωση του ενζύµου

• ∆ηµιουργία νέων δεσµών υδρογόνου, σχηµατισµός νέωναλληλεπιδράσεων µέσα και και έξω από το µόριο

• Παρέχεται ελεύθερη ενέργεια στο σύστηµα• Με τις φωσφορυλιώσεις έχουµε σηµαντική ενίσχυση τουαρχικού σήµατος (σε σηµατοδοτικά µονοπάτια)

• Το ΑΤΡ είναι δείκτης ενεργειακού φορτίου (σύνδεσηενεργειακής κατάστασης µε ρύθµιση µεταβολισµού)

Page 27: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Ενεργοποίηση ενζύµου µε την αντιστρεπτήπρόσδεση ενός νουκλεοτιδίου

Page 28: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Ρύθµιση της ενζυµικής δραστικότητας µε µη-αντιστρεπτή οµοιοπολική τροποποίηση

Page 29: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Ζυµογόνα (ανενεργές πρόδροµεςπρωτεάσες) που εκκρίνονται από το

πάνκρεας και το στοµάχι

Page 30: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Εκκριση ζυµογόνων απόένα εξωκρινές κύτταρο

του πανκρέατος

Page 31: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

ΠρωτεολυτικήΠρωτεολυτική ενεργοποίησηενεργοποίηση τουτουχυµοθρυψινογόνουχυµοθρυψινογόνου σεσε χυµοθρυψίνηχυµοθρυψίνη

ΑλλαγέςΑλλαγές στηνστηνστερεοδιαµόρφωσηστερεοδιαµόρφωση πουπουπροκαλούνταιπροκαλούνται απόαπό τηντην

πρωτεόλυσηπρωτεόλυση

Page 32: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Συντονισµός στην ενεργοποίησηζυµογόνων που εµπλέκονται στην πέψη

των τροφών από την θρυψίνη

Page 33: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

ΗΗ πρωτεολυτικήπρωτεολυτική διάσπασηδιάσπασηείναιείναι µηµη--αντιστρεπτήαντιστρεπτή. . ΠωςΠωςτερµατίζεταιτερµατίζεται ηη ενεργοποίησηενεργοποίηση

τωντων ζυµογόνωνζυµογόνων

Page 34: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Αλληλεπίδραση θρυψίνης-αναστολέαπανκρεατικής θρυψίνης

Ο αναστολέας δεσµεύεταιισχυράισχυρά στο ενεργόκέντρο της θρυψίνης.

Ο αναστολέας είναιανάλογο υποστρώµατος.

Αλληλεπιδρά µε τοAsp189 στην κοιλότηταεξειδίκευσης

Page 35: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Η κοιλότητα εξειδίκευσης τωνπρωτεασών σερίνης

Page 36: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

ΣηµασίαΣηµασία τουτου αναστολέααναστολέα τηςτηςθρυψίνηςθρυψίνης

• Εµποδίζει την πρόωρη ή την άσκοπηενεργοποίηση των πρωτεολυτικώνενζύµων στο πάνκρεας και τηνπανκρεατίτιδα.

Page 37: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

ΑντιθρυψίνηΑντιθρυψίνη αα11

• Προστετεύει τους ιστούς από τηνελαστάση (πρωτεάση που παράγεταιαπό τα ουδετερόφιλα).

• Ανεπάρκεια της αντιθρυψίνης α1 µεµετάλλαξη προκαλεί εµφύσηµα(καταστροφή των κυψελιδικώντοιχωµάτων στους πνεύµονες)

Page 38: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Προδιάθεση για εµφύσηµα έχουµε και ότανοξειδώνεται η µεθειονίνης 358 στον αναστολέα

της αντιθρυψίνης α1

ΚάπνισµαΚάπνισµα

∆εν∆εν προσδένεταιπροσδένεται στηνστην ελαστάσηελαστάση

Page 39: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

ΚαταρράκτηςΚαταρράκτης τηςτης πήξηςπήξης τουτου αίµατοςαίµατος

Page 40: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

∆οµή∆οµή ινωδογόνουινωδογόνου

Σύσταση: 2 x ΑαΒβγΑΑΑΑΒΒΒΒ

ινωδοπεπτίδια

Thrombin

Page 41: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

ΣχηµατισµόςΣχηµατισµός ινώδουςινώδους

Page 42: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

ΑντίδρασηΑντίδραση πουπου καταλύεταικαταλύεται απόαπό τηντηντρανσγλουταµινάσητρανσγλουταµινάση ((παράγονταςπαράγοντας

XIII)XIII)

Page 43: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

ΚαταρράκτηςΚαταρράκτης τηςτης πήξηςπήξης τουτου αίµατοςαίµατος

ΜονοµερέςΜονοµερές ινώδουςινώδους

ΙνώδεςΙνώδες

Page 44: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

∆οµικές∆οµικές περιοχέςπεριοχές προθροµβίνηςπροθροµβίνης

Το γ-καρβοξυγλουταµικόείναι σηµαντικό για τηνπρόσδεση του ασβεστίου

Ακινητοποίηση στιςµεµβράνες τωναιµοπεταλίων, προσέγγισηπρωτεϊνών πήξης (V)

∆ηµιουργείται µόνοπαρουσία βιταµίνης Κ

Αναστολείς της βιταµίνης Κ (προκαλούνθανατηφόρο αιµοραγία)

Page 45: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

ΕνεργοποίησηΕνεργοποίηση προθροµβίνηςπροθροµβίνηςΠεριοχήΠεριοχή πουπου προσδένειπροσδένει CaCa

ΠρωτεολυτικήΠρωτεολυτική ενεργοποίησηενεργοποίηση

ΠρωτεόλυσηΠρωτεόλυση ινωδογόνουινωδογόνου

Page 46: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

ΜοριακήΜοριακή βάσηβάση αιµορροφιλίαςαιµορροφιλίας: : ΜεταλλάξειςΜεταλλάξειςστονστον αντιαιµορροφιλικόαντιαιµορροφιλικό παράγονταπαράγοντα (VIII)(VIII)

(Θετικήεπανατροφοδότηση)

Page 47: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

Το ινώδες διαχωρίζεται από την πλασµίνη

ΤερµατισµόςΤερµατισµός τηςτης πήξηςπήξης

Page 48: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

ΑναστολείςΑναστολείς τωντων παραγόντωνπαραγόντων τηςτης πήξηςπήξης πουπουπεριορίζουνπεριορίζουν τηντην επέκτασηεπέκταση τωντων θρόµβωνθρόµβων

θροµβίνη

αντιθροµβίνη

παράγοντας ΧΙΙaπαράγοντας ΧΙaπαράγοντας ΙΧaπαράγοντας Χa

ηπαρίνη

++

++

Σιτευτικά κύτταρα(αιµοφόρα αγγεία)

Serpin(ser protease inhibitor)

Μετάλλαξη στην αντιθρυψίνη α1 που άλλαξε στην δραστικότητά της σεαντιθροµβίνη: θανατηφόρος αιµοραγία

Page 49: Enzyme Regulation Slides 2007-2008

ΛύσηΛύση τουτου ίδιοίδιο τουτου θρόµβουθρόµβου: : οο ρόλοςρόλος τουτου ΙστικούΙστικούενεργοποιητήενεργοποιητή τουτου πλασµινογόνουπλασµινογόνου ((TPA)TPA)

Πλασµινογόνο

ΠεριοχήΠεριοχή πουπου προσδένεταιπροσδένεταιστονστον θρόµβοθρόµβο

ΤΡΑΤΡΑ

Πλασµίνη

Λύση του ινώδους σε περιοχέςτης τριπλής έλικας

Ο ΤΡΑ χορηγείται στην στεφανιαία αρτηρία αµέσως µετά από µια καρδιακήπροσβολή που προκαλείται από θρόµβωση.