ΒΙΟΧΗΜΕΙΑ Ι Εισαγωγή Δομή και λειτουργία πρωτεϊνών DNA...

Biochemistry 2/e - Garrett & Grisham

ΒΙΟΧΗΜΕΙΑ ΙΕισαγωγή

Δομή και λειτουργία πρωτεϊνών DNA και RNA: Μόρια της κληρονομικότητας

Μυοσφαιρίνη και ΑιμοσφαιρίνηΕισαγωγή στα ένζυμα

Μηχανισμοί ενζυμικής δράσηςΕλεγχος της ενζυμικής δραστικότηταςΕισαγωγή στις βιολογικές μεμβράνες

Βασικές αρχές του μεταβολισμούΓλυκόλυση

Ο κύκλος του κιτρικού οξέοςΟξειδωτική φωσφορυλίωση

Η πορεία των φωσφορικών πεντοζών και γλυκονεογένεσηΦωτοσύνθεση

ΖΩΗ ΚΑΙ ΧΗΜΕΙΑ….

“Τα ζωντανά πράγματα αποτελούνται από άψυχα μόρια” (Albert Lehninger)

“Η Χημεία αποτελεί την λογική των βιολογικών φαινoμενων” (Garrett and Grisham)

ΙΔΙΟΤΗΤΕΣ ΖΩΝΤΑΝΩΝ ΣΥΣΤΗΜΑΤΩΝ

-Οι οργανισμοί είναι πολύπλοκοι με μεγάλο βαθμό οργάνωσης

-Οι βιολογικές δομές εξυπηρετούν λειτουργικούς σκοπούς

-Τα ζωντανά συστήματα συμμετέχουν σε ενεργειακούς μετασχηματισμούς

-Τα ζωντανά συστήματα έχουν μια εντυπωσιακή ικανότητα να αναπαράγονται

ΒΙΟΜΟΡΙΑ: Τα Μόρια της Ζωής

H, O, C και N συνιστούν το 99+% των ατόμων στο ανθρώπινο σώμα

Στοιχείο %Οξυγόνο 63

Υδρογόνο 25.2Ανθρακας 9.5Αζωτο 1.4

ΒΙΟΜΟΡΙΑ: Τα Μόρια της Ζωής

Ποια κοινή ιδιότητα των H, O, C και N καθιστά τα άτομα αυτά τόσο κατάλληλα για την Χημεία της Ζωής;

Απάντηση: Η ικανότητα τους να σχηματίζουν ομοιοπολικούς δεσμούς

Ποιες είναι οι ενέργειες δεσμών των ομοιοπολικών δεσμών;

Δεσμός Ενέργεια kJ/molH-H 436C-H 414C-C 343C-O 351

Ιεραρχία Βιομορίων

Απλά Μόρια είναι οι μονάδες που χρησιμοποιούνται για την δημιουργία

πολύπλοκων δομών

• Μεταβολίτες και μακρομόρια

• Οργανίδια

• Μεμβράνες

• Η «μονάδα» της ζωής είναι το Κύτταρο

Οι Ιδιότητες των Βιομορίων αντανακλούν την καταλληλότητα τους

για τις συνθήκες της Ζωής • Τα Μακρομόρια και οι δομικές τους

μονάδες έχουν «κατευθυντικότητα» • Τα Μακρομόρια περιέχουν πληροφορίες • Τα Βιομόρια έχουν χαρακτηριστική

τρισδιάστατη αρχιτεκτονική • Ασθενείς δυνάμεις διατηρούν την

βιολογική δομή και προσδιορίζουν τις αλληλεπιδράσεις μεταξύ βιομορίων

Οι Ιδιότητες των Βιομορίων αντανακλούν την καταλληλότητα τους για τις συνθήκες της Ζωής

Σημαντικοί Αριθμοί!• van der Waals: 0.4-4.0 kJ/mole• Δεσμοί υδρογόνου: 12-30 kJ/mole• Ιοντικοί δεσμοί: 20 kJ/mole• Υδρόφοβες αλληλεπιδράσεις: <40

kJ/mole

Δυο σημαντικά σημεία σχετικά με τις ασθενείς δυνάμεις

• Η αναγνώριση των βιομορίων γίνεται μέσω ασθενών χημικών δυνάμεων

• Οι ασθενείς δυνάμεις περιορίζουν τους οργανισμούς σε ένα στενό φάσμα περιβαλλοντικών συνθηκών

Οργάνωση και δομή των κυττάρων

• Προκαρυωτικά κύτταρα– Μια μόνο (πλασματική) μεμβράνη – Δεν έχουν πυρήνα ή οργανίδια

• Ευκαρυωτικά κύτταρα– Πολύ μεγαλύτερα από τα προκαρυωτικά – 103-104 φορές μαγαλύτερα!– Εχουν πυρήνα και πολλά οργανίδια – ER, Golgi, μιτοχόνδρια, κ.λ.π.

Ιδιότητες του Νερού

• Υψηλό σ.ζ., σ.τ., θερμότητα εξάτμισης και επιφανειακή τάση

• Η κεκαμένη δομή το καθιστά πολικό

• Μη-τετραεδρικές γωνίες δεσμών

• Δότης και αποδέκτης δεσμού-Η

• Δυνατότητα σχηματισμού 4 δεσμών-Η ανά μόριο νερού

Σύγκριση Πάγου-Νερού Δεσμοί-Η και κίνηση

• Πάγος: 4 δεσμοί-Η ανά μόριο νερού

• Νερό: 2,3 δεσμοί-Η ανά μόριο νερού

• Πάγος: Χρόνος ζωής δεσμού-Η περίπου 10μsec

• Νερό: Χρόνος ζωής δεσμού-Η περίπου 10 psec

• (10 psec = 0.00000000001 sec)

Νερό ως διαλύτης

• Τα ιόντα είναι πάντοτε ενυδατωμένα μέσα στο νερό και φέρουν γύρω τους μια «σφαίρα ενυδάτωσης»

• Το νερό σχηματίζει δεσμούς-Η με πολικές ενώσεις

• Υδρόφοβες αλληλεπιδράσεις – ένα «μυστικό της ζωής»

Υδρόφοβες αλληλεπιδράσεις

• Μια μη-πολική ένωση «οργανώνει» το νερό

• Το πλέγμα των δεσμών υδρογόνου <επανοργανώνεται> για να δεχθεί την μη-πολική ένωση

• Αυτό αποτελεί μια αύξηση της «οργάνωσης» του νερού

• Δηλαδή μια ελάττωση της ΕΝΤΡΟΠΙΑΣ

Αμφιπαθή Μόρια

• Αναφέρεται σε μόρια τα οποία περιέχουν

τόσο πολικές όσο και μη-πολικές ομάδες • Και επίσης σε μόρια τα οποία έχουν τάση

τόσο για πολικό όσο και μη-πολικό περιβάλλον

• Ένα καλό παράδειγμα είναι τα λιπαρά οξέα

ΒΙΟΧΗΜΕΙΑ Ι Εισαγωγή Δομή και λειτουργία πρωτεϊνών DNA...

Documents

Transcript of ΒΙΟΧΗΜΕΙΑ Ι Εισαγωγή Δομή και λειτουργία πρωτεϊνών DNA...

Βιοχημεία Αρχές Βιοτεχνολογίας · 2015-10-21 · 1 Βιοχημεία -Αρχές Βιοτεχνολογίας -Εισαγωγή, οργανικά μόρια,

· 2 days ago · Σελίδα 17 Διεθνής διασυρμός για το μπάχαλο στον προσφυγικό καταυλισμό της Μόρια Σελίδα 19

Μόρια μετάθεσης ΠΕ09 Οικονομολόγοι 2014, Χαράλαμπος Π. alfavita.gr

κλινικη βιοχημεια λιπιδια

ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ195.134.76.37/old_site_10-7-2016/courses/Undergraduate/Biochem/... · Η κινητικότητα πολλών πρωτεϊνών σε πηκτή sds-page είναι

ΒΙΟΧΗΜΕΙΑ ΤΟΥ ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΥ · 10 • ΙΝΣΟΥΛΙΝΗ • Αποτελείται από 51 αμινοξέα. • Δύοαλυσίδες συνδεδεμένες

άτομα και μόρια

11Α ΔΙΑΜΟΡΙΑΚΕΣ ΔΥΝΑΜΕΙΣ ΣΥΝΟΠΤΙΚΗ ΘΕΩΡΙΑ...Είναι γνωστό ότι και τα μη πολικά μόρια των στοιχείων, όπως

Ξενοδοχείο Epirus - BpathH επίσημη γλώσσα του Σεμιναρίου είναι η Ελληνική. Στο Σεμινάριο χορηγούνται 12 μόρια

ΒΙΟΧΗΜΕΙΑ (Lubert Stryer) · ΒΙΟΧΗΜΕΙΑ(Lubert Stryer) Βασικές Αρχές Βιοχημείας (Lehninger) Κεφ. 15.

Alzheimer: νέες διαστάσεις στην προσέγγιση της νόσουhelios-eie.ekt.gr/EIE/bitstream/10442/378/1/M01.050.05.pdf · 41 ,« πρωτεϊνών στον

ΒΙΟΧΗΜΕΙΑ (Lubert Stryer) · 2021. 3. 2. · BIO. Λ154 ΒΙΟΧΗΜΕΙΑ Ι. ΒΙΟΧΗΜΕΙΑ (Lubert Stryer) Βασικές Αρχές Βιοχημείας (Lehninger)

ΒΙΟΧΗΜΕΙΑ Ι‘ΝΑΛΥΤΙΚΗ... · 2010-10-11 · Ιατρικής του Π. Θ., η ύλη του μαθήματος Βιοχημεία Ι έχει διαμορφωθεί

151 ΤΡΑΚΤΕΡ ΚΑΙ ΑΓΡΟΤΙΚΑ ΜΗΧΑΝΗΜΑΤΑ · ση 54,8 μόρια. Δράση 4.1.3 «Σχέδια Βελτίωσης για ΑΠΕ»: 6 δικαιούχοι,

ΚΛΙΝΙΚΗ ΒΙΟΧΗΜΕΙΑ

Βιοπληροφορική - eclass.uowm.gr · • 70% ο κ άρο είναι νερό. • Εκ ός από ο νερό, όλα σχεδόν α μόρια ενός κ άρο βασίζον

ΒΙΟΧΗΜΕΙΑ ΤΟΥ ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΥ’ΙΟΧ-ΜΕΤ Θ...• ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΣ Η2Ο2 ΚΑΙ ΑΓΓΕΙΟΔΙΑΣΤΟΛΗ – ΑΙΜΑΤΩΣΗ ΤΩΝ ΜΥΩΝ,

ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ 1ο ΑΠΟΜΌΝΩΣΗ DNA ΑΠΌ ΙΣΤΌ....διαφορετικών τους φορτίων και μαζών, τα διάφορα μόρια θα κινηθούν

Μόρια μετάθεσης ΠΕ05 Γαλλικών 2014, του Χαράλαμπου Π. alfavita.gr

ΤΩΝ ΕΤΩΝ ΕΤΗ - lsparnas.gr · περί τα 200.000 δλα μόρια λευκώματος, εκ τών οποίων εκαστον έχει μορια κόν βάρος