Πανεπιστήμιο Κρήτης Τμήμα Βιολογίας · 6. Η 8η Ημέρα της...

Χ.Γ.Σπηλιανάκης-ΒιογραφικόΣημείωμα 1

ΠανεπιστήμιοΚρήτηςΤμήμαΒιολογίας

ΧΑΡΑΛΑΜΠΟΣΓ.ΣΠΗΛΙΑΝΑΚΗΣ

ΒΙΟΓΡΑΦΙΚΟΣΗΜΕΙΩΜΑΕΡΕΥΝΗΤΙΚΗ&ΔΙΔΑΚΤΙΚΗΔΡΑΣΤΗΡΙΟΤΗΤΑ

Ηράκλειο,Ιανουάριος2016


ΠΕΡΙΕΧΟΜΕΝΑΠροσωπικάστοιχεία...................................................................................................................................3ΒασικήΕκπαίδευση....................................................................................................................................3ΠανεπιστημιακήΕκπαίδευση......................................................................................................................3

ΠροπτυχιακέςΣπουδές................................................................................................................................3ΜεταπτυχιακέςΣπουδές.............................................................................................................................3

ΜεταδιδακτορικήΈρευνα...........................................................................................................................4ΕπαγγελματικήΔραστηριότητα..................................................................................................................4Υποτροφίες.................................................................................................................................................4ΚριτήςΕρευνητικώνΠροτάσεων.................................................................................................................4

Διεθνείς.......................................................................................................................................................4Εθνικές.........................................................................................................................................................5

Μέλοςεκδοτικήςομάδαςεπιστημονικώνπεριοδικών(AcademicEditorialBoard)......................................5Κριτήςεργασιώνγιαεπιστημονικάπεριοδικά(2008-)...............................................................................5Προσκεκλημένοςομιλητήςσεσυνέδρια.....................................................................................................5Προσκεκλημένοςομιλητήςσεακαδημαϊκάιδρύματα.................................................................................5Συμμετοχήσεσυνέδρια..............................................................................................................................6Συμμετοχήσεεργαστηριακάσεμινάρια(Workshops)καιΘερινάΣχολεία..................................................7Εκπαιδευτικέςδραστηριότητες...................................................................................................................8

Διδασκαλίαπροπτυχιακώνμαθημάτων......................................................................................................8Διδασκαλίαμεταπτυχιακώνμαθημάτων....................................................................................................8Επίβλεψηπροπτυχιακώνφοιτητών............................................................................................................9

Α.Επίβλεψηπροπτυχιακήςεργασίαςεξειδίκευσης–ΠρακτικήΆσκηση–ΤριμηνιαίοΕργ.Μάθημα..8Β.ΕπίβλεψηΔιπλωματικήςΕργασίας..................................................................................................10

Επίβλεψημεταπτυχιακώνφοιτητών.........................................................................................................11Α.Επίβλεψηπροχωρημένηςεργαστηριακήςάσκησης(Rotation).......................................................11Β.ΕπίβλεψηΜεταπτυχιακούΔιπλώματοςΕξειδίκευσης....................................................................12Γ.ΕπίβλεψηΔιδακτορικήςΔιατριβής...................................................................................................13Δ.ΕξωτερικόςεξεταστήςΜεταπτυχιακούΔιπλώματοςΕξειδίκευσης.................................................13Ε.ΜέλοςτριμελούςσυμβουλευτικήςεπιτροπήςΔιδακτορικήςΔιατριβής.........................................14Ζ.ΜέλοςεπιτροπώνΓενικώνεξετάσεωνπιστοποίησηςγιαεκπόνησηΔιδακτορικήςΔιατριβής(QualifyingExams).............................................................................................................................15

Η.ΜέλοςεπταμελούςεπιτροπήςεξέτασηςΔιδακτορικήςΔιατριβής..................................................15Θ.Επίβλεψηεπισκεπτώνμεταπτυχιακώνφοιτητών/καθηγητώναπόάλλαιδρύματα.......................16

Διοικητικές/ΟργανωτικέςΔραστηριότητες.....................................................................................................16Ερευνητικήομάδα(κύριαμέλη,2008-σήμερα)..............................................................................................17Ερευνητικέςσυνεργασίες(2008-σήμερα)..................................................................................................17ΓνώσειςΥπολογιστών.......................................................................................................................................18ΞένεςΓλώσσες...................................................................................................................................................18ΕρευνητικέςΔραστηριότητες...........................................................................................................................18

Α.Ερευνητικέςχρηματοδοτήσειςαπόανταγωνιστικάπρογράμματα(2008-σήμερα).............................18Β.Επιστημονικέςδημοσιεύσειςσεπεριοδικάμεκριτές...........................................................................20Γ.Μεταφράσεις.........................................................................................................................................22Δ.Απήχησηερευνητικούέργου................................................................................................................23Ε.Ανάλυσηερευνητικούέργου.................................................................................................................24

Ε1.Μεταπτυχιακέςσπουδές(ΤμήμαΒιολογίαςΠαν/μίουΚρήτης&ΙΜΒΒ-ΙΤΕ)1996-2003...............24Ε2.Μεταδιδακτορικέςσπουδές(ΤμήμαΑνοσολογίας,ΙατρικήσχολήΠαν/μίουYale)2003-2007....26Ε3.Αυτόνομηερευνητικήεργασία(ΤμήμαΒιολογίαςΠαν/μίουΚρήτης&ΙΜΒΒ-ΙΤΕ)2008-2012.....27

ΠΑΡΑΡΤΗΜΑΑξιολόγησημαθημάτων..................................................................................................................................29


ΧΑΡΑΛΑΜΠΟΣΓ.ΣΠΗΛΙΑΝΑΚΗΣ–ΒΙΟΓΡΑΦΙΚΟΣΗΜΕΙΩΜΑ

ΗΜΕΡΟΜΗΝΙΑ&ΤΟΠΟΣΓΕΝΝΗΣΗΣ: 13Απριλίου1972,ΑθήναΑττικήςΟΙΚΟΓΕΝΕΙΑΚΗΚΑΤΑΣΤΑΣΗ: ΈγγαμοςμεέναπαιδίΔΙΕΥΘΥΝΣΗΕΡΓΑΣΙΑΣ: ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτηςκαιΙΜΒΒ-ΙΤΕ ΤΚ70013Ηράκλειο,Κρήτη Τηλ.:+30-2810-391163ΗΛΕΚΤΡΟΝΙΚΟΤΑΧΥΔΡΟΜΕΙΟ: [email protected],[email protected]ΙΣΤΟΣΕΛΙΔΑ: www.SpilianakisLab.gr,www.biology.uoc.gr/el/personnel/48,ORCID: http://orcid.org/0000-0003-0921-1923RESEARCHERID: C-9893-2011ΒΑΣΙΚΗΕΚΠΑΙΔΕΥΣΗ 1978-1990 16οΔημοτικόσχολείοΗρακλείουκαι3οΓενικόΓυμνάσιοκαιΛύκειοΗρακλείου.

ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΑΚΗΕΚΠΑΙΔΕΥΣΗ ΠΡΟΠΤΥΧΙΑΚΕΣΣΠΟΥΔΕΣ1994 Εκπόνηση τρίμηνης εργασίας στο Τμήμα Βιολογικών Επιστημών του Πανεπιστημίου

Μanchester(UK).Τίτλος εργασίας: “Ανάλυση πολυμορφισμών του υποκινητήHLA-DRB1*0301 τωνHLA-DR3σχετιζόμενωναυτοάνοσωννοσημάτων.”(ΕργαστήριοΡευματοειδούςΑρθρίτιδας)Επιβλέποντες:Dr.RichardKayκαιProf.IanHutchinson.(ΠρόγραμμαERASMUS)

1992-1996 Πτυχίο Βιολογίας, Τμήμα Βιολογίας, Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Βαθμόςπτυχίου(7.51/10.0)“ΛίανΚαλώς”.

ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΕΣΣΠΟΥΔΕΣ1996-1998 ΜεταπτυχιακόςΤίτλοςΕιδίκευσης,ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.

Ειδίκευση:ΜοριακήΒιολογία.Βαθμός(9.14/10)“Άριστα”.Επίβλεψη:Καθ.Ι.Παπαματθαιάκης

ΤΙΤΛΟΣΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΗΣΔΙΑΤΡΙΒΗΣ:«Διερεύνηση του μηχανισμού δράσης του μεταγραφικού ενεργοποιητή των τάξης ΙΙαντιγόνωνιστοσυμαβατότητας,CIITA».

ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΑΜΑΘΗΜΑΤΑ:1. ΜοριακήΒιολογίαΚυττάρου 10/102. ΜοριακήΒιολογίατηςΑνάπτυξης 8.0/103. ΜοριακήΒιολογίατουΓονιδίου 8.0/104. Ανοσολογία 8.0/105. ΕιδικάθέματαΝευροβιολογίας 8.5/106. Η8ηΗμέρατηςΔημιουργίας 10/107. ΔιαγονιδιακάΜοντέλα-Οργανισμοί 8.5/108. ΜοριακήΒιολογίαΦυτώνΙ 9.0/109. ΕιδικάθέματαΦωτοσύνθεσης 9.0/1010. Φωτοϋποδοχείςκαιμεταγωγήσήματος 10/10

ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΕΣΑΣΚΗΣΕΙΣ(τρίμηνηςδιάρκειαςέκαστη):1. «ΜελέτητηςΒιτελλογενίνηςστοκαρκινοειδέςP.Potamios». Επίβλεψη:Kαθ.Ε.Στρατάκης(Βαθμός10/10)2. «Αναγωγάσες σιδήρου στον Σακχαρομύκητα: Καταλυτικές και γενετικές μελέτες

έκφρασης».Επίβλεψη:Καθ.Δ.Αλεξανδράκη.(Βαθμός:8.0/10)


3. «ΑνάλυσητηςέκφρασηςτουCIITAσεδιαγονιδιακάποντίκια». Επίβλεψη:Καθ.Ι.Παπαματθαιάκης.(Βαθμός:8.0/10)

1998-2003 Διδακτορικό Δίπλωμα. Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα “Μοριακή Βιολογία – Βιοϊατρική”,ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Επίβλεψη:Καθ.Ι.Παπαματθαιάκης.

ΤΙΤΛΟΣΔΙΔΑΚΤΟΡΙΚΗΣΔΙΑΤΡΙΒΗΣ:«ΜεταγραφικήρύθμισητωντάξηςΙΙαντιγόνωνιστοσυμβατότηταςαπότοCIITA.ΤοτάξηςΙΙενισχυόσωμα και μετα-μεταγραφικές τροποποιήσεις μεταγραφικών παραγόντων καιχρωματίνηςκατάτημεταγραφήτουγονιδίουDRA».

ΜΕΤΑΔΙΔΑΚΤΟΡΙΚΗΕΡΕΥΝΑ 2003-2007 Μεταδιδακτορικός Υπότροφος στο τμήμα Ανοσοβιολογίας της Iατρικής Σχολής του

ΠανεπιστημίουYaleστιςΗΠΑ.(Επιβλέπων:Prof.RichardA.Flavell) ΕΠΑΓΓΕΛΜΑΤΙΚΗΔΡΑΣΤΗΡΙΟΤΗΤΑ 2007-2009 Ερευνητής Γ’ βαθμίδας, Ινστιτούτο Μοριακής Βιολογίας και Βιοτεχνολογίας, Ίδρυμα

ΤεχνολογίαςκαιΈρευνας,ΗράκλειοΚρήτης.2009-2013 ΕπίκουροςΚαθηγητήςεπίθητεία,ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2013- ΜόνιμοςΕπίκουροςΚαθηγητής,ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2009- Συνεργαζόμενο μέλος ΔΕΠ, Ινστιτούτο Μοριακής Βιολογίας και Βιοτεχνολογίας, Ίδρυμα

ΤεχνολογίαςκαιΈρευνας,Ηράκλειο.ΥΠΟΤΡΟΦΙΕΣ 1994 Υποτροφία από το Ίδρυμα Κρατικών Υποτροφιών για την καλύτερη επίδοση στο 2ο έτος

προπτυχιακώνσπουδών.1996-1998 ΥποτροφίααπότοΊδρυμαΤεχνολογίαςκαιΈρευνας.1999 ΥποτροφίαΕΠΕΑΕΚαπότοΜεταπτυχιακόΠρόγραμμα“ΜοριακήΒιολογία–Βιοϊατρική”.2000 ΥποτροφίααπότοπρόγραμμαΠΕΝΕΔμετίτλο“ΜοριακήμελέτηΟστεοσαρκωμάτων”.2001 ΑριστείοαπότηΓενικήΓραμματείαΈρευναςκαιΤεχνολογίας.2003-2006 Ανταγωνιστική Μεταδιδακτορική υποτροφία του Ινστιτούτου Έρευνας για τον Καρκίνο

(CancerResearchInstitute,USA).Διάρκειατρίαέτη,σύνολουποστήριξης$135.000.2006-2007 ΜεταδιδακτορικήυποτροφίααπότοΠανεπιστήμιοYale(USA).Ετήσιοςμισθός$44.000.2007 ΜεταδιδακτορικήυποτροφίααπότοΙνστιτούτοΙατρικώνΕρευνώνHowardHughesMedical

Institute(HHMI)(USA).Ετήσιοςμισθός$47.000.2008-2011 InvestigatorAward,CancerResearchInstitute,USA(200.000$).ΚΡΙΤΗΣΕΡΕΥΝΗΤΙΚΩΝΠΡΟΤΑΣΕΩΝ ΔΙΕΘΝΕΙΣØ TheNetherlandsOrganisationforScientificResearch.Αξιολογητήςερευνητικώνπροτάσεων.(2007)Ø Αξιολογητήςπροτάσεων για την Ευρωπαϊκή Ένωσησταπλαίσια τουπρογράμματος FP7-PEOPLE-2012-

CIG(CareerIntergrationGrants).(2011,2012)Ø Αξιολογητής της Ουγγρικής Ακαδημίας Επιστημών (OTKA). Μέλος της Επιτροπής Αξιολόγησης

“MolecularBiologyandMolecularInteractions”(2015).Ø ΕξωτερικόςαξιολογητήςτηςδράσηςEU-COSTActionproposals(2015.1,2015.2).Ø ΕξωτερικόςαξιολογητήςγιαMarieSkłodowska-CurieIndividualFellowshipsH2020-MSCA-IF-2014(MSCA-

IF-EF-CAR;MSCA-IF-EF-RI;MSCA-IF-GF),ScientificPanel[LIF](2014).Ø ΕξωτερικόςαξιολογητήςγιαMarieSkłodowska-CurieIndividualFellowshipsH2020-MSCA-IF-2015(MSCA-

IF-EF),ScientificPanel[LIF](2015).Ø Αξιολογητήςερευνητικώνπροτάσεωντου“MarsdenFund”τηςΒασιλικήςΑκαδημίαςτηςΝέαςΖηλανδίας

(2015).


ΕΘΝΙΚΕΣØ ΥπουργείοΠαιδείαςΔιαΒίουΜάθησης&Θρησκευμάτων/ΕΥΔΕΕΤΑΚ.ΓενικήΓραμματείαΈρευναςκαι

Τεχνολογίας.ΑξιολογητήςΕρευνητικώνΠρογραμμάτωντηςπράξης“ΥποστήριξηΟμάδωνΜικρομεσαίωνΕπιχειρήσεων για Δραστηριότητες Έρευνας & Τεχνολογικής Ανάπτυξης” (The Scientific Officers ofIndustry-OrientedResearchPrograms)(2013).

Ø Υπουργείο Παιδείας Δια Βίου Μάθησης & Θρησκευμάτων. Αξιολογητής ερευνητικών προτάσεωνδιακρατικήςσυνεργασίαςΕλλάδας-Σλοβακίαςστοντομέα”ΥγείαR&D”(2012).

Ø Υπουργείο Παιδείας Δια Βίου Μάθησης & Θρησκευμάτων. Αξιολογητής ερευνητικών προτάσεωνδιακρατικήςσυνεργασίαςΕλλάδας-Κίνας(2012).

Ø Υπουργείο Παιδείας Δια Βίου Μάθησης & Θρησκευμάτων. Αξιολογητής ερευνητικών προτάσεωνδιακρατικήςσυνεργασίαςΕλλάδας-Τουρκίας(2013).

Ø Υπουργείο Παιδείας Δια Βίου Μάθησης & Θρησκευμάτων. Αξιολογητής προγραμμάτων της πράξης“ΠΕΓΑ” (Πρόγραμμα Επικαιροποίησης Γνώσεων Αποφοίτων ΑΕΙ), στο θεματικό πεδίο Ιατρική,Φαρμακευτική,Βιοτεχνολογία(2013).

Ø Υπουργείο Παιδείας Δια Βίου Μάθησης & Θρησκευμάτων. Αξιολογητής ερευνητικών προτάσεων στοπλαίσιοτηςπρόσκλησης“ΑΡΧΙΜΗΔΗΣ”(2010).

ΜΕΛΟΣΕΚΔΟΤΙΚΗΣΟΜΑΔΑΣΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΩΝΠΕΡΙΟΔΙΚΩΝ(ΑCADEMICEDITORIALBOARD) Ø ΕπιστημονικόπεριοδικόPLOSOne(ImpactFactor2014:3.234)ΚΡΙΤΗΣΕΡΓΑΣΙΩΝΓΙΑΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΑΠΕΡΙΟΔΙΚΑ(2008-) Ø EducationResearchReview(Elsevier). ImpactFactor2014:2.452Ø EuropeanJournalofImmunology(WILEY-VCHVerlangGmbH&Co). ImpactFactor2014:4.034Ø JournalofAgingResearch(HindawiPublishingCorporation). (2010-)Ø NatureCommunications(Naturepublishinggroup). ImpactFactor2014:11.470Ø NatureScientificReports(Naturepublishinggroup). ImpactFactor2014:5.578Ø PLOSOne(PublicLibraryofScience). ImpactFactor2014:3.234Ø JournalofMolecularBiology(Elsevier). ImpactFactor2014:4.333Ø MolecularandCellularBiochemistry(Springer). ImpactFactor2014:2.393ΠΡΟΣΚΕΚΛΗΜΕΝΟΣΟΜΙΛΗΤΗΣΣΕΣΥΝΕΔΡΙΑ 2007 ΕυρωπαϊκόσυνέδριοΓενετικήςτουΑνθρώπου,Νίκαια,Γαλλία,16-19Ιουνίου2007.2007 4thAnnualCMSBMembersSymposium,Leiden,Ολλανδία,7Σεπτεμβρίου2007.2008 “Epigenetics, Epigenomics and Applications”, Ερευνητικό Κέντρο ΕΚΕΤΑ, Θεσσαλονίκη, 27 Ιουνίου

2008.2009 Tri-Society Annual Conference of the Society for Leukocyte Biology, International Cytokine Society,

andtheInternationalSocietyforInterferonandCytokineResearch,“CellularandCytokineInteractionsinHealthandDisease”,Λισσαβόνα,Πορτογαλία,18-21Οκτωβρίου2009.

2009 60ο Πανελλήνιο Συνέδριο Ελληνικής Εταιρείας Βιοχημείας&Μοριακής Βιολογίας, Αίγλη Ζαππείου,Αθήνα,20-22Νοεμβρίου2009.

2012 “GENE REGULATION: From DNA sequence to nuclear structure”, Ευγενίδειο Ίδρυμα, Αθήνα, 14-16Νοεμβρίου2012.

2013 ΕλληνικόΣυνέδριοΑνοσολογίας,Αθήνα,12-14Δεκεμβρίου2013.2014 Recent Advances inOmics Research, Jagiellonian University, Κρακοβία, Πολωνία, 23-24 Οκτωβρίου

2014.2015 23οΜετεκπαιδευτικόΣυνέδριοΚλινικήςΟγκολογίας,Ηράκλειο,Κρήτη,12-15Νοεμβρίου2015.2015 66οΠανελλήνιοΣυνέδριοΕλληνικήςΕταιρείαςΒιοχημείας&ΜοριακήςΒιολογίας,ΕυγενίδειοΊδρυμα,

Αθήνα,11-13Δεκεμβρίου2015.ΠΡΟΣΚΕΚΛΗΜΕΝΟΣΟΜΙΛΗΤΗΣΣΕΑΚΑΔΗΜΑΪΚΑΙΔΡΥΜΑΤΑ 2004 IMBB-ΙΤΕ,ΗράκλειοΚρήτης,Ελλάδα,18Σεπτεμβρίου2004.


2005 Ερευνητικό Κέντρο Βιοϊατρικών Ερευνών Αλέξανδρος Φλέμινγκ, Ινστιτούτο Ανοσολογίας, Αθήνα,Ελλάδα,28Μαρτίου2005.

2005 IMBB-ΙΤΕ,ΗράκλειοΚρήτης,Ελλάδα,11Μαΐου2005.2006 Εθνικό Ινστιτούτο Αλλεργιών και μεταδιδόμενων νοσημάτων (NIAID/ΝΙΗ), Τμήμα Κυτταρικής και

ΜοριακήςΑνοσολογίας(LCMI),ΗΠΑ,28Μαρτίου2006.2006 IMBB-ΙΤΕ,ΗράκλειοΚρήτης,Ελλάδα,18Σεπτεμβρίου2006.2006 ΠανεπιστήμιοDuke,ΤμήμαΑνοσολογίας,ΗΠΑ,28Νοεμβρίου2006.2006 ΑντικαρκινικόκέντροMoffit,ΠανεπιστήμιοΝότιαςΦλόριδα,ΗΠΑ,15Μαρτίου2006.2007 Πανεπιστήμιο Washington στο Saint Louis, Τμήμα Παθολογίας/Ανοσολογίας, ΗΠΑ, 5 Ιανουαρίου

2007.2007 ΠανεπιστήμιοMassachusettsστοWorcester,ΤμήμαΠαθολογίας,ΗΠΑ,2Φεβρουαρίου2007.2007 ΠανεπιστήμιοColumbia,ΤμήμαΒιολογίας,ΝέαΥόρκη,ΗΠΑ,14Φεβρουαρίου2007.2007 ΠανεπιστήμιοHarvard,ΤμήμαΚυτταρικήςΒιολογίας,ΗΠΑ,22Φεβρουαρίου2007.2007 ΠανεπιστήμιοHarvard,ΤμήμαΠαθολογίας,ΗΠΑ,28Φεβρουαρίου2007.2007 ΠανεπιστήμιοRockefeller,ΝέαΥόρκη,ΗΠΑ,5Μαρτίου2007.2007 ΝοσοκομείοΗammersmith,MRC,Λονδίνο,Αγγλία,2Απριλίου2007.2007 ΠανεπιστήμιοDuke,ΚέντροεπιστημώνΓονιδιωματικής,ΗΠΑ,5Μαΐου2007.2015ΠανεπιστήμιοDebrecen,Medical&HealthScienceCenter,Ουγγαρία,14Μαΐου2015.ΣΥΜΜΕΤΟΧΗΣΕΣΥΝΕΔΡΙΑ(2008-,σαναυτόνομοςερευνητής/καθηγητής) 2009 Tri-Society Annual Conference of the Society for Leukocyte Biology, International Cytokine Society,

and the International Society for Interferon and Cytokine Research, Λισαβόνα, Πορτογαλία, 18-21Οκτωβρίου.

2009 60οΠανελλήνιοΣυνέδριοΕλληνικήςΕταιρείαςΒιοχημείας&ΜοριακήςΒιολογίας,ΑίγληΖαππείου,Αθήνα,20-22Νοεμβρίου.

2010 “ΠρώτοΣυνέδριοΠρωτεϊνωματικήςστηνΚρήτη”,Ηράκλειο,Κρήτη,7-9Οκτωβρίου2010.2012 “Joint Meeting on Chromatin Dynamics and Epigenomics”, Keystone, Colorado, USA, 17-22

Ιανουαρίου2012.2012 “2ndGreekOrbitrapUsersMeeting”,Ηράκλειο,Κρήτη,23-24Απριλίου2012.2012 "Gene regulation: From DNA Sequence to Nuclear Structure”, INTEGER-ITN Conference, Eugenides

Foundation,Athens,Greece,14-16November2012.StratigiC.,KapsetakiM.,AivaliotisM.andSpilianakisC.G(Poster)“Homologouspairingandlongnon-codingRNAsregulateTnfαallelicexpression”.

2012 "Gene regulation: From DNA Sequence to Nuclear Structure”, INTEGER-ITN Conference, EugenidesFoundation,Athens,Greece,14-16November2012.TzerposP.,SavvidisT.,AivaliotisM.,BenosP.V.,SpilianakisC.(Poster),“BioinformaticandproteomicanalysisoftranscriptionfactorbindingsitesininteractingregulatoryelementsinmouseTcells”.

2013 38thFEBSCongress“MechanismsinBiology”,StPetersburg,Russia,6-11July2013.TzerposP.,SavvidisT.,AivaliotisM.,BenosP.V.,SpilianakisC. (Poster)“BioinformaticandproteomicanalysisoftranscriptionfactorbindingsitesininteractingregulatoryelementsinmouseTcells”.

2013 The5thEMBOmeeting,Amsterdam,TheNetherlands,21-24September2013.Claire Psyllaki & Charalampos Spilianakis (Poster), “SATB1 mediates long-range chromosomalinteractionsinCD4+cells”.

2013 9thHellenicConferenceofImmunology,Athens,Greece,12-14December2013.CharalamposSpilianakis(speaker),“Epigeneticregulationofcytokines”.

2014 3rd Summer School inMedical&BiosciencesResearch&Management, Itilo-Mani, Laconia,Greece,17-25May2014.Charalampos Spilianakis (speaker) “Homologous pairing and long non-coding RNAs regulate Tnfαallelicexpression”.

2014 EMBO Workshop: “Non-coding RNAs in genome expression, maintenance and stability”, Cargese(Corsica),France,07-10October2014.


SalatajE.,StathopoulouC.andSpilianakisC.G.(Poster)“SubnuclearlocalizationofmiRNAgenelociasapotentialmechanismoftranscriptionalregulation”.

2014 EMBOPracticalCourse“Non-codingRNAinInfection”,Wurzburg,Germany,12-18October2014.Kapsetaki M., Stratigi K. and Spilianakis C. (Poster) “LncRNAs SeT and ASeT regulate Tnfα geneexpression”

2015 InternationalCourse:NonCodingGenome,InstituteCurie,Paris,France,09-13February2015.SalatajE., Stathopoulou C., Spilianakis C. (Poster) “Subnuclear localization of miRNA loci as a potentialmechanismoftranscriptionalregulation”.

2015 EMBOConference“ChromatinandEpigenetics”,Heidelberg,Germany,6-10May2015.TzerposP.,PanagopoulosG.,SavvidisT.,AivaliotisM.,BenosP.V.,SpilianakisC.(Poster)“ConvergentrolesoftranscriptionfactorsBACH1andSATB1inmurineTcells”.

2015 EMBOConference“ChromatinandEpigenetics”,Heidelberg,Germany,6-10May2015.Stratigi K., Kapsetaki M., Aivaliotis M., Town T., Flavell R. A. and Spilianakis C.G. (Poster) “Spatialproximity of homologous alleles and long noncoding RNAs regulate a switch in allelic geneexpression”.

2015 StemCellEpigenetics,Sitges,Spain,20-22September2015.SalatajE.,StathopoulouC.andSpilianakisC.G.(Poster)“SubnuclearlocalizationofmiRNAgenelociasapotentialmechanismoftranscriptionalregulation”.

2015 TheNon-codingGenome,EMBO/EMBLSymposium,Heidelberg,Germany,18-22October2015. SalatajE.,StathopoulouC.,HafthorssonR.,SpilianakisC.G.(Poster)“SubnuclearlocalizationofmiRNA

loci:Alinkbetweennuclearperipheryandtranscriptionalregulation”ΣΥΜΜΕΤΟΧΗΣΕΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΑΣΕΜΙΝΑΡΙΑ(WORKSHOPS)καιΘΕΡΙΝΑΣΧΟΛΕΙΑ 2008 ΟμιλητήςστοΚαλοκαιρινόσχολείοΑνοσολογίας,Κολυμπάρι,Κρήτη,Ιούλιος2008.2009 ΟμιλητήςστοΚαλοκαιρινόσχολείοΑνοσολογίας,Φισκάρδο,Κεφαλονιά,Αύγουστος2009.2011 “WorkshoponFunctionalandStructuralProteomics”,ΙνστιτούτοΠαστέρ,Αθήνα,6-7Οκτωβρίου20112012 “ProteintoProteomicsWorkshop”,Ηράκλειο,Κρήτη,5-9Μαρτίου2012. 2014 Third Summer School inMedical and Biosciences Research andManagement,Mani, Greece, 17-25

May2014(προσκεκλημένοςομιλητής).2014 ErasmusIntensiveProgramme“Careanduseoflaboratoryanimals.Science,philosophyandsociety”,

5-16May2014,Heraklion,Crete,Greece(ομιλητής).2014 European Summer School on Gene Regulation, 9-13 June 2014, Heraklion, Crete, Greece

(προσκεκλημένοςομιλητής).2015 Erasmus IntensiveProgramme,2nd International Course, “Care anduseof laboratory animals”, 1-12

June2015,Heraklion,Crete,Greece.ΟΡΓΑΝΩΣΗΣΥΝΕΔΡΙΩΝ2010 Μέλος της Οργανωτικής Επιτροπής για το “First International Proteomics Conference on Crete”.

IMBB-ΙΤΕΗράκλειο,Κρήτη,07-09Οκτωβρίου2010.2011 Μέλος της Οργανωτικής Επιτροπής για το “Workshop on Functional & Structural Proteomics,

ΙνστιτούτοΠαστέρ,Αθήνα,Ελλάδα,06-07Οκτωβρίου2011.2012 Μέλος τηςΟργανωτικήςΕπιτροπήςγια το “Proteins toProteomicsWorkshop”, IMBB-ΙΤΕ,Ηράκλειο,

Κρήτη,05-09Μαρτίου2012.2012 ΜέλοςτηςΟργανωτικήςΕπιτροπήςγιατο“2ndGreekOrbitrapUsersMeeting”,IMBB-ΙΤΕ,Ηράκλειο,

Κρήτη,23-24Απριλίου2012.2014 Μέλος της Οργανωτικής Επιτροπής “3rd Summer School in Medical & Biosciences Research &

Management,WHBA,Μάνη,Ελλάδα,17-25Μαΐου2014.2016 Οργανωτής του Workshop: “Folding chromatin in Three dimensions”, Μιλάνο, Ιταλία, 04

Φεβρουαρίου2016.


ΕΚΠΑΙΔΕΥΤΙΚΕΣΔΡΑΣΤΗΡΙΟΤΗΤΕΣ

Ø Στη διδασκαλία των προπτυχιακών μαθημάτων εφαρμόζεται το σύστημα διαδραστικής διδασκαλίαςiRESPOND (www.irespond.com) που επιτρέπει την αξιολόγηση της δεκτικότητας και κατανόησης τηςύληςκατάτηδιάρκειατωνδιαλέξεωναλλάκαιμετάαπόαυτές.Τοσύστημαέχειαποκτηθείμείδιαμέσακαιεφαρμόζεταιταδύοτελευταίαέτηστιςδιαλέξειςπροπτυχιακώνμαθημάτων.

Ø Για όλα τα μαθήματα έχουν δημιουργηθεί και συντηρούνται αποκλειστικές ιστοσελίδες με γενικέςπληροφορίες, τα ηλεκτρονικά αρχεία των διαλέξεων με λειτουργικά πολυμέσα (.pdf και PowerPointαρχεία με audiovisual effects) καθώς και όλα τα θέματα των εξετάσεων με απαντήσεις(http://www.spilianakislab.gr/courses.html).

Ø Στο Παράρτημα του παρόντος εντύπου/αρχείου παρατίθεται αποτίμηση του διδακτικού έργου τουδιδάσκοντα από τους φοιτητές για τα προπτυχιακά μαθήματα για τα οποία διατηρεί αρχείο τοΠανεπιστήμιοΚρήτης.

ΔΙΔΑΣΚΑΛΙΑΠΡΟΠΤΥΧΙΑΚΩΝΜΑΘΗΜΑΤΩΝ1997-1998 Εργαστηριακέςασκήσειςμαθήματος“ΒιοχημείαΙ”.ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.

1997-1998 Εργαστηριακές ασκήσεις μαθήματος “Μοριακή Βιολογία”. Τμήμα Βιολογίας, ΠανεπιστήμιοΚρήτης.

2006-2007 Διάλεξη στο μεταπτυχιακό μάθημα «Χρωματίνη και Γονιδιακή έκφραση» στο μεταπτυχιακόπρόγραμμα του τμήματος Ανοσοβιολογίας του πανεπιστημίου Yale. Τίτλος διάλεξης: «Δια-αλληλικάφαινόμεναστογονιδίωματωνευκαρυωτικώνκυττάρων».

2009-2010 Διδασκαλία του προπτυχιακού μαθήματος «Τα βραβεία Nobel στη Βιολογία». ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.(ΒΙΟΛ-448,υπεύθυνοςμαθήματος).

2009-2011 Υπεύθυνος του εργαστηριακών ασκήσεων Βιοχημείας στο εργαστηριακό μάθημα «ΜέθοδοιΜικροβιολογίας και Βιοχημείας». Τμήμα Βιολογίας, Πανεπιστήμιο Κρήτης. (ΒΙΟΛ-209συνυπεύθυνοςμεΑ.Οικονόμου).

2009- Μάθημαμεανάθεσηύλης.ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης(ΒΙΟΛ-443).

2010- Διδασκαλία του προπτυχιακού μαθήματος “Βιοχημεία Ι”. Τμήμα Βιολογίας, ΠανεπιστήμιοΚρήτης(ΒΙΟΛ-154,υπεύθυνοςμαθήματος).

2010- Συν-διδασκαλία τουπροπτυχιακούμαθήματος “ΒασικέςαρχέςΚυτταρικήςΒιολογίας”, ΤμήμαΧημείας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης(ΧΗΜ-046,4δίωρεςδιαλέξεις).

2011 Συνυπεύθυνος εργαστηριακού μαθήματος «Μέθοδοι Μοριακής και Κυτταρικής Βιολογίας».ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης(ΒΙΟΛ-250).

2011- Διδασκαλία του προπτυχιακού μαθήματος “Βιοχημεία της Επιγενετικής”. Τμήμα Βιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης(ΒΙΟΛ-414,υπεύθυνοςμαθήματος).

2012-2014 Συνυπεύθυνος στο εργαστηριακό μάθημα «Γενικές μέθοδοι ταυτοποίησης και ανάλυσηςβιολογικώνμακρομορίων».ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης(ΒΙΟΛ-155).

2012- Διδασκαλία στο εργαστηριακό μάθημα «Γενικές μέθοδοι ταυτοποίησης και ανάλυσηςβιολογικών μακρομορίων». Τμήμα Βιολογίας, Πανεπιστήμιο Κρήτης (ΒΙΟΛ-155, 3εργαστηριακέςασκήσεις).

2015- Υπεύθυνος του προπτυχιακού υποχρεωτικού μαθήματος «Μοριακή Βιολογία». ΤμήμαΒιολογίας, Πανεπιστήμιο Κρήτης (ΒΙΟΛ-207, Διδάσκων: Ομότιμος Καθηγητής ΙωσήφΠαπαματθαιάκης).

ΔΙΔΑΣΚΑΛΙΑΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΩΝΜΑΘΗΜΑΤΩΝ2008- Διδασκαλία(2δίωρεςδιαλέξεις)στομεταπτυχιακόμάθημαΒΙΟ1403«Μοριακήοργάνωσητης

ζωής»τουΜεταπτυχιακούΠρογράμματος«ΜοριακήΒιολογία–Βιοϊατρική».ΤμήμαΒιολογίας&Ιατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.


2008- Διδασκαλία (1 δίωρη διάλεξη) στο μεταπτυχιακό μάθημα «Ανοσία και Λοιμώξεις» τουΜεταπτυχιακού Προγράμματος «Μοριακή βάση των νοσημάτων του ανθρώπου». ΤμήμαΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.

2009-2014 Διδασκαλία (5 τετράωρες διαλέξεις στα Αγγλικά) του μεταπτυχιακού μαθήματος “Βασικέςαρχές Βιοχημείας” του Μεταπτυχιακού Προγράμματος “Horticultural Genetics andBiotechnology”. Τμήμα Γενετικής και Βιοτεχνολογίας Φυτών, Μεσογειακό ΑγρονομικόΙνστιτούτοΧανίων.(υπεύθυνοςμαθήματος).

2011- Διδασκαλία (2 δίωρες διαλέξεις) στο μεταπτυχιακό μάθημα ΒΙΟ1405 «Πολυκυτταρικήοργάνωση της ζωής» τουΜεταπτυχιακού Προγράμματος «Μοριακή Βιολογία – Βιοϊατρική».ΤμήμαΒιολογίας&Ιατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.

2015- Διδασκαλία(2δίωρεςδιαλέξεις)στομεταπτυχιακόμάθημαΒΙΟ1408«ΒιοϊατρικήΕπιστήμηκαιΤεχνολογία» του Μεταπτυχιακού Προγράμματος «Μοριακή Βιολογία – Βιοϊατρική». ΤμήμαΒιολογίας&Ιατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.

ΕΠΙΒΛΕΨΗΠΡΟΠΤΥΧΙΑΚΩΝΦΟΙΤΗΤΩΝA. Επίβλεψη Προπτυχιακής Εργασίας Εξειδίκευσης - Πρακτική Άσκηση - Τριμηνιαίο

ΕργαστηριακόΜάθημα

Ø ΑργυρώΞανθάκη(01.05.2008-30.09.2008).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«ΚλωνοποίησηγονιδίωνποντικούSOCS1καιSOCS3».

Ø ΘεόδωροςΣαββίδης(01.03.2009-30-06.2009).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«ΕκμάθησητεχνολογιώνinsituυβριδοποίησηςDNAμεφθορίζοντεςανιχνευτές».

Ø ΓεώργιοςΑραμπατζής(01.02.2010-15.06.2010).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«ΚλωνοποίησητηςκωδικήςπεριοχήςτουγονιδίουPKM2τουποντικούσεφορέαπουφέρειτηνπράσινηφθορίζουσαπρωτεΐνη».

Ø ΑγαθοκλήςΑνδριανός(01.02.2010-15.06.2010).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«ΑνάπτυξητεχνολογίαςανοσοφθορισμούγιατηνπρωτεΐνηSATB1τουποντικούσεσυνδυασμόμεinsituυβριδοποίησηDNAσεCD4+Tλεμφοκύτταρα».

Ø ΑνδρέαςΠάτσαλος(01.02.2010-30.09.2010).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«Κλωνοποίηση περιοχών της γενωμικής περιοχής του IFΝγR1 στις οποίες βρίσκονται πιθανές CpGνησίδεςέπειτααπόbisulfitetreatmentώστεναπιστοποιηθείημεθυλιωμένηκατάστασητωνπεριοχώνκαιναβρεθούνεπακριβώςοικυτοσίνεςπουμεθυλιώνονταιήόχιμέσωαλληλούχισης».

Ø ΑνίταΛουλουπή(15.09.2010-29.12.2010).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«ΚλωνοποίησηκαιέκφρασητηςπρωτεΐνηςBACH1σεκύτταραE.coli».

Ø Ταξιάρχης Παπακωνσταντίνου (01.09.2011-15.01.2012). Τμήμα Βιολογίας, Πανεπιστήμιο Κρήτης.«Εκμάθηση τεχνικών Μοριακής Βιολογίας και in situ φθορίζουσα υβριδοποίηση σε κύτταραμακροφάγωνποντικούγιατονέλεγχοδιαχρομοσωμικώναλληλεπιδράσεων».

Ø ΣτέλλαΜπάλιου(20.09.2011-25.01.2012).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«Βιοπληροφορική ανάλυση γενετικών τόπων που αλληλεπιδρούν με το γονίδιο TNFa σε κύτταραμακροφάγων ποντικού όπως αποκαλύφθηκε με την τεχνολογία ACT (Associated Chromosome Trap)προκειμένουναεντοπιστούνκοινάρυθμιστικάγενετικάστοιχεία».

Ø ΣοφίαΜπακογιάννη(25.09.2011-20.01.2012).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«ΕκμάθησημοριακώντεχνικώνκαικλωνοποίησηγονιδίουSatb1σεφορέαέκφρασηςPCRII-TOPO».

Ø Γεώργιος Παναγόπουλος (29.02.2012-31.05.2012). Τμήμα Βιολογίας, Εθνικό και ΚαποδιστριακόΠανεπιστήμιοΑθηνών.«Πραγματοποίηση πειραμάτων ανοσοκατακρήμνισης χρωματίνης με αντισώματα ειδικά για τηνπρωτεΐνηSATB1καιανάλυσημεποσοτικήPCRπεριοχώντουγενετικούτόπουTH2τουποντικού».

Ø ΜαρίαΣτρατηγοπούλου(07.02.2013-31.06.2014).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.


«Προσδιορισμόςτηςαπόστασηςαλληλομόρφωνγονιδίωνστονπυρήνακυττάρωνποντικών(musmusculus)».

Ø ΜαρίαΣτρατηγοπούλου(01.07.2013-31.09.2013).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«Εκμάθησημοριακώντεχνικών».

Ø ΚωνσταντίνοςΚλαουράκης(15.06.2013-31.08.2013).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«ΕκμάθησημοριακήςκλωνοποίησηςκαιαπομόνωσηDNAαπόβακτηριακέςκαλλιέργειες».

Ø ΕυαγγελίαΤαχματζίδη(01.10.2013-31.12.2013).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«ΑνάπτυξηκαιαξιολόγησηπειραματικώνδιαδικασιώνγιατονεντοπισμότηςτοπολογίαςγενετικώντόπωνmicroRNAsστονπυρηνικόφάκελοκαισυσχετισμόςμετοπρότυποέκφρασηςαυτών».

Ø ΔήμητραΝικολέρη(01.04.2014-31.08.2014).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«ΠραγματοποίησηγονιδιακήςκατασκευήςκυτταροειδήςεπαγόμενηςστόχευσηςτουLTγονιδιακούτόπουσεποντικό(musmusculus)».

Ø ΙωάνναΠιτσιδιανάκη(01.07.2014-31.08.2014).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«Κλωνοποίηση,απομόνωσηκαικαθαρισμόςπλασμιδιακήςκατασκευήςγιατησίγησητουμεταγραφικούπαράγονταCTCF».

Ø ΓεώργιοςΜαστροσταμάτης(01.02.2015-15.05.2015).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«Υποπυρηνικήτοποθέτηση9miRNAsσεCD4+ΤκύτταρασεαγρίουτύπουκαιSATB1-/-ποντίκια».

Ø ΗρώΣκόπα(15.09.2015-31.12.2015).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«Εκμάθησητεχνικήςχρώσηςολόκληρωνχρωμοσωμάτων».

Ø ΔημήτριοςΜαριάτος(15.09.2015-31.12.2015).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«Εκμάθησηβασικώνμοριακώντεχνικών».

Β.ΕπίβλεψηΔιπλωματικήςΕργασίαςØ ΘεόδωροςΣαββίδης(01.09.2009-30.08.2010).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.

«ΜιααναπτυξιακήσκοπιάδιαχρωμοσωμικάαλληλεπιδρώντωνγενετικώντόπωνσεΤλεμφοκύτταρακαιαναγνώρισηπιθανώνπ[πρωτεϊνικώνσυμπλόκωνπουμεσολαβούν,μέσωπρωτεϊνωματικήςανάλυσης»

Ø ΜάρκελλοςΚριτσιωτάκης(28.09.2009-30.08.2010).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«ΜελέτητουπαράγονταPur-1στηνομόλογηαλληλεπίδρασηΤNFααλληλίωνσεκύτταραμακροφάγωνποντικού».

Ø ΓεώργιοςΑραμπατζής(01.09.2010-15.06.2011).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«Συρρύθμιση του γενετικού τόπου TNFα με τους υποδοχείς του, TNFR1 και TNFR2 σε μακροφάγακύτταραποντικού:μιακυτταρογενετικήπροσέγγιση».

Ø ΑγαθοκλήςΑνδριανός(01.10.2010-15.07.2011).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«Μελέτη της αλληλεπίδρασης του γενετικού τόπου TNFα με τους γενετικούς τόπους Arrb1, P2RX4,Adipor1καιE4F1σεκύτταραμακροφάγων».

Ø ΑνδρέαςΠάτσαλος(01.10.2010-15.06.2011).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«Η οργάνωση της χρωματινικής δομής στους γενετικούς τόπους CD4 και CD8 σε πρωτογενήθυμοκύτταραποντικού».

Ø ΣοφίαΜπακογιάννη(21.01.2012-30.07.2012).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«SerinephosphorylationofBACH1definesitsnuclearlocalization».

Ø ΤαξιάρχηςΠαπακωνσταντίνου(01.02.2012-31.06.2012).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«Intra-chromosomal and inter-chromosomal interactions between TNF and E4F1, P2RX4, Arrb1 andAdipor1”.

Ø ΣτέλλαΜπάλιου(01.02.2012-30.06.2012).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«Βιοπληροφορική, βιοχημική και κυτταρογενετική μελέτη ευρείας κλίμακας διαχρωμοσωμικώναλληλεπιδράσεωντωνγενετικώντόπωνTNFακαιE4F1σεκύτταραμακροφάγωνποντικούπρινκαιμετάτηνενεργοποίησήτουςμεφυσιολογικέςσυγκεντρώσειςλιποπολυσακχαρίτη».


Ø ΕυαγγελίαΤζίκα(01.02.2013-31.06.2013).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«ΠροσδιορισμόςτηςθέσηςένθεσηςτουγενετικούτόπουΤΗ2σεδιαγονιδιακούςποντικούς».

Ø ΝεφέληΝτελεπιάνε(01.10.2013-31.05.2013).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Κλωνοποίηση και έκφραση σε ετερόλογο σύστημα της ισομορφήςΜ2 της πρωτεΐνης πυροσταφυλικήκινάσηεπίμυος(PKM2)καιπραγματοποίησημη-ραδιενεργώνδοκιμώνμετατόπισηςηλεκτροφορητικήςκινητικότητας(non-radioactiveEMSA).

Ø ΜαρίαΣτρατηγοπούλου(01.10.2013-31.05.2014).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«ΗαλληλεπίδρασηγενετικώντόπωνmicroRNAsμετηνπυρηνικήλαμίνηA/CκαιημελέτητουπροτύπουτηςέκφρασηςτωνπρωτεϊνώνBACH1,SATB1καιHP1σεκύτταρατουανοσοποιητικούσυστήματοςτουποντικού».

Ø ΔήμητραΝικολέρη(01.02.2015-31.10.2015).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«Δημιουργίαπλασμιδιακήςκατασκευήςγιατηνεξάλειψητωνρυθμιστικώνπεριοχώνυπεύθυνωνγιατημεταγραφικήρύθμισητουμεγάλουμη-κωδικούRNAAseTτουγονιδιακούτόπουTNFα».

Ø ΕυαγγελίαΤαχματζίδη(01.01.2014-31.09.2015).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«Ανάλυση της θέσης ένθεσης του ΤΗ2 γενετικού τόπου σε έξι διαγονιδιακές σειρές επίμυων καιπροσδιορισμόςτουζυγωτικούτουςπροτύπου».

Ø ΚωνσταντίνοςΚλαουράκης(15.09.2015-).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«ΠραγματοποίησηπειραμάτωνChIPseqγιαCOMPASS-εξαρτώμενες τροποποιήσεις ιστονώνσεMNase-treatedCD4κύτταρα».

Ø ΗρώΣκόπα(01.01.2016-).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.

Ø ΔημήτριοςΜαριάτος(01.01.2016-).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.ΕΠΙΒΛΕΨΗΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΩΝΦΟΙΤΗΤΩΝA. ΕπίβλεψηΠροχωρημένηςΕργαστηριακήςΆσκησης(rotation)

Ø ΜαριλέναΜελά (20.05.2008-15.08.2008).ΜεταπτυχιακόΠρόγραμμα«Μοριακήβάση των νοσημάτωντουανθρώπου»,ΤμήμαΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.“DNA-FISHinLPSinducedRAWmonocytes”.

Ø Καλλιόπη Στρατήγη (01.08.2008-30.09.2008). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «Μοριακή βάση τωννοσημάτωντουανθρώπου»,ΤμήμαΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.“UnravelingthemechanismofhomologousassociationoftheTNFaallelesinmousemacrophages”.

Ø ΠέτροςΤζέρπος(01.08.2008-30.09.2008).ΜεταπτυχιακόΠρόγραμμα«ΜοριακήΒιολογία–Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.“TheroleofBACH1proteinininterchromosomalinteractions”.

Ø Εμμανουέλλα Καλλέργη (01.03.2009-15.05.2009). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «Μοριακή Βιολογία –Βιοϊατρική».ΤμήμαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.“IdentificationofMARssitesinmultiplegeneticloci”.

Ø Γιάννης Λιάπης (01.04.2009-30.06.2009). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «Μοριακή βάση των νοσημάτωντουανθρώπου»,ΤμήμαΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.“IdentificationoflongintergenictranscriptsinthemouseTNFlocus”.

Ø ΜιχάληςΣαρρής(18.05.2009-30.06.2009).ΜεταπτυχιακόΠρόγραμμα«ΜοριακήΒιολογία–Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.“FunctionalevaluationofMARssitesinthemouseTH2locus”.

Ø ΙωάνναΠεράκη(01.07.2009-30.09.2009).ΜεταπτυχιακόΠρόγραμμα«ΜοριακήΒιολογία–Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«ΠυρηνικόςεντοπισμόςτωνγενετικώντόπωνΤΗ2καιIFNγσεπαρθέναCD4κύτταραποντικού».

Ø Κωνσταντίνος Παλικαράς (20.05.2010-20.07.2010). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «Μοριακή Βιολογία –Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.


«Χαρακτηρισμόςτων invivoθέσεωνπρόσδεσηςτωνπρωτεϊνώνGfi1καιp65(NFκB)στογενετικότόποTNFα του ποντικού με διενέργεια πειραμάτων ανοσοκατακρήμνισης χρωματίνης από κύτταραμακροφάγωνμετάαπόεπαγωγήμελιποπολυσακχαρίτησεδιακριτάχρονικάσημεία».

Ø Μαρία Αυγουλέα (20.07.2010-20.09.2010). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «Μοριακή Βιολογία –Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«ΑνάλυσηπροτύπουέκφρασηςmRNAτηςκυτοκίνηςTNFασεκύτταραμακροφάγωνποντικούμετάτηνεπαγωγήαπόλιποπολυσακχαρίτη».

Ø Δημήτρης Θεοφιλάτος (02.05.2011-29.07.2011). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «Μοριακή βάση τωννοσημάτωντουανθρώπου»,ΤμήμαΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«ΧαρακτηρισμόςτωνυποκινητώντουγονιδίουSATB1τουποντικούσεCD4+κύτταραποντικού».

Ø Κωνσταντίνα Καλοδήμου (23.05.2011-22.07.2011). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «Μοριακή Βιολογία-Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.“Chromosome Conformation Capture design and analysis for the mouse TNFa interacting loci in LPSactivatedmacrophages”.

Ø Αικατερίνη Τσουρούλα (25.07.2011-30.09.2011). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «Μοριακή Βιολογία-Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«Ο ρόλος της πρωτεΐνης SATB1 και της οικογένειας των miR200 microRNAs στη μετανάστευση τωνμακροφάγωνσεεστίεςφλεγμονής».

Ø ΚλαίρηΨυλλάκη (01.07.2012-30.09.2012).ΜεταπτυχιακόΠρόγραμμα«ΜοριακήΒιολογία-Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«ΚλωνοποίησηκαιμεταλλαξιγένεσησερίνηςστηνκωδικήπεριοχήτουγονιδίουSATB1τουποντικού».

Ø ΦράγγαΠέγκα (10.09.2012-25.12.2012).ΜεταπτυχιακόΠρόγραμμα«ΜοριακήΒιολογία - Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«ΚλωνοποίησητουγονιδίουποντικούThPOKκαιπαροδικήδιαμόλυνσηευκαρυωτικώνκυττάρων».

Ø Άννα Ιωανίδου (21.04.2013-15.07.2013).ΜεταπτυχιακόΠρόγραμμα«ΜοριακήΒιολογία - Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«Προσδιορισμός της θέσης ένθεσης διαγονιδίου του ΤΗ2 γενετικού τόπου σε διαφορετικέςδιαγονιδιακέςσειρέςποντικών».

Ø Γεώργιος Παναγόπουλος (15.07.2013-15.09.2013). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «Μοριακή Βιολογία -Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.

Ø Κωνσταντίνος Σοφιάδης (04.05.2014-07.07.2014). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «Μοριακή βάση τωννοσημάτωντουανθρώπου»,ΤμήμαΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.“PeripheralNuclearLocalizationofExpressedmiRNAgenes”

Ø ΕλευθερίαΛεδάκη(01.05.2015-31.10.2015).ΜεταπτυχιακόΠρόγραμμα«Μοριακήβάσητωννοσημάτωντουανθρώπου»,ΤμήμαΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«ΔημιουργίαπλασμιδιακώνκατασκευώνσεευκαρυωτικούςφορείςέκφρασηςγιατιςπρωτεϊνεςBACH1καιSATB1τουποντικού».

B. ΕπίβλεψηΜεταπτυχιακούΔιπλώματοςΕξειδίκευσηςØ Χρυσούλα Δεληγιάννη (01.12.2007-30.09.2008). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «Μοριακή βάση των

νοσημάτωντουανθρώπου»,ΤμήμαΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«Συρρύθμισηγενετικούτόπουκυτοκίνηςκαιυποδοχέατης.

Ø Καλλιόπη Στρατήγη (01.10.2008-31.09.2009). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «Μοριακή βάση τωννοσημάτωντουανθρώπου»,ΤμήμαΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης."Inter-chromosomalinteractionsbetweentheTNFαalleles”.

Ø ΠέτροςΤζέρπος(01.10.2008-31.09.2009).ΜεταπτυχιακόΠρόγραμμα«ΜοριακήΒιολογία-Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.


«Απομόνωση και χαρακτηρισμός πρωτεϊνικών συμπλόκων που συμμετέχουν στις διαχρωμοσωμικέςαλληλεπιδράσειςγενετικώντόπωνκυτοκινών».

Ø ΜιχάληςΣαρρής(01.09.2009-31.09.2010).ΜεταπτυχιακόΠρόγραμμα«ΜοριακήΒιολογία-Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης."TheroleofSATB1proteininregulatinglongrangeinterchromosomalinteractionsinImmunecells”.

Ø Κλεάνθη Ψυλλάκη (01.10.2012-31.07.2013). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «Μοριακή Βιολογία -Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«ΜελέτητηςδιαφορικήςέκφρασηςτουγονιδίουSATB1διαμέσωχρήσηςεναλλακτικώνυποκινητώνσταCD4+λεμφοκύτταρατουποντικούκατάτηδιάρκειατηςανάπτυξηςκαιδιαφοροποίησης».

Ø Γεώργιος Παναγόπουλος (01.10.2013-31.09.2014). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «Μοριακή Βιολογία -Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«DistinctrolesoftheSpecialAT-richsequence-Bindingprotein-1duringT-celldevelopment».

Ø RóbertAntonHafþórsson(12.09.2015-31.01.2016)LundUniversity,πρόγραμμαERASMUS+.«UnravelingthefunctionalsignificanceofchromatinorganisationintheregulationofthemurineInnateandAdaptiveImmunesystem».

Γ.ΕπίβλεψηΔιδακτορικήςΔιατριβήςØ ΧρυσούλαΔεληγιάννη(01.10.2008-31.08.2012).ΤμήμαΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.

«Ευρείαςκλίμακαςγονιδιωματικέςαλληλεπιδράσειςρυθμίζουνεπιγενετικάτηνέκφρασηενόςυποδοχέακυτοκίνης».

Ø ΚαλλιόπηΣτρατήγη(01.10.2009-22.07.2013).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«ΡύθμισητηςομόλογηςαλληλεπίδρασηςτουγενετικούτόπουTNFατουποντικούαπόμη-κωδικάRNAsκαθορίζειτηνδιαλληλικήέκφρασητουγονιδίου».

Ø ΠέτροςΤζέρπος(01.10.2009-).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«Ρύθμιση της παρθένας κατάστασης των CD4+ Τ λεμφοκυττάρων του ποντικού από το μεταγραφικόπαράγονταBACH1».

Ø EraldaSalataj(08.04.2013-).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«Υποπυρηνική τοποθέτηση και μεταγραφική ρύθμιση γενετικών τόπων miRNAs στο ανοσοποιητικόσύστημα».

Ø Χρυσάνθη Σταθοπούλου (01.02.2013- ). Τμήμα Μοριακής Βιολογίας και Γενετικής του ΔημοκρίτειουΠανεπιστημίουΘράκης.«ΜελέτητηςπυρηνικήςοργάνωσηςστηνέκφρασημικρώνRNAsστοέμφυτοκαιεπίκτητοανοσοποιητικόσύστημα».

Ø ΘεόδωροςΣαββίδης(15.11.2015-).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.«ΑποσαφήνισητουλειτουργικούρόλουτουπρωτεϊνικούπαράγονταSATB1στονκαθορισμότηςκυτταρικήςταυτότηταςτωνCD4+Τλεμφοκυττάρωνποντικού».

Ø TomasZelenka(01.11.2015-).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.“DefiningtheSATB1-dependentthreedimensionalchromatinstructureinCD4+cells”.

Δ.ΕξωτερικόςΕξεταστήςΜεταπτυχιακούΔιπλώματοςΕξειδίκευσηςØ Ζίβκος Αποστόλου (επιβλέπων: Γ.Γαρίνης). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «Μοριακή Βιολογία –

Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.

Ø Μαρία Αυγουλέα (επιβλέπων: Γ.Μαυροθαλασσίτης).ΜεταπτυχιακόΠρόγραμμα «Μοριακή Βιολογία –Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.

Ø Εμμανουήλ Βλάχος (επιβλέπων: Ν.Ταβερναράκης). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «Μοριακή Βιολογία –Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.


Ø Μαρίνα Θεοδοσίου (επιβλέπων: Δ.Καραγωγέως). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «Μοριακή Βιολογία –Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.

Ø Κωνσταντίνα Καλοδήμου (επιβλέπων: Χ.Δελιδάκης). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «Μοριακή Βιολογία –Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.

Ø Ισμήνη Καρακασιλιώτη (επιβλέπων: Γ.Γαρίνης). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «Μοριακή Βιολογία –Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.

Ø Δέσποινα Κατσούγκρη (επιβλέπων: Γ.Χαλεπάκης). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «Μοριακή Βιολογία –Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.

Ø ΕλβίραΜητράκα (επιβλέπων:Χ.Λούης).ΜεταπτυχιακόΠρόγραμμα«ΜοριακήΒιολογία–Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.

Ø Κατερίνα Δεληγιάννη-Δαλακούρα (επιβλέπων: Κ.Τοκατλίδης). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «ΜοριακήΒιολογία–Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.

Ø ΦράγκαΠέγκα(επιβλέπων:Χ.Τσατσάνης).ΜεταπτυχιακόΠρόγραμμα«ΜοριακήΒιολογία–Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.

Ø ΕλένηΚαμπράνη(επιβλέπων:Δ.Μπούμπας).«ΜοριακήΒιολογία–Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.

Ø Κωνσταντίνος Σοφιάδης (επιβλέπων: Χ.Τσατσάνης). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «Μοριακή Βιολογία –Βιοϊατρική».ΤμήματαΒιολογίαςκαιΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.

Ø Νικόλαος Κουνδουράκης (επιβλέπων: Α.Οικονόμου). Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα «ΠρωτεϊνικήΒιοτεχνολογία».ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.

Ε.ΜέλοςτριμελούςσυμβουλευτικήςεπιτροπήςΔιδακτορικήςΔιατριβήςØ ΧρυσούλαΔεληγιάννη(επιβλέπων:Χ.Σπηλιανάκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΠέτροςΤζέρπος(επιβλέπων:Χ.Σπηλιανάκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΚαλλιόπηΣτρατήγη(επιβλέπων:Χ.Σπηλιανάκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΧριστίναΔοξάκη(επιβλέπων:Χ.Τσατσάνης),ΤμήμαΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΕμμανουέλλαΚαλλέργη(επιβλέπων:Κ.Τοκατλίδης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΙωάνναΜόσιαλου(επιβλέπων:Δ.Καρδάσης),ΤμήμαΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΑριστείδηςΜοσχονάς(επιβλέπων:Ηλιόπουλος),ΤμήμαΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΚωνσταντίνοςΠαλικαράς(επιβλέπων:Ν.Ταβερναράκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΓεώργιοςΠαπαδόπουλος(επιβλέπων:Ι.Στρουμπούλης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΑθηνάΠορτάλιου(επιβλέπων:Α.Οικονόμου),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΧριστιάνναΧατζημιχαήλ(επιβλέπων:Α.Κρετσόβαλη),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø PawelPiwko(επιβλέπων:Χ.Δελιδάκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΚωνσταντίνοςΤσολής(επιβλέπων:Α.Οικονόμου),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø Χρυσούλα Σταθοπούλου (επιβλέπων: Χ.Σπηλιανάκης), Τμήμα Μοριακής Βιολογίας και Γενετικής του

ΔημοκρίτειουΠανεπιστημίουΘράκης.Ø EraldaSalataj(επιβλέπων:Χ.Σπηλιανάκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΖίβκοςΑποστόλου(επιβλέπων:Γ.Γαρίνης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΈστερΚαλέφ-Εζρά(επιβλέπων:Κ.Τοκατλίδης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΝικολέταΣαχίνη(επιβλέπων:Ι.Παπαματθαιάκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΚυριάκοςΑγαθαγγέλου(επιβλέπων:Γ.Γαρίνης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø AndreaPrincz(επιβλέπων:Ν.Ταβερναράκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΚωνσταντίναΧανουμίδου(επιβλέπων:Α.Κρετσόβαλη),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΑμαλίαΒογιατζόγλου(επιβλέπων:Ι.Παπαματθαιάκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΚωνσταντίναΚαλοδήμου(επιβλέπων:Χ.Δελιδάκης).ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.


Ζ. Μέλος επιτροπών Γενικών Εξετάσεων Πιστοποίησης για εκπόνηση Διδακτορικής Διατριβής

(QualifyingExams)Ø ΓεώργιοςΠαπαδόπουλος(επιβλέπων:Ι.Στρουμπούλης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΧριστίναΔοξάκη(επιβλέπων:Χ.Τσατσάνης),ΤμήμαΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΧρυσούλαΔεληγιάννη(επιβλέπων:Χ.Σπηλιανάκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΕλβίραΜητράκα(επιβλέπων:Χ.Λούης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΧριστιάνναΧατζημιχαήλ(επιβλέπων:Α.Κρετσόβαλη),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΚωνσταντίνοςΠαλικαράς(επιβλέπων:Ν.Ταβερναράκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΑθηνάΠορτάλιου(επιβλέπων:Α.Οικονόμου),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΕμμανουέλλαΚαλλέργη(επιβλέπων:Κ.Τοκατλίδης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΚωνσταντίνοςΤσολής(επιβλέπων:Α.Οικονόμου),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΜαρίαΔασκαλάκη(επιβλέπων:Χ.Δελιδάκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø AndreaPrincz(επιβλέπων:Ν.Ταβερναράκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø Αικατερίνη Καραγκούνη-Δαλακούρα (επιβλέπων: Κ. Τοκατλίδης), Τμήμα Βιολογίας, Πανεπιστήμιο

Κρήτης.Ø ΝικολέταΣαχίνη(επιβλέπων:Ι.Παπαματθαιάκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΓεώργιοςΠαναγόπουλος(επιβλέπων:Χ.Σπηλιανάκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΜαρίναΑζναούροβα(επιβλέπων:Χ.Τσατσάνης),ΤμήμαΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΙσμήνηΚαρακασιλιώτη(επιβλέπων:Γ.Γαρίνης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΖίβκοςΑποστόλου(επιβλέπων:Γ.Γαρίνης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΈστερΚαλέφ-Εζρά(επιβλέπων:Κ.Τοκατλίδης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΜαρίαΔασκαλάκη(επιβλέπων:Κ.Καλαντίδης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΚυριάκοςΑγαθαγγέλου(επιβλέπων:Γ.Γαρίνης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΑμαλίαΒογιατζόγλου(επιβλέπων:Ι.Παπαματθαιάκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΜαρίαΜακού(επιβλέπων:Ι.Παπαματθαιάκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø EraldaSalataj(επιβλέπων:Χ.Σπηλιανάκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΜαρίαΤσεκρέκου(επιβλέπων:Γ.Γαρίνης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø ΚωνσταντίνοςΜπαρσάκης(επιβλέπουσα:Δ.Αλεξανδράκη),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Ø LucaIamartino(επιβλέπων:Γ.Γαρίνης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Η.ΜέλοςΕπταμελούςεπιτροπήςεξέτασηςΔιδακτορικήςΔιατριβής2009 ΓεώργιοςΓκουρίδης(επιβλέπων:Α.Οικονόμου),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2009 ΔιονυσίαΣιδέρη(επιβλέπων:Κ.Τοκατλίδης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2009 ΚωστούλαΤρουλινάκη(επιβλέπων:Ν.Ταβερναράκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2009 ΒασιλείαΒαλαβανίδου(επιβλέπων:Α.Οικονόμου),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2009 ΕυθυμίαΚαράτζαλη(επιβλέπουσα:Α.Κρετσόβαλη),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2010 ΙωάνναΜόσιαλου(επιβλέπων:Δ.Καρδάσης),ΤμήμαΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2011 ΦοίβηΣταυρίδη(επιβλέπων:Ι.Παπαματθαιάκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2012 ΑικατερίνηΔασκαλάκη(επιβλέπων:Χ.Δελιδάκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2012 ΕιρήνηΚαμηλέρη(επιβλέπων:Γ.Γαρίνης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2012 ΜαριάνθηΚηπαράκη(επιβλέπων:Χ.Δελιδάκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2012 ΠαναγιώταΑραμπατζή(επιβλέπων:Ι.Παπαματθαιάκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2012 ΧρήστοςΑνδρεάδης(επιβλέπουσα:Δ.Αλεξανδράκη),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2012 ΧρυσούλαΔεληγιάννη(επιβλέπων:Χ.Σπηλιανάκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2013 ΕύαΖαχαριουδάκη(επιβλέπων:Χ.Δελιδάκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.


2013 ΜάριοςΣάρδης(επιβλέπων:Α.Οικονόμου),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2013 ΑικατερίνηΧατζή(επιβλέπων:Α.Οικονόμου),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2013 ΕλένηΠετσαλάκη(επιβλέπων:Γ.Ζάχος),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2013 ΝέστοραςΚαραθανάσης(επιβλέπων:Κ.Καλαντίδης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2013 ΑφροδίτηΧατζή(επιβλέπων:Α.Οικονόμου),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2013 ΠαναγιώταΑραμπατζή(επιβλέπων:Ι.Παπαματθαιάκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2013 ΚαλλιόπηΣτρατήγη(επιβλέπων:Χ.Σπηλιανάκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2013 ΕμμανουέλαΚαλλέργη(επιβλέπων:Κ.Τοκατλίδης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2013 JoanneCharlton(επιβλέπουσα:Κ.Μαμαλάκη),ΤμήμαΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2014 ΙσμήνηΚαρακασιλιώτη(επιβλέπων:Γ.Γαρίνης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2014 ΑριστείδηςΜοσχονάς(επιβλέπων:Α.Ηλιόπουλος),ΤμήμαΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2015 ΑθηνάΠορτάλιου(επιβλέπων:Α.Οικονόμου),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2015 ΓεωργίαΟρφανουδάκη(επιβλέπων:Α.Οικονόμου),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2015 ΚωνσταντίνοςΠαλικαράς(επιβλέπων:Ν.Ταβερναράκης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2015 ΓεώργιοςΠαπαδόπουλος(επιβλέπων:Ι.Στρουμπούλης),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2015 ΧριστιάνναΧατζημιχαήλ(επιβλέπων:Α.Κρετσόβαλη),ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2015 ΜιχαήλΣαρρής(επιβλέπων:Ι.Ταλιανίδης),ΤμήμαΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.Θ.Επίβλεψηεπισκεπτώνμεταπτυχιακώνφοιτητών/καθηγητώναπόάλλαιδρύματα2004 ΕκπαίδευσητηςΔρ.ΆνναςΓαρεφαλάκη,μεταδιδακτορικήςυποτρόφουτουΔρ.ΔημήτρηΚιούση

απότηνομάδαΜοριακήςΑνοσολογίας(MRC,Λονδίνο,Αγγλία)στηνπραγματοποίησημελετώνστον γενετικό τόπο CD8 χρησιμοποιώντας την τεχνική «χωροτακτική αποτύπωσηχρωμοσωμάτων»(3C).(Νοέμβριος-Δεκέμβριος2004).

2005-2007Επίβλεψη της εργαστηριακής άσκησης (rotation, τρίμηνη διάρκεια) και κατόπιν τωνμεταπτυχιακώνσπουδώντηςμεταπτυχιακήςφοιτήτριας(ΤμήμαΑνοσοβιολογίας,Παν/μιοYale)ΚαςCorneliaZorca.Τίτλοςεργασίας:«Διαχρωμοσωμικέςαλληλεπιδράσειςομόλογωνγενετικώντόπωνκατάτημεταγραφικήενεργοποίηση».

2010 Pawel Wolkov (Οκτώβριος 2010): εκπαίδευση Επίκουρου Καθηγητή από το JagiellonianUniversity της Κρακοβίας στην τεχνολογία Chromosome Conformation Capture σε δενδριτικάκύτταραανθρώπου.

ΔΙΟΙΚΗΤΙΚΕΣ/ΟΡΓΑΝΩΤΙΚΕΣΔΡΑΣΤΗΡΙΟΤΗΤΕΣ 2008- Μέλος της επιτροπής αξιολόγησης νεοεισακτέων φοιτητών στο μεταπτυχιακό πρόγραμμα

“ΜοριακήΒιολογία-Βιοϊατρική”,συνεργασίατμημάτωνΒιολογίαςκαιΙατρικήςτουΠανεπιστημίουΚρήτηςκαιτουΙΜΒΒ-ΙΤΕ.

2010 ΜέλοςτηςεπιτροπήςαναβάθμισηςκαισυντήρησηςτηςνέαςδιαδικτυακήςιστοσελίδαςτουΙΜΒΒ-ΙΤΕ.

2010- Μέλος του συντονιστικού οργάνου του μεταπτυχιακού προγράμματος «Μοριακή Βιολογία –Βιοϊατρική», συνεργασία τμημάτων Βιολογίας και Ιατρικής του Πανεπιστημίου Κρήτης και τουΙΜΒΒ-ΙΤΕ.

2010 Μέλοςτηςεπιτροπήςγιασύνταξηπροκήρυξηςκαιαξιολόγησηπροσφορώνγιααγοράμικροσκοπίουφθορισμού(Zeiss-Apotome)απότοΠανεπιστήμιοΚρήτης.

2010- ΜέλοςτηςεπιτροπήςΣχεδιασμούκαιΔιαχείρισηςτηςνέαςδιαδικτυακήςιστοσελίδαςτουΤμήματοςΒιολογίαςτουΠανεπιστημίουΚρήτης.

2011 Μέλος της επιτροπής αναδιάρθρωσης των εργαστηριακών μαθημάτων του Α’ Τομέα ΤμήματοςΒιολογίαςτουΠανεπιστημίουΚρήτης.

2012- ΜέλοςτηςΕπιτροπήςΔιαχείρισηςΖωοκομείουτουΙΜΒΒ-ΙΤΕ.


2013- ΜέλοςτεσσάρωνεπιτροπώνπαρακολούθησηςκαιπαραλαβήςέργωνπουδιαχειρίζεταιοΕΛΚΕτουΠανεπιστημίουΚρήτης.

2013 ΜέλοςτηςεπιτροπήςαξιολόγησηςπροσωπικούτωνκεντρικώνδομώντουΙΤΕ.2014- ΑναπληρωματικόμέλοςτηςΕπιτροπήςΜεταπτυχιακώνΣπουδώντουΠανεπιστημίουΚρήτης.2014- ΜέλοςτηςΕπιτροπήςΠροπτυχιακώνΣπουδώντουΤμήματοςΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2014 ΜέλοςεπιτροπώναξιολόγησηςμελώνΕΔΙΠγιατοΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης.2015 Πρόεδρος του μεταπτυχιακού προγράμματος «Μοριακή Βιολογία – Βιοϊατρική», συνεργασία

τμημάτωνΒιολογίαςκαιΙατρικήςτουΠανεπιστημίουΚρήτηςκαιτουΙΜΒΒ-ΙΤΕ.2015 ΜέλοςτηςΕπιτροπήςΕνοποίησηςΠρογραμμάτωνΠροπτυχιακώνΣπουδώντουΤμήματοςΒιολογίας

ΠανεπιστημίουΚρήτης.ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΗΟΜΑΔΑ(ΚΥΡΙΑΜΕΛΗ,2008–σήμερα)

ΕΡΕΥΝΗΤΗΣ ΘΕΣΗ ΔΙΑΡΚΕΙΑ

ΤΡΕΧΟΝΤΑΜΕΛΗ

ΕμμανουέλλαΚαψετάκη ΕιδικόςΤεχνικόςΈρευνας 01.01.2008-ΔέσποιναΤσουκάτου ΕιδικόςΤεχνικόςΈρευνας 01.07.2015-

ΠέτροςΤζέρπος

ΜεταπτυχιακόςΦοιτητής(ΥπότροφοςΙΜΒΒ-ΙΤΕ) 01.10.2008-31.09.2009

ΔιδακτορικόςΦοιτητής(ΥπότροφοςΙΚΥ) 01.10.2009-

EraldaSalataj ΔιδακτορικήΥπότροφος 08.04.2013-ΧρυσούλαΣταθοπούλου ΔιδακτορικήΥπότροφος 01.02.2013-ΘεόδωροςΣαββίδης ΔιδακτορικόςΥπότροφος 15.11.2015-TomasZelenka ΔιδακτορικόςΥπότροφος 01.11.2015-

RóbertAntonHafþórsson Μεταπτυχιακόςφοιτητής(ΥπότροφοςERASMUS+) 12.09.2015-31.01.2016

ΠΡΩΗΝΜΕΛΗ

ΧρυσούλαΔεληγιάννηΜεταπτυχιακήΥπότροφος 01.12.2007-30.09.2008ΔιδακτορικήΥπότροφος 01.10.2008-31.08.2012

ΚαλλιόπηΣτρατήγηΜεταπτυχιακήΥπότροφος 01.10.2008-30.09.2009ΔιδακτορικήΥπότροφος 01.10.2009-31.08.2013ΜεταδιδακτορικήΥπότροφος 01.09.2013-31.08.2015

ΜιχάληςΣαρρής ΜεταπτυχιακόςΥπότροφος(ΥπότροφοςΙΜΒΒ-ΙΤΕ) 01.09.2009-31.09.2010

ΚλεάνθηΨυλλάκη ΜεταπτυχιακήΥπότροφος 01.10.2012–31.07.2013ΓεώργιοςΠαναγόπουλος ΜεταπτυχιακόςΥπότροφος 01.10.2013–31.09.2014

ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΕΣΣΥΝΕΡΓΑΣΙΕΣ(τρέχουσες)

ΕΡΕΥΝΗΤΗΣ ΙΔΡΥΜΑ ΑΝΤΙΚΕΙΜΕΝΟR.A.Flavell Immunobiology,Yale

University,USAΜηχανισμοί διαφοροποίησης CD4λεμφοκυττάρων με χρήση γενετικών μοντέλωνποντικού.

TerrenceTown Cedars-SinaiMedicalCenter,USA

Ανάπτυξη τεχνολογιών μικροσκοπίας για τημελέτη ομόλογων αλληλεπιδράσεων γενετικώντόπων.

K.Igarashi TohokuUniversity,Japan Μελέτη κυτταρικής ομοιοστασίας στοανοσοποιητικό σύστημα των γενετικά


τροποποιημένωνποντικώνBACH1-/-.D.Amsen AcademischMedischCentrum,

TheNetherlandsΟρόλοςτηςπρωτεΐνηςSATB1στηνανάπτυξητωνCD8+Τλεμφοκυττάρων.

LaszloNagy (Sanford-BurnhamMedicalResearchInstitute,USA&UniversityofDebrecen,Hungary):

ΑναγέννησημυϊκούιστούσεεπίμυεςBach1-/-.

ΒασίλειοςΠάχνης (MRC,NationalInstituteforMedicalResearch,UK):

Δημιουργία επίμυων με ιστοειδική έλλειψη τηςπρωτεΐνηςSATB1.

ΠαναγιώτηςΜπένος

(UniversityofPittsburgh,USA): Βιολπηροφορική ανάλυση της θέσης πρόσδεσηςμεταγραφικών παραγόντων σε γενετικάαλληλεπιδρώντα στοιχεία σε CD4 κύτταραεπίμυος.

ΚωνσταντίνοςΜαυρομάτης

(DOEGenomeInstitute,Berkeley,USA)

Βιοπληροφορική ανάλυση για την αναγνώρισηρυθμιστικών στοιχείων σε γενετικούς τόπουςmiRNA που εκφράζονται στο ανοσοποιητικόσύστημα.

ΧρήστοςΤσατσάνης

ΤμήμαΙατρικής,ΠανεπιστήμιοΚρήτης

Ο ρόλος των miRNAs στη ρύθμιση ανοσολογικήςανοχήςσεμακροφάγακύτταραποντικού.

ΓΝΩΣΕΙΣΥΠΟΛΟΓΙΣΤΩΝ Ø Λογισμικόεπεξεργασίαςκειμένου,ψηφιακήςαπεικόνισηςερευνητικώνδεδομένων,ψηφιακής

φωτογραφίας,διαχείρισηςβάσηςδεδομένων,ηλεκτρονικήςεπικοινωνίας,ΜοριακήςΒιολογίας,σελογισμικόπεριβάλλονWindows.

Ø Έχωσυμμετάσχειστοσχεδιασμό,τηνυλοποίησηκαισυντήρησητωνπαρακάτωιστοσελίδων:§ www.spilianakislab.gr§ www.biology.uoc.gr§ http://www.imbb.forth.gr/imbb-people/index.php/en/welcome/§ www.miracle-grant.gr§ www.chromatin3d.eu

ΞΕΝΕΣΓΛΩΣΣΕΣ Αγγλικά(άπταιστα),Ιταλικά(elementary),Γερμανικά(elementary).ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΕΣΔΡΑΣΤΗΡΙΟΤΗΤΕΣ

Α.ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΗΧΡΗΜΑΤΟΔΟΤΗΣΗΑΠΟΑΝΤΑΓΩΝΙΣΤΙΚΑΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΑ(2008-σήμερα)ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ InvestigatorAwardΦΟΡΕΑΣ CancerResearchInstitute,USAΤΙΤΛΟΣ Biochemical isolation and characterization of the protein complexes that regulate

interchromosomalinteractionsΠΡΟΫΠΟΛΟΓΙΣΜΟΣ $200.000ΡΟΛΟΣ ΚύριοςΕρευνητήςΔΙΑΡΚΕΙΑ 06.2008-05.2012ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ MarieCurieInternationalRe-integrationGrant(IRG)ΦΟΡΕΑΣ ΕυρωπαϊκήΈνωσηΤΙΤΛΟΣ FunctionalproteincomplexesthatregulateThelpercelldifferentiationΠΡΟΫΠΟΛΟΓΙΣΜΟΣ €100.000ΡΟΛΟΣ ΚύριοςΕρευνητής


ΔΙΑΡΚΕΙΑ 06.2009-05.2013ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ Capacities-FP7-REGPOT-2008-1ΦΟΡΕΑΣ ΕυρωπαϊκήΈνωσηΤΙΤΛΟΣ ProFI-ProteomicsFacility@IMBBΠΡΟΫΠΟΛΟΓΙΣΜΟΣ €1.000.000ΡΟΛΟΣ Partner(Coordinator:A.Οικονόμου)ΔΙΑΡΚΕΙΑ 01.2009-09.2012ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ ΜικρούΜεγέθουςΤύπουΑΦΟΡΕΑΣ ΕρευνητικόςΛογαριασμόςΠανεπιστημίουΚρήτης(ΕΛΚΕ)ΤΙΤΛΟΣ Η μονοαλληλική έκφραση του γονιδίου IFNγR1 καθορίζεται από CTCF-

διαμεσολαβούμενεςενδοχρωμοσωμικέςαλληλεπιδράσειςμετογενετικότόποIFNγΠΡΟΫΠΟΛΟΓΙΣΜΟΣ €2.500(ΕργαστήριοΣπηλιανάκη)ΡΟΛΟΣ ΕπιστημονικόςΥπεύθυνοςΔΙΑΡΚΕΙΑ 02.2012-01.2014ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ ΜεγάλουΜεγέθουςΤύπουΒΦΟΡΕΑΣ ΕρευνητικόςΛογαριασμόςΠανεπιστημίουΚρήτης(ΕΛΚΕ)ΤΙΤΛΟΣ Πυρηνικήοργάνωσηκαι επιγενετικήρύθμισηγενετικών τόπωνπουενέχονταιστη

διαδικασίαδιαφοροποίησηςτωνCD4+κυττάρωνΠΡΟΫΠΟΛΟΓΙΣΜΟΣ €10.000(ΕργαστήριοΣπηλιανάκη)ΡΟΛΟΣ ΕπιστημονικόςΥπεύθυνοςΔΙΑΡΚΕΙΑ 02.2012-01.2014ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ ΘΑΛΗΣΙΦΟΡΕΑΣ ΥπουργείοΠαιδείαςΔιαΒίουΜάθησης&ΘρησκευμάτωνΤΙΤΛΟΣ miREG: MicroRNAs and Transcription Factor Networks in the regulation of cell

differentiation,agingandtumorigenesisΠΡΟΫΠΟΛΟΓΙΣΜΟΣ €75.000(ΕργαστήριοΣπηλιανάκη)ΡΟΛΟΣ Συμμετέχων(ΕπιστημονικόςΥπεύθυνος:Ι.Παπαματθαιάκης)ΔΙΑΡΚΕΙΑ 10.2012-09.2015ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ ΑΡΙΣΤΕΙΑΙΦΟΡΕΑΣ ΓενικήΓραμματείαΈρευναςκαιΤεχνολογίαςΤΙΤΛΟΣ MIRACLE:Subnuclear localizationandtranscriptionalregulationofmiRNAgeneloci

intheimmunesystemΠΡΟΫΠΟΛΟΓΙΣΜΟΣ €300.000(ΕργαστήριοΣπηλιανάκη)ΡΟΛΟΣ ΕπιστημονικόςΥπεύθυνοςΔΙΑΡΚΕΙΑ 10.2012-09.2015 ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ ΚΡΗΠΙΣ-ΒΙΟΣΥΣΦΟΡΕΑΣ ΓενικήΓραμματείαΈρευναςκαιΤεχνολογίαςΤΙΤΛΟΣ ΑναπτυξιακέςδραστηριότητεςστηΒιολογίαΣυστημάτωνΠΡΟΫΠΟΛΟΓΙΣΜΟΣ €2.519.000ΡΟΛΟΣ ΥπεύθυνοςΟμάδαςεργασίας(WP4:229.902€)ΔΙΑΡΚΕΙΑ 10.2012-10.2015 ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ ResearchGrantintheBiomedicalSciencesΦΟΡΕΑΣ FONDATIONSANTEΤΙΤΛΟΣ MAGNET: The regulatory networks of the lncRNAs SeT and AseT in macrophage

immuneresponses.ΠΡΟΫΠΟΛΟΓΙΣΜΟΣ €40.000ΡΟΛΟΣ ΚύριοςΕρευνητήςΔΙΑΡΚΕΙΑ 01.2014-12.2015 ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ H2020-MSCA-ETN-2014ΦΟΡΕΑΣ ΕυρωπαϊκήΈνωση


ΤΙΤΛΟΣ Chromatin3D:ChromatinDynamicsinDevelopmentandDisease.ΠΡΟΫΠΟΛΟΓΙΣΜΟΣ €3.782.583(ΕργαστήριοΣπηλιανάκη:€1.221.548)ΡΟΛΟΣ ΣυντονιστήςΔΙΑΡΚΕΙΑ 01.2015-12.2018 ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ SIEMENSΦΟΡΕΑΣ ΓενικήΓραμματείαΈρευναςκαιΤεχνολογίαςΤΙΤΛΟΣ ApplicationsofkeyenablingtechnologiesΠΡΟΫΠΟΛΟΓΙΣΜΟΣ €1.580.000ΡΟΛΟΣ Εκπρόσωπος&ΣυντονιστήςΙΜΒΒ-ΙΤΕ(IMBB:440.590€)ΔΙΑΡΚΕΙΑ 01.2014-12.2015 Β.ΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΕΣΔΗΜΟΣΙΕΥΣΕΙΣΣΕΠΕΡΙΟΔΙΚΑΜΕΚΡΙΤΕΣΒ1. KretsovaliA.,AgaliotiT.,SpilianakisC.G.,TzortzakakiE.,MerikaM.,PapamatheakisJ.(1998)

InvolvementofCREBbindingproteininexpressionofmajorhistocompatibilitycomplexclassIIgenesviainteractionwiththeclassIItransactivator.MolCellBiol.18:6777-6783.

Β2. SpilianakisC.,PapamatheakisJ.,KretsovaliA.(2000)Acetylation by PCAF enhances CIITA nuclear accumulation and transactivation of majorhistocompatibilitycomplexclassIIgenes.MolCellBiol.20:8489-8498

Β3. SpilianakisC.G.,KretsovaliA.,DimakopoulosA.,MakatounakisT.,PapamatheakisJ.(2001)Self-associationofclassIItransactivatorcorrelateswithitsintracellularlocalizationandtransactivation.JBiolChem.276:32191-32197

Β4. TzortzakakiE.,SpilianakisC.G.,ZikaE.,KretsovaliA.,PapamatheakisJ.(2003)Steroidreceptorcoactivator1linksthesteroidandinterferongammaresponsepathways.MolEndocrinol.12:2509-2518

Β5. SpilianakisC.G.*,KretsovaliA.*,AgaliotiT.*,MakatounakisT.,ThanosD.,PapamatheakisJ.(2003)CIITAregulatestranscriptiononsetviaSer5-phosphorylationofRNAPolII.EMBOJ.22:5125-5136(*equalfirstauthorship)

Β6. Muhlethaler-Mottet A., KrawczykM.,Masternak K., Spilianakis C.G., Kretsovali A., Papamatheakis J.,ReithW.(2004)TheSboxofmajorhistocompatibilitycomplexclassIIpromotersisakeydeterminantforrecruitmentofthetranscriptionalco-activatorCIITA.JBiolChem.279:40529-40535

Β7. SpilianakisC.G.,FlavellR.A.(2004) Long-rangeintrachromosomalinteractionsintheThelpertype-2cytokinelocus. NatImmunol.5:1017-1027

Β8. LeeG.R.,SpilianakisC.G.,FlavellR.A.(2005)Hypersensitivesite7oftheTH2locuscontrolregionisessentialforexpressingTH2cytokinegenesandforlong-rangeintrachromosomalinteractions.NatImmunol.6:42-48

Β9. SpilianakisC.G.,LaliotiM.,TownT.,LeeG.R.,FlavellR.A.(2005)Interchromosomalassociationsbetweenalternativelyexpressedloci.Nature(ResearchArticle)435:637-645

Β10. SpilianakisC.G.,LeeG.R.,FlavellR.A.(2005)TwistingtheTh1/Th2immuneresponseviatheretinoidXreceptor:Lessonsfromageneticapproach.EurJImmunol.35:3400-3404


Β11. Gialitakis M., Kretsovali A., Spilianakis C.G., Kravariti, L., Mages J., Hoffmann R., Hatzopoulos A.K.,PapamatheakisJ.(2006)

Coordinated changes of histonemodifications andHDACmobilization regulate the induction ofMHCclassIIgenesbyTrichostatinA.

NucleicAcidsRes.34:765-772

Β12. LeeG.R.,KimS.T.,SpilianakisC.G.,FieldsP.E.,FlavellR.A.(2006)Thelpercelldifferentiation:Regulationbycis-elementsandepigenetics.Immunity4:369-379

Β13. SpilianakisC.G.,FlavellR.A.(2006)Managingassociationsbetweendifferentchromosomes.Science312:207-208

Β14. SpilianakisC.G,FlavellR.A.(2007)EpigeneticregulationofIfnγexpression.NatImmunol.8:681-683

Β15. TownT.,BreunigJ.J.,SarkisianM.R.,SpilianakisC.G.,AyoubA.E.,LiuX.,FerrandinoA.F.,GallagherA.R.,LiM.O.,RakicP.,FlavellRA.(2008)Thestumpygeneisrequiredformammalianciliogenesis.ProcNatlAcadSciUSA.105:2853-2858

Β16. BrownM.R.,Kronengold J.,GazulaV.R.,SpilianakisC.G.,FlavellR.A.,vonHehnC.A.,BhattacharjeeA.,KaczmarekL.K.(2008)Amino-termini isoforms of the Slack K+ channel, regulated by alternative promoters, differentiallymodulaterhythmicfiringandadaptation.JPhysiol.586:5161-5179

Β17. AmsenD.,SpilianakisC.G.,FlavellR.A.(2009)HowareT(H)1andT(H)2effectorcellsmade?CurrOpinImmunol.21:153-160

Β18. WilliamsA.,SpilianakisC.G.,FlavellR.A.(2010)Interchromosomalassociationandgeneregulationintrans.TrendsGenet.26:188-197

Β19. Ktistaki E.,GarefalakiA.,WilliamsA.,Andrews S.R., BellD.M., FosterK.E.,Spilianakis CG, Flavell R.A.,KosyakovaN.,TrifonovV.,LiehrT.,KioussisD.(2010)CD8locusnucleardynamicsduringthymocytedevelopment.J.Immunol.184:5686-5695

Β20. DeligianniC.,SpilianakisC.G.(2012)Long-rangegenomicinteractionsepigeneticallyregulatetheexpressionofacytokinereceptor.EMBORep.13:819-826

B21.WilliamsA.,LeeG.R.,SpilianakisC.G.,HwangS.S.,EisenbarthS.C.,FlavellR.A.(2013)Hypersensitivesite6oftheTH2locuscontrolregionisessentialforTH2cytokineexpression.ProcNatlAcadSciUSA110:6955-6960

B22.ZorcaC.E.,KimL.K.,KimY.J.,KrauseM.R.,ZenklusenD.,SpilianakisC.G.,FlavellR.A.(2015)MyosinVIregulatesgenepairingandtranscriptionalpausereleaseinTcells.ProcNatlAcadSciUSA,112:E1587-1593

B23.StratigiK.,KapsetakiM.,AivaliotisM.,TownT.,FlavellRA.,SpilianakisCG.(2015)Spatial proximity of homologous alleles and long noncoding RNAs regulate a switch in allelic geneexpression.ProcNatlAcadSciUSA,112:E1577-1586

B24.DoxakiC.,KampranisS.C.,EliopoulosA.G.,SpilianakisC.,TsatsanisC.(2015)


Coordinated Regulation ofmiR-155 andmiR-146a Genes during Induction of Endotoxin Tolerance inMacrophages.JImmunol.195:5750-5761.

ΔΗΜΟΣΙΕΥΜΕΝΑΠΡΑΚΤΙΚΑΣΥΝΕΔΡΙΩΝ(ConferenceProceedings)1. Tzerpos P., Savvidis T., Aivaliotis M., Benos P., Spilianakis C.G. (2013) Bioinformatic and proteomic

analysis of transcription factor binding sites in interacting regulatory elements in mouse T cells. FEBSJournal280:20-20

2. Doxaki C., EliopoulosA., Spilianakis C.G., Tsatsanis C. (2013) Physical interactionbetweenmiR-155andmiR-146a gene loci: Co-regulationduringmacrophageactivation and inductionof endotoxin tolerance.InternationalJournalofMolecularMedicine32:S65-S65

3. Deligianni C., Spilianakis C.G. (2009) Long-range genomic cytokine-receptor interaction regulates geneexpression.CYTOKINE48(1-2):2

4. SpilianakisC.G.Interchromosomalcytokinegeneregulation.(2009)CYTOKINE48(1-2):35. Spilianakis C.G., Lalioti M., Town T., et al. Epigenetic regulation of cytokine gene expression (2009)

IMMUNOLOGY116:30-30Γ.ΜΕΤΑΦΡΑΣΕΙΣΜετάφραση Χ.Σπηλιανάκης,Ν.ΚουρμούληΤίτλοςΒιβλίου ΤοΚύτταρο:ΜιαΜοριακήΠροσέγγιση(2011)CooperG.M.,HausmanR.E.ΤΟΜΟΣΙΙΤίτλοςΚεφαλαίου ΟΠυρήνας(σελίδες:529-566)Τίτλοςπρωτότυπου TheCell:AMolecularApproach,5thEd.,c2009,G.M.Cooper,ΕκδοτικόςΟίκος ΑκαδημαϊκέςΕκδόσειςΙ.Μπάσδρα

Μετάφραση Χ.ΣπηλιανάκηςΤίτλοςΒιβλίου ΓΕΝΕΤΙΚΗ:ΑΠΟΤΑΓΟΝΙΔΙΑΣΤΑΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΑ,ΤέταρτηαμερικανικήέκδοσηΤίτλοςΚεφαλαίων Κεφάλαιο6:DNAStructure,Replication,andRecombination Κεφάλαιο8:GeneExpression:TheFlowofInformationfromDNAtoRNAtoProteinΤίτλοςπρωτότυπου GENETICS:FROMGENESTOGENOMES,FourthEditionΕκδοτικόςΟίκος UTOPIA


Δ.ΑΠΗΧΗΣΗΕΡΕΥΝΗΤΙΚΟΥΕΡΓΟΥ

ΠΗΓΗΔΕΔΟΜΕΝΩΝ ThomsonReuters–WebofScience(Ιανουάριος2016)ΣΥΝΟΛΟΕΡΓΑΣΙΩΝ 24 ΑΘΡΟΙΣΜΑΔΕΙΚΤΗΑΠΗΧΗΣΗΣ 285.790ΣΥΝΟΛΟΑΝΑΦΟΡΩΝ 1696 ΔΕΙΚΤΗΣh 16ΣΥΝΟΛΟΕΤΕΡΟΑΝΑΦΟΡΩΝ 1655ΕΤΕΡΟΑΝΑΦΟΡΕΣ/ΕΡΓΑΣΙΑ 68.95M.O.ΑΝΑΦΟΡΩΝ/ΕΤΟΣ 94.22

ΝΟ ΈτοςΠρώτος/Επιστέλλων

Συγγραφέας ΠεριοδικόImpactFactor(2014)

Αναφορές(01.2016)

Μ.Ο.Αναφορών

/ΈτοςΒ01 1998 Kretsovali/Papamatheakis MolecularandCellularBiology 4.777 140 7.37Β02 2000 Spilianakis/Kretsovali MolecularandCellularBiology 4.777 113 6.65Β03 2001 Spilianakis/Papamatheakis JournalofBiologicalChemistry 4.573 33 2.06Β04 2003 Tzortzakaki/Papamatheakis MolecularEndocrinology 4.022 18 1.29Β05 2003 Spilianakis/Papamatheakis EMBOJournal 10.434 66 4.71Β06 2004 Muhlethaler/Reith JournalofBiologicalChemistry 4.573 17 1.31Β07 2004 Spilianakis/Flavell NatureImmunology 20.004 272 20.92Β08 2005 Lee/Flavell NatureImmunology 20.004 95 7.92Β09 2005 Spilianakis/Flavell Nature 41.456 434 36.17Β10 2005 Spilianakis/Flavell EuropeanJournalofImmunology 5.179 16 1.33Β11 2006 Gialitakis/Papamatheakis NucleicAcidsResearch 9.112 43 3.91Β12 2006 Lee/Flavell Immunity 21.561 191 17.36Β13 2006 Spilianakis/Flavell Science 33.611 14 1.27Β14 2007 Spilianakis/Flavell NatureImmunology 20.004 8 0.80Β15 2008 Town/Flavell ProceedingoftheNationalAcademyofSciencesUSA 9.674 60 6.67Β16 2008 Brown/Kacsmarek JournalofPhysiology-London 5.037 25 2.78Β17 2009 Amsen/Flavell CurrentOpinionsinImmunology 7.478 90 11.25Β18 2010 Williams/Flavell TrendsinGenetics 11.597 44 6.29Β19 2010 Ktistaki/Kioussis JournalofImmunology 4.920 7 1.00Β20 2012 Deligianni/Spilianakis EMBOReports 9.055 3 0.60Β21 2013 Williams/Flavell ProceedingoftheNationalAcademyofSciencesUSA 9.674 7 1.75Β22 2015 Zorca/Flavell ProceedingoftheNationalAcademyofSciencesUSA 9.674 0.00 0.00Β23 2015 Stratigi/Spilianakis ProceedingoftheNationalAcademyofSciencesUSA 9.674 0.00 0.00Β24 2015 Doxaki/Tsatsanis JournalofImmunology 4.920 0.00 0.00ΣΥΝΟΛΟ: 285.790 1696


Ε.ΑΝΑΛΥΣΗΕΡΕΥΝΗΤΙΚΟΥΕΡΓΟΥΕ1.Μεταπτυχιακέςσπουδές(ΤμήμαΒιολογίας,ΠανεπιστήμιοΚρήτης&ΙΜΒΒ-ΙΤΕ)1996-2003Διερεύνηση του μηχανισμού δράσης του μεταγραφικού ενεργοποιητή των τάξης ΙΙ αντιγόνωνιστοσυμαβατότητας,CIITA.

Κατά τις μεταπτυχιακές σπουδές μου εργάστηκα με το μεταγραφικό ενεργοποιητή των τάξης ΙΙγονιδίωντουΜείζονοςΣυμπλόκουΙστοσυμβατότητας(MHCII),CIITA.ΟπαράγονταςCIITAκλωνοποιήθηκετο1995καιπολύσύντομαμετάτηνκλωνοποίησήτουάρχισαναεργάζομαικυρίωςγιατηναναγνώρισητων λειτουργικών περιοχών της πρωτεϊνης και το ρόλο τους στη μεταγραφική ενεργοποίηση. Ομεταγραφικός παράγοντας CIITA προσδένεται σε πρωτεΐνες της βασικής μεταγραφικής μηχανής,μεταγραφικούς παράγοντες ειδικούς για την έκφραση των MHC II γονιδίων καθώς και παράγοντεςγενικούςτηςμεταγραφής(Β01).ΒρήκαμεότιηπρωτεϊνηCIITAαλληλεπιδράειδικάμετονπαράγοντα,μειδιότητες ακετυλοτρανσφεράσης, p/CAF και ακετυλιώνεται απ’αυτόν στην αμινοξική περιοχή πουπεριλαμβάνει τα αμινοξικά κατάλοιπα 114-298. Η πρωτεϊνη CIITA που φέρει έλλειψη των πρώτων 102όξινωναμινοξέωνλειτουργείσανεπικρατήςμεταλλαγήκατασταλτικήτηςμεταγραφήςτόσοστησυστατικήόσο και την επαγόμενη από Ιντερφερόνη-γ (IFN-γ) μεταγραφική ενεργοποίηση (Β02). Η μεταγραφικήδράσητουενεργοποιητήCIITAρυθμίζεταιαπότηνύπαρξηστηνπρωτεΐνηδιαφόρωνσημάτωνπυρηνικούεντοπισμού ή σημάτων εξόδου από τον πυρήνα όπου η δράση τους ρυθμίζεται μετα-μεταφραστικά.Επίσης το φαινόμενο της ομότυπης αλληλεπίδρασης μεταξύ περιοχών της πρωτεΐνης CIITA μπορεί νακαθορίσειτηνυποκυτταρικήκατανομήτηςπρωτεΐνηςκαιέτσιτημεταγραφικήτηςενεργότητα(Β03).

Ο μεταγραφικός συνενεργοποιητής των στεροειδών, SRC-1, μετά από άμεση αλληλεπίδραση με τηνπρωτεΐνηCIITA,μπορείναρυθμίσειτημεταγραφικήενεργότητατωντάξηςΙΙγονιδίωναπόταστεροειδή.Βρήκαμε οτι ο συνενεργοποιητής στεροειδών SRC-1 είναι ένας συνενεργοποιητής των τάξης ΙΙ γονιδίωνπου ενεργοποιεί την επαγόμενη από Ιντερφερόνη-γ και την CIITA εξαρτώμενη έκφρασή τους. Το SRC-1αλληλεπιδρά με την αμινοτελική περιοχή, με μεταγραφική δραστικότητα, του CIITA δια μέσω δύοπεριοχών του:μίας κεντρικής (καλύπτοντας τααμινοξικά κατάλοιπα360-839)πουπεριέχει τηνπεριοχήαλληλεπίδρασης με πυρηνικούς υποδοχείς και μια καρβοξυτελική περιοχή (αμινοξικά κατάλοιπα 1138-1441) που περιέχει την περιοχή ενεργοποίησης της πρωτεΐνης. Χρησιμοποιώντας πειράματαανοσοκατακρήμνισης χρωματίνης δείξαμε οτι η στρατολόγηση του SRC-1 στον υποκινητή των τάξης ΙΙγονιδίωνενδυναμώνεταιμετάαπόενεργοποίησηαπόΙντερφερόνη-γ.Καιακόμαπιοενδιαφέρον,τοSRC-1απαλείφει τηνκατασταλτικήδράσητωνοιστρογόνωνστηνεπαγόμενηαπό Ιντερφερόνη-γενεργοποίησητωντάξηςΙΙγονιδίωνσεπειράματαμεπαροδικήδιαμόλυνσηκυττάρων(Β04).

Τααποτελέσματαπουσυλλέχθηκαναπότιςπαραπάνωμελέτεςαποτέλεσαντηβάσηγιατηνεκπόνησηκαιτηδιεκπεραίωσητηςδιδακτορικήςμουδιατριβής.ΗσημασίατωνευρημάτωνέγγυταιστογεγονόςοτιμιαπρωτεΐνημειδιότητεςμεταγραφικούενεργοποιητήόπωςτοCIITAαλληλεπιδράκαιακετυλιώνεταιστοσήμαπυρηνικούτηςεντοπισμούκαιαυτόρυθμίζειτονυποκυτταρικότηςεντοπισμόκαικατ’επέκτασητηνιδιότητάτηςσανμεταγραφικόενεργοποιητή.


ΜεταγραφικήρύθμισητωντάξηςΙΙαντιγόνωνιστοσυμβατότηταςαπότοCIITA.ΤοτάξηςΙΙενισχυόσωμακαι μετα-μεταφραστικές τροποποιήσεις μεταγραφικών παραγόντων και χρωματίνης κατά τημεταγραφήτουγονιδίουDRA.

Στα πλαίσια της διδακτορικής μου διατριβής μελέτησα τους μηχανισμούς ρύθμισης των τάξης ΙΙαντιγόνωντουΜείζονοςΣυμπλόκου Ιστοσυμβατότητας.Τατάξης ΙΙαντιγόναείναιδιμερείςμεμβρανικέςγλυκοπρωτεϊνεςμεσκοπότηνπαρουσίασηαντιγόνωνσταΤ-λεμφοκύτταρα.Ηρύθμισητηςέκφρασήςτουςείναι αυστηρά ρυθμιζόμενη στο μεταγραφικό επίπεδο και η επαγωγή τους απαιτεί την ύπαρξη ενόςενισχυοσώματοςπουδημιουργείταισεσυντηρημέναστοιχεία(Η,Χ,Υ)τουεγκύςυποκινητήκαθώςκαιτηνέκφρασητουπαράγονταCIITA,πουείναικαιοκύριοςμεταγραφικόςενεργοποιητήςτωντάξηςΙΙγονιδίων.

ΣεσυνεργασίαμετονΔρ.WalterReith,οοποίοςκαικλωνοποίησετομεταγραφικόπαράγονταCIITA,δείξαμεοτιτοστοιχείοSήΗτουυποκινητήτωντάξηςΙΙγονιδίωνιστοσυμβατότηταςείναισημαντικόγιατηστρατολόγησητουCIITA(Β06).

Το CIITA μπορεί να ρυθμίζει θετικά την έκφραση των MHC τάξης ΙΙ γονιδίων αφού με τηνκαρβοξυτελικήτουπεριοχήστρατολογείταιστοτάξηςΙΙενισχυόσωμακαιμετηναμινοτελικήτουπεριοχήμπορεί να αλληλεπιδρά με άλλους μεταγραφικούς συνενεργοποιητές και να επάγει τη μεταγραφή.Δείξαμεότι οι μεταγραφικοί συνενεργοποιητές CBP, pCAF καιGCN5αλληλεπιδρούνμε τηναμινοτελικήπεριοχήτουCIITAτόσοinvitroόσοκαιinvivoκαιμπορούνναρυθμίζουνθετικάτηνέκφρασητωντάξηςΙΙαντιγόνων.

ΤοCIITAόχιμόνοαλληλεπιδράμετουςπαραπάνωσυνενεργοποιητέςαλλάακετυλιώνεταιαπ’αυτούςσε διακριτά αμινοξικά κατάλοιπα λυσινών που εδράζονται σε ένα αμινοτελικό σήμα πυρηνικούεντοπισμούτου.ΗακετυλίωσητουCIITAέχεισαναποτέλεσματηναύξησητηςπυρηνικήςτουεντόπισηςκαιτηνενδυνάμωσήτουγιαμεταγραφικήενεργοποίηση.ΗυποκυτταρικήκατανομήτουCIITAκαθορίζεταιεπίσης καιαπό την ιδιότητά του νααλληλεπιδράμε τον εαυτό του.Ηαλληλεπίδραση τουCIITAμε τονεαυτό του οδηγεί στην υποκυτταρική του ανακατανομή καθώς και τη λειτουργική συμπλήρωσημεταλλαγώνπουδενέχουνμεταγραφικήενεργότητα.

ΟχαρακτηρισμόςτουτάξηςΙΙενισχυοσώματοςέγινεγιαπρώτηφοράσταπλαίσιααυτήςτηςεργασίαςχρησιμοποιώντας ανασυνδιασμένες πρωτεϊνες και όχι πρωτεϊνικά εκχυλίσματα και δείχθηκε ησυνεργατικότητα στην πρόσδεση των συμπλόκων στον εγκύς υποκινητή καθώς και η εξειδίκευση στηνπρόσδεση.ΔείξαμεοτιτοinvitroανασυστημένοτάξηςΙΙενισχυόσωμαμπορείναστρατολογείειδικάστονυποκινητή τόσο το CIITA όσο και άλλα μέλη της βασικής μεταγραφικής μηχανής. Χρησιμοποιώντας τηντεχνικήανοσοκατακρήμνισηςχρωματίνηςδείξαμετηχρονικήαλληλουχίαστρατολόγησηςτωνδιαφόρωνπαραγόντων που απαιτούνται για την επαγωγή του τάξης ΙΙ DRA γονιδίου μετά την προσθήκη IFN-γ σεκύτταρα.Πολλή σημαντικό αποτέλεσμα αποτελεί η απόδειξη οτι ένας συνενεργοποιητής όπως το CIITAμπορείναρυθμίζειτηνέναρξηκαιεπιμήκυνσητηςμεταγραφήςρυθμίζονταςταεπίπεδαφωσφορυλίωσηςσυγκεκριμένωνκαταλοίπωνσερίνηςτηςRNAΠολυμεράσηςΙΙ.

Το σύστημα επαγωγής του γονιδίου DRA από IFN-γ είναι ένα επαγόμενο σύστημα μεταγραφής πουομοιάζει στην αλληλουχία των γεγονότων επαγωγής του γονιδίου της Ιντερφερόνης-β (IFN-β) μετά τηνπροσθήκη ιού, στο ότι απαιτείται ένα ενισχυόσωμα, που στην περίπτωση των τάξης ΙΙ γονιδίων είναιπροσχηματισμένο ενώ στην περίπτωση της IFN-β είναι επαγόμενο. Πληροφορίες που αφορούν τημεταγραφική ρύθμιση των γονιδίων γενικότερα μπορεί να αντλήσει κανείς συγκρίνοντας τα δύοσυστήματα.ΠιοσημαντικόγεγονόςκρίνεταιόμωςηπροσπάθειακατανόησηςτηςμεταγραφήςτωντάξηςΙΙγονιδίων και η προσπάθεια επαγωγής τους σε συμπαγείς καρκινικούς όγκους όπου και η έκφρασηελλείπει. Τα πειράματα για αυτή τη δημοσίευση πραγματοποιήθηκαν σε συνεργασία με το εργαστήριοτουΔρ.ΔημήτρηΘάνουστοπανεπιστήμιοColumbiaόπουκαιεργάστηκαγιατηνολοκλήρωσημιαςσειράςπειραμάτων. Η συνεργασία βασίστηκε στο γεγονός οτι υπήρχε πληθώρα δημοσιευμένης πληροφορίαςαπό το εργαστήριο του Δρ. Δ.Θάνου και το εργαστήριο του καθ. Τ.Maniatis για τη δημιουργίαενισχυοσώματος στον υποκινητή της Ιντερφερόνης-β μετά από διαμόλυνση των κυττάρων από ιό.Κατ’αναλογία με την in vitro ανασύσταση του ενισχυοσώματος της Ιντερφερόνης-β εργάστηκα στηνανασύστασητουενισχυοσώματοςτωντάξηςΙΙγονιδίωνιστοσυμβατότητας(Β05).

Ο αναστολέας απακετυλασών, Τριχοστατίνη Α (ΤSA), επάγει τη μεταγραφή του γονιδίου DRA τουμείζονος συμπλόκου ιστοσυμβατότητας ανεξάρτητα από το μεταγραφικό ενεργοποιητή CIITA. Για νααναλύσουμετουςμοριακούςμηχανισμούςμετουςοποίουςαυτόςοεπιγενετικόςρυθμιστήςενεργοποιείτη γονιδιακή έκφραση χρησιμοποιήσαμε πειράματα ανοσοκατακρήμνισης χρωματίνης για ναπαρακολουθήσουμε τις μεταβολές στη χρωματίνη που σχετίζονται με τη μεταγραφή του γονιδίου DRA


μετά από χρήση TSA. Βρήκαμε οτι η δραματική αύξηση στην ακετυλίωση ιστονών στην περιοχή τουυποκινητή ακολουθείται από μια αύξηση στη μεθυλίωση της Λυσίνης 4 της ιστόνης 3 και μείωση τηςμεθυλίωσηςτηςΛυσίνης9.Πειράματαανάκαμψηςφθορισμούμετάαπόφωτοεξόντωση(FRAP)έδειξεοτιη τριχοστατίνηαυξάνει την κινητικότητα τωναπακετυλασών ιστονών ενώμειώνει την κινητικότητα τωνπαραγόντωνπουαπαρτίζουντοτάξηςΙΙενισχυόσωμα,όπωςοπαράγονταςRFX5(Β11).Ε2.Μεταδιδακτορικέςσπουδές(ΤμήμαΑνοσοβιολογίας,ΙατρικήΣχολήΠαν/μίουYale,ΗΠΑ)2003-2007Βιοχημικήαπόδειξημηχανισμούγιατησυρρύθμισηεκφραζόμενωνγονιδίωντουανοσοποιητικού.

Σανμεταδιδακτορικόςυπότροφοςδημοσίευσαμιασειράεργασιώνόπουμελετάταιηδιαμόρφωσητηςχρωματίνης και η δημιουργία μεγάλης έκτασης βρόχων χρωματίνης που φέρνουν κοντά ρυθμιστικάστοιχείακαιυποκινητέςγονιδίωνώστεναρυθμίσουντηγονιδιακήέκφραση.

Χρησιμοποιήσαμε εκτεταμένα την τεχνική αποτύπωσης της χρωμοσωμικής δομής κάνοντάς μας μιααπότιςπρώτεςερευνητικέςομάδεςπουχρησιμοποίησαναυτήτηντεχνικήγιαναμελετήσουντηδομήτηςχρωματίνης. Αποδείξαμε πως είναι δυνατόν ένα ρυθμιστικό στοιχείο όπως ένας LCR να ρυθμίζεισυνδυασμένα τρία γονίδια κυτοκινών που εδράζονται στον ίδιο γενετικό τόπο. Ήταν ήδη γνωστό απόμελέτεςστοεργαστήριοτουκαθ.R.A.FlavellοτιοΤΗ2LCRείναισημαντικόςγιατηρύθμισητωνγονιδίωνπουκωδικοποιούντιςκυτοκίνες Ιντερλευκίνη4,5και13.Χρησιμοποιώνταςτηντεχνικήαποτύπωσηςτηςχρωματίνης βρήκαμε οτι στα Τ λεμφοκύτταρα και άλλους κυτταρικούς τύπους του ανοσοποιητικού οιυποκινητέςτωνγονιδίωνπουκωδικοποιούντιςΤΗ2κυτοκίνεςβρίσκονταισεμιαπεριορισμένηχωροταξικήδομή σχηματίζοντας μια αρχική χρωματινική διαμόρφωση που εν δυνάμει ευνοεί τη μεταγραφικήενεργοποίηση. Για τη δημιουργία και τη διατήρηση ενδοχρωμοσωμικώναλληλεπιδράσεων βρήκαμε οτιείναι απαραίτητοι οι μεταγραφικοί παράγοντες GATA3 και STAT6. Αυτό που προτείναμε είναι οτι οιενδοχρωμοσωμικέςαλληλεπιδράσειςστογενετικότόποτωνΤΗ2κυτοκινώνδημιουργούντηβάσηγιατησυνδυασμένημεταγραφικήρύθμισητωνγονιδίωνκυτοκινώναπότονΤΗ2LCR(Β07).

ΜετάτηναπόδειξηοτιοTH2LCRείναιαπαραίτητοςγια τησυνδυασμένημεταγραφικήρύθμισητωνΤΗ2γονιδίωνκυτοκινώνπροκειμένουνααποδείξουμεποιαστοιχείατουLCRείναιαπαραίτηταγιααυτήτου τη δράση χρησιμοποιήσαμε γενετικά τροποποιημένα ποντίκια που έφεραν ελλείψεις σεσυγκεκριμένεςπεριοχέςDNAμευπερευαισθησίαστηνDNAse I καιαπαρτίζουν τιςρυθμιστικέςπεριοχέςτουLCR.Ανάμεσασ’αυτέςτιςπεριοχέςτοστοιχείοRHS7,πουεμφανίζειυπερευαισθησίαστηνDNAseIκαιαποτελείμέροςτουΤΗ2LCR,παρουσιάζειραγδαίααπομεθυλίωσηDNAειδικάσεΤΗ2κύτταρα,μετάαπόαντιγονική ενεργοποίηση. Για να μελετήσουμε τη λειτουργική δράση της περιοχής RHS7 στηδιαφοροποίηση των ΤΗ2 κυττάρων δημιουργήσαμε γενετικά τροποποιημένα ποντίκια με έλλειψη στηνπεριοχήRHS7.ΤαCD4+TλεμφοκύτταρακαιταιστιοκύτταρασταRHS7γενετικάτροποποιημέναποντίκιαέδειξαναξιοσημείωτημείωσηστοπρότυποέκφρασηςτωνΤΗ2κυτοκινώνinvitroκαιστιςΤΗ2αποκρίσειςinvivo.ΗέλλειψητηςπεριοχήςRHS7μείωσετιςενδοχρωμοσωμικέςαλληλεπιδράσειςανάμεσαστονLCRκαιτουςυποκινητέςτωνΤΗ2γονιδίωνκυτοκινών.Δείξαμελοιπόνχρησιμοποιώνταςμοριακές,βιοχημικέςκαιγενετικέςπροσεγγίσειςοτιηπεριοχήRHS7τουΤΗ2LCRείναιαπαραίτητηγιατησωστήρύθμισητηςγονιδιακήςέκφρασηςτωνΤΗ2γονιδίων(Β08).

Ηπυρηνικήαρχιτεκτονικήκαιηαναδιαμόρφωσητηςχρωματίνηςσυντονίζουντηγονιδιακήέκφρασησεποικίλααναπτυξιακάμονοπάτια.ΓιαναμελετήσουμεπωςρυθμιστικάστοιχείαστογενετικότόποCD8τουποντικού διατάσσονται στο χώρο και μεταξύ τους πραγματοποιήσαμε in situ υβριδοποίηση DNA μεφθορίζοντες ανιχνευτές καθώς και τεχνολογίες αποτίμησης της δομής της χρωματίνης προκειμένου ναπαρακολουθήσουμετημετακίνησητουγενετικούτόπουσεσχέσημετηχρωμοσωματικήτουεπικράτειακαιεντοπίσαμεμεγάληςκλίμακαςαλληλεπιδράσειςανάμεσασεδιαφορετικάστοιχείακατάτηδιαδικασίατηςανάπτυξηςτωνΤλεμφοκυττάρων(Β19).Γενετικήκαιβιοχημικήαπόδειξηδιαχρωμοσωμικήςαλληλεπίδρασηςγενετικώντόπων.

Ημελέτηαυτήαποτελεί ίσως τη σημαντικότερηανακάλυψηπου έχω κάνει έως τώρα και αφορά τογεγονόςοτιημεταγραφικήενεργοποίησηενόςγονιδίουμπορείναεπιτευχθείμε τηχρήσηρυθμιστικώνστοιχείωνπουεδράζονταιστονίδιογενετικότόπομετογονίδιοαλλάμπορείεπίσηςναρυθμιστείκιαπόρυθμιστικάστοιχείαπουεδράζονταισεάλλαχρωμοσώματαστονπυρήνατουκυττάρου.Ηδιευκόλυνσητης λειτουργικής δράσης τέτοιων ρυθμιστικών στοιχείων επιτυγχάνεται με τη συνεύρεση ρυθμιστή καιρυθμιζόμενουγενετικούστοιχείουστοίδιομικροπεριβάλλονστονπυρήνατουκυττάρου.


ΤαμονοπάτιαδιαφοροποίησηςτωνΤλεμφοκυττάρωνβοηθώνσεΤΗ1καιΤΗ2κύτταρακαθορίζονταιαπό τα πρότυπα έκφρασης της Ιντερφερόνης-γ και της Ιντερλευκίνης-4 αντίστοιχα. Τα ΤΗ1 και ΤΗ2κύτταρααποτελούνδύοδιαφορετικάκυτταρικάπεπρωμένατωνCD4+Τλεμφοκυττάρωνμελειτουργικέςσυνέπειες για το ανοσοποιητικό σύστημα του ξενιστή. Αυτά τα γονίδια κυτοκινών εδράζονται σεδιαφορετικά χρωμοσώματα. Τα ΤΗ2 σχετιζόμενα γονίδια που εδράζονται στον ίδιο γενετικό τόπορυθμίζονταιαπότονTH2-LCRσυμμετέχονταςσεένασύμπλοκοανάμεσαστονLCRκαιτουςυποκινητέςτωνγονιδίωνκυτοκινών Il4, Il5και Il13.Καιπαρότιαυτάταγονίδιαεδράζονταισεμιαπεριοχήπουκαλύπτει120κιλοβάσειςβρίσκονταισεστενήεπαφήμεταξύτουςστονπυρήνατουκυττάρουσεμιαχρωματινικήδιαμόρφωση που επιτρέπει τη γρήγορη ενεργοποίησή τους. Εκτός από αυτές τις ενδοχρωμοσωμικέςαλληλεπιδράσεις,περιγράψαμεδιαχρωμοσωμικέςαλληλεπιδράσειςανάμεσαστηνπεριοχήτουυποκινητήτου γονιδίου της Ιντερφερόνης-γ που εδράζεται στο χρωμόσωμα 10 και τις ρυθμιστικές περιοχές τουγενετικού τόπου των ΤΗ2 κυτοκινών που εδράζονται στο χρωμόσωμα 11. Οι περιοχές που εμφανίζουνυπερευαισθησία στην DNAse Ι και αποτελούν τον ΤΗ2 LCR ελέγχουν αναπτυξιακά αυτές τιςδιαχρωμοσωμικές αλληλεπιδράσεις. Επιπρόσθετα δείξαμε οτι υπάρχει μια κυτταροειδική δυναμικήαλληλεπίδραση ανάμεσα στις χρωματινικές περιοχές που αλληλεπιδρούν, όπου οι διαχρωμοσωμικέςαλληλεπιδράσειςμπορούνναχαθούνκαινααντικατασταθούναπόενδοχρωμοσωμικέςαλληλεπιδράσειςμετάτημεταγραφικήενεργοποίησηενόςγονιδίου.

Άραστηνπαρούσαεργασίαγιαπρώτηφοράκαταδείξαμεμιαομάδαγονιδίωνπουενώεδράζονταισεδιαφορετικά χρωμοσώματα η φυσική τους αλληλεπίδραση μπορεί να έχει λειτουργικές συνέπειες στησυνδυασμένηέκφρασήτους(Β09).

Ο αντίκτυπος αυτής της εργασίας στην επιστημονική κοινότητα σε ότι αφορά την επίδραση τηςτρισδιάστατηςδομήςτηςχρωματίνηςστηρύθμισητηςγονιδιακήςέκφρασηςαποτυπώνεταισεμιασειράάρθρωνανασκόπησης(Β10,Β12-14,Β17,Β18).Μεταγραφικήρύθμισηγονιδίωντουνευρικούσυστήματος.

Στα πλαίσια συνεργασιών που ανέπτυξα σαν μεταδιδακτορικός υπότροφος μελέτησα τη γονιδιακήέκφραση του γονιδίου stumpy το οποίο ενέχεται στην ανάπτυξη βλεφαρίδων (cilia) σε ποικίλουςκυτταρικούς τύπους του νεφρού και του εγκεφάλου. Γενετικά τροποποιημένα ποντίκια που φέρουνέλλειψη του γονιδίου stumpy εμφανίζουν υδροκεφαλία νωρίς στην ανάπτυξη καθώς και νόσο τωνπολυκυστικώννεφρώνμεσαφείςπροεκτάσειςσεανθρώπινεςασθένειες (Β15).Παράλληλαμεαυτή τηνεργασία εργάστηκα στο χαρακτηρισμό εναλλακτικών υποκινητώνπου ρυθμίζουν την έκφραση γονιδίωνπουκωδικοποιούνκανάλιαιόντωνκαλίου/νατρίουσενευρικάκύτταρα(Β16). Ε3.Αυτόνομηερευνητικήεργασία(ΤμήμαΒιολογίαςΠαν/μιοΚρήτης&ΙΜΒΒ-ΙΤΕ)2008-2016Μηχανισμόςεπιγενετικήςρύθμισηςγενετικώντόπωνκυτοκίνης/υποδοχέα

Ως αυτόνομος ερευνητής τα επιστημονικά μου ενδιαφέροντα εστιάζονται στη μεταγραφική ρύθμισηγενετικών τόπων του ανοσοποιητικού στα πλαίσια της χρόνο-χωροταξικής οργάνωσης του πυρήνα τουευκαρυωτικού κυττάρου. Κύριο στόχο αποτελούν η αναγνώριση και ο χαρακτηρισμός πρωτεϊνικώνσυμπλόκων που ενέχονται σε μεγάλης κλίμακας χρωμοσωματικές αλληλεπιδράσεις σε κυτταρικούςπληθυσμούςτουεπίκτητουκαιεγγενούςανοσιακούσυστήματοςμεχρήσητεχνολογιώνβιοπληροφορικής,μοριακής και κυτταρικής βιολογίας, γενετικής καθώς και τεχνικών μικροσκοπίας. Το κύριο ενδιαφέρονεστιάζεταιστοερώτημαπωςοργανώνεταιτογονιδίωμασανσύνολοκαιπωςηπυρηνικήαρχιτεκτονικήστοπλαίσιοδιακριτώνυποπυρηνικώνεπικρατειώνρυθμίζειτηγονιδιακήέκφραση(3D/4D-επιγενετική).

Προςαυτήτηνκατεύθυνσημελετήσαμετουςμοριακούςμηχανισμούςπουενέχονταιστησυνδυασμένηρύθμιση του γενετικού τόπου της Ιντερφερόνης-γ (κυτοκίνη) και του γενετικού τόπου της υπομονάδαςIFNγR1τουυποδοχέατηςπροκειμένουνακαθοριστείηκυτταρικήγενεαλογίατωνΤκυττάρωνβοηθών1(TH1). Δείξαμε με τεχνολογίες μικροσκοπίας και βιοχημείας ότι δημιουργούνται μεγάλης κλίμακαςενδοχρωμοσωματικές αλληλεπιδράσεις των δύο γενετικών τόπων, που καθορίζονται από το γενικόοργανωτή της χρωματίνης CTCF. Η μονοαλληλική αλληλεπίδραση των δύο γενετικών τόπων καικατ’επέκταση η μονοαλληλική έκφραση του γονιδίου του υποδοχέα καθορίζεται από τη διαφορικήμεθυλίωση του DNA του υποκινητή του υποδοχέα που επιτρέπει τη μονοαλληλική στρατολόγηση τωνπαραγόντων CTCF και Tbet. Τα ευρήματά μας προτείνουν πως ρυθμιστικά στοιχεία υπεύθυνα για τη


μεταγραφικήρύθμιση του γονιδίουμιας κυτοκίνηςμπορούνεπίσης ναρυθμίζουνθετικά τημεταγραφήτουγονιδίουτουυποδοχέααυτήςτηςκυτοκίνης(Β20).

Στα ευρύτερα ενδιαφέροντα του εργαστηρίου έγκειται η αποσαφήνιση των μοριακών μηχανισμώνρύθμισηςγονιδίωνκυτοκινώνοιοποίεςκαθορίζουντηνταυτότηταδιακριτώνκυτταρικώνγενεαλογιώνΤκυττάρων βοηθών στο ανοσοποιητικό σύστημα του ποντικού. Τα γονίδια κυτοκινών που εκφράζονταιειδικάσεκύτταραβοηθούς2 (ΤΗ2)όπως Ιντερλευκίνη4 (IL4), IL5και IL13εδράζονταισεμιαγονιδιακήπεριοχή 140 kb του χρωμοσώματος 11 στον ποντικό και η έκφρασή τους ελέγχεται από ένα γενετικόστοιχείο(locuscontrolregion–LCR)τοοποίοεδράζεταιστονίδιογενετικότόπο.ΟLCRαποτελείταιαπόμια σειρά θέσεις με υπερευαισθησία στηνDNAse I οι οποίες θεωρείται οτι αποτελούν τον πυρήνα τουLCR. Σε συνεργασία με το εργαστήριο του Richard Flavell προκειμένου να καθορίσουμε τη λειτουργίααυτών των θέσεων δημιουργήσαμε γενετικά τροποποιημένα ποντίκια τα οποία έφεραν συνδυασμούςελλείψεων αυτών των θέσεων υπερευαισθησίας από τον LCR και αποτιμήσαμε την επίδραση στηνέκφρασητωνΤΗ2-ειδικώνκυτοκινώνμετηχρήσητόσο invivoόσοκαι invitroμοντέλων.Ταπειράματαπου πραγματοποιήθηκαν αποκάλυψαν οτι παρά το γεγονός οτι οι θέσεις υπερευαισθησίας πουαναλύθηκανείναισημαντικέςγιατησωστήλειτουργίατουLCR,κάποιεςθέσειςείναιπιοσημαντικέςγιατηρύθμιση της έκφρασης κυτοκινών.Ηπλέον σημαντική θέσηυπερευαισθησία για την έκφραση των ΤΗ2κυτοκινώνείναιηθέσηυπερευαισθησίας6(B21).

Μια ευρύτερη επιστημονική παραδοχή είναι οτι στους διπλοειδείς οργανισμούς, διαλληλικέςχρωματινικές αλληλεπιδράσεις ελέγχουν τη γονιδιακή έκφραση παρέχοντας ένα χωροχρονικό επίπεδοελέγχου της μεταγραφής. Παρότι οι ομόλογες διαλληλικές αλληλεπιδράσεις είναι πολύ κοινές σεποικίλους οργανισμούς όπως η Drosophila, τα φυτά και οι μύκητες δεν υπάρχουν αναφορές για ταθηλαστικά. Στο εργαστήριό μας δείξαμε οτι τέτοιου είδους διαλληλικές αλληλεπιδράσεις όντωςυφίστανταισταθηλαστικάκαι ενέχουν τηνομόλογηχωροταξικήεγγύτητα τωναλληλομόρφων τουTnfασανπροαπαιτούμενογιατηνδιαλληλικήέκφρασητουγονιδίουTnfα.Θεωρούμεοτι τοφαινόμενοαυτόπουπεριγράψαμεπαρέχει μηχανιστικήπληροφορία για την εν γένει ρύθμιση τουαλληλικούπροτύπουέκφρασης των γονιδίων καθώς και του τρόπου ελέγχου της ποσότητας του mRNA απαραίτητα για τηβελτιστοποίησηφυσιολογικώνδιεργασιώνσταθηλαστικά(Β22,Β23).

Επεκτείνοντας τις μελέτες μας σε ότι αφορά τους μοριακούς μηχανισμούς ρύθμισης του έμφυτουανοσοποιητικούσυστήματοςσυνεργαστήκαμεμετοεργαστήριοτουκαθηγητήΧρήστουΤσατσάνηαπότοΤμήμα Ιατρικής του Πανεπιστημίου Κρήτης. Σκοπός της μελέτης ήταν η ρύθμιση της έκφρασης δύογενετικώντόπωνmicroRNAsταοποίαεκφράζονταισεκύτταραμακροφάγωντουποντικού.Δείξαμεοτιηχρωματινικήαλληλεπίδρασητωνδύογενετικώντόπωνκαθορίζειτηνεγκαθίδρυσηποικίλωνεπιγενετικώντροποποιήσεων στις περιοχές ρυθμιστικών στοιχείων οι οποίες μετέπειτα καθορίζουν το αλληλικόπρότυποέκφρασηςτωνγονιδίωνmicroRNAs(Β24).


ΠΑΡΑΡΤΗΜΑΤοΤμήμαΒιολογίαςκαιτοΠανεπιστήμιοΚρήτηςδιαθέτειαρχείαμετιςαξιολογήσειςτωνφοιτητώνγιαταπροπτυχιακάμαθήματαΒΙΟΛ-154(ΒΙΟΧΗΜΕΙΑΙ)(ακαδημαϊκάέτη(2010-2015)καιΒΙΟΛ-414(ΒΙΟΧΗΜΕΙΑΤΗΣΕΠΙΓΕΝΕΤΙΚΗΣ)(ακαδημαϊκάέτη2012-2015).

ΑΞΙΟΛΟΓΗΣΗΜΑΘΗΜΑΤΟΣΒΙΟΛ-154(ΒΙΟΧΗΜΕΙΑΙ)Διδάχθηκε: ΕαρινόΕξάμηνο2010-2015Φοιτητές: Πρωτοετείς(εξάμηνοΒ’καιτωνδύοκατευθύνσεων)Αξιολογήθηκεαπό: 2010(49φοιτητές) 2011(55φοιτητές) 2012(67φοιτητές) 2013(19φοιτητές) 2014(48φοιτητές) 2015(29φοιτητές)

Οδηγίες:ΣτονάξοναΥδίδονταιταποσοστάτωνφοιτητώνγιακάθεαπάντηση,στονάξοναΧοιαπαντήσεις.• Γιατηχρονικήπερίοδο2010-2012τοερωτηματολόγιοδιατίθετοαπότοΤμήμαΒιολογίας.• Γιατηχρονικήπερίοδο2013-2015 τοερωτηματολόγιοήτανδιαθέσιμοσεηλεκτρονικήπλατφόρματουΠανεπιστημίουΚρήτης.

ΧΡΟΝΙΚΗΠΕΡΙΟΔΟΣ2010-2012ΓΙΑΤΟΜΑΘΗΜΑ

1. Τομάθημαήτανκαλάδομημένοκαιοργανωμένο.

2. Ηπαρακολούθησητωνδιαλέξεωναύξησετοενδιαφέρονσαςγιατοαντικείμενοτουμαθήματος.

2010

2011 2012

ΜΟ2010-2012 1.Διαφωνώέντονα 2.Διαφωνώ 3.Ούτεδιαφωνώούτεσυμφωνώ 4.Συμφωνώ 5.Συμφωνώαπόλυτα 6.Καμίααπάντηση

2010

2011 2012

1.Διαφωνώέντονα 2.Διαφωνώ 3.Ούτεδιαφωνώούτεσυμφωνώ 4.Συμφωνώ 5.Συμφωνώαπόλυτα 6.Καμίααπάντηση

ΜΟ2010-2012


3. Γενικήεικόνατουμαθήματος.

ΓΙΑΤΟΔΙΔΑΣΚΟΝΤΑ4. Οιπροφορικέςδιαλέξειςήτανκαλάπροετοιμασμένεςαπότοδιδάσκοντα.

5. Οδιδάσκωνέδειξεενδιαφέρον(διαθεσιμότητα,επικοινωνία,μεταδοτικότητα,συμπεριφορά,

συνέπεια)γιατουςφοιτητέςκαιτομάθημα.

6. Οδιδάσκωναπαντούσεπρόθυμακαιμεσαφήνειαστιςαπορίες.

2010

2011 2012



2010 2011 2012

2010 2011 2012



2010

2011 2012


7. Γενικήεικόνατουδιδάσκοντα.

ΧΡΟΝΙΚΗΠΕΡΙΟΔΟΣ2013-2015ΓΙΑΤΟΜΑΘΗΜΑ1. Τοαντικείμενοκαιοιστόχοιτουμαθήματοςήτανσαφείς;

2. Οιστόχοιτουμαθήματοςεπιτεύχθηκαντελικά;

ΓΙΑΤΟΔΙΔΑΣΚΟΝΤΑ3.Οργανώνεικαλάτηνπαρουσίασητηςύληςσταμαθήματα;

2013 2014 2015


2013 2014 2015


2013 2014 2015


2010 2011 2012



4.Διαθέτειμεταδοτικότητακαιεπιτυγχάνειναδιεγείρειτοενδιαφέρονγιατοαντικείμενοτουμαθήματος;

5. Ήταν συνεπής στις υποχρεώσεις του (παρουσία στα μαθήματα, έγκαιρη διόρθωση εργασιών ή

εργαστηριακώναναφορών,ώρεςσυνεργασίαςμετουςφοιτητές);

6.Είναιγενικάπροσιτόςστουςφοιτητές;

2013 2014 2015


2013

2014 2015

ΜΟ2013-2015


2013 2014 2015



ΑΞΙΟΛΟΓΗΣΗΜΑΘΗΜΑΤΟΣΒΙΟΛ-414(ΒΙΟΧΗΜΕΙΑΤΗΣΕΠΙΓΕΝΕΤΙΚΗΣ)Διδάχθηκε: ΧειμερινόΕξάμηνο2013-2015Αξιολογήθηκεαπό: 2013 (9 φοιτητές), δεν περιλαμβάνεται στην ανάλυση γιατί το ερωτηματολόγιο

ήτανδιαφορετικό. 2014(15φοιτητές) 2015(17φοιτητές) Οδηγίες:ΣτονάξοναΥδίδονταιταποσοστάτωνφοιτητώνγιακάθεαπάντηση,στονάξοναΧοιαπαντήσεις.

ΓΙΑΤΟΜΑΘΗΜΑ1.Τοαντικείμενοκαιοιστόχοιτουμαθήματοςήτανσαφείς;

2.Οιστόχοιτουμαθήματοςεπιτεύχθηκαντελικά;

3.Ηύλητουμαθήματοςήτανσαφώςκαθορισμένη;

2014 2015


2014 2015


2014 2015



ΓΙΑΤΟΔΙΔΑΣΚΟΝΤΑ4.Οργάνωσεκαλάτηνπαρουσίασητηςύληςσταμαθήματα;

5.Διέθετεμεταδοτικότητακαιεπιτύγχανεναδιεγείρειτοενδιαφέρονγιατοαντικείμενοτουμαθήματος;

6. Ήταν συνεπής στις υποχρεώσεις του (παρουσία στα μαθήματα, έγκαιρη διόρθωση εργασιών ή

εργαστηριακώναναφορών,ώρεςσυνεργασίαςμετουςφοιτητές);

2014 2015


2014 2015


2014 2015



7.Ήτανγενικάπροσιτόςστουςφοιτητές;

2014 2015


Πανεπιστήμιο Κρήτης Τμήμα Βιολογίας · 6. Η 8η Ημέρα της...

Documents

Transcript of Πανεπιστήμιο Κρήτης Τμήμα Βιολογίας · 6. Η 8η Ημέρα της...