מעבדה מס' 3
description
Transcript of מעבדה מס' 3
3מעבדה מס'
α2[ – קלונידין לרצפטורים H3קישור ]אדרנרגיים
מטרות:
עבור קלונידיןKd. קביעת 1
אדרנרגיים α2. קביעת ריכוז הרצפטורים ה-2(Bmax)בממברנה
R+L RL
Kd=[R][L]/[RL]
הגדרות:
•RL = B )bound(רצפטור וליגנד קשורים
•R + RL = Bmax מקסימום אתרי קישור לליגנד
אדרנרגיים בממברנותα2 = מס' הרצפטורים ה-
•L = F מזניחים את( ליגנד חופשי B לעומת F)
שיטות להפרדת ליגנד חופשי מהקומפלקס
. צנטריפוגה1
חיסרון:
ליגנד חופשי יכול לשקוע, ולכן ההפרדה קשה.
. דיאליזה בשיווי משקל2
. לכן, B ו-A בשיווי משקל, ריכוז הליגנד החופשי יהיה זהה בתאים כמות הליגנד הקשור היא:
cpm B – cpm A = cpm )bound(
חיסרון:
- זמן רב עד הגעה לשיווי משקל
- יכולה להתרחש אינאקטיבציה או פירוק של הרצפטור
שיטה זו מתאימה גם לקבועי קישור קטנים )אפיניות נמוכה, -Kd)גבוה
הליגנד עלול להיקשר לממברנה של הדיאליזה -
פילטר מסיבי זכוכית. פילטרציה - 3
חיסרון:
ספיחה של ליגנדים הידרופוביים לסיבי הזכוכית. לכן, חייבים לשטוף וכתוצאה הקומפלקס עלול להתפרק )ולהסיט את שיווי
המשקל(.
נמוך = אפיניות גבוהה בין 5nM (Kd של כ- Kd לפיכך, מתאים ל-הליגנד והרצפטור(
Kon
R + L RL
Koff
Kd = Koff = [R][L]
Kon [RL]1 1
Sec M*sec
מאפיין ראקציה מסדר יחידות:ראשון כי הוא תלוי רק
RLבגורם אחד
מאפיין ראקציה מסדר שני כי הוא תלוי בשני
R + Lגורמים
Konמבטא את תנועת מקסימלי הוא קבוע הדיפוזיה : מקסימלי כל Konהחלקיקים )במים לדוגמא(. במצב של
RL מביאה ליצירת קומפלקס R ו Lהתנגשות בין
Kon)max( = 108M-1 * sec-1
:1-10nM בין Kdחישוב זמן מחצית חיים של קומפלקס עם
t1/2 = ln2 = ln2 = ln
Koff Kd*Kon )10-9~10-8(M*108M-1*sec-1
t1/2 = 0.7 - 7 sec
זהו ערך זמן מינימלי כיוון שחישבנו אותו על סמך קבוע הדיפוזיה (Kon.)מקסימלי
השיטה מוגבלת לבחירת קומפלקס רצפטור-ליגנד מתאים )עם מסקנה: מספיק נמוך(Kdערך
המשמעות המעשית עבורנו:
.פילטרציה מהירה )ע"י ואקום(1
(t1/2 )הגדלת Koff. עבודה בקור, להקטנת 2
שיטת הפילטרציה מותנית באפיניות הליגנד לרצפטור
cpm )B(
[clonidine] )F(
N
S
S+NNקישור לא ספציפי
Sקישור ספציפי
S+Nקישור כולל
אדרנרגייםα2 קישור ספציפי לרצפטורים •
קישור לא ספציפי לחלבונים ושומנים ממברנליים, סיבי •הפילטר ודפנות המבחנה
עקום הקישור הלא ספציפי הוא לינארי כי הוא תלוי רק •]L[ב-
עקום הקישור הספציפי הוא עקום רוויה כי אתרי הקישור •מוגבלים
קר בריכוז NA הקישור הלא ספציפי נקבע ע"י הוספת •גבוה
קר ולא בקלונידין קר?NAמדוע נעשה שימוש ב-
ישנם בממברנה אתרי קישור ספציפיים לקלונידין, • אדרנרגיים ואנו מעוניינים להחשיב אתרים α2שאינם
אלו כקישור לא ספציפי
• NA שונה מבנית מקלונידין, ולכן NA יכיר את ורק אותם הוא בלבד אדרנרגיים α2הרצפטורים ה-
יחסום. כך נוכל למדוד את הקישור הלא ספציפי שנובע α2מאתרים ספציפיים לקלונידין ושאינם רצפטורים
אדרנרגיים
הפילטרים הספוגים בקלונידין מסומן משמשים •total = B+Fלמדידת
שיטות לינאריזציה של עקומת הרוויה:
Bmax
Bרצפטורים קשורים
F ליגנד
50%
Kd
Bmax*F
B =
Kd + F
Vmax*[S]
V =
Km + [S]
כמו משוואת מיכאליס-מנטן:
אפשר להפוך את משוואת העקומה למשוואה של קו לינארי, ע"י
linweaver-burkהחלפת המונה במכנה ואז מקבלים את משוואת
1 = Kd * 1 + 1
B Bmax F Bmax
מנוסחת עקום הרוויה ולהפוך אותה Kdאפשר גם לבודד את ה-
scatchardלמשוואה של קו לינארי, ואז מקבלים את משוואת
)Bmax-B(*F
Kd =
B
B = Bmax - B
F Kd Kd
Linweaver-burk
-1/Kd
1/Bmaxa = Kd/Bmax
1/F
)1/nM(
1/B
)mg/fmol(
יתרון:
)ריכוזי רוויה(, נקודת החיתוך yרוב הנקודות מתרכזות ליד ציר ה- אמיןBmaxברורה ולכן
חיסרון:
)ריכוזים נמוכים( מפוזרות ומשפיעות Xהנקודות הרחוקות מציר ה- לא אמיןKdעל קביעת שיפוע הקו. לפיכך,
Scatchard
יתרון:
הינה Kdהנקודות מפוזרות לאורך הגרף באופן אחיד ולכן קביעת אמינה
חיסרון:
הולך וקטן עם העלאת B/F לא משתנה אבל Bבריכוזי רוויה, וקשה xהריכוז. לכן, יש פיזור אנכי של נקודות בקרבת ציר ה-
פחות אמינהBmaxלהחליט היכן לחתוך את הציר. לפיכך, קביעת
B/F
a = -1/Kd
Bmax
B
)fmol/mg(
B/F
( fmol/mg*nM)
Kd = )Bmax – B(F
B
B = Bmax – B
F Kd Kd
R+L RL
Kd=[R][L]/[RL]
הנחות עליהן מבוססים הפיתוחים:
ואין קואופרטיביות1:1 הוא RL. יחס קישור 1
(L=F. ריכוז הליגנד גדול בהרבה מריכוז הרצפטור )לכן 2
. הרצפטור יכול להיות במצב חופשי או בקומפלקס, ללא צורות 3ביניים
. כל המדידות נעשות במצב של שווי משקל4
שיטות לזיהוי קרינה:
פליטת אלקטרון תוך כדי התפרקות= βקרינת
מונה גייגר: האלקטרונים המשתחררים נקלטים •ע"י גז שעובר יינון ויוצר מתח חשמלי
חשיפה לפילם: האלקטרונים נקלטים ע"י יוני •Ag+ אלו מתחזרים, שוקעים ויוצרים בנד שחור .
על הפילם
פלט מונה סנטילציה: •
מתרגם את מעבד:cpmהאותות החשמליים ל-
דוגמא
רק התפרקות מדידה כפולה: שנמדדה בו זמנית ע"י שני
cpmהחיישנים תתורגם ל-
Photomultiplier:
אנרגיית הפוטון הופכת לפוטנציאל חשמלי, תוך
כדי הגברת הסיגנל
יש צורך להשתמש בנוזל סנטילציה, על מנת להגביר את הסיגנל נמוכה, כמו בטריטיום(β)רק במקרים בהם קרינת ה-
(dpm)יותר חומר רדיואקטיבי יותר התפרקויות
יותר אלקטרונים מעוררים פוטנציאל חשמלי גדול יותר
(cpm)יותר ספירות
אם כך:
dpm = disintegrations per minute
cpm = counts per minute
cpm/dpm = 0.5 = יעילות המונה
Ci = 1012*2.2 = מספר ההתפרקויות של גרם רדיום dpm
דקה
Specific radioactivity = Ci = כמות חומר חם
mmole סה"כ חומר
איזוטופים רדיואקטיביים הנמצאים בשימוש בביולוגיה:
טווח נדידה במים
טווח נדידה באוויר
איזוטופt1/2סוג קרינה
P32 ימיםβ14.3 מטר7.9 ס"מ0.8
S35 ימיםβ87.4 ס"מ26 מ"מ0.32
γ קרני( X)59.6ימים I126
C14 שניםβ5730 ס"מ24 מ"מ0.28
H3 שניםβ12.4 מ"מ6מ"מ 10-3*6