Αμινοξέα - Πρωτεΐνες
-
Upload
chimiko-ergastirio -
Category
Documents
-
view
1.366 -
download
0
description
Transcript of Αμινοξέα - Πρωτεΐνες
45
3T 13 13 13 -
13 H 13 -
13 H13 H 13 - $ $
I ΧΗΜΙΚΟΙ ∆ΕΣΜΟΙ ΚΑΙ ΜΟΡΙΑ ΝΕΡΟΥ ΣΤΑ ΒΙΟΛΟΓΙΚΑ ΣΥΣΤΗΜΑΤΑ 46
31 Iσχυροί και ασθενείς χηmicroικοί δεσmicroοί 4632 Γενική θεώρηση των microακροmicroορίων και
του νερού ως βιολογικού διαλύτη 49
II ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ 51
33 Πολυσακχαρίτες 5134 Λιπίδια 5235 Nουκλεϊκά οξέα 5336 Tα αmicroινοξέα και ο πεπτιδικός δεσmicroός 5637 Πρωτεΐνες πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή 5838 Πρωτεΐνες δοmicroές υψηλότερης τάξης
και αποδιάταξη 60
ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
Γλωσσάριο εργασίας
αποδιάταξη microετουσίωση (denaturation) κατα-στροφή των ιδιοτήτων αναδίπλωσης microιας πρω-τεΐνης που οδηγεί (συνήθως) σε απώλεια τηςβιολογικής λειτουργίας της
γλυκοζιτικός δεσmicroός (glycosidic bond) τύποςοmicroοιοπολικού δεσmicroού που συνδέει microεταξύτους τα microονοmicroερή σακχάρων σε έναν πολυ-σακχαρίτη
δεσmicroός υδρογόνου (hydrogen bond) ασθενήςχηmicroικός δεσmicroός microεταξύ ενός ατόmicroου υδρογό-νου και ενός δεύτερου ηλεκτραρνητικότε-ρου ατόmicroου συνήθως οξυγόνου ή αζώτου
δευτεροταγής δοmicroή (secondary structure) ηαρχική αναδιπλωmicroένη δοmicroή που αποκτά έναπολυπεπτίδιο ή πολυνουκλεοτίδιο συνήθωςυπαγορεύεται από τις δυνατότητες σχηmicroατι-σmicroού δεσmicroών υδρογόνου
εναντιοmicroερές (enantiomer) microορφή ενός microορίουπου αποτελεί κατοπτρικό είδωλο microιας άλληςmicroορφής του ίδιου microορίου
λιπίδιο (lipid) γλυκερόλη συνδεδεmicroένη microε λιπα-ρά οξέα ή άλλα υδρόφοβα microόρια microέσω εστε-ρικού ή άλλου δεσmicroού Περιέχει συχνά καιάλλες οmicroάδες όπως τη φωσφορική
microακροmicroόριο (macromolecule) πολυmicroερές πουσυνίσταται από οmicroοιοπολικώς συνδεδεmicroέναmicroονοmicroερή
microη πολικός (nonpolar) microε υδρόφοβα χαρακτη-ριστικά και δυσδιάλυτος στο νερό
microόριο (molecule) δύο ή περισσότερα άτοmicroασυνδεδεmicroένα microεταξύ τους microε χηmicroικό δεσmicroό
νουκλεοζίτης (nucleoside) νουκλεοτίδιο χωρίςτη φωσφορική του οmicroάδα
νουκλεοτίδιο (nucleotide) microονοmicroερές νουκλεϊ-κού οξέος που περιέχει microια αζωτούχο βάση(αδενίνη γουανίνη κυτοσίνη θυmicroίνη ή ου-ρακίλη) ένα microόριο φωσφορικού και ένα σάκ-χαρο που microπορεί να είναι ριβόζη (στο RNA)ή δεοξυριβόζη (στο DNA)
οmicroοιοπολικός δεσmicroός (covalent bond) χηmicroικόςδεσmicroός στον οποίο τα ηλεκτρόνια ανήκουναπό κοινού σε δύο άτοmicroα
πεπτιδικός δεσmicroός (peptide bond) τύπος οmicroοι-οπολικού δεσmicroού που συνδέει αmicroινοξέα σεένα πολυπεπτίδιο
πολικός (polar) microε υδρόφιλα χαρακτηριστικάκαι εν γένει υδατοδιαλυτός
πολυmicroερές (polymer) χηmicroική ένωση που σχη-microατίζεται microε πολυmicroερισmicroό και συγκροτείταιαπό επαναλαmicroβανόmicroενες microονάδες που ονο-microάζονται microονοmicroερή
πολυνουκλεοτίδιο (polynucleotide) πολυmicroερέςνουκλεοτιδίων που συνδέονται microεταξύ τουςmicroε φωσφοδιεστερικούς δεσmicroούς
πολυπεπτίδιο (polypeptide) πολυmicroερές αmicroινο-ξέων που συνδέονται microεταξύ τους microε πεπτι-δικούς δεσmicroούς
πολυσακχαρίτης (polysaccharide) πολυmicroερέςmicroονοσακχαριτών που συνδέονται microεταξύτους microε γλυκοζιτικούς δεσmicroούς
πρωτεΐνη (protein) πολυπεπτίδιο ή σύνολο πο-λυπεπτιδίων που συγκροτούν microόριο microε ειδικήβιολογική λειτουργία
πρωτοταγής δοmicroή (primary structure) (σεπληροφοριακά microακροmicroόρια πχ πολυπεπτί-δια) η ακριβής ακολουθία των microονοmicroερώνmicroονάδων
τεταρτοταγής δοmicroή (quaternary structure) (σεπρωτεΐνες που αποτελούνται από δύο ή πε-ρισσότερες πολυπεπτιδικές υποmicroονάδες) οαριθmicroός και η διευθέτηση των διακριτών πο-λυπεπτιδικών υποmicroονάδων στο τελικό πρω-τεϊνικό microόριο
τριτοταγής δοmicroή (tertiary structure) η τελικήαναδιπλωmicroένη δοmicroή που αποκτά ένα πολυπε-πτίδιο το οποίο έχει προηγουmicroένως αποκτή-σει δευτεροταγή δοmicroή
φωσφοδιεστερικός δεσmicroός (phosphodiesterbond) τύπος οmicroοιοπολικού δεσmicroού που συν-δέει microεταξύ τους τα νουκλεοτίδια σε ένα πο-λυνουκλεοτίδιο
46 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
I ΧΗΜΙΚΟΙ ∆ΕΣΜΟΙ ΚΑΙ ΜΟΡΙΑΝΕΡΟΥ ΣΤΑ ΒΙΟΛΟΓΙΚΑΣΥΣΤΗΜΑΤΑ
13 13-
- - - laquoraquo 13 - $- 13 - $ 4 - 13
31 Iσχυροί και ασθενείς χηmicroικοί δεσmicroοί
13 $ -
amp $ 13 T - -$ $ (O) $ (O2) T 13 -$ $ Oslash - amp O H
$ $ $ 13 - H O H2O - $ + 1313 - - -$ $ ( 31)
2H H HO O+
∆εσmicroοί υδρογόνου και άλλες ασθενείς αλληλεπιδράσεις
13 13 13- ( 32) $ $ amp - 0 $ -$
-$ ( 32) 1313 - $ (-) - $ $ $ - $ 5
$- ( 32) - $ $- $ 13 - -
31 ΙΣΧΥΡΟΙ ΚΑΙ ΑΣΘΕΝΕΙΣ ΧΗΜΙΚΟΙ ∆ΕΣΜΟΙ 47
K˘UgraveOcircUcircrsaquoOacuteEuml (middot˙ˆUgraveOcircDaggermacrOcirc˜sbquoiquestUcircEuml UgraveOcirc˘ DNA IcircmiddotEgraveUgraveOcirc˘ RNA)
paraAcircUgraveEgravepermilEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜UacuteˆUgraveAcirc˚OacuteOgraveOacute
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcirclsaquo Uacutersaquo˙middotOtilde˙ˆUgraveOcirccentEgraveOcircIacuteAcircrsaquopermilEgraveOcirc UgraveOcirc˘ iquestOacuteıUacutemiddotIcircmiddot
AIcircAcircUgrave˘IumlcurrenOacuteEgraveOcircAEgraveı˘IumlcurrenOacuteEgraveOcirc
OH
NH2
(CO2) (PO43-)(N2) ndashO
O-
O-P
OUacuteEgraveUcircIgravecurrenOacuteAcirc˜ middotOacutefiUacuteAacutemiddotOacuteAcirc˜ AcircOacuteOgraveUcircAcircEgrave˜ IgraveAcirc permilEgraveIumlfi lsaquo UgraveUacuteEgraveIumlfi permilAcircUcircIgravefi
AEgraveı˘IumlcurrenOacuteEgraveOcirc IgraveEgravemiddot OcircUacuteAacutemiddotOacuteEgraveIcirclsaquo currenOacuteˆUcircEuml IgraveAcirc permilEgraveIumlfi permilAcircUcircIgravefi
AIcircAcircUgrave˘IumlcurrenOacuteEgraveOcirc IgraveEgravemiddot OcircUacuteAacutemiddotOacuteEgraveIcirclsaquo currenOacuteˆUcircEuml IgraveAcirc UgraveUacuteEgraveIumlfi permilAcircUcircIgravefi
H
H
H
H
H H
O O
O
O
O
HH H
H H
H H
HC C C CHHHH C C C C
C
C C C C C C
N N
N
O
N
N
NH2
616
704 955
805
ordmmiddotEgraveOacute˘IumlmiddotIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml(middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteDagger UacuteˆUgraveAcirc˚OacuteOgraveOacute)
OUacuteAacutemiddotOacuteEgraveIcirccurren˜ AcircOacuteOgraveUcircAcircEgrave˜ IgraveAcirc permilEgraveIumlOcircDagger˜ permilAcircUcircIgraveOcircDagger˜
Εικόνα 31 Οmicroοιοπολικοί δεσmicroοί ορισmicroένων βιολογικά σηmicroαντικών microο-ρίων που περιέχουν διπλούς και τριπλούς δεσmicroούς Στις περιπτώσεις του ακε-τυλενίου και του αιθυλενίου δίνεται και η ηλεκτρονιακή στερεοαπεικόνισητων microορίων Η ισχύς ενός δεσmicroού ανά γραmicromicroοmicroόριο (αριθmicroοί microε κόκκινοχρώmicroα) microετράται σε kilojoule (kJ) και αντιστοιχεί στη θερmicroική ενέργεια πουαπαιτείται για τη διάσπαση του δεσmicroού αυτού
N
N
N
NH
H O
N
OH
H
H
N
NH
HK˘UgraveOcircUcircrsaquoOacuteEuml
N
C
C
N
C
C
O
O
H
H
H
O
O
H
C
N
C
C
N
C H
H
OH
H
H
HH
H
H
H
degOcirc˘middotOacutersaquoOacuteEuml
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEumlpound˘IgraversaquoOacuteEuml
H
H
H
H
H
H
H H
H
O
O
O
O
O
O HO
R1
R2
R3
R4
N
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘
N
N
N
N
N
N
N
H
H
H
H
H
O
O
CH3
(middot) NAcircUacutefi
(sbquo) AIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenmiddot UcircAcirc UacuteˆUgraveAcirc˚OacuteEgraveIcirclsaquo middotIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot R AcircrsaquoOacutemiddotEgrave Euml IumlAcirc˘UacuteEgraveIcirclsaquo middotIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot IcirciquestıAcirc middotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenOcirc˜
(Aacute) A˙ˆUgraveOcircDaggermacrAcirc˜ sbquoiquestUcircAcircEgrave˜ UcircUgraveOcirc DNA
Εικόνα 32 ∆εσmicroοί υδρογόνου Στα νουκλεϊκά οξέα οι δεσmicroοί υδρογό-νου συmicroβολίζονται συχνά microε συνεχείς γραmicromicroές αντί για στικτές δύο γραmicromicroέςmicroεταξύ των ζευγών αδενίνηςθυmicroίνης και τρεις γραmicromicroές microεταξύ των ζευγώνγουανίνηςκυτοσίνης (βλ Eικόνα 311)
( 32 ) 0 - 6 13 - - 0 - 13 13- 7- ( 32) 7 $ (32) (13 35 37 38)
13 - 13 van der Waals - $ $ 3-4 angstrom (Aring) = van der Waals
- (f 55) - $ 7 7 $
13 13 1313 gt13 - (13) $ 13 - - - $ 13 - - 7 - van der Waals
48 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
ΠΙΝΑΚΑΣ 31 Λειτουργικές οmicroάδες ιδιαίτερης βιοχηmicroικής σηmicroασίας
Xηmicroική οmicroάδα ∆οmicroήα Bιολογική σπουδαιότητα
Καρβοξυλική Oργανικά οξέα λιπαρά οξέα αmicroινοξέα λιπίδια πρωτεΐνες
Αλδεϋδική Λειτουργική οmicroάδα αναγωγικών σακχάρων πχ γλυκόζης πολυσακχαρίτες
Αλκοολική Λιπίδια υδατάνθρακες
Κετονική Πυροσταφυλικό ενδιάmicroεσα κύκλου του Krebs
Εστερική Λιπίδια σε Βακτήρια και Ευκάρυα σύνδεση των αmicroινοξέων στα tRNA
Φωσφοεστερική Nουκλεϊκά οξέα DNA και RNA
Θειοεστερική Mεταβολισmicroός ενέργειας βιοσύνθεση λιπαρών οξέων
Αιθερική Λιπίδια Αρχαίων σφιγγολιπίδια
Οξεοανυδριτική Mεταβολισmicroός ενέργειας πχ ακετυλο-φωσφορικό
Φωσφοανυδριτική Mεταβολισmicroός ενέργειας πχ ATP
α H απεικόνιση δεσmicroού microε κυmicroατιστή γραmicromicroή (~) υποδηλώνει ότι ο δεσmicroός είναι laquoυψηλής ενέργειαςraquo (f Tmicroήmicroα 58)
| |mdash mdash
||mdash mdash
||
|
mdash mdash
|
|mdash mdash mdash
||mdash
|
|
|
|mdash mdash mdash mdash
||
O
|
|mdash mdash mdashmdash
|
|mdash mdash mdash
|
|mdash
|
|mdash mdash
||
| | ||
|mdash mdash mdash
||mdash ~
~
~
mdash
O
C OH
O
C H
O
C
H
H
C O
O
C
H
H
H
H
C O C
O Ondash
C O O P
Ondash
O
P OndashO C
H
H
C OH
ndashO
Ondash Ondash
O O
O OndashPP
O
C S
$- 13 - $ - 6 - 13
Mοτίβα σύνδεσης στα βιοmicroόρια
(C) - () Oslash - - - 13- 31 13 - 13 13 13 $ 13
31 Έλεγχος εννοιών
$ amp van der Waals 13 13
-
-
32 Γενική θεώρηση των microακροmicroορίων και του νερού ως βιολογικού διαλύτη
amp 13 - 13 Escherichia coli 13 - 13- ( ) ( 32) 96 $ 13 - -
6 ( 32) 6 - () ( 33)
13 RNA DNA $ RNA - 6 ( 32 33)A 13 - 13 (laquoraquo 7) RNA 6 +- RNA - (mRNA) RNA (tRNA) 7 amp RNA DNA 13 13 (32) DNA 1313 - -
13 13 - 13 (-
32 ΓΕΝΙΚΗ ΘΕΩΡΗΣΗ ΤΩΝ ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΩΝ ΚΑΙ ΤΟΥ ΝΕΡΟΥ ΩΣ ΒΙΟΛΟΓΙΚΟΥ ∆ΙΑΛΥΤΗ 49
ΠΙΝΑΚΑΣ 32 Xηmicroική σύνθεση προκαρυωτικού κυττάρουα
Mόριο Ποσοστό () Aριθmicroός microορίων ανάεπί ξηρού κύτταρο (διαφορετικοίβάρουςβ τύποι)
Σύνολο microακροmicroορίων 96 24610000 (~2500)Πρωτεΐνες 55 2350000 (~1850)Πολυσακχαρίτες 5 4300 (2)γ
Λιπίδια 91 22000000 (4)δ
Λιποπολυσακχαρίτες 34 1430000 (1)DNA 31 21 (1)RNA 205 255500 (~660)
Σύνολο microονοmicroερών 30 mdashε (~350)Αmicroινοξέα και 05 mdash (~100)
πρόδροmicroά τουςΣάκχαρα και 2 mdash (~50)
πρόδροmicroά τουςΝουκλεοτίδια και 05 mdash (~200)
πρόδροmicroά τους
Ανόργανα ιόντα 1 mdash (18)
Σύνολο 100 mdash
α ∆εδοmicroένα από Neidhardt F C et al (eds) 1996 Escherichia coli and Sal-monella typhimurium-Cellular and Molecular Biology 2nd edition American So-ciety for Microbiology Washington DCβ Ξηρό βάρος ενός ενεργά αυξανόmicroενου κυττάρου E coli asymp 28 times 10ndash13 g ολι-κό βάρος (70 νερό) = 95 times 10-13 gγ Ως κύριοι πολυσακχαρίτες θεωρούνται οι πεπτιδογλυκάνες και το γλυκογό-νοδ Υπάρχουν διάφοροι τύποι φωσφολιπιδίων κάθε τύπος απαντά σε πολλέςmicroορφές λόγω διαφορών στη σύνθεση των λιπαρών οξέων από είδος σε είδοςκαι λόγω διαφορών στις συνθήκες ανάπτυξηςε ∆έν υπάρχουν αξιόπιστες microετρήσεις για την ποσοστιαία σύσταση σε microονο-microερή και σε ανόργανα ιόντα
33) - - 0 13 - ( ) -
Tο νερό ως βιολογικός διαλύτης
laquo13raquo - 13 O - $ 13 13-
= - 13 0 - 4 $ - - 13 (f 46 47) - - $ (32) 13 - 13 = F - - (13) $ E 13 - $
- F - - - ( 32) - = 13 1313 13 13 ( - F 1degC) $ () 13- 13 - - $
F 13 13
= 13 13 (- - 610 13) A - 13 ( 32)
50 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
(middot) paraUacuteˆUgraveAcirc˝OacuteAcirc˜
(sbquo) NOcirc˘IcircIumlAcirc˚Icirciquest OcircIacutecurrenmiddot
(Aacute) paraOcircIuml˘UcircmiddotIcircmacrmiddotUacutersaquoUgraveAcirc˜
(permil) sectEgraversaquopermilEgravemiddot
AOcircıEumlIcircAcirc˘UgraveEgraveIcirciquestIcircOcircIcircIcircrsaquomiddot
MmiddotUcircUgraversaquoAacuteEgraveOcircMAcircIgravesbquoUacuteiquestOacuteEuml TOcircrsaquomacrˆIgravemiddot
K˘UgraveUgravemiddotUacutefiIumlmiddotUcircIgravemiddot
PEgravesbquoOcircUcircOgraveIgravemiddotUgravemiddotpara˘UacuteEumlOacuteOcircAcircEgravepermilcurren˜
Εικόνα 33 Θέσεις των microακροmicroορίων microέσα στο κύτταρο (α) Πρωτεΐνες(καφέ χρώmicroα) απαντούν σε όλη την έκταση του κυττάρου είτε ως microέρη κυτ-ταρικών δοmicroών είτε ως ένζυmicroα (β) Νουκλεϊκά οξέα DNA (πράσινο χρώmicroα)απαντά στο πυρηνοειδές των προκαρυωτικών κυττάρων και στον πυρήνα τωνευκαρυωτικών κυττάρων RNA (πορτοκαλί χρώmicroα) απαντά στο κυτταρόπλασmicroα(mRNA tRNA) και στα ριβοσώmicroατα (rRNA) (γ) Πολυσακχαρίτες (κίτρινοχρώmicroα) υπάρχουν στο κυτταρικό τοίχωmicroα και ενίοτε σε εσωτερικά αποθη-κευτικά κοκκία (δ) Λιπίδια (κυανό χρώmicroα) απαντούν στην κυτταροπλασmicroατι-κή microεmicroβράνη στο κυτταρικό τοίχωmicroα και σε αποθηκευτικά κοκκία Οχρωmicroατικός κώδικας που χρησιmicroοποιείται εδώ θα εφαρmicroοσθεί για την απει-κόνιση των 4 τύπων microακροmicroορίων σε όλο το βιβλίο Για το DNA βλ επίσηςτη λεζάντα της Εικόνας 311
32 Έλεγχος εννοιών
= - 6 7 $ (DNA RNA) - - 13
RNA - $
+ F 13
I I ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑamp 32 $
33 Πολυσακχαρίτες
13 () $ - 121 - C6H12O6 ( 34)+ 13 - 4 5 6 7 ( C4 C5 C6 C7) amp C5 () 7 $- C6 ($) - - 34 -
$ = 13- 13 (f 48) - ( 35) $ - 1313- 13 (13 36) $ -
O γλυκοζιτικός δεσmicroός
( ) 13 ( 36)0 () - = - - - -
33 ΠΟΛΥΣΑΚΧΑΡΙΤΕΣ 51
MED
IA T
UTO
RIAL
MED
IA T
UTO
RIAL
Mac
rom
olec
ules
centOcircIgraveEgraveIcircfi˜UcircIcircAcircIumlAcircUgravefi˜RNA
centOcircIgraveEgraveIcircfi˜UcircIcircAcircIumlAcircUgravefi˜DNA
paraEumlAacutelsaquoAcircOacutecurrenUacuteAacuteAcircEgravemiddot˜Icirc˘UgraveUgravemiddotUacuteEgraveIcirciquestUgraveOcircEgravemacrOgraveIgravemiddotUgravemiddot
paraEumlAacutelsaquoAcircOacutecurrenUacuteAacuteAcircEgravemiddot˜UcirciquestIcircmacrmiddotUacuteOcircEcircUacuteOcircDaggerUgraveˆOacute
ordmUacuteOcirc˘IcircUgravefi˙Euml
tradeiquestIcircmacrmiddotUacuteOcirc AOacuteOcircEgraveIcircUgravelsaquo middotIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot centmiddotIcircUgraveDaggerIumlEgraveOcirc˜ PfiIumlOcirc˜
1
23
4
5
PEgravesbquofi˙Euml
paraAcircOacuteUgravefi˙Acirc˜
centAcircOcircIacute˘UacuteEgravesbquofi˙Euml
degIuml˘Icircfi˙Euml
EIacutefi˙Acirc˜
H
H
H
H
HH H
H
H
H H
H
H
HH
H
HH
H
H
H
H
H HH
H
H
H
H
H
H
H
HH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OHOH
OH
C
C
C
C
C
C C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C C
C
C
C C
C
C
C
C C
C
C
C
C
C
OO
O
O
O O
OO
CH2OH
HOCH2
HOCH2
HOCH2
HOCH2
CH2OH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
HO
HO
HO
1
23
4
51
2
3
4
5
1
2
3
4
5
1
2
3
4
5
6
1
2
3
4
5
6
1
23
4
5
6
5
6
4 3
2
1
Εικόνα 34 Συντακτικοί τύποι ορισmicroένων κοινών σακχάρων Τα σάκχα-ρα αναπαρίστανται microε δύο εναλλακτικούς τρόπους ανοικτής αλυσίδας καιδακτυλίου Η microορφή της ανοικτής αλυσίδας είναι περισσότερο ευανάγνωστηαλλά συνηθέστερα χρησιmicroοποιείται η microορφή του δακτυλίου Σηmicroειώστε τοντρόπο αρίθmicroησης των θέσεων του δακτυλίου
TOcirc iquestUgraveOcircIgraveOcirc NmiddotOacuteUgraveEgraveIcircmiddotıEgraveUcircUgraveiquest currenOacutemiddotiquestUgraveOcircIgraveOcirc O UgraveOcirc˘ UcircmiddotIcircmacriquestUacuteOcirc˘
AIcircAcircUgrave˘IumlOcircIgraveiquestpermilmiddotHC
O
CH N
H
C
O
CH3
C HHO
C OHH
C OHH
CH2OH
CH2OH
O
HHOH
H
HO
H NH
C O
CH3
OH2
1
3
4
5
6
1
23
4
5
6
Εικόνα 35 Ν-ακετυλογλυκοζαmicroίνη ένα παράγωγο σακχάρου
- - - ( 36) 13 - $ 1 4 - ( Oslash - 36) - 13 amp -14 (36) - - - - (- -) $ 6 13 amp - 13 -- - $ 13 - $ - Gram 13- - ( 49)
33 Έλεγχος εννοιών
$ - - (- -) - 6
- - 100
34 Λιπίδια
-13 amp 13 (f 45) $ - 13 ( 37) $ 16 15 - ( ) 13$ L
52 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
O
CH2OH
H
H
OH
OH
H
H
HO
H
O
CH2OH
H
OHH
OH
OH
H
HH
O
OtildeIgrave˘IumlOcirc
degIuml˘IcircOcircAacutefiOacuteOcirc
K˘UgraveUgravemiddotUacutersaquoOacuteEuml
(sbquo)
(middot)
O
CH2OH
H
H
OH
OH
H
H
HO
H
OH
O
CH2
H
H
OH
OH
H
HH
O
HO
O
CH2OH
HH
OH
OH
H
H
HO
HOH
O
CH2OH
HH
OH
OH
H
HH
O
middot-14-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
middot-16-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
sbquo-14-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-14
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-16
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo sbquo-14
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-14
1
23
4
5
6
1
23
4
5
6
1
23
4
5
6
Εικόνα 36 Πολυσακχαρίτες (α) ∆οmicroές διαφόρων γλυκοζιτικών δεσmicroώνΣηmicroειώστε ότι microπορεί να ποικίλλουν τόσο η σύνδεση όσο και η γεωmicroετρία (α-ή β-) του δεσmicroού (β) ∆οmicroές ορισmicroένων κοινών πολυσακχαριτών Συγκρίνετετον χρωmicroατικό κώδικα microε το (α)
$ 14 20 ( 37)
Tριγλυκερίδια και σύνθετα λιπίδια
() $ 13 ( 37)
13 $
- ( 37) $$13 - 13 13 (f 45)
13 13 13- $ ()13 13 (f 45) - 13 -13 $
34 Έλεγχος εννοιών
13 - 13
$ 13
13 13 $
$ 4 (C4)
35 Nουκλεϊκά οξέα
7 $ $137 (DNA) 137 (RNA) 13 -13 DNA - RNA - - $ 6 M - 5 13 ( RNA)
35 ΝΟΥΚΛΕΪΚΑ ΟΞΕΑ 53
MOcircOacuteOcircAacutemiddotIumlmiddotIcircUgraveOcirc˙˘IumlOcircpermilEgraveAacuteIuml˘IcircAcircUacutersaquopermilEgraveOcirc(currenOacutemiddot AacuteIuml˘IcircOcircIumlEgraversaquopermilEgraveOcirc)
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot Ucirc˘OacutepermilAcircpermilAcircIgravecurrenOacutemiddot IgraveAcirc AacuteIuml˘IcircAcircUacutefiIumlEumlIgravecurrenUcircˆ AcircUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircOcircDagger permilAcircUcircIgraveOcircDagger
OH
OH
OH
H3CKOcircUacuteAcircUcircIgravecurrenOacuteOcirc C16 (middotIumlIgraveEgraveUgraveEgraveIcircfi)
MOcircOacuteOcircmiddotIcircfiUacuteAcircUcircUgraveOcirc C16 (middotIumlIgraveEgraveUgraveAcircIumlmiddot˚Icircfi)
C OH
O
CH3 C OH
O
H3CC O
O
H3CC O
OC
C
H
H
H
O C H
H
O
CH2OH
degmiddotIumlmiddotIcircUgravefi˙Euml
H3CC O
O
H3CC O
OC
C
H
H
H
P O
O
C H
H
ndashO
O
CH2
CH2+NH3
AEgraveımiddotOacuteOcircIumlmiddotIgraversaquoOacuteEuml
H3CC O
O
C H
H3CC O
O
C H
H3CC O
O
C H
H
H
KOcircEgraveOacuteiquest IumlEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
tradeDaggerOacuteıAcircUgraveOcirc IumlEgraversaquopermilEgraveOcirc
AIumliquest IumlEgraversaquopermilEgravemiddot (UgraveUacuteEgraveAacuteIuml˘IcircAcircUacutersaquopermilEgravemiddot)
tradeDaggerOacuteıAcircUgraveOcirc IumlEgraversaquopermilEgraveOcircordmˆUcircEcircmiddotUgraveEgravepermil˘IumlOcircmiddotEgraveımiddotOacuteOcircIumlmiddotIgraversaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot EcircˆUcircEcircOcircIumlEgraversaquopermilEgraveOcirc)
degIuml˘IcircAcircUacutefiIumlEuml
12
3546
78
910
1112
1314
1516
23
4
5
6
1
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
EUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi
Εικόνα 37 Λιπαρά οξέα απλά λιπίδια (λίπη) και σύνθετα λιπίδια Απλάλιπίδια σχηmicroατίζονται microε microια αντίδραση αφυδάτωσης microεταξύ λιπαρών οξέωνκαι γλυκερόλης η οποία δηmicroιουργεί εστερικό δεσmicroό
$13 ( DNA) 13 PO4
3ndash = - DNA RNA - 38
Nουκλεοτίδια
13 7 $ - 13 13 (
) 13 - $ ( 39) = DNA RNA = ( $-) DNA RNA 13 () -$ C-1 N 13 13 1 ( ) 9 ( -) amp - 13 - ( 310)
13 7 $ 5 ATP ( ) ( 310) -
54 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi P
O
Ondash
OndashO
C C
O BiquestUcircEuml
OH
H HHH C
OH PEgravesbquofi˙Euml
5atilde
4atilde
3atilde 2atilde1atilde
C
CH2
Εικόνα 38 Νουκλεοτίδια Εδώ απεικονίζεται ένα ριβονουκλεοτίδιο πουαπαντά στο RNA Τα δεοξυριβονουκλεοτίδια που απαντούν στο DNA έχουνστον άνθρακα 2rsquo ένα άτοmicroο H αντί της οmicroάδας ndashOH Η αρίθmicroηση των θέσε-ων του σακχάρου γίνεται microε τονούmicroενους αριθmicroούς για να διακρίνεται από τηναρίθmicroηση των θέσεων του δακτυλίου της αζωτούχου βάσης οι οποίες επί-σης αριθmicroούνται (1 2 3 κλπ) (βλ Εικόνα 39) Τόσο τα δεοξυριβονου-κλεοτίδια όσο και τα ριβονουκλεοτίδια περιέχουν microια 5rsquo-φωσφορική οmicroάδα
N
N
N
N
1
234
56
78
9
N
N
N
N
NH2
N
N
N
NH
NH2
O
N
N
3
216
54
N
NH
O
O
H3C
NH
O
NH2
K˘UgraveOcircUcircrsaquoOacuteEuml (C)
pound˘IgraversaquoOacuteEuml (T)
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEuml (A)
degOcirc˘middotOacutersaquoOacuteEuml (G)
DNA RNA
BiquestUcircAcircEgrave˜ ˘UacuteEgraveIgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml˜ BiquestUcircAcircEgrave˜ Ocirc˘UacutersaquoOacuteEuml˜
H
N
DNA RNA
MfiOacuteOcircDNA
Εικόνα 39 ∆οmicroές των βάσεων του DNA και του RNA ∆εν παρατίθεταιστην εικόνα η ουρακίλη (U) της οποίας η δοmicroή είναι όmicroοια microε της θυmicroίνηςmicroε τη microόνη διαφορά ότι στερείται της microεθυλοmicroάδας στον C-5 Παρατηρήστετο σύστηmicroα αρίθmicroησης των δακτυλίων Κατά την ένωση τους microε τον άνθρα-κα 1rsquo του φωσφοσακχάρου για τον σχηmicroατισmicroό νουκλεοτιδίου (Εικόνα 38)οι βάσεις πυριmicroιδίνης συνδέονται microέσω του N-1 του δακτυλίου και οι βάσειςπουρίνης microέσω του N-9
TUacuteEgraveEcircˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcirclsaquo middotpermilAcircOacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot OacuteOcirc˘IcircIumlAcircOcircUgraversaquopermilEgraveOcirc)
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi˜AcircUcircUgravecurrenUacutemiddot˜
N-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
OHOCH2 OH
HH
H
H
OHOH
PEgravesbquofi˙Euml
N N
NN
NH2
+
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEuml
OHOCH2
OHOH
N N
NN
NH2
ApermilAcircOacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot˜ OacuteOcirc˘IcircIumlAcircOcirc˙rsaquoUgraveEuml˜)
3 PO43ndash
OCH2
OHOH
N N
NN
NH2
OPOPOPndashO
O
Ondash
O
Ondash
O
Ondash
ordmˆUcircEcircOcirc-middotOacute˘permilUacutersaquoUgraveEuml˜
H H
H
H
H
H
H H H
~ ~65
4 32
178
9
65
4 32
178
9
65
4 32
178
9
Eικόνα 310 Συστατικά ενός σηmicroαντικού νουκλεοτιδίου της τριφω-σφορικής αδενοσίνης Η ενέργεια υδρόλυσης του φωσφοανυδριτικού δεσmicroού(κυmicroατιστές παύλες) είναι microεγαλύτερη από αυτήν του φωσφορικού εστέραγεγονός που η σηmicroασία του θα γίνει αντιληπτή στο Κεφάλαιο 5 (f Tmicroήmicroα58)
- - - (f 58) L - $- (f 57) 13 (f
515) 13 $ - 7 $ $ -
Nουκλεϊκά οξέα
Q 7 $ - - ( 311)
$ - 3 ( 3acute) 5 (5acute) (- 311) = F $$13
= DNA RNA - 0 13 DNA RNA - 0 - (f 7) DNA - RNA
35 ΝΟΥΚΛΕΪΚΑ ΟΞΕΑ 55
paraAcircUacuteEgraveOcircmacrlsaquo UcircDagger˙Acirc˘IacuteEuml˜Ucirc˘IgraveIumlEumlUacuteˆIgravemiddotUgraveEgraveIcircOgraveOacutesbquoiquestUcircAcircˆOacute
A˙ˆUgraveOcircDaggermacrOcirc˜ sbquoiquestUcircEumlUcirc˘OacutepermilAcircpermilAcircIgravecurrenOacuteEuml UcircUgraveEuml ıcurrenUcircEuml 1atilde
H H
H2C BiquestUcircEumlO
O3atilde
1atilde
2atilde
5atilde
5atilde
5atilde
5 3
3atilde
3atilde
3atilde
3atilde 5atilde
P OndashO
H H H
H
H
H2C BiquestUcircEumlO
O
O
H H H
H
H
O
O
(i)
(ii)
poundcurrenUcircEuml 5atilde
P OndashO
O
P OndashO
O
centAcircOcircIacute˘UacuteEgravesbquofi˙Euml
paraUacuteˆUgraveOcircUgravemiddotAacutelsaquo˜permilOcircIgravelsaquo
centAcirc˘UgraveAcircUacuteOcircUgravemiddotAacutelsaquo˜permilOcircIgravelsaquo
poundcurrenUcircEuml 3atilde
(middot)
(sbquo)
A
C G
G C
C G
C G
A U
(Aacute)
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi
A GG CC T T A
T CC GG A A T
C C A U C GA CG U G A
C C U C G GC GG A C A
C
BiquestUcircEumlH2C
5atilde
4atilde
H
HcentAcircUcircIgraveOcircrsaquo˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘
ordmˆUcircEcircOcircpermilEgraveAcircUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 311 DNA και RNA (α) ∆οmicroή microέρους microιας αλυσίδας DNA Οι αζωτούχες βάσεις microπορεί να είναι αδενίνη γουανίνη κυτοσίνη ή θυmicroίνη Στο RNAυπάρχει microια οmicroάδα ndashOH στον άνθρακα 2rsquo της πεντόζης (βλ Εικόνα 38) και ουρακίλη αντί της θυmicroίνης (β) Απλουστευmicroένο σχήmicroα της δοmicroής του DNA όπουαπεικονίζονται microόνον οι αζωτούχες βάσεις Παρατηρήστε ότι οι δύο αλυσίδες (κλώνοι DNA) είναι συmicroπληρωmicroατικές ως προς την ακολουθία βάσεων (A=T GintC)και συνδέονται microε δεσmicroούς υδρογόνου που σχηmicroατίζονται microεταξύ αυτών των βάσεων Οι δύο κλώνοι DNA απεικονίζονται microε πράσινο χρώmicroα σε δύο διαφορετι-κούς τόνους σκίασης χρωmicroατική σύmicroβαση που εφαρmicroόζεται σε όλο το βιβλίο (γ) RNA (i) πρωτοταγής δοmicroή (ii) πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή Στο RNAσχηmicroατίζονται δευτεροταγείς δοmicroές όταν παρουσιάζονται δυνατότητες για ενδοmicroοριακή ζεύξη βάσεων δηλ για ζεύξη βάσεων της ίδιας αλυσίδας Σε ορισmicroέναπολύ microεγάλα microόρια RNA όπως πχ στο ριβοσωmicroατικό RNA (f Τmicroήmicroατα 715 και 114) άλλες περιοχές του microορίου έχουν microόνο πρωτοταγή δοmicroή και άλλεςτόσο πρωτοταγή όσο και δευτεροταγή δοmicroή Αυτό οδηγεί σε microόρια microε τελικό τριδιάστατο σχήmicroα που είναι καθοριστικό για τη λειτουργία τους και εmicroπεριέχειεκτενείς περιελίξεις ή συσπειρώσεις (f Εικόνα 118γ) Το RNA απεικονίζεται microε πορτοκαλί χρώmicroα χρωmicroατική σύmicroβαση που διατηρείται σε όλο το βιβλίο
$ 1313 -
DNA
DNA DNA - $ -$ (13 32) - - $ (G) (C) $ (A) (T) (13 32) $ $ 13 A T G C DNA - 13 0 G - C T A ( 311)
RNA
$ 137$ S RNA $ 13 - amp 13 - RNA 1313 ( 311)
RNA 13 $ RNA (messenger RNAmRNA) DNA 13- DNA $ RNA (transfer RNA tRNA) - 7 -- -$ 7 - RNA (ribosomal RNA rRNA) 13 7 0 RNA $ - 7 11
35 Έλεγχος εννοιών
7 $ - 13 - RNA DNA RNA
-
13 $ 1313
RNA
36 Tα αmicroινοξέα και ο πεπτιδικός δεσmicroός
$ 7- $ - $ 21 $ 0 $ - (ndashCOOH) (ndashNH2) (- 31 312) amp - $ 13-$ $ - $ ( ) -13 13 - 6 ( 313)
0 $ - 312 ( ROslash 312) - -- 13$13 13 13$ ( ) ( $ ) (- 312) $ 13 - $ - laquoraquo$ 312 = - - 13$ $ $ $ $ L $ 13 - $ = 6 - (ndashSH) -$ - (RndashSndashSndashR) F - $ $ 7 - 13
Iσοmicroερή
amp
56 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
$ Louis Pasteur 13 -F (f 15) 13 = Pasteur F $ ( 314) $ 13 - ( $ )
- (f 48) X laquo- raquo $ - D
L ( 315) 13 - Dndash
$ D L 0 - 6 $ Lndash$ Dndash (- 315) Dndash$ - (f 48) 13 (f 209) Dndash$ Lndash Lndash Dndash
36 ΤΑ ΑΜΙΝΟΞΕΑ ΚΑΙ Ο ΠΕΠΤΙ∆ΙΚΟΣ ∆ΕΣΜΟΣ 57
H
CH3
CHCH3
CH3
CH2CHCH3
CH3
CHCH3
CH2CH3
CH2OHCHCH3
OH
CH2
O-O
CH2C
O
NH2
CH2C
O-O CH2
CH2C
O
CH2NH2
CH2HS
CH2S CH2CH3
CH2
CH2HO
CH2
NH
CH2CH2CH2CH2+NH3
CH2CH2CH2+NH2 N
HC
NH2CH2
HN
+HN
N
CH2H2C
H2C CH COOndash
Gly degIuml˘IcircrsaquoOacuteEuml (G)
Ala AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (A)
Val BmiddotIumlrsaquoOacuteEuml (V)
Leu sectAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (L)
Ile IUcircOcircIumlAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (I)
Ser tradeAcircUacutersaquoOacuteEuml (S)Thr poundUacuteAcircOcircOacutersaquoOacuteEuml (T)
Asp AUcircmiddotUacuteUgraveEgraveIcircfi (D)
Asn AUcircmiddotUacutemiddotAacutersaquoOacuteEuml (N)
Glu degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraveEgraveIcircfi (E)
Gln degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraversaquoOacuteEuml (Q)
Cys K˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (C)
CH2HSe Sec tradeAcircIumlEumlOacuteOcircIcirc˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (U)
Met MAcircıAcircEgraveOcircOacutersaquoOacuteEuml (M)
Phe ordmmiddotEgraveOacute˘IumlmiddotIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (F)
Tyr T˘UacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (Y)
Trp TUacute˘UgraveOcircEcirciquestOacuteEuml (W)
Lys sect˘UcircrsaquoOacuteEuml (K)
Arg AUacuteAacuteEgraveOacutersaquoOacuteEuml (R)
His IUcircUgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml (H)
Pro
centOcircIgravelsaquo UgraveˆOacute middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteEgraveIcircOgraveOacute OcircIgraveiquestpermilˆOacute
OHC
O
CR
H
NH2
AIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot
degAcircOacuteEgraveIcirclsaquo permilOcircIgravelsaquo AcircOacutefi˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenOcirc˜
(tradeEumlIgraveAcircrsaquoˆUcircEuml tradeUgraveEumlOacute AcircUacutersaquoUgraveˆUcircEuml UgraveEuml˜ UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml˜ middotAcircEgraveIcircOcircOacutersaquo˙AcircUgravemiddotEgrave OcircIumlfiIcircIumlEumlUacuteEuml Euml permilOcircIgravelsaquo fimacrEgrave IgravefiOacuteOcircOacute Euml OcircIgraveiquestpermilmiddot R H UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml permilAcircOacute AcircrsaquoOacutemiddotEgrave middotIcircUacuteEgravesbquoOgrave˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteDagger permilEgravefiUgraveEgrave UcircUgraveAcircUacuteAcircrsaquoUgravemiddotEgrave AcircIumlAcircDaggerıAcircUacuteEuml˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot˜)
H IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-fiIacuteEgraveOacuteOcirc
MEuml OcircIumlEgraveIcircfi(˘permilUacutefiEcircOcircsbquoOcirc)
C
KIumlAcircrsaquopermilmiddot
-iquestOacuteıUacutemiddotIcircmiddot˜
KmiddotUacutesbquoOcircIacute˘IumlOcircIgraveiquestpermilmiddot
paraUacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml (P)
IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-middotIumlIcircmiddotIumlEgraveIcircfi
paraOcircIumlEgraveIcircfi IgraveEuml EgraveOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc Εικόνα 312 Συντακτικοί τύποι των 21 κοινών αmicroινοξέων Αριστερά απότο όνοmicroα κάθε αmicroινοξέος δίνεται η τριγράmicromicroατη συντοmicroογραφία του και δεξιά(σε παρένθεση) η microονογράmicromicroατη συντοmicroογραφία του
H2N C C
H O
OH NH
C C
H
R2
O
OH+ H
H2O
H2N C C
H
R1
O
N C C
H
R2
O
OH
R1
H
paraAcircUgraveEgravepermilEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 313 Σχηmicroατισmicroός πεπτιδικού δεσmicroού R1 και R2 αναφέρονταιστο microεταβλητό microέρος των αmicroινοξέων (πλευρική αλυσίδα) (βλ Εικόνα 312)
(Lndash Dndash$) 13- (Dndash Lndash$)
36 Έλεγχος εννοιών
21 $ - $ 13 13 $ ( ) -6
$ - $
$ -
- $ 13 - $ -
37 Πρωτεΐνες πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή
6 - - 6 () 6
13 - (f 5 17) 6 13 - - - 6 = 7 - -
Πρωτοταγής δοmicroή
6 $ $ (-
58 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
T T
P
M M
Pbatilde b
h
n n
h
(middot) (sbquo)
Εικόνα 314 Σχεδιαγράmicromicroατα κρυστάλλων τρυγικού οξέος (C4H6O6) διάχειρός Louis Pasteur από το περίφηmicroο άρθρο του περί οπτικής ενεργότητας(α) Αριστεροχειρικός κρύσταλλος (microορφή L) (β) ∆εξιοχειρικός κρύσταλλος(microορφή D) Οι δύο κρύσταλλοι είναι κατοπτρικά είδωλα ο ένας του άλλου(δηλ εναντιοmicroερή) Τα γράmicromicroατα πάνω στις έδρες των κρυστάλλων υποδη-λώνουν τα ζεύγη εναντιοmicroερών εδρών κατά τον συmicroβολισmicroό του PasteurΓια να αναδειχθεί σαφέστερα η εναντιοmicroέρεια των κρυστάλλων έχει χρησι-microοποιηθεί έγχρωmicroη σκίαση
(sbquo)
NH2H2N
COOH
C HH2N
CH3
COO
CH
CH3
ErsaquoAcircpermilEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
COOH
C NH2
CH3
COOH
CH
CH3
H
L-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml D-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml
(Aacute)
HO
HO
HO
OH
HHO
C OHH
OH
CH2OH
O
C H
CH
H
H
CH2OH
D-degIuml˘Icircfi˙Euml L-degIuml˘Icircfi˙Euml
CO
OH
(middot)
H
CH
C
CH
HC
C
C
tradeUgraveEumlOacute UgraveUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEuml UacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo UgraveOcirc IgraveAcircOacute sbquocurrenIumlOcirc˜ ımiddot UacutecurrenAcircEgrave Oacutemiddot ıAcircˆUacuteEumlıAcircrsaquo fiUgraveEgrave IcircmiddotUgraveAcirc˘ıDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave UacuteOcirc˜ UgraveOcircOacute middotUacutemiddotUgraveEumlUacuteEumlUgravelsaquo Euml permilAcirc permilEgravemiddotIcircAcircIcircOcircIgraveIgravecurrenOacuteEuml AacuteUacutemiddotIgraveIgravelsaquo fiUgraveEgrave middotOcircIgravemiddotIcircUacuteDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave middotfi middot˘UgravefiOacute
bC C
a
c c
a
d db
TUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
Εικόνα 315 Ισοmicroερή (α) Υπόδειγmicroα ζεύγους κατοπτρικών ειδώλων(β) Εναντιοmicroερή γλυκόζης (γ) Εναντιοmicroερή του αmicroινοξέος αλανίνη Παρατη-ρήστε ότι όπως και να περιστραφούν οι τριδιάστατες προβολές των microορίωνοι δύο microορφές L και D είναι αδύνατον να συmicroπέσουν
313) $ $ - 13 $ 13 0 $ - $ 13 6 - $ 6 6 6 15 $ 6 10000 -$ 6 $ 7 ( )
= $ - 13 = - 13 13 + - 13 13
∆ευτεροταγής δοmicroή
= $ R $ 13 13 6( 316) ( 31) - 6 M - - - 7 - (316) gt $ $ = ( - ) - - ( 316)
M - 1313 - $ (- 316)
- - - -
37 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ΠΡΩΤΟΤΑΓΗΣ ΚΑΙ ∆ΕΥΤΕΡΟΤΑΓΗΣ ∆ΟΜΗ 59
(middot)
(sbquo)
CC C
C
CC
C C
C
C
C
C
CCC
C C C
C
C
CC C
CC C
C
C
C
CC
CC
C
CC CC
C C
CC
C
C
C C
CC C
CC
C
CC
C C
CC
CCCC
C C
CC CC
C C
C
O
O
O O O
O
O
O O O
O
O O
O
O O
O
OO
O
OO
O
O O
O
O
O O
O
O O
OO
OO
RR
R R
R
RR R R
R R R
RRR
R R R
RRR
R R R
R R R
RR
RR
RR
R
R
H
HH
HH
HHH H
H
H HH
H
H
H
H
H H
H
H H
H
H H
H
H H
H
HH
H
H
H
HHHH
HH
H
HH
HH
HH
HH
HH
HH
NN
NN
NN
NN
N
N
N N
N
NN
N
N N
N
N N
N
NN
N
NN
N
N N
N
N
NNNN
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger AacuteAcircEgraveUgraveOcircOacuteEgraveIcircOgraveOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger middotOcircIgravemiddotIcircUacute˘UcircIgravecurrenOacuteˆOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
Εικόνα 316 ∆ευτεροταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων (α) ∆ευτεροταγήςδοmicroή α-έλικας Παρατηρήστε ότι οι δεσmicroοί υδρογόνου σχηmicroατίζονται microετα-ξύ ατόmicroων των πεπτιδικών δεσmicroών χωρίς τη συmicromicroετοχή των οmicroάδων R (β)∆ευτεροταγής δοmicroή β-πτυχωτής επιφάνειας
13 - - - 13 6 - - - (13 317)amp 13 13(domains) - $ 7-
38 Πρωτεΐνες δοmicroές υψηλότερης τάξης και αποδιάταξη
+ - $ - = 13 6 0 - - 13 S $ - - - 13 -
$ 13 - - ( 317)
(ndashSH) 6 amp ndashSH - $ $ amp 6 -6 $ ( 317) $- 6 = - - ( 317 318) - ( - ) (f 55)
A 6 - 13 6 - 7 7 - 13 ( 318) 6 +-
60 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot B
(middot) IOacuteUcircOcirc˘IumlrsaquoOacuteEuml (sbquo) PEgravesbquoOcircOacuteOcirc˘IcircIumlAcirciquestUcircEuml
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot A
-currenIumlEgraveIcircmiddot
-Ugrave˘macrˆUgravelsaquoAcircEgraveEcirciquestOacuteAcircEgravemiddot
Εικόνα 317 Τριτοταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων που υποδεικνύει και τιςθέσεις εντοπισmicroού περιοχών microε δευτεροταγή δοmicroή α-έλικας ή β-πτυχωτήςεπιφάνειας (α) Ινσουλίνη microια πρωτεΐνη που έχει δύο πολυπεπτιδικές αλυ-σίδες (f Τmicroήmicroα 319) παρατηρήστε ότι η αλυσίδα Β περιέχει δοmicroές α-έλικας αλλά και β-πτυχωτής επιφάνειας και ότι οι δισουλφιδικοί δεσmicroοί(κυανό χρώmicroα) συντελούν στον καθορισmicroό της τελικής αναδίπλωσης (τριτο-ταγούς δοmicroής) (β) Ριβονουκλεάση microια microεγάλη πρωτεΐνη microε αρκετές περιο-χές α-έλικας και β-πτυχωτής επιφάνειας
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜ 13
Εικόνα 318 Τεταρτοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης Υπάρχουν δύο είδηπολυπεπτιδίων στην αιmicroοσφαιρίνη αλυσίδες α (κυανό και κόκκινο χρώmicroα)και αλυσίδες β (πορτοκαλί και κίτρινο χρώmicroα) και συνολικά 4 πολυπεπτίδιαστο τελικό πρωτεϊνικό microόριο (εδώ τα laquoαraquo και laquoβraquo αναφέρονται σε ονοmicroασίεςπολυπεπτιδικών αλυσίδων και όχι σε είδη δευτεροταγούς δοmicroής) Η τεταρ-τοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης συmicroβολίζεται ως α2 β2 Οι 4 διακριτές αλυ-σίδες απεικονίζονται microε 4 διαφορετικά χρώmicroατα
6 - ( 6 13) - $ ( van der Waals 13 ) ( - $ )
Aποδιάταξη (microετουσίωση)
0 6 - pH - 13 ( 319) =$ 13 - 6 - ( 313) + $ F $ - - (-) amp $ $ ( 319) S 13 6 13 - ( 1313 ) - - $ 1313-13 13
= $ 7 - 7 13 - 0 20 - 6 - amp - - $ 13
Tα επόmicroενα κεφάλαια
amp - 4
- - 13 - 5 13 13 amp - 4 5 $ 13- (f 12) $ $- 0 $ ( 6)
M 1313 - 3 13
38 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ∆ΟΜΕΣ ΥΨΗΛΟΤΕΡΗΣ ΤΑΞΗΣ ΚΑΙ ΑΠΟ∆ΙΑΤΑΞΗ 61
lozEgravemiddotmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(Ocirc˘Uacutersaquomiddot)
ŒOacuteUgraveOcircOacuteEumlmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(100AEligC)
AOcircIgraveiquestIcircUacute˘OacuteUcircEumlOcirc˘Uacutersaquomiddot˜Oslash OacutecurrenmiddotAcircOacuteAcircUacuteAacuteOcircOcircrsaquoEumlUcircEuml
aeligDaggerIacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜ AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
Εικόνα 319 Aποδιάταξη (microετουσίωση) της πρωτεΐνης ριβονουκλεάση(της οποίας η δοmicroή δίνεται στην Εικόνα 317β) Παρατηρήστε πώς οι έντο-νες συνθήκες αποδιάταξης οδηγούν σε ένα οριστικά κατεστραmicromicroένο microόριο(ως προς τη βιολογική λειτουργία του) λόγω εσφαλmicroένης αναδίπλωσης
amp - $ - $ - - F - 13 7 7 $ 13 $ 13 13 -13
37 και 38 Έλεγχος εννοιών
= 6 - $ 6
( ) ( F- $)
1313 7
13 13amp -
6 - - -
F 13 -6 1313136
F $ 6 $ $ 7
62 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
Eρωτήσεις επανάληψης
- $
7 RNA DNA - amp $ RNA DNA DNA RNA
8 amp F $ R 7 $ 13amp -7
9 $ -$ - (Y13 13 313)
10 Z (13 31) -
1 -13 13 $
2 $
3 13 ((13- 13 31)
4 amp13 $ 13 13 amp 13- -
5 amp -
6 $ - 37
Eρωτήσεις εφαρmicroογής
1 RNA () GUCAAAGAC (13) ACGAUAACC+ RNA - amp
2 () -6 F 13 -$ 13 -6
3 Halobacterium A 13 - (K+) 5 M 5- F K+ - 6 Haloba-cterium F $ 6 Escherichia coli 13-
ΕΡΩΤΗΣΕΙΣ ΕΦΑΡΜΟΓΗΣ 63
K+ $ (-13 $ $- 13 K+
4 6 -- 6 - amp-
5 0 13 13 - - F
13- 13
6 M rsquo F 5 1313 - 13 ( $) laquo- 13raquo 6 6 13
Γλωσσάριο εργασίας
αποδιάταξη microετουσίωση (denaturation) κατα-στροφή των ιδιοτήτων αναδίπλωσης microιας πρω-τεΐνης που οδηγεί (συνήθως) σε απώλεια τηςβιολογικής λειτουργίας της
γλυκοζιτικός δεσmicroός (glycosidic bond) τύποςοmicroοιοπολικού δεσmicroού που συνδέει microεταξύτους τα microονοmicroερή σακχάρων σε έναν πολυ-σακχαρίτη
δεσmicroός υδρογόνου (hydrogen bond) ασθενήςχηmicroικός δεσmicroός microεταξύ ενός ατόmicroου υδρογό-νου και ενός δεύτερου ηλεκτραρνητικότε-ρου ατόmicroου συνήθως οξυγόνου ή αζώτου
δευτεροταγής δοmicroή (secondary structure) ηαρχική αναδιπλωmicroένη δοmicroή που αποκτά έναπολυπεπτίδιο ή πολυνουκλεοτίδιο συνήθωςυπαγορεύεται από τις δυνατότητες σχηmicroατι-σmicroού δεσmicroών υδρογόνου
εναντιοmicroερές (enantiomer) microορφή ενός microορίουπου αποτελεί κατοπτρικό είδωλο microιας άλληςmicroορφής του ίδιου microορίου
λιπίδιο (lipid) γλυκερόλη συνδεδεmicroένη microε λιπα-ρά οξέα ή άλλα υδρόφοβα microόρια microέσω εστε-ρικού ή άλλου δεσmicroού Περιέχει συχνά καιάλλες οmicroάδες όπως τη φωσφορική
microακροmicroόριο (macromolecule) πολυmicroερές πουσυνίσταται από οmicroοιοπολικώς συνδεδεmicroέναmicroονοmicroερή
microη πολικός (nonpolar) microε υδρόφοβα χαρακτη-ριστικά και δυσδιάλυτος στο νερό
microόριο (molecule) δύο ή περισσότερα άτοmicroασυνδεδεmicroένα microεταξύ τους microε χηmicroικό δεσmicroό
νουκλεοζίτης (nucleoside) νουκλεοτίδιο χωρίςτη φωσφορική του οmicroάδα
νουκλεοτίδιο (nucleotide) microονοmicroερές νουκλεϊ-κού οξέος που περιέχει microια αζωτούχο βάση(αδενίνη γουανίνη κυτοσίνη θυmicroίνη ή ου-ρακίλη) ένα microόριο φωσφορικού και ένα σάκ-χαρο που microπορεί να είναι ριβόζη (στο RNA)ή δεοξυριβόζη (στο DNA)
οmicroοιοπολικός δεσmicroός (covalent bond) χηmicroικόςδεσmicroός στον οποίο τα ηλεκτρόνια ανήκουναπό κοινού σε δύο άτοmicroα
πεπτιδικός δεσmicroός (peptide bond) τύπος οmicroοι-οπολικού δεσmicroού που συνδέει αmicroινοξέα σεένα πολυπεπτίδιο
πολικός (polar) microε υδρόφιλα χαρακτηριστικάκαι εν γένει υδατοδιαλυτός
πολυmicroερές (polymer) χηmicroική ένωση που σχη-microατίζεται microε πολυmicroερισmicroό και συγκροτείταιαπό επαναλαmicroβανόmicroενες microονάδες που ονο-microάζονται microονοmicroερή
πολυνουκλεοτίδιο (polynucleotide) πολυmicroερέςνουκλεοτιδίων που συνδέονται microεταξύ τουςmicroε φωσφοδιεστερικούς δεσmicroούς
πολυπεπτίδιο (polypeptide) πολυmicroερές αmicroινο-ξέων που συνδέονται microεταξύ τους microε πεπτι-δικούς δεσmicroούς
πολυσακχαρίτης (polysaccharide) πολυmicroερέςmicroονοσακχαριτών που συνδέονται microεταξύτους microε γλυκοζιτικούς δεσmicroούς
πρωτεΐνη (protein) πολυπεπτίδιο ή σύνολο πο-λυπεπτιδίων που συγκροτούν microόριο microε ειδικήβιολογική λειτουργία
πρωτοταγής δοmicroή (primary structure) (σεπληροφοριακά microακροmicroόρια πχ πολυπεπτί-δια) η ακριβής ακολουθία των microονοmicroερώνmicroονάδων
τεταρτοταγής δοmicroή (quaternary structure) (σεπρωτεΐνες που αποτελούνται από δύο ή πε-ρισσότερες πολυπεπτιδικές υποmicroονάδες) οαριθmicroός και η διευθέτηση των διακριτών πο-λυπεπτιδικών υποmicroονάδων στο τελικό πρω-τεϊνικό microόριο
τριτοταγής δοmicroή (tertiary structure) η τελικήαναδιπλωmicroένη δοmicroή που αποκτά ένα πολυπε-πτίδιο το οποίο έχει προηγουmicroένως αποκτή-σει δευτεροταγή δοmicroή
φωσφοδιεστερικός δεσmicroός (phosphodiesterbond) τύπος οmicroοιοπολικού δεσmicroού που συν-δέει microεταξύ τους τα νουκλεοτίδια σε ένα πο-λυνουκλεοτίδιο
46 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
I ΧΗΜΙΚΟΙ ∆ΕΣΜΟΙ ΚΑΙ ΜΟΡΙΑΝΕΡΟΥ ΣΤΑ ΒΙΟΛΟΓΙΚΑΣΥΣΤΗΜΑΤΑ
13 13-
- - - laquoraquo 13 - $- 13 - $ 4 - 13
31 Iσχυροί και ασθενείς χηmicroικοί δεσmicroοί
13 $ -
amp $ 13 T - -$ $ (O) $ (O2) T 13 -$ $ Oslash - amp O H
$ $ $ 13 - H O H2O - $ + 1313 - - -$ $ ( 31)
2H H HO O+
∆εσmicroοί υδρογόνου και άλλες ασθενείς αλληλεπιδράσεις
13 13 13- ( 32) $ $ amp - 0 $ -$
-$ ( 32) 1313 - $ (-) - $ $ $ - $ 5
$- ( 32) - $ $- $ 13 - -
31 ΙΣΧΥΡΟΙ ΚΑΙ ΑΣΘΕΝΕΙΣ ΧΗΜΙΚΟΙ ∆ΕΣΜΟΙ 47
K˘UgraveOcircUcircrsaquoOacuteEuml (middot˙ˆUgraveOcircDaggermacrOcirc˜sbquoiquestUcircEuml UgraveOcirc˘ DNA IcircmiddotEgraveUgraveOcirc˘ RNA)
paraAcircUgraveEgravepermilEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜UacuteˆUgraveAcirc˚OacuteOgraveOacute
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcirclsaquo Uacutersaquo˙middotOtilde˙ˆUgraveOcirccentEgraveOcircIacuteAcircrsaquopermilEgraveOcirc UgraveOcirc˘ iquestOacuteıUacutemiddotIcircmiddot
AIcircAcircUgrave˘IumlcurrenOacuteEgraveOcircAEgraveı˘IumlcurrenOacuteEgraveOcirc
OH
NH2
(CO2) (PO43-)(N2) ndashO
O-
O-P
OUacuteEgraveUcircIgravecurrenOacuteAcirc˜ middotOacutefiUacuteAacutemiddotOacuteAcirc˜ AcircOacuteOgraveUcircAcircEgrave˜ IgraveAcirc permilEgraveIumlfi lsaquo UgraveUacuteEgraveIumlfi permilAcircUcircIgravefi
AEgraveı˘IumlcurrenOacuteEgraveOcirc IgraveEgravemiddot OcircUacuteAacutemiddotOacuteEgraveIcirclsaquo currenOacuteˆUcircEuml IgraveAcirc permilEgraveIumlfi permilAcircUcircIgravefi
AIcircAcircUgrave˘IumlcurrenOacuteEgraveOcirc IgraveEgravemiddot OcircUacuteAacutemiddotOacuteEgraveIcirclsaquo currenOacuteˆUcircEuml IgraveAcirc UgraveUacuteEgraveIumlfi permilAcircUcircIgravefi
H
H
H
H
H H
O O
O
O
O
HH H
H H
H H
HC C C CHHHH C C C C
C
C C C C C C
N N
N
O
N
N
NH2
616
704 955
805
ordmmiddotEgraveOacute˘IumlmiddotIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml(middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteDagger UacuteˆUgraveAcirc˚OacuteOgraveOacute)
OUacuteAacutemiddotOacuteEgraveIcirccurren˜ AcircOacuteOgraveUcircAcircEgrave˜ IgraveAcirc permilEgraveIumlOcircDagger˜ permilAcircUcircIgraveOcircDagger˜
Εικόνα 31 Οmicroοιοπολικοί δεσmicroοί ορισmicroένων βιολογικά σηmicroαντικών microο-ρίων που περιέχουν διπλούς και τριπλούς δεσmicroούς Στις περιπτώσεις του ακε-τυλενίου και του αιθυλενίου δίνεται και η ηλεκτρονιακή στερεοαπεικόνισητων microορίων Η ισχύς ενός δεσmicroού ανά γραmicromicroοmicroόριο (αριθmicroοί microε κόκκινοχρώmicroα) microετράται σε kilojoule (kJ) και αντιστοιχεί στη θερmicroική ενέργεια πουαπαιτείται για τη διάσπαση του δεσmicroού αυτού
N
N
N
NH
H O
N
OH
H
H
N
NH
HK˘UgraveOcircUcircrsaquoOacuteEuml
N
C
C
N
C
C
O
O
H
H
H
O
O
H
C
N
C
C
N
C H
H
OH
H
H
HH
H
H
H
degOcirc˘middotOacutersaquoOacuteEuml
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEumlpound˘IgraversaquoOacuteEuml
H
H
H
H
H
H
H H
H
O
O
O
O
O
O HO
R1
R2
R3
R4
N
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘
N
N
N
N
N
N
N
H
H
H
H
H
O
O
CH3
(middot) NAcircUacutefi
(sbquo) AIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenmiddot UcircAcirc UacuteˆUgraveAcirc˚OacuteEgraveIcirclsaquo middotIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot R AcircrsaquoOacutemiddotEgrave Euml IumlAcirc˘UacuteEgraveIcirclsaquo middotIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot IcirciquestıAcirc middotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenOcirc˜
(Aacute) A˙ˆUgraveOcircDaggermacrAcirc˜ sbquoiquestUcircAcircEgrave˜ UcircUgraveOcirc DNA
Εικόνα 32 ∆εσmicroοί υδρογόνου Στα νουκλεϊκά οξέα οι δεσmicroοί υδρογό-νου συmicroβολίζονται συχνά microε συνεχείς γραmicromicroές αντί για στικτές δύο γραmicromicroέςmicroεταξύ των ζευγών αδενίνηςθυmicroίνης και τρεις γραmicromicroές microεταξύ των ζευγώνγουανίνηςκυτοσίνης (βλ Eικόνα 311)
( 32 ) 0 - 6 13 - - 0 - 13 13- 7- ( 32) 7 $ (32) (13 35 37 38)
13 - 13 van der Waals - $ $ 3-4 angstrom (Aring) = van der Waals
- (f 55) - $ 7 7 $
13 13 1313 gt13 - (13) $ 13 - - - $ 13 - - 7 - van der Waals
48 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
ΠΙΝΑΚΑΣ 31 Λειτουργικές οmicroάδες ιδιαίτερης βιοχηmicroικής σηmicroασίας
Xηmicroική οmicroάδα ∆οmicroήα Bιολογική σπουδαιότητα
Καρβοξυλική Oργανικά οξέα λιπαρά οξέα αmicroινοξέα λιπίδια πρωτεΐνες
Αλδεϋδική Λειτουργική οmicroάδα αναγωγικών σακχάρων πχ γλυκόζης πολυσακχαρίτες
Αλκοολική Λιπίδια υδατάνθρακες
Κετονική Πυροσταφυλικό ενδιάmicroεσα κύκλου του Krebs
Εστερική Λιπίδια σε Βακτήρια και Ευκάρυα σύνδεση των αmicroινοξέων στα tRNA
Φωσφοεστερική Nουκλεϊκά οξέα DNA και RNA
Θειοεστερική Mεταβολισmicroός ενέργειας βιοσύνθεση λιπαρών οξέων
Αιθερική Λιπίδια Αρχαίων σφιγγολιπίδια
Οξεοανυδριτική Mεταβολισmicroός ενέργειας πχ ακετυλο-φωσφορικό
Φωσφοανυδριτική Mεταβολισmicroός ενέργειας πχ ATP
α H απεικόνιση δεσmicroού microε κυmicroατιστή γραmicromicroή (~) υποδηλώνει ότι ο δεσmicroός είναι laquoυψηλής ενέργειαςraquo (f Tmicroήmicroα 58)
| |mdash mdash
||mdash mdash
||
|
mdash mdash
|
|mdash mdash mdash
||mdash
|
|
|
|mdash mdash mdash mdash
||
O
|
|mdash mdash mdashmdash
|
|mdash mdash mdash
|
|mdash
|
|mdash mdash
||
| | ||
|mdash mdash mdash
||mdash ~
~
~
mdash
O
C OH
O
C H
O
C
H
H
C O
O
C
H
H
H
H
C O C
O Ondash
C O O P
Ondash
O
P OndashO C
H
H
C OH
ndashO
Ondash Ondash
O O
O OndashPP
O
C S
$- 13 - $ - 6 - 13
Mοτίβα σύνδεσης στα βιοmicroόρια
(C) - () Oslash - - - 13- 31 13 - 13 13 13 $ 13
31 Έλεγχος εννοιών
$ amp van der Waals 13 13
-
-
32 Γενική θεώρηση των microακροmicroορίων και του νερού ως βιολογικού διαλύτη
amp 13 - 13 Escherichia coli 13 - 13- ( ) ( 32) 96 $ 13 - -
6 ( 32) 6 - () ( 33)
13 RNA DNA $ RNA - 6 ( 32 33)A 13 - 13 (laquoraquo 7) RNA 6 +- RNA - (mRNA) RNA (tRNA) 7 amp RNA DNA 13 13 (32) DNA 1313 - -
13 13 - 13 (-
32 ΓΕΝΙΚΗ ΘΕΩΡΗΣΗ ΤΩΝ ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΩΝ ΚΑΙ ΤΟΥ ΝΕΡΟΥ ΩΣ ΒΙΟΛΟΓΙΚΟΥ ∆ΙΑΛΥΤΗ 49
ΠΙΝΑΚΑΣ 32 Xηmicroική σύνθεση προκαρυωτικού κυττάρουα
Mόριο Ποσοστό () Aριθmicroός microορίων ανάεπί ξηρού κύτταρο (διαφορετικοίβάρουςβ τύποι)
Σύνολο microακροmicroορίων 96 24610000 (~2500)Πρωτεΐνες 55 2350000 (~1850)Πολυσακχαρίτες 5 4300 (2)γ
Λιπίδια 91 22000000 (4)δ
Λιποπολυσακχαρίτες 34 1430000 (1)DNA 31 21 (1)RNA 205 255500 (~660)
Σύνολο microονοmicroερών 30 mdashε (~350)Αmicroινοξέα και 05 mdash (~100)
πρόδροmicroά τουςΣάκχαρα και 2 mdash (~50)
πρόδροmicroά τουςΝουκλεοτίδια και 05 mdash (~200)
πρόδροmicroά τους
Ανόργανα ιόντα 1 mdash (18)
Σύνολο 100 mdash
α ∆εδοmicroένα από Neidhardt F C et al (eds) 1996 Escherichia coli and Sal-monella typhimurium-Cellular and Molecular Biology 2nd edition American So-ciety for Microbiology Washington DCβ Ξηρό βάρος ενός ενεργά αυξανόmicroενου κυττάρου E coli asymp 28 times 10ndash13 g ολι-κό βάρος (70 νερό) = 95 times 10-13 gγ Ως κύριοι πολυσακχαρίτες θεωρούνται οι πεπτιδογλυκάνες και το γλυκογό-νοδ Υπάρχουν διάφοροι τύποι φωσφολιπιδίων κάθε τύπος απαντά σε πολλέςmicroορφές λόγω διαφορών στη σύνθεση των λιπαρών οξέων από είδος σε είδοςκαι λόγω διαφορών στις συνθήκες ανάπτυξηςε ∆έν υπάρχουν αξιόπιστες microετρήσεις για την ποσοστιαία σύσταση σε microονο-microερή και σε ανόργανα ιόντα
33) - - 0 13 - ( ) -
Tο νερό ως βιολογικός διαλύτης
laquo13raquo - 13 O - $ 13 13-
= - 13 0 - 4 $ - - 13 (f 46 47) - - $ (32) 13 - 13 = F - - (13) $ E 13 - $
- F - - - ( 32) - = 13 1313 13 13 ( - F 1degC) $ () 13- 13 - - $
F 13 13
= 13 13 (- - 610 13) A - 13 ( 32)
50 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
(middot) paraUacuteˆUgraveAcirc˝OacuteAcirc˜
(sbquo) NOcirc˘IcircIumlAcirc˚Icirciquest OcircIacutecurrenmiddot
(Aacute) paraOcircIuml˘UcircmiddotIcircmacrmiddotUacutersaquoUgraveAcirc˜
(permil) sectEgraversaquopermilEgravemiddot
AOcircıEumlIcircAcirc˘UgraveEgraveIcirciquestIcircOcircIcircIcircrsaquomiddot
MmiddotUcircUgraversaquoAacuteEgraveOcircMAcircIgravesbquoUacuteiquestOacuteEuml TOcircrsaquomacrˆIgravemiddot
K˘UgraveUgravemiddotUacutefiIumlmiddotUcircIgravemiddot
PEgravesbquoOcircUcircOgraveIgravemiddotUgravemiddotpara˘UacuteEumlOacuteOcircAcircEgravepermilcurren˜
Εικόνα 33 Θέσεις των microακροmicroορίων microέσα στο κύτταρο (α) Πρωτεΐνες(καφέ χρώmicroα) απαντούν σε όλη την έκταση του κυττάρου είτε ως microέρη κυτ-ταρικών δοmicroών είτε ως ένζυmicroα (β) Νουκλεϊκά οξέα DNA (πράσινο χρώmicroα)απαντά στο πυρηνοειδές των προκαρυωτικών κυττάρων και στον πυρήνα τωνευκαρυωτικών κυττάρων RNA (πορτοκαλί χρώmicroα) απαντά στο κυτταρόπλασmicroα(mRNA tRNA) και στα ριβοσώmicroατα (rRNA) (γ) Πολυσακχαρίτες (κίτρινοχρώmicroα) υπάρχουν στο κυτταρικό τοίχωmicroα και ενίοτε σε εσωτερικά αποθη-κευτικά κοκκία (δ) Λιπίδια (κυανό χρώmicroα) απαντούν στην κυτταροπλασmicroατι-κή microεmicroβράνη στο κυτταρικό τοίχωmicroα και σε αποθηκευτικά κοκκία Οχρωmicroατικός κώδικας που χρησιmicroοποιείται εδώ θα εφαρmicroοσθεί για την απει-κόνιση των 4 τύπων microακροmicroορίων σε όλο το βιβλίο Για το DNA βλ επίσηςτη λεζάντα της Εικόνας 311
32 Έλεγχος εννοιών
= - 6 7 $ (DNA RNA) - - 13
RNA - $
+ F 13
I I ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑamp 32 $
33 Πολυσακχαρίτες
13 () $ - 121 - C6H12O6 ( 34)+ 13 - 4 5 6 7 ( C4 C5 C6 C7) amp C5 () 7 $- C6 ($) - - 34 -
$ = 13- 13 (f 48) - ( 35) $ - 1313- 13 (13 36) $ -
O γλυκοζιτικός δεσmicroός
( ) 13 ( 36)0 () - = - - - -
33 ΠΟΛΥΣΑΚΧΑΡΙΤΕΣ 51
MED
IA T
UTO
RIAL
MED
IA T
UTO
RIAL
Mac
rom
olec
ules
centOcircIgraveEgraveIcircfi˜UcircIcircAcircIumlAcircUgravefi˜RNA
centOcircIgraveEgraveIcircfi˜UcircIcircAcircIumlAcircUgravefi˜DNA
paraEumlAacutelsaquoAcircOacutecurrenUacuteAacuteAcircEgravemiddot˜Icirc˘UgraveUgravemiddotUacuteEgraveIcirciquestUgraveOcircEgravemacrOgraveIgravemiddotUgravemiddot
paraEumlAacutelsaquoAcircOacutecurrenUacuteAacuteAcircEgravemiddot˜UcirciquestIcircmacrmiddotUacuteOcircEcircUacuteOcircDaggerUgraveˆOacute
ordmUacuteOcirc˘IcircUgravefi˙Euml
tradeiquestIcircmacrmiddotUacuteOcirc AOacuteOcircEgraveIcircUgravelsaquo middotIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot centmiddotIcircUgraveDaggerIumlEgraveOcirc˜ PfiIumlOcirc˜
1
23
4
5
PEgravesbquofi˙Euml
paraAcircOacuteUgravefi˙Acirc˜
centAcircOcircIacute˘UacuteEgravesbquofi˙Euml
degIuml˘Icircfi˙Euml
EIacutefi˙Acirc˜
H
H
H
H
HH H
H
H
H H
H
H
HH
H
HH
H
H
H
H
H HH
H
H
H
H
H
H
H
HH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OHOH
OH
C
C
C
C
C
C C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C C
C
C
C C
C
C
C
C C
C
C
C
C
C
OO
O
O
O O
OO
CH2OH
HOCH2
HOCH2
HOCH2
HOCH2
CH2OH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
HO
HO
HO
1
23
4
51
2
3
4
5
1
2
3
4
5
1
2
3
4
5
6
1
2
3
4
5
6
1
23
4
5
6
5
6
4 3
2
1
Εικόνα 34 Συντακτικοί τύποι ορισmicroένων κοινών σακχάρων Τα σάκχα-ρα αναπαρίστανται microε δύο εναλλακτικούς τρόπους ανοικτής αλυσίδας καιδακτυλίου Η microορφή της ανοικτής αλυσίδας είναι περισσότερο ευανάγνωστηαλλά συνηθέστερα χρησιmicroοποιείται η microορφή του δακτυλίου Σηmicroειώστε τοντρόπο αρίθmicroησης των θέσεων του δακτυλίου
TOcirc iquestUgraveOcircIgraveOcirc NmiddotOacuteUgraveEgraveIcircmiddotıEgraveUcircUgraveiquest currenOacutemiddotiquestUgraveOcircIgraveOcirc O UgraveOcirc˘ UcircmiddotIcircmacriquestUacuteOcirc˘
AIcircAcircUgrave˘IumlOcircIgraveiquestpermilmiddotHC
O
CH N
H
C
O
CH3
C HHO
C OHH
C OHH
CH2OH
CH2OH
O
HHOH
H
HO
H NH
C O
CH3
OH2
1
3
4
5
6
1
23
4
5
6
Εικόνα 35 Ν-ακετυλογλυκοζαmicroίνη ένα παράγωγο σακχάρου
- - - ( 36) 13 - $ 1 4 - ( Oslash - 36) - 13 amp -14 (36) - - - - (- -) $ 6 13 amp - 13 -- - $ 13 - $ - Gram 13- - ( 49)
33 Έλεγχος εννοιών
$ - - (- -) - 6
- - 100
34 Λιπίδια
-13 amp 13 (f 45) $ - 13 ( 37) $ 16 15 - ( ) 13$ L
52 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
O
CH2OH
H
H
OH
OH
H
H
HO
H
O
CH2OH
H
OHH
OH
OH
H
HH
O
OtildeIgrave˘IumlOcirc
degIuml˘IcircOcircAacutefiOacuteOcirc
K˘UgraveUgravemiddotUacutersaquoOacuteEuml
(sbquo)
(middot)
O
CH2OH
H
H
OH
OH
H
H
HO
H
OH
O
CH2
H
H
OH
OH
H
HH
O
HO
O
CH2OH
HH
OH
OH
H
H
HO
HOH
O
CH2OH
HH
OH
OH
H
HH
O
middot-14-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
middot-16-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
sbquo-14-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-14
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-16
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo sbquo-14
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-14
1
23
4
5
6
1
23
4
5
6
1
23
4
5
6
Εικόνα 36 Πολυσακχαρίτες (α) ∆οmicroές διαφόρων γλυκοζιτικών δεσmicroώνΣηmicroειώστε ότι microπορεί να ποικίλλουν τόσο η σύνδεση όσο και η γεωmicroετρία (α-ή β-) του δεσmicroού (β) ∆οmicroές ορισmicroένων κοινών πολυσακχαριτών Συγκρίνετετον χρωmicroατικό κώδικα microε το (α)
$ 14 20 ( 37)
Tριγλυκερίδια και σύνθετα λιπίδια
() $ 13 ( 37)
13 $
- ( 37) $$13 - 13 13 (f 45)
13 13 13- $ ()13 13 (f 45) - 13 -13 $
34 Έλεγχος εννοιών
13 - 13
$ 13
13 13 $
$ 4 (C4)
35 Nουκλεϊκά οξέα
7 $ $137 (DNA) 137 (RNA) 13 -13 DNA - RNA - - $ 6 M - 5 13 ( RNA)
35 ΝΟΥΚΛΕΪΚΑ ΟΞΕΑ 53
MOcircOacuteOcircAacutemiddotIumlmiddotIcircUgraveOcirc˙˘IumlOcircpermilEgraveAacuteIuml˘IcircAcircUacutersaquopermilEgraveOcirc(currenOacutemiddot AacuteIuml˘IcircOcircIumlEgraversaquopermilEgraveOcirc)
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot Ucirc˘OacutepermilAcircpermilAcircIgravecurrenOacutemiddot IgraveAcirc AacuteIuml˘IcircAcircUacutefiIumlEumlIgravecurrenUcircˆ AcircUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircOcircDagger permilAcircUcircIgraveOcircDagger
OH
OH
OH
H3CKOcircUacuteAcircUcircIgravecurrenOacuteOcirc C16 (middotIumlIgraveEgraveUgraveEgraveIcircfi)
MOcircOacuteOcircmiddotIcircfiUacuteAcircUcircUgraveOcirc C16 (middotIumlIgraveEgraveUgraveAcircIumlmiddot˚Icircfi)
C OH
O
CH3 C OH
O
H3CC O
O
H3CC O
OC
C
H
H
H
O C H
H
O
CH2OH
degmiddotIumlmiddotIcircUgravefi˙Euml
H3CC O
O
H3CC O
OC
C
H
H
H
P O
O
C H
H
ndashO
O
CH2
CH2+NH3
AEgraveımiddotOacuteOcircIumlmiddotIgraversaquoOacuteEuml
H3CC O
O
C H
H3CC O
O
C H
H3CC O
O
C H
H
H
KOcircEgraveOacuteiquest IumlEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
tradeDaggerOacuteıAcircUgraveOcirc IumlEgraversaquopermilEgraveOcirc
AIumliquest IumlEgraversaquopermilEgravemiddot (UgraveUacuteEgraveAacuteIuml˘IcircAcircUacutersaquopermilEgravemiddot)
tradeDaggerOacuteıAcircUgraveOcirc IumlEgraversaquopermilEgraveOcircordmˆUcircEcircmiddotUgraveEgravepermil˘IumlOcircmiddotEgraveımiddotOacuteOcircIumlmiddotIgraversaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot EcircˆUcircEcircOcircIumlEgraversaquopermilEgraveOcirc)
degIuml˘IcircAcircUacutefiIumlEuml
12
3546
78
910
1112
1314
1516
23
4
5
6
1
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
EUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi
Εικόνα 37 Λιπαρά οξέα απλά λιπίδια (λίπη) και σύνθετα λιπίδια Απλάλιπίδια σχηmicroατίζονται microε microια αντίδραση αφυδάτωσης microεταξύ λιπαρών οξέωνκαι γλυκερόλης η οποία δηmicroιουργεί εστερικό δεσmicroό
$13 ( DNA) 13 PO4
3ndash = - DNA RNA - 38
Nουκλεοτίδια
13 7 $ - 13 13 (
) 13 - $ ( 39) = DNA RNA = ( $-) DNA RNA 13 () -$ C-1 N 13 13 1 ( ) 9 ( -) amp - 13 - ( 310)
13 7 $ 5 ATP ( ) ( 310) -
54 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi P
O
Ondash
OndashO
C C
O BiquestUcircEuml
OH
H HHH C
OH PEgravesbquofi˙Euml
5atilde
4atilde
3atilde 2atilde1atilde
C
CH2
Εικόνα 38 Νουκλεοτίδια Εδώ απεικονίζεται ένα ριβονουκλεοτίδιο πουαπαντά στο RNA Τα δεοξυριβονουκλεοτίδια που απαντούν στο DNA έχουνστον άνθρακα 2rsquo ένα άτοmicroο H αντί της οmicroάδας ndashOH Η αρίθmicroηση των θέσε-ων του σακχάρου γίνεται microε τονούmicroενους αριθmicroούς για να διακρίνεται από τηναρίθmicroηση των θέσεων του δακτυλίου της αζωτούχου βάσης οι οποίες επί-σης αριθmicroούνται (1 2 3 κλπ) (βλ Εικόνα 39) Τόσο τα δεοξυριβονου-κλεοτίδια όσο και τα ριβονουκλεοτίδια περιέχουν microια 5rsquo-φωσφορική οmicroάδα
N
N
N
N
1
234
56
78
9
N
N
N
N
NH2
N
N
N
NH
NH2
O
N
N
3
216
54
N
NH
O
O
H3C
NH
O
NH2
K˘UgraveOcircUcircrsaquoOacuteEuml (C)
pound˘IgraversaquoOacuteEuml (T)
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEuml (A)
degOcirc˘middotOacutersaquoOacuteEuml (G)
DNA RNA
BiquestUcircAcircEgrave˜ ˘UacuteEgraveIgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml˜ BiquestUcircAcircEgrave˜ Ocirc˘UacutersaquoOacuteEuml˜
H
N
DNA RNA
MfiOacuteOcircDNA
Εικόνα 39 ∆οmicroές των βάσεων του DNA και του RNA ∆εν παρατίθεταιστην εικόνα η ουρακίλη (U) της οποίας η δοmicroή είναι όmicroοια microε της θυmicroίνηςmicroε τη microόνη διαφορά ότι στερείται της microεθυλοmicroάδας στον C-5 Παρατηρήστετο σύστηmicroα αρίθmicroησης των δακτυλίων Κατά την ένωση τους microε τον άνθρα-κα 1rsquo του φωσφοσακχάρου για τον σχηmicroατισmicroό νουκλεοτιδίου (Εικόνα 38)οι βάσεις πυριmicroιδίνης συνδέονται microέσω του N-1 του δακτυλίου και οι βάσειςπουρίνης microέσω του N-9
TUacuteEgraveEcircˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcirclsaquo middotpermilAcircOacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot OacuteOcirc˘IcircIumlAcircOcircUgraversaquopermilEgraveOcirc)
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi˜AcircUcircUgravecurrenUacutemiddot˜
N-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
OHOCH2 OH
HH
H
H
OHOH
PEgravesbquofi˙Euml
N N
NN
NH2
+
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEuml
OHOCH2
OHOH
N N
NN
NH2
ApermilAcircOacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot˜ OacuteOcirc˘IcircIumlAcircOcirc˙rsaquoUgraveEuml˜)
3 PO43ndash
OCH2
OHOH
N N
NN
NH2
OPOPOPndashO
O
Ondash
O
Ondash
O
Ondash
ordmˆUcircEcircOcirc-middotOacute˘permilUacutersaquoUgraveEuml˜
H H
H
H
H
H
H H H
~ ~65
4 32
178
9
65
4 32
178
9
65
4 32
178
9
Eικόνα 310 Συστατικά ενός σηmicroαντικού νουκλεοτιδίου της τριφω-σφορικής αδενοσίνης Η ενέργεια υδρόλυσης του φωσφοανυδριτικού δεσmicroού(κυmicroατιστές παύλες) είναι microεγαλύτερη από αυτήν του φωσφορικού εστέραγεγονός που η σηmicroασία του θα γίνει αντιληπτή στο Κεφάλαιο 5 (f Tmicroήmicroα58)
- - - (f 58) L - $- (f 57) 13 (f
515) 13 $ - 7 $ $ -
Nουκλεϊκά οξέα
Q 7 $ - - ( 311)
$ - 3 ( 3acute) 5 (5acute) (- 311) = F $$13
= DNA RNA - 0 13 DNA RNA - 0 - (f 7) DNA - RNA
35 ΝΟΥΚΛΕΪΚΑ ΟΞΕΑ 55
paraAcircUacuteEgraveOcircmacrlsaquo UcircDagger˙Acirc˘IacuteEuml˜Ucirc˘IgraveIumlEumlUacuteˆIgravemiddotUgraveEgraveIcircOgraveOacutesbquoiquestUcircAcircˆOacute
A˙ˆUgraveOcircDaggermacrOcirc˜ sbquoiquestUcircEumlUcirc˘OacutepermilAcircpermilAcircIgravecurrenOacuteEuml UcircUgraveEuml ıcurrenUcircEuml 1atilde
H H
H2C BiquestUcircEumlO
O3atilde
1atilde
2atilde
5atilde
5atilde
5atilde
5 3
3atilde
3atilde
3atilde
3atilde 5atilde
P OndashO
H H H
H
H
H2C BiquestUcircEumlO
O
O
H H H
H
H
O
O
(i)
(ii)
poundcurrenUcircEuml 5atilde
P OndashO
O
P OndashO
O
centAcircOcircIacute˘UacuteEgravesbquofi˙Euml
paraUacuteˆUgraveOcircUgravemiddotAacutelsaquo˜permilOcircIgravelsaquo
centAcirc˘UgraveAcircUacuteOcircUgravemiddotAacutelsaquo˜permilOcircIgravelsaquo
poundcurrenUcircEuml 3atilde
(middot)
(sbquo)
A
C G
G C
C G
C G
A U
(Aacute)
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi
A GG CC T T A
T CC GG A A T
C C A U C GA CG U G A
C C U C G GC GG A C A
C
BiquestUcircEumlH2C
5atilde
4atilde
H
HcentAcircUcircIgraveOcircrsaquo˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘
ordmˆUcircEcircOcircpermilEgraveAcircUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 311 DNA και RNA (α) ∆οmicroή microέρους microιας αλυσίδας DNA Οι αζωτούχες βάσεις microπορεί να είναι αδενίνη γουανίνη κυτοσίνη ή θυmicroίνη Στο RNAυπάρχει microια οmicroάδα ndashOH στον άνθρακα 2rsquo της πεντόζης (βλ Εικόνα 38) και ουρακίλη αντί της θυmicroίνης (β) Απλουστευmicroένο σχήmicroα της δοmicroής του DNA όπουαπεικονίζονται microόνον οι αζωτούχες βάσεις Παρατηρήστε ότι οι δύο αλυσίδες (κλώνοι DNA) είναι συmicroπληρωmicroατικές ως προς την ακολουθία βάσεων (A=T GintC)και συνδέονται microε δεσmicroούς υδρογόνου που σχηmicroατίζονται microεταξύ αυτών των βάσεων Οι δύο κλώνοι DNA απεικονίζονται microε πράσινο χρώmicroα σε δύο διαφορετι-κούς τόνους σκίασης χρωmicroατική σύmicroβαση που εφαρmicroόζεται σε όλο το βιβλίο (γ) RNA (i) πρωτοταγής δοmicroή (ii) πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή Στο RNAσχηmicroατίζονται δευτεροταγείς δοmicroές όταν παρουσιάζονται δυνατότητες για ενδοmicroοριακή ζεύξη βάσεων δηλ για ζεύξη βάσεων της ίδιας αλυσίδας Σε ορισmicroέναπολύ microεγάλα microόρια RNA όπως πχ στο ριβοσωmicroατικό RNA (f Τmicroήmicroατα 715 και 114) άλλες περιοχές του microορίου έχουν microόνο πρωτοταγή δοmicroή και άλλεςτόσο πρωτοταγή όσο και δευτεροταγή δοmicroή Αυτό οδηγεί σε microόρια microε τελικό τριδιάστατο σχήmicroα που είναι καθοριστικό για τη λειτουργία τους και εmicroπεριέχειεκτενείς περιελίξεις ή συσπειρώσεις (f Εικόνα 118γ) Το RNA απεικονίζεται microε πορτοκαλί χρώmicroα χρωmicroατική σύmicroβαση που διατηρείται σε όλο το βιβλίο
$ 1313 -
DNA
DNA DNA - $ -$ (13 32) - - $ (G) (C) $ (A) (T) (13 32) $ $ 13 A T G C DNA - 13 0 G - C T A ( 311)
RNA
$ 137$ S RNA $ 13 - amp 13 - RNA 1313 ( 311)
RNA 13 $ RNA (messenger RNAmRNA) DNA 13- DNA $ RNA (transfer RNA tRNA) - 7 -- -$ 7 - RNA (ribosomal RNA rRNA) 13 7 0 RNA $ - 7 11
35 Έλεγχος εννοιών
7 $ - 13 - RNA DNA RNA
-
13 $ 1313
RNA
36 Tα αmicroινοξέα και ο πεπτιδικός δεσmicroός
$ 7- $ - $ 21 $ 0 $ - (ndashCOOH) (ndashNH2) (- 31 312) amp - $ 13-$ $ - $ ( ) -13 13 - 6 ( 313)
0 $ - 312 ( ROslash 312) - -- 13$13 13 13$ ( ) ( $ ) (- 312) $ 13 - $ - laquoraquo$ 312 = - - 13$ $ $ $ $ L $ 13 - $ = 6 - (ndashSH) -$ - (RndashSndashSndashR) F - $ $ 7 - 13
Iσοmicroερή
amp
56 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
$ Louis Pasteur 13 -F (f 15) 13 = Pasteur F $ ( 314) $ 13 - ( $ )
- (f 48) X laquo- raquo $ - D
L ( 315) 13 - Dndash
$ D L 0 - 6 $ Lndash$ Dndash (- 315) Dndash$ - (f 48) 13 (f 209) Dndash$ Lndash Lndash Dndash
36 ΤΑ ΑΜΙΝΟΞΕΑ ΚΑΙ Ο ΠΕΠΤΙ∆ΙΚΟΣ ∆ΕΣΜΟΣ 57
H
CH3
CHCH3
CH3
CH2CHCH3
CH3
CHCH3
CH2CH3
CH2OHCHCH3
OH
CH2
O-O
CH2C
O
NH2
CH2C
O-O CH2
CH2C
O
CH2NH2
CH2HS
CH2S CH2CH3
CH2
CH2HO
CH2
NH
CH2CH2CH2CH2+NH3
CH2CH2CH2+NH2 N
HC
NH2CH2
HN
+HN
N
CH2H2C
H2C CH COOndash
Gly degIuml˘IcircrsaquoOacuteEuml (G)
Ala AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (A)
Val BmiddotIumlrsaquoOacuteEuml (V)
Leu sectAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (L)
Ile IUcircOcircIumlAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (I)
Ser tradeAcircUacutersaquoOacuteEuml (S)Thr poundUacuteAcircOcircOacutersaquoOacuteEuml (T)
Asp AUcircmiddotUacuteUgraveEgraveIcircfi (D)
Asn AUcircmiddotUacutemiddotAacutersaquoOacuteEuml (N)
Glu degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraveEgraveIcircfi (E)
Gln degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraversaquoOacuteEuml (Q)
Cys K˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (C)
CH2HSe Sec tradeAcircIumlEumlOacuteOcircIcirc˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (U)
Met MAcircıAcircEgraveOcircOacutersaquoOacuteEuml (M)
Phe ordmmiddotEgraveOacute˘IumlmiddotIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (F)
Tyr T˘UacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (Y)
Trp TUacute˘UgraveOcircEcirciquestOacuteEuml (W)
Lys sect˘UcircrsaquoOacuteEuml (K)
Arg AUacuteAacuteEgraveOacutersaquoOacuteEuml (R)
His IUcircUgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml (H)
Pro
centOcircIgravelsaquo UgraveˆOacute middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteEgraveIcircOgraveOacute OcircIgraveiquestpermilˆOacute
OHC
O
CR
H
NH2
AIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot
degAcircOacuteEgraveIcirclsaquo permilOcircIgravelsaquo AcircOacutefi˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenOcirc˜
(tradeEumlIgraveAcircrsaquoˆUcircEuml tradeUgraveEumlOacute AcircUacutersaquoUgraveˆUcircEuml UgraveEuml˜ UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml˜ middotAcircEgraveIcircOcircOacutersaquo˙AcircUgravemiddotEgrave OcircIumlfiIcircIumlEumlUacuteEuml Euml permilOcircIgravelsaquo fimacrEgrave IgravefiOacuteOcircOacute Euml OcircIgraveiquestpermilmiddot R H UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml permilAcircOacute AcircrsaquoOacutemiddotEgrave middotIcircUacuteEgravesbquoOgrave˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteDagger permilEgravefiUgraveEgrave UcircUgraveAcircUacuteAcircrsaquoUgravemiddotEgrave AcircIumlAcircDaggerıAcircUacuteEuml˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot˜)
H IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-fiIacuteEgraveOacuteOcirc
MEuml OcircIumlEgraveIcircfi(˘permilUacutefiEcircOcircsbquoOcirc)
C
KIumlAcircrsaquopermilmiddot
-iquestOacuteıUacutemiddotIcircmiddot˜
KmiddotUacutesbquoOcircIacute˘IumlOcircIgraveiquestpermilmiddot
paraUacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml (P)
IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-middotIumlIcircmiddotIumlEgraveIcircfi
paraOcircIumlEgraveIcircfi IgraveEuml EgraveOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc Εικόνα 312 Συντακτικοί τύποι των 21 κοινών αmicroινοξέων Αριστερά απότο όνοmicroα κάθε αmicroινοξέος δίνεται η τριγράmicromicroατη συντοmicroογραφία του και δεξιά(σε παρένθεση) η microονογράmicromicroατη συντοmicroογραφία του
H2N C C
H O
OH NH
C C
H
R2
O
OH+ H
H2O
H2N C C
H
R1
O
N C C
H
R2
O
OH
R1
H
paraAcircUgraveEgravepermilEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 313 Σχηmicroατισmicroός πεπτιδικού δεσmicroού R1 και R2 αναφέρονταιστο microεταβλητό microέρος των αmicroινοξέων (πλευρική αλυσίδα) (βλ Εικόνα 312)
(Lndash Dndash$) 13- (Dndash Lndash$)
36 Έλεγχος εννοιών
21 $ - $ 13 13 $ ( ) -6
$ - $
$ -
- $ 13 - $ -
37 Πρωτεΐνες πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή
6 - - 6 () 6
13 - (f 5 17) 6 13 - - - 6 = 7 - -
Πρωτοταγής δοmicroή
6 $ $ (-
58 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
T T
P
M M
Pbatilde b
h
n n
h
(middot) (sbquo)
Εικόνα 314 Σχεδιαγράmicromicroατα κρυστάλλων τρυγικού οξέος (C4H6O6) διάχειρός Louis Pasteur από το περίφηmicroο άρθρο του περί οπτικής ενεργότητας(α) Αριστεροχειρικός κρύσταλλος (microορφή L) (β) ∆εξιοχειρικός κρύσταλλος(microορφή D) Οι δύο κρύσταλλοι είναι κατοπτρικά είδωλα ο ένας του άλλου(δηλ εναντιοmicroερή) Τα γράmicromicroατα πάνω στις έδρες των κρυστάλλων υποδη-λώνουν τα ζεύγη εναντιοmicroερών εδρών κατά τον συmicroβολισmicroό του PasteurΓια να αναδειχθεί σαφέστερα η εναντιοmicroέρεια των κρυστάλλων έχει χρησι-microοποιηθεί έγχρωmicroη σκίαση
(sbquo)
NH2H2N
COOH
C HH2N
CH3
COO
CH
CH3
ErsaquoAcircpermilEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
COOH
C NH2
CH3
COOH
CH
CH3
H
L-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml D-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml
(Aacute)
HO
HO
HO
OH
HHO
C OHH
OH
CH2OH
O
C H
CH
H
H
CH2OH
D-degIuml˘Icircfi˙Euml L-degIuml˘Icircfi˙Euml
CO
OH
(middot)
H
CH
C
CH
HC
C
C
tradeUgraveEumlOacute UgraveUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEuml UacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo UgraveOcirc IgraveAcircOacute sbquocurrenIumlOcirc˜ ımiddot UacutecurrenAcircEgrave Oacutemiddot ıAcircˆUacuteEumlıAcircrsaquo fiUgraveEgrave IcircmiddotUgraveAcirc˘ıDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave UacuteOcirc˜ UgraveOcircOacute middotUacutemiddotUgraveEumlUacuteEumlUgravelsaquo Euml permilAcirc permilEgravemiddotIcircAcircIcircOcircIgraveIgravecurrenOacuteEuml AacuteUacutemiddotIgraveIgravelsaquo fiUgraveEgrave middotOcircIgravemiddotIcircUacuteDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave middotfi middot˘UgravefiOacute
bC C
a
c c
a
d db
TUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
Εικόνα 315 Ισοmicroερή (α) Υπόδειγmicroα ζεύγους κατοπτρικών ειδώλων(β) Εναντιοmicroερή γλυκόζης (γ) Εναντιοmicroερή του αmicroινοξέος αλανίνη Παρατη-ρήστε ότι όπως και να περιστραφούν οι τριδιάστατες προβολές των microορίωνοι δύο microορφές L και D είναι αδύνατον να συmicroπέσουν
313) $ $ - 13 $ 13 0 $ - $ 13 6 - $ 6 6 6 15 $ 6 10000 -$ 6 $ 7 ( )
= $ - 13 = - 13 13 + - 13 13
∆ευτεροταγής δοmicroή
= $ R $ 13 13 6( 316) ( 31) - 6 M - - - 7 - (316) gt $ $ = ( - ) - - ( 316)
M - 1313 - $ (- 316)
- - - -
37 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ΠΡΩΤΟΤΑΓΗΣ ΚΑΙ ∆ΕΥΤΕΡΟΤΑΓΗΣ ∆ΟΜΗ 59
(middot)
(sbquo)
CC C
C
CC
C C
C
C
C
C
CCC
C C C
C
C
CC C
CC C
C
C
C
CC
CC
C
CC CC
C C
CC
C
C
C C
CC C
CC
C
CC
C C
CC
CCCC
C C
CC CC
C C
C
O
O
O O O
O
O
O O O
O
O O
O
O O
O
OO
O
OO
O
O O
O
O
O O
O
O O
OO
OO
RR
R R
R
RR R R
R R R
RRR
R R R
RRR
R R R
R R R
RR
RR
RR
R
R
H
HH
HH
HHH H
H
H HH
H
H
H
H
H H
H
H H
H
H H
H
H H
H
HH
H
H
H
HHHH
HH
H
HH
HH
HH
HH
HH
HH
NN
NN
NN
NN
N
N
N N
N
NN
N
N N
N
N N
N
NN
N
NN
N
N N
N
N
NNNN
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger AacuteAcircEgraveUgraveOcircOacuteEgraveIcircOgraveOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger middotOcircIgravemiddotIcircUacute˘UcircIgravecurrenOacuteˆOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
Εικόνα 316 ∆ευτεροταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων (α) ∆ευτεροταγήςδοmicroή α-έλικας Παρατηρήστε ότι οι δεσmicroοί υδρογόνου σχηmicroατίζονται microετα-ξύ ατόmicroων των πεπτιδικών δεσmicroών χωρίς τη συmicromicroετοχή των οmicroάδων R (β)∆ευτεροταγής δοmicroή β-πτυχωτής επιφάνειας
13 - - - 13 6 - - - (13 317)amp 13 13(domains) - $ 7-
38 Πρωτεΐνες δοmicroές υψηλότερης τάξης και αποδιάταξη
+ - $ - = 13 6 0 - - 13 S $ - - - 13 -
$ 13 - - ( 317)
(ndashSH) 6 amp ndashSH - $ $ amp 6 -6 $ ( 317) $- 6 = - - ( 317 318) - ( - ) (f 55)
A 6 - 13 6 - 7 7 - 13 ( 318) 6 +-
60 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot B
(middot) IOacuteUcircOcirc˘IumlrsaquoOacuteEuml (sbquo) PEgravesbquoOcircOacuteOcirc˘IcircIumlAcirciquestUcircEuml
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot A
-currenIumlEgraveIcircmiddot
-Ugrave˘macrˆUgravelsaquoAcircEgraveEcirciquestOacuteAcircEgravemiddot
Εικόνα 317 Τριτοταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων που υποδεικνύει και τιςθέσεις εντοπισmicroού περιοχών microε δευτεροταγή δοmicroή α-έλικας ή β-πτυχωτήςεπιφάνειας (α) Ινσουλίνη microια πρωτεΐνη που έχει δύο πολυπεπτιδικές αλυ-σίδες (f Τmicroήmicroα 319) παρατηρήστε ότι η αλυσίδα Β περιέχει δοmicroές α-έλικας αλλά και β-πτυχωτής επιφάνειας και ότι οι δισουλφιδικοί δεσmicroοί(κυανό χρώmicroα) συντελούν στον καθορισmicroό της τελικής αναδίπλωσης (τριτο-ταγούς δοmicroής) (β) Ριβονουκλεάση microια microεγάλη πρωτεΐνη microε αρκετές περιο-χές α-έλικας και β-πτυχωτής επιφάνειας
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜ 13
Εικόνα 318 Τεταρτοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης Υπάρχουν δύο είδηπολυπεπτιδίων στην αιmicroοσφαιρίνη αλυσίδες α (κυανό και κόκκινο χρώmicroα)και αλυσίδες β (πορτοκαλί και κίτρινο χρώmicroα) και συνολικά 4 πολυπεπτίδιαστο τελικό πρωτεϊνικό microόριο (εδώ τα laquoαraquo και laquoβraquo αναφέρονται σε ονοmicroασίεςπολυπεπτιδικών αλυσίδων και όχι σε είδη δευτεροταγούς δοmicroής) Η τεταρ-τοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης συmicroβολίζεται ως α2 β2 Οι 4 διακριτές αλυ-σίδες απεικονίζονται microε 4 διαφορετικά χρώmicroατα
6 - ( 6 13) - $ ( van der Waals 13 ) ( - $ )
Aποδιάταξη (microετουσίωση)
0 6 - pH - 13 ( 319) =$ 13 - 6 - ( 313) + $ F $ - - (-) amp $ $ ( 319) S 13 6 13 - ( 1313 ) - - $ 1313-13 13
= $ 7 - 7 13 - 0 20 - 6 - amp - - $ 13
Tα επόmicroενα κεφάλαια
amp - 4
- - 13 - 5 13 13 amp - 4 5 $ 13- (f 12) $ $- 0 $ ( 6)
M 1313 - 3 13
38 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ∆ΟΜΕΣ ΥΨΗΛΟΤΕΡΗΣ ΤΑΞΗΣ ΚΑΙ ΑΠΟ∆ΙΑΤΑΞΗ 61
lozEgravemiddotmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(Ocirc˘Uacutersaquomiddot)
ŒOacuteUgraveOcircOacuteEumlmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(100AEligC)
AOcircIgraveiquestIcircUacute˘OacuteUcircEumlOcirc˘Uacutersaquomiddot˜Oslash OacutecurrenmiddotAcircOacuteAcircUacuteAacuteOcircOcircrsaquoEumlUcircEuml
aeligDaggerIacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜ AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
Εικόνα 319 Aποδιάταξη (microετουσίωση) της πρωτεΐνης ριβονουκλεάση(της οποίας η δοmicroή δίνεται στην Εικόνα 317β) Παρατηρήστε πώς οι έντο-νες συνθήκες αποδιάταξης οδηγούν σε ένα οριστικά κατεστραmicromicroένο microόριο(ως προς τη βιολογική λειτουργία του) λόγω εσφαλmicroένης αναδίπλωσης
amp - $ - $ - - F - 13 7 7 $ 13 $ 13 13 -13
37 και 38 Έλεγχος εννοιών
= 6 - $ 6
( ) ( F- $)
1313 7
13 13amp -
6 - - -
F 13 -6 1313136
F $ 6 $ $ 7
62 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
Eρωτήσεις επανάληψης
- $
7 RNA DNA - amp $ RNA DNA DNA RNA
8 amp F $ R 7 $ 13amp -7
9 $ -$ - (Y13 13 313)
10 Z (13 31) -
1 -13 13 $
2 $
3 13 ((13- 13 31)
4 amp13 $ 13 13 amp 13- -
5 amp -
6 $ - 37
Eρωτήσεις εφαρmicroογής
1 RNA () GUCAAAGAC (13) ACGAUAACC+ RNA - amp
2 () -6 F 13 -$ 13 -6
3 Halobacterium A 13 - (K+) 5 M 5- F K+ - 6 Haloba-cterium F $ 6 Escherichia coli 13-
ΕΡΩΤΗΣΕΙΣ ΕΦΑΡΜΟΓΗΣ 63
K+ $ (-13 $ $- 13 K+
4 6 -- 6 - amp-
5 0 13 13 - - F
13- 13
6 M rsquo F 5 1313 - 13 ( $) laquo- 13raquo 6 6 13
∆εσmicroοί υδρογόνου και άλλες ασθενείς αλληλεπιδράσεις
13 13 13- ( 32) $ $ amp - 0 $ -$
-$ ( 32) 1313 - $ (-) - $ $ $ - $ 5
$- ( 32) - $ $- $ 13 - -
31 ΙΣΧΥΡΟΙ ΚΑΙ ΑΣΘΕΝΕΙΣ ΧΗΜΙΚΟΙ ∆ΕΣΜΟΙ 47
K˘UgraveOcircUcircrsaquoOacuteEuml (middot˙ˆUgraveOcircDaggermacrOcirc˜sbquoiquestUcircEuml UgraveOcirc˘ DNA IcircmiddotEgraveUgraveOcirc˘ RNA)
paraAcircUgraveEgravepermilEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜UacuteˆUgraveAcirc˚OacuteOgraveOacute
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcirclsaquo Uacutersaquo˙middotOtilde˙ˆUgraveOcirccentEgraveOcircIacuteAcircrsaquopermilEgraveOcirc UgraveOcirc˘ iquestOacuteıUacutemiddotIcircmiddot
AIcircAcircUgrave˘IumlcurrenOacuteEgraveOcircAEgraveı˘IumlcurrenOacuteEgraveOcirc
OH
NH2
(CO2) (PO43-)(N2) ndashO
O-
O-P
OUacuteEgraveUcircIgravecurrenOacuteAcirc˜ middotOacutefiUacuteAacutemiddotOacuteAcirc˜ AcircOacuteOgraveUcircAcircEgrave˜ IgraveAcirc permilEgraveIumlfi lsaquo UgraveUacuteEgraveIumlfi permilAcircUcircIgravefi
AEgraveı˘IumlcurrenOacuteEgraveOcirc IgraveEgravemiddot OcircUacuteAacutemiddotOacuteEgraveIcirclsaquo currenOacuteˆUcircEuml IgraveAcirc permilEgraveIumlfi permilAcircUcircIgravefi
AIcircAcircUgrave˘IumlcurrenOacuteEgraveOcirc IgraveEgravemiddot OcircUacuteAacutemiddotOacuteEgraveIcirclsaquo currenOacuteˆUcircEuml IgraveAcirc UgraveUacuteEgraveIumlfi permilAcircUcircIgravefi
H
H
H
H
H H
O O
O
O
O
HH H
H H
H H
HC C C CHHHH C C C C
C
C C C C C C
N N
N
O
N
N
NH2
616
704 955
805
ordmmiddotEgraveOacute˘IumlmiddotIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml(middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteDagger UacuteˆUgraveAcirc˚OacuteOgraveOacute)
OUacuteAacutemiddotOacuteEgraveIcirccurren˜ AcircOacuteOgraveUcircAcircEgrave˜ IgraveAcirc permilEgraveIumlOcircDagger˜ permilAcircUcircIgraveOcircDagger˜
Εικόνα 31 Οmicroοιοπολικοί δεσmicroοί ορισmicroένων βιολογικά σηmicroαντικών microο-ρίων που περιέχουν διπλούς και τριπλούς δεσmicroούς Στις περιπτώσεις του ακε-τυλενίου και του αιθυλενίου δίνεται και η ηλεκτρονιακή στερεοαπεικόνισητων microορίων Η ισχύς ενός δεσmicroού ανά γραmicromicroοmicroόριο (αριθmicroοί microε κόκκινοχρώmicroα) microετράται σε kilojoule (kJ) και αντιστοιχεί στη θερmicroική ενέργεια πουαπαιτείται για τη διάσπαση του δεσmicroού αυτού
N
N
N
NH
H O
N
OH
H
H
N
NH
HK˘UgraveOcircUcircrsaquoOacuteEuml
N
C
C
N
C
C
O
O
H
H
H
O
O
H
C
N
C
C
N
C H
H
OH
H
H
HH
H
H
H
degOcirc˘middotOacutersaquoOacuteEuml
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEumlpound˘IgraversaquoOacuteEuml
H
H
H
H
H
H
H H
H
O
O
O
O
O
O HO
R1
R2
R3
R4
N
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘
N
N
N
N
N
N
N
H
H
H
H
H
O
O
CH3
(middot) NAcircUacutefi
(sbquo) AIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenmiddot UcircAcirc UacuteˆUgraveAcirc˚OacuteEgraveIcirclsaquo middotIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot R AcircrsaquoOacutemiddotEgrave Euml IumlAcirc˘UacuteEgraveIcirclsaquo middotIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot IcirciquestıAcirc middotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenOcirc˜
(Aacute) A˙ˆUgraveOcircDaggermacrAcirc˜ sbquoiquestUcircAcircEgrave˜ UcircUgraveOcirc DNA
Εικόνα 32 ∆εσmicroοί υδρογόνου Στα νουκλεϊκά οξέα οι δεσmicroοί υδρογό-νου συmicroβολίζονται συχνά microε συνεχείς γραmicromicroές αντί για στικτές δύο γραmicromicroέςmicroεταξύ των ζευγών αδενίνηςθυmicroίνης και τρεις γραmicromicroές microεταξύ των ζευγώνγουανίνηςκυτοσίνης (βλ Eικόνα 311)
( 32 ) 0 - 6 13 - - 0 - 13 13- 7- ( 32) 7 $ (32) (13 35 37 38)
13 - 13 van der Waals - $ $ 3-4 angstrom (Aring) = van der Waals
- (f 55) - $ 7 7 $
13 13 1313 gt13 - (13) $ 13 - - - $ 13 - - 7 - van der Waals
48 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
ΠΙΝΑΚΑΣ 31 Λειτουργικές οmicroάδες ιδιαίτερης βιοχηmicroικής σηmicroασίας
Xηmicroική οmicroάδα ∆οmicroήα Bιολογική σπουδαιότητα
Καρβοξυλική Oργανικά οξέα λιπαρά οξέα αmicroινοξέα λιπίδια πρωτεΐνες
Αλδεϋδική Λειτουργική οmicroάδα αναγωγικών σακχάρων πχ γλυκόζης πολυσακχαρίτες
Αλκοολική Λιπίδια υδατάνθρακες
Κετονική Πυροσταφυλικό ενδιάmicroεσα κύκλου του Krebs
Εστερική Λιπίδια σε Βακτήρια και Ευκάρυα σύνδεση των αmicroινοξέων στα tRNA
Φωσφοεστερική Nουκλεϊκά οξέα DNA και RNA
Θειοεστερική Mεταβολισmicroός ενέργειας βιοσύνθεση λιπαρών οξέων
Αιθερική Λιπίδια Αρχαίων σφιγγολιπίδια
Οξεοανυδριτική Mεταβολισmicroός ενέργειας πχ ακετυλο-φωσφορικό
Φωσφοανυδριτική Mεταβολισmicroός ενέργειας πχ ATP
α H απεικόνιση δεσmicroού microε κυmicroατιστή γραmicromicroή (~) υποδηλώνει ότι ο δεσmicroός είναι laquoυψηλής ενέργειαςraquo (f Tmicroήmicroα 58)
| |mdash mdash
||mdash mdash
||
|
mdash mdash
|
|mdash mdash mdash
||mdash
|
|
|
|mdash mdash mdash mdash
||
O
|
|mdash mdash mdashmdash
|
|mdash mdash mdash
|
|mdash
|
|mdash mdash
||
| | ||
|mdash mdash mdash
||mdash ~
~
~
mdash
O
C OH
O
C H
O
C
H
H
C O
O
C
H
H
H
H
C O C
O Ondash
C O O P
Ondash
O
P OndashO C
H
H
C OH
ndashO
Ondash Ondash
O O
O OndashPP
O
C S
$- 13 - $ - 6 - 13
Mοτίβα σύνδεσης στα βιοmicroόρια
(C) - () Oslash - - - 13- 31 13 - 13 13 13 $ 13
31 Έλεγχος εννοιών
$ amp van der Waals 13 13
-
-
32 Γενική θεώρηση των microακροmicroορίων και του νερού ως βιολογικού διαλύτη
amp 13 - 13 Escherichia coli 13 - 13- ( ) ( 32) 96 $ 13 - -
6 ( 32) 6 - () ( 33)
13 RNA DNA $ RNA - 6 ( 32 33)A 13 - 13 (laquoraquo 7) RNA 6 +- RNA - (mRNA) RNA (tRNA) 7 amp RNA DNA 13 13 (32) DNA 1313 - -
13 13 - 13 (-
32 ΓΕΝΙΚΗ ΘΕΩΡΗΣΗ ΤΩΝ ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΩΝ ΚΑΙ ΤΟΥ ΝΕΡΟΥ ΩΣ ΒΙΟΛΟΓΙΚΟΥ ∆ΙΑΛΥΤΗ 49
ΠΙΝΑΚΑΣ 32 Xηmicroική σύνθεση προκαρυωτικού κυττάρουα
Mόριο Ποσοστό () Aριθmicroός microορίων ανάεπί ξηρού κύτταρο (διαφορετικοίβάρουςβ τύποι)
Σύνολο microακροmicroορίων 96 24610000 (~2500)Πρωτεΐνες 55 2350000 (~1850)Πολυσακχαρίτες 5 4300 (2)γ
Λιπίδια 91 22000000 (4)δ
Λιποπολυσακχαρίτες 34 1430000 (1)DNA 31 21 (1)RNA 205 255500 (~660)
Σύνολο microονοmicroερών 30 mdashε (~350)Αmicroινοξέα και 05 mdash (~100)
πρόδροmicroά τουςΣάκχαρα και 2 mdash (~50)
πρόδροmicroά τουςΝουκλεοτίδια και 05 mdash (~200)
πρόδροmicroά τους
Ανόργανα ιόντα 1 mdash (18)
Σύνολο 100 mdash
α ∆εδοmicroένα από Neidhardt F C et al (eds) 1996 Escherichia coli and Sal-monella typhimurium-Cellular and Molecular Biology 2nd edition American So-ciety for Microbiology Washington DCβ Ξηρό βάρος ενός ενεργά αυξανόmicroενου κυττάρου E coli asymp 28 times 10ndash13 g ολι-κό βάρος (70 νερό) = 95 times 10-13 gγ Ως κύριοι πολυσακχαρίτες θεωρούνται οι πεπτιδογλυκάνες και το γλυκογό-νοδ Υπάρχουν διάφοροι τύποι φωσφολιπιδίων κάθε τύπος απαντά σε πολλέςmicroορφές λόγω διαφορών στη σύνθεση των λιπαρών οξέων από είδος σε είδοςκαι λόγω διαφορών στις συνθήκες ανάπτυξηςε ∆έν υπάρχουν αξιόπιστες microετρήσεις για την ποσοστιαία σύσταση σε microονο-microερή και σε ανόργανα ιόντα
33) - - 0 13 - ( ) -
Tο νερό ως βιολογικός διαλύτης
laquo13raquo - 13 O - $ 13 13-
= - 13 0 - 4 $ - - 13 (f 46 47) - - $ (32) 13 - 13 = F - - (13) $ E 13 - $
- F - - - ( 32) - = 13 1313 13 13 ( - F 1degC) $ () 13- 13 - - $
F 13 13
= 13 13 (- - 610 13) A - 13 ( 32)
50 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
(middot) paraUacuteˆUgraveAcirc˝OacuteAcirc˜
(sbquo) NOcirc˘IcircIumlAcirc˚Icirciquest OcircIacutecurrenmiddot
(Aacute) paraOcircIuml˘UcircmiddotIcircmacrmiddotUacutersaquoUgraveAcirc˜
(permil) sectEgraversaquopermilEgravemiddot
AOcircıEumlIcircAcirc˘UgraveEgraveIcirciquestIcircOcircIcircIcircrsaquomiddot
MmiddotUcircUgraversaquoAacuteEgraveOcircMAcircIgravesbquoUacuteiquestOacuteEuml TOcircrsaquomacrˆIgravemiddot
K˘UgraveUgravemiddotUacutefiIumlmiddotUcircIgravemiddot
PEgravesbquoOcircUcircOgraveIgravemiddotUgravemiddotpara˘UacuteEumlOacuteOcircAcircEgravepermilcurren˜
Εικόνα 33 Θέσεις των microακροmicroορίων microέσα στο κύτταρο (α) Πρωτεΐνες(καφέ χρώmicroα) απαντούν σε όλη την έκταση του κυττάρου είτε ως microέρη κυτ-ταρικών δοmicroών είτε ως ένζυmicroα (β) Νουκλεϊκά οξέα DNA (πράσινο χρώmicroα)απαντά στο πυρηνοειδές των προκαρυωτικών κυττάρων και στον πυρήνα τωνευκαρυωτικών κυττάρων RNA (πορτοκαλί χρώmicroα) απαντά στο κυτταρόπλασmicroα(mRNA tRNA) και στα ριβοσώmicroατα (rRNA) (γ) Πολυσακχαρίτες (κίτρινοχρώmicroα) υπάρχουν στο κυτταρικό τοίχωmicroα και ενίοτε σε εσωτερικά αποθη-κευτικά κοκκία (δ) Λιπίδια (κυανό χρώmicroα) απαντούν στην κυτταροπλασmicroατι-κή microεmicroβράνη στο κυτταρικό τοίχωmicroα και σε αποθηκευτικά κοκκία Οχρωmicroατικός κώδικας που χρησιmicroοποιείται εδώ θα εφαρmicroοσθεί για την απει-κόνιση των 4 τύπων microακροmicroορίων σε όλο το βιβλίο Για το DNA βλ επίσηςτη λεζάντα της Εικόνας 311
32 Έλεγχος εννοιών
= - 6 7 $ (DNA RNA) - - 13
RNA - $
+ F 13
I I ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑamp 32 $
33 Πολυσακχαρίτες
13 () $ - 121 - C6H12O6 ( 34)+ 13 - 4 5 6 7 ( C4 C5 C6 C7) amp C5 () 7 $- C6 ($) - - 34 -
$ = 13- 13 (f 48) - ( 35) $ - 1313- 13 (13 36) $ -
O γλυκοζιτικός δεσmicroός
( ) 13 ( 36)0 () - = - - - -
33 ΠΟΛΥΣΑΚΧΑΡΙΤΕΣ 51
MED
IA T
UTO
RIAL
MED
IA T
UTO
RIAL
Mac
rom
olec
ules
centOcircIgraveEgraveIcircfi˜UcircIcircAcircIumlAcircUgravefi˜RNA
centOcircIgraveEgraveIcircfi˜UcircIcircAcircIumlAcircUgravefi˜DNA
paraEumlAacutelsaquoAcircOacutecurrenUacuteAacuteAcircEgravemiddot˜Icirc˘UgraveUgravemiddotUacuteEgraveIcirciquestUgraveOcircEgravemacrOgraveIgravemiddotUgravemiddot
paraEumlAacutelsaquoAcircOacutecurrenUacuteAacuteAcircEgravemiddot˜UcirciquestIcircmacrmiddotUacuteOcircEcircUacuteOcircDaggerUgraveˆOacute
ordmUacuteOcirc˘IcircUgravefi˙Euml
tradeiquestIcircmacrmiddotUacuteOcirc AOacuteOcircEgraveIcircUgravelsaquo middotIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot centmiddotIcircUgraveDaggerIumlEgraveOcirc˜ PfiIumlOcirc˜
1
23
4
5
PEgravesbquofi˙Euml
paraAcircOacuteUgravefi˙Acirc˜
centAcircOcircIacute˘UacuteEgravesbquofi˙Euml
degIuml˘Icircfi˙Euml
EIacutefi˙Acirc˜
H
H
H
H
HH H
H
H
H H
H
H
HH
H
HH
H
H
H
H
H HH
H
H
H
H
H
H
H
HH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OHOH
OH
C
C
C
C
C
C C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C C
C
C
C C
C
C
C
C C
C
C
C
C
C
OO
O
O
O O
OO
CH2OH
HOCH2
HOCH2
HOCH2
HOCH2
CH2OH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
HO
HO
HO
1
23
4
51
2
3
4
5
1
2
3
4
5
1
2
3
4
5
6
1
2
3
4
5
6
1
23
4
5
6
5
6
4 3
2
1
Εικόνα 34 Συντακτικοί τύποι ορισmicroένων κοινών σακχάρων Τα σάκχα-ρα αναπαρίστανται microε δύο εναλλακτικούς τρόπους ανοικτής αλυσίδας καιδακτυλίου Η microορφή της ανοικτής αλυσίδας είναι περισσότερο ευανάγνωστηαλλά συνηθέστερα χρησιmicroοποιείται η microορφή του δακτυλίου Σηmicroειώστε τοντρόπο αρίθmicroησης των θέσεων του δακτυλίου
TOcirc iquestUgraveOcircIgraveOcirc NmiddotOacuteUgraveEgraveIcircmiddotıEgraveUcircUgraveiquest currenOacutemiddotiquestUgraveOcircIgraveOcirc O UgraveOcirc˘ UcircmiddotIcircmacriquestUacuteOcirc˘
AIcircAcircUgrave˘IumlOcircIgraveiquestpermilmiddotHC
O
CH N
H
C
O
CH3
C HHO
C OHH
C OHH
CH2OH
CH2OH
O
HHOH
H
HO
H NH
C O
CH3
OH2
1
3
4
5
6
1
23
4
5
6
Εικόνα 35 Ν-ακετυλογλυκοζαmicroίνη ένα παράγωγο σακχάρου
- - - ( 36) 13 - $ 1 4 - ( Oslash - 36) - 13 amp -14 (36) - - - - (- -) $ 6 13 amp - 13 -- - $ 13 - $ - Gram 13- - ( 49)
33 Έλεγχος εννοιών
$ - - (- -) - 6
- - 100
34 Λιπίδια
-13 amp 13 (f 45) $ - 13 ( 37) $ 16 15 - ( ) 13$ L
52 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
O
CH2OH
H
H
OH
OH
H
H
HO
H
O
CH2OH
H
OHH
OH
OH
H
HH
O
OtildeIgrave˘IumlOcirc
degIuml˘IcircOcircAacutefiOacuteOcirc
K˘UgraveUgravemiddotUacutersaquoOacuteEuml
(sbquo)
(middot)
O
CH2OH
H
H
OH
OH
H
H
HO
H
OH
O
CH2
H
H
OH
OH
H
HH
O
HO
O
CH2OH
HH
OH
OH
H
H
HO
HOH
O
CH2OH
HH
OH
OH
H
HH
O
middot-14-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
middot-16-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
sbquo-14-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-14
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-16
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo sbquo-14
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-14
1
23
4
5
6
1
23
4
5
6
1
23
4
5
6
Εικόνα 36 Πολυσακχαρίτες (α) ∆οmicroές διαφόρων γλυκοζιτικών δεσmicroώνΣηmicroειώστε ότι microπορεί να ποικίλλουν τόσο η σύνδεση όσο και η γεωmicroετρία (α-ή β-) του δεσmicroού (β) ∆οmicroές ορισmicroένων κοινών πολυσακχαριτών Συγκρίνετετον χρωmicroατικό κώδικα microε το (α)
$ 14 20 ( 37)
Tριγλυκερίδια και σύνθετα λιπίδια
() $ 13 ( 37)
13 $
- ( 37) $$13 - 13 13 (f 45)
13 13 13- $ ()13 13 (f 45) - 13 -13 $
34 Έλεγχος εννοιών
13 - 13
$ 13
13 13 $
$ 4 (C4)
35 Nουκλεϊκά οξέα
7 $ $137 (DNA) 137 (RNA) 13 -13 DNA - RNA - - $ 6 M - 5 13 ( RNA)
35 ΝΟΥΚΛΕΪΚΑ ΟΞΕΑ 53
MOcircOacuteOcircAacutemiddotIumlmiddotIcircUgraveOcirc˙˘IumlOcircpermilEgraveAacuteIuml˘IcircAcircUacutersaquopermilEgraveOcirc(currenOacutemiddot AacuteIuml˘IcircOcircIumlEgraversaquopermilEgraveOcirc)
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot Ucirc˘OacutepermilAcircpermilAcircIgravecurrenOacutemiddot IgraveAcirc AacuteIuml˘IcircAcircUacutefiIumlEumlIgravecurrenUcircˆ AcircUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircOcircDagger permilAcircUcircIgraveOcircDagger
OH
OH
OH
H3CKOcircUacuteAcircUcircIgravecurrenOacuteOcirc C16 (middotIumlIgraveEgraveUgraveEgraveIcircfi)
MOcircOacuteOcircmiddotIcircfiUacuteAcircUcircUgraveOcirc C16 (middotIumlIgraveEgraveUgraveAcircIumlmiddot˚Icircfi)
C OH
O
CH3 C OH
O
H3CC O
O
H3CC O
OC
C
H
H
H
O C H
H
O
CH2OH
degmiddotIumlmiddotIcircUgravefi˙Euml
H3CC O
O
H3CC O
OC
C
H
H
H
P O
O
C H
H
ndashO
O
CH2
CH2+NH3
AEgraveımiddotOacuteOcircIumlmiddotIgraversaquoOacuteEuml
H3CC O
O
C H
H3CC O
O
C H
H3CC O
O
C H
H
H
KOcircEgraveOacuteiquest IumlEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
tradeDaggerOacuteıAcircUgraveOcirc IumlEgraversaquopermilEgraveOcirc
AIumliquest IumlEgraversaquopermilEgravemiddot (UgraveUacuteEgraveAacuteIuml˘IcircAcircUacutersaquopermilEgravemiddot)
tradeDaggerOacuteıAcircUgraveOcirc IumlEgraversaquopermilEgraveOcircordmˆUcircEcircmiddotUgraveEgravepermil˘IumlOcircmiddotEgraveımiddotOacuteOcircIumlmiddotIgraversaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot EcircˆUcircEcircOcircIumlEgraversaquopermilEgraveOcirc)
degIuml˘IcircAcircUacutefiIumlEuml
12
3546
78
910
1112
1314
1516
23
4
5
6
1
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
EUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi
Εικόνα 37 Λιπαρά οξέα απλά λιπίδια (λίπη) και σύνθετα λιπίδια Απλάλιπίδια σχηmicroατίζονται microε microια αντίδραση αφυδάτωσης microεταξύ λιπαρών οξέωνκαι γλυκερόλης η οποία δηmicroιουργεί εστερικό δεσmicroό
$13 ( DNA) 13 PO4
3ndash = - DNA RNA - 38
Nουκλεοτίδια
13 7 $ - 13 13 (
) 13 - $ ( 39) = DNA RNA = ( $-) DNA RNA 13 () -$ C-1 N 13 13 1 ( ) 9 ( -) amp - 13 - ( 310)
13 7 $ 5 ATP ( ) ( 310) -
54 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi P
O
Ondash
OndashO
C C
O BiquestUcircEuml
OH
H HHH C
OH PEgravesbquofi˙Euml
5atilde
4atilde
3atilde 2atilde1atilde
C
CH2
Εικόνα 38 Νουκλεοτίδια Εδώ απεικονίζεται ένα ριβονουκλεοτίδιο πουαπαντά στο RNA Τα δεοξυριβονουκλεοτίδια που απαντούν στο DNA έχουνστον άνθρακα 2rsquo ένα άτοmicroο H αντί της οmicroάδας ndashOH Η αρίθmicroηση των θέσε-ων του σακχάρου γίνεται microε τονούmicroενους αριθmicroούς για να διακρίνεται από τηναρίθmicroηση των θέσεων του δακτυλίου της αζωτούχου βάσης οι οποίες επί-σης αριθmicroούνται (1 2 3 κλπ) (βλ Εικόνα 39) Τόσο τα δεοξυριβονου-κλεοτίδια όσο και τα ριβονουκλεοτίδια περιέχουν microια 5rsquo-φωσφορική οmicroάδα
N
N
N
N
1
234
56
78
9
N
N
N
N
NH2
N
N
N
NH
NH2
O
N
N
3
216
54
N
NH
O
O
H3C
NH
O
NH2
K˘UgraveOcircUcircrsaquoOacuteEuml (C)
pound˘IgraversaquoOacuteEuml (T)
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEuml (A)
degOcirc˘middotOacutersaquoOacuteEuml (G)
DNA RNA
BiquestUcircAcircEgrave˜ ˘UacuteEgraveIgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml˜ BiquestUcircAcircEgrave˜ Ocirc˘UacutersaquoOacuteEuml˜
H
N
DNA RNA
MfiOacuteOcircDNA
Εικόνα 39 ∆οmicroές των βάσεων του DNA και του RNA ∆εν παρατίθεταιστην εικόνα η ουρακίλη (U) της οποίας η δοmicroή είναι όmicroοια microε της θυmicroίνηςmicroε τη microόνη διαφορά ότι στερείται της microεθυλοmicroάδας στον C-5 Παρατηρήστετο σύστηmicroα αρίθmicroησης των δακτυλίων Κατά την ένωση τους microε τον άνθρα-κα 1rsquo του φωσφοσακχάρου για τον σχηmicroατισmicroό νουκλεοτιδίου (Εικόνα 38)οι βάσεις πυριmicroιδίνης συνδέονται microέσω του N-1 του δακτυλίου και οι βάσειςπουρίνης microέσω του N-9
TUacuteEgraveEcircˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcirclsaquo middotpermilAcircOacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot OacuteOcirc˘IcircIumlAcircOcircUgraversaquopermilEgraveOcirc)
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi˜AcircUcircUgravecurrenUacutemiddot˜
N-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
OHOCH2 OH
HH
H
H
OHOH
PEgravesbquofi˙Euml
N N
NN
NH2
+
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEuml
OHOCH2
OHOH
N N
NN
NH2
ApermilAcircOacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot˜ OacuteOcirc˘IcircIumlAcircOcirc˙rsaquoUgraveEuml˜)
3 PO43ndash
OCH2
OHOH
N N
NN
NH2
OPOPOPndashO
O
Ondash
O
Ondash
O
Ondash
ordmˆUcircEcircOcirc-middotOacute˘permilUacutersaquoUgraveEuml˜
H H
H
H
H
H
H H H
~ ~65
4 32
178
9
65
4 32
178
9
65
4 32
178
9
Eικόνα 310 Συστατικά ενός σηmicroαντικού νουκλεοτιδίου της τριφω-σφορικής αδενοσίνης Η ενέργεια υδρόλυσης του φωσφοανυδριτικού δεσmicroού(κυmicroατιστές παύλες) είναι microεγαλύτερη από αυτήν του φωσφορικού εστέραγεγονός που η σηmicroασία του θα γίνει αντιληπτή στο Κεφάλαιο 5 (f Tmicroήmicroα58)
- - - (f 58) L - $- (f 57) 13 (f
515) 13 $ - 7 $ $ -
Nουκλεϊκά οξέα
Q 7 $ - - ( 311)
$ - 3 ( 3acute) 5 (5acute) (- 311) = F $$13
= DNA RNA - 0 13 DNA RNA - 0 - (f 7) DNA - RNA
35 ΝΟΥΚΛΕΪΚΑ ΟΞΕΑ 55
paraAcircUacuteEgraveOcircmacrlsaquo UcircDagger˙Acirc˘IacuteEuml˜Ucirc˘IgraveIumlEumlUacuteˆIgravemiddotUgraveEgraveIcircOgraveOacutesbquoiquestUcircAcircˆOacute
A˙ˆUgraveOcircDaggermacrOcirc˜ sbquoiquestUcircEumlUcirc˘OacutepermilAcircpermilAcircIgravecurrenOacuteEuml UcircUgraveEuml ıcurrenUcircEuml 1atilde
H H
H2C BiquestUcircEumlO
O3atilde
1atilde
2atilde
5atilde
5atilde
5atilde
5 3
3atilde
3atilde
3atilde
3atilde 5atilde
P OndashO
H H H
H
H
H2C BiquestUcircEumlO
O
O
H H H
H
H
O
O
(i)
(ii)
poundcurrenUcircEuml 5atilde
P OndashO
O
P OndashO
O
centAcircOcircIacute˘UacuteEgravesbquofi˙Euml
paraUacuteˆUgraveOcircUgravemiddotAacutelsaquo˜permilOcircIgravelsaquo
centAcirc˘UgraveAcircUacuteOcircUgravemiddotAacutelsaquo˜permilOcircIgravelsaquo
poundcurrenUcircEuml 3atilde
(middot)
(sbquo)
A
C G
G C
C G
C G
A U
(Aacute)
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi
A GG CC T T A
T CC GG A A T
C C A U C GA CG U G A
C C U C G GC GG A C A
C
BiquestUcircEumlH2C
5atilde
4atilde
H
HcentAcircUcircIgraveOcircrsaquo˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘
ordmˆUcircEcircOcircpermilEgraveAcircUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 311 DNA και RNA (α) ∆οmicroή microέρους microιας αλυσίδας DNA Οι αζωτούχες βάσεις microπορεί να είναι αδενίνη γουανίνη κυτοσίνη ή θυmicroίνη Στο RNAυπάρχει microια οmicroάδα ndashOH στον άνθρακα 2rsquo της πεντόζης (βλ Εικόνα 38) και ουρακίλη αντί της θυmicroίνης (β) Απλουστευmicroένο σχήmicroα της δοmicroής του DNA όπουαπεικονίζονται microόνον οι αζωτούχες βάσεις Παρατηρήστε ότι οι δύο αλυσίδες (κλώνοι DNA) είναι συmicroπληρωmicroατικές ως προς την ακολουθία βάσεων (A=T GintC)και συνδέονται microε δεσmicroούς υδρογόνου που σχηmicroατίζονται microεταξύ αυτών των βάσεων Οι δύο κλώνοι DNA απεικονίζονται microε πράσινο χρώmicroα σε δύο διαφορετι-κούς τόνους σκίασης χρωmicroατική σύmicroβαση που εφαρmicroόζεται σε όλο το βιβλίο (γ) RNA (i) πρωτοταγής δοmicroή (ii) πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή Στο RNAσχηmicroατίζονται δευτεροταγείς δοmicroές όταν παρουσιάζονται δυνατότητες για ενδοmicroοριακή ζεύξη βάσεων δηλ για ζεύξη βάσεων της ίδιας αλυσίδας Σε ορισmicroέναπολύ microεγάλα microόρια RNA όπως πχ στο ριβοσωmicroατικό RNA (f Τmicroήmicroατα 715 και 114) άλλες περιοχές του microορίου έχουν microόνο πρωτοταγή δοmicroή και άλλεςτόσο πρωτοταγή όσο και δευτεροταγή δοmicroή Αυτό οδηγεί σε microόρια microε τελικό τριδιάστατο σχήmicroα που είναι καθοριστικό για τη λειτουργία τους και εmicroπεριέχειεκτενείς περιελίξεις ή συσπειρώσεις (f Εικόνα 118γ) Το RNA απεικονίζεται microε πορτοκαλί χρώmicroα χρωmicroατική σύmicroβαση που διατηρείται σε όλο το βιβλίο
$ 1313 -
DNA
DNA DNA - $ -$ (13 32) - - $ (G) (C) $ (A) (T) (13 32) $ $ 13 A T G C DNA - 13 0 G - C T A ( 311)
RNA
$ 137$ S RNA $ 13 - amp 13 - RNA 1313 ( 311)
RNA 13 $ RNA (messenger RNAmRNA) DNA 13- DNA $ RNA (transfer RNA tRNA) - 7 -- -$ 7 - RNA (ribosomal RNA rRNA) 13 7 0 RNA $ - 7 11
35 Έλεγχος εννοιών
7 $ - 13 - RNA DNA RNA
-
13 $ 1313
RNA
36 Tα αmicroινοξέα και ο πεπτιδικός δεσmicroός
$ 7- $ - $ 21 $ 0 $ - (ndashCOOH) (ndashNH2) (- 31 312) amp - $ 13-$ $ - $ ( ) -13 13 - 6 ( 313)
0 $ - 312 ( ROslash 312) - -- 13$13 13 13$ ( ) ( $ ) (- 312) $ 13 - $ - laquoraquo$ 312 = - - 13$ $ $ $ $ L $ 13 - $ = 6 - (ndashSH) -$ - (RndashSndashSndashR) F - $ $ 7 - 13
Iσοmicroερή
amp
56 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
$ Louis Pasteur 13 -F (f 15) 13 = Pasteur F $ ( 314) $ 13 - ( $ )
- (f 48) X laquo- raquo $ - D
L ( 315) 13 - Dndash
$ D L 0 - 6 $ Lndash$ Dndash (- 315) Dndash$ - (f 48) 13 (f 209) Dndash$ Lndash Lndash Dndash
36 ΤΑ ΑΜΙΝΟΞΕΑ ΚΑΙ Ο ΠΕΠΤΙ∆ΙΚΟΣ ∆ΕΣΜΟΣ 57
H
CH3
CHCH3
CH3
CH2CHCH3
CH3
CHCH3
CH2CH3
CH2OHCHCH3
OH
CH2
O-O
CH2C
O
NH2
CH2C
O-O CH2
CH2C
O
CH2NH2
CH2HS
CH2S CH2CH3
CH2
CH2HO
CH2
NH
CH2CH2CH2CH2+NH3
CH2CH2CH2+NH2 N
HC
NH2CH2
HN
+HN
N
CH2H2C
H2C CH COOndash
Gly degIuml˘IcircrsaquoOacuteEuml (G)
Ala AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (A)
Val BmiddotIumlrsaquoOacuteEuml (V)
Leu sectAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (L)
Ile IUcircOcircIumlAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (I)
Ser tradeAcircUacutersaquoOacuteEuml (S)Thr poundUacuteAcircOcircOacutersaquoOacuteEuml (T)
Asp AUcircmiddotUacuteUgraveEgraveIcircfi (D)
Asn AUcircmiddotUacutemiddotAacutersaquoOacuteEuml (N)
Glu degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraveEgraveIcircfi (E)
Gln degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraversaquoOacuteEuml (Q)
Cys K˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (C)
CH2HSe Sec tradeAcircIumlEumlOacuteOcircIcirc˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (U)
Met MAcircıAcircEgraveOcircOacutersaquoOacuteEuml (M)
Phe ordmmiddotEgraveOacute˘IumlmiddotIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (F)
Tyr T˘UacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (Y)
Trp TUacute˘UgraveOcircEcirciquestOacuteEuml (W)
Lys sect˘UcircrsaquoOacuteEuml (K)
Arg AUacuteAacuteEgraveOacutersaquoOacuteEuml (R)
His IUcircUgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml (H)
Pro
centOcircIgravelsaquo UgraveˆOacute middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteEgraveIcircOgraveOacute OcircIgraveiquestpermilˆOacute
OHC
O
CR
H
NH2
AIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot
degAcircOacuteEgraveIcirclsaquo permilOcircIgravelsaquo AcircOacutefi˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenOcirc˜
(tradeEumlIgraveAcircrsaquoˆUcircEuml tradeUgraveEumlOacute AcircUacutersaquoUgraveˆUcircEuml UgraveEuml˜ UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml˜ middotAcircEgraveIcircOcircOacutersaquo˙AcircUgravemiddotEgrave OcircIumlfiIcircIumlEumlUacuteEuml Euml permilOcircIgravelsaquo fimacrEgrave IgravefiOacuteOcircOacute Euml OcircIgraveiquestpermilmiddot R H UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml permilAcircOacute AcircrsaquoOacutemiddotEgrave middotIcircUacuteEgravesbquoOgrave˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteDagger permilEgravefiUgraveEgrave UcircUgraveAcircUacuteAcircrsaquoUgravemiddotEgrave AcircIumlAcircDaggerıAcircUacuteEuml˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot˜)
H IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-fiIacuteEgraveOacuteOcirc
MEuml OcircIumlEgraveIcircfi(˘permilUacutefiEcircOcircsbquoOcirc)
C
KIumlAcircrsaquopermilmiddot
-iquestOacuteıUacutemiddotIcircmiddot˜
KmiddotUacutesbquoOcircIacute˘IumlOcircIgraveiquestpermilmiddot
paraUacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml (P)
IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-middotIumlIcircmiddotIumlEgraveIcircfi
paraOcircIumlEgraveIcircfi IgraveEuml EgraveOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc Εικόνα 312 Συντακτικοί τύποι των 21 κοινών αmicroινοξέων Αριστερά απότο όνοmicroα κάθε αmicroινοξέος δίνεται η τριγράmicromicroατη συντοmicroογραφία του και δεξιά(σε παρένθεση) η microονογράmicromicroατη συντοmicroογραφία του
H2N C C
H O
OH NH
C C
H
R2
O
OH+ H
H2O
H2N C C
H
R1
O
N C C
H
R2
O
OH
R1
H
paraAcircUgraveEgravepermilEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 313 Σχηmicroατισmicroός πεπτιδικού δεσmicroού R1 και R2 αναφέρονταιστο microεταβλητό microέρος των αmicroινοξέων (πλευρική αλυσίδα) (βλ Εικόνα 312)
(Lndash Dndash$) 13- (Dndash Lndash$)
36 Έλεγχος εννοιών
21 $ - $ 13 13 $ ( ) -6
$ - $
$ -
- $ 13 - $ -
37 Πρωτεΐνες πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή
6 - - 6 () 6
13 - (f 5 17) 6 13 - - - 6 = 7 - -
Πρωτοταγής δοmicroή
6 $ $ (-
58 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
T T
P
M M
Pbatilde b
h
n n
h
(middot) (sbquo)
Εικόνα 314 Σχεδιαγράmicromicroατα κρυστάλλων τρυγικού οξέος (C4H6O6) διάχειρός Louis Pasteur από το περίφηmicroο άρθρο του περί οπτικής ενεργότητας(α) Αριστεροχειρικός κρύσταλλος (microορφή L) (β) ∆εξιοχειρικός κρύσταλλος(microορφή D) Οι δύο κρύσταλλοι είναι κατοπτρικά είδωλα ο ένας του άλλου(δηλ εναντιοmicroερή) Τα γράmicromicroατα πάνω στις έδρες των κρυστάλλων υποδη-λώνουν τα ζεύγη εναντιοmicroερών εδρών κατά τον συmicroβολισmicroό του PasteurΓια να αναδειχθεί σαφέστερα η εναντιοmicroέρεια των κρυστάλλων έχει χρησι-microοποιηθεί έγχρωmicroη σκίαση
(sbquo)
NH2H2N
COOH
C HH2N
CH3
COO
CH
CH3
ErsaquoAcircpermilEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
COOH
C NH2
CH3
COOH
CH
CH3
H
L-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml D-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml
(Aacute)
HO
HO
HO
OH
HHO
C OHH
OH
CH2OH
O
C H
CH
H
H
CH2OH
D-degIuml˘Icircfi˙Euml L-degIuml˘Icircfi˙Euml
CO
OH
(middot)
H
CH
C
CH
HC
C
C
tradeUgraveEumlOacute UgraveUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEuml UacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo UgraveOcirc IgraveAcircOacute sbquocurrenIumlOcirc˜ ımiddot UacutecurrenAcircEgrave Oacutemiddot ıAcircˆUacuteEumlıAcircrsaquo fiUgraveEgrave IcircmiddotUgraveAcirc˘ıDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave UacuteOcirc˜ UgraveOcircOacute middotUacutemiddotUgraveEumlUacuteEumlUgravelsaquo Euml permilAcirc permilEgravemiddotIcircAcircIcircOcircIgraveIgravecurrenOacuteEuml AacuteUacutemiddotIgraveIgravelsaquo fiUgraveEgrave middotOcircIgravemiddotIcircUacuteDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave middotfi middot˘UgravefiOacute
bC C
a
c c
a
d db
TUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
Εικόνα 315 Ισοmicroερή (α) Υπόδειγmicroα ζεύγους κατοπτρικών ειδώλων(β) Εναντιοmicroερή γλυκόζης (γ) Εναντιοmicroερή του αmicroινοξέος αλανίνη Παρατη-ρήστε ότι όπως και να περιστραφούν οι τριδιάστατες προβολές των microορίωνοι δύο microορφές L και D είναι αδύνατον να συmicroπέσουν
313) $ $ - 13 $ 13 0 $ - $ 13 6 - $ 6 6 6 15 $ 6 10000 -$ 6 $ 7 ( )
= $ - 13 = - 13 13 + - 13 13
∆ευτεροταγής δοmicroή
= $ R $ 13 13 6( 316) ( 31) - 6 M - - - 7 - (316) gt $ $ = ( - ) - - ( 316)
M - 1313 - $ (- 316)
- - - -
37 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ΠΡΩΤΟΤΑΓΗΣ ΚΑΙ ∆ΕΥΤΕΡΟΤΑΓΗΣ ∆ΟΜΗ 59
(middot)
(sbquo)
CC C
C
CC
C C
C
C
C
C
CCC
C C C
C
C
CC C
CC C
C
C
C
CC
CC
C
CC CC
C C
CC
C
C
C C
CC C
CC
C
CC
C C
CC
CCCC
C C
CC CC
C C
C
O
O
O O O
O
O
O O O
O
O O
O
O O
O
OO
O
OO
O
O O
O
O
O O
O
O O
OO
OO
RR
R R
R
RR R R
R R R
RRR
R R R
RRR
R R R
R R R
RR
RR
RR
R
R
H
HH
HH
HHH H
H
H HH
H
H
H
H
H H
H
H H
H
H H
H
H H
H
HH
H
H
H
HHHH
HH
H
HH
HH
HH
HH
HH
HH
NN
NN
NN
NN
N
N
N N
N
NN
N
N N
N
N N
N
NN
N
NN
N
N N
N
N
NNNN
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger AacuteAcircEgraveUgraveOcircOacuteEgraveIcircOgraveOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger middotOcircIgravemiddotIcircUacute˘UcircIgravecurrenOacuteˆOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
Εικόνα 316 ∆ευτεροταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων (α) ∆ευτεροταγήςδοmicroή α-έλικας Παρατηρήστε ότι οι δεσmicroοί υδρογόνου σχηmicroατίζονται microετα-ξύ ατόmicroων των πεπτιδικών δεσmicroών χωρίς τη συmicromicroετοχή των οmicroάδων R (β)∆ευτεροταγής δοmicroή β-πτυχωτής επιφάνειας
13 - - - 13 6 - - - (13 317)amp 13 13(domains) - $ 7-
38 Πρωτεΐνες δοmicroές υψηλότερης τάξης και αποδιάταξη
+ - $ - = 13 6 0 - - 13 S $ - - - 13 -
$ 13 - - ( 317)
(ndashSH) 6 amp ndashSH - $ $ amp 6 -6 $ ( 317) $- 6 = - - ( 317 318) - ( - ) (f 55)
A 6 - 13 6 - 7 7 - 13 ( 318) 6 +-
60 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot B
(middot) IOacuteUcircOcirc˘IumlrsaquoOacuteEuml (sbquo) PEgravesbquoOcircOacuteOcirc˘IcircIumlAcirciquestUcircEuml
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot A
-currenIumlEgraveIcircmiddot
-Ugrave˘macrˆUgravelsaquoAcircEgraveEcirciquestOacuteAcircEgravemiddot
Εικόνα 317 Τριτοταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων που υποδεικνύει και τιςθέσεις εντοπισmicroού περιοχών microε δευτεροταγή δοmicroή α-έλικας ή β-πτυχωτήςεπιφάνειας (α) Ινσουλίνη microια πρωτεΐνη που έχει δύο πολυπεπτιδικές αλυ-σίδες (f Τmicroήmicroα 319) παρατηρήστε ότι η αλυσίδα Β περιέχει δοmicroές α-έλικας αλλά και β-πτυχωτής επιφάνειας και ότι οι δισουλφιδικοί δεσmicroοί(κυανό χρώmicroα) συντελούν στον καθορισmicroό της τελικής αναδίπλωσης (τριτο-ταγούς δοmicroής) (β) Ριβονουκλεάση microια microεγάλη πρωτεΐνη microε αρκετές περιο-χές α-έλικας και β-πτυχωτής επιφάνειας
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜ 13
Εικόνα 318 Τεταρτοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης Υπάρχουν δύο είδηπολυπεπτιδίων στην αιmicroοσφαιρίνη αλυσίδες α (κυανό και κόκκινο χρώmicroα)και αλυσίδες β (πορτοκαλί και κίτρινο χρώmicroα) και συνολικά 4 πολυπεπτίδιαστο τελικό πρωτεϊνικό microόριο (εδώ τα laquoαraquo και laquoβraquo αναφέρονται σε ονοmicroασίεςπολυπεπτιδικών αλυσίδων και όχι σε είδη δευτεροταγούς δοmicroής) Η τεταρ-τοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης συmicroβολίζεται ως α2 β2 Οι 4 διακριτές αλυ-σίδες απεικονίζονται microε 4 διαφορετικά χρώmicroατα
6 - ( 6 13) - $ ( van der Waals 13 ) ( - $ )
Aποδιάταξη (microετουσίωση)
0 6 - pH - 13 ( 319) =$ 13 - 6 - ( 313) + $ F $ - - (-) amp $ $ ( 319) S 13 6 13 - ( 1313 ) - - $ 1313-13 13
= $ 7 - 7 13 - 0 20 - 6 - amp - - $ 13
Tα επόmicroενα κεφάλαια
amp - 4
- - 13 - 5 13 13 amp - 4 5 $ 13- (f 12) $ $- 0 $ ( 6)
M 1313 - 3 13
38 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ∆ΟΜΕΣ ΥΨΗΛΟΤΕΡΗΣ ΤΑΞΗΣ ΚΑΙ ΑΠΟ∆ΙΑΤΑΞΗ 61
lozEgravemiddotmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(Ocirc˘Uacutersaquomiddot)
ŒOacuteUgraveOcircOacuteEumlmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(100AEligC)
AOcircIgraveiquestIcircUacute˘OacuteUcircEumlOcirc˘Uacutersaquomiddot˜Oslash OacutecurrenmiddotAcircOacuteAcircUacuteAacuteOcircOcircrsaquoEumlUcircEuml
aeligDaggerIacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜ AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
Εικόνα 319 Aποδιάταξη (microετουσίωση) της πρωτεΐνης ριβονουκλεάση(της οποίας η δοmicroή δίνεται στην Εικόνα 317β) Παρατηρήστε πώς οι έντο-νες συνθήκες αποδιάταξης οδηγούν σε ένα οριστικά κατεστραmicromicroένο microόριο(ως προς τη βιολογική λειτουργία του) λόγω εσφαλmicroένης αναδίπλωσης
amp - $ - $ - - F - 13 7 7 $ 13 $ 13 13 -13
37 και 38 Έλεγχος εννοιών
= 6 - $ 6
( ) ( F- $)
1313 7
13 13amp -
6 - - -
F 13 -6 1313136
F $ 6 $ $ 7
62 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
Eρωτήσεις επανάληψης
- $
7 RNA DNA - amp $ RNA DNA DNA RNA
8 amp F $ R 7 $ 13amp -7
9 $ -$ - (Y13 13 313)
10 Z (13 31) -
1 -13 13 $
2 $
3 13 ((13- 13 31)
4 amp13 $ 13 13 amp 13- -
5 amp -
6 $ - 37
Eρωτήσεις εφαρmicroογής
1 RNA () GUCAAAGAC (13) ACGAUAACC+ RNA - amp
2 () -6 F 13 -$ 13 -6
3 Halobacterium A 13 - (K+) 5 M 5- F K+ - 6 Haloba-cterium F $ 6 Escherichia coli 13-
ΕΡΩΤΗΣΕΙΣ ΕΦΑΡΜΟΓΗΣ 63
K+ $ (-13 $ $- 13 K+
4 6 -- 6 - amp-
5 0 13 13 - - F
13- 13
6 M rsquo F 5 1313 - 13 ( $) laquo- 13raquo 6 6 13
( 32 ) 0 - 6 13 - - 0 - 13 13- 7- ( 32) 7 $ (32) (13 35 37 38)
13 - 13 van der Waals - $ $ 3-4 angstrom (Aring) = van der Waals
- (f 55) - $ 7 7 $
13 13 1313 gt13 - (13) $ 13 - - - $ 13 - - 7 - van der Waals
48 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
ΠΙΝΑΚΑΣ 31 Λειτουργικές οmicroάδες ιδιαίτερης βιοχηmicroικής σηmicroασίας
Xηmicroική οmicroάδα ∆οmicroήα Bιολογική σπουδαιότητα
Καρβοξυλική Oργανικά οξέα λιπαρά οξέα αmicroινοξέα λιπίδια πρωτεΐνες
Αλδεϋδική Λειτουργική οmicroάδα αναγωγικών σακχάρων πχ γλυκόζης πολυσακχαρίτες
Αλκοολική Λιπίδια υδατάνθρακες
Κετονική Πυροσταφυλικό ενδιάmicroεσα κύκλου του Krebs
Εστερική Λιπίδια σε Βακτήρια και Ευκάρυα σύνδεση των αmicroινοξέων στα tRNA
Φωσφοεστερική Nουκλεϊκά οξέα DNA και RNA
Θειοεστερική Mεταβολισmicroός ενέργειας βιοσύνθεση λιπαρών οξέων
Αιθερική Λιπίδια Αρχαίων σφιγγολιπίδια
Οξεοανυδριτική Mεταβολισmicroός ενέργειας πχ ακετυλο-φωσφορικό
Φωσφοανυδριτική Mεταβολισmicroός ενέργειας πχ ATP
α H απεικόνιση δεσmicroού microε κυmicroατιστή γραmicromicroή (~) υποδηλώνει ότι ο δεσmicroός είναι laquoυψηλής ενέργειαςraquo (f Tmicroήmicroα 58)
| |mdash mdash
||mdash mdash
||
|
mdash mdash
|
|mdash mdash mdash
||mdash
|
|
|
|mdash mdash mdash mdash
||
O
|
|mdash mdash mdashmdash
|
|mdash mdash mdash
|
|mdash
|
|mdash mdash
||
| | ||
|mdash mdash mdash
||mdash ~
~
~
mdash
O
C OH
O
C H
O
C
H
H
C O
O
C
H
H
H
H
C O C
O Ondash
C O O P
Ondash
O
P OndashO C
H
H
C OH
ndashO
Ondash Ondash
O O
O OndashPP
O
C S
$- 13 - $ - 6 - 13
Mοτίβα σύνδεσης στα βιοmicroόρια
(C) - () Oslash - - - 13- 31 13 - 13 13 13 $ 13
31 Έλεγχος εννοιών
$ amp van der Waals 13 13
-
-
32 Γενική θεώρηση των microακροmicroορίων και του νερού ως βιολογικού διαλύτη
amp 13 - 13 Escherichia coli 13 - 13- ( ) ( 32) 96 $ 13 - -
6 ( 32) 6 - () ( 33)
13 RNA DNA $ RNA - 6 ( 32 33)A 13 - 13 (laquoraquo 7) RNA 6 +- RNA - (mRNA) RNA (tRNA) 7 amp RNA DNA 13 13 (32) DNA 1313 - -
13 13 - 13 (-
32 ΓΕΝΙΚΗ ΘΕΩΡΗΣΗ ΤΩΝ ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΩΝ ΚΑΙ ΤΟΥ ΝΕΡΟΥ ΩΣ ΒΙΟΛΟΓΙΚΟΥ ∆ΙΑΛΥΤΗ 49
ΠΙΝΑΚΑΣ 32 Xηmicroική σύνθεση προκαρυωτικού κυττάρουα
Mόριο Ποσοστό () Aριθmicroός microορίων ανάεπί ξηρού κύτταρο (διαφορετικοίβάρουςβ τύποι)
Σύνολο microακροmicroορίων 96 24610000 (~2500)Πρωτεΐνες 55 2350000 (~1850)Πολυσακχαρίτες 5 4300 (2)γ
Λιπίδια 91 22000000 (4)δ
Λιποπολυσακχαρίτες 34 1430000 (1)DNA 31 21 (1)RNA 205 255500 (~660)
Σύνολο microονοmicroερών 30 mdashε (~350)Αmicroινοξέα και 05 mdash (~100)
πρόδροmicroά τουςΣάκχαρα και 2 mdash (~50)
πρόδροmicroά τουςΝουκλεοτίδια και 05 mdash (~200)
πρόδροmicroά τους
Ανόργανα ιόντα 1 mdash (18)
Σύνολο 100 mdash
α ∆εδοmicroένα από Neidhardt F C et al (eds) 1996 Escherichia coli and Sal-monella typhimurium-Cellular and Molecular Biology 2nd edition American So-ciety for Microbiology Washington DCβ Ξηρό βάρος ενός ενεργά αυξανόmicroενου κυττάρου E coli asymp 28 times 10ndash13 g ολι-κό βάρος (70 νερό) = 95 times 10-13 gγ Ως κύριοι πολυσακχαρίτες θεωρούνται οι πεπτιδογλυκάνες και το γλυκογό-νοδ Υπάρχουν διάφοροι τύποι φωσφολιπιδίων κάθε τύπος απαντά σε πολλέςmicroορφές λόγω διαφορών στη σύνθεση των λιπαρών οξέων από είδος σε είδοςκαι λόγω διαφορών στις συνθήκες ανάπτυξηςε ∆έν υπάρχουν αξιόπιστες microετρήσεις για την ποσοστιαία σύσταση σε microονο-microερή και σε ανόργανα ιόντα
33) - - 0 13 - ( ) -
Tο νερό ως βιολογικός διαλύτης
laquo13raquo - 13 O - $ 13 13-
= - 13 0 - 4 $ - - 13 (f 46 47) - - $ (32) 13 - 13 = F - - (13) $ E 13 - $
- F - - - ( 32) - = 13 1313 13 13 ( - F 1degC) $ () 13- 13 - - $
F 13 13
= 13 13 (- - 610 13) A - 13 ( 32)
50 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
(middot) paraUacuteˆUgraveAcirc˝OacuteAcirc˜
(sbquo) NOcirc˘IcircIumlAcirc˚Icirciquest OcircIacutecurrenmiddot
(Aacute) paraOcircIuml˘UcircmiddotIcircmacrmiddotUacutersaquoUgraveAcirc˜
(permil) sectEgraversaquopermilEgravemiddot
AOcircıEumlIcircAcirc˘UgraveEgraveIcirciquestIcircOcircIcircIcircrsaquomiddot
MmiddotUcircUgraversaquoAacuteEgraveOcircMAcircIgravesbquoUacuteiquestOacuteEuml TOcircrsaquomacrˆIgravemiddot
K˘UgraveUgravemiddotUacutefiIumlmiddotUcircIgravemiddot
PEgravesbquoOcircUcircOgraveIgravemiddotUgravemiddotpara˘UacuteEumlOacuteOcircAcircEgravepermilcurren˜
Εικόνα 33 Θέσεις των microακροmicroορίων microέσα στο κύτταρο (α) Πρωτεΐνες(καφέ χρώmicroα) απαντούν σε όλη την έκταση του κυττάρου είτε ως microέρη κυτ-ταρικών δοmicroών είτε ως ένζυmicroα (β) Νουκλεϊκά οξέα DNA (πράσινο χρώmicroα)απαντά στο πυρηνοειδές των προκαρυωτικών κυττάρων και στον πυρήνα τωνευκαρυωτικών κυττάρων RNA (πορτοκαλί χρώmicroα) απαντά στο κυτταρόπλασmicroα(mRNA tRNA) και στα ριβοσώmicroατα (rRNA) (γ) Πολυσακχαρίτες (κίτρινοχρώmicroα) υπάρχουν στο κυτταρικό τοίχωmicroα και ενίοτε σε εσωτερικά αποθη-κευτικά κοκκία (δ) Λιπίδια (κυανό χρώmicroα) απαντούν στην κυτταροπλασmicroατι-κή microεmicroβράνη στο κυτταρικό τοίχωmicroα και σε αποθηκευτικά κοκκία Οχρωmicroατικός κώδικας που χρησιmicroοποιείται εδώ θα εφαρmicroοσθεί για την απει-κόνιση των 4 τύπων microακροmicroορίων σε όλο το βιβλίο Για το DNA βλ επίσηςτη λεζάντα της Εικόνας 311
32 Έλεγχος εννοιών
= - 6 7 $ (DNA RNA) - - 13
RNA - $
+ F 13
I I ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑamp 32 $
33 Πολυσακχαρίτες
13 () $ - 121 - C6H12O6 ( 34)+ 13 - 4 5 6 7 ( C4 C5 C6 C7) amp C5 () 7 $- C6 ($) - - 34 -
$ = 13- 13 (f 48) - ( 35) $ - 1313- 13 (13 36) $ -
O γλυκοζιτικός δεσmicroός
( ) 13 ( 36)0 () - = - - - -
33 ΠΟΛΥΣΑΚΧΑΡΙΤΕΣ 51
MED
IA T
UTO
RIAL
MED
IA T
UTO
RIAL
Mac
rom
olec
ules
centOcircIgraveEgraveIcircfi˜UcircIcircAcircIumlAcircUgravefi˜RNA
centOcircIgraveEgraveIcircfi˜UcircIcircAcircIumlAcircUgravefi˜DNA
paraEumlAacutelsaquoAcircOacutecurrenUacuteAacuteAcircEgravemiddot˜Icirc˘UgraveUgravemiddotUacuteEgraveIcirciquestUgraveOcircEgravemacrOgraveIgravemiddotUgravemiddot
paraEumlAacutelsaquoAcircOacutecurrenUacuteAacuteAcircEgravemiddot˜UcirciquestIcircmacrmiddotUacuteOcircEcircUacuteOcircDaggerUgraveˆOacute
ordmUacuteOcirc˘IcircUgravefi˙Euml
tradeiquestIcircmacrmiddotUacuteOcirc AOacuteOcircEgraveIcircUgravelsaquo middotIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot centmiddotIcircUgraveDaggerIumlEgraveOcirc˜ PfiIumlOcirc˜
1
23
4
5
PEgravesbquofi˙Euml
paraAcircOacuteUgravefi˙Acirc˜
centAcircOcircIacute˘UacuteEgravesbquofi˙Euml
degIuml˘Icircfi˙Euml
EIacutefi˙Acirc˜
H
H
H
H
HH H
H
H
H H
H
H
HH
H
HH
H
H
H
H
H HH
H
H
H
H
H
H
H
HH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OHOH
OH
C
C
C
C
C
C C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C C
C
C
C C
C
C
C
C C
C
C
C
C
C
OO
O
O
O O
OO
CH2OH
HOCH2
HOCH2
HOCH2
HOCH2
CH2OH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
HO
HO
HO
1
23
4
51
2
3
4
5
1
2
3
4
5
1
2
3
4
5
6
1
2
3
4
5
6
1
23
4
5
6
5
6
4 3
2
1
Εικόνα 34 Συντακτικοί τύποι ορισmicroένων κοινών σακχάρων Τα σάκχα-ρα αναπαρίστανται microε δύο εναλλακτικούς τρόπους ανοικτής αλυσίδας καιδακτυλίου Η microορφή της ανοικτής αλυσίδας είναι περισσότερο ευανάγνωστηαλλά συνηθέστερα χρησιmicroοποιείται η microορφή του δακτυλίου Σηmicroειώστε τοντρόπο αρίθmicroησης των θέσεων του δακτυλίου
TOcirc iquestUgraveOcircIgraveOcirc NmiddotOacuteUgraveEgraveIcircmiddotıEgraveUcircUgraveiquest currenOacutemiddotiquestUgraveOcircIgraveOcirc O UgraveOcirc˘ UcircmiddotIcircmacriquestUacuteOcirc˘
AIcircAcircUgrave˘IumlOcircIgraveiquestpermilmiddotHC
O
CH N
H
C
O
CH3
C HHO
C OHH
C OHH
CH2OH
CH2OH
O
HHOH
H
HO
H NH
C O
CH3
OH2
1
3
4
5
6
1
23
4
5
6
Εικόνα 35 Ν-ακετυλογλυκοζαmicroίνη ένα παράγωγο σακχάρου
- - - ( 36) 13 - $ 1 4 - ( Oslash - 36) - 13 amp -14 (36) - - - - (- -) $ 6 13 amp - 13 -- - $ 13 - $ - Gram 13- - ( 49)
33 Έλεγχος εννοιών
$ - - (- -) - 6
- - 100
34 Λιπίδια
-13 amp 13 (f 45) $ - 13 ( 37) $ 16 15 - ( ) 13$ L
52 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
O
CH2OH
H
H
OH
OH
H
H
HO
H
O
CH2OH
H
OHH
OH
OH
H
HH
O
OtildeIgrave˘IumlOcirc
degIuml˘IcircOcircAacutefiOacuteOcirc
K˘UgraveUgravemiddotUacutersaquoOacuteEuml
(sbquo)
(middot)
O
CH2OH
H
H
OH
OH
H
H
HO
H
OH
O
CH2
H
H
OH
OH
H
HH
O
HO
O
CH2OH
HH
OH
OH
H
H
HO
HOH
O
CH2OH
HH
OH
OH
H
HH
O
middot-14-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
middot-16-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
sbquo-14-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-14
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-16
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo sbquo-14
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-14
1
23
4
5
6
1
23
4
5
6
1
23
4
5
6
Εικόνα 36 Πολυσακχαρίτες (α) ∆οmicroές διαφόρων γλυκοζιτικών δεσmicroώνΣηmicroειώστε ότι microπορεί να ποικίλλουν τόσο η σύνδεση όσο και η γεωmicroετρία (α-ή β-) του δεσmicroού (β) ∆οmicroές ορισmicroένων κοινών πολυσακχαριτών Συγκρίνετετον χρωmicroατικό κώδικα microε το (α)
$ 14 20 ( 37)
Tριγλυκερίδια και σύνθετα λιπίδια
() $ 13 ( 37)
13 $
- ( 37) $$13 - 13 13 (f 45)
13 13 13- $ ()13 13 (f 45) - 13 -13 $
34 Έλεγχος εννοιών
13 - 13
$ 13
13 13 $
$ 4 (C4)
35 Nουκλεϊκά οξέα
7 $ $137 (DNA) 137 (RNA) 13 -13 DNA - RNA - - $ 6 M - 5 13 ( RNA)
35 ΝΟΥΚΛΕΪΚΑ ΟΞΕΑ 53
MOcircOacuteOcircAacutemiddotIumlmiddotIcircUgraveOcirc˙˘IumlOcircpermilEgraveAacuteIuml˘IcircAcircUacutersaquopermilEgraveOcirc(currenOacutemiddot AacuteIuml˘IcircOcircIumlEgraversaquopermilEgraveOcirc)
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot Ucirc˘OacutepermilAcircpermilAcircIgravecurrenOacutemiddot IgraveAcirc AacuteIuml˘IcircAcircUacutefiIumlEumlIgravecurrenUcircˆ AcircUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircOcircDagger permilAcircUcircIgraveOcircDagger
OH
OH
OH
H3CKOcircUacuteAcircUcircIgravecurrenOacuteOcirc C16 (middotIumlIgraveEgraveUgraveEgraveIcircfi)
MOcircOacuteOcircmiddotIcircfiUacuteAcircUcircUgraveOcirc C16 (middotIumlIgraveEgraveUgraveAcircIumlmiddot˚Icircfi)
C OH
O
CH3 C OH
O
H3CC O
O
H3CC O
OC
C
H
H
H
O C H
H
O
CH2OH
degmiddotIumlmiddotIcircUgravefi˙Euml
H3CC O
O
H3CC O
OC
C
H
H
H
P O
O
C H
H
ndashO
O
CH2
CH2+NH3
AEgraveımiddotOacuteOcircIumlmiddotIgraversaquoOacuteEuml
H3CC O
O
C H
H3CC O
O
C H
H3CC O
O
C H
H
H
KOcircEgraveOacuteiquest IumlEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
tradeDaggerOacuteıAcircUgraveOcirc IumlEgraversaquopermilEgraveOcirc
AIumliquest IumlEgraversaquopermilEgravemiddot (UgraveUacuteEgraveAacuteIuml˘IcircAcircUacutersaquopermilEgravemiddot)
tradeDaggerOacuteıAcircUgraveOcirc IumlEgraversaquopermilEgraveOcircordmˆUcircEcircmiddotUgraveEgravepermil˘IumlOcircmiddotEgraveımiddotOacuteOcircIumlmiddotIgraversaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot EcircˆUcircEcircOcircIumlEgraversaquopermilEgraveOcirc)
degIuml˘IcircAcircUacutefiIumlEuml
12
3546
78
910
1112
1314
1516
23
4
5
6
1
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
EUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi
Εικόνα 37 Λιπαρά οξέα απλά λιπίδια (λίπη) και σύνθετα λιπίδια Απλάλιπίδια σχηmicroατίζονται microε microια αντίδραση αφυδάτωσης microεταξύ λιπαρών οξέωνκαι γλυκερόλης η οποία δηmicroιουργεί εστερικό δεσmicroό
$13 ( DNA) 13 PO4
3ndash = - DNA RNA - 38
Nουκλεοτίδια
13 7 $ - 13 13 (
) 13 - $ ( 39) = DNA RNA = ( $-) DNA RNA 13 () -$ C-1 N 13 13 1 ( ) 9 ( -) amp - 13 - ( 310)
13 7 $ 5 ATP ( ) ( 310) -
54 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi P
O
Ondash
OndashO
C C
O BiquestUcircEuml
OH
H HHH C
OH PEgravesbquofi˙Euml
5atilde
4atilde
3atilde 2atilde1atilde
C
CH2
Εικόνα 38 Νουκλεοτίδια Εδώ απεικονίζεται ένα ριβονουκλεοτίδιο πουαπαντά στο RNA Τα δεοξυριβονουκλεοτίδια που απαντούν στο DNA έχουνστον άνθρακα 2rsquo ένα άτοmicroο H αντί της οmicroάδας ndashOH Η αρίθmicroηση των θέσε-ων του σακχάρου γίνεται microε τονούmicroενους αριθmicroούς για να διακρίνεται από τηναρίθmicroηση των θέσεων του δακτυλίου της αζωτούχου βάσης οι οποίες επί-σης αριθmicroούνται (1 2 3 κλπ) (βλ Εικόνα 39) Τόσο τα δεοξυριβονου-κλεοτίδια όσο και τα ριβονουκλεοτίδια περιέχουν microια 5rsquo-φωσφορική οmicroάδα
N
N
N
N
1
234
56
78
9
N
N
N
N
NH2
N
N
N
NH
NH2
O
N
N
3
216
54
N
NH
O
O
H3C
NH
O
NH2
K˘UgraveOcircUcircrsaquoOacuteEuml (C)
pound˘IgraversaquoOacuteEuml (T)
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEuml (A)
degOcirc˘middotOacutersaquoOacuteEuml (G)
DNA RNA
BiquestUcircAcircEgrave˜ ˘UacuteEgraveIgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml˜ BiquestUcircAcircEgrave˜ Ocirc˘UacutersaquoOacuteEuml˜
H
N
DNA RNA
MfiOacuteOcircDNA
Εικόνα 39 ∆οmicroές των βάσεων του DNA και του RNA ∆εν παρατίθεταιστην εικόνα η ουρακίλη (U) της οποίας η δοmicroή είναι όmicroοια microε της θυmicroίνηςmicroε τη microόνη διαφορά ότι στερείται της microεθυλοmicroάδας στον C-5 Παρατηρήστετο σύστηmicroα αρίθmicroησης των δακτυλίων Κατά την ένωση τους microε τον άνθρα-κα 1rsquo του φωσφοσακχάρου για τον σχηmicroατισmicroό νουκλεοτιδίου (Εικόνα 38)οι βάσεις πυριmicroιδίνης συνδέονται microέσω του N-1 του δακτυλίου και οι βάσειςπουρίνης microέσω του N-9
TUacuteEgraveEcircˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcirclsaquo middotpermilAcircOacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot OacuteOcirc˘IcircIumlAcircOcircUgraversaquopermilEgraveOcirc)
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi˜AcircUcircUgravecurrenUacutemiddot˜
N-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
OHOCH2 OH
HH
H
H
OHOH
PEgravesbquofi˙Euml
N N
NN
NH2
+
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEuml
OHOCH2
OHOH
N N
NN
NH2
ApermilAcircOacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot˜ OacuteOcirc˘IcircIumlAcircOcirc˙rsaquoUgraveEuml˜)
3 PO43ndash
OCH2
OHOH
N N
NN
NH2
OPOPOPndashO
O
Ondash
O
Ondash
O
Ondash
ordmˆUcircEcircOcirc-middotOacute˘permilUacutersaquoUgraveEuml˜
H H
H
H
H
H
H H H
~ ~65
4 32
178
9
65
4 32
178
9
65
4 32
178
9
Eικόνα 310 Συστατικά ενός σηmicroαντικού νουκλεοτιδίου της τριφω-σφορικής αδενοσίνης Η ενέργεια υδρόλυσης του φωσφοανυδριτικού δεσmicroού(κυmicroατιστές παύλες) είναι microεγαλύτερη από αυτήν του φωσφορικού εστέραγεγονός που η σηmicroασία του θα γίνει αντιληπτή στο Κεφάλαιο 5 (f Tmicroήmicroα58)
- - - (f 58) L - $- (f 57) 13 (f
515) 13 $ - 7 $ $ -
Nουκλεϊκά οξέα
Q 7 $ - - ( 311)
$ - 3 ( 3acute) 5 (5acute) (- 311) = F $$13
= DNA RNA - 0 13 DNA RNA - 0 - (f 7) DNA - RNA
35 ΝΟΥΚΛΕΪΚΑ ΟΞΕΑ 55
paraAcircUacuteEgraveOcircmacrlsaquo UcircDagger˙Acirc˘IacuteEuml˜Ucirc˘IgraveIumlEumlUacuteˆIgravemiddotUgraveEgraveIcircOgraveOacutesbquoiquestUcircAcircˆOacute
A˙ˆUgraveOcircDaggermacrOcirc˜ sbquoiquestUcircEumlUcirc˘OacutepermilAcircpermilAcircIgravecurrenOacuteEuml UcircUgraveEuml ıcurrenUcircEuml 1atilde
H H
H2C BiquestUcircEumlO
O3atilde
1atilde
2atilde
5atilde
5atilde
5atilde
5 3
3atilde
3atilde
3atilde
3atilde 5atilde
P OndashO
H H H
H
H
H2C BiquestUcircEumlO
O
O
H H H
H
H
O
O
(i)
(ii)
poundcurrenUcircEuml 5atilde
P OndashO
O
P OndashO
O
centAcircOcircIacute˘UacuteEgravesbquofi˙Euml
paraUacuteˆUgraveOcircUgravemiddotAacutelsaquo˜permilOcircIgravelsaquo
centAcirc˘UgraveAcircUacuteOcircUgravemiddotAacutelsaquo˜permilOcircIgravelsaquo
poundcurrenUcircEuml 3atilde
(middot)
(sbquo)
A
C G
G C
C G
C G
A U
(Aacute)
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi
A GG CC T T A
T CC GG A A T
C C A U C GA CG U G A
C C U C G GC GG A C A
C
BiquestUcircEumlH2C
5atilde
4atilde
H
HcentAcircUcircIgraveOcircrsaquo˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘
ordmˆUcircEcircOcircpermilEgraveAcircUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 311 DNA και RNA (α) ∆οmicroή microέρους microιας αλυσίδας DNA Οι αζωτούχες βάσεις microπορεί να είναι αδενίνη γουανίνη κυτοσίνη ή θυmicroίνη Στο RNAυπάρχει microια οmicroάδα ndashOH στον άνθρακα 2rsquo της πεντόζης (βλ Εικόνα 38) και ουρακίλη αντί της θυmicroίνης (β) Απλουστευmicroένο σχήmicroα της δοmicroής του DNA όπουαπεικονίζονται microόνον οι αζωτούχες βάσεις Παρατηρήστε ότι οι δύο αλυσίδες (κλώνοι DNA) είναι συmicroπληρωmicroατικές ως προς την ακολουθία βάσεων (A=T GintC)και συνδέονται microε δεσmicroούς υδρογόνου που σχηmicroατίζονται microεταξύ αυτών των βάσεων Οι δύο κλώνοι DNA απεικονίζονται microε πράσινο χρώmicroα σε δύο διαφορετι-κούς τόνους σκίασης χρωmicroατική σύmicroβαση που εφαρmicroόζεται σε όλο το βιβλίο (γ) RNA (i) πρωτοταγής δοmicroή (ii) πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή Στο RNAσχηmicroατίζονται δευτεροταγείς δοmicroές όταν παρουσιάζονται δυνατότητες για ενδοmicroοριακή ζεύξη βάσεων δηλ για ζεύξη βάσεων της ίδιας αλυσίδας Σε ορισmicroέναπολύ microεγάλα microόρια RNA όπως πχ στο ριβοσωmicroατικό RNA (f Τmicroήmicroατα 715 και 114) άλλες περιοχές του microορίου έχουν microόνο πρωτοταγή δοmicroή και άλλεςτόσο πρωτοταγή όσο και δευτεροταγή δοmicroή Αυτό οδηγεί σε microόρια microε τελικό τριδιάστατο σχήmicroα που είναι καθοριστικό για τη λειτουργία τους και εmicroπεριέχειεκτενείς περιελίξεις ή συσπειρώσεις (f Εικόνα 118γ) Το RNA απεικονίζεται microε πορτοκαλί χρώmicroα χρωmicroατική σύmicroβαση που διατηρείται σε όλο το βιβλίο
$ 1313 -
DNA
DNA DNA - $ -$ (13 32) - - $ (G) (C) $ (A) (T) (13 32) $ $ 13 A T G C DNA - 13 0 G - C T A ( 311)
RNA
$ 137$ S RNA $ 13 - amp 13 - RNA 1313 ( 311)
RNA 13 $ RNA (messenger RNAmRNA) DNA 13- DNA $ RNA (transfer RNA tRNA) - 7 -- -$ 7 - RNA (ribosomal RNA rRNA) 13 7 0 RNA $ - 7 11
35 Έλεγχος εννοιών
7 $ - 13 - RNA DNA RNA
-
13 $ 1313
RNA
36 Tα αmicroινοξέα και ο πεπτιδικός δεσmicroός
$ 7- $ - $ 21 $ 0 $ - (ndashCOOH) (ndashNH2) (- 31 312) amp - $ 13-$ $ - $ ( ) -13 13 - 6 ( 313)
0 $ - 312 ( ROslash 312) - -- 13$13 13 13$ ( ) ( $ ) (- 312) $ 13 - $ - laquoraquo$ 312 = - - 13$ $ $ $ $ L $ 13 - $ = 6 - (ndashSH) -$ - (RndashSndashSndashR) F - $ $ 7 - 13
Iσοmicroερή
amp
56 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
$ Louis Pasteur 13 -F (f 15) 13 = Pasteur F $ ( 314) $ 13 - ( $ )
- (f 48) X laquo- raquo $ - D
L ( 315) 13 - Dndash
$ D L 0 - 6 $ Lndash$ Dndash (- 315) Dndash$ - (f 48) 13 (f 209) Dndash$ Lndash Lndash Dndash
36 ΤΑ ΑΜΙΝΟΞΕΑ ΚΑΙ Ο ΠΕΠΤΙ∆ΙΚΟΣ ∆ΕΣΜΟΣ 57
H
CH3
CHCH3
CH3
CH2CHCH3
CH3
CHCH3
CH2CH3
CH2OHCHCH3
OH
CH2
O-O
CH2C
O
NH2
CH2C
O-O CH2
CH2C
O
CH2NH2
CH2HS
CH2S CH2CH3
CH2
CH2HO
CH2
NH
CH2CH2CH2CH2+NH3
CH2CH2CH2+NH2 N
HC
NH2CH2
HN
+HN
N
CH2H2C
H2C CH COOndash
Gly degIuml˘IcircrsaquoOacuteEuml (G)
Ala AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (A)
Val BmiddotIumlrsaquoOacuteEuml (V)
Leu sectAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (L)
Ile IUcircOcircIumlAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (I)
Ser tradeAcircUacutersaquoOacuteEuml (S)Thr poundUacuteAcircOcircOacutersaquoOacuteEuml (T)
Asp AUcircmiddotUacuteUgraveEgraveIcircfi (D)
Asn AUcircmiddotUacutemiddotAacutersaquoOacuteEuml (N)
Glu degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraveEgraveIcircfi (E)
Gln degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraversaquoOacuteEuml (Q)
Cys K˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (C)
CH2HSe Sec tradeAcircIumlEumlOacuteOcircIcirc˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (U)
Met MAcircıAcircEgraveOcircOacutersaquoOacuteEuml (M)
Phe ordmmiddotEgraveOacute˘IumlmiddotIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (F)
Tyr T˘UacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (Y)
Trp TUacute˘UgraveOcircEcirciquestOacuteEuml (W)
Lys sect˘UcircrsaquoOacuteEuml (K)
Arg AUacuteAacuteEgraveOacutersaquoOacuteEuml (R)
His IUcircUgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml (H)
Pro
centOcircIgravelsaquo UgraveˆOacute middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteEgraveIcircOgraveOacute OcircIgraveiquestpermilˆOacute
OHC
O
CR
H
NH2
AIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot
degAcircOacuteEgraveIcirclsaquo permilOcircIgravelsaquo AcircOacutefi˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenOcirc˜
(tradeEumlIgraveAcircrsaquoˆUcircEuml tradeUgraveEumlOacute AcircUacutersaquoUgraveˆUcircEuml UgraveEuml˜ UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml˜ middotAcircEgraveIcircOcircOacutersaquo˙AcircUgravemiddotEgrave OcircIumlfiIcircIumlEumlUacuteEuml Euml permilOcircIgravelsaquo fimacrEgrave IgravefiOacuteOcircOacute Euml OcircIgraveiquestpermilmiddot R H UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml permilAcircOacute AcircrsaquoOacutemiddotEgrave middotIcircUacuteEgravesbquoOgrave˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteDagger permilEgravefiUgraveEgrave UcircUgraveAcircUacuteAcircrsaquoUgravemiddotEgrave AcircIumlAcircDaggerıAcircUacuteEuml˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot˜)
H IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-fiIacuteEgraveOacuteOcirc
MEuml OcircIumlEgraveIcircfi(˘permilUacutefiEcircOcircsbquoOcirc)
C
KIumlAcircrsaquopermilmiddot
-iquestOacuteıUacutemiddotIcircmiddot˜
KmiddotUacutesbquoOcircIacute˘IumlOcircIgraveiquestpermilmiddot
paraUacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml (P)
IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-middotIumlIcircmiddotIumlEgraveIcircfi
paraOcircIumlEgraveIcircfi IgraveEuml EgraveOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc Εικόνα 312 Συντακτικοί τύποι των 21 κοινών αmicroινοξέων Αριστερά απότο όνοmicroα κάθε αmicroινοξέος δίνεται η τριγράmicromicroατη συντοmicroογραφία του και δεξιά(σε παρένθεση) η microονογράmicromicroατη συντοmicroογραφία του
H2N C C
H O
OH NH
C C
H
R2
O
OH+ H
H2O
H2N C C
H
R1
O
N C C
H
R2
O
OH
R1
H
paraAcircUgraveEgravepermilEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 313 Σχηmicroατισmicroός πεπτιδικού δεσmicroού R1 και R2 αναφέρονταιστο microεταβλητό microέρος των αmicroινοξέων (πλευρική αλυσίδα) (βλ Εικόνα 312)
(Lndash Dndash$) 13- (Dndash Lndash$)
36 Έλεγχος εννοιών
21 $ - $ 13 13 $ ( ) -6
$ - $
$ -
- $ 13 - $ -
37 Πρωτεΐνες πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή
6 - - 6 () 6
13 - (f 5 17) 6 13 - - - 6 = 7 - -
Πρωτοταγής δοmicroή
6 $ $ (-
58 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
T T
P
M M
Pbatilde b
h
n n
h
(middot) (sbquo)
Εικόνα 314 Σχεδιαγράmicromicroατα κρυστάλλων τρυγικού οξέος (C4H6O6) διάχειρός Louis Pasteur από το περίφηmicroο άρθρο του περί οπτικής ενεργότητας(α) Αριστεροχειρικός κρύσταλλος (microορφή L) (β) ∆εξιοχειρικός κρύσταλλος(microορφή D) Οι δύο κρύσταλλοι είναι κατοπτρικά είδωλα ο ένας του άλλου(δηλ εναντιοmicroερή) Τα γράmicromicroατα πάνω στις έδρες των κρυστάλλων υποδη-λώνουν τα ζεύγη εναντιοmicroερών εδρών κατά τον συmicroβολισmicroό του PasteurΓια να αναδειχθεί σαφέστερα η εναντιοmicroέρεια των κρυστάλλων έχει χρησι-microοποιηθεί έγχρωmicroη σκίαση
(sbquo)
NH2H2N
COOH
C HH2N
CH3
COO
CH
CH3
ErsaquoAcircpermilEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
COOH
C NH2
CH3
COOH
CH
CH3
H
L-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml D-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml
(Aacute)
HO
HO
HO
OH
HHO
C OHH
OH
CH2OH
O
C H
CH
H
H
CH2OH
D-degIuml˘Icircfi˙Euml L-degIuml˘Icircfi˙Euml
CO
OH
(middot)
H
CH
C
CH
HC
C
C
tradeUgraveEumlOacute UgraveUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEuml UacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo UgraveOcirc IgraveAcircOacute sbquocurrenIumlOcirc˜ ımiddot UacutecurrenAcircEgrave Oacutemiddot ıAcircˆUacuteEumlıAcircrsaquo fiUgraveEgrave IcircmiddotUgraveAcirc˘ıDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave UacuteOcirc˜ UgraveOcircOacute middotUacutemiddotUgraveEumlUacuteEumlUgravelsaquo Euml permilAcirc permilEgravemiddotIcircAcircIcircOcircIgraveIgravecurrenOacuteEuml AacuteUacutemiddotIgraveIgravelsaquo fiUgraveEgrave middotOcircIgravemiddotIcircUacuteDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave middotfi middot˘UgravefiOacute
bC C
a
c c
a
d db
TUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
Εικόνα 315 Ισοmicroερή (α) Υπόδειγmicroα ζεύγους κατοπτρικών ειδώλων(β) Εναντιοmicroερή γλυκόζης (γ) Εναντιοmicroερή του αmicroινοξέος αλανίνη Παρατη-ρήστε ότι όπως και να περιστραφούν οι τριδιάστατες προβολές των microορίωνοι δύο microορφές L και D είναι αδύνατον να συmicroπέσουν
313) $ $ - 13 $ 13 0 $ - $ 13 6 - $ 6 6 6 15 $ 6 10000 -$ 6 $ 7 ( )
= $ - 13 = - 13 13 + - 13 13
∆ευτεροταγής δοmicroή
= $ R $ 13 13 6( 316) ( 31) - 6 M - - - 7 - (316) gt $ $ = ( - ) - - ( 316)
M - 1313 - $ (- 316)
- - - -
37 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ΠΡΩΤΟΤΑΓΗΣ ΚΑΙ ∆ΕΥΤΕΡΟΤΑΓΗΣ ∆ΟΜΗ 59
(middot)
(sbquo)
CC C
C
CC
C C
C
C
C
C
CCC
C C C
C
C
CC C
CC C
C
C
C
CC
CC
C
CC CC
C C
CC
C
C
C C
CC C
CC
C
CC
C C
CC
CCCC
C C
CC CC
C C
C
O
O
O O O
O
O
O O O
O
O O
O
O O
O
OO
O
OO
O
O O
O
O
O O
O
O O
OO
OO
RR
R R
R
RR R R
R R R
RRR
R R R
RRR
R R R
R R R
RR
RR
RR
R
R
H
HH
HH
HHH H
H
H HH
H
H
H
H
H H
H
H H
H
H H
H
H H
H
HH
H
H
H
HHHH
HH
H
HH
HH
HH
HH
HH
HH
NN
NN
NN
NN
N
N
N N
N
NN
N
N N
N
N N
N
NN
N
NN
N
N N
N
N
NNNN
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger AacuteAcircEgraveUgraveOcircOacuteEgraveIcircOgraveOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger middotOcircIgravemiddotIcircUacute˘UcircIgravecurrenOacuteˆOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
Εικόνα 316 ∆ευτεροταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων (α) ∆ευτεροταγήςδοmicroή α-έλικας Παρατηρήστε ότι οι δεσmicroοί υδρογόνου σχηmicroατίζονται microετα-ξύ ατόmicroων των πεπτιδικών δεσmicroών χωρίς τη συmicromicroετοχή των οmicroάδων R (β)∆ευτεροταγής δοmicroή β-πτυχωτής επιφάνειας
13 - - - 13 6 - - - (13 317)amp 13 13(domains) - $ 7-
38 Πρωτεΐνες δοmicroές υψηλότερης τάξης και αποδιάταξη
+ - $ - = 13 6 0 - - 13 S $ - - - 13 -
$ 13 - - ( 317)
(ndashSH) 6 amp ndashSH - $ $ amp 6 -6 $ ( 317) $- 6 = - - ( 317 318) - ( - ) (f 55)
A 6 - 13 6 - 7 7 - 13 ( 318) 6 +-
60 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot B
(middot) IOacuteUcircOcirc˘IumlrsaquoOacuteEuml (sbquo) PEgravesbquoOcircOacuteOcirc˘IcircIumlAcirciquestUcircEuml
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot A
-currenIumlEgraveIcircmiddot
-Ugrave˘macrˆUgravelsaquoAcircEgraveEcirciquestOacuteAcircEgravemiddot
Εικόνα 317 Τριτοταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων που υποδεικνύει και τιςθέσεις εντοπισmicroού περιοχών microε δευτεροταγή δοmicroή α-έλικας ή β-πτυχωτήςεπιφάνειας (α) Ινσουλίνη microια πρωτεΐνη που έχει δύο πολυπεπτιδικές αλυ-σίδες (f Τmicroήmicroα 319) παρατηρήστε ότι η αλυσίδα Β περιέχει δοmicroές α-έλικας αλλά και β-πτυχωτής επιφάνειας και ότι οι δισουλφιδικοί δεσmicroοί(κυανό χρώmicroα) συντελούν στον καθορισmicroό της τελικής αναδίπλωσης (τριτο-ταγούς δοmicroής) (β) Ριβονουκλεάση microια microεγάλη πρωτεΐνη microε αρκετές περιο-χές α-έλικας και β-πτυχωτής επιφάνειας
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜ 13
Εικόνα 318 Τεταρτοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης Υπάρχουν δύο είδηπολυπεπτιδίων στην αιmicroοσφαιρίνη αλυσίδες α (κυανό και κόκκινο χρώmicroα)και αλυσίδες β (πορτοκαλί και κίτρινο χρώmicroα) και συνολικά 4 πολυπεπτίδιαστο τελικό πρωτεϊνικό microόριο (εδώ τα laquoαraquo και laquoβraquo αναφέρονται σε ονοmicroασίεςπολυπεπτιδικών αλυσίδων και όχι σε είδη δευτεροταγούς δοmicroής) Η τεταρ-τοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης συmicroβολίζεται ως α2 β2 Οι 4 διακριτές αλυ-σίδες απεικονίζονται microε 4 διαφορετικά χρώmicroατα
6 - ( 6 13) - $ ( van der Waals 13 ) ( - $ )
Aποδιάταξη (microετουσίωση)
0 6 - pH - 13 ( 319) =$ 13 - 6 - ( 313) + $ F $ - - (-) amp $ $ ( 319) S 13 6 13 - ( 1313 ) - - $ 1313-13 13
= $ 7 - 7 13 - 0 20 - 6 - amp - - $ 13
Tα επόmicroενα κεφάλαια
amp - 4
- - 13 - 5 13 13 amp - 4 5 $ 13- (f 12) $ $- 0 $ ( 6)
M 1313 - 3 13
38 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ∆ΟΜΕΣ ΥΨΗΛΟΤΕΡΗΣ ΤΑΞΗΣ ΚΑΙ ΑΠΟ∆ΙΑΤΑΞΗ 61
lozEgravemiddotmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(Ocirc˘Uacutersaquomiddot)
ŒOacuteUgraveOcircOacuteEumlmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(100AEligC)
AOcircIgraveiquestIcircUacute˘OacuteUcircEumlOcirc˘Uacutersaquomiddot˜Oslash OacutecurrenmiddotAcircOacuteAcircUacuteAacuteOcircOcircrsaquoEumlUcircEuml
aeligDaggerIacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜ AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
Εικόνα 319 Aποδιάταξη (microετουσίωση) της πρωτεΐνης ριβονουκλεάση(της οποίας η δοmicroή δίνεται στην Εικόνα 317β) Παρατηρήστε πώς οι έντο-νες συνθήκες αποδιάταξης οδηγούν σε ένα οριστικά κατεστραmicromicroένο microόριο(ως προς τη βιολογική λειτουργία του) λόγω εσφαλmicroένης αναδίπλωσης
amp - $ - $ - - F - 13 7 7 $ 13 $ 13 13 -13
37 και 38 Έλεγχος εννοιών
= 6 - $ 6
( ) ( F- $)
1313 7
13 13amp -
6 - - -
F 13 -6 1313136
F $ 6 $ $ 7
62 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
Eρωτήσεις επανάληψης
- $
7 RNA DNA - amp $ RNA DNA DNA RNA
8 amp F $ R 7 $ 13amp -7
9 $ -$ - (Y13 13 313)
10 Z (13 31) -
1 -13 13 $
2 $
3 13 ((13- 13 31)
4 amp13 $ 13 13 amp 13- -
5 amp -
6 $ - 37
Eρωτήσεις εφαρmicroογής
1 RNA () GUCAAAGAC (13) ACGAUAACC+ RNA - amp
2 () -6 F 13 -$ 13 -6
3 Halobacterium A 13 - (K+) 5 M 5- F K+ - 6 Haloba-cterium F $ 6 Escherichia coli 13-
ΕΡΩΤΗΣΕΙΣ ΕΦΑΡΜΟΓΗΣ 63
K+ $ (-13 $ $- 13 K+
4 6 -- 6 - amp-
5 0 13 13 - - F
13- 13
6 M rsquo F 5 1313 - 13 ( $) laquo- 13raquo 6 6 13
$- 13 - $ - 6 - 13
Mοτίβα σύνδεσης στα βιοmicroόρια
(C) - () Oslash - - - 13- 31 13 - 13 13 13 $ 13
31 Έλεγχος εννοιών
$ amp van der Waals 13 13
-
-
32 Γενική θεώρηση των microακροmicroορίων και του νερού ως βιολογικού διαλύτη
amp 13 - 13 Escherichia coli 13 - 13- ( ) ( 32) 96 $ 13 - -
6 ( 32) 6 - () ( 33)
13 RNA DNA $ RNA - 6 ( 32 33)A 13 - 13 (laquoraquo 7) RNA 6 +- RNA - (mRNA) RNA (tRNA) 7 amp RNA DNA 13 13 (32) DNA 1313 - -
13 13 - 13 (-
32 ΓΕΝΙΚΗ ΘΕΩΡΗΣΗ ΤΩΝ ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΩΝ ΚΑΙ ΤΟΥ ΝΕΡΟΥ ΩΣ ΒΙΟΛΟΓΙΚΟΥ ∆ΙΑΛΥΤΗ 49
ΠΙΝΑΚΑΣ 32 Xηmicroική σύνθεση προκαρυωτικού κυττάρουα
Mόριο Ποσοστό () Aριθmicroός microορίων ανάεπί ξηρού κύτταρο (διαφορετικοίβάρουςβ τύποι)
Σύνολο microακροmicroορίων 96 24610000 (~2500)Πρωτεΐνες 55 2350000 (~1850)Πολυσακχαρίτες 5 4300 (2)γ
Λιπίδια 91 22000000 (4)δ
Λιποπολυσακχαρίτες 34 1430000 (1)DNA 31 21 (1)RNA 205 255500 (~660)
Σύνολο microονοmicroερών 30 mdashε (~350)Αmicroινοξέα και 05 mdash (~100)
πρόδροmicroά τουςΣάκχαρα και 2 mdash (~50)
πρόδροmicroά τουςΝουκλεοτίδια και 05 mdash (~200)
πρόδροmicroά τους
Ανόργανα ιόντα 1 mdash (18)
Σύνολο 100 mdash
α ∆εδοmicroένα από Neidhardt F C et al (eds) 1996 Escherichia coli and Sal-monella typhimurium-Cellular and Molecular Biology 2nd edition American So-ciety for Microbiology Washington DCβ Ξηρό βάρος ενός ενεργά αυξανόmicroενου κυττάρου E coli asymp 28 times 10ndash13 g ολι-κό βάρος (70 νερό) = 95 times 10-13 gγ Ως κύριοι πολυσακχαρίτες θεωρούνται οι πεπτιδογλυκάνες και το γλυκογό-νοδ Υπάρχουν διάφοροι τύποι φωσφολιπιδίων κάθε τύπος απαντά σε πολλέςmicroορφές λόγω διαφορών στη σύνθεση των λιπαρών οξέων από είδος σε είδοςκαι λόγω διαφορών στις συνθήκες ανάπτυξηςε ∆έν υπάρχουν αξιόπιστες microετρήσεις για την ποσοστιαία σύσταση σε microονο-microερή και σε ανόργανα ιόντα
33) - - 0 13 - ( ) -
Tο νερό ως βιολογικός διαλύτης
laquo13raquo - 13 O - $ 13 13-
= - 13 0 - 4 $ - - 13 (f 46 47) - - $ (32) 13 - 13 = F - - (13) $ E 13 - $
- F - - - ( 32) - = 13 1313 13 13 ( - F 1degC) $ () 13- 13 - - $
F 13 13
= 13 13 (- - 610 13) A - 13 ( 32)
50 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
(middot) paraUacuteˆUgraveAcirc˝OacuteAcirc˜
(sbquo) NOcirc˘IcircIumlAcirc˚Icirciquest OcircIacutecurrenmiddot
(Aacute) paraOcircIuml˘UcircmiddotIcircmacrmiddotUacutersaquoUgraveAcirc˜
(permil) sectEgraversaquopermilEgravemiddot
AOcircıEumlIcircAcirc˘UgraveEgraveIcirciquestIcircOcircIcircIcircrsaquomiddot
MmiddotUcircUgraversaquoAacuteEgraveOcircMAcircIgravesbquoUacuteiquestOacuteEuml TOcircrsaquomacrˆIgravemiddot
K˘UgraveUgravemiddotUacutefiIumlmiddotUcircIgravemiddot
PEgravesbquoOcircUcircOgraveIgravemiddotUgravemiddotpara˘UacuteEumlOacuteOcircAcircEgravepermilcurren˜
Εικόνα 33 Θέσεις των microακροmicroορίων microέσα στο κύτταρο (α) Πρωτεΐνες(καφέ χρώmicroα) απαντούν σε όλη την έκταση του κυττάρου είτε ως microέρη κυτ-ταρικών δοmicroών είτε ως ένζυmicroα (β) Νουκλεϊκά οξέα DNA (πράσινο χρώmicroα)απαντά στο πυρηνοειδές των προκαρυωτικών κυττάρων και στον πυρήνα τωνευκαρυωτικών κυττάρων RNA (πορτοκαλί χρώmicroα) απαντά στο κυτταρόπλασmicroα(mRNA tRNA) και στα ριβοσώmicroατα (rRNA) (γ) Πολυσακχαρίτες (κίτρινοχρώmicroα) υπάρχουν στο κυτταρικό τοίχωmicroα και ενίοτε σε εσωτερικά αποθη-κευτικά κοκκία (δ) Λιπίδια (κυανό χρώmicroα) απαντούν στην κυτταροπλασmicroατι-κή microεmicroβράνη στο κυτταρικό τοίχωmicroα και σε αποθηκευτικά κοκκία Οχρωmicroατικός κώδικας που χρησιmicroοποιείται εδώ θα εφαρmicroοσθεί για την απει-κόνιση των 4 τύπων microακροmicroορίων σε όλο το βιβλίο Για το DNA βλ επίσηςτη λεζάντα της Εικόνας 311
32 Έλεγχος εννοιών
= - 6 7 $ (DNA RNA) - - 13
RNA - $
+ F 13
I I ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑamp 32 $
33 Πολυσακχαρίτες
13 () $ - 121 - C6H12O6 ( 34)+ 13 - 4 5 6 7 ( C4 C5 C6 C7) amp C5 () 7 $- C6 ($) - - 34 -
$ = 13- 13 (f 48) - ( 35) $ - 1313- 13 (13 36) $ -
O γλυκοζιτικός δεσmicroός
( ) 13 ( 36)0 () - = - - - -
33 ΠΟΛΥΣΑΚΧΑΡΙΤΕΣ 51
MED
IA T
UTO
RIAL
MED
IA T
UTO
RIAL
Mac
rom
olec
ules
centOcircIgraveEgraveIcircfi˜UcircIcircAcircIumlAcircUgravefi˜RNA
centOcircIgraveEgraveIcircfi˜UcircIcircAcircIumlAcircUgravefi˜DNA
paraEumlAacutelsaquoAcircOacutecurrenUacuteAacuteAcircEgravemiddot˜Icirc˘UgraveUgravemiddotUacuteEgraveIcirciquestUgraveOcircEgravemacrOgraveIgravemiddotUgravemiddot
paraEumlAacutelsaquoAcircOacutecurrenUacuteAacuteAcircEgravemiddot˜UcirciquestIcircmacrmiddotUacuteOcircEcircUacuteOcircDaggerUgraveˆOacute
ordmUacuteOcirc˘IcircUgravefi˙Euml
tradeiquestIcircmacrmiddotUacuteOcirc AOacuteOcircEgraveIcircUgravelsaquo middotIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot centmiddotIcircUgraveDaggerIumlEgraveOcirc˜ PfiIumlOcirc˜
1
23
4
5
PEgravesbquofi˙Euml
paraAcircOacuteUgravefi˙Acirc˜
centAcircOcircIacute˘UacuteEgravesbquofi˙Euml
degIuml˘Icircfi˙Euml
EIacutefi˙Acirc˜
H
H
H
H
HH H
H
H
H H
H
H
HH
H
HH
H
H
H
H
H HH
H
H
H
H
H
H
H
HH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OHOH
OH
C
C
C
C
C
C C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C C
C
C
C C
C
C
C
C C
C
C
C
C
C
OO
O
O
O O
OO
CH2OH
HOCH2
HOCH2
HOCH2
HOCH2
CH2OH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
HO
HO
HO
1
23
4
51
2
3
4
5
1
2
3
4
5
1
2
3
4
5
6
1
2
3
4
5
6
1
23
4
5
6
5
6
4 3
2
1
Εικόνα 34 Συντακτικοί τύποι ορισmicroένων κοινών σακχάρων Τα σάκχα-ρα αναπαρίστανται microε δύο εναλλακτικούς τρόπους ανοικτής αλυσίδας καιδακτυλίου Η microορφή της ανοικτής αλυσίδας είναι περισσότερο ευανάγνωστηαλλά συνηθέστερα χρησιmicroοποιείται η microορφή του δακτυλίου Σηmicroειώστε τοντρόπο αρίθmicroησης των θέσεων του δακτυλίου
TOcirc iquestUgraveOcircIgraveOcirc NmiddotOacuteUgraveEgraveIcircmiddotıEgraveUcircUgraveiquest currenOacutemiddotiquestUgraveOcircIgraveOcirc O UgraveOcirc˘ UcircmiddotIcircmacriquestUacuteOcirc˘
AIcircAcircUgrave˘IumlOcircIgraveiquestpermilmiddotHC
O
CH N
H
C
O
CH3
C HHO
C OHH
C OHH
CH2OH
CH2OH
O
HHOH
H
HO
H NH
C O
CH3
OH2
1
3
4
5
6
1
23
4
5
6
Εικόνα 35 Ν-ακετυλογλυκοζαmicroίνη ένα παράγωγο σακχάρου
- - - ( 36) 13 - $ 1 4 - ( Oslash - 36) - 13 amp -14 (36) - - - - (- -) $ 6 13 amp - 13 -- - $ 13 - $ - Gram 13- - ( 49)
33 Έλεγχος εννοιών
$ - - (- -) - 6
- - 100
34 Λιπίδια
-13 amp 13 (f 45) $ - 13 ( 37) $ 16 15 - ( ) 13$ L
52 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
O
CH2OH
H
H
OH
OH
H
H
HO
H
O
CH2OH
H
OHH
OH
OH
H
HH
O
OtildeIgrave˘IumlOcirc
degIuml˘IcircOcircAacutefiOacuteOcirc
K˘UgraveUgravemiddotUacutersaquoOacuteEuml
(sbquo)
(middot)
O
CH2OH
H
H
OH
OH
H
H
HO
H
OH
O
CH2
H
H
OH
OH
H
HH
O
HO
O
CH2OH
HH
OH
OH
H
H
HO
HOH
O
CH2OH
HH
OH
OH
H
HH
O
middot-14-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
middot-16-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
sbquo-14-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-14
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-16
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo sbquo-14
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-14
1
23
4
5
6
1
23
4
5
6
1
23
4
5
6
Εικόνα 36 Πολυσακχαρίτες (α) ∆οmicroές διαφόρων γλυκοζιτικών δεσmicroώνΣηmicroειώστε ότι microπορεί να ποικίλλουν τόσο η σύνδεση όσο και η γεωmicroετρία (α-ή β-) του δεσmicroού (β) ∆οmicroές ορισmicroένων κοινών πολυσακχαριτών Συγκρίνετετον χρωmicroατικό κώδικα microε το (α)
$ 14 20 ( 37)
Tριγλυκερίδια και σύνθετα λιπίδια
() $ 13 ( 37)
13 $
- ( 37) $$13 - 13 13 (f 45)
13 13 13- $ ()13 13 (f 45) - 13 -13 $
34 Έλεγχος εννοιών
13 - 13
$ 13
13 13 $
$ 4 (C4)
35 Nουκλεϊκά οξέα
7 $ $137 (DNA) 137 (RNA) 13 -13 DNA - RNA - - $ 6 M - 5 13 ( RNA)
35 ΝΟΥΚΛΕΪΚΑ ΟΞΕΑ 53
MOcircOacuteOcircAacutemiddotIumlmiddotIcircUgraveOcirc˙˘IumlOcircpermilEgraveAacuteIuml˘IcircAcircUacutersaquopermilEgraveOcirc(currenOacutemiddot AacuteIuml˘IcircOcircIumlEgraversaquopermilEgraveOcirc)
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot Ucirc˘OacutepermilAcircpermilAcircIgravecurrenOacutemiddot IgraveAcirc AacuteIuml˘IcircAcircUacutefiIumlEumlIgravecurrenUcircˆ AcircUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircOcircDagger permilAcircUcircIgraveOcircDagger
OH
OH
OH
H3CKOcircUacuteAcircUcircIgravecurrenOacuteOcirc C16 (middotIumlIgraveEgraveUgraveEgraveIcircfi)
MOcircOacuteOcircmiddotIcircfiUacuteAcircUcircUgraveOcirc C16 (middotIumlIgraveEgraveUgraveAcircIumlmiddot˚Icircfi)
C OH
O
CH3 C OH
O
H3CC O
O
H3CC O
OC
C
H
H
H
O C H
H
O
CH2OH
degmiddotIumlmiddotIcircUgravefi˙Euml
H3CC O
O
H3CC O
OC
C
H
H
H
P O
O
C H
H
ndashO
O
CH2
CH2+NH3
AEgraveımiddotOacuteOcircIumlmiddotIgraversaquoOacuteEuml
H3CC O
O
C H
H3CC O
O
C H
H3CC O
O
C H
H
H
KOcircEgraveOacuteiquest IumlEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
tradeDaggerOacuteıAcircUgraveOcirc IumlEgraversaquopermilEgraveOcirc
AIumliquest IumlEgraversaquopermilEgravemiddot (UgraveUacuteEgraveAacuteIuml˘IcircAcircUacutersaquopermilEgravemiddot)
tradeDaggerOacuteıAcircUgraveOcirc IumlEgraversaquopermilEgraveOcircordmˆUcircEcircmiddotUgraveEgravepermil˘IumlOcircmiddotEgraveımiddotOacuteOcircIumlmiddotIgraversaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot EcircˆUcircEcircOcircIumlEgraversaquopermilEgraveOcirc)
degIuml˘IcircAcircUacutefiIumlEuml
12
3546
78
910
1112
1314
1516
23
4
5
6
1
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
EUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi
Εικόνα 37 Λιπαρά οξέα απλά λιπίδια (λίπη) και σύνθετα λιπίδια Απλάλιπίδια σχηmicroατίζονται microε microια αντίδραση αφυδάτωσης microεταξύ λιπαρών οξέωνκαι γλυκερόλης η οποία δηmicroιουργεί εστερικό δεσmicroό
$13 ( DNA) 13 PO4
3ndash = - DNA RNA - 38
Nουκλεοτίδια
13 7 $ - 13 13 (
) 13 - $ ( 39) = DNA RNA = ( $-) DNA RNA 13 () -$ C-1 N 13 13 1 ( ) 9 ( -) amp - 13 - ( 310)
13 7 $ 5 ATP ( ) ( 310) -
54 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi P
O
Ondash
OndashO
C C
O BiquestUcircEuml
OH
H HHH C
OH PEgravesbquofi˙Euml
5atilde
4atilde
3atilde 2atilde1atilde
C
CH2
Εικόνα 38 Νουκλεοτίδια Εδώ απεικονίζεται ένα ριβονουκλεοτίδιο πουαπαντά στο RNA Τα δεοξυριβονουκλεοτίδια που απαντούν στο DNA έχουνστον άνθρακα 2rsquo ένα άτοmicroο H αντί της οmicroάδας ndashOH Η αρίθmicroηση των θέσε-ων του σακχάρου γίνεται microε τονούmicroενους αριθmicroούς για να διακρίνεται από τηναρίθmicroηση των θέσεων του δακτυλίου της αζωτούχου βάσης οι οποίες επί-σης αριθmicroούνται (1 2 3 κλπ) (βλ Εικόνα 39) Τόσο τα δεοξυριβονου-κλεοτίδια όσο και τα ριβονουκλεοτίδια περιέχουν microια 5rsquo-φωσφορική οmicroάδα
N
N
N
N
1
234
56
78
9
N
N
N
N
NH2
N
N
N
NH
NH2
O
N
N
3
216
54
N
NH
O
O
H3C
NH
O
NH2
K˘UgraveOcircUcircrsaquoOacuteEuml (C)
pound˘IgraversaquoOacuteEuml (T)
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEuml (A)
degOcirc˘middotOacutersaquoOacuteEuml (G)
DNA RNA
BiquestUcircAcircEgrave˜ ˘UacuteEgraveIgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml˜ BiquestUcircAcircEgrave˜ Ocirc˘UacutersaquoOacuteEuml˜
H
N
DNA RNA
MfiOacuteOcircDNA
Εικόνα 39 ∆οmicroές των βάσεων του DNA και του RNA ∆εν παρατίθεταιστην εικόνα η ουρακίλη (U) της οποίας η δοmicroή είναι όmicroοια microε της θυmicroίνηςmicroε τη microόνη διαφορά ότι στερείται της microεθυλοmicroάδας στον C-5 Παρατηρήστετο σύστηmicroα αρίθmicroησης των δακτυλίων Κατά την ένωση τους microε τον άνθρα-κα 1rsquo του φωσφοσακχάρου για τον σχηmicroατισmicroό νουκλεοτιδίου (Εικόνα 38)οι βάσεις πυριmicroιδίνης συνδέονται microέσω του N-1 του δακτυλίου και οι βάσειςπουρίνης microέσω του N-9
TUacuteEgraveEcircˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcirclsaquo middotpermilAcircOacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot OacuteOcirc˘IcircIumlAcircOcircUgraversaquopermilEgraveOcirc)
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi˜AcircUcircUgravecurrenUacutemiddot˜
N-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
OHOCH2 OH
HH
H
H
OHOH
PEgravesbquofi˙Euml
N N
NN
NH2
+
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEuml
OHOCH2
OHOH
N N
NN
NH2
ApermilAcircOacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot˜ OacuteOcirc˘IcircIumlAcircOcirc˙rsaquoUgraveEuml˜)
3 PO43ndash
OCH2
OHOH
N N
NN
NH2
OPOPOPndashO
O
Ondash
O
Ondash
O
Ondash
ordmˆUcircEcircOcirc-middotOacute˘permilUacutersaquoUgraveEuml˜
H H
H
H
H
H
H H H
~ ~65
4 32
178
9
65
4 32
178
9
65
4 32
178
9
Eικόνα 310 Συστατικά ενός σηmicroαντικού νουκλεοτιδίου της τριφω-σφορικής αδενοσίνης Η ενέργεια υδρόλυσης του φωσφοανυδριτικού δεσmicroού(κυmicroατιστές παύλες) είναι microεγαλύτερη από αυτήν του φωσφορικού εστέραγεγονός που η σηmicroασία του θα γίνει αντιληπτή στο Κεφάλαιο 5 (f Tmicroήmicroα58)
- - - (f 58) L - $- (f 57) 13 (f
515) 13 $ - 7 $ $ -
Nουκλεϊκά οξέα
Q 7 $ - - ( 311)
$ - 3 ( 3acute) 5 (5acute) (- 311) = F $$13
= DNA RNA - 0 13 DNA RNA - 0 - (f 7) DNA - RNA
35 ΝΟΥΚΛΕΪΚΑ ΟΞΕΑ 55
paraAcircUacuteEgraveOcircmacrlsaquo UcircDagger˙Acirc˘IacuteEuml˜Ucirc˘IgraveIumlEumlUacuteˆIgravemiddotUgraveEgraveIcircOgraveOacutesbquoiquestUcircAcircˆOacute
A˙ˆUgraveOcircDaggermacrOcirc˜ sbquoiquestUcircEumlUcirc˘OacutepermilAcircpermilAcircIgravecurrenOacuteEuml UcircUgraveEuml ıcurrenUcircEuml 1atilde
H H
H2C BiquestUcircEumlO
O3atilde
1atilde
2atilde
5atilde
5atilde
5atilde
5 3
3atilde
3atilde
3atilde
3atilde 5atilde
P OndashO
H H H
H
H
H2C BiquestUcircEumlO
O
O
H H H
H
H
O
O
(i)
(ii)
poundcurrenUcircEuml 5atilde
P OndashO
O
P OndashO
O
centAcircOcircIacute˘UacuteEgravesbquofi˙Euml
paraUacuteˆUgraveOcircUgravemiddotAacutelsaquo˜permilOcircIgravelsaquo
centAcirc˘UgraveAcircUacuteOcircUgravemiddotAacutelsaquo˜permilOcircIgravelsaquo
poundcurrenUcircEuml 3atilde
(middot)
(sbquo)
A
C G
G C
C G
C G
A U
(Aacute)
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi
A GG CC T T A
T CC GG A A T
C C A U C GA CG U G A
C C U C G GC GG A C A
C
BiquestUcircEumlH2C
5atilde
4atilde
H
HcentAcircUcircIgraveOcircrsaquo˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘
ordmˆUcircEcircOcircpermilEgraveAcircUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 311 DNA και RNA (α) ∆οmicroή microέρους microιας αλυσίδας DNA Οι αζωτούχες βάσεις microπορεί να είναι αδενίνη γουανίνη κυτοσίνη ή θυmicroίνη Στο RNAυπάρχει microια οmicroάδα ndashOH στον άνθρακα 2rsquo της πεντόζης (βλ Εικόνα 38) και ουρακίλη αντί της θυmicroίνης (β) Απλουστευmicroένο σχήmicroα της δοmicroής του DNA όπουαπεικονίζονται microόνον οι αζωτούχες βάσεις Παρατηρήστε ότι οι δύο αλυσίδες (κλώνοι DNA) είναι συmicroπληρωmicroατικές ως προς την ακολουθία βάσεων (A=T GintC)και συνδέονται microε δεσmicroούς υδρογόνου που σχηmicroατίζονται microεταξύ αυτών των βάσεων Οι δύο κλώνοι DNA απεικονίζονται microε πράσινο χρώmicroα σε δύο διαφορετι-κούς τόνους σκίασης χρωmicroατική σύmicroβαση που εφαρmicroόζεται σε όλο το βιβλίο (γ) RNA (i) πρωτοταγής δοmicroή (ii) πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή Στο RNAσχηmicroατίζονται δευτεροταγείς δοmicroές όταν παρουσιάζονται δυνατότητες για ενδοmicroοριακή ζεύξη βάσεων δηλ για ζεύξη βάσεων της ίδιας αλυσίδας Σε ορισmicroέναπολύ microεγάλα microόρια RNA όπως πχ στο ριβοσωmicroατικό RNA (f Τmicroήmicroατα 715 και 114) άλλες περιοχές του microορίου έχουν microόνο πρωτοταγή δοmicroή και άλλεςτόσο πρωτοταγή όσο και δευτεροταγή δοmicroή Αυτό οδηγεί σε microόρια microε τελικό τριδιάστατο σχήmicroα που είναι καθοριστικό για τη λειτουργία τους και εmicroπεριέχειεκτενείς περιελίξεις ή συσπειρώσεις (f Εικόνα 118γ) Το RNA απεικονίζεται microε πορτοκαλί χρώmicroα χρωmicroατική σύmicroβαση που διατηρείται σε όλο το βιβλίο
$ 1313 -
DNA
DNA DNA - $ -$ (13 32) - - $ (G) (C) $ (A) (T) (13 32) $ $ 13 A T G C DNA - 13 0 G - C T A ( 311)
RNA
$ 137$ S RNA $ 13 - amp 13 - RNA 1313 ( 311)
RNA 13 $ RNA (messenger RNAmRNA) DNA 13- DNA $ RNA (transfer RNA tRNA) - 7 -- -$ 7 - RNA (ribosomal RNA rRNA) 13 7 0 RNA $ - 7 11
35 Έλεγχος εννοιών
7 $ - 13 - RNA DNA RNA
-
13 $ 1313
RNA
36 Tα αmicroινοξέα και ο πεπτιδικός δεσmicroός
$ 7- $ - $ 21 $ 0 $ - (ndashCOOH) (ndashNH2) (- 31 312) amp - $ 13-$ $ - $ ( ) -13 13 - 6 ( 313)
0 $ - 312 ( ROslash 312) - -- 13$13 13 13$ ( ) ( $ ) (- 312) $ 13 - $ - laquoraquo$ 312 = - - 13$ $ $ $ $ L $ 13 - $ = 6 - (ndashSH) -$ - (RndashSndashSndashR) F - $ $ 7 - 13
Iσοmicroερή
amp
56 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
$ Louis Pasteur 13 -F (f 15) 13 = Pasteur F $ ( 314) $ 13 - ( $ )
- (f 48) X laquo- raquo $ - D
L ( 315) 13 - Dndash
$ D L 0 - 6 $ Lndash$ Dndash (- 315) Dndash$ - (f 48) 13 (f 209) Dndash$ Lndash Lndash Dndash
36 ΤΑ ΑΜΙΝΟΞΕΑ ΚΑΙ Ο ΠΕΠΤΙ∆ΙΚΟΣ ∆ΕΣΜΟΣ 57
H
CH3
CHCH3
CH3
CH2CHCH3
CH3
CHCH3
CH2CH3
CH2OHCHCH3
OH
CH2
O-O
CH2C
O
NH2
CH2C
O-O CH2
CH2C
O
CH2NH2
CH2HS
CH2S CH2CH3
CH2
CH2HO
CH2
NH
CH2CH2CH2CH2+NH3
CH2CH2CH2+NH2 N
HC
NH2CH2
HN
+HN
N
CH2H2C
H2C CH COOndash
Gly degIuml˘IcircrsaquoOacuteEuml (G)
Ala AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (A)
Val BmiddotIumlrsaquoOacuteEuml (V)
Leu sectAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (L)
Ile IUcircOcircIumlAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (I)
Ser tradeAcircUacutersaquoOacuteEuml (S)Thr poundUacuteAcircOcircOacutersaquoOacuteEuml (T)
Asp AUcircmiddotUacuteUgraveEgraveIcircfi (D)
Asn AUcircmiddotUacutemiddotAacutersaquoOacuteEuml (N)
Glu degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraveEgraveIcircfi (E)
Gln degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraversaquoOacuteEuml (Q)
Cys K˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (C)
CH2HSe Sec tradeAcircIumlEumlOacuteOcircIcirc˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (U)
Met MAcircıAcircEgraveOcircOacutersaquoOacuteEuml (M)
Phe ordmmiddotEgraveOacute˘IumlmiddotIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (F)
Tyr T˘UacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (Y)
Trp TUacute˘UgraveOcircEcirciquestOacuteEuml (W)
Lys sect˘UcircrsaquoOacuteEuml (K)
Arg AUacuteAacuteEgraveOacutersaquoOacuteEuml (R)
His IUcircUgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml (H)
Pro
centOcircIgravelsaquo UgraveˆOacute middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteEgraveIcircOgraveOacute OcircIgraveiquestpermilˆOacute
OHC
O
CR
H
NH2
AIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot
degAcircOacuteEgraveIcirclsaquo permilOcircIgravelsaquo AcircOacutefi˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenOcirc˜
(tradeEumlIgraveAcircrsaquoˆUcircEuml tradeUgraveEumlOacute AcircUacutersaquoUgraveˆUcircEuml UgraveEuml˜ UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml˜ middotAcircEgraveIcircOcircOacutersaquo˙AcircUgravemiddotEgrave OcircIumlfiIcircIumlEumlUacuteEuml Euml permilOcircIgravelsaquo fimacrEgrave IgravefiOacuteOcircOacute Euml OcircIgraveiquestpermilmiddot R H UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml permilAcircOacute AcircrsaquoOacutemiddotEgrave middotIcircUacuteEgravesbquoOgrave˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteDagger permilEgravefiUgraveEgrave UcircUgraveAcircUacuteAcircrsaquoUgravemiddotEgrave AcircIumlAcircDaggerıAcircUacuteEuml˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot˜)
H IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-fiIacuteEgraveOacuteOcirc
MEuml OcircIumlEgraveIcircfi(˘permilUacutefiEcircOcircsbquoOcirc)
C
KIumlAcircrsaquopermilmiddot
-iquestOacuteıUacutemiddotIcircmiddot˜
KmiddotUacutesbquoOcircIacute˘IumlOcircIgraveiquestpermilmiddot
paraUacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml (P)
IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-middotIumlIcircmiddotIumlEgraveIcircfi
paraOcircIumlEgraveIcircfi IgraveEuml EgraveOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc Εικόνα 312 Συντακτικοί τύποι των 21 κοινών αmicroινοξέων Αριστερά απότο όνοmicroα κάθε αmicroινοξέος δίνεται η τριγράmicromicroατη συντοmicroογραφία του και δεξιά(σε παρένθεση) η microονογράmicromicroατη συντοmicroογραφία του
H2N C C
H O
OH NH
C C
H
R2
O
OH+ H
H2O
H2N C C
H
R1
O
N C C
H
R2
O
OH
R1
H
paraAcircUgraveEgravepermilEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 313 Σχηmicroατισmicroός πεπτιδικού δεσmicroού R1 και R2 αναφέρονταιστο microεταβλητό microέρος των αmicroινοξέων (πλευρική αλυσίδα) (βλ Εικόνα 312)
(Lndash Dndash$) 13- (Dndash Lndash$)
36 Έλεγχος εννοιών
21 $ - $ 13 13 $ ( ) -6
$ - $
$ -
- $ 13 - $ -
37 Πρωτεΐνες πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή
6 - - 6 () 6
13 - (f 5 17) 6 13 - - - 6 = 7 - -
Πρωτοταγής δοmicroή
6 $ $ (-
58 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
T T
P
M M
Pbatilde b
h
n n
h
(middot) (sbquo)
Εικόνα 314 Σχεδιαγράmicromicroατα κρυστάλλων τρυγικού οξέος (C4H6O6) διάχειρός Louis Pasteur από το περίφηmicroο άρθρο του περί οπτικής ενεργότητας(α) Αριστεροχειρικός κρύσταλλος (microορφή L) (β) ∆εξιοχειρικός κρύσταλλος(microορφή D) Οι δύο κρύσταλλοι είναι κατοπτρικά είδωλα ο ένας του άλλου(δηλ εναντιοmicroερή) Τα γράmicromicroατα πάνω στις έδρες των κρυστάλλων υποδη-λώνουν τα ζεύγη εναντιοmicroερών εδρών κατά τον συmicroβολισmicroό του PasteurΓια να αναδειχθεί σαφέστερα η εναντιοmicroέρεια των κρυστάλλων έχει χρησι-microοποιηθεί έγχρωmicroη σκίαση
(sbquo)
NH2H2N
COOH
C HH2N
CH3
COO
CH
CH3
ErsaquoAcircpermilEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
COOH
C NH2
CH3
COOH
CH
CH3
H
L-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml D-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml
(Aacute)
HO
HO
HO
OH
HHO
C OHH
OH
CH2OH
O
C H
CH
H
H
CH2OH
D-degIuml˘Icircfi˙Euml L-degIuml˘Icircfi˙Euml
CO
OH
(middot)
H
CH
C
CH
HC
C
C
tradeUgraveEumlOacute UgraveUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEuml UacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo UgraveOcirc IgraveAcircOacute sbquocurrenIumlOcirc˜ ımiddot UacutecurrenAcircEgrave Oacutemiddot ıAcircˆUacuteEumlıAcircrsaquo fiUgraveEgrave IcircmiddotUgraveAcirc˘ıDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave UacuteOcirc˜ UgraveOcircOacute middotUacutemiddotUgraveEumlUacuteEumlUgravelsaquo Euml permilAcirc permilEgravemiddotIcircAcircIcircOcircIgraveIgravecurrenOacuteEuml AacuteUacutemiddotIgraveIgravelsaquo fiUgraveEgrave middotOcircIgravemiddotIcircUacuteDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave middotfi middot˘UgravefiOacute
bC C
a
c c
a
d db
TUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
Εικόνα 315 Ισοmicroερή (α) Υπόδειγmicroα ζεύγους κατοπτρικών ειδώλων(β) Εναντιοmicroερή γλυκόζης (γ) Εναντιοmicroερή του αmicroινοξέος αλανίνη Παρατη-ρήστε ότι όπως και να περιστραφούν οι τριδιάστατες προβολές των microορίωνοι δύο microορφές L και D είναι αδύνατον να συmicroπέσουν
313) $ $ - 13 $ 13 0 $ - $ 13 6 - $ 6 6 6 15 $ 6 10000 -$ 6 $ 7 ( )
= $ - 13 = - 13 13 + - 13 13
∆ευτεροταγής δοmicroή
= $ R $ 13 13 6( 316) ( 31) - 6 M - - - 7 - (316) gt $ $ = ( - ) - - ( 316)
M - 1313 - $ (- 316)
- - - -
37 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ΠΡΩΤΟΤΑΓΗΣ ΚΑΙ ∆ΕΥΤΕΡΟΤΑΓΗΣ ∆ΟΜΗ 59
(middot)
(sbquo)
CC C
C
CC
C C
C
C
C
C
CCC
C C C
C
C
CC C
CC C
C
C
C
CC
CC
C
CC CC
C C
CC
C
C
C C
CC C
CC
C
CC
C C
CC
CCCC
C C
CC CC
C C
C
O
O
O O O
O
O
O O O
O
O O
O
O O
O
OO
O
OO
O
O O
O
O
O O
O
O O
OO
OO
RR
R R
R
RR R R
R R R
RRR
R R R
RRR
R R R
R R R
RR
RR
RR
R
R
H
HH
HH
HHH H
H
H HH
H
H
H
H
H H
H
H H
H
H H
H
H H
H
HH
H
H
H
HHHH
HH
H
HH
HH
HH
HH
HH
HH
NN
NN
NN
NN
N
N
N N
N
NN
N
N N
N
N N
N
NN
N
NN
N
N N
N
N
NNNN
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger AacuteAcircEgraveUgraveOcircOacuteEgraveIcircOgraveOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger middotOcircIgravemiddotIcircUacute˘UcircIgravecurrenOacuteˆOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
Εικόνα 316 ∆ευτεροταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων (α) ∆ευτεροταγήςδοmicroή α-έλικας Παρατηρήστε ότι οι δεσmicroοί υδρογόνου σχηmicroατίζονται microετα-ξύ ατόmicroων των πεπτιδικών δεσmicroών χωρίς τη συmicromicroετοχή των οmicroάδων R (β)∆ευτεροταγής δοmicroή β-πτυχωτής επιφάνειας
13 - - - 13 6 - - - (13 317)amp 13 13(domains) - $ 7-
38 Πρωτεΐνες δοmicroές υψηλότερης τάξης και αποδιάταξη
+ - $ - = 13 6 0 - - 13 S $ - - - 13 -
$ 13 - - ( 317)
(ndashSH) 6 amp ndashSH - $ $ amp 6 -6 $ ( 317) $- 6 = - - ( 317 318) - ( - ) (f 55)
A 6 - 13 6 - 7 7 - 13 ( 318) 6 +-
60 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot B
(middot) IOacuteUcircOcirc˘IumlrsaquoOacuteEuml (sbquo) PEgravesbquoOcircOacuteOcirc˘IcircIumlAcirciquestUcircEuml
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot A
-currenIumlEgraveIcircmiddot
-Ugrave˘macrˆUgravelsaquoAcircEgraveEcirciquestOacuteAcircEgravemiddot
Εικόνα 317 Τριτοταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων που υποδεικνύει και τιςθέσεις εντοπισmicroού περιοχών microε δευτεροταγή δοmicroή α-έλικας ή β-πτυχωτήςεπιφάνειας (α) Ινσουλίνη microια πρωτεΐνη που έχει δύο πολυπεπτιδικές αλυ-σίδες (f Τmicroήmicroα 319) παρατηρήστε ότι η αλυσίδα Β περιέχει δοmicroές α-έλικας αλλά και β-πτυχωτής επιφάνειας και ότι οι δισουλφιδικοί δεσmicroοί(κυανό χρώmicroα) συντελούν στον καθορισmicroό της τελικής αναδίπλωσης (τριτο-ταγούς δοmicroής) (β) Ριβονουκλεάση microια microεγάλη πρωτεΐνη microε αρκετές περιο-χές α-έλικας και β-πτυχωτής επιφάνειας
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜ 13
Εικόνα 318 Τεταρτοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης Υπάρχουν δύο είδηπολυπεπτιδίων στην αιmicroοσφαιρίνη αλυσίδες α (κυανό και κόκκινο χρώmicroα)και αλυσίδες β (πορτοκαλί και κίτρινο χρώmicroα) και συνολικά 4 πολυπεπτίδιαστο τελικό πρωτεϊνικό microόριο (εδώ τα laquoαraquo και laquoβraquo αναφέρονται σε ονοmicroασίεςπολυπεπτιδικών αλυσίδων και όχι σε είδη δευτεροταγούς δοmicroής) Η τεταρ-τοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης συmicroβολίζεται ως α2 β2 Οι 4 διακριτές αλυ-σίδες απεικονίζονται microε 4 διαφορετικά χρώmicroατα
6 - ( 6 13) - $ ( van der Waals 13 ) ( - $ )
Aποδιάταξη (microετουσίωση)
0 6 - pH - 13 ( 319) =$ 13 - 6 - ( 313) + $ F $ - - (-) amp $ $ ( 319) S 13 6 13 - ( 1313 ) - - $ 1313-13 13
= $ 7 - 7 13 - 0 20 - 6 - amp - - $ 13
Tα επόmicroενα κεφάλαια
amp - 4
- - 13 - 5 13 13 amp - 4 5 $ 13- (f 12) $ $- 0 $ ( 6)
M 1313 - 3 13
38 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ∆ΟΜΕΣ ΥΨΗΛΟΤΕΡΗΣ ΤΑΞΗΣ ΚΑΙ ΑΠΟ∆ΙΑΤΑΞΗ 61
lozEgravemiddotmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(Ocirc˘Uacutersaquomiddot)
ŒOacuteUgraveOcircOacuteEumlmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(100AEligC)
AOcircIgraveiquestIcircUacute˘OacuteUcircEumlOcirc˘Uacutersaquomiddot˜Oslash OacutecurrenmiddotAcircOacuteAcircUacuteAacuteOcircOcircrsaquoEumlUcircEuml
aeligDaggerIacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜ AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
Εικόνα 319 Aποδιάταξη (microετουσίωση) της πρωτεΐνης ριβονουκλεάση(της οποίας η δοmicroή δίνεται στην Εικόνα 317β) Παρατηρήστε πώς οι έντο-νες συνθήκες αποδιάταξης οδηγούν σε ένα οριστικά κατεστραmicromicroένο microόριο(ως προς τη βιολογική λειτουργία του) λόγω εσφαλmicroένης αναδίπλωσης
amp - $ - $ - - F - 13 7 7 $ 13 $ 13 13 -13
37 και 38 Έλεγχος εννοιών
= 6 - $ 6
( ) ( F- $)
1313 7
13 13amp -
6 - - -
F 13 -6 1313136
F $ 6 $ $ 7
62 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
Eρωτήσεις επανάληψης
- $
7 RNA DNA - amp $ RNA DNA DNA RNA
8 amp F $ R 7 $ 13amp -7
9 $ -$ - (Y13 13 313)
10 Z (13 31) -
1 -13 13 $
2 $
3 13 ((13- 13 31)
4 amp13 $ 13 13 amp 13- -
5 amp -
6 $ - 37
Eρωτήσεις εφαρmicroογής
1 RNA () GUCAAAGAC (13) ACGAUAACC+ RNA - amp
2 () -6 F 13 -$ 13 -6
3 Halobacterium A 13 - (K+) 5 M 5- F K+ - 6 Haloba-cterium F $ 6 Escherichia coli 13-
ΕΡΩΤΗΣΕΙΣ ΕΦΑΡΜΟΓΗΣ 63
K+ $ (-13 $ $- 13 K+
4 6 -- 6 - amp-
5 0 13 13 - - F
13- 13
6 M rsquo F 5 1313 - 13 ( $) laquo- 13raquo 6 6 13
33) - - 0 13 - ( ) -
Tο νερό ως βιολογικός διαλύτης
laquo13raquo - 13 O - $ 13 13-
= - 13 0 - 4 $ - - 13 (f 46 47) - - $ (32) 13 - 13 = F - - (13) $ E 13 - $
- F - - - ( 32) - = 13 1313 13 13 ( - F 1degC) $ () 13- 13 - - $
F 13 13
= 13 13 (- - 610 13) A - 13 ( 32)
50 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
(middot) paraUacuteˆUgraveAcirc˝OacuteAcirc˜
(sbquo) NOcirc˘IcircIumlAcirc˚Icirciquest OcircIacutecurrenmiddot
(Aacute) paraOcircIuml˘UcircmiddotIcircmacrmiddotUacutersaquoUgraveAcirc˜
(permil) sectEgraversaquopermilEgravemiddot
AOcircıEumlIcircAcirc˘UgraveEgraveIcirciquestIcircOcircIcircIcircrsaquomiddot
MmiddotUcircUgraversaquoAacuteEgraveOcircMAcircIgravesbquoUacuteiquestOacuteEuml TOcircrsaquomacrˆIgravemiddot
K˘UgraveUgravemiddotUacutefiIumlmiddotUcircIgravemiddot
PEgravesbquoOcircUcircOgraveIgravemiddotUgravemiddotpara˘UacuteEumlOacuteOcircAcircEgravepermilcurren˜
Εικόνα 33 Θέσεις των microακροmicroορίων microέσα στο κύτταρο (α) Πρωτεΐνες(καφέ χρώmicroα) απαντούν σε όλη την έκταση του κυττάρου είτε ως microέρη κυτ-ταρικών δοmicroών είτε ως ένζυmicroα (β) Νουκλεϊκά οξέα DNA (πράσινο χρώmicroα)απαντά στο πυρηνοειδές των προκαρυωτικών κυττάρων και στον πυρήνα τωνευκαρυωτικών κυττάρων RNA (πορτοκαλί χρώmicroα) απαντά στο κυτταρόπλασmicroα(mRNA tRNA) και στα ριβοσώmicroατα (rRNA) (γ) Πολυσακχαρίτες (κίτρινοχρώmicroα) υπάρχουν στο κυτταρικό τοίχωmicroα και ενίοτε σε εσωτερικά αποθη-κευτικά κοκκία (δ) Λιπίδια (κυανό χρώmicroα) απαντούν στην κυτταροπλασmicroατι-κή microεmicroβράνη στο κυτταρικό τοίχωmicroα και σε αποθηκευτικά κοκκία Οχρωmicroατικός κώδικας που χρησιmicroοποιείται εδώ θα εφαρmicroοσθεί για την απει-κόνιση των 4 τύπων microακροmicroορίων σε όλο το βιβλίο Για το DNA βλ επίσηςτη λεζάντα της Εικόνας 311
32 Έλεγχος εννοιών
= - 6 7 $ (DNA RNA) - - 13
RNA - $
+ F 13
I I ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑamp 32 $
33 Πολυσακχαρίτες
13 () $ - 121 - C6H12O6 ( 34)+ 13 - 4 5 6 7 ( C4 C5 C6 C7) amp C5 () 7 $- C6 ($) - - 34 -
$ = 13- 13 (f 48) - ( 35) $ - 1313- 13 (13 36) $ -
O γλυκοζιτικός δεσmicroός
( ) 13 ( 36)0 () - = - - - -
33 ΠΟΛΥΣΑΚΧΑΡΙΤΕΣ 51
MED
IA T
UTO
RIAL
MED
IA T
UTO
RIAL
Mac
rom
olec
ules
centOcircIgraveEgraveIcircfi˜UcircIcircAcircIumlAcircUgravefi˜RNA
centOcircIgraveEgraveIcircfi˜UcircIcircAcircIumlAcircUgravefi˜DNA
paraEumlAacutelsaquoAcircOacutecurrenUacuteAacuteAcircEgravemiddot˜Icirc˘UgraveUgravemiddotUacuteEgraveIcirciquestUgraveOcircEgravemacrOgraveIgravemiddotUgravemiddot
paraEumlAacutelsaquoAcircOacutecurrenUacuteAacuteAcircEgravemiddot˜UcirciquestIcircmacrmiddotUacuteOcircEcircUacuteOcircDaggerUgraveˆOacute
ordmUacuteOcirc˘IcircUgravefi˙Euml
tradeiquestIcircmacrmiddotUacuteOcirc AOacuteOcircEgraveIcircUgravelsaquo middotIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot centmiddotIcircUgraveDaggerIumlEgraveOcirc˜ PfiIumlOcirc˜
1
23
4
5
PEgravesbquofi˙Euml
paraAcircOacuteUgravefi˙Acirc˜
centAcircOcircIacute˘UacuteEgravesbquofi˙Euml
degIuml˘Icircfi˙Euml
EIacutefi˙Acirc˜
H
H
H
H
HH H
H
H
H H
H
H
HH
H
HH
H
H
H
H
H HH
H
H
H
H
H
H
H
HH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OHOH
OH
C
C
C
C
C
C C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C C
C
C
C C
C
C
C
C C
C
C
C
C
C
OO
O
O
O O
OO
CH2OH
HOCH2
HOCH2
HOCH2
HOCH2
CH2OH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
HO
HO
HO
1
23
4
51
2
3
4
5
1
2
3
4
5
1
2
3
4
5
6
1
2
3
4
5
6
1
23
4
5
6
5
6
4 3
2
1
Εικόνα 34 Συντακτικοί τύποι ορισmicroένων κοινών σακχάρων Τα σάκχα-ρα αναπαρίστανται microε δύο εναλλακτικούς τρόπους ανοικτής αλυσίδας καιδακτυλίου Η microορφή της ανοικτής αλυσίδας είναι περισσότερο ευανάγνωστηαλλά συνηθέστερα χρησιmicroοποιείται η microορφή του δακτυλίου Σηmicroειώστε τοντρόπο αρίθmicroησης των θέσεων του δακτυλίου
TOcirc iquestUgraveOcircIgraveOcirc NmiddotOacuteUgraveEgraveIcircmiddotıEgraveUcircUgraveiquest currenOacutemiddotiquestUgraveOcircIgraveOcirc O UgraveOcirc˘ UcircmiddotIcircmacriquestUacuteOcirc˘
AIcircAcircUgrave˘IumlOcircIgraveiquestpermilmiddotHC
O
CH N
H
C
O
CH3
C HHO
C OHH
C OHH
CH2OH
CH2OH
O
HHOH
H
HO
H NH
C O
CH3
OH2
1
3
4
5
6
1
23
4
5
6
Εικόνα 35 Ν-ακετυλογλυκοζαmicroίνη ένα παράγωγο σακχάρου
- - - ( 36) 13 - $ 1 4 - ( Oslash - 36) - 13 amp -14 (36) - - - - (- -) $ 6 13 amp - 13 -- - $ 13 - $ - Gram 13- - ( 49)
33 Έλεγχος εννοιών
$ - - (- -) - 6
- - 100
34 Λιπίδια
-13 amp 13 (f 45) $ - 13 ( 37) $ 16 15 - ( ) 13$ L
52 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
O
CH2OH
H
H
OH
OH
H
H
HO
H
O
CH2OH
H
OHH
OH
OH
H
HH
O
OtildeIgrave˘IumlOcirc
degIuml˘IcircOcircAacutefiOacuteOcirc
K˘UgraveUgravemiddotUacutersaquoOacuteEuml
(sbquo)
(middot)
O
CH2OH
H
H
OH
OH
H
H
HO
H
OH
O
CH2
H
H
OH
OH
H
HH
O
HO
O
CH2OH
HH
OH
OH
H
H
HO
HOH
O
CH2OH
HH
OH
OH
H
HH
O
middot-14-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
middot-16-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
sbquo-14-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-14
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-16
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo sbquo-14
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-14
1
23
4
5
6
1
23
4
5
6
1
23
4
5
6
Εικόνα 36 Πολυσακχαρίτες (α) ∆οmicroές διαφόρων γλυκοζιτικών δεσmicroώνΣηmicroειώστε ότι microπορεί να ποικίλλουν τόσο η σύνδεση όσο και η γεωmicroετρία (α-ή β-) του δεσmicroού (β) ∆οmicroές ορισmicroένων κοινών πολυσακχαριτών Συγκρίνετετον χρωmicroατικό κώδικα microε το (α)
$ 14 20 ( 37)
Tριγλυκερίδια και σύνθετα λιπίδια
() $ 13 ( 37)
13 $
- ( 37) $$13 - 13 13 (f 45)
13 13 13- $ ()13 13 (f 45) - 13 -13 $
34 Έλεγχος εννοιών
13 - 13
$ 13
13 13 $
$ 4 (C4)
35 Nουκλεϊκά οξέα
7 $ $137 (DNA) 137 (RNA) 13 -13 DNA - RNA - - $ 6 M - 5 13 ( RNA)
35 ΝΟΥΚΛΕΪΚΑ ΟΞΕΑ 53
MOcircOacuteOcircAacutemiddotIumlmiddotIcircUgraveOcirc˙˘IumlOcircpermilEgraveAacuteIuml˘IcircAcircUacutersaquopermilEgraveOcirc(currenOacutemiddot AacuteIuml˘IcircOcircIumlEgraversaquopermilEgraveOcirc)
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot Ucirc˘OacutepermilAcircpermilAcircIgravecurrenOacutemiddot IgraveAcirc AacuteIuml˘IcircAcircUacutefiIumlEumlIgravecurrenUcircˆ AcircUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircOcircDagger permilAcircUcircIgraveOcircDagger
OH
OH
OH
H3CKOcircUacuteAcircUcircIgravecurrenOacuteOcirc C16 (middotIumlIgraveEgraveUgraveEgraveIcircfi)
MOcircOacuteOcircmiddotIcircfiUacuteAcircUcircUgraveOcirc C16 (middotIumlIgraveEgraveUgraveAcircIumlmiddot˚Icircfi)
C OH
O
CH3 C OH
O
H3CC O
O
H3CC O
OC
C
H
H
H
O C H
H
O
CH2OH
degmiddotIumlmiddotIcircUgravefi˙Euml
H3CC O
O
H3CC O
OC
C
H
H
H
P O
O
C H
H
ndashO
O
CH2
CH2+NH3
AEgraveımiddotOacuteOcircIumlmiddotIgraversaquoOacuteEuml
H3CC O
O
C H
H3CC O
O
C H
H3CC O
O
C H
H
H
KOcircEgraveOacuteiquest IumlEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
tradeDaggerOacuteıAcircUgraveOcirc IumlEgraversaquopermilEgraveOcirc
AIumliquest IumlEgraversaquopermilEgravemiddot (UgraveUacuteEgraveAacuteIuml˘IcircAcircUacutersaquopermilEgravemiddot)
tradeDaggerOacuteıAcircUgraveOcirc IumlEgraversaquopermilEgraveOcircordmˆUcircEcircmiddotUgraveEgravepermil˘IumlOcircmiddotEgraveımiddotOacuteOcircIumlmiddotIgraversaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot EcircˆUcircEcircOcircIumlEgraversaquopermilEgraveOcirc)
degIuml˘IcircAcircUacutefiIumlEuml
12
3546
78
910
1112
1314
1516
23
4
5
6
1
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
EUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi
Εικόνα 37 Λιπαρά οξέα απλά λιπίδια (λίπη) και σύνθετα λιπίδια Απλάλιπίδια σχηmicroατίζονται microε microια αντίδραση αφυδάτωσης microεταξύ λιπαρών οξέωνκαι γλυκερόλης η οποία δηmicroιουργεί εστερικό δεσmicroό
$13 ( DNA) 13 PO4
3ndash = - DNA RNA - 38
Nουκλεοτίδια
13 7 $ - 13 13 (
) 13 - $ ( 39) = DNA RNA = ( $-) DNA RNA 13 () -$ C-1 N 13 13 1 ( ) 9 ( -) amp - 13 - ( 310)
13 7 $ 5 ATP ( ) ( 310) -
54 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi P
O
Ondash
OndashO
C C
O BiquestUcircEuml
OH
H HHH C
OH PEgravesbquofi˙Euml
5atilde
4atilde
3atilde 2atilde1atilde
C
CH2
Εικόνα 38 Νουκλεοτίδια Εδώ απεικονίζεται ένα ριβονουκλεοτίδιο πουαπαντά στο RNA Τα δεοξυριβονουκλεοτίδια που απαντούν στο DNA έχουνστον άνθρακα 2rsquo ένα άτοmicroο H αντί της οmicroάδας ndashOH Η αρίθmicroηση των θέσε-ων του σακχάρου γίνεται microε τονούmicroενους αριθmicroούς για να διακρίνεται από τηναρίθmicroηση των θέσεων του δακτυλίου της αζωτούχου βάσης οι οποίες επί-σης αριθmicroούνται (1 2 3 κλπ) (βλ Εικόνα 39) Τόσο τα δεοξυριβονου-κλεοτίδια όσο και τα ριβονουκλεοτίδια περιέχουν microια 5rsquo-φωσφορική οmicroάδα
N
N
N
N
1
234
56
78
9
N
N
N
N
NH2
N
N
N
NH
NH2
O
N
N
3
216
54
N
NH
O
O
H3C
NH
O
NH2
K˘UgraveOcircUcircrsaquoOacuteEuml (C)
pound˘IgraversaquoOacuteEuml (T)
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEuml (A)
degOcirc˘middotOacutersaquoOacuteEuml (G)
DNA RNA
BiquestUcircAcircEgrave˜ ˘UacuteEgraveIgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml˜ BiquestUcircAcircEgrave˜ Ocirc˘UacutersaquoOacuteEuml˜
H
N
DNA RNA
MfiOacuteOcircDNA
Εικόνα 39 ∆οmicroές των βάσεων του DNA και του RNA ∆εν παρατίθεταιστην εικόνα η ουρακίλη (U) της οποίας η δοmicroή είναι όmicroοια microε της θυmicroίνηςmicroε τη microόνη διαφορά ότι στερείται της microεθυλοmicroάδας στον C-5 Παρατηρήστετο σύστηmicroα αρίθmicroησης των δακτυλίων Κατά την ένωση τους microε τον άνθρα-κα 1rsquo του φωσφοσακχάρου για τον σχηmicroατισmicroό νουκλεοτιδίου (Εικόνα 38)οι βάσεις πυριmicroιδίνης συνδέονται microέσω του N-1 του δακτυλίου και οι βάσειςπουρίνης microέσω του N-9
TUacuteEgraveEcircˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcirclsaquo middotpermilAcircOacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot OacuteOcirc˘IcircIumlAcircOcircUgraversaquopermilEgraveOcirc)
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi˜AcircUcircUgravecurrenUacutemiddot˜
N-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
OHOCH2 OH
HH
H
H
OHOH
PEgravesbquofi˙Euml
N N
NN
NH2
+
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEuml
OHOCH2
OHOH
N N
NN
NH2
ApermilAcircOacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot˜ OacuteOcirc˘IcircIumlAcircOcirc˙rsaquoUgraveEuml˜)
3 PO43ndash
OCH2
OHOH
N N
NN
NH2
OPOPOPndashO
O
Ondash
O
Ondash
O
Ondash
ordmˆUcircEcircOcirc-middotOacute˘permilUacutersaquoUgraveEuml˜
H H
H
H
H
H
H H H
~ ~65
4 32
178
9
65
4 32
178
9
65
4 32
178
9
Eικόνα 310 Συστατικά ενός σηmicroαντικού νουκλεοτιδίου της τριφω-σφορικής αδενοσίνης Η ενέργεια υδρόλυσης του φωσφοανυδριτικού δεσmicroού(κυmicroατιστές παύλες) είναι microεγαλύτερη από αυτήν του φωσφορικού εστέραγεγονός που η σηmicroασία του θα γίνει αντιληπτή στο Κεφάλαιο 5 (f Tmicroήmicroα58)
- - - (f 58) L - $- (f 57) 13 (f
515) 13 $ - 7 $ $ -
Nουκλεϊκά οξέα
Q 7 $ - - ( 311)
$ - 3 ( 3acute) 5 (5acute) (- 311) = F $$13
= DNA RNA - 0 13 DNA RNA - 0 - (f 7) DNA - RNA
35 ΝΟΥΚΛΕΪΚΑ ΟΞΕΑ 55
paraAcircUacuteEgraveOcircmacrlsaquo UcircDagger˙Acirc˘IacuteEuml˜Ucirc˘IgraveIumlEumlUacuteˆIgravemiddotUgraveEgraveIcircOgraveOacutesbquoiquestUcircAcircˆOacute
A˙ˆUgraveOcircDaggermacrOcirc˜ sbquoiquestUcircEumlUcirc˘OacutepermilAcircpermilAcircIgravecurrenOacuteEuml UcircUgraveEuml ıcurrenUcircEuml 1atilde
H H
H2C BiquestUcircEumlO
O3atilde
1atilde
2atilde
5atilde
5atilde
5atilde
5 3
3atilde
3atilde
3atilde
3atilde 5atilde
P OndashO
H H H
H
H
H2C BiquestUcircEumlO
O
O
H H H
H
H
O
O
(i)
(ii)
poundcurrenUcircEuml 5atilde
P OndashO
O
P OndashO
O
centAcircOcircIacute˘UacuteEgravesbquofi˙Euml
paraUacuteˆUgraveOcircUgravemiddotAacutelsaquo˜permilOcircIgravelsaquo
centAcirc˘UgraveAcircUacuteOcircUgravemiddotAacutelsaquo˜permilOcircIgravelsaquo
poundcurrenUcircEuml 3atilde
(middot)
(sbquo)
A
C G
G C
C G
C G
A U
(Aacute)
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi
A GG CC T T A
T CC GG A A T
C C A U C GA CG U G A
C C U C G GC GG A C A
C
BiquestUcircEumlH2C
5atilde
4atilde
H
HcentAcircUcircIgraveOcircrsaquo˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘
ordmˆUcircEcircOcircpermilEgraveAcircUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 311 DNA και RNA (α) ∆οmicroή microέρους microιας αλυσίδας DNA Οι αζωτούχες βάσεις microπορεί να είναι αδενίνη γουανίνη κυτοσίνη ή θυmicroίνη Στο RNAυπάρχει microια οmicroάδα ndashOH στον άνθρακα 2rsquo της πεντόζης (βλ Εικόνα 38) και ουρακίλη αντί της θυmicroίνης (β) Απλουστευmicroένο σχήmicroα της δοmicroής του DNA όπουαπεικονίζονται microόνον οι αζωτούχες βάσεις Παρατηρήστε ότι οι δύο αλυσίδες (κλώνοι DNA) είναι συmicroπληρωmicroατικές ως προς την ακολουθία βάσεων (A=T GintC)και συνδέονται microε δεσmicroούς υδρογόνου που σχηmicroατίζονται microεταξύ αυτών των βάσεων Οι δύο κλώνοι DNA απεικονίζονται microε πράσινο χρώmicroα σε δύο διαφορετι-κούς τόνους σκίασης χρωmicroατική σύmicroβαση που εφαρmicroόζεται σε όλο το βιβλίο (γ) RNA (i) πρωτοταγής δοmicroή (ii) πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή Στο RNAσχηmicroατίζονται δευτεροταγείς δοmicroές όταν παρουσιάζονται δυνατότητες για ενδοmicroοριακή ζεύξη βάσεων δηλ για ζεύξη βάσεων της ίδιας αλυσίδας Σε ορισmicroέναπολύ microεγάλα microόρια RNA όπως πχ στο ριβοσωmicroατικό RNA (f Τmicroήmicroατα 715 και 114) άλλες περιοχές του microορίου έχουν microόνο πρωτοταγή δοmicroή και άλλεςτόσο πρωτοταγή όσο και δευτεροταγή δοmicroή Αυτό οδηγεί σε microόρια microε τελικό τριδιάστατο σχήmicroα που είναι καθοριστικό για τη λειτουργία τους και εmicroπεριέχειεκτενείς περιελίξεις ή συσπειρώσεις (f Εικόνα 118γ) Το RNA απεικονίζεται microε πορτοκαλί χρώmicroα χρωmicroατική σύmicroβαση που διατηρείται σε όλο το βιβλίο
$ 1313 -
DNA
DNA DNA - $ -$ (13 32) - - $ (G) (C) $ (A) (T) (13 32) $ $ 13 A T G C DNA - 13 0 G - C T A ( 311)
RNA
$ 137$ S RNA $ 13 - amp 13 - RNA 1313 ( 311)
RNA 13 $ RNA (messenger RNAmRNA) DNA 13- DNA $ RNA (transfer RNA tRNA) - 7 -- -$ 7 - RNA (ribosomal RNA rRNA) 13 7 0 RNA $ - 7 11
35 Έλεγχος εννοιών
7 $ - 13 - RNA DNA RNA
-
13 $ 1313
RNA
36 Tα αmicroινοξέα και ο πεπτιδικός δεσmicroός
$ 7- $ - $ 21 $ 0 $ - (ndashCOOH) (ndashNH2) (- 31 312) amp - $ 13-$ $ - $ ( ) -13 13 - 6 ( 313)
0 $ - 312 ( ROslash 312) - -- 13$13 13 13$ ( ) ( $ ) (- 312) $ 13 - $ - laquoraquo$ 312 = - - 13$ $ $ $ $ L $ 13 - $ = 6 - (ndashSH) -$ - (RndashSndashSndashR) F - $ $ 7 - 13
Iσοmicroερή
amp
56 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
$ Louis Pasteur 13 -F (f 15) 13 = Pasteur F $ ( 314) $ 13 - ( $ )
- (f 48) X laquo- raquo $ - D
L ( 315) 13 - Dndash
$ D L 0 - 6 $ Lndash$ Dndash (- 315) Dndash$ - (f 48) 13 (f 209) Dndash$ Lndash Lndash Dndash
36 ΤΑ ΑΜΙΝΟΞΕΑ ΚΑΙ Ο ΠΕΠΤΙ∆ΙΚΟΣ ∆ΕΣΜΟΣ 57
H
CH3
CHCH3
CH3
CH2CHCH3
CH3
CHCH3
CH2CH3
CH2OHCHCH3
OH
CH2
O-O
CH2C
O
NH2
CH2C
O-O CH2
CH2C
O
CH2NH2
CH2HS
CH2S CH2CH3
CH2
CH2HO
CH2
NH
CH2CH2CH2CH2+NH3
CH2CH2CH2+NH2 N
HC
NH2CH2
HN
+HN
N
CH2H2C
H2C CH COOndash
Gly degIuml˘IcircrsaquoOacuteEuml (G)
Ala AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (A)
Val BmiddotIumlrsaquoOacuteEuml (V)
Leu sectAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (L)
Ile IUcircOcircIumlAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (I)
Ser tradeAcircUacutersaquoOacuteEuml (S)Thr poundUacuteAcircOcircOacutersaquoOacuteEuml (T)
Asp AUcircmiddotUacuteUgraveEgraveIcircfi (D)
Asn AUcircmiddotUacutemiddotAacutersaquoOacuteEuml (N)
Glu degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraveEgraveIcircfi (E)
Gln degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraversaquoOacuteEuml (Q)
Cys K˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (C)
CH2HSe Sec tradeAcircIumlEumlOacuteOcircIcirc˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (U)
Met MAcircıAcircEgraveOcircOacutersaquoOacuteEuml (M)
Phe ordmmiddotEgraveOacute˘IumlmiddotIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (F)
Tyr T˘UacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (Y)
Trp TUacute˘UgraveOcircEcirciquestOacuteEuml (W)
Lys sect˘UcircrsaquoOacuteEuml (K)
Arg AUacuteAacuteEgraveOacutersaquoOacuteEuml (R)
His IUcircUgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml (H)
Pro
centOcircIgravelsaquo UgraveˆOacute middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteEgraveIcircOgraveOacute OcircIgraveiquestpermilˆOacute
OHC
O
CR
H
NH2
AIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot
degAcircOacuteEgraveIcirclsaquo permilOcircIgravelsaquo AcircOacutefi˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenOcirc˜
(tradeEumlIgraveAcircrsaquoˆUcircEuml tradeUgraveEumlOacute AcircUacutersaquoUgraveˆUcircEuml UgraveEuml˜ UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml˜ middotAcircEgraveIcircOcircOacutersaquo˙AcircUgravemiddotEgrave OcircIumlfiIcircIumlEumlUacuteEuml Euml permilOcircIgravelsaquo fimacrEgrave IgravefiOacuteOcircOacute Euml OcircIgraveiquestpermilmiddot R H UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml permilAcircOacute AcircrsaquoOacutemiddotEgrave middotIcircUacuteEgravesbquoOgrave˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteDagger permilEgravefiUgraveEgrave UcircUgraveAcircUacuteAcircrsaquoUgravemiddotEgrave AcircIumlAcircDaggerıAcircUacuteEuml˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot˜)
H IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-fiIacuteEgraveOacuteOcirc
MEuml OcircIumlEgraveIcircfi(˘permilUacutefiEcircOcircsbquoOcirc)
C
KIumlAcircrsaquopermilmiddot
-iquestOacuteıUacutemiddotIcircmiddot˜
KmiddotUacutesbquoOcircIacute˘IumlOcircIgraveiquestpermilmiddot
paraUacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml (P)
IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-middotIumlIcircmiddotIumlEgraveIcircfi
paraOcircIumlEgraveIcircfi IgraveEuml EgraveOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc Εικόνα 312 Συντακτικοί τύποι των 21 κοινών αmicroινοξέων Αριστερά απότο όνοmicroα κάθε αmicroινοξέος δίνεται η τριγράmicromicroατη συντοmicroογραφία του και δεξιά(σε παρένθεση) η microονογράmicromicroατη συντοmicroογραφία του
H2N C C
H O
OH NH
C C
H
R2
O
OH+ H
H2O
H2N C C
H
R1
O
N C C
H
R2
O
OH
R1
H
paraAcircUgraveEgravepermilEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 313 Σχηmicroατισmicroός πεπτιδικού δεσmicroού R1 και R2 αναφέρονταιστο microεταβλητό microέρος των αmicroινοξέων (πλευρική αλυσίδα) (βλ Εικόνα 312)
(Lndash Dndash$) 13- (Dndash Lndash$)
36 Έλεγχος εννοιών
21 $ - $ 13 13 $ ( ) -6
$ - $
$ -
- $ 13 - $ -
37 Πρωτεΐνες πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή
6 - - 6 () 6
13 - (f 5 17) 6 13 - - - 6 = 7 - -
Πρωτοταγής δοmicroή
6 $ $ (-
58 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
T T
P
M M
Pbatilde b
h
n n
h
(middot) (sbquo)
Εικόνα 314 Σχεδιαγράmicromicroατα κρυστάλλων τρυγικού οξέος (C4H6O6) διάχειρός Louis Pasteur από το περίφηmicroο άρθρο του περί οπτικής ενεργότητας(α) Αριστεροχειρικός κρύσταλλος (microορφή L) (β) ∆εξιοχειρικός κρύσταλλος(microορφή D) Οι δύο κρύσταλλοι είναι κατοπτρικά είδωλα ο ένας του άλλου(δηλ εναντιοmicroερή) Τα γράmicromicroατα πάνω στις έδρες των κρυστάλλων υποδη-λώνουν τα ζεύγη εναντιοmicroερών εδρών κατά τον συmicroβολισmicroό του PasteurΓια να αναδειχθεί σαφέστερα η εναντιοmicroέρεια των κρυστάλλων έχει χρησι-microοποιηθεί έγχρωmicroη σκίαση
(sbquo)
NH2H2N
COOH
C HH2N
CH3
COO
CH
CH3
ErsaquoAcircpermilEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
COOH
C NH2
CH3
COOH
CH
CH3
H
L-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml D-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml
(Aacute)
HO
HO
HO
OH
HHO
C OHH
OH
CH2OH
O
C H
CH
H
H
CH2OH
D-degIuml˘Icircfi˙Euml L-degIuml˘Icircfi˙Euml
CO
OH
(middot)
H
CH
C
CH
HC
C
C
tradeUgraveEumlOacute UgraveUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEuml UacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo UgraveOcirc IgraveAcircOacute sbquocurrenIumlOcirc˜ ımiddot UacutecurrenAcircEgrave Oacutemiddot ıAcircˆUacuteEumlıAcircrsaquo fiUgraveEgrave IcircmiddotUgraveAcirc˘ıDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave UacuteOcirc˜ UgraveOcircOacute middotUacutemiddotUgraveEumlUacuteEumlUgravelsaquo Euml permilAcirc permilEgravemiddotIcircAcircIcircOcircIgraveIgravecurrenOacuteEuml AacuteUacutemiddotIgraveIgravelsaquo fiUgraveEgrave middotOcircIgravemiddotIcircUacuteDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave middotfi middot˘UgravefiOacute
bC C
a
c c
a
d db
TUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
Εικόνα 315 Ισοmicroερή (α) Υπόδειγmicroα ζεύγους κατοπτρικών ειδώλων(β) Εναντιοmicroερή γλυκόζης (γ) Εναντιοmicroερή του αmicroινοξέος αλανίνη Παρατη-ρήστε ότι όπως και να περιστραφούν οι τριδιάστατες προβολές των microορίωνοι δύο microορφές L και D είναι αδύνατον να συmicroπέσουν
313) $ $ - 13 $ 13 0 $ - $ 13 6 - $ 6 6 6 15 $ 6 10000 -$ 6 $ 7 ( )
= $ - 13 = - 13 13 + - 13 13
∆ευτεροταγής δοmicroή
= $ R $ 13 13 6( 316) ( 31) - 6 M - - - 7 - (316) gt $ $ = ( - ) - - ( 316)
M - 1313 - $ (- 316)
- - - -
37 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ΠΡΩΤΟΤΑΓΗΣ ΚΑΙ ∆ΕΥΤΕΡΟΤΑΓΗΣ ∆ΟΜΗ 59
(middot)
(sbquo)
CC C
C
CC
C C
C
C
C
C
CCC
C C C
C
C
CC C
CC C
C
C
C
CC
CC
C
CC CC
C C
CC
C
C
C C
CC C
CC
C
CC
C C
CC
CCCC
C C
CC CC
C C
C
O
O
O O O
O
O
O O O
O
O O
O
O O
O
OO
O
OO
O
O O
O
O
O O
O
O O
OO
OO
RR
R R
R
RR R R
R R R
RRR
R R R
RRR
R R R
R R R
RR
RR
RR
R
R
H
HH
HH
HHH H
H
H HH
H
H
H
H
H H
H
H H
H
H H
H
H H
H
HH
H
H
H
HHHH
HH
H
HH
HH
HH
HH
HH
HH
NN
NN
NN
NN
N
N
N N
N
NN
N
N N
N
N N
N
NN
N
NN
N
N N
N
N
NNNN
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger AacuteAcircEgraveUgraveOcircOacuteEgraveIcircOgraveOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger middotOcircIgravemiddotIcircUacute˘UcircIgravecurrenOacuteˆOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
Εικόνα 316 ∆ευτεροταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων (α) ∆ευτεροταγήςδοmicroή α-έλικας Παρατηρήστε ότι οι δεσmicroοί υδρογόνου σχηmicroατίζονται microετα-ξύ ατόmicroων των πεπτιδικών δεσmicroών χωρίς τη συmicromicroετοχή των οmicroάδων R (β)∆ευτεροταγής δοmicroή β-πτυχωτής επιφάνειας
13 - - - 13 6 - - - (13 317)amp 13 13(domains) - $ 7-
38 Πρωτεΐνες δοmicroές υψηλότερης τάξης και αποδιάταξη
+ - $ - = 13 6 0 - - 13 S $ - - - 13 -
$ 13 - - ( 317)
(ndashSH) 6 amp ndashSH - $ $ amp 6 -6 $ ( 317) $- 6 = - - ( 317 318) - ( - ) (f 55)
A 6 - 13 6 - 7 7 - 13 ( 318) 6 +-
60 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot B
(middot) IOacuteUcircOcirc˘IumlrsaquoOacuteEuml (sbquo) PEgravesbquoOcircOacuteOcirc˘IcircIumlAcirciquestUcircEuml
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot A
-currenIumlEgraveIcircmiddot
-Ugrave˘macrˆUgravelsaquoAcircEgraveEcirciquestOacuteAcircEgravemiddot
Εικόνα 317 Τριτοταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων που υποδεικνύει και τιςθέσεις εντοπισmicroού περιοχών microε δευτεροταγή δοmicroή α-έλικας ή β-πτυχωτήςεπιφάνειας (α) Ινσουλίνη microια πρωτεΐνη που έχει δύο πολυπεπτιδικές αλυ-σίδες (f Τmicroήmicroα 319) παρατηρήστε ότι η αλυσίδα Β περιέχει δοmicroές α-έλικας αλλά και β-πτυχωτής επιφάνειας και ότι οι δισουλφιδικοί δεσmicroοί(κυανό χρώmicroα) συντελούν στον καθορισmicroό της τελικής αναδίπλωσης (τριτο-ταγούς δοmicroής) (β) Ριβονουκλεάση microια microεγάλη πρωτεΐνη microε αρκετές περιο-χές α-έλικας και β-πτυχωτής επιφάνειας
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜ 13
Εικόνα 318 Τεταρτοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης Υπάρχουν δύο είδηπολυπεπτιδίων στην αιmicroοσφαιρίνη αλυσίδες α (κυανό και κόκκινο χρώmicroα)και αλυσίδες β (πορτοκαλί και κίτρινο χρώmicroα) και συνολικά 4 πολυπεπτίδιαστο τελικό πρωτεϊνικό microόριο (εδώ τα laquoαraquo και laquoβraquo αναφέρονται σε ονοmicroασίεςπολυπεπτιδικών αλυσίδων και όχι σε είδη δευτεροταγούς δοmicroής) Η τεταρ-τοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης συmicroβολίζεται ως α2 β2 Οι 4 διακριτές αλυ-σίδες απεικονίζονται microε 4 διαφορετικά χρώmicroατα
6 - ( 6 13) - $ ( van der Waals 13 ) ( - $ )
Aποδιάταξη (microετουσίωση)
0 6 - pH - 13 ( 319) =$ 13 - 6 - ( 313) + $ F $ - - (-) amp $ $ ( 319) S 13 6 13 - ( 1313 ) - - $ 1313-13 13
= $ 7 - 7 13 - 0 20 - 6 - amp - - $ 13
Tα επόmicroενα κεφάλαια
amp - 4
- - 13 - 5 13 13 amp - 4 5 $ 13- (f 12) $ $- 0 $ ( 6)
M 1313 - 3 13
38 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ∆ΟΜΕΣ ΥΨΗΛΟΤΕΡΗΣ ΤΑΞΗΣ ΚΑΙ ΑΠΟ∆ΙΑΤΑΞΗ 61
lozEgravemiddotmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(Ocirc˘Uacutersaquomiddot)
ŒOacuteUgraveOcircOacuteEumlmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(100AEligC)
AOcircIgraveiquestIcircUacute˘OacuteUcircEumlOcirc˘Uacutersaquomiddot˜Oslash OacutecurrenmiddotAcircOacuteAcircUacuteAacuteOcircOcircrsaquoEumlUcircEuml
aeligDaggerIacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜ AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
Εικόνα 319 Aποδιάταξη (microετουσίωση) της πρωτεΐνης ριβονουκλεάση(της οποίας η δοmicroή δίνεται στην Εικόνα 317β) Παρατηρήστε πώς οι έντο-νες συνθήκες αποδιάταξης οδηγούν σε ένα οριστικά κατεστραmicromicroένο microόριο(ως προς τη βιολογική λειτουργία του) λόγω εσφαλmicroένης αναδίπλωσης
amp - $ - $ - - F - 13 7 7 $ 13 $ 13 13 -13
37 και 38 Έλεγχος εννοιών
= 6 - $ 6
( ) ( F- $)
1313 7
13 13amp -
6 - - -
F 13 -6 1313136
F $ 6 $ $ 7
62 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
Eρωτήσεις επανάληψης
- $
7 RNA DNA - amp $ RNA DNA DNA RNA
8 amp F $ R 7 $ 13amp -7
9 $ -$ - (Y13 13 313)
10 Z (13 31) -
1 -13 13 $
2 $
3 13 ((13- 13 31)
4 amp13 $ 13 13 amp 13- -
5 amp -
6 $ - 37
Eρωτήσεις εφαρmicroογής
1 RNA () GUCAAAGAC (13) ACGAUAACC+ RNA - amp
2 () -6 F 13 -$ 13 -6
3 Halobacterium A 13 - (K+) 5 M 5- F K+ - 6 Haloba-cterium F $ 6 Escherichia coli 13-
ΕΡΩΤΗΣΕΙΣ ΕΦΑΡΜΟΓΗΣ 63
K+ $ (-13 $ $- 13 K+
4 6 -- 6 - amp-
5 0 13 13 - - F
13- 13
6 M rsquo F 5 1313 - 13 ( $) laquo- 13raquo 6 6 13
32 Έλεγχος εννοιών
= - 6 7 $ (DNA RNA) - - 13
RNA - $
+ F 13
I I ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑamp 32 $
33 Πολυσακχαρίτες
13 () $ - 121 - C6H12O6 ( 34)+ 13 - 4 5 6 7 ( C4 C5 C6 C7) amp C5 () 7 $- C6 ($) - - 34 -
$ = 13- 13 (f 48) - ( 35) $ - 1313- 13 (13 36) $ -
O γλυκοζιτικός δεσmicroός
( ) 13 ( 36)0 () - = - - - -
33 ΠΟΛΥΣΑΚΧΑΡΙΤΕΣ 51
MED
IA T
UTO
RIAL
MED
IA T
UTO
RIAL
Mac
rom
olec
ules
centOcircIgraveEgraveIcircfi˜UcircIcircAcircIumlAcircUgravefi˜RNA
centOcircIgraveEgraveIcircfi˜UcircIcircAcircIumlAcircUgravefi˜DNA
paraEumlAacutelsaquoAcircOacutecurrenUacuteAacuteAcircEgravemiddot˜Icirc˘UgraveUgravemiddotUacuteEgraveIcirciquestUgraveOcircEgravemacrOgraveIgravemiddotUgravemiddot
paraEumlAacutelsaquoAcircOacutecurrenUacuteAacuteAcircEgravemiddot˜UcirciquestIcircmacrmiddotUacuteOcircEcircUacuteOcircDaggerUgraveˆOacute
ordmUacuteOcirc˘IcircUgravefi˙Euml
tradeiquestIcircmacrmiddotUacuteOcirc AOacuteOcircEgraveIcircUgravelsaquo middotIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot centmiddotIcircUgraveDaggerIumlEgraveOcirc˜ PfiIumlOcirc˜
1
23
4
5
PEgravesbquofi˙Euml
paraAcircOacuteUgravefi˙Acirc˜
centAcircOcircIacute˘UacuteEgravesbquofi˙Euml
degIuml˘Icircfi˙Euml
EIacutefi˙Acirc˜
H
H
H
H
HH H
H
H
H H
H
H
HH
H
HH
H
H
H
H
H HH
H
H
H
H
H
H
H
HH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OHOH
OH
C
C
C
C
C
C C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C C
C
C
C C
C
C
C
C C
C
C
C
C
C
OO
O
O
O O
OO
CH2OH
HOCH2
HOCH2
HOCH2
HOCH2
CH2OH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
CH2OH
HO
HO
HO
1
23
4
51
2
3
4
5
1
2
3
4
5
1
2
3
4
5
6
1
2
3
4
5
6
1
23
4
5
6
5
6
4 3
2
1
Εικόνα 34 Συντακτικοί τύποι ορισmicroένων κοινών σακχάρων Τα σάκχα-ρα αναπαρίστανται microε δύο εναλλακτικούς τρόπους ανοικτής αλυσίδας καιδακτυλίου Η microορφή της ανοικτής αλυσίδας είναι περισσότερο ευανάγνωστηαλλά συνηθέστερα χρησιmicroοποιείται η microορφή του δακτυλίου Σηmicroειώστε τοντρόπο αρίθmicroησης των θέσεων του δακτυλίου
TOcirc iquestUgraveOcircIgraveOcirc NmiddotOacuteUgraveEgraveIcircmiddotıEgraveUcircUgraveiquest currenOacutemiddotiquestUgraveOcircIgraveOcirc O UgraveOcirc˘ UcircmiddotIcircmacriquestUacuteOcirc˘
AIcircAcircUgrave˘IumlOcircIgraveiquestpermilmiddotHC
O
CH N
H
C
O
CH3
C HHO
C OHH
C OHH
CH2OH
CH2OH
O
HHOH
H
HO
H NH
C O
CH3
OH2
1
3
4
5
6
1
23
4
5
6
Εικόνα 35 Ν-ακετυλογλυκοζαmicroίνη ένα παράγωγο σακχάρου
- - - ( 36) 13 - $ 1 4 - ( Oslash - 36) - 13 amp -14 (36) - - - - (- -) $ 6 13 amp - 13 -- - $ 13 - $ - Gram 13- - ( 49)
33 Έλεγχος εννοιών
$ - - (- -) - 6
- - 100
34 Λιπίδια
-13 amp 13 (f 45) $ - 13 ( 37) $ 16 15 - ( ) 13$ L
52 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
O
CH2OH
H
H
OH
OH
H
H
HO
H
O
CH2OH
H
OHH
OH
OH
H
HH
O
OtildeIgrave˘IumlOcirc
degIuml˘IcircOcircAacutefiOacuteOcirc
K˘UgraveUgravemiddotUacutersaquoOacuteEuml
(sbquo)
(middot)
O
CH2OH
H
H
OH
OH
H
H
HO
H
OH
O
CH2
H
H
OH
OH
H
HH
O
HO
O
CH2OH
HH
OH
OH
H
H
HO
HOH
O
CH2OH
HH
OH
OH
H
HH
O
middot-14-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
middot-16-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
sbquo-14-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-14
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-16
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo sbquo-14
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-14
1
23
4
5
6
1
23
4
5
6
1
23
4
5
6
Εικόνα 36 Πολυσακχαρίτες (α) ∆οmicroές διαφόρων γλυκοζιτικών δεσmicroώνΣηmicroειώστε ότι microπορεί να ποικίλλουν τόσο η σύνδεση όσο και η γεωmicroετρία (α-ή β-) του δεσmicroού (β) ∆οmicroές ορισmicroένων κοινών πολυσακχαριτών Συγκρίνετετον χρωmicroατικό κώδικα microε το (α)
$ 14 20 ( 37)
Tριγλυκερίδια και σύνθετα λιπίδια
() $ 13 ( 37)
13 $
- ( 37) $$13 - 13 13 (f 45)
13 13 13- $ ()13 13 (f 45) - 13 -13 $
34 Έλεγχος εννοιών
13 - 13
$ 13
13 13 $
$ 4 (C4)
35 Nουκλεϊκά οξέα
7 $ $137 (DNA) 137 (RNA) 13 -13 DNA - RNA - - $ 6 M - 5 13 ( RNA)
35 ΝΟΥΚΛΕΪΚΑ ΟΞΕΑ 53
MOcircOacuteOcircAacutemiddotIumlmiddotIcircUgraveOcirc˙˘IumlOcircpermilEgraveAacuteIuml˘IcircAcircUacutersaquopermilEgraveOcirc(currenOacutemiddot AacuteIuml˘IcircOcircIumlEgraversaquopermilEgraveOcirc)
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot Ucirc˘OacutepermilAcircpermilAcircIgravecurrenOacutemiddot IgraveAcirc AacuteIuml˘IcircAcircUacutefiIumlEumlIgravecurrenUcircˆ AcircUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircOcircDagger permilAcircUcircIgraveOcircDagger
OH
OH
OH
H3CKOcircUacuteAcircUcircIgravecurrenOacuteOcirc C16 (middotIumlIgraveEgraveUgraveEgraveIcircfi)
MOcircOacuteOcircmiddotIcircfiUacuteAcircUcircUgraveOcirc C16 (middotIumlIgraveEgraveUgraveAcircIumlmiddot˚Icircfi)
C OH
O
CH3 C OH
O
H3CC O
O
H3CC O
OC
C
H
H
H
O C H
H
O
CH2OH
degmiddotIumlmiddotIcircUgravefi˙Euml
H3CC O
O
H3CC O
OC
C
H
H
H
P O
O
C H
H
ndashO
O
CH2
CH2+NH3
AEgraveımiddotOacuteOcircIumlmiddotIgraversaquoOacuteEuml
H3CC O
O
C H
H3CC O
O
C H
H3CC O
O
C H
H
H
KOcircEgraveOacuteiquest IumlEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
tradeDaggerOacuteıAcircUgraveOcirc IumlEgraversaquopermilEgraveOcirc
AIumliquest IumlEgraversaquopermilEgravemiddot (UgraveUacuteEgraveAacuteIuml˘IcircAcircUacutersaquopermilEgravemiddot)
tradeDaggerOacuteıAcircUgraveOcirc IumlEgraversaquopermilEgraveOcircordmˆUcircEcircmiddotUgraveEgravepermil˘IumlOcircmiddotEgraveımiddotOacuteOcircIumlmiddotIgraversaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot EcircˆUcircEcircOcircIumlEgraversaquopermilEgraveOcirc)
degIuml˘IcircAcircUacutefiIumlEuml
12
3546
78
910
1112
1314
1516
23
4
5
6
1
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
EUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi
Εικόνα 37 Λιπαρά οξέα απλά λιπίδια (λίπη) και σύνθετα λιπίδια Απλάλιπίδια σχηmicroατίζονται microε microια αντίδραση αφυδάτωσης microεταξύ λιπαρών οξέωνκαι γλυκερόλης η οποία δηmicroιουργεί εστερικό δεσmicroό
$13 ( DNA) 13 PO4
3ndash = - DNA RNA - 38
Nουκλεοτίδια
13 7 $ - 13 13 (
) 13 - $ ( 39) = DNA RNA = ( $-) DNA RNA 13 () -$ C-1 N 13 13 1 ( ) 9 ( -) amp - 13 - ( 310)
13 7 $ 5 ATP ( ) ( 310) -
54 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi P
O
Ondash
OndashO
C C
O BiquestUcircEuml
OH
H HHH C
OH PEgravesbquofi˙Euml
5atilde
4atilde
3atilde 2atilde1atilde
C
CH2
Εικόνα 38 Νουκλεοτίδια Εδώ απεικονίζεται ένα ριβονουκλεοτίδιο πουαπαντά στο RNA Τα δεοξυριβονουκλεοτίδια που απαντούν στο DNA έχουνστον άνθρακα 2rsquo ένα άτοmicroο H αντί της οmicroάδας ndashOH Η αρίθmicroηση των θέσε-ων του σακχάρου γίνεται microε τονούmicroενους αριθmicroούς για να διακρίνεται από τηναρίθmicroηση των θέσεων του δακτυλίου της αζωτούχου βάσης οι οποίες επί-σης αριθmicroούνται (1 2 3 κλπ) (βλ Εικόνα 39) Τόσο τα δεοξυριβονου-κλεοτίδια όσο και τα ριβονουκλεοτίδια περιέχουν microια 5rsquo-φωσφορική οmicroάδα
N
N
N
N
1
234
56
78
9
N
N
N
N
NH2
N
N
N
NH
NH2
O
N
N
3
216
54
N
NH
O
O
H3C
NH
O
NH2
K˘UgraveOcircUcircrsaquoOacuteEuml (C)
pound˘IgraversaquoOacuteEuml (T)
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEuml (A)
degOcirc˘middotOacutersaquoOacuteEuml (G)
DNA RNA
BiquestUcircAcircEgrave˜ ˘UacuteEgraveIgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml˜ BiquestUcircAcircEgrave˜ Ocirc˘UacutersaquoOacuteEuml˜
H
N
DNA RNA
MfiOacuteOcircDNA
Εικόνα 39 ∆οmicroές των βάσεων του DNA και του RNA ∆εν παρατίθεταιστην εικόνα η ουρακίλη (U) της οποίας η δοmicroή είναι όmicroοια microε της θυmicroίνηςmicroε τη microόνη διαφορά ότι στερείται της microεθυλοmicroάδας στον C-5 Παρατηρήστετο σύστηmicroα αρίθmicroησης των δακτυλίων Κατά την ένωση τους microε τον άνθρα-κα 1rsquo του φωσφοσακχάρου για τον σχηmicroατισmicroό νουκλεοτιδίου (Εικόνα 38)οι βάσεις πυριmicroιδίνης συνδέονται microέσω του N-1 του δακτυλίου και οι βάσειςπουρίνης microέσω του N-9
TUacuteEgraveEcircˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcirclsaquo middotpermilAcircOacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot OacuteOcirc˘IcircIumlAcircOcircUgraversaquopermilEgraveOcirc)
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi˜AcircUcircUgravecurrenUacutemiddot˜
N-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
OHOCH2 OH
HH
H
H
OHOH
PEgravesbquofi˙Euml
N N
NN
NH2
+
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEuml
OHOCH2
OHOH
N N
NN
NH2
ApermilAcircOacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot˜ OacuteOcirc˘IcircIumlAcircOcirc˙rsaquoUgraveEuml˜)
3 PO43ndash
OCH2
OHOH
N N
NN
NH2
OPOPOPndashO
O
Ondash
O
Ondash
O
Ondash
ordmˆUcircEcircOcirc-middotOacute˘permilUacutersaquoUgraveEuml˜
H H
H
H
H
H
H H H
~ ~65
4 32
178
9
65
4 32
178
9
65
4 32
178
9
Eικόνα 310 Συστατικά ενός σηmicroαντικού νουκλεοτιδίου της τριφω-σφορικής αδενοσίνης Η ενέργεια υδρόλυσης του φωσφοανυδριτικού δεσmicroού(κυmicroατιστές παύλες) είναι microεγαλύτερη από αυτήν του φωσφορικού εστέραγεγονός που η σηmicroασία του θα γίνει αντιληπτή στο Κεφάλαιο 5 (f Tmicroήmicroα58)
- - - (f 58) L - $- (f 57) 13 (f
515) 13 $ - 7 $ $ -
Nουκλεϊκά οξέα
Q 7 $ - - ( 311)
$ - 3 ( 3acute) 5 (5acute) (- 311) = F $$13
= DNA RNA - 0 13 DNA RNA - 0 - (f 7) DNA - RNA
35 ΝΟΥΚΛΕΪΚΑ ΟΞΕΑ 55
paraAcircUacuteEgraveOcircmacrlsaquo UcircDagger˙Acirc˘IacuteEuml˜Ucirc˘IgraveIumlEumlUacuteˆIgravemiddotUgraveEgraveIcircOgraveOacutesbquoiquestUcircAcircˆOacute
A˙ˆUgraveOcircDaggermacrOcirc˜ sbquoiquestUcircEumlUcirc˘OacutepermilAcircpermilAcircIgravecurrenOacuteEuml UcircUgraveEuml ıcurrenUcircEuml 1atilde
H H
H2C BiquestUcircEumlO
O3atilde
1atilde
2atilde
5atilde
5atilde
5atilde
5 3
3atilde
3atilde
3atilde
3atilde 5atilde
P OndashO
H H H
H
H
H2C BiquestUcircEumlO
O
O
H H H
H
H
O
O
(i)
(ii)
poundcurrenUcircEuml 5atilde
P OndashO
O
P OndashO
O
centAcircOcircIacute˘UacuteEgravesbquofi˙Euml
paraUacuteˆUgraveOcircUgravemiddotAacutelsaquo˜permilOcircIgravelsaquo
centAcirc˘UgraveAcircUacuteOcircUgravemiddotAacutelsaquo˜permilOcircIgravelsaquo
poundcurrenUcircEuml 3atilde
(middot)
(sbquo)
A
C G
G C
C G
C G
A U
(Aacute)
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi
A GG CC T T A
T CC GG A A T
C C A U C GA CG U G A
C C U C G GC GG A C A
C
BiquestUcircEumlH2C
5atilde
4atilde
H
HcentAcircUcircIgraveOcircrsaquo˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘
ordmˆUcircEcircOcircpermilEgraveAcircUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 311 DNA και RNA (α) ∆οmicroή microέρους microιας αλυσίδας DNA Οι αζωτούχες βάσεις microπορεί να είναι αδενίνη γουανίνη κυτοσίνη ή θυmicroίνη Στο RNAυπάρχει microια οmicroάδα ndashOH στον άνθρακα 2rsquo της πεντόζης (βλ Εικόνα 38) και ουρακίλη αντί της θυmicroίνης (β) Απλουστευmicroένο σχήmicroα της δοmicroής του DNA όπουαπεικονίζονται microόνον οι αζωτούχες βάσεις Παρατηρήστε ότι οι δύο αλυσίδες (κλώνοι DNA) είναι συmicroπληρωmicroατικές ως προς την ακολουθία βάσεων (A=T GintC)και συνδέονται microε δεσmicroούς υδρογόνου που σχηmicroατίζονται microεταξύ αυτών των βάσεων Οι δύο κλώνοι DNA απεικονίζονται microε πράσινο χρώmicroα σε δύο διαφορετι-κούς τόνους σκίασης χρωmicroατική σύmicroβαση που εφαρmicroόζεται σε όλο το βιβλίο (γ) RNA (i) πρωτοταγής δοmicroή (ii) πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή Στο RNAσχηmicroατίζονται δευτεροταγείς δοmicroές όταν παρουσιάζονται δυνατότητες για ενδοmicroοριακή ζεύξη βάσεων δηλ για ζεύξη βάσεων της ίδιας αλυσίδας Σε ορισmicroέναπολύ microεγάλα microόρια RNA όπως πχ στο ριβοσωmicroατικό RNA (f Τmicroήmicroατα 715 και 114) άλλες περιοχές του microορίου έχουν microόνο πρωτοταγή δοmicroή και άλλεςτόσο πρωτοταγή όσο και δευτεροταγή δοmicroή Αυτό οδηγεί σε microόρια microε τελικό τριδιάστατο σχήmicroα που είναι καθοριστικό για τη λειτουργία τους και εmicroπεριέχειεκτενείς περιελίξεις ή συσπειρώσεις (f Εικόνα 118γ) Το RNA απεικονίζεται microε πορτοκαλί χρώmicroα χρωmicroατική σύmicroβαση που διατηρείται σε όλο το βιβλίο
$ 1313 -
DNA
DNA DNA - $ -$ (13 32) - - $ (G) (C) $ (A) (T) (13 32) $ $ 13 A T G C DNA - 13 0 G - C T A ( 311)
RNA
$ 137$ S RNA $ 13 - amp 13 - RNA 1313 ( 311)
RNA 13 $ RNA (messenger RNAmRNA) DNA 13- DNA $ RNA (transfer RNA tRNA) - 7 -- -$ 7 - RNA (ribosomal RNA rRNA) 13 7 0 RNA $ - 7 11
35 Έλεγχος εννοιών
7 $ - 13 - RNA DNA RNA
-
13 $ 1313
RNA
36 Tα αmicroινοξέα και ο πεπτιδικός δεσmicroός
$ 7- $ - $ 21 $ 0 $ - (ndashCOOH) (ndashNH2) (- 31 312) amp - $ 13-$ $ - $ ( ) -13 13 - 6 ( 313)
0 $ - 312 ( ROslash 312) - -- 13$13 13 13$ ( ) ( $ ) (- 312) $ 13 - $ - laquoraquo$ 312 = - - 13$ $ $ $ $ L $ 13 - $ = 6 - (ndashSH) -$ - (RndashSndashSndashR) F - $ $ 7 - 13
Iσοmicroερή
amp
56 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
$ Louis Pasteur 13 -F (f 15) 13 = Pasteur F $ ( 314) $ 13 - ( $ )
- (f 48) X laquo- raquo $ - D
L ( 315) 13 - Dndash
$ D L 0 - 6 $ Lndash$ Dndash (- 315) Dndash$ - (f 48) 13 (f 209) Dndash$ Lndash Lndash Dndash
36 ΤΑ ΑΜΙΝΟΞΕΑ ΚΑΙ Ο ΠΕΠΤΙ∆ΙΚΟΣ ∆ΕΣΜΟΣ 57
H
CH3
CHCH3
CH3
CH2CHCH3
CH3
CHCH3
CH2CH3
CH2OHCHCH3
OH
CH2
O-O
CH2C
O
NH2
CH2C
O-O CH2
CH2C
O
CH2NH2
CH2HS
CH2S CH2CH3
CH2
CH2HO
CH2
NH
CH2CH2CH2CH2+NH3
CH2CH2CH2+NH2 N
HC
NH2CH2
HN
+HN
N
CH2H2C
H2C CH COOndash
Gly degIuml˘IcircrsaquoOacuteEuml (G)
Ala AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (A)
Val BmiddotIumlrsaquoOacuteEuml (V)
Leu sectAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (L)
Ile IUcircOcircIumlAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (I)
Ser tradeAcircUacutersaquoOacuteEuml (S)Thr poundUacuteAcircOcircOacutersaquoOacuteEuml (T)
Asp AUcircmiddotUacuteUgraveEgraveIcircfi (D)
Asn AUcircmiddotUacutemiddotAacutersaquoOacuteEuml (N)
Glu degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraveEgraveIcircfi (E)
Gln degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraversaquoOacuteEuml (Q)
Cys K˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (C)
CH2HSe Sec tradeAcircIumlEumlOacuteOcircIcirc˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (U)
Met MAcircıAcircEgraveOcircOacutersaquoOacuteEuml (M)
Phe ordmmiddotEgraveOacute˘IumlmiddotIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (F)
Tyr T˘UacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (Y)
Trp TUacute˘UgraveOcircEcirciquestOacuteEuml (W)
Lys sect˘UcircrsaquoOacuteEuml (K)
Arg AUacuteAacuteEgraveOacutersaquoOacuteEuml (R)
His IUcircUgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml (H)
Pro
centOcircIgravelsaquo UgraveˆOacute middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteEgraveIcircOgraveOacute OcircIgraveiquestpermilˆOacute
OHC
O
CR
H
NH2
AIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot
degAcircOacuteEgraveIcirclsaquo permilOcircIgravelsaquo AcircOacutefi˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenOcirc˜
(tradeEumlIgraveAcircrsaquoˆUcircEuml tradeUgraveEumlOacute AcircUacutersaquoUgraveˆUcircEuml UgraveEuml˜ UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml˜ middotAcircEgraveIcircOcircOacutersaquo˙AcircUgravemiddotEgrave OcircIumlfiIcircIumlEumlUacuteEuml Euml permilOcircIgravelsaquo fimacrEgrave IgravefiOacuteOcircOacute Euml OcircIgraveiquestpermilmiddot R H UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml permilAcircOacute AcircrsaquoOacutemiddotEgrave middotIcircUacuteEgravesbquoOgrave˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteDagger permilEgravefiUgraveEgrave UcircUgraveAcircUacuteAcircrsaquoUgravemiddotEgrave AcircIumlAcircDaggerıAcircUacuteEuml˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot˜)
H IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-fiIacuteEgraveOacuteOcirc
MEuml OcircIumlEgraveIcircfi(˘permilUacutefiEcircOcircsbquoOcirc)
C
KIumlAcircrsaquopermilmiddot
-iquestOacuteıUacutemiddotIcircmiddot˜
KmiddotUacutesbquoOcircIacute˘IumlOcircIgraveiquestpermilmiddot
paraUacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml (P)
IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-middotIumlIcircmiddotIumlEgraveIcircfi
paraOcircIumlEgraveIcircfi IgraveEuml EgraveOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc Εικόνα 312 Συντακτικοί τύποι των 21 κοινών αmicroινοξέων Αριστερά απότο όνοmicroα κάθε αmicroινοξέος δίνεται η τριγράmicromicroατη συντοmicroογραφία του και δεξιά(σε παρένθεση) η microονογράmicromicroατη συντοmicroογραφία του
H2N C C
H O
OH NH
C C
H
R2
O
OH+ H
H2O
H2N C C
H
R1
O
N C C
H
R2
O
OH
R1
H
paraAcircUgraveEgravepermilEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 313 Σχηmicroατισmicroός πεπτιδικού δεσmicroού R1 και R2 αναφέρονταιστο microεταβλητό microέρος των αmicroινοξέων (πλευρική αλυσίδα) (βλ Εικόνα 312)
(Lndash Dndash$) 13- (Dndash Lndash$)
36 Έλεγχος εννοιών
21 $ - $ 13 13 $ ( ) -6
$ - $
$ -
- $ 13 - $ -
37 Πρωτεΐνες πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή
6 - - 6 () 6
13 - (f 5 17) 6 13 - - - 6 = 7 - -
Πρωτοταγής δοmicroή
6 $ $ (-
58 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
T T
P
M M
Pbatilde b
h
n n
h
(middot) (sbquo)
Εικόνα 314 Σχεδιαγράmicromicroατα κρυστάλλων τρυγικού οξέος (C4H6O6) διάχειρός Louis Pasteur από το περίφηmicroο άρθρο του περί οπτικής ενεργότητας(α) Αριστεροχειρικός κρύσταλλος (microορφή L) (β) ∆εξιοχειρικός κρύσταλλος(microορφή D) Οι δύο κρύσταλλοι είναι κατοπτρικά είδωλα ο ένας του άλλου(δηλ εναντιοmicroερή) Τα γράmicromicroατα πάνω στις έδρες των κρυστάλλων υποδη-λώνουν τα ζεύγη εναντιοmicroερών εδρών κατά τον συmicroβολισmicroό του PasteurΓια να αναδειχθεί σαφέστερα η εναντιοmicroέρεια των κρυστάλλων έχει χρησι-microοποιηθεί έγχρωmicroη σκίαση
(sbquo)
NH2H2N
COOH
C HH2N
CH3
COO
CH
CH3
ErsaquoAcircpermilEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
COOH
C NH2
CH3
COOH
CH
CH3
H
L-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml D-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml
(Aacute)
HO
HO
HO
OH
HHO
C OHH
OH
CH2OH
O
C H
CH
H
H
CH2OH
D-degIuml˘Icircfi˙Euml L-degIuml˘Icircfi˙Euml
CO
OH
(middot)
H
CH
C
CH
HC
C
C
tradeUgraveEumlOacute UgraveUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEuml UacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo UgraveOcirc IgraveAcircOacute sbquocurrenIumlOcirc˜ ımiddot UacutecurrenAcircEgrave Oacutemiddot ıAcircˆUacuteEumlıAcircrsaquo fiUgraveEgrave IcircmiddotUgraveAcirc˘ıDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave UacuteOcirc˜ UgraveOcircOacute middotUacutemiddotUgraveEumlUacuteEumlUgravelsaquo Euml permilAcirc permilEgravemiddotIcircAcircIcircOcircIgraveIgravecurrenOacuteEuml AacuteUacutemiddotIgraveIgravelsaquo fiUgraveEgrave middotOcircIgravemiddotIcircUacuteDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave middotfi middot˘UgravefiOacute
bC C
a
c c
a
d db
TUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
Εικόνα 315 Ισοmicroερή (α) Υπόδειγmicroα ζεύγους κατοπτρικών ειδώλων(β) Εναντιοmicroερή γλυκόζης (γ) Εναντιοmicroερή του αmicroινοξέος αλανίνη Παρατη-ρήστε ότι όπως και να περιστραφούν οι τριδιάστατες προβολές των microορίωνοι δύο microορφές L και D είναι αδύνατον να συmicroπέσουν
313) $ $ - 13 $ 13 0 $ - $ 13 6 - $ 6 6 6 15 $ 6 10000 -$ 6 $ 7 ( )
= $ - 13 = - 13 13 + - 13 13
∆ευτεροταγής δοmicroή
= $ R $ 13 13 6( 316) ( 31) - 6 M - - - 7 - (316) gt $ $ = ( - ) - - ( 316)
M - 1313 - $ (- 316)
- - - -
37 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ΠΡΩΤΟΤΑΓΗΣ ΚΑΙ ∆ΕΥΤΕΡΟΤΑΓΗΣ ∆ΟΜΗ 59
(middot)
(sbquo)
CC C
C
CC
C C
C
C
C
C
CCC
C C C
C
C
CC C
CC C
C
C
C
CC
CC
C
CC CC
C C
CC
C
C
C C
CC C
CC
C
CC
C C
CC
CCCC
C C
CC CC
C C
C
O
O
O O O
O
O
O O O
O
O O
O
O O
O
OO
O
OO
O
O O
O
O
O O
O
O O
OO
OO
RR
R R
R
RR R R
R R R
RRR
R R R
RRR
R R R
R R R
RR
RR
RR
R
R
H
HH
HH
HHH H
H
H HH
H
H
H
H
H H
H
H H
H
H H
H
H H
H
HH
H
H
H
HHHH
HH
H
HH
HH
HH
HH
HH
HH
NN
NN
NN
NN
N
N
N N
N
NN
N
N N
N
N N
N
NN
N
NN
N
N N
N
N
NNNN
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger AacuteAcircEgraveUgraveOcircOacuteEgraveIcircOgraveOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger middotOcircIgravemiddotIcircUacute˘UcircIgravecurrenOacuteˆOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
Εικόνα 316 ∆ευτεροταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων (α) ∆ευτεροταγήςδοmicroή α-έλικας Παρατηρήστε ότι οι δεσmicroοί υδρογόνου σχηmicroατίζονται microετα-ξύ ατόmicroων των πεπτιδικών δεσmicroών χωρίς τη συmicromicroετοχή των οmicroάδων R (β)∆ευτεροταγής δοmicroή β-πτυχωτής επιφάνειας
13 - - - 13 6 - - - (13 317)amp 13 13(domains) - $ 7-
38 Πρωτεΐνες δοmicroές υψηλότερης τάξης και αποδιάταξη
+ - $ - = 13 6 0 - - 13 S $ - - - 13 -
$ 13 - - ( 317)
(ndashSH) 6 amp ndashSH - $ $ amp 6 -6 $ ( 317) $- 6 = - - ( 317 318) - ( - ) (f 55)
A 6 - 13 6 - 7 7 - 13 ( 318) 6 +-
60 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot B
(middot) IOacuteUcircOcirc˘IumlrsaquoOacuteEuml (sbquo) PEgravesbquoOcircOacuteOcirc˘IcircIumlAcirciquestUcircEuml
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot A
-currenIumlEgraveIcircmiddot
-Ugrave˘macrˆUgravelsaquoAcircEgraveEcirciquestOacuteAcircEgravemiddot
Εικόνα 317 Τριτοταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων που υποδεικνύει και τιςθέσεις εντοπισmicroού περιοχών microε δευτεροταγή δοmicroή α-έλικας ή β-πτυχωτήςεπιφάνειας (α) Ινσουλίνη microια πρωτεΐνη που έχει δύο πολυπεπτιδικές αλυ-σίδες (f Τmicroήmicroα 319) παρατηρήστε ότι η αλυσίδα Β περιέχει δοmicroές α-έλικας αλλά και β-πτυχωτής επιφάνειας και ότι οι δισουλφιδικοί δεσmicroοί(κυανό χρώmicroα) συντελούν στον καθορισmicroό της τελικής αναδίπλωσης (τριτο-ταγούς δοmicroής) (β) Ριβονουκλεάση microια microεγάλη πρωτεΐνη microε αρκετές περιο-χές α-έλικας και β-πτυχωτής επιφάνειας
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜ 13
Εικόνα 318 Τεταρτοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης Υπάρχουν δύο είδηπολυπεπτιδίων στην αιmicroοσφαιρίνη αλυσίδες α (κυανό και κόκκινο χρώmicroα)και αλυσίδες β (πορτοκαλί και κίτρινο χρώmicroα) και συνολικά 4 πολυπεπτίδιαστο τελικό πρωτεϊνικό microόριο (εδώ τα laquoαraquo και laquoβraquo αναφέρονται σε ονοmicroασίεςπολυπεπτιδικών αλυσίδων και όχι σε είδη δευτεροταγούς δοmicroής) Η τεταρ-τοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης συmicroβολίζεται ως α2 β2 Οι 4 διακριτές αλυ-σίδες απεικονίζονται microε 4 διαφορετικά χρώmicroατα
6 - ( 6 13) - $ ( van der Waals 13 ) ( - $ )
Aποδιάταξη (microετουσίωση)
0 6 - pH - 13 ( 319) =$ 13 - 6 - ( 313) + $ F $ - - (-) amp $ $ ( 319) S 13 6 13 - ( 1313 ) - - $ 1313-13 13
= $ 7 - 7 13 - 0 20 - 6 - amp - - $ 13
Tα επόmicroενα κεφάλαια
amp - 4
- - 13 - 5 13 13 amp - 4 5 $ 13- (f 12) $ $- 0 $ ( 6)
M 1313 - 3 13
38 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ∆ΟΜΕΣ ΥΨΗΛΟΤΕΡΗΣ ΤΑΞΗΣ ΚΑΙ ΑΠΟ∆ΙΑΤΑΞΗ 61
lozEgravemiddotmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(Ocirc˘Uacutersaquomiddot)
ŒOacuteUgraveOcircOacuteEumlmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(100AEligC)
AOcircIgraveiquestIcircUacute˘OacuteUcircEumlOcirc˘Uacutersaquomiddot˜Oslash OacutecurrenmiddotAcircOacuteAcircUacuteAacuteOcircOcircrsaquoEumlUcircEuml
aeligDaggerIacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜ AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
Εικόνα 319 Aποδιάταξη (microετουσίωση) της πρωτεΐνης ριβονουκλεάση(της οποίας η δοmicroή δίνεται στην Εικόνα 317β) Παρατηρήστε πώς οι έντο-νες συνθήκες αποδιάταξης οδηγούν σε ένα οριστικά κατεστραmicromicroένο microόριο(ως προς τη βιολογική λειτουργία του) λόγω εσφαλmicroένης αναδίπλωσης
amp - $ - $ - - F - 13 7 7 $ 13 $ 13 13 -13
37 και 38 Έλεγχος εννοιών
= 6 - $ 6
( ) ( F- $)
1313 7
13 13amp -
6 - - -
F 13 -6 1313136
F $ 6 $ $ 7
62 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
Eρωτήσεις επανάληψης
- $
7 RNA DNA - amp $ RNA DNA DNA RNA
8 amp F $ R 7 $ 13amp -7
9 $ -$ - (Y13 13 313)
10 Z (13 31) -
1 -13 13 $
2 $
3 13 ((13- 13 31)
4 amp13 $ 13 13 amp 13- -
5 amp -
6 $ - 37
Eρωτήσεις εφαρmicroογής
1 RNA () GUCAAAGAC (13) ACGAUAACC+ RNA - amp
2 () -6 F 13 -$ 13 -6
3 Halobacterium A 13 - (K+) 5 M 5- F K+ - 6 Haloba-cterium F $ 6 Escherichia coli 13-
ΕΡΩΤΗΣΕΙΣ ΕΦΑΡΜΟΓΗΣ 63
K+ $ (-13 $ $- 13 K+
4 6 -- 6 - amp-
5 0 13 13 - - F
13- 13
6 M rsquo F 5 1313 - 13 ( $) laquo- 13raquo 6 6 13
- - - ( 36) 13 - $ 1 4 - ( Oslash - 36) - 13 amp -14 (36) - - - - (- -) $ 6 13 amp - 13 -- - $ 13 - $ - Gram 13- - ( 49)
33 Έλεγχος εννοιών
$ - - (- -) - 6
- - 100
34 Λιπίδια
-13 amp 13 (f 45) $ - 13 ( 37) $ 16 15 - ( ) 13$ L
52 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
O
CH2OH
H
H
OH
OH
H
H
HO
H
O
CH2OH
H
OHH
OH
OH
H
HH
O
OtildeIgrave˘IumlOcirc
degIuml˘IcircOcircAacutefiOacuteOcirc
K˘UgraveUgravemiddotUacutersaquoOacuteEuml
(sbquo)
(middot)
O
CH2OH
H
H
OH
OH
H
H
HO
H
OH
O
CH2
H
H
OH
OH
H
HH
O
HO
O
CH2OH
HH
OH
OH
H
H
HO
HOH
O
CH2OH
HH
OH
OH
H
HH
O
middot-14-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
middot-16-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
sbquo-14-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜ permilAcircUcircIgravefi˜
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-14
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-16
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo sbquo-14
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo middot-14
1
23
4
5
6
1
23
4
5
6
1
23
4
5
6
Εικόνα 36 Πολυσακχαρίτες (α) ∆οmicroές διαφόρων γλυκοζιτικών δεσmicroώνΣηmicroειώστε ότι microπορεί να ποικίλλουν τόσο η σύνδεση όσο και η γεωmicroετρία (α-ή β-) του δεσmicroού (β) ∆οmicroές ορισmicroένων κοινών πολυσακχαριτών Συγκρίνετετον χρωmicroατικό κώδικα microε το (α)
$ 14 20 ( 37)
Tριγλυκερίδια και σύνθετα λιπίδια
() $ 13 ( 37)
13 $
- ( 37) $$13 - 13 13 (f 45)
13 13 13- $ ()13 13 (f 45) - 13 -13 $
34 Έλεγχος εννοιών
13 - 13
$ 13
13 13 $
$ 4 (C4)
35 Nουκλεϊκά οξέα
7 $ $137 (DNA) 137 (RNA) 13 -13 DNA - RNA - - $ 6 M - 5 13 ( RNA)
35 ΝΟΥΚΛΕΪΚΑ ΟΞΕΑ 53
MOcircOacuteOcircAacutemiddotIumlmiddotIcircUgraveOcirc˙˘IumlOcircpermilEgraveAacuteIuml˘IcircAcircUacutersaquopermilEgraveOcirc(currenOacutemiddot AacuteIuml˘IcircOcircIumlEgraversaquopermilEgraveOcirc)
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot Ucirc˘OacutepermilAcircpermilAcircIgravecurrenOacutemiddot IgraveAcirc AacuteIuml˘IcircAcircUacutefiIumlEumlIgravecurrenUcircˆ AcircUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircOcircDagger permilAcircUcircIgraveOcircDagger
OH
OH
OH
H3CKOcircUacuteAcircUcircIgravecurrenOacuteOcirc C16 (middotIumlIgraveEgraveUgraveEgraveIcircfi)
MOcircOacuteOcircmiddotIcircfiUacuteAcircUcircUgraveOcirc C16 (middotIumlIgraveEgraveUgraveAcircIumlmiddot˚Icircfi)
C OH
O
CH3 C OH
O
H3CC O
O
H3CC O
OC
C
H
H
H
O C H
H
O
CH2OH
degmiddotIumlmiddotIcircUgravefi˙Euml
H3CC O
O
H3CC O
OC
C
H
H
H
P O
O
C H
H
ndashO
O
CH2
CH2+NH3
AEgraveımiddotOacuteOcircIumlmiddotIgraversaquoOacuteEuml
H3CC O
O
C H
H3CC O
O
C H
H3CC O
O
C H
H
H
KOcircEgraveOacuteiquest IumlEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
tradeDaggerOacuteıAcircUgraveOcirc IumlEgraversaquopermilEgraveOcirc
AIumliquest IumlEgraversaquopermilEgravemiddot (UgraveUacuteEgraveAacuteIuml˘IcircAcircUacutersaquopermilEgravemiddot)
tradeDaggerOacuteıAcircUgraveOcirc IumlEgraversaquopermilEgraveOcircordmˆUcircEcircmiddotUgraveEgravepermil˘IumlOcircmiddotEgraveımiddotOacuteOcircIumlmiddotIgraversaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot EcircˆUcircEcircOcircIumlEgraversaquopermilEgraveOcirc)
degIuml˘IcircAcircUacutefiIumlEuml
12
3546
78
910
1112
1314
1516
23
4
5
6
1
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
EUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi
Εικόνα 37 Λιπαρά οξέα απλά λιπίδια (λίπη) και σύνθετα λιπίδια Απλάλιπίδια σχηmicroατίζονται microε microια αντίδραση αφυδάτωσης microεταξύ λιπαρών οξέωνκαι γλυκερόλης η οποία δηmicroιουργεί εστερικό δεσmicroό
$13 ( DNA) 13 PO4
3ndash = - DNA RNA - 38
Nουκλεοτίδια
13 7 $ - 13 13 (
) 13 - $ ( 39) = DNA RNA = ( $-) DNA RNA 13 () -$ C-1 N 13 13 1 ( ) 9 ( -) amp - 13 - ( 310)
13 7 $ 5 ATP ( ) ( 310) -
54 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi P
O
Ondash
OndashO
C C
O BiquestUcircEuml
OH
H HHH C
OH PEgravesbquofi˙Euml
5atilde
4atilde
3atilde 2atilde1atilde
C
CH2
Εικόνα 38 Νουκλεοτίδια Εδώ απεικονίζεται ένα ριβονουκλεοτίδιο πουαπαντά στο RNA Τα δεοξυριβονουκλεοτίδια που απαντούν στο DNA έχουνστον άνθρακα 2rsquo ένα άτοmicroο H αντί της οmicroάδας ndashOH Η αρίθmicroηση των θέσε-ων του σακχάρου γίνεται microε τονούmicroενους αριθmicroούς για να διακρίνεται από τηναρίθmicroηση των θέσεων του δακτυλίου της αζωτούχου βάσης οι οποίες επί-σης αριθmicroούνται (1 2 3 κλπ) (βλ Εικόνα 39) Τόσο τα δεοξυριβονου-κλεοτίδια όσο και τα ριβονουκλεοτίδια περιέχουν microια 5rsquo-φωσφορική οmicroάδα
N
N
N
N
1
234
56
78
9
N
N
N
N
NH2
N
N
N
NH
NH2
O
N
N
3
216
54
N
NH
O
O
H3C
NH
O
NH2
K˘UgraveOcircUcircrsaquoOacuteEuml (C)
pound˘IgraversaquoOacuteEuml (T)
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEuml (A)
degOcirc˘middotOacutersaquoOacuteEuml (G)
DNA RNA
BiquestUcircAcircEgrave˜ ˘UacuteEgraveIgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml˜ BiquestUcircAcircEgrave˜ Ocirc˘UacutersaquoOacuteEuml˜
H
N
DNA RNA
MfiOacuteOcircDNA
Εικόνα 39 ∆οmicroές των βάσεων του DNA και του RNA ∆εν παρατίθεταιστην εικόνα η ουρακίλη (U) της οποίας η δοmicroή είναι όmicroοια microε της θυmicroίνηςmicroε τη microόνη διαφορά ότι στερείται της microεθυλοmicroάδας στον C-5 Παρατηρήστετο σύστηmicroα αρίθmicroησης των δακτυλίων Κατά την ένωση τους microε τον άνθρα-κα 1rsquo του φωσφοσακχάρου για τον σχηmicroατισmicroό νουκλεοτιδίου (Εικόνα 38)οι βάσεις πυριmicroιδίνης συνδέονται microέσω του N-1 του δακτυλίου και οι βάσειςπουρίνης microέσω του N-9
TUacuteEgraveEcircˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcirclsaquo middotpermilAcircOacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot OacuteOcirc˘IcircIumlAcircOcircUgraversaquopermilEgraveOcirc)
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi˜AcircUcircUgravecurrenUacutemiddot˜
N-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
OHOCH2 OH
HH
H
H
OHOH
PEgravesbquofi˙Euml
N N
NN
NH2
+
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEuml
OHOCH2
OHOH
N N
NN
NH2
ApermilAcircOacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot˜ OacuteOcirc˘IcircIumlAcircOcirc˙rsaquoUgraveEuml˜)
3 PO43ndash
OCH2
OHOH
N N
NN
NH2
OPOPOPndashO
O
Ondash
O
Ondash
O
Ondash
ordmˆUcircEcircOcirc-middotOacute˘permilUacutersaquoUgraveEuml˜
H H
H
H
H
H
H H H
~ ~65
4 32
178
9
65
4 32
178
9
65
4 32
178
9
Eικόνα 310 Συστατικά ενός σηmicroαντικού νουκλεοτιδίου της τριφω-σφορικής αδενοσίνης Η ενέργεια υδρόλυσης του φωσφοανυδριτικού δεσmicroού(κυmicroατιστές παύλες) είναι microεγαλύτερη από αυτήν του φωσφορικού εστέραγεγονός που η σηmicroασία του θα γίνει αντιληπτή στο Κεφάλαιο 5 (f Tmicroήmicroα58)
- - - (f 58) L - $- (f 57) 13 (f
515) 13 $ - 7 $ $ -
Nουκλεϊκά οξέα
Q 7 $ - - ( 311)
$ - 3 ( 3acute) 5 (5acute) (- 311) = F $$13
= DNA RNA - 0 13 DNA RNA - 0 - (f 7) DNA - RNA
35 ΝΟΥΚΛΕΪΚΑ ΟΞΕΑ 55
paraAcircUacuteEgraveOcircmacrlsaquo UcircDagger˙Acirc˘IacuteEuml˜Ucirc˘IgraveIumlEumlUacuteˆIgravemiddotUgraveEgraveIcircOgraveOacutesbquoiquestUcircAcircˆOacute
A˙ˆUgraveOcircDaggermacrOcirc˜ sbquoiquestUcircEumlUcirc˘OacutepermilAcircpermilAcircIgravecurrenOacuteEuml UcircUgraveEuml ıcurrenUcircEuml 1atilde
H H
H2C BiquestUcircEumlO
O3atilde
1atilde
2atilde
5atilde
5atilde
5atilde
5 3
3atilde
3atilde
3atilde
3atilde 5atilde
P OndashO
H H H
H
H
H2C BiquestUcircEumlO
O
O
H H H
H
H
O
O
(i)
(ii)
poundcurrenUcircEuml 5atilde
P OndashO
O
P OndashO
O
centAcircOcircIacute˘UacuteEgravesbquofi˙Euml
paraUacuteˆUgraveOcircUgravemiddotAacutelsaquo˜permilOcircIgravelsaquo
centAcirc˘UgraveAcircUacuteOcircUgravemiddotAacutelsaquo˜permilOcircIgravelsaquo
poundcurrenUcircEuml 3atilde
(middot)
(sbquo)
A
C G
G C
C G
C G
A U
(Aacute)
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi
A GG CC T T A
T CC GG A A T
C C A U C GA CG U G A
C C U C G GC GG A C A
C
BiquestUcircEumlH2C
5atilde
4atilde
H
HcentAcircUcircIgraveOcircrsaquo˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘
ordmˆUcircEcircOcircpermilEgraveAcircUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 311 DNA και RNA (α) ∆οmicroή microέρους microιας αλυσίδας DNA Οι αζωτούχες βάσεις microπορεί να είναι αδενίνη γουανίνη κυτοσίνη ή θυmicroίνη Στο RNAυπάρχει microια οmicroάδα ndashOH στον άνθρακα 2rsquo της πεντόζης (βλ Εικόνα 38) και ουρακίλη αντί της θυmicroίνης (β) Απλουστευmicroένο σχήmicroα της δοmicroής του DNA όπουαπεικονίζονται microόνον οι αζωτούχες βάσεις Παρατηρήστε ότι οι δύο αλυσίδες (κλώνοι DNA) είναι συmicroπληρωmicroατικές ως προς την ακολουθία βάσεων (A=T GintC)και συνδέονται microε δεσmicroούς υδρογόνου που σχηmicroατίζονται microεταξύ αυτών των βάσεων Οι δύο κλώνοι DNA απεικονίζονται microε πράσινο χρώmicroα σε δύο διαφορετι-κούς τόνους σκίασης χρωmicroατική σύmicroβαση που εφαρmicroόζεται σε όλο το βιβλίο (γ) RNA (i) πρωτοταγής δοmicroή (ii) πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή Στο RNAσχηmicroατίζονται δευτεροταγείς δοmicroές όταν παρουσιάζονται δυνατότητες για ενδοmicroοριακή ζεύξη βάσεων δηλ για ζεύξη βάσεων της ίδιας αλυσίδας Σε ορισmicroέναπολύ microεγάλα microόρια RNA όπως πχ στο ριβοσωmicroατικό RNA (f Τmicroήmicroατα 715 και 114) άλλες περιοχές του microορίου έχουν microόνο πρωτοταγή δοmicroή και άλλεςτόσο πρωτοταγή όσο και δευτεροταγή δοmicroή Αυτό οδηγεί σε microόρια microε τελικό τριδιάστατο σχήmicroα που είναι καθοριστικό για τη λειτουργία τους και εmicroπεριέχειεκτενείς περιελίξεις ή συσπειρώσεις (f Εικόνα 118γ) Το RNA απεικονίζεται microε πορτοκαλί χρώmicroα χρωmicroατική σύmicroβαση που διατηρείται σε όλο το βιβλίο
$ 1313 -
DNA
DNA DNA - $ -$ (13 32) - - $ (G) (C) $ (A) (T) (13 32) $ $ 13 A T G C DNA - 13 0 G - C T A ( 311)
RNA
$ 137$ S RNA $ 13 - amp 13 - RNA 1313 ( 311)
RNA 13 $ RNA (messenger RNAmRNA) DNA 13- DNA $ RNA (transfer RNA tRNA) - 7 -- -$ 7 - RNA (ribosomal RNA rRNA) 13 7 0 RNA $ - 7 11
35 Έλεγχος εννοιών
7 $ - 13 - RNA DNA RNA
-
13 $ 1313
RNA
36 Tα αmicroινοξέα και ο πεπτιδικός δεσmicroός
$ 7- $ - $ 21 $ 0 $ - (ndashCOOH) (ndashNH2) (- 31 312) amp - $ 13-$ $ - $ ( ) -13 13 - 6 ( 313)
0 $ - 312 ( ROslash 312) - -- 13$13 13 13$ ( ) ( $ ) (- 312) $ 13 - $ - laquoraquo$ 312 = - - 13$ $ $ $ $ L $ 13 - $ = 6 - (ndashSH) -$ - (RndashSndashSndashR) F - $ $ 7 - 13
Iσοmicroερή
amp
56 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
$ Louis Pasteur 13 -F (f 15) 13 = Pasteur F $ ( 314) $ 13 - ( $ )
- (f 48) X laquo- raquo $ - D
L ( 315) 13 - Dndash
$ D L 0 - 6 $ Lndash$ Dndash (- 315) Dndash$ - (f 48) 13 (f 209) Dndash$ Lndash Lndash Dndash
36 ΤΑ ΑΜΙΝΟΞΕΑ ΚΑΙ Ο ΠΕΠΤΙ∆ΙΚΟΣ ∆ΕΣΜΟΣ 57
H
CH3
CHCH3
CH3
CH2CHCH3
CH3
CHCH3
CH2CH3
CH2OHCHCH3
OH
CH2
O-O
CH2C
O
NH2
CH2C
O-O CH2
CH2C
O
CH2NH2
CH2HS
CH2S CH2CH3
CH2
CH2HO
CH2
NH
CH2CH2CH2CH2+NH3
CH2CH2CH2+NH2 N
HC
NH2CH2
HN
+HN
N
CH2H2C
H2C CH COOndash
Gly degIuml˘IcircrsaquoOacuteEuml (G)
Ala AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (A)
Val BmiddotIumlrsaquoOacuteEuml (V)
Leu sectAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (L)
Ile IUcircOcircIumlAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (I)
Ser tradeAcircUacutersaquoOacuteEuml (S)Thr poundUacuteAcircOcircOacutersaquoOacuteEuml (T)
Asp AUcircmiddotUacuteUgraveEgraveIcircfi (D)
Asn AUcircmiddotUacutemiddotAacutersaquoOacuteEuml (N)
Glu degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraveEgraveIcircfi (E)
Gln degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraversaquoOacuteEuml (Q)
Cys K˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (C)
CH2HSe Sec tradeAcircIumlEumlOacuteOcircIcirc˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (U)
Met MAcircıAcircEgraveOcircOacutersaquoOacuteEuml (M)
Phe ordmmiddotEgraveOacute˘IumlmiddotIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (F)
Tyr T˘UacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (Y)
Trp TUacute˘UgraveOcircEcirciquestOacuteEuml (W)
Lys sect˘UcircrsaquoOacuteEuml (K)
Arg AUacuteAacuteEgraveOacutersaquoOacuteEuml (R)
His IUcircUgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml (H)
Pro
centOcircIgravelsaquo UgraveˆOacute middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteEgraveIcircOgraveOacute OcircIgraveiquestpermilˆOacute
OHC
O
CR
H
NH2
AIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot
degAcircOacuteEgraveIcirclsaquo permilOcircIgravelsaquo AcircOacutefi˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenOcirc˜
(tradeEumlIgraveAcircrsaquoˆUcircEuml tradeUgraveEumlOacute AcircUacutersaquoUgraveˆUcircEuml UgraveEuml˜ UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml˜ middotAcircEgraveIcircOcircOacutersaquo˙AcircUgravemiddotEgrave OcircIumlfiIcircIumlEumlUacuteEuml Euml permilOcircIgravelsaquo fimacrEgrave IgravefiOacuteOcircOacute Euml OcircIgraveiquestpermilmiddot R H UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml permilAcircOacute AcircrsaquoOacutemiddotEgrave middotIcircUacuteEgravesbquoOgrave˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteDagger permilEgravefiUgraveEgrave UcircUgraveAcircUacuteAcircrsaquoUgravemiddotEgrave AcircIumlAcircDaggerıAcircUacuteEuml˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot˜)
H IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-fiIacuteEgraveOacuteOcirc
MEuml OcircIumlEgraveIcircfi(˘permilUacutefiEcircOcircsbquoOcirc)
C
KIumlAcircrsaquopermilmiddot
-iquestOacuteıUacutemiddotIcircmiddot˜
KmiddotUacutesbquoOcircIacute˘IumlOcircIgraveiquestpermilmiddot
paraUacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml (P)
IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-middotIumlIcircmiddotIumlEgraveIcircfi
paraOcircIumlEgraveIcircfi IgraveEuml EgraveOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc Εικόνα 312 Συντακτικοί τύποι των 21 κοινών αmicroινοξέων Αριστερά απότο όνοmicroα κάθε αmicroινοξέος δίνεται η τριγράmicromicroατη συντοmicroογραφία του και δεξιά(σε παρένθεση) η microονογράmicromicroατη συντοmicroογραφία του
H2N C C
H O
OH NH
C C
H
R2
O
OH+ H
H2O
H2N C C
H
R1
O
N C C
H
R2
O
OH
R1
H
paraAcircUgraveEgravepermilEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 313 Σχηmicroατισmicroός πεπτιδικού δεσmicroού R1 και R2 αναφέρονταιστο microεταβλητό microέρος των αmicroινοξέων (πλευρική αλυσίδα) (βλ Εικόνα 312)
(Lndash Dndash$) 13- (Dndash Lndash$)
36 Έλεγχος εννοιών
21 $ - $ 13 13 $ ( ) -6
$ - $
$ -
- $ 13 - $ -
37 Πρωτεΐνες πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή
6 - - 6 () 6
13 - (f 5 17) 6 13 - - - 6 = 7 - -
Πρωτοταγής δοmicroή
6 $ $ (-
58 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
T T
P
M M
Pbatilde b
h
n n
h
(middot) (sbquo)
Εικόνα 314 Σχεδιαγράmicromicroατα κρυστάλλων τρυγικού οξέος (C4H6O6) διάχειρός Louis Pasteur από το περίφηmicroο άρθρο του περί οπτικής ενεργότητας(α) Αριστεροχειρικός κρύσταλλος (microορφή L) (β) ∆εξιοχειρικός κρύσταλλος(microορφή D) Οι δύο κρύσταλλοι είναι κατοπτρικά είδωλα ο ένας του άλλου(δηλ εναντιοmicroερή) Τα γράmicromicroατα πάνω στις έδρες των κρυστάλλων υποδη-λώνουν τα ζεύγη εναντιοmicroερών εδρών κατά τον συmicroβολισmicroό του PasteurΓια να αναδειχθεί σαφέστερα η εναντιοmicroέρεια των κρυστάλλων έχει χρησι-microοποιηθεί έγχρωmicroη σκίαση
(sbquo)
NH2H2N
COOH
C HH2N
CH3
COO
CH
CH3
ErsaquoAcircpermilEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
COOH
C NH2
CH3
COOH
CH
CH3
H
L-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml D-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml
(Aacute)
HO
HO
HO
OH
HHO
C OHH
OH
CH2OH
O
C H
CH
H
H
CH2OH
D-degIuml˘Icircfi˙Euml L-degIuml˘Icircfi˙Euml
CO
OH
(middot)
H
CH
C
CH
HC
C
C
tradeUgraveEumlOacute UgraveUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEuml UacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo UgraveOcirc IgraveAcircOacute sbquocurrenIumlOcirc˜ ımiddot UacutecurrenAcircEgrave Oacutemiddot ıAcircˆUacuteEumlıAcircrsaquo fiUgraveEgrave IcircmiddotUgraveAcirc˘ıDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave UacuteOcirc˜ UgraveOcircOacute middotUacutemiddotUgraveEumlUacuteEumlUgravelsaquo Euml permilAcirc permilEgravemiddotIcircAcircIcircOcircIgraveIgravecurrenOacuteEuml AacuteUacutemiddotIgraveIgravelsaquo fiUgraveEgrave middotOcircIgravemiddotIcircUacuteDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave middotfi middot˘UgravefiOacute
bC C
a
c c
a
d db
TUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
Εικόνα 315 Ισοmicroερή (α) Υπόδειγmicroα ζεύγους κατοπτρικών ειδώλων(β) Εναντιοmicroερή γλυκόζης (γ) Εναντιοmicroερή του αmicroινοξέος αλανίνη Παρατη-ρήστε ότι όπως και να περιστραφούν οι τριδιάστατες προβολές των microορίωνοι δύο microορφές L και D είναι αδύνατον να συmicroπέσουν
313) $ $ - 13 $ 13 0 $ - $ 13 6 - $ 6 6 6 15 $ 6 10000 -$ 6 $ 7 ( )
= $ - 13 = - 13 13 + - 13 13
∆ευτεροταγής δοmicroή
= $ R $ 13 13 6( 316) ( 31) - 6 M - - - 7 - (316) gt $ $ = ( - ) - - ( 316)
M - 1313 - $ (- 316)
- - - -
37 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ΠΡΩΤΟΤΑΓΗΣ ΚΑΙ ∆ΕΥΤΕΡΟΤΑΓΗΣ ∆ΟΜΗ 59
(middot)
(sbquo)
CC C
C
CC
C C
C
C
C
C
CCC
C C C
C
C
CC C
CC C
C
C
C
CC
CC
C
CC CC
C C
CC
C
C
C C
CC C
CC
C
CC
C C
CC
CCCC
C C
CC CC
C C
C
O
O
O O O
O
O
O O O
O
O O
O
O O
O
OO
O
OO
O
O O
O
O
O O
O
O O
OO
OO
RR
R R
R
RR R R
R R R
RRR
R R R
RRR
R R R
R R R
RR
RR
RR
R
R
H
HH
HH
HHH H
H
H HH
H
H
H
H
H H
H
H H
H
H H
H
H H
H
HH
H
H
H
HHHH
HH
H
HH
HH
HH
HH
HH
HH
NN
NN
NN
NN
N
N
N N
N
NN
N
N N
N
N N
N
NN
N
NN
N
N N
N
N
NNNN
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger AacuteAcircEgraveUgraveOcircOacuteEgraveIcircOgraveOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger middotOcircIgravemiddotIcircUacute˘UcircIgravecurrenOacuteˆOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
Εικόνα 316 ∆ευτεροταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων (α) ∆ευτεροταγήςδοmicroή α-έλικας Παρατηρήστε ότι οι δεσmicroοί υδρογόνου σχηmicroατίζονται microετα-ξύ ατόmicroων των πεπτιδικών δεσmicroών χωρίς τη συmicromicroετοχή των οmicroάδων R (β)∆ευτεροταγής δοmicroή β-πτυχωτής επιφάνειας
13 - - - 13 6 - - - (13 317)amp 13 13(domains) - $ 7-
38 Πρωτεΐνες δοmicroές υψηλότερης τάξης και αποδιάταξη
+ - $ - = 13 6 0 - - 13 S $ - - - 13 -
$ 13 - - ( 317)
(ndashSH) 6 amp ndashSH - $ $ amp 6 -6 $ ( 317) $- 6 = - - ( 317 318) - ( - ) (f 55)
A 6 - 13 6 - 7 7 - 13 ( 318) 6 +-
60 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot B
(middot) IOacuteUcircOcirc˘IumlrsaquoOacuteEuml (sbquo) PEgravesbquoOcircOacuteOcirc˘IcircIumlAcirciquestUcircEuml
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot A
-currenIumlEgraveIcircmiddot
-Ugrave˘macrˆUgravelsaquoAcircEgraveEcirciquestOacuteAcircEgravemiddot
Εικόνα 317 Τριτοταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων που υποδεικνύει και τιςθέσεις εντοπισmicroού περιοχών microε δευτεροταγή δοmicroή α-έλικας ή β-πτυχωτήςεπιφάνειας (α) Ινσουλίνη microια πρωτεΐνη που έχει δύο πολυπεπτιδικές αλυ-σίδες (f Τmicroήmicroα 319) παρατηρήστε ότι η αλυσίδα Β περιέχει δοmicroές α-έλικας αλλά και β-πτυχωτής επιφάνειας και ότι οι δισουλφιδικοί δεσmicroοί(κυανό χρώmicroα) συντελούν στον καθορισmicroό της τελικής αναδίπλωσης (τριτο-ταγούς δοmicroής) (β) Ριβονουκλεάση microια microεγάλη πρωτεΐνη microε αρκετές περιο-χές α-έλικας και β-πτυχωτής επιφάνειας
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜ 13
Εικόνα 318 Τεταρτοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης Υπάρχουν δύο είδηπολυπεπτιδίων στην αιmicroοσφαιρίνη αλυσίδες α (κυανό και κόκκινο χρώmicroα)και αλυσίδες β (πορτοκαλί και κίτρινο χρώmicroα) και συνολικά 4 πολυπεπτίδιαστο τελικό πρωτεϊνικό microόριο (εδώ τα laquoαraquo και laquoβraquo αναφέρονται σε ονοmicroασίεςπολυπεπτιδικών αλυσίδων και όχι σε είδη δευτεροταγούς δοmicroής) Η τεταρ-τοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης συmicroβολίζεται ως α2 β2 Οι 4 διακριτές αλυ-σίδες απεικονίζονται microε 4 διαφορετικά χρώmicroατα
6 - ( 6 13) - $ ( van der Waals 13 ) ( - $ )
Aποδιάταξη (microετουσίωση)
0 6 - pH - 13 ( 319) =$ 13 - 6 - ( 313) + $ F $ - - (-) amp $ $ ( 319) S 13 6 13 - ( 1313 ) - - $ 1313-13 13
= $ 7 - 7 13 - 0 20 - 6 - amp - - $ 13
Tα επόmicroενα κεφάλαια
amp - 4
- - 13 - 5 13 13 amp - 4 5 $ 13- (f 12) $ $- 0 $ ( 6)
M 1313 - 3 13
38 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ∆ΟΜΕΣ ΥΨΗΛΟΤΕΡΗΣ ΤΑΞΗΣ ΚΑΙ ΑΠΟ∆ΙΑΤΑΞΗ 61
lozEgravemiddotmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(Ocirc˘Uacutersaquomiddot)
ŒOacuteUgraveOcircOacuteEumlmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(100AEligC)
AOcircIgraveiquestIcircUacute˘OacuteUcircEumlOcirc˘Uacutersaquomiddot˜Oslash OacutecurrenmiddotAcircOacuteAcircUacuteAacuteOcircOcircrsaquoEumlUcircEuml
aeligDaggerIacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜ AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
Εικόνα 319 Aποδιάταξη (microετουσίωση) της πρωτεΐνης ριβονουκλεάση(της οποίας η δοmicroή δίνεται στην Εικόνα 317β) Παρατηρήστε πώς οι έντο-νες συνθήκες αποδιάταξης οδηγούν σε ένα οριστικά κατεστραmicromicroένο microόριο(ως προς τη βιολογική λειτουργία του) λόγω εσφαλmicroένης αναδίπλωσης
amp - $ - $ - - F - 13 7 7 $ 13 $ 13 13 -13
37 και 38 Έλεγχος εννοιών
= 6 - $ 6
( ) ( F- $)
1313 7
13 13amp -
6 - - -
F 13 -6 1313136
F $ 6 $ $ 7
62 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
Eρωτήσεις επανάληψης
- $
7 RNA DNA - amp $ RNA DNA DNA RNA
8 amp F $ R 7 $ 13amp -7
9 $ -$ - (Y13 13 313)
10 Z (13 31) -
1 -13 13 $
2 $
3 13 ((13- 13 31)
4 amp13 $ 13 13 amp 13- -
5 amp -
6 $ - 37
Eρωτήσεις εφαρmicroογής
1 RNA () GUCAAAGAC (13) ACGAUAACC+ RNA - amp
2 () -6 F 13 -$ 13 -6
3 Halobacterium A 13 - (K+) 5 M 5- F K+ - 6 Haloba-cterium F $ 6 Escherichia coli 13-
ΕΡΩΤΗΣΕΙΣ ΕΦΑΡΜΟΓΗΣ 63
K+ $ (-13 $ $- 13 K+
4 6 -- 6 - amp-
5 0 13 13 - - F
13- 13
6 M rsquo F 5 1313 - 13 ( $) laquo- 13raquo 6 6 13
$ 14 20 ( 37)
Tριγλυκερίδια και σύνθετα λιπίδια
() $ 13 ( 37)
13 $
- ( 37) $$13 - 13 13 (f 45)
13 13 13- $ ()13 13 (f 45) - 13 -13 $
34 Έλεγχος εννοιών
13 - 13
$ 13
13 13 $
$ 4 (C4)
35 Nουκλεϊκά οξέα
7 $ $137 (DNA) 137 (RNA) 13 -13 DNA - RNA - - $ 6 M - 5 13 ( RNA)
35 ΝΟΥΚΛΕΪΚΑ ΟΞΕΑ 53
MOcircOacuteOcircAacutemiddotIumlmiddotIcircUgraveOcirc˙˘IumlOcircpermilEgraveAacuteIuml˘IcircAcircUacutersaquopermilEgraveOcirc(currenOacutemiddot AacuteIuml˘IcircOcircIumlEgraversaquopermilEgraveOcirc)
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot Ucirc˘OacutepermilAcircpermilAcircIgravecurrenOacutemiddot IgraveAcirc AacuteIuml˘IcircAcircUacutefiIumlEumlIgravecurrenUcircˆ AcircUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircOcircDagger permilAcircUcircIgraveOcircDagger
OH
OH
OH
H3CKOcircUacuteAcircUcircIgravecurrenOacuteOcirc C16 (middotIumlIgraveEgraveUgraveEgraveIcircfi)
MOcircOacuteOcircmiddotIcircfiUacuteAcircUcircUgraveOcirc C16 (middotIumlIgraveEgraveUgraveAcircIumlmiddot˚Icircfi)
C OH
O
CH3 C OH
O
H3CC O
O
H3CC O
OC
C
H
H
H
O C H
H
O
CH2OH
degmiddotIumlmiddotIcircUgravefi˙Euml
H3CC O
O
H3CC O
OC
C
H
H
H
P O
O
C H
H
ndashO
O
CH2
CH2+NH3
AEgraveımiddotOacuteOcircIumlmiddotIgraversaquoOacuteEuml
H3CC O
O
C H
H3CC O
O
C H
H3CC O
O
C H
H
H
KOcircEgraveOacuteiquest IumlEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
tradeDaggerOacuteıAcircUgraveOcirc IumlEgraversaquopermilEgraveOcirc
AIumliquest IumlEgraversaquopermilEgravemiddot (UgraveUacuteEgraveAacuteIuml˘IcircAcircUacutersaquopermilEgravemiddot)
tradeDaggerOacuteıAcircUgraveOcirc IumlEgraversaquopermilEgraveOcircordmˆUcircEcircmiddotUgraveEgravepermil˘IumlOcircmiddotEgraveımiddotOacuteOcircIumlmiddotIgraversaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot EcircˆUcircEcircOcircIumlEgraversaquopermilEgraveOcirc)
degIuml˘IcircAcircUacutefiIumlEuml
12
3546
78
910
1112
1314
1516
23
4
5
6
1
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
sectEgravemiddotUacuteiquest OcircIacutecurrenmiddot
EUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi
Εικόνα 37 Λιπαρά οξέα απλά λιπίδια (λίπη) και σύνθετα λιπίδια Απλάλιπίδια σχηmicroατίζονται microε microια αντίδραση αφυδάτωσης microεταξύ λιπαρών οξέωνκαι γλυκερόλης η οποία δηmicroιουργεί εστερικό δεσmicroό
$13 ( DNA) 13 PO4
3ndash = - DNA RNA - 38
Nουκλεοτίδια
13 7 $ - 13 13 (
) 13 - $ ( 39) = DNA RNA = ( $-) DNA RNA 13 () -$ C-1 N 13 13 1 ( ) 9 ( -) amp - 13 - ( 310)
13 7 $ 5 ATP ( ) ( 310) -
54 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi P
O
Ondash
OndashO
C C
O BiquestUcircEuml
OH
H HHH C
OH PEgravesbquofi˙Euml
5atilde
4atilde
3atilde 2atilde1atilde
C
CH2
Εικόνα 38 Νουκλεοτίδια Εδώ απεικονίζεται ένα ριβονουκλεοτίδιο πουαπαντά στο RNA Τα δεοξυριβονουκλεοτίδια που απαντούν στο DNA έχουνστον άνθρακα 2rsquo ένα άτοmicroο H αντί της οmicroάδας ndashOH Η αρίθmicroηση των θέσε-ων του σακχάρου γίνεται microε τονούmicroενους αριθmicroούς για να διακρίνεται από τηναρίθmicroηση των θέσεων του δακτυλίου της αζωτούχου βάσης οι οποίες επί-σης αριθmicroούνται (1 2 3 κλπ) (βλ Εικόνα 39) Τόσο τα δεοξυριβονου-κλεοτίδια όσο και τα ριβονουκλεοτίδια περιέχουν microια 5rsquo-φωσφορική οmicroάδα
N
N
N
N
1
234
56
78
9
N
N
N
N
NH2
N
N
N
NH
NH2
O
N
N
3
216
54
N
NH
O
O
H3C
NH
O
NH2
K˘UgraveOcircUcircrsaquoOacuteEuml (C)
pound˘IgraversaquoOacuteEuml (T)
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEuml (A)
degOcirc˘middotOacutersaquoOacuteEuml (G)
DNA RNA
BiquestUcircAcircEgrave˜ ˘UacuteEgraveIgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml˜ BiquestUcircAcircEgrave˜ Ocirc˘UacutersaquoOacuteEuml˜
H
N
DNA RNA
MfiOacuteOcircDNA
Εικόνα 39 ∆οmicroές των βάσεων του DNA και του RNA ∆εν παρατίθεταιστην εικόνα η ουρακίλη (U) της οποίας η δοmicroή είναι όmicroοια microε της θυmicroίνηςmicroε τη microόνη διαφορά ότι στερείται της microεθυλοmicroάδας στον C-5 Παρατηρήστετο σύστηmicroα αρίθmicroησης των δακτυλίων Κατά την ένωση τους microε τον άνθρα-κα 1rsquo του φωσφοσακχάρου για τον σχηmicroατισmicroό νουκλεοτιδίου (Εικόνα 38)οι βάσεις πυριmicroιδίνης συνδέονται microέσω του N-1 του δακτυλίου και οι βάσειςπουρίνης microέσω του N-9
TUacuteEgraveEcircˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcirclsaquo middotpermilAcircOacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot OacuteOcirc˘IcircIumlAcircOcircUgraversaquopermilEgraveOcirc)
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi˜AcircUcircUgravecurrenUacutemiddot˜
N-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
OHOCH2 OH
HH
H
H
OHOH
PEgravesbquofi˙Euml
N N
NN
NH2
+
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEuml
OHOCH2
OHOH
N N
NN
NH2
ApermilAcircOacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot˜ OacuteOcirc˘IcircIumlAcircOcirc˙rsaquoUgraveEuml˜)
3 PO43ndash
OCH2
OHOH
N N
NN
NH2
OPOPOPndashO
O
Ondash
O
Ondash
O
Ondash
ordmˆUcircEcircOcirc-middotOacute˘permilUacutersaquoUgraveEuml˜
H H
H
H
H
H
H H H
~ ~65
4 32
178
9
65
4 32
178
9
65
4 32
178
9
Eικόνα 310 Συστατικά ενός σηmicroαντικού νουκλεοτιδίου της τριφω-σφορικής αδενοσίνης Η ενέργεια υδρόλυσης του φωσφοανυδριτικού δεσmicroού(κυmicroατιστές παύλες) είναι microεγαλύτερη από αυτήν του φωσφορικού εστέραγεγονός που η σηmicroασία του θα γίνει αντιληπτή στο Κεφάλαιο 5 (f Tmicroήmicroα58)
- - - (f 58) L - $- (f 57) 13 (f
515) 13 $ - 7 $ $ -
Nουκλεϊκά οξέα
Q 7 $ - - ( 311)
$ - 3 ( 3acute) 5 (5acute) (- 311) = F $$13
= DNA RNA - 0 13 DNA RNA - 0 - (f 7) DNA - RNA
35 ΝΟΥΚΛΕΪΚΑ ΟΞΕΑ 55
paraAcircUacuteEgraveOcircmacrlsaquo UcircDagger˙Acirc˘IacuteEuml˜Ucirc˘IgraveIumlEumlUacuteˆIgravemiddotUgraveEgraveIcircOgraveOacutesbquoiquestUcircAcircˆOacute
A˙ˆUgraveOcircDaggermacrOcirc˜ sbquoiquestUcircEumlUcirc˘OacutepermilAcircpermilAcircIgravecurrenOacuteEuml UcircUgraveEuml ıcurrenUcircEuml 1atilde
H H
H2C BiquestUcircEumlO
O3atilde
1atilde
2atilde
5atilde
5atilde
5atilde
5 3
3atilde
3atilde
3atilde
3atilde 5atilde
P OndashO
H H H
H
H
H2C BiquestUcircEumlO
O
O
H H H
H
H
O
O
(i)
(ii)
poundcurrenUcircEuml 5atilde
P OndashO
O
P OndashO
O
centAcircOcircIacute˘UacuteEgravesbquofi˙Euml
paraUacuteˆUgraveOcircUgravemiddotAacutelsaquo˜permilOcircIgravelsaquo
centAcirc˘UgraveAcircUacuteOcircUgravemiddotAacutelsaquo˜permilOcircIgravelsaquo
poundcurrenUcircEuml 3atilde
(middot)
(sbquo)
A
C G
G C
C G
C G
A U
(Aacute)
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi
A GG CC T T A
T CC GG A A T
C C A U C GA CG U G A
C C U C G GC GG A C A
C
BiquestUcircEumlH2C
5atilde
4atilde
H
HcentAcircUcircIgraveOcircrsaquo˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘
ordmˆUcircEcircOcircpermilEgraveAcircUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 311 DNA και RNA (α) ∆οmicroή microέρους microιας αλυσίδας DNA Οι αζωτούχες βάσεις microπορεί να είναι αδενίνη γουανίνη κυτοσίνη ή θυmicroίνη Στο RNAυπάρχει microια οmicroάδα ndashOH στον άνθρακα 2rsquo της πεντόζης (βλ Εικόνα 38) και ουρακίλη αντί της θυmicroίνης (β) Απλουστευmicroένο σχήmicroα της δοmicroής του DNA όπουαπεικονίζονται microόνον οι αζωτούχες βάσεις Παρατηρήστε ότι οι δύο αλυσίδες (κλώνοι DNA) είναι συmicroπληρωmicroατικές ως προς την ακολουθία βάσεων (A=T GintC)και συνδέονται microε δεσmicroούς υδρογόνου που σχηmicroατίζονται microεταξύ αυτών των βάσεων Οι δύο κλώνοι DNA απεικονίζονται microε πράσινο χρώmicroα σε δύο διαφορετι-κούς τόνους σκίασης χρωmicroατική σύmicroβαση που εφαρmicroόζεται σε όλο το βιβλίο (γ) RNA (i) πρωτοταγής δοmicroή (ii) πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή Στο RNAσχηmicroατίζονται δευτεροταγείς δοmicroές όταν παρουσιάζονται δυνατότητες για ενδοmicroοριακή ζεύξη βάσεων δηλ για ζεύξη βάσεων της ίδιας αλυσίδας Σε ορισmicroέναπολύ microεγάλα microόρια RNA όπως πχ στο ριβοσωmicroατικό RNA (f Τmicroήmicroατα 715 και 114) άλλες περιοχές του microορίου έχουν microόνο πρωτοταγή δοmicroή και άλλεςτόσο πρωτοταγή όσο και δευτεροταγή δοmicroή Αυτό οδηγεί σε microόρια microε τελικό τριδιάστατο σχήmicroα που είναι καθοριστικό για τη λειτουργία τους και εmicroπεριέχειεκτενείς περιελίξεις ή συσπειρώσεις (f Εικόνα 118γ) Το RNA απεικονίζεται microε πορτοκαλί χρώmicroα χρωmicroατική σύmicroβαση που διατηρείται σε όλο το βιβλίο
$ 1313 -
DNA
DNA DNA - $ -$ (13 32) - - $ (G) (C) $ (A) (T) (13 32) $ $ 13 A T G C DNA - 13 0 G - C T A ( 311)
RNA
$ 137$ S RNA $ 13 - amp 13 - RNA 1313 ( 311)
RNA 13 $ RNA (messenger RNAmRNA) DNA 13- DNA $ RNA (transfer RNA tRNA) - 7 -- -$ 7 - RNA (ribosomal RNA rRNA) 13 7 0 RNA $ - 7 11
35 Έλεγχος εννοιών
7 $ - 13 - RNA DNA RNA
-
13 $ 1313
RNA
36 Tα αmicroινοξέα και ο πεπτιδικός δεσmicroός
$ 7- $ - $ 21 $ 0 $ - (ndashCOOH) (ndashNH2) (- 31 312) amp - $ 13-$ $ - $ ( ) -13 13 - 6 ( 313)
0 $ - 312 ( ROslash 312) - -- 13$13 13 13$ ( ) ( $ ) (- 312) $ 13 - $ - laquoraquo$ 312 = - - 13$ $ $ $ $ L $ 13 - $ = 6 - (ndashSH) -$ - (RndashSndashSndashR) F - $ $ 7 - 13
Iσοmicroερή
amp
56 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
$ Louis Pasteur 13 -F (f 15) 13 = Pasteur F $ ( 314) $ 13 - ( $ )
- (f 48) X laquo- raquo $ - D
L ( 315) 13 - Dndash
$ D L 0 - 6 $ Lndash$ Dndash (- 315) Dndash$ - (f 48) 13 (f 209) Dndash$ Lndash Lndash Dndash
36 ΤΑ ΑΜΙΝΟΞΕΑ ΚΑΙ Ο ΠΕΠΤΙ∆ΙΚΟΣ ∆ΕΣΜΟΣ 57
H
CH3
CHCH3
CH3
CH2CHCH3
CH3
CHCH3
CH2CH3
CH2OHCHCH3
OH
CH2
O-O
CH2C
O
NH2
CH2C
O-O CH2
CH2C
O
CH2NH2
CH2HS
CH2S CH2CH3
CH2
CH2HO
CH2
NH
CH2CH2CH2CH2+NH3
CH2CH2CH2+NH2 N
HC
NH2CH2
HN
+HN
N
CH2H2C
H2C CH COOndash
Gly degIuml˘IcircrsaquoOacuteEuml (G)
Ala AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (A)
Val BmiddotIumlrsaquoOacuteEuml (V)
Leu sectAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (L)
Ile IUcircOcircIumlAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (I)
Ser tradeAcircUacutersaquoOacuteEuml (S)Thr poundUacuteAcircOcircOacutersaquoOacuteEuml (T)
Asp AUcircmiddotUacuteUgraveEgraveIcircfi (D)
Asn AUcircmiddotUacutemiddotAacutersaquoOacuteEuml (N)
Glu degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraveEgraveIcircfi (E)
Gln degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraversaquoOacuteEuml (Q)
Cys K˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (C)
CH2HSe Sec tradeAcircIumlEumlOacuteOcircIcirc˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (U)
Met MAcircıAcircEgraveOcircOacutersaquoOacuteEuml (M)
Phe ordmmiddotEgraveOacute˘IumlmiddotIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (F)
Tyr T˘UacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (Y)
Trp TUacute˘UgraveOcircEcirciquestOacuteEuml (W)
Lys sect˘UcircrsaquoOacuteEuml (K)
Arg AUacuteAacuteEgraveOacutersaquoOacuteEuml (R)
His IUcircUgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml (H)
Pro
centOcircIgravelsaquo UgraveˆOacute middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteEgraveIcircOgraveOacute OcircIgraveiquestpermilˆOacute
OHC
O
CR
H
NH2
AIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot
degAcircOacuteEgraveIcirclsaquo permilOcircIgravelsaquo AcircOacutefi˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenOcirc˜
(tradeEumlIgraveAcircrsaquoˆUcircEuml tradeUgraveEumlOacute AcircUacutersaquoUgraveˆUcircEuml UgraveEuml˜ UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml˜ middotAcircEgraveIcircOcircOacutersaquo˙AcircUgravemiddotEgrave OcircIumlfiIcircIumlEumlUacuteEuml Euml permilOcircIgravelsaquo fimacrEgrave IgravefiOacuteOcircOacute Euml OcircIgraveiquestpermilmiddot R H UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml permilAcircOacute AcircrsaquoOacutemiddotEgrave middotIcircUacuteEgravesbquoOgrave˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteDagger permilEgravefiUgraveEgrave UcircUgraveAcircUacuteAcircrsaquoUgravemiddotEgrave AcircIumlAcircDaggerıAcircUacuteEuml˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot˜)
H IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-fiIacuteEgraveOacuteOcirc
MEuml OcircIumlEgraveIcircfi(˘permilUacutefiEcircOcircsbquoOcirc)
C
KIumlAcircrsaquopermilmiddot
-iquestOacuteıUacutemiddotIcircmiddot˜
KmiddotUacutesbquoOcircIacute˘IumlOcircIgraveiquestpermilmiddot
paraUacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml (P)
IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-middotIumlIcircmiddotIumlEgraveIcircfi
paraOcircIumlEgraveIcircfi IgraveEuml EgraveOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc Εικόνα 312 Συντακτικοί τύποι των 21 κοινών αmicroινοξέων Αριστερά απότο όνοmicroα κάθε αmicroινοξέος δίνεται η τριγράmicromicroατη συντοmicroογραφία του και δεξιά(σε παρένθεση) η microονογράmicromicroατη συντοmicroογραφία του
H2N C C
H O
OH NH
C C
H
R2
O
OH+ H
H2O
H2N C C
H
R1
O
N C C
H
R2
O
OH
R1
H
paraAcircUgraveEgravepermilEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 313 Σχηmicroατισmicroός πεπτιδικού δεσmicroού R1 και R2 αναφέρονταιστο microεταβλητό microέρος των αmicroινοξέων (πλευρική αλυσίδα) (βλ Εικόνα 312)
(Lndash Dndash$) 13- (Dndash Lndash$)
36 Έλεγχος εννοιών
21 $ - $ 13 13 $ ( ) -6
$ - $
$ -
- $ 13 - $ -
37 Πρωτεΐνες πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή
6 - - 6 () 6
13 - (f 5 17) 6 13 - - - 6 = 7 - -
Πρωτοταγής δοmicroή
6 $ $ (-
58 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
T T
P
M M
Pbatilde b
h
n n
h
(middot) (sbquo)
Εικόνα 314 Σχεδιαγράmicromicroατα κρυστάλλων τρυγικού οξέος (C4H6O6) διάχειρός Louis Pasteur από το περίφηmicroο άρθρο του περί οπτικής ενεργότητας(α) Αριστεροχειρικός κρύσταλλος (microορφή L) (β) ∆εξιοχειρικός κρύσταλλος(microορφή D) Οι δύο κρύσταλλοι είναι κατοπτρικά είδωλα ο ένας του άλλου(δηλ εναντιοmicroερή) Τα γράmicromicroατα πάνω στις έδρες των κρυστάλλων υποδη-λώνουν τα ζεύγη εναντιοmicroερών εδρών κατά τον συmicroβολισmicroό του PasteurΓια να αναδειχθεί σαφέστερα η εναντιοmicroέρεια των κρυστάλλων έχει χρησι-microοποιηθεί έγχρωmicroη σκίαση
(sbquo)
NH2H2N
COOH
C HH2N
CH3
COO
CH
CH3
ErsaquoAcircpermilEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
COOH
C NH2
CH3
COOH
CH
CH3
H
L-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml D-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml
(Aacute)
HO
HO
HO
OH
HHO
C OHH
OH
CH2OH
O
C H
CH
H
H
CH2OH
D-degIuml˘Icircfi˙Euml L-degIuml˘Icircfi˙Euml
CO
OH
(middot)
H
CH
C
CH
HC
C
C
tradeUgraveEumlOacute UgraveUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEuml UacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo UgraveOcirc IgraveAcircOacute sbquocurrenIumlOcirc˜ ımiddot UacutecurrenAcircEgrave Oacutemiddot ıAcircˆUacuteEumlıAcircrsaquo fiUgraveEgrave IcircmiddotUgraveAcirc˘ıDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave UacuteOcirc˜ UgraveOcircOacute middotUacutemiddotUgraveEumlUacuteEumlUgravelsaquo Euml permilAcirc permilEgravemiddotIcircAcircIcircOcircIgraveIgravecurrenOacuteEuml AacuteUacutemiddotIgraveIgravelsaquo fiUgraveEgrave middotOcircIgravemiddotIcircUacuteDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave middotfi middot˘UgravefiOacute
bC C
a
c c
a
d db
TUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
Εικόνα 315 Ισοmicroερή (α) Υπόδειγmicroα ζεύγους κατοπτρικών ειδώλων(β) Εναντιοmicroερή γλυκόζης (γ) Εναντιοmicroερή του αmicroινοξέος αλανίνη Παρατη-ρήστε ότι όπως και να περιστραφούν οι τριδιάστατες προβολές των microορίωνοι δύο microορφές L και D είναι αδύνατον να συmicroπέσουν
313) $ $ - 13 $ 13 0 $ - $ 13 6 - $ 6 6 6 15 $ 6 10000 -$ 6 $ 7 ( )
= $ - 13 = - 13 13 + - 13 13
∆ευτεροταγής δοmicroή
= $ R $ 13 13 6( 316) ( 31) - 6 M - - - 7 - (316) gt $ $ = ( - ) - - ( 316)
M - 1313 - $ (- 316)
- - - -
37 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ΠΡΩΤΟΤΑΓΗΣ ΚΑΙ ∆ΕΥΤΕΡΟΤΑΓΗΣ ∆ΟΜΗ 59
(middot)
(sbquo)
CC C
C
CC
C C
C
C
C
C
CCC
C C C
C
C
CC C
CC C
C
C
C
CC
CC
C
CC CC
C C
CC
C
C
C C
CC C
CC
C
CC
C C
CC
CCCC
C C
CC CC
C C
C
O
O
O O O
O
O
O O O
O
O O
O
O O
O
OO
O
OO
O
O O
O
O
O O
O
O O
OO
OO
RR
R R
R
RR R R
R R R
RRR
R R R
RRR
R R R
R R R
RR
RR
RR
R
R
H
HH
HH
HHH H
H
H HH
H
H
H
H
H H
H
H H
H
H H
H
H H
H
HH
H
H
H
HHHH
HH
H
HH
HH
HH
HH
HH
HH
NN
NN
NN
NN
N
N
N N
N
NN
N
N N
N
N N
N
NN
N
NN
N
N N
N
N
NNNN
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger AacuteAcircEgraveUgraveOcircOacuteEgraveIcircOgraveOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger middotOcircIgravemiddotIcircUacute˘UcircIgravecurrenOacuteˆOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
Εικόνα 316 ∆ευτεροταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων (α) ∆ευτεροταγήςδοmicroή α-έλικας Παρατηρήστε ότι οι δεσmicroοί υδρογόνου σχηmicroατίζονται microετα-ξύ ατόmicroων των πεπτιδικών δεσmicroών χωρίς τη συmicromicroετοχή των οmicroάδων R (β)∆ευτεροταγής δοmicroή β-πτυχωτής επιφάνειας
13 - - - 13 6 - - - (13 317)amp 13 13(domains) - $ 7-
38 Πρωτεΐνες δοmicroές υψηλότερης τάξης και αποδιάταξη
+ - $ - = 13 6 0 - - 13 S $ - - - 13 -
$ 13 - - ( 317)
(ndashSH) 6 amp ndashSH - $ $ amp 6 -6 $ ( 317) $- 6 = - - ( 317 318) - ( - ) (f 55)
A 6 - 13 6 - 7 7 - 13 ( 318) 6 +-
60 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot B
(middot) IOacuteUcircOcirc˘IumlrsaquoOacuteEuml (sbquo) PEgravesbquoOcircOacuteOcirc˘IcircIumlAcirciquestUcircEuml
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot A
-currenIumlEgraveIcircmiddot
-Ugrave˘macrˆUgravelsaquoAcircEgraveEcirciquestOacuteAcircEgravemiddot
Εικόνα 317 Τριτοταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων που υποδεικνύει και τιςθέσεις εντοπισmicroού περιοχών microε δευτεροταγή δοmicroή α-έλικας ή β-πτυχωτήςεπιφάνειας (α) Ινσουλίνη microια πρωτεΐνη που έχει δύο πολυπεπτιδικές αλυ-σίδες (f Τmicroήmicroα 319) παρατηρήστε ότι η αλυσίδα Β περιέχει δοmicroές α-έλικας αλλά και β-πτυχωτής επιφάνειας και ότι οι δισουλφιδικοί δεσmicroοί(κυανό χρώmicroα) συντελούν στον καθορισmicroό της τελικής αναδίπλωσης (τριτο-ταγούς δοmicroής) (β) Ριβονουκλεάση microια microεγάλη πρωτεΐνη microε αρκετές περιο-χές α-έλικας και β-πτυχωτής επιφάνειας
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜ 13
Εικόνα 318 Τεταρτοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης Υπάρχουν δύο είδηπολυπεπτιδίων στην αιmicroοσφαιρίνη αλυσίδες α (κυανό και κόκκινο χρώmicroα)και αλυσίδες β (πορτοκαλί και κίτρινο χρώmicroα) και συνολικά 4 πολυπεπτίδιαστο τελικό πρωτεϊνικό microόριο (εδώ τα laquoαraquo και laquoβraquo αναφέρονται σε ονοmicroασίεςπολυπεπτιδικών αλυσίδων και όχι σε είδη δευτεροταγούς δοmicroής) Η τεταρ-τοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης συmicroβολίζεται ως α2 β2 Οι 4 διακριτές αλυ-σίδες απεικονίζονται microε 4 διαφορετικά χρώmicroατα
6 - ( 6 13) - $ ( van der Waals 13 ) ( - $ )
Aποδιάταξη (microετουσίωση)
0 6 - pH - 13 ( 319) =$ 13 - 6 - ( 313) + $ F $ - - (-) amp $ $ ( 319) S 13 6 13 - ( 1313 ) - - $ 1313-13 13
= $ 7 - 7 13 - 0 20 - 6 - amp - - $ 13
Tα επόmicroενα κεφάλαια
amp - 4
- - 13 - 5 13 13 amp - 4 5 $ 13- (f 12) $ $- 0 $ ( 6)
M 1313 - 3 13
38 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ∆ΟΜΕΣ ΥΨΗΛΟΤΕΡΗΣ ΤΑΞΗΣ ΚΑΙ ΑΠΟ∆ΙΑΤΑΞΗ 61
lozEgravemiddotmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(Ocirc˘Uacutersaquomiddot)
ŒOacuteUgraveOcircOacuteEumlmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(100AEligC)
AOcircIgraveiquestIcircUacute˘OacuteUcircEumlOcirc˘Uacutersaquomiddot˜Oslash OacutecurrenmiddotAcircOacuteAcircUacuteAacuteOcircOcircrsaquoEumlUcircEuml
aeligDaggerIacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜ AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
Εικόνα 319 Aποδιάταξη (microετουσίωση) της πρωτεΐνης ριβονουκλεάση(της οποίας η δοmicroή δίνεται στην Εικόνα 317β) Παρατηρήστε πώς οι έντο-νες συνθήκες αποδιάταξης οδηγούν σε ένα οριστικά κατεστραmicromicroένο microόριο(ως προς τη βιολογική λειτουργία του) λόγω εσφαλmicroένης αναδίπλωσης
amp - $ - $ - - F - 13 7 7 $ 13 $ 13 13 -13
37 και 38 Έλεγχος εννοιών
= 6 - $ 6
( ) ( F- $)
1313 7
13 13amp -
6 - - -
F 13 -6 1313136
F $ 6 $ $ 7
62 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
Eρωτήσεις επανάληψης
- $
7 RNA DNA - amp $ RNA DNA DNA RNA
8 amp F $ R 7 $ 13amp -7
9 $ -$ - (Y13 13 313)
10 Z (13 31) -
1 -13 13 $
2 $
3 13 ((13- 13 31)
4 amp13 $ 13 13 amp 13- -
5 amp -
6 $ - 37
Eρωτήσεις εφαρmicroογής
1 RNA () GUCAAAGAC (13) ACGAUAACC+ RNA - amp
2 () -6 F 13 -$ 13 -6
3 Halobacterium A 13 - (K+) 5 M 5- F K+ - 6 Haloba-cterium F $ 6 Escherichia coli 13-
ΕΡΩΤΗΣΕΙΣ ΕΦΑΡΜΟΓΗΣ 63
K+ $ (-13 $ $- 13 K+
4 6 -- 6 - amp-
5 0 13 13 - - F
13- 13
6 M rsquo F 5 1313 - 13 ( $) laquo- 13raquo 6 6 13
$13 ( DNA) 13 PO4
3ndash = - DNA RNA - 38
Nουκλεοτίδια
13 7 $ - 13 13 (
) 13 - $ ( 39) = DNA RNA = ( $-) DNA RNA 13 () -$ C-1 N 13 13 1 ( ) 9 ( -) amp - 13 - ( 310)
13 7 $ 5 ATP ( ) ( 310) -
54 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi P
O
Ondash
OndashO
C C
O BiquestUcircEuml
OH
H HHH C
OH PEgravesbquofi˙Euml
5atilde
4atilde
3atilde 2atilde1atilde
C
CH2
Εικόνα 38 Νουκλεοτίδια Εδώ απεικονίζεται ένα ριβονουκλεοτίδιο πουαπαντά στο RNA Τα δεοξυριβονουκλεοτίδια που απαντούν στο DNA έχουνστον άνθρακα 2rsquo ένα άτοmicroο H αντί της οmicroάδας ndashOH Η αρίθmicroηση των θέσε-ων του σακχάρου γίνεται microε τονούmicroενους αριθmicroούς για να διακρίνεται από τηναρίθmicroηση των θέσεων του δακτυλίου της αζωτούχου βάσης οι οποίες επί-σης αριθmicroούνται (1 2 3 κλπ) (βλ Εικόνα 39) Τόσο τα δεοξυριβονου-κλεοτίδια όσο και τα ριβονουκλεοτίδια περιέχουν microια 5rsquo-φωσφορική οmicroάδα
N
N
N
N
1
234
56
78
9
N
N
N
N
NH2
N
N
N
NH
NH2
O
N
N
3
216
54
N
NH
O
O
H3C
NH
O
NH2
K˘UgraveOcircUcircrsaquoOacuteEuml (C)
pound˘IgraversaquoOacuteEuml (T)
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEuml (A)
degOcirc˘middotOacutersaquoOacuteEuml (G)
DNA RNA
BiquestUcircAcircEgrave˜ ˘UacuteEgraveIgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml˜ BiquestUcircAcircEgrave˜ Ocirc˘UacutersaquoOacuteEuml˜
H
N
DNA RNA
MfiOacuteOcircDNA
Εικόνα 39 ∆οmicroές των βάσεων του DNA και του RNA ∆εν παρατίθεταιστην εικόνα η ουρακίλη (U) της οποίας η δοmicroή είναι όmicroοια microε της θυmicroίνηςmicroε τη microόνη διαφορά ότι στερείται της microεθυλοmicroάδας στον C-5 Παρατηρήστετο σύστηmicroα αρίθmicroησης των δακτυλίων Κατά την ένωση τους microε τον άνθρα-κα 1rsquo του φωσφοσακχάρου για τον σχηmicroατισmicroό νουκλεοτιδίου (Εικόνα 38)οι βάσεις πυριmicroιδίνης συνδέονται microέσω του N-1 του δακτυλίου και οι βάσειςπουρίνης microέσω του N-9
TUacuteEgraveEcircˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcirclsaquo middotpermilAcircOacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot OacuteOcirc˘IcircIumlAcircOcircUgraversaquopermilEgraveOcirc)
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi˜AcircUcircUgravecurrenUacutemiddot˜
N-degIuml˘IcircOcirc˙EgraveUgraveEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
OHOCH2 OH
HH
H
H
OHOH
PEgravesbquofi˙Euml
N N
NN
NH2
+
ApermilAcircOacutersaquoOacuteEuml
OHOCH2
OHOH
N N
NN
NH2
ApermilAcircOacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (currenOacutemiddot˜ OacuteOcirc˘IcircIumlAcircOcirc˙rsaquoUgraveEuml˜)
3 PO43ndash
OCH2
OHOH
N N
NN
NH2
OPOPOPndashO
O
Ondash
O
Ondash
O
Ondash
ordmˆUcircEcircOcirc-middotOacute˘permilUacutersaquoUgraveEuml˜
H H
H
H
H
H
H H H
~ ~65
4 32
178
9
65
4 32
178
9
65
4 32
178
9
Eικόνα 310 Συστατικά ενός σηmicroαντικού νουκλεοτιδίου της τριφω-σφορικής αδενοσίνης Η ενέργεια υδρόλυσης του φωσφοανυδριτικού δεσmicroού(κυmicroατιστές παύλες) είναι microεγαλύτερη από αυτήν του φωσφορικού εστέραγεγονός που η σηmicroασία του θα γίνει αντιληπτή στο Κεφάλαιο 5 (f Tmicroήmicroα58)
- - - (f 58) L - $- (f 57) 13 (f
515) 13 $ - 7 $ $ -
Nουκλεϊκά οξέα
Q 7 $ - - ( 311)
$ - 3 ( 3acute) 5 (5acute) (- 311) = F $$13
= DNA RNA - 0 13 DNA RNA - 0 - (f 7) DNA - RNA
35 ΝΟΥΚΛΕΪΚΑ ΟΞΕΑ 55
paraAcircUacuteEgraveOcircmacrlsaquo UcircDagger˙Acirc˘IacuteEuml˜Ucirc˘IgraveIumlEumlUacuteˆIgravemiddotUgraveEgraveIcircOgraveOacutesbquoiquestUcircAcircˆOacute
A˙ˆUgraveOcircDaggermacrOcirc˜ sbquoiquestUcircEumlUcirc˘OacutepermilAcircpermilAcircIgravecurrenOacuteEuml UcircUgraveEuml ıcurrenUcircEuml 1atilde
H H
H2C BiquestUcircEumlO
O3atilde
1atilde
2atilde
5atilde
5atilde
5atilde
5 3
3atilde
3atilde
3atilde
3atilde 5atilde
P OndashO
H H H
H
H
H2C BiquestUcircEumlO
O
O
H H H
H
H
O
O
(i)
(ii)
poundcurrenUcircEuml 5atilde
P OndashO
O
P OndashO
O
centAcircOcircIacute˘UacuteEgravesbquofi˙Euml
paraUacuteˆUgraveOcircUgravemiddotAacutelsaquo˜permilOcircIgravelsaquo
centAcirc˘UgraveAcircUacuteOcircUgravemiddotAacutelsaquo˜permilOcircIgravelsaquo
poundcurrenUcircEuml 3atilde
(middot)
(sbquo)
A
C G
G C
C G
C G
A U
(Aacute)
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi
A GG CC T T A
T CC GG A A T
C C A U C GA CG U G A
C C U C G GC GG A C A
C
BiquestUcircEumlH2C
5atilde
4atilde
H
HcentAcircUcircIgraveOcircrsaquo˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘
ordmˆUcircEcircOcircpermilEgraveAcircUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 311 DNA και RNA (α) ∆οmicroή microέρους microιας αλυσίδας DNA Οι αζωτούχες βάσεις microπορεί να είναι αδενίνη γουανίνη κυτοσίνη ή θυmicroίνη Στο RNAυπάρχει microια οmicroάδα ndashOH στον άνθρακα 2rsquo της πεντόζης (βλ Εικόνα 38) και ουρακίλη αντί της θυmicroίνης (β) Απλουστευmicroένο σχήmicroα της δοmicroής του DNA όπουαπεικονίζονται microόνον οι αζωτούχες βάσεις Παρατηρήστε ότι οι δύο αλυσίδες (κλώνοι DNA) είναι συmicroπληρωmicroατικές ως προς την ακολουθία βάσεων (A=T GintC)και συνδέονται microε δεσmicroούς υδρογόνου που σχηmicroατίζονται microεταξύ αυτών των βάσεων Οι δύο κλώνοι DNA απεικονίζονται microε πράσινο χρώmicroα σε δύο διαφορετι-κούς τόνους σκίασης χρωmicroατική σύmicroβαση που εφαρmicroόζεται σε όλο το βιβλίο (γ) RNA (i) πρωτοταγής δοmicroή (ii) πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή Στο RNAσχηmicroατίζονται δευτεροταγείς δοmicroές όταν παρουσιάζονται δυνατότητες για ενδοmicroοριακή ζεύξη βάσεων δηλ για ζεύξη βάσεων της ίδιας αλυσίδας Σε ορισmicroέναπολύ microεγάλα microόρια RNA όπως πχ στο ριβοσωmicroατικό RNA (f Τmicroήmicroατα 715 και 114) άλλες περιοχές του microορίου έχουν microόνο πρωτοταγή δοmicroή και άλλεςτόσο πρωτοταγή όσο και δευτεροταγή δοmicroή Αυτό οδηγεί σε microόρια microε τελικό τριδιάστατο σχήmicroα που είναι καθοριστικό για τη λειτουργία τους και εmicroπεριέχειεκτενείς περιελίξεις ή συσπειρώσεις (f Εικόνα 118γ) Το RNA απεικονίζεται microε πορτοκαλί χρώmicroα χρωmicroατική σύmicroβαση που διατηρείται σε όλο το βιβλίο
$ 1313 -
DNA
DNA DNA - $ -$ (13 32) - - $ (G) (C) $ (A) (T) (13 32) $ $ 13 A T G C DNA - 13 0 G - C T A ( 311)
RNA
$ 137$ S RNA $ 13 - amp 13 - RNA 1313 ( 311)
RNA 13 $ RNA (messenger RNAmRNA) DNA 13- DNA $ RNA (transfer RNA tRNA) - 7 -- -$ 7 - RNA (ribosomal RNA rRNA) 13 7 0 RNA $ - 7 11
35 Έλεγχος εννοιών
7 $ - 13 - RNA DNA RNA
-
13 $ 1313
RNA
36 Tα αmicroινοξέα και ο πεπτιδικός δεσmicroός
$ 7- $ - $ 21 $ 0 $ - (ndashCOOH) (ndashNH2) (- 31 312) amp - $ 13-$ $ - $ ( ) -13 13 - 6 ( 313)
0 $ - 312 ( ROslash 312) - -- 13$13 13 13$ ( ) ( $ ) (- 312) $ 13 - $ - laquoraquo$ 312 = - - 13$ $ $ $ $ L $ 13 - $ = 6 - (ndashSH) -$ - (RndashSndashSndashR) F - $ $ 7 - 13
Iσοmicroερή
amp
56 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
$ Louis Pasteur 13 -F (f 15) 13 = Pasteur F $ ( 314) $ 13 - ( $ )
- (f 48) X laquo- raquo $ - D
L ( 315) 13 - Dndash
$ D L 0 - 6 $ Lndash$ Dndash (- 315) Dndash$ - (f 48) 13 (f 209) Dndash$ Lndash Lndash Dndash
36 ΤΑ ΑΜΙΝΟΞΕΑ ΚΑΙ Ο ΠΕΠΤΙ∆ΙΚΟΣ ∆ΕΣΜΟΣ 57
H
CH3
CHCH3
CH3
CH2CHCH3
CH3
CHCH3
CH2CH3
CH2OHCHCH3
OH
CH2
O-O
CH2C
O
NH2
CH2C
O-O CH2
CH2C
O
CH2NH2
CH2HS
CH2S CH2CH3
CH2
CH2HO
CH2
NH
CH2CH2CH2CH2+NH3
CH2CH2CH2+NH2 N
HC
NH2CH2
HN
+HN
N
CH2H2C
H2C CH COOndash
Gly degIuml˘IcircrsaquoOacuteEuml (G)
Ala AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (A)
Val BmiddotIumlrsaquoOacuteEuml (V)
Leu sectAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (L)
Ile IUcircOcircIumlAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (I)
Ser tradeAcircUacutersaquoOacuteEuml (S)Thr poundUacuteAcircOcircOacutersaquoOacuteEuml (T)
Asp AUcircmiddotUacuteUgraveEgraveIcircfi (D)
Asn AUcircmiddotUacutemiddotAacutersaquoOacuteEuml (N)
Glu degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraveEgraveIcircfi (E)
Gln degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraversaquoOacuteEuml (Q)
Cys K˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (C)
CH2HSe Sec tradeAcircIumlEumlOacuteOcircIcirc˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (U)
Met MAcircıAcircEgraveOcircOacutersaquoOacuteEuml (M)
Phe ordmmiddotEgraveOacute˘IumlmiddotIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (F)
Tyr T˘UacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (Y)
Trp TUacute˘UgraveOcircEcirciquestOacuteEuml (W)
Lys sect˘UcircrsaquoOacuteEuml (K)
Arg AUacuteAacuteEgraveOacutersaquoOacuteEuml (R)
His IUcircUgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml (H)
Pro
centOcircIgravelsaquo UgraveˆOacute middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteEgraveIcircOgraveOacute OcircIgraveiquestpermilˆOacute
OHC
O
CR
H
NH2
AIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot
degAcircOacuteEgraveIcirclsaquo permilOcircIgravelsaquo AcircOacutefi˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenOcirc˜
(tradeEumlIgraveAcircrsaquoˆUcircEuml tradeUgraveEumlOacute AcircUacutersaquoUgraveˆUcircEuml UgraveEuml˜ UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml˜ middotAcircEgraveIcircOcircOacutersaquo˙AcircUgravemiddotEgrave OcircIumlfiIcircIumlEumlUacuteEuml Euml permilOcircIgravelsaquo fimacrEgrave IgravefiOacuteOcircOacute Euml OcircIgraveiquestpermilmiddot R H UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml permilAcircOacute AcircrsaquoOacutemiddotEgrave middotIcircUacuteEgravesbquoOgrave˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteDagger permilEgravefiUgraveEgrave UcircUgraveAcircUacuteAcircrsaquoUgravemiddotEgrave AcircIumlAcircDaggerıAcircUacuteEuml˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot˜)
H IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-fiIacuteEgraveOacuteOcirc
MEuml OcircIumlEgraveIcircfi(˘permilUacutefiEcircOcircsbquoOcirc)
C
KIumlAcircrsaquopermilmiddot
-iquestOacuteıUacutemiddotIcircmiddot˜
KmiddotUacutesbquoOcircIacute˘IumlOcircIgraveiquestpermilmiddot
paraUacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml (P)
IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-middotIumlIcircmiddotIumlEgraveIcircfi
paraOcircIumlEgraveIcircfi IgraveEuml EgraveOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc Εικόνα 312 Συντακτικοί τύποι των 21 κοινών αmicroινοξέων Αριστερά απότο όνοmicroα κάθε αmicroινοξέος δίνεται η τριγράmicromicroατη συντοmicroογραφία του και δεξιά(σε παρένθεση) η microονογράmicromicroατη συντοmicroογραφία του
H2N C C
H O
OH NH
C C
H
R2
O
OH+ H
H2O
H2N C C
H
R1
O
N C C
H
R2
O
OH
R1
H
paraAcircUgraveEgravepermilEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 313 Σχηmicroατισmicroός πεπτιδικού δεσmicroού R1 και R2 αναφέρονταιστο microεταβλητό microέρος των αmicroινοξέων (πλευρική αλυσίδα) (βλ Εικόνα 312)
(Lndash Dndash$) 13- (Dndash Lndash$)
36 Έλεγχος εννοιών
21 $ - $ 13 13 $ ( ) -6
$ - $
$ -
- $ 13 - $ -
37 Πρωτεΐνες πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή
6 - - 6 () 6
13 - (f 5 17) 6 13 - - - 6 = 7 - -
Πρωτοταγής δοmicroή
6 $ $ (-
58 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
T T
P
M M
Pbatilde b
h
n n
h
(middot) (sbquo)
Εικόνα 314 Σχεδιαγράmicromicroατα κρυστάλλων τρυγικού οξέος (C4H6O6) διάχειρός Louis Pasteur από το περίφηmicroο άρθρο του περί οπτικής ενεργότητας(α) Αριστεροχειρικός κρύσταλλος (microορφή L) (β) ∆εξιοχειρικός κρύσταλλος(microορφή D) Οι δύο κρύσταλλοι είναι κατοπτρικά είδωλα ο ένας του άλλου(δηλ εναντιοmicroερή) Τα γράmicromicroατα πάνω στις έδρες των κρυστάλλων υποδη-λώνουν τα ζεύγη εναντιοmicroερών εδρών κατά τον συmicroβολισmicroό του PasteurΓια να αναδειχθεί σαφέστερα η εναντιοmicroέρεια των κρυστάλλων έχει χρησι-microοποιηθεί έγχρωmicroη σκίαση
(sbquo)
NH2H2N
COOH
C HH2N
CH3
COO
CH
CH3
ErsaquoAcircpermilEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
COOH
C NH2
CH3
COOH
CH
CH3
H
L-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml D-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml
(Aacute)
HO
HO
HO
OH
HHO
C OHH
OH
CH2OH
O
C H
CH
H
H
CH2OH
D-degIuml˘Icircfi˙Euml L-degIuml˘Icircfi˙Euml
CO
OH
(middot)
H
CH
C
CH
HC
C
C
tradeUgraveEumlOacute UgraveUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEuml UacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo UgraveOcirc IgraveAcircOacute sbquocurrenIumlOcirc˜ ımiddot UacutecurrenAcircEgrave Oacutemiddot ıAcircˆUacuteEumlıAcircrsaquo fiUgraveEgrave IcircmiddotUgraveAcirc˘ıDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave UacuteOcirc˜ UgraveOcircOacute middotUacutemiddotUgraveEumlUacuteEumlUgravelsaquo Euml permilAcirc permilEgravemiddotIcircAcircIcircOcircIgraveIgravecurrenOacuteEuml AacuteUacutemiddotIgraveIgravelsaquo fiUgraveEgrave middotOcircIgravemiddotIcircUacuteDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave middotfi middot˘UgravefiOacute
bC C
a
c c
a
d db
TUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
Εικόνα 315 Ισοmicroερή (α) Υπόδειγmicroα ζεύγους κατοπτρικών ειδώλων(β) Εναντιοmicroερή γλυκόζης (γ) Εναντιοmicroερή του αmicroινοξέος αλανίνη Παρατη-ρήστε ότι όπως και να περιστραφούν οι τριδιάστατες προβολές των microορίωνοι δύο microορφές L και D είναι αδύνατον να συmicroπέσουν
313) $ $ - 13 $ 13 0 $ - $ 13 6 - $ 6 6 6 15 $ 6 10000 -$ 6 $ 7 ( )
= $ - 13 = - 13 13 + - 13 13
∆ευτεροταγής δοmicroή
= $ R $ 13 13 6( 316) ( 31) - 6 M - - - 7 - (316) gt $ $ = ( - ) - - ( 316)
M - 1313 - $ (- 316)
- - - -
37 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ΠΡΩΤΟΤΑΓΗΣ ΚΑΙ ∆ΕΥΤΕΡΟΤΑΓΗΣ ∆ΟΜΗ 59
(middot)
(sbquo)
CC C
C
CC
C C
C
C
C
C
CCC
C C C
C
C
CC C
CC C
C
C
C
CC
CC
C
CC CC
C C
CC
C
C
C C
CC C
CC
C
CC
C C
CC
CCCC
C C
CC CC
C C
C
O
O
O O O
O
O
O O O
O
O O
O
O O
O
OO
O
OO
O
O O
O
O
O O
O
O O
OO
OO
RR
R R
R
RR R R
R R R
RRR
R R R
RRR
R R R
R R R
RR
RR
RR
R
R
H
HH
HH
HHH H
H
H HH
H
H
H
H
H H
H
H H
H
H H
H
H H
H
HH
H
H
H
HHHH
HH
H
HH
HH
HH
HH
HH
HH
NN
NN
NN
NN
N
N
N N
N
NN
N
N N
N
N N
N
NN
N
NN
N
N N
N
N
NNNN
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger AacuteAcircEgraveUgraveOcircOacuteEgraveIcircOgraveOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger middotOcircIgravemiddotIcircUacute˘UcircIgravecurrenOacuteˆOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
Εικόνα 316 ∆ευτεροταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων (α) ∆ευτεροταγήςδοmicroή α-έλικας Παρατηρήστε ότι οι δεσmicroοί υδρογόνου σχηmicroατίζονται microετα-ξύ ατόmicroων των πεπτιδικών δεσmicroών χωρίς τη συmicromicroετοχή των οmicroάδων R (β)∆ευτεροταγής δοmicroή β-πτυχωτής επιφάνειας
13 - - - 13 6 - - - (13 317)amp 13 13(domains) - $ 7-
38 Πρωτεΐνες δοmicroές υψηλότερης τάξης και αποδιάταξη
+ - $ - = 13 6 0 - - 13 S $ - - - 13 -
$ 13 - - ( 317)
(ndashSH) 6 amp ndashSH - $ $ amp 6 -6 $ ( 317) $- 6 = - - ( 317 318) - ( - ) (f 55)
A 6 - 13 6 - 7 7 - 13 ( 318) 6 +-
60 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot B
(middot) IOacuteUcircOcirc˘IumlrsaquoOacuteEuml (sbquo) PEgravesbquoOcircOacuteOcirc˘IcircIumlAcirciquestUcircEuml
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot A
-currenIumlEgraveIcircmiddot
-Ugrave˘macrˆUgravelsaquoAcircEgraveEcirciquestOacuteAcircEgravemiddot
Εικόνα 317 Τριτοταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων που υποδεικνύει και τιςθέσεις εντοπισmicroού περιοχών microε δευτεροταγή δοmicroή α-έλικας ή β-πτυχωτήςεπιφάνειας (α) Ινσουλίνη microια πρωτεΐνη που έχει δύο πολυπεπτιδικές αλυ-σίδες (f Τmicroήmicroα 319) παρατηρήστε ότι η αλυσίδα Β περιέχει δοmicroές α-έλικας αλλά και β-πτυχωτής επιφάνειας και ότι οι δισουλφιδικοί δεσmicroοί(κυανό χρώmicroα) συντελούν στον καθορισmicroό της τελικής αναδίπλωσης (τριτο-ταγούς δοmicroής) (β) Ριβονουκλεάση microια microεγάλη πρωτεΐνη microε αρκετές περιο-χές α-έλικας και β-πτυχωτής επιφάνειας
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜ 13
Εικόνα 318 Τεταρτοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης Υπάρχουν δύο είδηπολυπεπτιδίων στην αιmicroοσφαιρίνη αλυσίδες α (κυανό και κόκκινο χρώmicroα)και αλυσίδες β (πορτοκαλί και κίτρινο χρώmicroα) και συνολικά 4 πολυπεπτίδιαστο τελικό πρωτεϊνικό microόριο (εδώ τα laquoαraquo και laquoβraquo αναφέρονται σε ονοmicroασίεςπολυπεπτιδικών αλυσίδων και όχι σε είδη δευτεροταγούς δοmicroής) Η τεταρ-τοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης συmicroβολίζεται ως α2 β2 Οι 4 διακριτές αλυ-σίδες απεικονίζονται microε 4 διαφορετικά χρώmicroατα
6 - ( 6 13) - $ ( van der Waals 13 ) ( - $ )
Aποδιάταξη (microετουσίωση)
0 6 - pH - 13 ( 319) =$ 13 - 6 - ( 313) + $ F $ - - (-) amp $ $ ( 319) S 13 6 13 - ( 1313 ) - - $ 1313-13 13
= $ 7 - 7 13 - 0 20 - 6 - amp - - $ 13
Tα επόmicroενα κεφάλαια
amp - 4
- - 13 - 5 13 13 amp - 4 5 $ 13- (f 12) $ $- 0 $ ( 6)
M 1313 - 3 13
38 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ∆ΟΜΕΣ ΥΨΗΛΟΤΕΡΗΣ ΤΑΞΗΣ ΚΑΙ ΑΠΟ∆ΙΑΤΑΞΗ 61
lozEgravemiddotmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(Ocirc˘Uacutersaquomiddot)
ŒOacuteUgraveOcircOacuteEumlmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(100AEligC)
AOcircIgraveiquestIcircUacute˘OacuteUcircEumlOcirc˘Uacutersaquomiddot˜Oslash OacutecurrenmiddotAcircOacuteAcircUacuteAacuteOcircOcircrsaquoEumlUcircEuml
aeligDaggerIacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜ AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
Εικόνα 319 Aποδιάταξη (microετουσίωση) της πρωτεΐνης ριβονουκλεάση(της οποίας η δοmicroή δίνεται στην Εικόνα 317β) Παρατηρήστε πώς οι έντο-νες συνθήκες αποδιάταξης οδηγούν σε ένα οριστικά κατεστραmicromicroένο microόριο(ως προς τη βιολογική λειτουργία του) λόγω εσφαλmicroένης αναδίπλωσης
amp - $ - $ - - F - 13 7 7 $ 13 $ 13 13 -13
37 και 38 Έλεγχος εννοιών
= 6 - $ 6
( ) ( F- $)
1313 7
13 13amp -
6 - - -
F 13 -6 1313136
F $ 6 $ $ 7
62 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
Eρωτήσεις επανάληψης
- $
7 RNA DNA - amp $ RNA DNA DNA RNA
8 amp F $ R 7 $ 13amp -7
9 $ -$ - (Y13 13 313)
10 Z (13 31) -
1 -13 13 $
2 $
3 13 ((13- 13 31)
4 amp13 $ 13 13 amp 13- -
5 amp -
6 $ - 37
Eρωτήσεις εφαρmicroογής
1 RNA () GUCAAAGAC (13) ACGAUAACC+ RNA - amp
2 () -6 F 13 -$ 13 -6
3 Halobacterium A 13 - (K+) 5 M 5- F K+ - 6 Haloba-cterium F $ 6 Escherichia coli 13-
ΕΡΩΤΗΣΕΙΣ ΕΦΑΡΜΟΓΗΣ 63
K+ $ (-13 $ $- 13 K+
4 6 -- 6 - amp-
5 0 13 13 - - F
13- 13
6 M rsquo F 5 1313 - 13 ( $) laquo- 13raquo 6 6 13
- - - (f 58) L - $- (f 57) 13 (f
515) 13 $ - 7 $ $ -
Nουκλεϊκά οξέα
Q 7 $ - - ( 311)
$ - 3 ( 3acute) 5 (5acute) (- 311) = F $$13
= DNA RNA - 0 13 DNA RNA - 0 - (f 7) DNA - RNA
35 ΝΟΥΚΛΕΪΚΑ ΟΞΕΑ 55
paraAcircUacuteEgraveOcircmacrlsaquo UcircDagger˙Acirc˘IacuteEuml˜Ucirc˘IgraveIumlEumlUacuteˆIgravemiddotUgraveEgraveIcircOgraveOacutesbquoiquestUcircAcircˆOacute
A˙ˆUgraveOcircDaggermacrOcirc˜ sbquoiquestUcircEumlUcirc˘OacutepermilAcircpermilAcircIgravecurrenOacuteEuml UcircUgraveEuml ıcurrenUcircEuml 1atilde
H H
H2C BiquestUcircEumlO
O3atilde
1atilde
2atilde
5atilde
5atilde
5atilde
5 3
3atilde
3atilde
3atilde
3atilde 5atilde
P OndashO
H H H
H
H
H2C BiquestUcircEumlO
O
O
H H H
H
H
O
O
(i)
(ii)
poundcurrenUcircEuml 5atilde
P OndashO
O
P OndashO
O
centAcircOcircIacute˘UacuteEgravesbquofi˙Euml
paraUacuteˆUgraveOcircUgravemiddotAacutelsaquo˜permilOcircIgravelsaquo
centAcirc˘UgraveAcircUacuteOcircUgravemiddotAacutelsaquo˜permilOcircIgravelsaquo
poundcurrenUcircEuml 3atilde
(middot)
(sbquo)
A
C G
G C
C G
C G
A U
(Aacute)
ordmˆUcircEcircOcircUacuteEgraveIcircfi
A GG CC T T A
T CC GG A A T
C C A U C GA CG U G A
C C U C G GC GG A C A
C
BiquestUcircEumlH2C
5atilde
4atilde
H
HcentAcircUcircIgraveOcircrsaquo˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘
ordmˆUcircEcircOcircpermilEgraveAcircUcircUgraveAcircUacuteEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 311 DNA και RNA (α) ∆οmicroή microέρους microιας αλυσίδας DNA Οι αζωτούχες βάσεις microπορεί να είναι αδενίνη γουανίνη κυτοσίνη ή θυmicroίνη Στο RNAυπάρχει microια οmicroάδα ndashOH στον άνθρακα 2rsquo της πεντόζης (βλ Εικόνα 38) και ουρακίλη αντί της θυmicroίνης (β) Απλουστευmicroένο σχήmicroα της δοmicroής του DNA όπουαπεικονίζονται microόνον οι αζωτούχες βάσεις Παρατηρήστε ότι οι δύο αλυσίδες (κλώνοι DNA) είναι συmicroπληρωmicroατικές ως προς την ακολουθία βάσεων (A=T GintC)και συνδέονται microε δεσmicroούς υδρογόνου που σχηmicroατίζονται microεταξύ αυτών των βάσεων Οι δύο κλώνοι DNA απεικονίζονται microε πράσινο χρώmicroα σε δύο διαφορετι-κούς τόνους σκίασης χρωmicroατική σύmicroβαση που εφαρmicroόζεται σε όλο το βιβλίο (γ) RNA (i) πρωτοταγής δοmicroή (ii) πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή Στο RNAσχηmicroατίζονται δευτεροταγείς δοmicroές όταν παρουσιάζονται δυνατότητες για ενδοmicroοριακή ζεύξη βάσεων δηλ για ζεύξη βάσεων της ίδιας αλυσίδας Σε ορισmicroέναπολύ microεγάλα microόρια RNA όπως πχ στο ριβοσωmicroατικό RNA (f Τmicroήmicroατα 715 και 114) άλλες περιοχές του microορίου έχουν microόνο πρωτοταγή δοmicroή και άλλεςτόσο πρωτοταγή όσο και δευτεροταγή δοmicroή Αυτό οδηγεί σε microόρια microε τελικό τριδιάστατο σχήmicroα που είναι καθοριστικό για τη λειτουργία τους και εmicroπεριέχειεκτενείς περιελίξεις ή συσπειρώσεις (f Εικόνα 118γ) Το RNA απεικονίζεται microε πορτοκαλί χρώmicroα χρωmicroατική σύmicroβαση που διατηρείται σε όλο το βιβλίο
$ 1313 -
DNA
DNA DNA - $ -$ (13 32) - - $ (G) (C) $ (A) (T) (13 32) $ $ 13 A T G C DNA - 13 0 G - C T A ( 311)
RNA
$ 137$ S RNA $ 13 - amp 13 - RNA 1313 ( 311)
RNA 13 $ RNA (messenger RNAmRNA) DNA 13- DNA $ RNA (transfer RNA tRNA) - 7 -- -$ 7 - RNA (ribosomal RNA rRNA) 13 7 0 RNA $ - 7 11
35 Έλεγχος εννοιών
7 $ - 13 - RNA DNA RNA
-
13 $ 1313
RNA
36 Tα αmicroινοξέα και ο πεπτιδικός δεσmicroός
$ 7- $ - $ 21 $ 0 $ - (ndashCOOH) (ndashNH2) (- 31 312) amp - $ 13-$ $ - $ ( ) -13 13 - 6 ( 313)
0 $ - 312 ( ROslash 312) - -- 13$13 13 13$ ( ) ( $ ) (- 312) $ 13 - $ - laquoraquo$ 312 = - - 13$ $ $ $ $ L $ 13 - $ = 6 - (ndashSH) -$ - (RndashSndashSndashR) F - $ $ 7 - 13
Iσοmicroερή
amp
56 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
$ Louis Pasteur 13 -F (f 15) 13 = Pasteur F $ ( 314) $ 13 - ( $ )
- (f 48) X laquo- raquo $ - D
L ( 315) 13 - Dndash
$ D L 0 - 6 $ Lndash$ Dndash (- 315) Dndash$ - (f 48) 13 (f 209) Dndash$ Lndash Lndash Dndash
36 ΤΑ ΑΜΙΝΟΞΕΑ ΚΑΙ Ο ΠΕΠΤΙ∆ΙΚΟΣ ∆ΕΣΜΟΣ 57
H
CH3
CHCH3
CH3
CH2CHCH3
CH3
CHCH3
CH2CH3
CH2OHCHCH3
OH
CH2
O-O
CH2C
O
NH2
CH2C
O-O CH2
CH2C
O
CH2NH2
CH2HS
CH2S CH2CH3
CH2
CH2HO
CH2
NH
CH2CH2CH2CH2+NH3
CH2CH2CH2+NH2 N
HC
NH2CH2
HN
+HN
N
CH2H2C
H2C CH COOndash
Gly degIuml˘IcircrsaquoOacuteEuml (G)
Ala AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (A)
Val BmiddotIumlrsaquoOacuteEuml (V)
Leu sectAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (L)
Ile IUcircOcircIumlAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (I)
Ser tradeAcircUacutersaquoOacuteEuml (S)Thr poundUacuteAcircOcircOacutersaquoOacuteEuml (T)
Asp AUcircmiddotUacuteUgraveEgraveIcircfi (D)
Asn AUcircmiddotUacutemiddotAacutersaquoOacuteEuml (N)
Glu degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraveEgraveIcircfi (E)
Gln degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraversaquoOacuteEuml (Q)
Cys K˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (C)
CH2HSe Sec tradeAcircIumlEumlOacuteOcircIcirc˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (U)
Met MAcircıAcircEgraveOcircOacutersaquoOacuteEuml (M)
Phe ordmmiddotEgraveOacute˘IumlmiddotIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (F)
Tyr T˘UacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (Y)
Trp TUacute˘UgraveOcircEcirciquestOacuteEuml (W)
Lys sect˘UcircrsaquoOacuteEuml (K)
Arg AUacuteAacuteEgraveOacutersaquoOacuteEuml (R)
His IUcircUgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml (H)
Pro
centOcircIgravelsaquo UgraveˆOacute middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteEgraveIcircOgraveOacute OcircIgraveiquestpermilˆOacute
OHC
O
CR
H
NH2
AIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot
degAcircOacuteEgraveIcirclsaquo permilOcircIgravelsaquo AcircOacutefi˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenOcirc˜
(tradeEumlIgraveAcircrsaquoˆUcircEuml tradeUgraveEumlOacute AcircUacutersaquoUgraveˆUcircEuml UgraveEuml˜ UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml˜ middotAcircEgraveIcircOcircOacutersaquo˙AcircUgravemiddotEgrave OcircIumlfiIcircIumlEumlUacuteEuml Euml permilOcircIgravelsaquo fimacrEgrave IgravefiOacuteOcircOacute Euml OcircIgraveiquestpermilmiddot R H UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml permilAcircOacute AcircrsaquoOacutemiddotEgrave middotIcircUacuteEgravesbquoOgrave˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteDagger permilEgravefiUgraveEgrave UcircUgraveAcircUacuteAcircrsaquoUgravemiddotEgrave AcircIumlAcircDaggerıAcircUacuteEuml˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot˜)
H IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-fiIacuteEgraveOacuteOcirc
MEuml OcircIumlEgraveIcircfi(˘permilUacutefiEcircOcircsbquoOcirc)
C
KIumlAcircrsaquopermilmiddot
-iquestOacuteıUacutemiddotIcircmiddot˜
KmiddotUacutesbquoOcircIacute˘IumlOcircIgraveiquestpermilmiddot
paraUacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml (P)
IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-middotIumlIcircmiddotIumlEgraveIcircfi
paraOcircIumlEgraveIcircfi IgraveEuml EgraveOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc Εικόνα 312 Συντακτικοί τύποι των 21 κοινών αmicroινοξέων Αριστερά απότο όνοmicroα κάθε αmicroινοξέος δίνεται η τριγράmicromicroατη συντοmicroογραφία του και δεξιά(σε παρένθεση) η microονογράmicromicroατη συντοmicroογραφία του
H2N C C
H O
OH NH
C C
H
R2
O
OH+ H
H2O
H2N C C
H
R1
O
N C C
H
R2
O
OH
R1
H
paraAcircUgraveEgravepermilEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 313 Σχηmicroατισmicroός πεπτιδικού δεσmicroού R1 και R2 αναφέρονταιστο microεταβλητό microέρος των αmicroινοξέων (πλευρική αλυσίδα) (βλ Εικόνα 312)
(Lndash Dndash$) 13- (Dndash Lndash$)
36 Έλεγχος εννοιών
21 $ - $ 13 13 $ ( ) -6
$ - $
$ -
- $ 13 - $ -
37 Πρωτεΐνες πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή
6 - - 6 () 6
13 - (f 5 17) 6 13 - - - 6 = 7 - -
Πρωτοταγής δοmicroή
6 $ $ (-
58 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
T T
P
M M
Pbatilde b
h
n n
h
(middot) (sbquo)
Εικόνα 314 Σχεδιαγράmicromicroατα κρυστάλλων τρυγικού οξέος (C4H6O6) διάχειρός Louis Pasteur από το περίφηmicroο άρθρο του περί οπτικής ενεργότητας(α) Αριστεροχειρικός κρύσταλλος (microορφή L) (β) ∆εξιοχειρικός κρύσταλλος(microορφή D) Οι δύο κρύσταλλοι είναι κατοπτρικά είδωλα ο ένας του άλλου(δηλ εναντιοmicroερή) Τα γράmicromicroατα πάνω στις έδρες των κρυστάλλων υποδη-λώνουν τα ζεύγη εναντιοmicroερών εδρών κατά τον συmicroβολισmicroό του PasteurΓια να αναδειχθεί σαφέστερα η εναντιοmicroέρεια των κρυστάλλων έχει χρησι-microοποιηθεί έγχρωmicroη σκίαση
(sbquo)
NH2H2N
COOH
C HH2N
CH3
COO
CH
CH3
ErsaquoAcircpermilEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
COOH
C NH2
CH3
COOH
CH
CH3
H
L-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml D-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml
(Aacute)
HO
HO
HO
OH
HHO
C OHH
OH
CH2OH
O
C H
CH
H
H
CH2OH
D-degIuml˘Icircfi˙Euml L-degIuml˘Icircfi˙Euml
CO
OH
(middot)
H
CH
C
CH
HC
C
C
tradeUgraveEumlOacute UgraveUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEuml UacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo UgraveOcirc IgraveAcircOacute sbquocurrenIumlOcirc˜ ımiddot UacutecurrenAcircEgrave Oacutemiddot ıAcircˆUacuteEumlıAcircrsaquo fiUgraveEgrave IcircmiddotUgraveAcirc˘ıDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave UacuteOcirc˜ UgraveOcircOacute middotUacutemiddotUgraveEumlUacuteEumlUgravelsaquo Euml permilAcirc permilEgravemiddotIcircAcircIcircOcircIgraveIgravecurrenOacuteEuml AacuteUacutemiddotIgraveIgravelsaquo fiUgraveEgrave middotOcircIgravemiddotIcircUacuteDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave middotfi middot˘UgravefiOacute
bC C
a
c c
a
d db
TUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
Εικόνα 315 Ισοmicroερή (α) Υπόδειγmicroα ζεύγους κατοπτρικών ειδώλων(β) Εναντιοmicroερή γλυκόζης (γ) Εναντιοmicroερή του αmicroινοξέος αλανίνη Παρατη-ρήστε ότι όπως και να περιστραφούν οι τριδιάστατες προβολές των microορίωνοι δύο microορφές L και D είναι αδύνατον να συmicroπέσουν
313) $ $ - 13 $ 13 0 $ - $ 13 6 - $ 6 6 6 15 $ 6 10000 -$ 6 $ 7 ( )
= $ - 13 = - 13 13 + - 13 13
∆ευτεροταγής δοmicroή
= $ R $ 13 13 6( 316) ( 31) - 6 M - - - 7 - (316) gt $ $ = ( - ) - - ( 316)
M - 1313 - $ (- 316)
- - - -
37 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ΠΡΩΤΟΤΑΓΗΣ ΚΑΙ ∆ΕΥΤΕΡΟΤΑΓΗΣ ∆ΟΜΗ 59
(middot)
(sbquo)
CC C
C
CC
C C
C
C
C
C
CCC
C C C
C
C
CC C
CC C
C
C
C
CC
CC
C
CC CC
C C
CC
C
C
C C
CC C
CC
C
CC
C C
CC
CCCC
C C
CC CC
C C
C
O
O
O O O
O
O
O O O
O
O O
O
O O
O
OO
O
OO
O
O O
O
O
O O
O
O O
OO
OO
RR
R R
R
RR R R
R R R
RRR
R R R
RRR
R R R
R R R
RR
RR
RR
R
R
H
HH
HH
HHH H
H
H HH
H
H
H
H
H H
H
H H
H
H H
H
H H
H
HH
H
H
H
HHHH
HH
H
HH
HH
HH
HH
HH
HH
NN
NN
NN
NN
N
N
N N
N
NN
N
N N
N
N N
N
NN
N
NN
N
N N
N
N
NNNN
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger AacuteAcircEgraveUgraveOcircOacuteEgraveIcircOgraveOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger middotOcircIgravemiddotIcircUacute˘UcircIgravecurrenOacuteˆOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
Εικόνα 316 ∆ευτεροταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων (α) ∆ευτεροταγήςδοmicroή α-έλικας Παρατηρήστε ότι οι δεσmicroοί υδρογόνου σχηmicroατίζονται microετα-ξύ ατόmicroων των πεπτιδικών δεσmicroών χωρίς τη συmicromicroετοχή των οmicroάδων R (β)∆ευτεροταγής δοmicroή β-πτυχωτής επιφάνειας
13 - - - 13 6 - - - (13 317)amp 13 13(domains) - $ 7-
38 Πρωτεΐνες δοmicroές υψηλότερης τάξης και αποδιάταξη
+ - $ - = 13 6 0 - - 13 S $ - - - 13 -
$ 13 - - ( 317)
(ndashSH) 6 amp ndashSH - $ $ amp 6 -6 $ ( 317) $- 6 = - - ( 317 318) - ( - ) (f 55)
A 6 - 13 6 - 7 7 - 13 ( 318) 6 +-
60 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot B
(middot) IOacuteUcircOcirc˘IumlrsaquoOacuteEuml (sbquo) PEgravesbquoOcircOacuteOcirc˘IcircIumlAcirciquestUcircEuml
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot A
-currenIumlEgraveIcircmiddot
-Ugrave˘macrˆUgravelsaquoAcircEgraveEcirciquestOacuteAcircEgravemiddot
Εικόνα 317 Τριτοταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων που υποδεικνύει και τιςθέσεις εντοπισmicroού περιοχών microε δευτεροταγή δοmicroή α-έλικας ή β-πτυχωτήςεπιφάνειας (α) Ινσουλίνη microια πρωτεΐνη που έχει δύο πολυπεπτιδικές αλυ-σίδες (f Τmicroήmicroα 319) παρατηρήστε ότι η αλυσίδα Β περιέχει δοmicroές α-έλικας αλλά και β-πτυχωτής επιφάνειας και ότι οι δισουλφιδικοί δεσmicroοί(κυανό χρώmicroα) συντελούν στον καθορισmicroό της τελικής αναδίπλωσης (τριτο-ταγούς δοmicroής) (β) Ριβονουκλεάση microια microεγάλη πρωτεΐνη microε αρκετές περιο-χές α-έλικας και β-πτυχωτής επιφάνειας
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜ 13
Εικόνα 318 Τεταρτοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης Υπάρχουν δύο είδηπολυπεπτιδίων στην αιmicroοσφαιρίνη αλυσίδες α (κυανό και κόκκινο χρώmicroα)και αλυσίδες β (πορτοκαλί και κίτρινο χρώmicroα) και συνολικά 4 πολυπεπτίδιαστο τελικό πρωτεϊνικό microόριο (εδώ τα laquoαraquo και laquoβraquo αναφέρονται σε ονοmicroασίεςπολυπεπτιδικών αλυσίδων και όχι σε είδη δευτεροταγούς δοmicroής) Η τεταρ-τοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης συmicroβολίζεται ως α2 β2 Οι 4 διακριτές αλυ-σίδες απεικονίζονται microε 4 διαφορετικά χρώmicroατα
6 - ( 6 13) - $ ( van der Waals 13 ) ( - $ )
Aποδιάταξη (microετουσίωση)
0 6 - pH - 13 ( 319) =$ 13 - 6 - ( 313) + $ F $ - - (-) amp $ $ ( 319) S 13 6 13 - ( 1313 ) - - $ 1313-13 13
= $ 7 - 7 13 - 0 20 - 6 - amp - - $ 13
Tα επόmicroενα κεφάλαια
amp - 4
- - 13 - 5 13 13 amp - 4 5 $ 13- (f 12) $ $- 0 $ ( 6)
M 1313 - 3 13
38 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ∆ΟΜΕΣ ΥΨΗΛΟΤΕΡΗΣ ΤΑΞΗΣ ΚΑΙ ΑΠΟ∆ΙΑΤΑΞΗ 61
lozEgravemiddotmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(Ocirc˘Uacutersaquomiddot)
ŒOacuteUgraveOcircOacuteEumlmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(100AEligC)
AOcircIgraveiquestIcircUacute˘OacuteUcircEumlOcirc˘Uacutersaquomiddot˜Oslash OacutecurrenmiddotAcircOacuteAcircUacuteAacuteOcircOcircrsaquoEumlUcircEuml
aeligDaggerIacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜ AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
Εικόνα 319 Aποδιάταξη (microετουσίωση) της πρωτεΐνης ριβονουκλεάση(της οποίας η δοmicroή δίνεται στην Εικόνα 317β) Παρατηρήστε πώς οι έντο-νες συνθήκες αποδιάταξης οδηγούν σε ένα οριστικά κατεστραmicromicroένο microόριο(ως προς τη βιολογική λειτουργία του) λόγω εσφαλmicroένης αναδίπλωσης
amp - $ - $ - - F - 13 7 7 $ 13 $ 13 13 -13
37 και 38 Έλεγχος εννοιών
= 6 - $ 6
( ) ( F- $)
1313 7
13 13amp -
6 - - -
F 13 -6 1313136
F $ 6 $ $ 7
62 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
Eρωτήσεις επανάληψης
- $
7 RNA DNA - amp $ RNA DNA DNA RNA
8 amp F $ R 7 $ 13amp -7
9 $ -$ - (Y13 13 313)
10 Z (13 31) -
1 -13 13 $
2 $
3 13 ((13- 13 31)
4 amp13 $ 13 13 amp 13- -
5 amp -
6 $ - 37
Eρωτήσεις εφαρmicroογής
1 RNA () GUCAAAGAC (13) ACGAUAACC+ RNA - amp
2 () -6 F 13 -$ 13 -6
3 Halobacterium A 13 - (K+) 5 M 5- F K+ - 6 Haloba-cterium F $ 6 Escherichia coli 13-
ΕΡΩΤΗΣΕΙΣ ΕΦΑΡΜΟΓΗΣ 63
K+ $ (-13 $ $- 13 K+
4 6 -- 6 - amp-
5 0 13 13 - - F
13- 13
6 M rsquo F 5 1313 - 13 ( $) laquo- 13raquo 6 6 13
$ 1313 -
DNA
DNA DNA - $ -$ (13 32) - - $ (G) (C) $ (A) (T) (13 32) $ $ 13 A T G C DNA - 13 0 G - C T A ( 311)
RNA
$ 137$ S RNA $ 13 - amp 13 - RNA 1313 ( 311)
RNA 13 $ RNA (messenger RNAmRNA) DNA 13- DNA $ RNA (transfer RNA tRNA) - 7 -- -$ 7 - RNA (ribosomal RNA rRNA) 13 7 0 RNA $ - 7 11
35 Έλεγχος εννοιών
7 $ - 13 - RNA DNA RNA
-
13 $ 1313
RNA
36 Tα αmicroινοξέα και ο πεπτιδικός δεσmicroός
$ 7- $ - $ 21 $ 0 $ - (ndashCOOH) (ndashNH2) (- 31 312) amp - $ 13-$ $ - $ ( ) -13 13 - 6 ( 313)
0 $ - 312 ( ROslash 312) - -- 13$13 13 13$ ( ) ( $ ) (- 312) $ 13 - $ - laquoraquo$ 312 = - - 13$ $ $ $ $ L $ 13 - $ = 6 - (ndashSH) -$ - (RndashSndashSndashR) F - $ $ 7 - 13
Iσοmicroερή
amp
56 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
$ Louis Pasteur 13 -F (f 15) 13 = Pasteur F $ ( 314) $ 13 - ( $ )
- (f 48) X laquo- raquo $ - D
L ( 315) 13 - Dndash
$ D L 0 - 6 $ Lndash$ Dndash (- 315) Dndash$ - (f 48) 13 (f 209) Dndash$ Lndash Lndash Dndash
36 ΤΑ ΑΜΙΝΟΞΕΑ ΚΑΙ Ο ΠΕΠΤΙ∆ΙΚΟΣ ∆ΕΣΜΟΣ 57
H
CH3
CHCH3
CH3
CH2CHCH3
CH3
CHCH3
CH2CH3
CH2OHCHCH3
OH
CH2
O-O
CH2C
O
NH2
CH2C
O-O CH2
CH2C
O
CH2NH2
CH2HS
CH2S CH2CH3
CH2
CH2HO
CH2
NH
CH2CH2CH2CH2+NH3
CH2CH2CH2+NH2 N
HC
NH2CH2
HN
+HN
N
CH2H2C
H2C CH COOndash
Gly degIuml˘IcircrsaquoOacuteEuml (G)
Ala AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (A)
Val BmiddotIumlrsaquoOacuteEuml (V)
Leu sectAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (L)
Ile IUcircOcircIumlAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (I)
Ser tradeAcircUacutersaquoOacuteEuml (S)Thr poundUacuteAcircOcircOacutersaquoOacuteEuml (T)
Asp AUcircmiddotUacuteUgraveEgraveIcircfi (D)
Asn AUcircmiddotUacutemiddotAacutersaquoOacuteEuml (N)
Glu degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraveEgraveIcircfi (E)
Gln degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraversaquoOacuteEuml (Q)
Cys K˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (C)
CH2HSe Sec tradeAcircIumlEumlOacuteOcircIcirc˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (U)
Met MAcircıAcircEgraveOcircOacutersaquoOacuteEuml (M)
Phe ordmmiddotEgraveOacute˘IumlmiddotIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (F)
Tyr T˘UacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (Y)
Trp TUacute˘UgraveOcircEcirciquestOacuteEuml (W)
Lys sect˘UcircrsaquoOacuteEuml (K)
Arg AUacuteAacuteEgraveOacutersaquoOacuteEuml (R)
His IUcircUgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml (H)
Pro
centOcircIgravelsaquo UgraveˆOacute middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteEgraveIcircOgraveOacute OcircIgraveiquestpermilˆOacute
OHC
O
CR
H
NH2
AIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot
degAcircOacuteEgraveIcirclsaquo permilOcircIgravelsaquo AcircOacutefi˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenOcirc˜
(tradeEumlIgraveAcircrsaquoˆUcircEuml tradeUgraveEumlOacute AcircUacutersaquoUgraveˆUcircEuml UgraveEuml˜ UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml˜ middotAcircEgraveIcircOcircOacutersaquo˙AcircUgravemiddotEgrave OcircIumlfiIcircIumlEumlUacuteEuml Euml permilOcircIgravelsaquo fimacrEgrave IgravefiOacuteOcircOacute Euml OcircIgraveiquestpermilmiddot R H UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml permilAcircOacute AcircrsaquoOacutemiddotEgrave middotIcircUacuteEgravesbquoOgrave˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteDagger permilEgravefiUgraveEgrave UcircUgraveAcircUacuteAcircrsaquoUgravemiddotEgrave AcircIumlAcircDaggerıAcircUacuteEuml˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot˜)
H IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-fiIacuteEgraveOacuteOcirc
MEuml OcircIumlEgraveIcircfi(˘permilUacutefiEcircOcircsbquoOcirc)
C
KIumlAcircrsaquopermilmiddot
-iquestOacuteıUacutemiddotIcircmiddot˜
KmiddotUacutesbquoOcircIacute˘IumlOcircIgraveiquestpermilmiddot
paraUacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml (P)
IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-middotIumlIcircmiddotIumlEgraveIcircfi
paraOcircIumlEgraveIcircfi IgraveEuml EgraveOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc Εικόνα 312 Συντακτικοί τύποι των 21 κοινών αmicroινοξέων Αριστερά απότο όνοmicroα κάθε αmicroινοξέος δίνεται η τριγράmicromicroατη συντοmicroογραφία του και δεξιά(σε παρένθεση) η microονογράmicromicroατη συντοmicroογραφία του
H2N C C
H O
OH NH
C C
H
R2
O
OH+ H
H2O
H2N C C
H
R1
O
N C C
H
R2
O
OH
R1
H
paraAcircUgraveEgravepermilEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 313 Σχηmicroατισmicroός πεπτιδικού δεσmicroού R1 και R2 αναφέρονταιστο microεταβλητό microέρος των αmicroινοξέων (πλευρική αλυσίδα) (βλ Εικόνα 312)
(Lndash Dndash$) 13- (Dndash Lndash$)
36 Έλεγχος εννοιών
21 $ - $ 13 13 $ ( ) -6
$ - $
$ -
- $ 13 - $ -
37 Πρωτεΐνες πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή
6 - - 6 () 6
13 - (f 5 17) 6 13 - - - 6 = 7 - -
Πρωτοταγής δοmicroή
6 $ $ (-
58 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
T T
P
M M
Pbatilde b
h
n n
h
(middot) (sbquo)
Εικόνα 314 Σχεδιαγράmicromicroατα κρυστάλλων τρυγικού οξέος (C4H6O6) διάχειρός Louis Pasteur από το περίφηmicroο άρθρο του περί οπτικής ενεργότητας(α) Αριστεροχειρικός κρύσταλλος (microορφή L) (β) ∆εξιοχειρικός κρύσταλλος(microορφή D) Οι δύο κρύσταλλοι είναι κατοπτρικά είδωλα ο ένας του άλλου(δηλ εναντιοmicroερή) Τα γράmicromicroατα πάνω στις έδρες των κρυστάλλων υποδη-λώνουν τα ζεύγη εναντιοmicroερών εδρών κατά τον συmicroβολισmicroό του PasteurΓια να αναδειχθεί σαφέστερα η εναντιοmicroέρεια των κρυστάλλων έχει χρησι-microοποιηθεί έγχρωmicroη σκίαση
(sbquo)
NH2H2N
COOH
C HH2N
CH3
COO
CH
CH3
ErsaquoAcircpermilEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
COOH
C NH2
CH3
COOH
CH
CH3
H
L-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml D-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml
(Aacute)
HO
HO
HO
OH
HHO
C OHH
OH
CH2OH
O
C H
CH
H
H
CH2OH
D-degIuml˘Icircfi˙Euml L-degIuml˘Icircfi˙Euml
CO
OH
(middot)
H
CH
C
CH
HC
C
C
tradeUgraveEumlOacute UgraveUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEuml UacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo UgraveOcirc IgraveAcircOacute sbquocurrenIumlOcirc˜ ımiddot UacutecurrenAcircEgrave Oacutemiddot ıAcircˆUacuteEumlıAcircrsaquo fiUgraveEgrave IcircmiddotUgraveAcirc˘ıDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave UacuteOcirc˜ UgraveOcircOacute middotUacutemiddotUgraveEumlUacuteEumlUgravelsaquo Euml permilAcirc permilEgravemiddotIcircAcircIcircOcircIgraveIgravecurrenOacuteEuml AacuteUacutemiddotIgraveIgravelsaquo fiUgraveEgrave middotOcircIgravemiddotIcircUacuteDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave middotfi middot˘UgravefiOacute
bC C
a
c c
a
d db
TUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
Εικόνα 315 Ισοmicroερή (α) Υπόδειγmicroα ζεύγους κατοπτρικών ειδώλων(β) Εναντιοmicroερή γλυκόζης (γ) Εναντιοmicroερή του αmicroινοξέος αλανίνη Παρατη-ρήστε ότι όπως και να περιστραφούν οι τριδιάστατες προβολές των microορίωνοι δύο microορφές L και D είναι αδύνατον να συmicroπέσουν
313) $ $ - 13 $ 13 0 $ - $ 13 6 - $ 6 6 6 15 $ 6 10000 -$ 6 $ 7 ( )
= $ - 13 = - 13 13 + - 13 13
∆ευτεροταγής δοmicroή
= $ R $ 13 13 6( 316) ( 31) - 6 M - - - 7 - (316) gt $ $ = ( - ) - - ( 316)
M - 1313 - $ (- 316)
- - - -
37 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ΠΡΩΤΟΤΑΓΗΣ ΚΑΙ ∆ΕΥΤΕΡΟΤΑΓΗΣ ∆ΟΜΗ 59
(middot)
(sbquo)
CC C
C
CC
C C
C
C
C
C
CCC
C C C
C
C
CC C
CC C
C
C
C
CC
CC
C
CC CC
C C
CC
C
C
C C
CC C
CC
C
CC
C C
CC
CCCC
C C
CC CC
C C
C
O
O
O O O
O
O
O O O
O
O O
O
O O
O
OO
O
OO
O
O O
O
O
O O
O
O O
OO
OO
RR
R R
R
RR R R
R R R
RRR
R R R
RRR
R R R
R R R
RR
RR
RR
R
R
H
HH
HH
HHH H
H
H HH
H
H
H
H
H H
H
H H
H
H H
H
H H
H
HH
H
H
H
HHHH
HH
H
HH
HH
HH
HH
HH
HH
NN
NN
NN
NN
N
N
N N
N
NN
N
N N
N
N N
N
NN
N
NN
N
N N
N
N
NNNN
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger AacuteAcircEgraveUgraveOcircOacuteEgraveIcircOgraveOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger middotOcircIgravemiddotIcircUacute˘UcircIgravecurrenOacuteˆOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
Εικόνα 316 ∆ευτεροταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων (α) ∆ευτεροταγήςδοmicroή α-έλικας Παρατηρήστε ότι οι δεσmicroοί υδρογόνου σχηmicroατίζονται microετα-ξύ ατόmicroων των πεπτιδικών δεσmicroών χωρίς τη συmicromicroετοχή των οmicroάδων R (β)∆ευτεροταγής δοmicroή β-πτυχωτής επιφάνειας
13 - - - 13 6 - - - (13 317)amp 13 13(domains) - $ 7-
38 Πρωτεΐνες δοmicroές υψηλότερης τάξης και αποδιάταξη
+ - $ - = 13 6 0 - - 13 S $ - - - 13 -
$ 13 - - ( 317)
(ndashSH) 6 amp ndashSH - $ $ amp 6 -6 $ ( 317) $- 6 = - - ( 317 318) - ( - ) (f 55)
A 6 - 13 6 - 7 7 - 13 ( 318) 6 +-
60 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot B
(middot) IOacuteUcircOcirc˘IumlrsaquoOacuteEuml (sbquo) PEgravesbquoOcircOacuteOcirc˘IcircIumlAcirciquestUcircEuml
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot A
-currenIumlEgraveIcircmiddot
-Ugrave˘macrˆUgravelsaquoAcircEgraveEcirciquestOacuteAcircEgravemiddot
Εικόνα 317 Τριτοταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων που υποδεικνύει και τιςθέσεις εντοπισmicroού περιοχών microε δευτεροταγή δοmicroή α-έλικας ή β-πτυχωτήςεπιφάνειας (α) Ινσουλίνη microια πρωτεΐνη που έχει δύο πολυπεπτιδικές αλυ-σίδες (f Τmicroήmicroα 319) παρατηρήστε ότι η αλυσίδα Β περιέχει δοmicroές α-έλικας αλλά και β-πτυχωτής επιφάνειας και ότι οι δισουλφιδικοί δεσmicroοί(κυανό χρώmicroα) συντελούν στον καθορισmicroό της τελικής αναδίπλωσης (τριτο-ταγούς δοmicroής) (β) Ριβονουκλεάση microια microεγάλη πρωτεΐνη microε αρκετές περιο-χές α-έλικας και β-πτυχωτής επιφάνειας
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜ 13
Εικόνα 318 Τεταρτοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης Υπάρχουν δύο είδηπολυπεπτιδίων στην αιmicroοσφαιρίνη αλυσίδες α (κυανό και κόκκινο χρώmicroα)και αλυσίδες β (πορτοκαλί και κίτρινο χρώmicroα) και συνολικά 4 πολυπεπτίδιαστο τελικό πρωτεϊνικό microόριο (εδώ τα laquoαraquo και laquoβraquo αναφέρονται σε ονοmicroασίεςπολυπεπτιδικών αλυσίδων και όχι σε είδη δευτεροταγούς δοmicroής) Η τεταρ-τοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης συmicroβολίζεται ως α2 β2 Οι 4 διακριτές αλυ-σίδες απεικονίζονται microε 4 διαφορετικά χρώmicroατα
6 - ( 6 13) - $ ( van der Waals 13 ) ( - $ )
Aποδιάταξη (microετουσίωση)
0 6 - pH - 13 ( 319) =$ 13 - 6 - ( 313) + $ F $ - - (-) amp $ $ ( 319) S 13 6 13 - ( 1313 ) - - $ 1313-13 13
= $ 7 - 7 13 - 0 20 - 6 - amp - - $ 13
Tα επόmicroενα κεφάλαια
amp - 4
- - 13 - 5 13 13 amp - 4 5 $ 13- (f 12) $ $- 0 $ ( 6)
M 1313 - 3 13
38 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ∆ΟΜΕΣ ΥΨΗΛΟΤΕΡΗΣ ΤΑΞΗΣ ΚΑΙ ΑΠΟ∆ΙΑΤΑΞΗ 61
lozEgravemiddotmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(Ocirc˘Uacutersaquomiddot)
ŒOacuteUgraveOcircOacuteEumlmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(100AEligC)
AOcircIgraveiquestIcircUacute˘OacuteUcircEumlOcirc˘Uacutersaquomiddot˜Oslash OacutecurrenmiddotAcircOacuteAcircUacuteAacuteOcircOcircrsaquoEumlUcircEuml
aeligDaggerIacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜ AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
Εικόνα 319 Aποδιάταξη (microετουσίωση) της πρωτεΐνης ριβονουκλεάση(της οποίας η δοmicroή δίνεται στην Εικόνα 317β) Παρατηρήστε πώς οι έντο-νες συνθήκες αποδιάταξης οδηγούν σε ένα οριστικά κατεστραmicromicroένο microόριο(ως προς τη βιολογική λειτουργία του) λόγω εσφαλmicroένης αναδίπλωσης
amp - $ - $ - - F - 13 7 7 $ 13 $ 13 13 -13
37 και 38 Έλεγχος εννοιών
= 6 - $ 6
( ) ( F- $)
1313 7
13 13amp -
6 - - -
F 13 -6 1313136
F $ 6 $ $ 7
62 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
Eρωτήσεις επανάληψης
- $
7 RNA DNA - amp $ RNA DNA DNA RNA
8 amp F $ R 7 $ 13amp -7
9 $ -$ - (Y13 13 313)
10 Z (13 31) -
1 -13 13 $
2 $
3 13 ((13- 13 31)
4 amp13 $ 13 13 amp 13- -
5 amp -
6 $ - 37
Eρωτήσεις εφαρmicroογής
1 RNA () GUCAAAGAC (13) ACGAUAACC+ RNA - amp
2 () -6 F 13 -$ 13 -6
3 Halobacterium A 13 - (K+) 5 M 5- F K+ - 6 Haloba-cterium F $ 6 Escherichia coli 13-
ΕΡΩΤΗΣΕΙΣ ΕΦΑΡΜΟΓΗΣ 63
K+ $ (-13 $ $- 13 K+
4 6 -- 6 - amp-
5 0 13 13 - - F
13- 13
6 M rsquo F 5 1313 - 13 ( $) laquo- 13raquo 6 6 13
$ Louis Pasteur 13 -F (f 15) 13 = Pasteur F $ ( 314) $ 13 - ( $ )
- (f 48) X laquo- raquo $ - D
L ( 315) 13 - Dndash
$ D L 0 - 6 $ Lndash$ Dndash (- 315) Dndash$ - (f 48) 13 (f 209) Dndash$ Lndash Lndash Dndash
36 ΤΑ ΑΜΙΝΟΞΕΑ ΚΑΙ Ο ΠΕΠΤΙ∆ΙΚΟΣ ∆ΕΣΜΟΣ 57
H
CH3
CHCH3
CH3
CH2CHCH3
CH3
CHCH3
CH2CH3
CH2OHCHCH3
OH
CH2
O-O
CH2C
O
NH2
CH2C
O-O CH2
CH2C
O
CH2NH2
CH2HS
CH2S CH2CH3
CH2
CH2HO
CH2
NH
CH2CH2CH2CH2+NH3
CH2CH2CH2+NH2 N
HC
NH2CH2
HN
+HN
N
CH2H2C
H2C CH COOndash
Gly degIuml˘IcircrsaquoOacuteEuml (G)
Ala AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (A)
Val BmiddotIumlrsaquoOacuteEuml (V)
Leu sectAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (L)
Ile IUcircOcircIumlAcirc˘IcircrsaquoOacuteEuml (I)
Ser tradeAcircUacutersaquoOacuteEuml (S)Thr poundUacuteAcircOcircOacutersaquoOacuteEuml (T)
Asp AUcircmiddotUacuteUgraveEgraveIcircfi (D)
Asn AUcircmiddotUacutemiddotAacutersaquoOacuteEuml (N)
Glu degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraveEgraveIcircfi (E)
Gln degIumlOcirc˘UgravemiddotIgraversaquoOacuteEuml (Q)
Cys K˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (C)
CH2HSe Sec tradeAcircIumlEumlOacuteOcircIcirc˘UcircUgraveAcirc˝OacuteEuml (U)
Met MAcircıAcircEgraveOcircOacutersaquoOacuteEuml (M)
Phe ordmmiddotEgraveOacute˘IumlmiddotIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml (F)
Tyr T˘UacuteOcircUcircrsaquoOacuteEuml (Y)
Trp TUacute˘UgraveOcircEcirciquestOacuteEuml (W)
Lys sect˘UcircrsaquoOacuteEuml (K)
Arg AUacuteAacuteEgraveOacutersaquoOacuteEuml (R)
His IUcircUgraveEgravepermilrsaquoOacuteEuml (H)
Pro
centOcircIgravelsaquo UgraveˆOacute middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteEgraveIcircOgraveOacute OcircIgraveiquestpermilˆOacute
OHC
O
CR
H
NH2
AIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot
degAcircOacuteEgraveIcirclsaquo permilOcircIgravelsaquo AcircOacutefi˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenOcirc˜
(tradeEumlIgraveAcircrsaquoˆUcircEuml tradeUgraveEumlOacute AcircUacutersaquoUgraveˆUcircEuml UgraveEuml˜ UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml˜ middotAcircEgraveIcircOcircOacutersaquo˙AcircUgravemiddotEgrave OcircIumlfiIcircIumlEumlUacuteEuml Euml permilOcircIgravelsaquo fimacrEgrave IgravefiOacuteOcircOacute Euml OcircIgraveiquestpermilmiddot R H UacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml permilAcircOacute AcircrsaquoOacutemiddotEgrave middotIcircUacuteEgravesbquoOgrave˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIacuteDagger permilEgravefiUgraveEgrave UcircUgraveAcircUacuteAcircrsaquoUgravemiddotEgrave AcircIumlAcircDaggerıAcircUacuteEuml˜ middotIgraveEgraveOacuteOcircIgraveiquestpermilmiddot˜)
H IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-fiIacuteEgraveOacuteOcirc
MEuml OcircIumlEgraveIcircfi(˘permilUacutefiEcircOcircsbquoOcirc)
C
KIumlAcircrsaquopermilmiddot
-iquestOacuteıUacutemiddotIcircmiddot˜
KmiddotUacutesbquoOcircIacute˘IumlOcircIgraveiquestpermilmiddot
paraUacuteOcircIumlrsaquoOacuteEuml (P)
IOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc-middotIumlIcircmiddotIumlEgraveIcircfi
paraOcircIumlEgraveIcircfi IgraveEuml EgraveOcircOacuteUgraveEgrave˙fiIgraveAcircOacuteOcirc Εικόνα 312 Συντακτικοί τύποι των 21 κοινών αmicroινοξέων Αριστερά απότο όνοmicroα κάθε αmicroινοξέος δίνεται η τριγράmicromicroατη συντοmicroογραφία του και δεξιά(σε παρένθεση) η microονογράmicromicroατη συντοmicroογραφία του
H2N C C
H O
OH NH
C C
H
R2
O
OH+ H
H2O
H2N C C
H
R1
O
N C C
H
R2
O
OH
R1
H
paraAcircUgraveEgravepermilEgraveIcircfi˜permilAcircUcircIgravefi˜
Εικόνα 313 Σχηmicroατισmicroός πεπτιδικού δεσmicroού R1 και R2 αναφέρονταιστο microεταβλητό microέρος των αmicroινοξέων (πλευρική αλυσίδα) (βλ Εικόνα 312)
(Lndash Dndash$) 13- (Dndash Lndash$)
36 Έλεγχος εννοιών
21 $ - $ 13 13 $ ( ) -6
$ - $
$ -
- $ 13 - $ -
37 Πρωτεΐνες πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή
6 - - 6 () 6
13 - (f 5 17) 6 13 - - - 6 = 7 - -
Πρωτοταγής δοmicroή
6 $ $ (-
58 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
T T
P
M M
Pbatilde b
h
n n
h
(middot) (sbquo)
Εικόνα 314 Σχεδιαγράmicromicroατα κρυστάλλων τρυγικού οξέος (C4H6O6) διάχειρός Louis Pasteur από το περίφηmicroο άρθρο του περί οπτικής ενεργότητας(α) Αριστεροχειρικός κρύσταλλος (microορφή L) (β) ∆εξιοχειρικός κρύσταλλος(microορφή D) Οι δύο κρύσταλλοι είναι κατοπτρικά είδωλα ο ένας του άλλου(δηλ εναντιοmicroερή) Τα γράmicromicroατα πάνω στις έδρες των κρυστάλλων υποδη-λώνουν τα ζεύγη εναντιοmicroερών εδρών κατά τον συmicroβολισmicroό του PasteurΓια να αναδειχθεί σαφέστερα η εναντιοmicroέρεια των κρυστάλλων έχει χρησι-microοποιηθεί έγχρωmicroη σκίαση
(sbquo)
NH2H2N
COOH
C HH2N
CH3
COO
CH
CH3
ErsaquoAcircpermilEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
COOH
C NH2
CH3
COOH
CH
CH3
H
L-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml D-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml
(Aacute)
HO
HO
HO
OH
HHO
C OHH
OH
CH2OH
O
C H
CH
H
H
CH2OH
D-degIuml˘Icircfi˙Euml L-degIuml˘Icircfi˙Euml
CO
OH
(middot)
H
CH
C
CH
HC
C
C
tradeUgraveEumlOacute UgraveUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEuml UacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo UgraveOcirc IgraveAcircOacute sbquocurrenIumlOcirc˜ ımiddot UacutecurrenAcircEgrave Oacutemiddot ıAcircˆUacuteEumlıAcircrsaquo fiUgraveEgrave IcircmiddotUgraveAcirc˘ıDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave UacuteOcirc˜ UgraveOcircOacute middotUacutemiddotUgraveEumlUacuteEumlUgravelsaquo Euml permilAcirc permilEgravemiddotIcircAcircIcircOcircIgraveIgravecurrenOacuteEuml AacuteUacutemiddotIgraveIgravelsaquo fiUgraveEgrave middotOcircIgravemiddotIcircUacuteDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave middotfi middot˘UgravefiOacute
bC C
a
c c
a
d db
TUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
Εικόνα 315 Ισοmicroερή (α) Υπόδειγmicroα ζεύγους κατοπτρικών ειδώλων(β) Εναντιοmicroερή γλυκόζης (γ) Εναντιοmicroερή του αmicroινοξέος αλανίνη Παρατη-ρήστε ότι όπως και να περιστραφούν οι τριδιάστατες προβολές των microορίωνοι δύο microορφές L και D είναι αδύνατον να συmicroπέσουν
313) $ $ - 13 $ 13 0 $ - $ 13 6 - $ 6 6 6 15 $ 6 10000 -$ 6 $ 7 ( )
= $ - 13 = - 13 13 + - 13 13
∆ευτεροταγής δοmicroή
= $ R $ 13 13 6( 316) ( 31) - 6 M - - - 7 - (316) gt $ $ = ( - ) - - ( 316)
M - 1313 - $ (- 316)
- - - -
37 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ΠΡΩΤΟΤΑΓΗΣ ΚΑΙ ∆ΕΥΤΕΡΟΤΑΓΗΣ ∆ΟΜΗ 59
(middot)
(sbquo)
CC C
C
CC
C C
C
C
C
C
CCC
C C C
C
C
CC C
CC C
C
C
C
CC
CC
C
CC CC
C C
CC
C
C
C C
CC C
CC
C
CC
C C
CC
CCCC
C C
CC CC
C C
C
O
O
O O O
O
O
O O O
O
O O
O
O O
O
OO
O
OO
O
O O
O
O
O O
O
O O
OO
OO
RR
R R
R
RR R R
R R R
RRR
R R R
RRR
R R R
R R R
RR
RR
RR
R
R
H
HH
HH
HHH H
H
H HH
H
H
H
H
H H
H
H H
H
H H
H
H H
H
HH
H
H
H
HHHH
HH
H
HH
HH
HH
HH
HH
HH
NN
NN
NN
NN
N
N
N N
N
NN
N
N N
N
N N
N
NN
N
NN
N
N N
N
N
NNNN
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger AacuteAcircEgraveUgraveOcircOacuteEgraveIcircOgraveOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger middotOcircIgravemiddotIcircUacute˘UcircIgravecurrenOacuteˆOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
Εικόνα 316 ∆ευτεροταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων (α) ∆ευτεροταγήςδοmicroή α-έλικας Παρατηρήστε ότι οι δεσmicroοί υδρογόνου σχηmicroατίζονται microετα-ξύ ατόmicroων των πεπτιδικών δεσmicroών χωρίς τη συmicromicroετοχή των οmicroάδων R (β)∆ευτεροταγής δοmicroή β-πτυχωτής επιφάνειας
13 - - - 13 6 - - - (13 317)amp 13 13(domains) - $ 7-
38 Πρωτεΐνες δοmicroές υψηλότερης τάξης και αποδιάταξη
+ - $ - = 13 6 0 - - 13 S $ - - - 13 -
$ 13 - - ( 317)
(ndashSH) 6 amp ndashSH - $ $ amp 6 -6 $ ( 317) $- 6 = - - ( 317 318) - ( - ) (f 55)
A 6 - 13 6 - 7 7 - 13 ( 318) 6 +-
60 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot B
(middot) IOacuteUcircOcirc˘IumlrsaquoOacuteEuml (sbquo) PEgravesbquoOcircOacuteOcirc˘IcircIumlAcirciquestUcircEuml
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot A
-currenIumlEgraveIcircmiddot
-Ugrave˘macrˆUgravelsaquoAcircEgraveEcirciquestOacuteAcircEgravemiddot
Εικόνα 317 Τριτοταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων που υποδεικνύει και τιςθέσεις εντοπισmicroού περιοχών microε δευτεροταγή δοmicroή α-έλικας ή β-πτυχωτήςεπιφάνειας (α) Ινσουλίνη microια πρωτεΐνη που έχει δύο πολυπεπτιδικές αλυ-σίδες (f Τmicroήmicroα 319) παρατηρήστε ότι η αλυσίδα Β περιέχει δοmicroές α-έλικας αλλά και β-πτυχωτής επιφάνειας και ότι οι δισουλφιδικοί δεσmicroοί(κυανό χρώmicroα) συντελούν στον καθορισmicroό της τελικής αναδίπλωσης (τριτο-ταγούς δοmicroής) (β) Ριβονουκλεάση microια microεγάλη πρωτεΐνη microε αρκετές περιο-χές α-έλικας και β-πτυχωτής επιφάνειας
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜ 13
Εικόνα 318 Τεταρτοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης Υπάρχουν δύο είδηπολυπεπτιδίων στην αιmicroοσφαιρίνη αλυσίδες α (κυανό και κόκκινο χρώmicroα)και αλυσίδες β (πορτοκαλί και κίτρινο χρώmicroα) και συνολικά 4 πολυπεπτίδιαστο τελικό πρωτεϊνικό microόριο (εδώ τα laquoαraquo και laquoβraquo αναφέρονται σε ονοmicroασίεςπολυπεπτιδικών αλυσίδων και όχι σε είδη δευτεροταγούς δοmicroής) Η τεταρ-τοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης συmicroβολίζεται ως α2 β2 Οι 4 διακριτές αλυ-σίδες απεικονίζονται microε 4 διαφορετικά χρώmicroατα
6 - ( 6 13) - $ ( van der Waals 13 ) ( - $ )
Aποδιάταξη (microετουσίωση)
0 6 - pH - 13 ( 319) =$ 13 - 6 - ( 313) + $ F $ - - (-) amp $ $ ( 319) S 13 6 13 - ( 1313 ) - - $ 1313-13 13
= $ 7 - 7 13 - 0 20 - 6 - amp - - $ 13
Tα επόmicroενα κεφάλαια
amp - 4
- - 13 - 5 13 13 amp - 4 5 $ 13- (f 12) $ $- 0 $ ( 6)
M 1313 - 3 13
38 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ∆ΟΜΕΣ ΥΨΗΛΟΤΕΡΗΣ ΤΑΞΗΣ ΚΑΙ ΑΠΟ∆ΙΑΤΑΞΗ 61
lozEgravemiddotmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(Ocirc˘Uacutersaquomiddot)
ŒOacuteUgraveOcircOacuteEumlmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(100AEligC)
AOcircIgraveiquestIcircUacute˘OacuteUcircEumlOcirc˘Uacutersaquomiddot˜Oslash OacutecurrenmiddotAcircOacuteAcircUacuteAacuteOcircOcircrsaquoEumlUcircEuml
aeligDaggerIacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜ AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
Εικόνα 319 Aποδιάταξη (microετουσίωση) της πρωτεΐνης ριβονουκλεάση(της οποίας η δοmicroή δίνεται στην Εικόνα 317β) Παρατηρήστε πώς οι έντο-νες συνθήκες αποδιάταξης οδηγούν σε ένα οριστικά κατεστραmicromicroένο microόριο(ως προς τη βιολογική λειτουργία του) λόγω εσφαλmicroένης αναδίπλωσης
amp - $ - $ - - F - 13 7 7 $ 13 $ 13 13 -13
37 και 38 Έλεγχος εννοιών
= 6 - $ 6
( ) ( F- $)
1313 7
13 13amp -
6 - - -
F 13 -6 1313136
F $ 6 $ $ 7
62 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
Eρωτήσεις επανάληψης
- $
7 RNA DNA - amp $ RNA DNA DNA RNA
8 amp F $ R 7 $ 13amp -7
9 $ -$ - (Y13 13 313)
10 Z (13 31) -
1 -13 13 $
2 $
3 13 ((13- 13 31)
4 amp13 $ 13 13 amp 13- -
5 amp -
6 $ - 37
Eρωτήσεις εφαρmicroογής
1 RNA () GUCAAAGAC (13) ACGAUAACC+ RNA - amp
2 () -6 F 13 -$ 13 -6
3 Halobacterium A 13 - (K+) 5 M 5- F K+ - 6 Haloba-cterium F $ 6 Escherichia coli 13-
ΕΡΩΤΗΣΕΙΣ ΕΦΑΡΜΟΓΗΣ 63
K+ $ (-13 $ $- 13 K+
4 6 -- 6 - amp-
5 0 13 13 - - F
13- 13
6 M rsquo F 5 1313 - 13 ( $) laquo- 13raquo 6 6 13
(Lndash Dndash$) 13- (Dndash Lndash$)
36 Έλεγχος εννοιών
21 $ - $ 13 13 $ ( ) -6
$ - $
$ -
- $ 13 - $ -
37 Πρωτεΐνες πρωτοταγής και δευτεροταγής δοmicroή
6 - - 6 () 6
13 - (f 5 17) 6 13 - - - 6 = 7 - -
Πρωτοταγής δοmicroή
6 $ $ (-
58 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
T T
P
M M
Pbatilde b
h
n n
h
(middot) (sbquo)
Εικόνα 314 Σχεδιαγράmicromicroατα κρυστάλλων τρυγικού οξέος (C4H6O6) διάχειρός Louis Pasteur από το περίφηmicroο άρθρο του περί οπτικής ενεργότητας(α) Αριστεροχειρικός κρύσταλλος (microορφή L) (β) ∆εξιοχειρικός κρύσταλλος(microορφή D) Οι δύο κρύσταλλοι είναι κατοπτρικά είδωλα ο ένας του άλλου(δηλ εναντιοmicroερή) Τα γράmicromicroατα πάνω στις έδρες των κρυστάλλων υποδη-λώνουν τα ζεύγη εναντιοmicroερών εδρών κατά τον συmicroβολισmicroό του PasteurΓια να αναδειχθεί σαφέστερα η εναντιοmicroέρεια των κρυστάλλων έχει χρησι-microοποιηθεί έγχρωmicroη σκίαση
(sbquo)
NH2H2N
COOH
C HH2N
CH3
COO
CH
CH3
ErsaquoAcircpermilEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
COOH
C NH2
CH3
COOH
CH
CH3
H
L-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml D-AIumlmiddotOacutersaquoOacuteEuml
(Aacute)
HO
HO
HO
OH
HHO
C OHH
OH
CH2OH
O
C H
CH
H
H
CH2OH
D-degIuml˘Icircfi˙Euml L-degIuml˘Icircfi˙Euml
CO
OH
(middot)
H
CH
C
CH
HC
C
C
tradeUgraveEumlOacute UgraveUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEuml UacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo UgraveOcirc IgraveAcircOacute sbquocurrenIumlOcirc˜ ımiddot UacutecurrenAcircEgrave Oacutemiddot ıAcircˆUacuteEumlıAcircrsaquo fiUgraveEgrave IcircmiddotUgraveAcirc˘ıDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave UacuteOcirc˜ UgraveOcircOacute middotUacutemiddotUgraveEumlUacuteEumlUgravelsaquo Euml permilAcirc permilEgravemiddotIcircAcircIcircOcircIgraveIgravecurrenOacuteEuml AacuteUacutemiddotIgraveIgravelsaquo fiUgraveEgrave middotOcircIgravemiddotIcircUacuteDaggerOacuteAcircUgravemiddotEgrave middotfi middot˘UgravefiOacute
bC C
a
c c
a
d db
TUacuteEgravepermilEgraveiquestUcircUgravemiddotUgraveEumlUacuteOcircsbquoOcircIumllsaquo
Εικόνα 315 Ισοmicroερή (α) Υπόδειγmicroα ζεύγους κατοπτρικών ειδώλων(β) Εναντιοmicroερή γλυκόζης (γ) Εναντιοmicroερή του αmicroινοξέος αλανίνη Παρατη-ρήστε ότι όπως και να περιστραφούν οι τριδιάστατες προβολές των microορίωνοι δύο microορφές L και D είναι αδύνατον να συmicroπέσουν
313) $ $ - 13 $ 13 0 $ - $ 13 6 - $ 6 6 6 15 $ 6 10000 -$ 6 $ 7 ( )
= $ - 13 = - 13 13 + - 13 13
∆ευτεροταγής δοmicroή
= $ R $ 13 13 6( 316) ( 31) - 6 M - - - 7 - (316) gt $ $ = ( - ) - - ( 316)
M - 1313 - $ (- 316)
- - - -
37 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ΠΡΩΤΟΤΑΓΗΣ ΚΑΙ ∆ΕΥΤΕΡΟΤΑΓΗΣ ∆ΟΜΗ 59
(middot)
(sbquo)
CC C
C
CC
C C
C
C
C
C
CCC
C C C
C
C
CC C
CC C
C
C
C
CC
CC
C
CC CC
C C
CC
C
C
C C
CC C
CC
C
CC
C C
CC
CCCC
C C
CC CC
C C
C
O
O
O O O
O
O
O O O
O
O O
O
O O
O
OO
O
OO
O
O O
O
O
O O
O
O O
OO
OO
RR
R R
R
RR R R
R R R
RRR
R R R
RRR
R R R
R R R
RR
RR
RR
R
R
H
HH
HH
HHH H
H
H HH
H
H
H
H
H H
H
H H
H
H H
H
H H
H
HH
H
H
H
HHHH
HH
H
HH
HH
HH
HH
HH
HH
NN
NN
NN
NN
N
N
N N
N
NN
N
N N
N
N N
N
NN
N
NN
N
N N
N
N
NNNN
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger AacuteAcircEgraveUgraveOcircOacuteEgraveIcircOgraveOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger middotOcircIgravemiddotIcircUacute˘UcircIgravecurrenOacuteˆOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
Εικόνα 316 ∆ευτεροταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων (α) ∆ευτεροταγήςδοmicroή α-έλικας Παρατηρήστε ότι οι δεσmicroοί υδρογόνου σχηmicroατίζονται microετα-ξύ ατόmicroων των πεπτιδικών δεσmicroών χωρίς τη συmicromicroετοχή των οmicroάδων R (β)∆ευτεροταγής δοmicroή β-πτυχωτής επιφάνειας
13 - - - 13 6 - - - (13 317)amp 13 13(domains) - $ 7-
38 Πρωτεΐνες δοmicroές υψηλότερης τάξης και αποδιάταξη
+ - $ - = 13 6 0 - - 13 S $ - - - 13 -
$ 13 - - ( 317)
(ndashSH) 6 amp ndashSH - $ $ amp 6 -6 $ ( 317) $- 6 = - - ( 317 318) - ( - ) (f 55)
A 6 - 13 6 - 7 7 - 13 ( 318) 6 +-
60 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot B
(middot) IOacuteUcircOcirc˘IumlrsaquoOacuteEuml (sbquo) PEgravesbquoOcircOacuteOcirc˘IcircIumlAcirciquestUcircEuml
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot A
-currenIumlEgraveIcircmiddot
-Ugrave˘macrˆUgravelsaquoAcircEgraveEcirciquestOacuteAcircEgravemiddot
Εικόνα 317 Τριτοταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων που υποδεικνύει και τιςθέσεις εντοπισmicroού περιοχών microε δευτεροταγή δοmicroή α-έλικας ή β-πτυχωτήςεπιφάνειας (α) Ινσουλίνη microια πρωτεΐνη που έχει δύο πολυπεπτιδικές αλυ-σίδες (f Τmicroήmicroα 319) παρατηρήστε ότι η αλυσίδα Β περιέχει δοmicroές α-έλικας αλλά και β-πτυχωτής επιφάνειας και ότι οι δισουλφιδικοί δεσmicroοί(κυανό χρώmicroα) συντελούν στον καθορισmicroό της τελικής αναδίπλωσης (τριτο-ταγούς δοmicroής) (β) Ριβονουκλεάση microια microεγάλη πρωτεΐνη microε αρκετές περιο-χές α-έλικας και β-πτυχωτής επιφάνειας
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜ 13
Εικόνα 318 Τεταρτοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης Υπάρχουν δύο είδηπολυπεπτιδίων στην αιmicroοσφαιρίνη αλυσίδες α (κυανό και κόκκινο χρώmicroα)και αλυσίδες β (πορτοκαλί και κίτρινο χρώmicroα) και συνολικά 4 πολυπεπτίδιαστο τελικό πρωτεϊνικό microόριο (εδώ τα laquoαraquo και laquoβraquo αναφέρονται σε ονοmicroασίεςπολυπεπτιδικών αλυσίδων και όχι σε είδη δευτεροταγούς δοmicroής) Η τεταρ-τοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης συmicroβολίζεται ως α2 β2 Οι 4 διακριτές αλυ-σίδες απεικονίζονται microε 4 διαφορετικά χρώmicroατα
6 - ( 6 13) - $ ( van der Waals 13 ) ( - $ )
Aποδιάταξη (microετουσίωση)
0 6 - pH - 13 ( 319) =$ 13 - 6 - ( 313) + $ F $ - - (-) amp $ $ ( 319) S 13 6 13 - ( 1313 ) - - $ 1313-13 13
= $ 7 - 7 13 - 0 20 - 6 - amp - - $ 13
Tα επόmicroενα κεφάλαια
amp - 4
- - 13 - 5 13 13 amp - 4 5 $ 13- (f 12) $ $- 0 $ ( 6)
M 1313 - 3 13
38 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ∆ΟΜΕΣ ΥΨΗΛΟΤΕΡΗΣ ΤΑΞΗΣ ΚΑΙ ΑΠΟ∆ΙΑΤΑΞΗ 61
lozEgravemiddotmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(Ocirc˘Uacutersaquomiddot)
ŒOacuteUgraveOcircOacuteEumlmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(100AEligC)
AOcircIgraveiquestIcircUacute˘OacuteUcircEumlOcirc˘Uacutersaquomiddot˜Oslash OacutecurrenmiddotAcircOacuteAcircUacuteAacuteOcircOcircrsaquoEumlUcircEuml
aeligDaggerIacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜ AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
Εικόνα 319 Aποδιάταξη (microετουσίωση) της πρωτεΐνης ριβονουκλεάση(της οποίας η δοmicroή δίνεται στην Εικόνα 317β) Παρατηρήστε πώς οι έντο-νες συνθήκες αποδιάταξης οδηγούν σε ένα οριστικά κατεστραmicromicroένο microόριο(ως προς τη βιολογική λειτουργία του) λόγω εσφαλmicroένης αναδίπλωσης
amp - $ - $ - - F - 13 7 7 $ 13 $ 13 13 -13
37 και 38 Έλεγχος εννοιών
= 6 - $ 6
( ) ( F- $)
1313 7
13 13amp -
6 - - -
F 13 -6 1313136
F $ 6 $ $ 7
62 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
Eρωτήσεις επανάληψης
- $
7 RNA DNA - amp $ RNA DNA DNA RNA
8 amp F $ R 7 $ 13amp -7
9 $ -$ - (Y13 13 313)
10 Z (13 31) -
1 -13 13 $
2 $
3 13 ((13- 13 31)
4 amp13 $ 13 13 amp 13- -
5 amp -
6 $ - 37
Eρωτήσεις εφαρmicroογής
1 RNA () GUCAAAGAC (13) ACGAUAACC+ RNA - amp
2 () -6 F 13 -$ 13 -6
3 Halobacterium A 13 - (K+) 5 M 5- F K+ - 6 Haloba-cterium F $ 6 Escherichia coli 13-
ΕΡΩΤΗΣΕΙΣ ΕΦΑΡΜΟΓΗΣ 63
K+ $ (-13 $ $- 13 K+
4 6 -- 6 - amp-
5 0 13 13 - - F
13- 13
6 M rsquo F 5 1313 - 13 ( $) laquo- 13raquo 6 6 13
313) $ $ - 13 $ 13 0 $ - $ 13 6 - $ 6 6 6 15 $ 6 10000 -$ 6 $ 7 ( )
= $ - 13 = - 13 13 + - 13 13
∆ευτεροταγής δοmicroή
= $ R $ 13 13 6( 316) ( 31) - 6 M - - - 7 - (316) gt $ $ = ( - ) - - ( 316)
M - 1313 - $ (- 316)
- - - -
37 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ΠΡΩΤΟΤΑΓΗΣ ΚΑΙ ∆ΕΥΤΕΡΟΤΑΓΗΣ ∆ΟΜΗ 59
(middot)
(sbquo)
CC C
C
CC
C C
C
C
C
C
CCC
C C C
C
C
CC C
CC C
C
C
C
CC
CC
C
CC CC
C C
CC
C
C
C C
CC C
CC
C
CC
C C
CC
CCCC
C C
CC CC
C C
C
O
O
O O O
O
O
O O O
O
O O
O
O O
O
OO
O
OO
O
O O
O
O
O O
O
O O
OO
OO
RR
R R
R
RR R R
R R R
RRR
R R R
RRR
R R R
R R R
RR
RR
RR
R
R
H
HH
HH
HHH H
H
H HH
H
H
H
H
H H
H
H H
H
H H
H
H H
H
HH
H
H
H
HHHH
HH
H
HH
HH
HH
HH
HH
HH
NN
NN
NN
NN
N
N
N N
N
NN
N
N N
N
N N
N
NN
N
NN
N
N N
N
N
NNNN
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger AacuteAcircEgraveUgraveOcircOacuteEgraveIcircOgraveOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
centAcircUcircIgraveOcircrsaquo ˘permilUacuteOcircAacutefiOacuteOcirc˘IgraveAcircUgravemiddotIacuteDagger middotOcircIgravemiddotIcircUacute˘UcircIgravecurrenOacuteˆOacutemiddotIgraveEgraveOacuteOcircIacutecurrenˆOacute
Εικόνα 316 ∆ευτεροταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων (α) ∆ευτεροταγήςδοmicroή α-έλικας Παρατηρήστε ότι οι δεσmicroοί υδρογόνου σχηmicroατίζονται microετα-ξύ ατόmicroων των πεπτιδικών δεσmicroών χωρίς τη συmicromicroετοχή των οmicroάδων R (β)∆ευτεροταγής δοmicroή β-πτυχωτής επιφάνειας
13 - - - 13 6 - - - (13 317)amp 13 13(domains) - $ 7-
38 Πρωτεΐνες δοmicroές υψηλότερης τάξης και αποδιάταξη
+ - $ - = 13 6 0 - - 13 S $ - - - 13 -
$ 13 - - ( 317)
(ndashSH) 6 amp ndashSH - $ $ amp 6 -6 $ ( 317) $- 6 = - - ( 317 318) - ( - ) (f 55)
A 6 - 13 6 - 7 7 - 13 ( 318) 6 +-
60 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot B
(middot) IOacuteUcircOcirc˘IumlrsaquoOacuteEuml (sbquo) PEgravesbquoOcircOacuteOcirc˘IcircIumlAcirciquestUcircEuml
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot A
-currenIumlEgraveIcircmiddot
-Ugrave˘macrˆUgravelsaquoAcircEgraveEcirciquestOacuteAcircEgravemiddot
Εικόνα 317 Τριτοταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων που υποδεικνύει και τιςθέσεις εντοπισmicroού περιοχών microε δευτεροταγή δοmicroή α-έλικας ή β-πτυχωτήςεπιφάνειας (α) Ινσουλίνη microια πρωτεΐνη που έχει δύο πολυπεπτιδικές αλυ-σίδες (f Τmicroήmicroα 319) παρατηρήστε ότι η αλυσίδα Β περιέχει δοmicroές α-έλικας αλλά και β-πτυχωτής επιφάνειας και ότι οι δισουλφιδικοί δεσmicroοί(κυανό χρώmicroα) συντελούν στον καθορισmicroό της τελικής αναδίπλωσης (τριτο-ταγούς δοmicroής) (β) Ριβονουκλεάση microια microεγάλη πρωτεΐνη microε αρκετές περιο-χές α-έλικας και β-πτυχωτής επιφάνειας
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜ 13
Εικόνα 318 Τεταρτοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης Υπάρχουν δύο είδηπολυπεπτιδίων στην αιmicroοσφαιρίνη αλυσίδες α (κυανό και κόκκινο χρώmicroα)και αλυσίδες β (πορτοκαλί και κίτρινο χρώmicroα) και συνολικά 4 πολυπεπτίδιαστο τελικό πρωτεϊνικό microόριο (εδώ τα laquoαraquo και laquoβraquo αναφέρονται σε ονοmicroασίεςπολυπεπτιδικών αλυσίδων και όχι σε είδη δευτεροταγούς δοmicroής) Η τεταρ-τοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης συmicroβολίζεται ως α2 β2 Οι 4 διακριτές αλυ-σίδες απεικονίζονται microε 4 διαφορετικά χρώmicroατα
6 - ( 6 13) - $ ( van der Waals 13 ) ( - $ )
Aποδιάταξη (microετουσίωση)
0 6 - pH - 13 ( 319) =$ 13 - 6 - ( 313) + $ F $ - - (-) amp $ $ ( 319) S 13 6 13 - ( 1313 ) - - $ 1313-13 13
= $ 7 - 7 13 - 0 20 - 6 - amp - - $ 13
Tα επόmicroενα κεφάλαια
amp - 4
- - 13 - 5 13 13 amp - 4 5 $ 13- (f 12) $ $- 0 $ ( 6)
M 1313 - 3 13
38 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ∆ΟΜΕΣ ΥΨΗΛΟΤΕΡΗΣ ΤΑΞΗΣ ΚΑΙ ΑΠΟ∆ΙΑΤΑΞΗ 61
lozEgravemiddotmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(Ocirc˘Uacutersaquomiddot)
ŒOacuteUgraveOcircOacuteEumlmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(100AEligC)
AOcircIgraveiquestIcircUacute˘OacuteUcircEumlOcirc˘Uacutersaquomiddot˜Oslash OacutecurrenmiddotAcircOacuteAcircUacuteAacuteOcircOcircrsaquoEumlUcircEuml
aeligDaggerIacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜ AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
Εικόνα 319 Aποδιάταξη (microετουσίωση) της πρωτεΐνης ριβονουκλεάση(της οποίας η δοmicroή δίνεται στην Εικόνα 317β) Παρατηρήστε πώς οι έντο-νες συνθήκες αποδιάταξης οδηγούν σε ένα οριστικά κατεστραmicromicroένο microόριο(ως προς τη βιολογική λειτουργία του) λόγω εσφαλmicroένης αναδίπλωσης
amp - $ - $ - - F - 13 7 7 $ 13 $ 13 13 -13
37 και 38 Έλεγχος εννοιών
= 6 - $ 6
( ) ( F- $)
1313 7
13 13amp -
6 - - -
F 13 -6 1313136
F $ 6 $ $ 7
62 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
Eρωτήσεις επανάληψης
- $
7 RNA DNA - amp $ RNA DNA DNA RNA
8 amp F $ R 7 $ 13amp -7
9 $ -$ - (Y13 13 313)
10 Z (13 31) -
1 -13 13 $
2 $
3 13 ((13- 13 31)
4 amp13 $ 13 13 amp 13- -
5 amp -
6 $ - 37
Eρωτήσεις εφαρmicroογής
1 RNA () GUCAAAGAC (13) ACGAUAACC+ RNA - amp
2 () -6 F 13 -$ 13 -6
3 Halobacterium A 13 - (K+) 5 M 5- F K+ - 6 Haloba-cterium F $ 6 Escherichia coli 13-
ΕΡΩΤΗΣΕΙΣ ΕΦΑΡΜΟΓΗΣ 63
K+ $ (-13 $ $- 13 K+
4 6 -- 6 - amp-
5 0 13 13 - - F
13- 13
6 M rsquo F 5 1313 - 13 ( $) laquo- 13raquo 6 6 13
13 - - - 13 6 - - - (13 317)amp 13 13(domains) - $ 7-
38 Πρωτεΐνες δοmicroές υψηλότερης τάξης και αποδιάταξη
+ - $ - = 13 6 0 - - 13 S $ - - - 13 -
$ 13 - - ( 317)
(ndashSH) 6 amp ndashSH - $ $ amp 6 -6 $ ( 317) $- 6 = - - ( 317 318) - ( - ) (f 55)
A 6 - 13 6 - 7 7 - 13 ( 318) 6 +-
60 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot B
(middot) IOacuteUcircOcirc˘IumlrsaquoOacuteEuml (sbquo) PEgravesbquoOcircOacuteOcirc˘IcircIumlAcirciquestUcircEuml
AIuml˘Ucircrsaquopermilmiddot A
-currenIumlEgraveIcircmiddot
-Ugrave˘macrˆUgravelsaquoAcircEgraveEcirciquestOacuteAcircEgravemiddot
Εικόνα 317 Τριτοταγής δοmicroή πολυπεπτιδίων που υποδεικνύει και τιςθέσεις εντοπισmicroού περιοχών microε δευτεροταγή δοmicroή α-έλικας ή β-πτυχωτήςεπιφάνειας (α) Ινσουλίνη microια πρωτεΐνη που έχει δύο πολυπεπτιδικές αλυ-σίδες (f Τmicroήmicroα 319) παρατηρήστε ότι η αλυσίδα Β περιέχει δοmicroές α-έλικας αλλά και β-πτυχωτής επιφάνειας και ότι οι δισουλφιδικοί δεσmicroοί(κυανό χρώmicroα) συντελούν στον καθορισmicroό της τελικής αναδίπλωσης (τριτο-ταγούς δοmicroής) (β) Ριβονουκλεάση microια microεγάλη πρωτεΐνη microε αρκετές περιο-χές α-έλικας και β-πτυχωτής επιφάνειας
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜
AIuml˘UcircrsaquopermilAcirc˜ 13
Εικόνα 318 Τεταρτοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης Υπάρχουν δύο είδηπολυπεπτιδίων στην αιmicroοσφαιρίνη αλυσίδες α (κυανό και κόκκινο χρώmicroα)και αλυσίδες β (πορτοκαλί και κίτρινο χρώmicroα) και συνολικά 4 πολυπεπτίδιαστο τελικό πρωτεϊνικό microόριο (εδώ τα laquoαraquo και laquoβraquo αναφέρονται σε ονοmicroασίεςπολυπεπτιδικών αλυσίδων και όχι σε είδη δευτεροταγούς δοmicroής) Η τεταρ-τοταγής δοmicroή της αιmicroοσφαιρίνης συmicroβολίζεται ως α2 β2 Οι 4 διακριτές αλυ-σίδες απεικονίζονται microε 4 διαφορετικά χρώmicroατα
6 - ( 6 13) - $ ( van der Waals 13 ) ( - $ )
Aποδιάταξη (microετουσίωση)
0 6 - pH - 13 ( 319) =$ 13 - 6 - ( 313) + $ F $ - - (-) amp $ $ ( 319) S 13 6 13 - ( 1313 ) - - $ 1313-13 13
= $ 7 - 7 13 - 0 20 - 6 - amp - - $ 13
Tα επόmicroενα κεφάλαια
amp - 4
- - 13 - 5 13 13 amp - 4 5 $ 13- (f 12) $ $- 0 $ ( 6)
M 1313 - 3 13
38 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ∆ΟΜΕΣ ΥΨΗΛΟΤΕΡΗΣ ΤΑΞΗΣ ΚΑΙ ΑΠΟ∆ΙΑΤΑΞΗ 61
lozEgravemiddotmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(Ocirc˘Uacutersaquomiddot)
ŒOacuteUgraveOcircOacuteEumlmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(100AEligC)
AOcircIgraveiquestIcircUacute˘OacuteUcircEumlOcirc˘Uacutersaquomiddot˜Oslash OacutecurrenmiddotAcircOacuteAcircUacuteAacuteOcircOcircrsaquoEumlUcircEuml
aeligDaggerIacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜ AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
Εικόνα 319 Aποδιάταξη (microετουσίωση) της πρωτεΐνης ριβονουκλεάση(της οποίας η δοmicroή δίνεται στην Εικόνα 317β) Παρατηρήστε πώς οι έντο-νες συνθήκες αποδιάταξης οδηγούν σε ένα οριστικά κατεστραmicromicroένο microόριο(ως προς τη βιολογική λειτουργία του) λόγω εσφαλmicroένης αναδίπλωσης
amp - $ - $ - - F - 13 7 7 $ 13 $ 13 13 -13
37 και 38 Έλεγχος εννοιών
= 6 - $ 6
( ) ( F- $)
1313 7
13 13amp -
6 - - -
F 13 -6 1313136
F $ 6 $ $ 7
62 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
Eρωτήσεις επανάληψης
- $
7 RNA DNA - amp $ RNA DNA DNA RNA
8 amp F $ R 7 $ 13amp -7
9 $ -$ - (Y13 13 313)
10 Z (13 31) -
1 -13 13 $
2 $
3 13 ((13- 13 31)
4 amp13 $ 13 13 amp 13- -
5 amp -
6 $ - 37
Eρωτήσεις εφαρmicroογής
1 RNA () GUCAAAGAC (13) ACGAUAACC+ RNA - amp
2 () -6 F 13 -$ 13 -6
3 Halobacterium A 13 - (K+) 5 M 5- F K+ - 6 Haloba-cterium F $ 6 Escherichia coli 13-
ΕΡΩΤΗΣΕΙΣ ΕΦΑΡΜΟΓΗΣ 63
K+ $ (-13 $ $- 13 K+
4 6 -- 6 - amp-
5 0 13 13 - - F
13- 13
6 M rsquo F 5 1313 - 13 ( $) laquo- 13raquo 6 6 13
6 - ( 6 13) - $ ( van der Waals 13 ) ( - $ )
Aποδιάταξη (microετουσίωση)
0 6 - pH - 13 ( 319) =$ 13 - 6 - ( 313) + $ F $ - - (-) amp $ $ ( 319) S 13 6 13 - ( 1313 ) - - $ 1313-13 13
= $ 7 - 7 13 - 0 20 - 6 - amp - - $ 13
Tα επόmicroενα κεφάλαια
amp - 4
- - 13 - 5 13 13 amp - 4 5 $ 13- (f 12) $ $- 0 $ ( 6)
M 1313 - 3 13
38 ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ∆ΟΜΕΣ ΥΨΗΛΟΤΕΡΗΣ ΤΑΞΗΣ ΚΑΙ ΑΠΟ∆ΙΑΤΑΞΗ 61
lozEgravemiddotmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(Ocirc˘Uacutersaquomiddot)
ŒOacuteUgraveOcircOacuteEumlmiddotOcircpermilEgraveiquestUgravemiddotIacuteEuml(100AEligC)
AOcircIgraveiquestIcircUacute˘OacuteUcircEumlOcirc˘Uacutersaquomiddot˜Oslash OacutecurrenmiddotAcircOacuteAcircUacuteAacuteOcircOcircrsaquoEumlUcircEuml
aeligDaggerIacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
EOacuteAcircUacuteAacutefi˜UacuteˆUgraveAcirc˝OacuteEuml
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜ AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
AOacuteAcircOacuteAcircUacuteAacutefi˜
Εικόνα 319 Aποδιάταξη (microετουσίωση) της πρωτεΐνης ριβονουκλεάση(της οποίας η δοmicroή δίνεται στην Εικόνα 317β) Παρατηρήστε πώς οι έντο-νες συνθήκες αποδιάταξης οδηγούν σε ένα οριστικά κατεστραmicromicroένο microόριο(ως προς τη βιολογική λειτουργία του) λόγω εσφαλmicroένης αναδίπλωσης
amp - $ - $ - - F - 13 7 7 $ 13 $ 13 13 -13
37 και 38 Έλεγχος εννοιών
= 6 - $ 6
( ) ( F- $)
1313 7
13 13amp -
6 - - -
F 13 -6 1313136
F $ 6 $ $ 7
62 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
Eρωτήσεις επανάληψης
- $
7 RNA DNA - amp $ RNA DNA DNA RNA
8 amp F $ R 7 $ 13amp -7
9 $ -$ - (Y13 13 313)
10 Z (13 31) -
1 -13 13 $
2 $
3 13 ((13- 13 31)
4 amp13 $ 13 13 amp 13- -
5 amp -
6 $ - 37
Eρωτήσεις εφαρmicroογής
1 RNA () GUCAAAGAC (13) ACGAUAACC+ RNA - amp
2 () -6 F 13 -$ 13 -6
3 Halobacterium A 13 - (K+) 5 M 5- F K+ - 6 Haloba-cterium F $ 6 Escherichia coli 13-
ΕΡΩΤΗΣΕΙΣ ΕΦΑΡΜΟΓΗΣ 63
K+ $ (-13 $ $- 13 K+
4 6 -- 6 - amp-
5 0 13 13 - - F
13- 13
6 M rsquo F 5 1313 - 13 ( $) laquo- 13raquo 6 6 13
amp - $ - $ - - F - 13 7 7 $ 13 $ 13 13 -13
37 και 38 Έλεγχος εννοιών
= 6 - $ 6
( ) ( F- $)
1313 7
13 13amp -
6 - - -
F 13 -6 1313136
F $ 6 $ $ 7
62 Kεφάλαιο 3 ΜΑΚΡΟΜΟΡΙΑ
Eρωτήσεις επανάληψης
- $
7 RNA DNA - amp $ RNA DNA DNA RNA
8 amp F $ R 7 $ 13amp -7
9 $ -$ - (Y13 13 313)
10 Z (13 31) -
1 -13 13 $
2 $
3 13 ((13- 13 31)
4 amp13 $ 13 13 amp 13- -
5 amp -
6 $ - 37
Eρωτήσεις εφαρmicroογής
1 RNA () GUCAAAGAC (13) ACGAUAACC+ RNA - amp
2 () -6 F 13 -$ 13 -6
3 Halobacterium A 13 - (K+) 5 M 5- F K+ - 6 Haloba-cterium F $ 6 Escherichia coli 13-
ΕΡΩΤΗΣΕΙΣ ΕΦΑΡΜΟΓΗΣ 63
K+ $ (-13 $ $- 13 K+
4 6 -- 6 - amp-
5 0 13 13 - - F
13- 13
6 M rsquo F 5 1313 - 13 ( $) laquo- 13raquo 6 6 13
ΕΡΩΤΗΣΕΙΣ ΕΦΑΡΜΟΓΗΣ 63
K+ $ (-13 $ $- 13 K+
4 6 -- 6 - amp-
5 0 13 13 - - F
13- 13
6 M rsquo F 5 1313 - 13 ( $) laquo- 13raquo 6 6 13