Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf ·...

30
Βιολογία Θετικής Κατεύθυνσης

Transcript of Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf ·...

Page 1: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

ΒιολογίαΘετικής Κατεύθυνσης

Page 2: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

ΤΕΧΝΟΛΟΓΊΑ ΤΟΥ ΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΈΝΟΥ DNA

Κεφάλαιο 4ο

Page 3: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

Γενετική Μηχανική

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης

3

Είναι ο κλάδος της Βιολογίας που

περιλαμβάνει τις τεχνικές με τις οποίες ο

άνθρωπος επεμβαίνει στο γενετικό υλικό.

Page 4: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 4

Άνοιξε τον δρόμο για την κατανόηση τωνμυστηρίων της ζωής και της εξέλιξης στη γη.

Συμβάλλει στη βελτίωση της υγείας καιτου τρόπου διαβίωσής του ανθρώπου μέσωτων εφαρμογών στην Ιατρική, Γεωργία καιΚτηνοτροφία.

Page 5: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 5

Η τεχνολογία του ανασυνδυασμένου DNA

Η τεχνολογία του ανασυνδυασμένου DNAπεριλαμβάνει τις τεχνικές εκείνες πουοδηγούν σε μεταφορά του γενετικού υλικούαπό ένα οργανισμό στον άλλο.

Page 6: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 6

Στάδια 

Κατασκευή του ανασυνδυασμένου DNA

Μεταφορά του ανασυνδυασμένου μορίουDNA σε ένα κύτταρο‐ξενιστή.

Επιλογή και απομόνωση των κυττάρωνξενιστών.

Επιλογή του βακτηριακού κλώνου πουπεριέχει το επιθυμητό τμήμα DNA.

Page 7: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 7

1. Απομόνωση ολικού DNA ενόςοργανισμού.

2. Ενζυματικό «κόψιμο» με ειδικάένζυμα που ονομάζονταιπεριοριστικές ενδονουκλεάσες.

1. Κατασκευή ανασυνδυασμένου DNA

Page 8: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 8

Περιοριστικές ενδονουκλεάσες

Είναι ένζυμα που παράγονται από βακτήριακαι ο φυσιολογικός τους ρόλος είναι να ταπροστατεύουν από εισβολή «ξένου» DNA.

Αναγνωρίζουν συγκεκριμένες αλληλουχίεςδίκλωνου DNA 4 – 8 ή περισσοτέρωννουκλεοτιδίων. Χαρακτηριστικό ένζυμο είναι ηEcoRI που «κόβει» αλληλουχίες GAATTC, μεταξύ Gκαι A.

Page 9: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 9

EcoR 1

Hind II

Page 10: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 10

EcoR I G AATTC

EcoR V GAT ATC σε «τυφλά» άκρα

Hind III A AGCTT

Sac I GAGGCT C

Sac II CCGC GG

Sal l G TCGAC

Σειρά περιοριστικών ενδονουκλεασών και οι περιοχές στις οποίες «κόβουν» τις αλυσίδες DNA.

Page 11: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 11

3. Εισαγωγή σε «φορέα κλωνοποίησης».

Το DNA που δημιουργείται ονομάζεται 

ανασυνδυασμένο.

Page 12: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 12

Φορείς κλωνοποίησης

1. Το πλασμίδιο

2. Το DNA των φάγων, όπως οφάγος λ.

3. Σαν φορείς επίσης χρησιμοποιούνται τα κοσμίδια και τα YACS (τεχνητές μορφές φορέων για να μπορούν να δέχονται τμήματα DNA αρκετών εκατοντάδων χιλιάδων βάσεων).

Page 13: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 13

2. Μεταφορά του ανασυνδυασμένου μορίου DNA σε ένα κύτταρο‐ξενιστή

Η διαδικασία αυτή ονομάζεται μετασχηματισμός και

επιτυγχάνεται με τη βοήθεια των κατάλληλων

γονιδίων που υπάρχουν στο πλασμίδιο, ή μέσω

διαμόλυνσης των βακτηρίων με φάγους.

Page 14: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 14

Μετασχ

ηματισμ

όςβα

κτηρ

ίων.

Page 15: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 15

3. Επιλογή και απομόνωση των κυττάρων ξενιστών.

Επιλογή των κυττάρων‐ξενιστών που έχουνμετασχηματιστεί από το ανασυνδυασμένο DNA.

Η επιλογή γίνεται εκμεταλλευόμενοι τηνανθεκτικότητα των κυττάρων‐ξενιστών στααντιβιοτικά που τους προσδίδουν τα πλασμίδια‐φορείς.

Page 16: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 16

Κάθε βακτήριο που θέλουμε να αναπτύξουμε σε

αποικία θα πρέπει να είναι μετασχηματισμένο με ένα

μόριο ανασυνδυασμένου DNA.

Η διαδικασία αυτή ονομάζεται κλωνοποίηση. Ο όρος

κλώνος αναφέρεται σε μια ομάδα πανομοιότυπων

μορίων, ή κυττάρων, ή οργανισμών.

Page 17: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 17

4. Επιλογή ενός βακτηριακού κλώνου που περιέχει το επιθυμητό  τμήμα DNA

Χρησιμοποιώντας ειδικά μόρια‐ανιχνευτές κατάλληλα

ιχνηθετημένα, επιλέγουμε τον κλώνο που περιέχει την

επιθυμητή αλληλουχία του DNA μέσω της τεχνικής της

υβριδοποίησης.

Page 18: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 18

Ι. Γονιδιωματική Βιβλιοθήκη

Η γονιδιωματική βιβλιοθήκη δημιουργείταιόταν κλωνοποιηθεί το συνολικό DNA ενόςοργανισμού μέσα σε κύτταρα‐ξενιστές.

Page 19: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

Επιλογή μετασχηματισμένων κλώνων με τοανασυνδυασμένο DNΑ, μέσω β‐γαλακτοσιδάσης.

3ο ε.λ. Ηλιούπολης επιμέλεια: Αργύρης Γιάννης19

Page 20: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

1. Η εμφάνιση μπλε

αποικιών δείχνει τους 

μετασχηματισμένους 

κλώνους χωρίς 

ανασυνδυασμένο DNA

2. Οι λευκές αποικίες 

δείχνουν τους κλώνους με 

το ανασυνδυασμένο DNA.

3ο ε.λ. Ηλιούπολης επιμέλεια: Αργύρης Γιάννης20

Page 21: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 21

Ανίχνευση κλώνου με ανιχνευτή  νουκλεϊκό οξύ.

Page 22: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 22

ΙΙ. Κλωνοποίηση του mRNA: κατασκευή cDNAβιβλιοθήκης

Η cDNA βιβλιοθήκη κατασκευάζεται όταν

θέλουμε να κλωνοποιήσουμε μόνο τα γονίδια

τα οποία εκφράζονται σε συγκεκριμένα

κύτταρα.

Page 23: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 23

Οι cDNA βιβλιοθήκες περιέχουν αντίγραφατων mRNA όλων των γονιδίων πουεκφράζονται στα κύτταρα αυτά.

Με την διαδικασία αυτή απομονώνονται οιαλληλουχίες εκείνες του γενετικού υλικού οιοποίες εκφράζονται σε αμινοξέα (εξώνια).

Page 24: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 24

Απομόνωση των poly(Α)‐RNA μεχρήση ολιγονουκλεοτιδίωνΤΤΤΤΤΤ (σε χρωματογραφίαστήλης), για την απομόνωση τουολικούmRNA.

Page 25: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 25

Διαδικασία σχηματισμού της cDNA βιβλιοθήκης

Απομόνωση ολικού RNA από κύτταρα που

εκφράζουν το επιθυμητό γονίδιο και από

αυτό απομονώνουμε τοmRNA.

Page 26: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

Μέθοδος μετατροπής mRNA σε δίκλωνο cDNA

Μέσω του ενζύμου αντίστροφημεταγραφάση και με πρότυπο τηναλυσίδα mRNA σχηματίζεταιυβρίδιο μόριοmRNA‐cDNA.

Το mRNA του υβριδικού μορίουmRNA‐cDNA διασπάται με χρήσηκατάλληλων χημικών ουσιών (π.χ.ένζυμο RNάση Η) ήαποδιατάσσεται με θέρμανση και«κρατάμε» τις αλυσίδες cDNA.

Με πρότυπο το cDNA και χρήσητου ενζύμου DNA πολυμεράσηςδημιουργείται δίκλωνο cDNA.

Page 27: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 27

Στο δίκλωνο cDNA δημιουργούμε κατάλληλα

μονόκλωνα άκρα ώστε να «κολλήσουν» με τον

κατάλληλο φορέα.

Τα ανασυνδυασμένα μόρια κλωνοποιούνται

σε κύτταρα‐ξενιστές κατά τα γνωστά και

δημιουργούμε την cDNA βιβλιοθήκη.

Page 28: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 28

ΙΙΙ.  Αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (PCR)

Η μέθοδος της PCR: (polymerase chain reaction) μαςεπιτρέπει να αντιγράψουμε επιλεκτικά,εκατομμύρια φορές, ειδικές αλληλουχίες DNA, μέσααπό ένα σύνθετο μίγμα μορίων DNA χωρίς τημεσολάβηση ζωντανού κυττάρου και αντίστοιχα τηνεπίπονη και χρονοβόρα διαδικασία τηςκλωνοποίησης.

Page 29: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 29

Συσκευή PCR

Page 30: Βιολογία - 3lyk-ilioup.att.sch.gr3lyk-ilioup.att.sch.gr/viologia/Files/4-kat.pdf · Βιολογία. Θετικής Κατεύθυνσης. ... Κεφάλαιο 4ο Author:

3ο ε.λ. Ηλιούποληςεπιμέλεια: Αργύρης Γιάννης 30

Πρωταρχικά τμήματα

Συμπληρωματικές αλυσίδες

Νέα πρωταρχικά τμήματα

Αλυσίδες DNA μεταβλητού μήκους

Νέα πρωταρχικά τμήματα

Επιθυμητά τμήματα μεταβλητού μήκους