Download - Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

Transcript
Page 1: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR

Τομέας Φαρμακογνωσίας & Χημείας Φυσικών Προϊόντων, Τμήμα Φαρμακευτικής, Εθνικό &Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών

[email protected]

Μαρία-Ελένη ΓραφάκουΥποψήφια Διδάκτωρ

Επιβλέπουσα: Καθ. Ελένη Σκαλτσά

Page 2: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

ΦΑΡΜΑΚΟΝ + ΓΝΩΣΙΣ

ΘΕΩΡΗΤΙΚΟ ΜΕΡΟΣ

Page 3: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

✓Στόχος: χημική και φαρμακολογική μελέτη των φαρμακευτικών φυτών

✓Τα φαρμακευτικά φυτά αποτελούν είδη ευρείας εξάπλωσης, εμφανίζοντας πληθώρα εθνοφαρμακολογικών αναφορών και φυτοχημικών μελετών. Τα αντίστοιχα ενδημικά φυτικά είδη με στενή εξάπλωση παρουσιάζουν ερευνητικό ενδιαφέρον, καθώς αποτελούν δυνητικά σημαντικές πηγές νέων βιοδραστικών δευτερογενών μεταβολιτών.

Το Εργαστήριο Φαρμακογνωσίας & Χημείας Φυσικών Προϊόντων

✓ Ελλάδα: biodiversity spot

Page 5: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

Chemistry of Natural Products

SECONDARY METABOLITES

Page 6: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

• Το μεταβόλομα αποτελεί το σύνολο των μεταβολιτών (πρωτογενών και δευτερογενών) ενός βιολογικού συστήματος.

• Δύο μεγάλα πεδία απαντώνται στην έρευνα μικρών μορίων βιολογικής προέλευσης, η μεταβολομική και η χημεία φυσικών προϊόντων.

Page 7: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

Nuclear Magnetic Resonance (NMR) spectroscopy

Advanced analytical method for the identification &

characterization of biological small

molecules

Page 8: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

Nuclear Magnetic Resonance (NMR) spectroscopy

Page 9: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

Nuclear Magnetic Resonance (NMR) spectroscopy

Tα φάσματα NMR κάθε ένωσης είναι χαρακτηριστικά.

Page 10: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

The whole fractionation and final isolation procedure is continuously monitored by NMR:

✓ Extraction and fractionation is carried out by non-deuterated solvents

✓ The resultant solutions are dried under vacuum and subsequently re-

dissolved in deuterated solvent, specifically chloroform-d

Schripsema J., 2010. Phytochem. Anal., 21, 14-21.

Page 11: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

The whole fractionation and final isolation procedure is continuously monitored by NMR:

✓ Extraction and fractionation is carried out by non-deuterated solvents

✓ The resultant solutions are dried under vacuum and subsequently re-

dissolved in deuterated solvent, specifically chloroform-d

Page 12: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

The whole fractionation and final isolation procedure is continuously monitored by NMR:

✓ Extraction and fractionation is carried out by non-deuterated solvents

✓ The resultant solutions are dried under vacuum and subsequently re-

dissolved in deuterated solvent, specifically chloroform-d

Page 13: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

Project: NMR metabolomic strategy: Metabolites isolated from Calea jamaicensis

Page 14: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

Project: NMR metabolomic strategy: Metabolites isolated from Calea jamaicensis

Χρωμένια & Σεσκιτερπενικές Λακτόνες

✓isolation

✓structure elucidation

✓evaluation of the biological activities High activity in living systems

Strong pharmacological interest

Chadwick et al., 2013. Int. J. Mol. Sci.,14, 12780-12805Costa et al., 2016. Eur J Med Chem, 10;123:487-507

ΠΡΑΚΤΙΚΟ ΜΕΡΟΣ

Page 15: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

Amaral et al., 2017. J. Med. Plants Res., 11, 518-537.Wussow et al., 1985. Systematic Botany, 10, 241.

✓ Asteraceae family

✓ 125 spp.

✓ Τροπικές & υποτροπικές περιοχές της Αμερικής

✓ Χρήση στη λαϊκή θεραπευτική (skin infections, dermatitis, gastroenteritis & diarrhoia, diabetes, urinary problems, fever)

✓ C. jamaicensis ενδημικό από το Μεξικό έως την Κολομβία.

Το γένος Calea L. (Asteraceae)

Page 16: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

VLC (silica gel) cHex-EtOAc-Me2CO μείγματα

αυξημένης πολικότητας

Εκχύλιση της δρόγης (maceration): cyclohexane/ether/ methanol 1:1:1

Υγρό-υγρό εκχύλιση(EtOAc)

Page 17: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

NMR spectra of the terpenoid crude extract

and derived sub-fractions have given certain

evidence of compounds belonging to chromenes &

sesquiterpene lactones

CRUDE EXTRACT

Page 18: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

VLC (silica gel) cHex-EtOAc-Me2CO μείγματα

αυξημένης πολικότητας

Εκχύλιση της δρόγης (maceration): cyclohexane/ether/methanol 1:1:1

Υγρό-υγρό εκχύλιση (EtOAc)

Page 19: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

Kλάσμα Α

Kλάσμα ΒKλάσμα C

Kλάσμα D

Kλάσμα G

Kλάσμα F

Kλάσμα E

Kλάσμα HKλάσμα I

Page 20: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

Ten metabolites have been isolated so far

Further purificationRP18-HPLC, prep.TLC, CC and microscale CC (pipette) on silica gel

Page 21: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

Κλάσμα Β

Page 22: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

Κλάσμα Β

Page 23: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

Κλάσμα BM

Page 24: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

Κλάσμα C

Page 25: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

Κλάσμα CK

Page 26: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

Κλάσμα D

Page 27: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

Κλάσμα DK

Page 28: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

Centaurea spp.

C. papposa

Page 29: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

Crocus sativus L. (Iridaceae)

Christodoulou E, Grafakou ME, Skaltsa H, Kadoglou N,

Kostomitsopoulos N, Valsami G. JPP, accepted 18/11/2018.

Page 30: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

Euphorbia spp.

Page 31: Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο NMR · 2018-12-11 · Μεταβολομική στρατηγική βασισμένη στο nmr Τομέας

Natural Products Chemistry