Transcrição e Processamento - iq.usp.br · Transcrição e Processamento transcrição do DNA...
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Transcrição e ProcessamentoTranscrição e Processamento
transcriçãodo DNA
maturaçãodo RNA tradução
em proteínaAAAAAAAA
AAAA
NÚCLEO CITOPLASMA
RNAsRNAs adotam estruturas terciárias complexasadotam estruturas terciárias complexas
RNA carregado
anticódon
aminoácido
RNA transportador
ccóódondon
BraBraçço o aceptoraceptorBraBraçço Do D
BraBraçço o TTΨΨCC
BraBraçço do o do anticanticóódondon
RNA transportador
BraBraçço Do DBraBraçço o TTΨΨCC
((DehidrouridinaDehidrouridina)) ((PseudouridinaPseudouridina))
BraBraçço o aceptoraceptor
AlAlçça varia variáávelvel
ccóódondon
BraBraçço do o do anticanticóódondon TTTTTT
RNA
•nuclear heterogêneo/ mensageiro
•transportador (carrega aminoácidos p/a síntese de proteínas)
•ribossomal (estrutura para a tradução)
•SNuRPs (auxiliadores de transcrição e no “splicing”)
•pequenos RNA (controle de expressão)
Tipos de
rRNArRNA
rRNA + proteínas = ribossomosrRNA + proteínas = ribossomos
RNA de interferRNA de interferêênciancia
ReplicaçãoReplicação
TranscriçãoTranscrição
TraduçãoTradução
O RNA mensageiro transmite a informação genéticaO RNA mensageiro transmite a informação genéticaarmazenada no DNAarmazenada no DNA
ProteínaProteína
DNADNA
RNARNA
Veja, sem oxigênio
desoxiribose
Grupofosfato
Açúcar(ribose)
RIBONUCLEOTÍDEO
• ribose•fita simples•AUGC
RNA
ACGTACGT
UGCAUGCA
Pareamento DNA: RNA
TemplateTemplate= fita molde= fita molde Matriz= fita Matriz= fita codificadoracodificadora
mRNAmRNA
ATGGCATGCAATAGCTCATCG
TACCGTACGTTATCGAGTAGC
AUGGCAUGCAAUAGCUC
55´́
55´́
33´́
33´́
55´́
DireDireçãção de so de sííntese da RNA ntese da RNA polimerasepolimerase
transcritotranscrito
COMPONENTES NECESSÁRIOS PARA OCORRER A TRANSCRIÇÃOCOMPONENTES NECESSÁRIOS PARA OCORRER A TRANSCRIÇÃO
PROTEÍNAS ESPECÍFICAS (FATORES DE TRANSCRIÇÃO) SE LIGAM À PROTEÍNAS ESPECÍFICAS (FATORES DE TRANSCRIÇÃO) SE LIGAM À REGIÕES ESPECÍFICAS DO DNA REGULANDO A TRANSCRIÇÃO DE REGIÕES ESPECÍFICAS DO DNA REGULANDO A TRANSCRIÇÃO DE MODO QUE SOMENTE PROTEÍNAS NECESSÁRIAS VENHAM A SER MODO QUE SOMENTE PROTEÍNAS NECESSÁRIAS VENHAM A SER
PRODUZIDAS.PRODUZIDAS.
RNA polimerase
promotor
InIníício de transcricio de transcriçãção em o em procariotosprocariotos
σσ
Promotores mais comuns em Promotores mais comuns em eucariotoseucariotos
TATA TATA box box (posi(posiçãção o ––25)25)
CAAT CAAT box box (posi(posiçãção o ––40 40 -->110)>110)
GC GC box box (posi(posiçãção o ––40 40 -->110)>110)
TATAAAATATAAAA
TATAAATTATAAATsinal para iniciar a ssinal para iniciar a sííntese de ntese de RNAmRNAm
GGNCAATCTGGNCAATCTpromotor auxiliarpromotor auxiliar
GGGCGGGGGCGGpromotor auxiliar promotor auxiliar –– genes sempre genes sempre expressos (constitutivos)expressos (constitutivos)
^^^^^^^CAAT^^^^^^^GC^^^^^^^^^^^^TATA^^^^^^^^^^
ssíítio de iniciatio de iniciaçãçãoo
+1+1--2525--4040--110110
fatores de transcrifatores de transcriçãção + RNAo + RNA polimerasepolimerase
VAMOS AMPLIAR A REGIÃO QUE NOS INTERESSA!!!VAMOS AMPLIAR A REGIÃO QUE NOS INTERESSA!!!
RNA polimerase
promotor
PRIMEIRO TEMOS QUE ABRIR A BOLHA DE TRANSCRIÇÃO NO PRIMEIRO TEMOS QUE ABRIR A BOLHA DE TRANSCRIÇÃO NO DNA DUPLA FITADNA DUPLA FITA
Bolha de transcrição
ADIANTE E ATRÁS DA BOLHA OCORRE A ATIVIDADE DA ADIANTE E ATRÁS DA BOLHA OCORRE A ATIVIDADE DA TOPOISOMERASETOPOISOMERASE
RIBONUCLEOTÍDEOS SÃO ADICIONADOS A PARTIR DE UM RIBONUCLEOTÍDEOS SÃO ADICIONADOS A PARTIR DE UM SÍTIO ESPECÍFICO (iniciação)SÍTIO ESPECÍFICO (iniciação)
ribonucleotídeo
sítio ativo da enzima
Bolha de transcrição tem 10 a 12 nucleotídeos da cada vez Bolha de transcrição tem 10 a 12 nucleotídeos da cada vez
TRANSLOCAÇÃO da RNAP TRANSLOCAÇÃO da RNAP
LIGAÇÕES FOSFODIÉSTER IGUAIS ÀS DO DNA SÃO FEITAS PARALIGAÇÕES FOSFODIÉSTER IGUAIS ÀS DO DNA SÃO FEITAS PARAUNIR OS RIBONUCLEOTÍDEOS NO RNAUNIR OS RIBONUCLEOTÍDEOS NO RNA
Ligação
fosfodiéster
ApApóós a s a translocatranslocaçãção o de 6 a de 6 a 10 nucleot10 nucleotíídeos hdeos hááa liberaa liberaçãção de o de σσ
RNA polimerase em procariotos (apenas 1)
Holoenzima α2ββ´σ
α - estruturalβ e β´ - unidade catalíticaσ – reconhece promotores identificam o início da transcrição
RPB1 tem um domRPB1 tem um domíínio C terminal(CTD) = PTSPSYS, que repetido nio C terminal(CTD) = PTSPSYS, que repetido muitas vezes exerce controle de transcrimuitas vezes exerce controle de transcriçãção por o por fosforilafosforilaçãçãoo
β e β´ = RBP1 e 2 em eucariotos
RNA polimerase II em eucariotos
3 tipos de RNA polimerase em células de eucariotos
I – se encontra no nucléolo, síntese de subunidades dos ribossomos
II – se encontra no núcleo, síntese de RNAhn / pré-RNAm, SNRPs
III – se encontra no núcleo, síntese de RNAt e RNAr 5S
I I –– se encontra no nuclse encontra no nuclééolo, solo, sííntese de subunidades dos ntese de subunidades dos ribossomosribossomos
II II –– se encontra no nse encontra no núúcleo, scleo, sííntese de ntese de RNAhn RNAhn / pr/ préé--RNAmRNAm, , SNRPsSNRPs
III III –– se encontra no nse encontra no núúcleo, scleo, sííntese de ntese de RNAt RNAt e e RNAr RNAr 5S5S
CAPCAPCAP metilametilaçãção o pospos.7.7--cap0cap0
metilametilaçãçãoo –– cap1cap1
metilametilaçãçãoo –– cap2cap2
EmEm eucariotoseucariotoslogo aplogo apóós o ins o iníício da cio da ssííntese de ntese de hnRNAhnRNAocorre colocaocorre colocaçãção de o de CAP na ponta 5CAP na ponta 5´́ pelapelaguanililguanilil--transferasetransferase
estabilidadeestabilidadeestabilidade
1. síntese do hnRNA2. estabilização pela adição de guanina em posição
inversa na ponta 5´ (Cap)3. metilação de cap 4. poliadenilação (sinal é AAUAA) = tempo de vida do
RNA5. splicing6. passagem para o citoplasma
RNA mensageiroEtapas de preparo de um
OKOKOKOK
OKOK
TTéérmino da transcrirmino da transcriçãção em o em procariotosprocariotos
dependente da proteína ρ (rho), uma helicase
dependente de sequências de terminação no próprio DNA
VVáários Urios U
alalççaaou grampoou grampo
TTéérmino da transcrirmino da transcriçãção em o em eucariotoseucariotos
adiadiçãção em torno de 100 a 200 A pela poliA o em torno de 100 a 200 A pela poliA polimerasepolimerase
sinal de clivagemsinal de clivagem
1. síntese do hnRNA2. estabilização pela adição de guanina em posição
inversa na ponta 5´ (Cap)3. metilação de cap 4. poliadenilação (sinal é AAUAA) = tempo de vida do
RNA5. splicing6. passagem para o citoplasma
RNA mensageiroEtapas de preparo de um
OKOK
OKOKOKOK
OKOK
mRNA maduro
O RNA MENSAGEIRO MADURO É MENOR QUE O DNA QUEO RNA MENSAGEIRO MADURO É MENOR QUE O DNA QUEDEU ORIGEM A ELEDEU ORIGEM A ELE
Pré-mRNA
GENES DE EUCARIOTOS SÃO MAIS COMPLEXOS QUE GENES DE EUCARIOTOS SÃO MAIS COMPLEXOS QUE OS DE PROCARIOTOSOS DE PROCARIOTOS
DNA
AAAAA
AAAAA
exon intron
Pré-mRNA
O SPLICING OCORRE DENTRO DO NÚCLEOO SPLICING OCORRE DENTRO DO NÚCLEO
DNA
GU
AAAAA
sequência consenso Pyr ...A40.........AG
CapCap
GU Pyr ...A40.........AG
AAAAA
sequsequêência ncia consenso consenso -- splicingsplicing
SSíítio de ramificatio de ramificaçãçãoo
Regra GU-AG
O " O " splicingsplicing" ocorre com aux" ocorre com auxíílio dos lio dos sNuRPs sNuRPs (U1 (U1 -- U6)U6)
O " O " splicingsplicing" ocorre " ocorre com auxcom auxíílio dos lio dos
sNuRPs sNuRPs (U1 (U1 -- U6)U6)
FormaFormaçãção do "o do "lariatlariat" (la" (laçço)o)
Pré-RNAm sítio de processamento 5’ sítio de processamento 3’
Formação dospliceossomo
spliceossomo
Forma de Lariat (exon 5’ é clivado)
spliceossomo
o intron serádegradadoTradução
o exon 3’ é clivadoe se liga ao exon 5’
SPLICING ALTERNATIVOSPLICING ALTERNATIVOproduz produz isoformas isoformas do mesmo genedo mesmo gene
SPLICING ALTERNATIVOSPLICING ALTERNATIVO
mmúúsculo estriadosculo estriado
mmúúsculo estriado*sculo estriado*
mioblastomioblasto
mmúúsculo lisosculo liso
fibroblastofibroblasto
hepatomahepatoma
ccéérebrorebro
exemplo alfaexemplo alfa--tropomiosinatropomiosina
após o splicing => RNA diferentes =>proteínas diferentes
A troca de uma A troca de uma úúnica base modifica o nica base modifica o ssíítio de tio de splicing splicing e causa a doene causa a doençça a
chamada chamada TalassemiaTalassemia
ssíítio 3' normal do tio 3' normal do intronintron
1. síntese do hnRNA2. estabilização pela adição de guanina em posição
inversa na ponta 5´ (Cap)3. metilação de cap 4. poliadenilação (sinal é AAUAA) = tempo de vida do
RNA5. splicing6. passagem para o citoplasma
RNA mensageiroEtapas de preparo de um
OKOK
OKOKOKOK
OKOK
OKOK
O RNA mensageiro pronto passa pelos poros nucleares e alcança o citoplasma
O RNA mensageiro é acoplado ao ribossomo com auxílio de diversas proteínas
...
http://gslc.genetics.utah.edu/
OKOK
OKOKOKOKOKOK
prpróóxima aulaxima aula