Niveles de estructura de las proteínas · Niveles de estructura de las proteínas Dos...

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Quimotripsina (21.6 kDa) Glicina (75 Da) Niveles de estructura de las proteínas Dos representaciones de la estructura de una proteína Diagrama de cintas Superficie

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  • Quimotripsina (21.6 kDa)

    Glicina (75 Da)

    Niveles de estructura de las proteínas

    Dos representaciones de la estructura de una proteína

    Diagrama de cintas Superficie

  • Difracción de Rayos X y estructura tridimensional de macromoléculas

  • Conformación de la cadena polipeptídica

  • Conformación hélice α

    Hélice α ideal:Ф = -57ºΨ = -47º

    Puentes de hidrógeno

  • Hélice α

    Puentes de hidrógeno

    Representación de secuencias en conformación α

  • Conformación β

    Antiparalela: Φ = -139º, Ψ = 135º

    Paralela: Φ = -119º, Ψ = 113º

    Láminas β ideales:

  • Conformación β

    Antiparalela

    Paralela

    Mixta

    Puentes de hidrógeno

  • Giros βAbundancia relativa de los Aaen estructuras secundarias

  • Unidad βαβ Meandro β Unidad αα Barril β Greca

    Estructuras supersecundarias

    (Mackee)

    (Lehninger)

  • Representaciones de Ramachandran

    Piruvato kinasa

  • Aa hidrofílicos

    Aa hidrofóbicos

    Plegamiento proteico

    Conformación nativa

    Conformación desplegada

    Efecto hidrofóbico

    Formación de puentes de hidrógeno

  • Estructura terciaria: Interacciones estabilizantes

  • Distribución de aminoácidos en las proteínas globulares

    Porina

    Mioglobina

    Aa hidrofóbicosAa cargados

    Aa Hidrofílicos

    InteriorExterior

    Presencia de dominios en las proteínas globulares

    Troponina C

    Proteína CD-4

  • Estructuras terciarias de algunas proteínas.

    Diversidad en el contenido de conformación α y β

  • Estructuras cuaternarias

    Hemoglobina

    Chaperonina GroES-Gro-EL

  • Desnaturalización proteica

    Desnaturalización reversiblede la ribonucleasa A

  • Etapas del plegamiento proteico:En ausencia (A) y en presencia (B) de chaperonas

    B Hsp 70

    Hsp 60

    A

  • Predicción de la estructura secundaria

  • Predicción de la estructura terciaria

    “La predicción de estructuras terciarias está todavía lejos de nuestro alcance. De hecho, a medida que aprendemos más sobre la complejidad del plegamiento de las proteínas, el objetivo parece alejarse más en el horizonte. En 1998, está claro que la predicción directa de la estructura a partir de la secuencia está a décadas de distancia.”

    Attwod TK, Parry-Smith TJ.Introducción a la Bioinformática.Prentice-Hall, 2002.

  • Conformaciones de la proteína priónica humana

    PrPc, conformación α normal

    PrPSc conformación βpatológica

  • Proteínas fibrosasFibroína de la seda (β-queratina)

    Gly↑ Ala↑ Ser↑

    α-queratinas (cabello, lana, uñas etc). Cys ↑, Aa hidrófobos ↑

    Prot-tridimens-1.pdfProt-tridimens-2.pdf