Niveles de estructura de las proteínas · Niveles de estructura de las proteínas Dos...
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Quimotripsina (21.6 kDa)
Glicina (75 Da)
Niveles de estructura de las proteínas
Dos representaciones de la estructura de una proteína
Diagrama de cintas Superficie
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Difracción de Rayos X y estructura tridimensional de macromoléculas
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Conformación de la cadena polipeptídica
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Conformación hélice α
Hélice α ideal:Ф = -57ºΨ = -47º
Puentes de hidrógeno
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Hélice α
Puentes de hidrógeno
Representación de secuencias en conformación α
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Conformación β
Antiparalela: Φ = -139º, Ψ = 135º
Paralela: Φ = -119º, Ψ = 113º
Láminas β ideales:
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Conformación β
Antiparalela
Paralela
Mixta
Puentes de hidrógeno
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Giros βAbundancia relativa de los Aaen estructuras secundarias
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Unidad βαβ Meandro β Unidad αα Barril β Greca
Estructuras supersecundarias
(Mackee)
(Lehninger)
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Representaciones de Ramachandran
Piruvato kinasa
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Aa hidrofílicos
Aa hidrofóbicos
Plegamiento proteico
Conformación nativa
Conformación desplegada
Efecto hidrofóbico
Formación de puentes de hidrógeno
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Estructura terciaria: Interacciones estabilizantes
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Distribución de aminoácidos en las proteínas globulares
Porina
Mioglobina
Aa hidrofóbicosAa cargados
Aa Hidrofílicos
InteriorExterior
Presencia de dominios en las proteínas globulares
Troponina C
Proteína CD-4
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Estructuras terciarias de algunas proteínas.
Diversidad en el contenido de conformación α y β
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Estructuras cuaternarias
Hemoglobina
Chaperonina GroES-Gro-EL
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Desnaturalización proteica
Desnaturalización reversiblede la ribonucleasa A
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Etapas del plegamiento proteico:En ausencia (A) y en presencia (B) de chaperonas
B Hsp 70
Hsp 60
A
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Predicción de la estructura secundaria
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Predicción de la estructura terciaria
“La predicción de estructuras terciarias está todavía lejos de nuestro alcance. De hecho, a medida que aprendemos más sobre la complejidad del plegamiento de las proteínas, el objetivo parece alejarse más en el horizonte. En 1998, está claro que la predicción directa de la estructura a partir de la secuencia está a décadas de distancia.”
Attwod TK, Parry-Smith TJ.Introducción a la Bioinformática.Prentice-Hall, 2002.
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Conformaciones de la proteína priónica humana
PrPc, conformación α normal
PrPSc conformación βpatológica
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Proteínas fibrosasFibroína de la seda (β-queratina)
Gly↑ Ala↑ Ser↑
α-queratinas (cabello, lana, uñas etc). Cys ↑, Aa hidrófobos ↑
Prot-tridimens-1.pdfProt-tridimens-2.pdf
