!ΒΙΟMIC - ΚΕΔΕΚ ΑΠΘkedek.auth.gr/sites/default/files/BIOMIC.pdf · Ερευνητές!...

9
ΒΙΟMIC Κέντρο Βιοανάλυσης και Τεχνολογιών Omics Συντονιστής: Γ. Θεοδωρίδης , καθ. Τμ. Χημείας

Transcript of !ΒΙΟMIC - ΚΕΔΕΚ ΑΠΘkedek.auth.gr/sites/default/files/BIOMIC.pdf · Ερευνητές!...

Page 1: !ΒΙΟMIC - ΚΕΔΕΚ ΑΠΘkedek.auth.gr/sites/default/files/BIOMIC.pdf · Ερευνητές! 1! Δρ.ΛεμονιάΒαλιάνου ! Χημικός,!Δρ.!Αναλυτική!Χημεία!

 ΒΙΟMIC  

Κέντρο  Βιοανάλυσης  και  Τεχνολογιών  Omics  

Συντονιστής:  Γ.  Θεοδωρίδης  ,  καθ.  Τμ.  Χημείας  

Page 2: !ΒΙΟMIC - ΚΕΔΕΚ ΑΠΘkedek.auth.gr/sites/default/files/BIOMIC.pdf · Ερευνητές! 1! Δρ.ΛεμονιάΒαλιάνου ! Χημικός,!Δρ.!Αναλυτική!Χημεία!

BIOMIC  

Page 3: !ΒΙΟMIC - ΚΕΔΕΚ ΑΠΘkedek.auth.gr/sites/default/files/BIOMIC.pdf · Ερευνητές! 1! Δρ.ΛεμονιάΒαλιάνου ! Χημικός,!Δρ.!Αναλυτική!Χημεία!

ΒΙΟΜΙC:  Ανθρώπινο  δυναμικό  

1   ΓΕΩΡΓΙΟΣ  ΘΕΟΔΩΡΙΔΗΣ  (Καθ.  Χημ)   Βιοαναλυτική  Χημεία,  Μεταβολομική,  LC-­‐MS,    Χρωματογραφία,  Φασματοσκοπικές  Τεχνικές    

2   ΓΕΩΡΓΙΟΣ  ΚΑΡΑΚΙΟΥΛΑΚΗΣ  (Καθ.  Ιατρ)   Βιοδιαθεσιμότητα,  Φαρμακολογία  

3   ΔΗΜΗΤΡΙΟΣ  ΚΟΥΒΕΛΑΣ  (Καθ.  Ιατρ)   Κλινικές  Μελέτες  φάσης  Ι  και  ΙΙ,  Βιοϊσοδυναμία  

4   ΓΕΩΡΓΙΟΣ  ΑΡΣΕΝΟΣ  (Καθ.  Κτηνιατρ)   Ζωική  παραγωγή  

5   ΝΙΚΟΛΑΟΣ  ΡΑΙΚΟΣ  (Αν.Καθ.  Ιατρ.)   Κλινική,  Αναλυτική  και  Ιατροδικαστική  Τοξικολογία,  GC-­‐MS,  LC-­‐MS  

6   ΒΑΣΙΛΗΣ  ΜΟΥΓΙΟΣ  (Καθ.  ΤΕΦΑΑ)   Βιοχημεία  της  Ασκησης  

7   ΑΛΕΞΑΝΔΡΟΣ  ΤΡΙΑΝΤΑΦΥΛΛΙΔΗΣ  (Αν.Καθ.  Βιολ)   Γενετική  πληθυσμών  ζώων,  Γονιδιωματική,  Ιχνηλασιμότητα  

8   ΕΛΕΝΗ  ΓΚΙΚΑ  (Λέκτορας  Ιατρ.)   Βιοαναλυτική,  Μεταβολομική,  Εύρεση  Βιοδεικτών,  LC-­‐MS,  NMR,  GC-­‐MS  

9   ΙΩΑΝΝΗΣ  ΒΛΑΧΑΒΑΣ  (Καθ.  Πληρ.)   Μηχανική  Μάθηση  και  Ανακάλυψη  γνώσης  από  Βάσεις  Δεδομένων  (Data  Mining  

10   ΕΜΜΑΝΟΥΗΛ  ΡΟΗΛΙΔΗΣ  (Καθ.  Ιατρ)   Λοιμωξιολογία,  Ανοσολογία  Λοιμώξεων,  Βιομεμβράνες  

11   ΚΟΣΜΑΣ  ΣΑΡΑΦΙΔΗΣ  (Αν.  Καθ.  Ιατρ.)   Νεογνολογία,  Παιδιατρική  

12   ΣΥΜΕΩΝ  ΜΕΤΑΛΛΙΔΗΣ  (Επικ.  Καθ.  Ιατρ.)   Λοιμωξιολογία,  Θεραπευτική,  Γενική  παθολογία  

13   ΝΙΚΟΣ  ΝΕΝΑΔΗΣ  (Επικ.  Καθ.  Χημ.)   Οξείδωση  λιπών  και  ελαίων,  φαινολικά  αντιοξειδωτικά,  ενόργανη  ανάλυση  

14   ΑΝΑΣΤΑΣΙΑ  ΚΑΡΙΩΤΗ  (Επικ.  Καθ.  Φαρμ.)   Χημεία  Φυσικών  Βιοδραστικών  Προϊόντων,  απομόνωση  και  ταυτοποίηση.  Ελεγχος  ποιότητας  φυτοθεραπευτικών/συμπληρωμάτων  διατροφής.  

15   ΣΤΑΥΡΟΣ  ΚΑΛΟΓΙΑΝΝΗΣ  (Επικ.  Καθ.  ΑΤΕΙ  Διατροφής)  

Βιοχημεία  Τροφίμων  και  Διατροφής  

16   ΔΗΜΗΤΡΑ  ΛΑΜΠΡΟΠΟΥΛΟΥ  (Επικ.  Καθ.  Χημ)   Ελεγχος  ρύπανσης  περιβαλλοντος    

Μελη  ΔΕΠ    

Page 4: !ΒΙΟMIC - ΚΕΔΕΚ ΑΠΘkedek.auth.gr/sites/default/files/BIOMIC.pdf · Ερευνητές! 1! Δρ.ΛεμονιάΒαλιάνου ! Χημικός,!Δρ.!Αναλυτική!Χημεία!

Ερευνητές  1   Δρ.  Λεμονιά  Βαλιάνου   Χημικός,  Δρ.  Αναλυτική  Χημεία  

Βιοαναλυτική,  LC-­‐MS,  GC-­‐MS  

2   Δημήτριος  Παλαχάνης   Χημικός,  MSc  Bioinforma~cs  Βιοπληροφορική  

3   Ολγα  Δέδα   Βιο-­‐Χημικός,  MSc  Βιοαναλυτική  Χημεία  Βιοαναλυτική,  LC-­‐MS,  GC-­‐MS,  NMR  

4   Χριστίνα  Βιργιλίου   Χημικός,  MSc  Αναλυτική  Τοξικολογία  Βιοαναλυτική,  LC-­‐MS,  GC-­‐MS  

5   Χρυσοβαλάντου  Χατζηιωάννου     Χημικός,  MSc  Βιοαναλυτική  Χημεία  Βιοαναλυτική,  LC-­‐MS,  GC-­‐MS,  NMR  

6   Ολγα  Μπέγου   Χημικός,  MSc  Βιοαναλυτική  Χημεία  Βιοαναλυτική,  LC-­‐MS  

7   Νικολέττα  Καραίσκου   Βιολόγος,  ΕΔΙΠ  Γενετική  Πληθυσμών  

8   Αικατερίνη  Σιώπη   Διατροφή  και  διαιτολογία  Επιστήμες  άσκησης,  διατροφή  και  διαιτολογία  

9   Καβακιώτης  Ιωάννης   Πληροφορικός  MSc  Πληροφοριακά  Συστήματα  MSc  Εφαρμοσμένη  Γενετική  και  Βιοτεχνολογία,  Ανάλυση  δεδομένων  

10   Ελένη  Παπακωνσταντίνου   Φαρμακολόγος  Βιοϊσοδυναμία,  Βιοδιαθεσιμότητα,  Φαρμακοκινητική  

ΒΙΟΜΙC:  Ανθρώπινο  δυναμικό  

Page 5: !ΒΙΟMIC - ΚΕΔΕΚ ΑΠΘkedek.auth.gr/sites/default/files/BIOMIC.pdf · Ερευνητές! 1! Δρ.ΛεμονιάΒαλιάνου ! Χημικός,!Δρ.!Αναλυτική!Χημεία!

Δομή  

Σύστημα  Ι:  HPLC  (Aliance  Waters)  -­‐API350  MS      (Applied  Biosystems)  Σύστημα  ΙΙ:  UPLC  (Acquity  Waters)  -­‐  TOF-­‐HR-­‐MS  (Ul~ma  Waters)  Σύστημα  ΙΙΙ:    UPLC  (  Accela)-­‐  TSQ  Quantum  MS  (Thermo)    Σύστημα  ΙV:  GC  –FID  (Agilent)    

Page 6: !ΒΙΟMIC - ΚΕΔΕΚ ΑΠΘkedek.auth.gr/sites/default/files/BIOMIC.pdf · Ερευνητές! 1! Δρ.ΛεμονιάΒαλιάνου ! Χημικός,!Δρ.!Αναλυτική!Χημεία!

Δράσεις    

•   Εφαρμογή  τεχνολογιών  omics  σε  θέματα  υγείας,  διατροφής  και  τροφίμων  Βιοδείκτες  ασθενειών  (διάγνωση-­‐πρόγνωση),  >  40  μελέτες  (τοξικότητα,  ρευματοειδής  αρθρίτιδα,  σήψη,  IVF,  

ανάπτυξη  εμβρύων,  παχυσαρκία,  μεταβολικό  σύνδρομο  κ.α.)    

Χαρακτηρισμός    προϊόντων/τροφίμων  υψηλής  διατροφικής  αξίας,  έλεγχος  γεωγραφικής  προέλευσης  και  αυθεντικότητας    (μέλι,  κρασί,  φρούτα  κ.α.),    

Προϊόντα  βιοτεχνολογικής  βελτίωσης  (γενετικό/μεταβολικό  προφίλ).  

•  Ανάπτυξη  και  παροχή  υπηρεσιών  στο  πεδίο  κλινικών  μελετών  φάσης  Ι  και  ΙΙ,  βιοϊσοδυναμίας  -­‐βιοδιαθεσιμότητας  φαρμακευτικών  ουσιών  που  προορίζονται  για  άνθρωπο  και  ζώα  και  προσδιορισμό  καταλοίπων  από  χορήγηση  φαρμακευτικών  ουσιών  σε  ζώα.    

•  Ελεγχος  ποιότητας  ιατρικών  και  κτηνιατρικών  φαρμακευτικών  σκευασμάτων  

                   (φυτοθεραπευτικά  σκευάσματα-­‐συμπληρώματα  διατροφής  κ.α.)  

•  Βιο-­‐φαρμακευτική  ανάλυση  και  έλεγχος  θεραπευτικών  επιπέδων  φαρμάκων  

•  Παροχή  υπηρεσιών  στο  πεδίο  περιβαλλοντικού  ελέγχου    

•  Ανάπτυξη  και  παροχή  Υπηρεσιών  σε  ανάλυση  Δεδομένων  

Οι  δράσεις  μπορούν  να  εξυπηρετήσουν  τις  ανάγκες  φαρμακευτικών  εταιριών,  εταιριών  του  αγροδιατροφικού  τομέα  (παραγωγή,  έλεγχος  ποιότητας),  εταιριών  βιοχημικών  ή  άλλων  αναλύσεων  καθώς  και  παροχή  υπηρεσιών  σε  μεμονωμένους  παραγωγούς  

     Εφαρμοσμένη  έρευνα  

   Παροχή  υπηρεσιών    

Page 7: !ΒΙΟMIC - ΚΕΔΕΚ ΑΠΘkedek.auth.gr/sites/default/files/BIOMIC.pdf · Ερευνητές! 1! Δρ.ΛεμονιάΒαλιάνου ! Χημικός,!Δρ.!Αναλυτική!Χημεία!

Σχολή:  ΘΕΤΙΚΩΝ  ΕΠΙΣΤΗΜΩΝ  Τμήμα:  ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ  Τομέας:  ΓΕΝΕΤΙΚΗΣ,  ΑΝΑΠΤΥΞΗΣ  ΚΑΙ  ΜΟΡΙΑΚΗΣ  ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ  Διευθυντής:  Αναπληρωτής  Καθηγητής  Τριανταφυλλίδης  Αλέξανδρος  E-­‐mail:  [email protected]  

Γενετικές  Υπηρεσίες  Ιχνηλασιμότητας    σε  ζώα  και  στα  παράγωγά  τους  

Eφαρμογή   της   γενετικής   και   του   DNA   στην  ταυτοποίηση   ζώων   και   τροφίμων.   Χρησιμοποιούνται  κυρίως   ουδέτεροι   μοριακοί   δείκτες   (μιτοχονδριακό  DNA   και   μικροδορυφορικό   DNA),   ενώ   ήδη  συμπεριλαμβάνονται   και   τεχνολογίες   αλληλούχησης  νέας   γενιάς   (NGS)   και   βιοπληροφορικής   ανάλυσης  γονιδιωματικών  δεδομένων.  

Page 8: !ΒΙΟMIC - ΚΕΔΕΚ ΑΠΘkedek.auth.gr/sites/default/files/BIOMIC.pdf · Ερευνητές! 1! Δρ.ΛεμονιάΒαλιάνου ! Χημικός,!Δρ.!Αναλυτική!Χημεία!

Γενετικές  Υπηρεσίες  Ιχνηλασιμότητας    σε  ζώα  και  στα  παράγωγά  τους  

Ποιοτική  και  ποσοτική  ανάλυση  προϊόντων  κρέατος  

Ταυτοποίηση  ειδών  όπως  μοσχάρι,  κατσίκα,  κοτόπουλο,  πρόβατο,  χοίρος,  άλογο  σε  τρόφιμα  

Γενετική  ταυτοποίηση  ιχθυηρών    

Ταυτοποίηση  νοθείας  σε  επίπεδο  είδους  σε  ιχθυηρά  τρόφιμα  

Γενετική  ταυτοποίηση  εκτρεφόμενων  ζώων  

Ταυτοποίηση  ενδημικότητας  σε  επίπεδο  γεωγραφικής  προέλευσης.  Ταυτοποίηση  ελληνικών  παραγωγικών  φυλών  (μαύρος  χοίρος,  φυλές  αιγοπροβάτων)  

Γενετική  ταυτοποίηση  γεννητόρων  και  παραγώγων  

Ταυτοποίηση  γονέων  και  απογόνων  σε  παραγωγικά  ζώα  

Γενετική  ταυτοποίηση  προέλευσης  

Ταυτοποίηση  άγριων  και  καλλιεργούμενων  ατόμων  τσιπούρας  και  λαυρακιού  στα  ελληνικά  ύδατα    

Γενετική  ταυτοποίηση  θηραμάτων  

Αγριόχοιρος,  λαγός,  ελάφι,  ορεινή/νησιωτική/πεδινή  πέρδικα,  φασιανός    

Μελλοντικά…  Βιοπαρακολούθηση  περιβάλλοντος  με  υπηρεσίες  Next  Genera~on  Sequencing  

ΠΕΛΑΤΕΣ:    ΕΦΕΤ,  Κρατικές  Υπηρεσίες,  Κτηνοτρόφοι,  Γαλακτοβιομηχανία,  Δασολόγοι,  Κυνηγοί,  Ιχθυοκαλλιεργητές,  Ιδιώτες  

Μοσχάρι

Κοτόπουλο Πρόβατο

Κατσίκα

Χοίρος Άλογο

Page 9: !ΒΙΟMIC - ΚΕΔΕΚ ΑΠΘkedek.auth.gr/sites/default/files/BIOMIC.pdf · Ερευνητές! 1! Δρ.ΛεμονιάΒαλιάνου ! Χημικός,!Δρ.!Αναλυτική!Χημεία!

Στόχοι  -­‐Προοπτικές  

•  Συνένωση  δυνάμεων,  ειδικοτήτων,  εμπειρίας,  υλικών  για  τη  δημιουργία  ενός  σύγχρονου  κέντρου  βιοανάλυσης  και  τεχνολογιών  -­‐omics.    

Το  κεντρικό  αυτό    εργαστήριο  λείπει  από  το  ΑΠΘ  

•  Ερευνα  αιχμής  και  παροχή  υπηρεσιών  σε  δι-­‐επιστημονικά  πεδία.    

•  Ανάπτυξη  νέων  μεθόδων  και  υπηρεσιών.  Διαπίστευση  μεθόδων.  •  Υποβολή  ερευνητικών  προτάσεων,  προσέλκυση  χρηματοδότησης,  

εκπαίδευση  νέων  ερευνητών