Gram Positive Cocci: Strep and Staph...Bacillus, Corynebacterium, Clostridium, Lactobacillus,...

18
Gram Positive Cocci: Strep and Staph Organism Physiology/Structure Virulence Epidemiology Diseases Tx Staph Aureus Gram (+) cocci formed in clusters Facultative Anaerobes Catalase (+) Coagulase (+) Β‐Hemolytic A protein evades phagocytosis Coagulase forms fibrin clot around organism, protecting it from phagocytosis Toxic Shock Syndrome Toxin produces the superantigen TSST‐1 that leads to toxic shock. Exfoliatin causes the skin to slough off, disrupts desmosomes. Enterotoxin causes gastroenteritis Is normal flora found in mucous membranes and skin. Transmission can either be endogenous or exogenous. Common contamination is found in food workers that sneeze on their hands, then don’t wash. Found on food that has been left out, like potatoe salid. Gastroenteritis usually self limiting. Can be caused by ingestion of bacteria (then subsequent production of toxin) or by ingestion of heat stabile toxin produced before organism was killed by cooking. Scalded Skin Syndrome local infection produces a toxin distally. Causes mild epidermal tears, with a “sunburn like rash” Toxic Shock associated with tampons left in too long, toxin is a superantigen that causes fever, hypotension, and death Infective Endocarditis acute onset endocarditis with fever, malaise, and a heart murmur. Caused by cytolytic toxins Gastroenteritis is self limiting, and the organism is passed with stool It is gram (+) with penicillinase activity, so Beta‐ Lactams don’t work. Methacillin and Nafcillin were drugs of choice because of their resistance to penicillinase. MRSA (methicillin resistant staph aureus) has made treatment more difficulty. Vancomycin is now the drug of choice, though resistant strains are being identified. Enterrococcus (Fecalis and Fecium) Gram (+) Coccus, it is one of the Strep Species Lancefield Group D’ Can grown in Bile or in High Salt (6.5%) γHemolytic PYR (+) Survives Bile and Salt so can colonize in the gall bladder. They are part of the normal flora of the GI and GU tract. During a procedure, they can be dislodged or displaced and presented to where they should no be. Normal Flora Most prevalent bacteria of GI tract Endogenous Transmission UTI GI GU Cholecystitis – infection of the gallbladder. Penicillin Strep Pyogenes Gram (+) Coccus Lancelfield Group A βHemolytic Bacitracin Sensitive to separate it from Strep Agalactiae Theme is “escape or spread” M protein – antiphagocytic protein. M12 is associated with glomerular nephritis Streptolysin O Oxygen Labile, antigenic cytolysin that causes lysis of cells. Streptolysin S – Oxygen Stabile, nonantigenic cytolysin that causes lysis of cells. “ASE”s Streptokinase, DNAase, Hyalurindase, all makes it easier to spread in tissue. Exotoxin A‐C that are superantigens and cause symptoms of scarlet fever Human throat, transmitted by aerosol droplets or endogenous infection. Sequellae of Disease (to fit better) Rheumatic Fever – possible sequella of untreated pharyngitis ONLY. This is a type II hypersensitivity reaction, where antibodies to the strep cross react with heart tissue. Causes endocartitis, a chorea, fever, and arthralgia. Poststreptococcal Glomerular Nephritis – possible sequella of untreated strep pharyngitis or skin infection. Type III hypersensitivity reaction. Immune complexes are deposited in the kidney, causing damage. Associated with M12 serotype Pharyngitis – white, purulent lesions on the oropharynx. Scarlet fever – if strep throat is untreated it can then be accompanied by scarlet fever. It is described as a sand‐ paper rash, also called a sun burn‐like rash, in that the skin is red. The palms and soles are spared. There is also a strawberry tongue that presents bright red with many bumps. Impetigo ‐ just like staph aureus Necrotizing Fasciitis ‐ infection that causes “flesh‐eating bacteria.” Rapid spread through fascial layer can involve large amounts of tissue requiring debreidment or amputation. Culture all negatives on a rapid test. βLactams work well. In those with allergies, use macrolides.

Transcript of Gram Positive Cocci: Strep and Staph...Bacillus, Corynebacterium, Clostridium, Lactobacillus,...

Page 1: Gram Positive Cocci: Strep and Staph...Bacillus, Corynebacterium, Clostridium, Lactobacillus, Actinomyces, Nocardia, Listeria, Mycobacteria; you know “N” is NOT neisseria because

Gram Positive Cocci: Strep and Staph 

Organism  Physiology/Structure  Virulence  Epidemiology  Diseases  Tx Staph Aureus  Gram (+) cocci formed 

in clusters  Facultative Anaerobes  Catalase (+)  Coagulase (+)   Β‐Hemolytic 

A protein evades phagocytosis  Coagulase forms fibrin clot around organism, protecting it from phagocytosis  Toxic Shock Syndrome Toxin produces the superantigen TSST‐1 that leads to toxic shock.  Exfoliatin causes the skin to slough off, disrupts desmosomes.  Enterotoxin causes gastroenteritis 

Is normal flora found in mucous membranes and skin. Transmission can either be endogenous or exogenous.   Common contamination is found in food workers that sneeze on their hands, then don’t wash. Found on food that has been left out, like potatoe salid.   

Gastroenteritis usually self limiting. Can be caused by ingestion of bacteria (then subsequent production of toxin) or by ingestion of heat stabile toxin produced before organism was killed by cooking.   Scalded Skin Syndrome local infection produces a toxin distally. Causes mild epidermal tears, with a “sunburn like rash”  Toxic Shock associated with tampons left in too long, toxin is a superantigen that causes fever, hypotension, and death  Infective Endocarditis acute onset endocarditis with fever, malaise, and a heart murmur. Caused by cytolytic toxins 

Gastroenteritis is self limiting, and the organism is passed with stool  It is gram (+) with penicillinase activity, so Beta‐Lactams don’t work.   Methacillin and Nafcillin were drugs of choice because of their resistance to penicillinase. MRSA (methicillin resistant staph aureus) has made treatment more difficulty.   Vancomycin is now the drug of choice, though resistant strains are being identified.  

Enterrococcus (Fecalis and Fecium) 

Gram (+) Coccus, it is one of the Strep Species  Lancefield Group D’  Can grown in Bile or in High Salt (6.5%)   γ­Hemolytic  PYR (+) 

Survives Bile and Salt so can colonize in the gall bladder.   

They are part of the normal flora of the GI and GU tract. During a procedure, they can be dislodged or displaced and presented to where they should no be.   Normal Flora  Most prevalent bacteria of GI tract  Endogenous Transmission 

UTI GI   GU  Cholecystitis – infection of the gallbladder.    

Penicillin 

Strep Pyogenes  Gram (+) Coccus  Lancelfield Group  A  β­Hemolytic  Bacitracin Sensitive to separate it from Strep Agalactiae 

Theme is “escape or spread” M protein – antiphagocytic protein. M12 is associated with glomerular  nephritis  Streptolysin O – Oxygen Labile, antigenic cytolysin that causes lysis of cells.   Streptolysin S – Oxygen Stabile, non­antigenic cytolysin that causes lysis of cells.   “ASE”s Streptokinase, DNAase, Hyalurindase, all makes it easier to spread in tissue.   Exotoxin A‐C  that are superantigens and cause symptoms of scarlet fever  

Human throat, transmitted by aerosol droplets or endogenous infection.  Sequellae of Disease (to fit better)  Rheumatic Fever – possible sequella of untreated pharyngitis ONLY. This is a type II hypersensitivity reaction, where antibodies to the strep cross react with heart tissue. Causes endocartitis, a chorea, fever, and arthralgia.   Poststreptococcal Glomerular Nephritis – possible sequella of untreated strep pharyngitis or skin infection. Type III hypersensitivity reaction. Immune complexes are deposited in the kidney, causing damage. Associated with M12 serotype 

Pharyngitis – white, purulent lesions on the oropharynx.   Scarlet fever – if strep throat is untreated it can then be accompanied by scarlet fever. It is described as a sand‐paper rash, also called a sun burn‐like rash, in that the skin is red. The palms and soles are spared. There is also a strawberry tongue that presents bright red with many bumps.   Impetigo  ‐ just like staph aureus  Necrotizing Fasciitis  ‐ infection that causes “flesh‐eating bacteria.” Rapid spread through fascial layer can involve large amounts of tissue requiring debreidment or amputation.   

Culture all negatives on a rapid test.  β­Lactams work well.   In those with allergies, use macrolides.  

  

  

  

  

  

  

Page 2: Gram Positive Cocci: Strep and Staph...Bacillus, Corynebacterium, Clostridium, Lactobacillus, Actinomyces, Nocardia, Listeria, Mycobacteria; you know “N” is NOT neisseria because

Organism  Physiology/Structure  Virulence  Epidemiology  Diseases  Tx Strep Pneumoniae  Gram (+) Coccus 

 Lancet­Shaped Diplococci  No Lancelfield Group    α­Hemolytic  Optochin Sensitive to separate it from Viridans group 

Capsule – most important virulence factor  IgA protease – cleaves IgA that allows colonization of mucosa.   Pneumolysin O – what is responsible for the rust colored sputum associated with the disease. Destroys ciliated cells by inducing classic complement.  

Normal flora of the upper respiratory tract. They can be colonized, but not be infected. Any immunocompromise (chronic pulmonary disease, viral infection, spleen‐ectomy) can lead to pathogenesis 

Acute Pneumonia  rapid onset of fever and chills, pain on inspiration, and an X‐ray with infilitrates  Otitis Media – most common cause of otitis media in children, despite vaccine.  Sinusitus – same as otitis media, commonly causes sinusitis in kids  Adult Meningitis – since the vaccine for H. Influenzae b (later), now is leading cause of meningitis in neonates.   

Macrolides for adult bacterial pneumonia  Third Generation Cephalosporin for meningitis  Vaccines are available. The pediatric vaccine covers 7 common serotypes protecting against meningitis.   The adult vaccine covers 23 common serotypes to protect against pneumonia   

Viridans group  Gram (+) Coccus  No Lancelfield Group    α­Hemolytic  Optochin Resistant to separate it from S. Penuemo 

Dextran Bioslime  that both protect the organism from the immune system and increases adherence to teeth or heart valves 

This is a variety of organisms such as S. Mutans.   S. Mutans is part of the normal flora of dental caries. These buggers cause plaque. Plaque then allows other Viridans group to colonize and cause cavities 

Subacute Endocarditis – dental surgery gives S. Mutans access to the blood stream where it colonizes the mitral valve.   This is why people with prostethic valves or previous valve problems get prophylactic antibiotics before dental procedures.  

Penicillin often prophylactic for endocarditis.   In pharm, you learn you treat with Clindamycin or a combination of Vancomycin + Gentamycin. 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Page 3: Gram Positive Cocci: Strep and Staph...Bacillus, Corynebacterium, Clostridium, Lactobacillus, Actinomyces, Nocardia, Listeria, Mycobacteria; you know “N” is NOT neisseria because

Gram Positive Rods: BCC LAN LM “Send an Email (BCC) over the network (LAN) to Lincoln Martin (LM)” Bacillus, Corynebacterium, Clostridium, Lactobacillus, Actinomyces, Nocardia, Listeria, Mycobacteria; you know “N”  is NOT neisseria because Mycobacteria and Nocardia are similar.  

Organism  Physiology/Structure  Virulence  Epidemiology  Diseases  Diagnosis Bacillus Anthracis  Gram (+) Rod 

 Forms spores  Is unique for its polypeptide capsule (most others are polysaccharide)  Facultatively Anaerobic 

Spore Forming so they are highly resistant to drying, desiccation, heating, etc.  Antiphagocytic Capsule evades phagocytosis  Exotoxins    Edema Factor – calmodulin dependent increase in cAMP leading to fluid extrusion.     Lethal Factor – causes tissue necrosis.   Protective Factor  ‐allows entry of toxins into target cells. Called this because it is target of vaccine. 

Found in soil, water, and on animals (particularly sheep).   Can be inoculated into a cutaneous wound or inhaled into the lungs.   Possible agent of bioterrorism (note the postal scare).  

Cutaneous Anthrax is 95% of all anthrax cases. Spores get into wound causing black painless swollen postules called eschars. They crust over and resolve spontaneously. They can rarely enter circulation and cause fatal septicemia.   Pulmonary Anthrax (Woolsorter’s Disease). Inhaled spores cause hemorrhagic lymphedemitis  with mediastinal widening. It resembles many pulmonary diseases initially, and is rapidly fatal without treatement. Normally transmitted by sheep, it is now a risk of bioterrorism.  

Formerly Penicillin (which may still work).   Currently use doxycyline or cirpofloxain 

Bacillus Cereus  Gram (+) Rod  Forms spores  Same as Bacillus Anthracis 

Similar virulence to Anthracis, has different toxins  Exotoxins   Emetic Toxin causes N/V/D 1‐6 hrs after ingestion    Diarrheal Toxin causes a cAMP dependent secretory diarrhea similar to Cholera or ETEC 

Found on food that was cooked and reheated. Think buffet line at a Chinese food restaurant.   The classic presentation is fried rice at a Chinese buffet.  

Gastroenteritis­like symptoms  Self Limiting 

Corynebacterium  Diphtheriae 

Gram (+) Rod  Aerobic  Non‐spore formers  Form “Chinese Letters” on gram stain, V or L shape.   Grow Grey or Black colonies on Tellurite  Loeffler’s Media causes granule formation 

Toxin – inhibits protein synthesis. It is a classic AB toxin that inhibits EF‐2  While it colonizes the naso or oropharynx, it is not invasive 

Throat and nasopharynx, usually transmitted by respiratory droplets.    

Diphtheria – Grey pseudomembrane  that is  on the pharynx. It is well attached and will cause hemorrhage if removed. It is here that necrotic tissue, leukocytes, and the corynebacterium are. If the membrane gets to large, it can cause respiratory obstruction.   Bull Neck – swelling of the neck out 

Elek test will confirm toxin producing strains. In this test, bacteria are streaked across a plate, with a elek strip placed across all streaks. It contains an anti‐toxin that causes precipitation   Antitoxin is top priority to neutralize toxin  Antibiotics will kill bacteria, and stop the toxin production  DPT vaccine 

     

     

     

     

     

     

Page 4: Gram Positive Cocci: Strep and Staph...Bacillus, Corynebacterium, Clostridium, Lactobacillus, Actinomyces, Nocardia, Listeria, Mycobacteria; you know “N” is NOT neisseria because

Organism  Physiology/Structure  Virulence  Epidemiology  Diseases  Diagnosis 

Clostridium Tetani 

Same as other clostridium species, no double zone of hemolysis 

Tetanus Toxin (tetanospasmin)– causes spastic paralysis known as Tetanus.   Classic AB toxin that targets the central nervous system, inhibiting inhibitory neurons by preventing vesicle transport and fusion.   No fusion = no release. No release = disinhibition of skeletal muscles = contraction.   Targets GABA and glycine.  

Found in dirt, soil, or dust.   Common presentation is a penetrating wound (such as a rusty nail).  

Tetanus     Bacteria colonize a local infection, housed in necrotic tissue (anaerobic space).      Secrete exotoxin that travels everywhere, targets the CNS inhibitory neurons.      Symptoms begin with trismus (lockjaw) and risus sardonic us (a smile that cannot be stopped)        Progresses to a spastic paralysis with death resulting from spasm of diaphragm

Antitoxin binds and neutralizes free toxin in circulation  Toxoid (aka the vaccine) conveys long term neutralization of toxin and active immunity. Survival DOES NOT convey immunity.   Give injections at separate sites  Muscle Relaxants (benzos) to alleviate contractions 

Clostridium Botulinum 

Same as other clostridium species, no double zone of hemolysis 

BotulismToxin – causes spastic paralysis known as Botulism.  Classic AB toxin that targets the peripheral nerves, inhibiting NMJ neurons by preventing vesicle transport and fusion.   No fusion = no release. No release = inhibition of skeletal muscles = flaccid.  Targets ACh 

It is also found in dirt, soil, or dust, that can cause the low‐yield wound botulism.  Found in home­canned foods that are not cooked well enough.   Found in honey given to newborns.  

Adult Botulism – food contaminated with botulism is not cooked or prepared well enough. Begins with dipolia and dysphagia, progressing to flaccid paralysis  and death from flaccid diaphragm  Infant Botulism – honey contaminated with botulism in an infant less than one year old. Begins with constipation and feeding problems progressing to floppy baby syndrome.  

Palliative care to provide ventilator support  Antitoxin to alleviate circulating toxin (any toxin in cells has already taken effect).   Penicillin to kill bacteria 

Clostridium Difficle 

Same as other clostridium species, no double zone of hemolysis 

Toxin A = Enterotoxin   Causes inflammation and secretory diarrhea   Toxin B = Cytotoxin    Disrupts protein synthesis and causes disorganization of the cytoskeleton.   

Part of the normal GI Flora.   When on broad­spectrum antibiotics the normal flora is eliminated. This is highly resistant, so then grows in the space left by the previous flora.  

Psuedomembranous Colitis – watery, secretory diarrhea that results from the enterotoxin. Ulcerations can be visualized on endoscopy resulting from Cytotoxin. Cultures will be positive (normal flora), but a tox screen of stool will confirm diagnosis.  

Discontinue antibiotic therapy.   Give oral vancomycin (one of the few drugs it is NOT resistant to). You must give it orally because vancomycin cannot penetrate GI barrier, and the infection is in the GI tract.  

Lactobacillus  Low­yield organism    Know that it maintains the vaginal pH to prevent exogenous infection. When giving broad‐spectrum antibiotics, you can kill lactobacillus, and allow overgrowth of other organisms (like candida) 

   

Page 5: Gram Positive Cocci: Strep and Staph...Bacillus, Corynebacterium, Clostridium, Lactobacillus, Actinomyces, Nocardia, Listeria, Mycobacteria; you know “N” is NOT neisseria because

Actinomyces Israelii 

Facultatively anaerobic/strictly anaerobic  NOT acidfast (contrast to Nocardia)  Grow slowly  Filamentous hyphae  Resemble “grains of sand” ‐> sulfur granules  NOT found on skin 

Colonize URT, GI, female genital tracts Actinomycosis – chronic granulomatous lesions ‐> suppurative and form abscesses   

No person to person spread  Disease from soil or water  Cervicofacial infections ‐> poor oral hygiene; invasive dental procedure  Thoracic infections ‐> Hx of aspiration ‐> spreads to lung‐adjoining tissues  Abdominal infections ‐> GI surgery; trauma to bowel  Pelvic infections ‐> secondary manifestation of abdominal actinomycosis; primary infection of woman with IUD  CNS ‐> hematogenous spread from other tissues

Most cases: Cervico facial ‐> draining sinus tracts along angle of jaw/neck   

Difficult Culturing is slow  Sulfur granules ‐> tin, gram positive, branching rods around periphery 

Nocardia Asteroides 

Gram (+) branching rods.   Partially Acid­Fast  Aerobic 

Ill defined pathogenesis  Reservoir is Soil and Dust, thus there is an exogenous inoculation via trauma or inhalation.    

(Inhalation) Cavitary Broncholpulmonary Nocardosis – often associated with immune compromised patients. Symptoms are fever, cough, diffuse pneumonia with cavitation of the lungs.   Spread via the blood to the brain.   (Traumatic Implantation) Subcutaneous nocardosis – training type of sinus tracts and granules. This is similar to actinomyces only with a traumatic implantation.  

Sulfonamides  

Listeria monocytogenes 

G+ve coccobacili ‐> arranged in pairs resembling enterococci  Faculative anaerobes  Motile at room temp, weakly β‐hemolytic, capable of growth at 4°C and high salt concentration 

Facultative intracellular pathogen that can avoid Ab‐mediated clearance  Virulent Strains produce cell attachment factors (internallins), hemolysins (listeriolysin O, two phospholipase Cs), and a protein that mediates actin‐directed motility (ActA)  “Actin rockets” – cell to cell movement  

Isolated in soil, water, and vegetation  Disease assoc. with consumption of contaminated food products (unpasteurized milk)  Transplacental spread from mother to neonate (vaginal transmission)  HIGH RISK: Young, elderly, Pregnant, pts with defective cellular immunity 

Neonatal Disease ­ Amnionitis: 1. Early onset disease: 

“granulomatosis infantiseptica” ‐> disseminated ascesses and granulomas in multiple organs 

2. Late onset disease: acquired at or shortly after birth.  Presents as meningitis or meningoencephalitis w/ septicemia 

 Healthy Adults: Influenza like (with or without gastroenteritis)  Pregnant women/cell­mediated immune defects: Primary bacteremia or disseminated disease (hypotension and meningitis)  

Microscopy ‐> insensitive  Culture 2‐3 days or cold enrichment 

Page 6: Gram Positive Cocci: Strep and Staph...Bacillus, Corynebacterium, Clostridium, Lactobacillus, Actinomyces, Nocardia, Listeria, Mycobacteria; you know “N” is NOT neisseria because

Mycobacteria Tuberculosis 

Gram (+) Weakly  Obligate Aerobes  Acid­Fast – cell wall has a lot of lipid in it, which makes it poorly gram staining  Facultatively Intracellular (causes granuloma) 

Cord Factor – serpentine growth in  culture and inhibits PMN migration. It is the mycolic acid  Mycolic Acid – TB is made of primarily fat in its cell wall. The fat happens to be mycolic acid.   Peptidoglycan Layer  ‐ it is partially gram + and this is because of its peptidoglycan layer beneath its fatty cell wall  Tuberculin – protein secreted used to do the PPD test.   Sulfatides – glycolipids in cell wall that inhibit phagolysomal fusion, increasing longevity in macrophages  Reactive O2 and N2 species survives the oxidative burst 

Humans are the only known reservoir. Aerosolized particles are released by an infected patient only in the active form of TB. Therefore, most infections are generally reinfections.  Requires a large infectious dose over a prolonged exposure  PPD Test: assess exposure to TB by giving the protein Tuberculin in a Subdermal injection. It is a Type IV hypersensitivity   High risk: (AIDS)>5mm   Moderate Risk (health care worker  / inmate / regular exposure) >10mm   Low Risk: (general population) >15mm 

TB – there is no exotoxin, there is no endotoxin, the damage that TB does is the damage the immune system causes in an attempt to get rid of the disease. Macrophages wall it off in a granuloma.  Primary TB – recent exposure, currently active, transmittable, growing in macrophage Active TB – Lung Disease, X‐ray Changes, Liquefactive Granulomas (with hemoptysis) Latent TB – Non contagious, calcified granulomas. When immunocompromised it will revert to Primary TB.  Reactivation – Latent to Active.  These are a type 1 immune response mediated by Th1 cells (compare to leprosy) 

Sensitive to UV Light  Auramine­Rhodamine is a rapid test to see if there are mycobacteria. This stain turns TB bright apple green.   BCG vaccine is a live attenuated vaccine given in third world countries that protect against systemic TB, not so much the Pulmonary TB.   Treated with a combination of Isoniazid and Rifampin.  Caution when treating RA patients with TNF‐α antagonists; TNF‐α keeps the TB contained.  

Mycobacteria Leprae 

Obligate Intracellular   Grows only at cooler temperature (which is why it effects the skin and not the internal organs)  Slowest Growing Bacteria (doubling time of 2 weeks) 

None listed in Class nor Kaplan   Armadillos have Leprae.   Humans are the usual reservoir, which requires significantly prolonged exposure.  The lapromin test is the analogous test to the tuberculin test (PPD) of tuberculosis. It will be positive only for the tuberculoid leprosy because it shows an active immune response.  

Tuberculoid Leprosy – strong immune system. This is a Th1 response. It contains the disease by forming granulomas in the nervous tissue. It causes patches of anesthesia as the immune system walls of the leprae in the nerves.   Lepromatous Leprosy – weak immune system. This is a Th2 response and is a wild dissemination. There will be nodular skin lesions with multiple organ involvement. This causes the “lion‐like” facial lesions that are associated with the severe form.  

Dapsone and Rifampin that has to be taken over 2 years to eliminate the disease.   Close household contacts will receive prohphylactic Dapsone.  Isolation is not required (leper colonies are archaic) 

           

 

 

Page 7: Gram Positive Cocci: Strep and Staph...Bacillus, Corynebacterium, Clostridium, Lactobacillus, Actinomyces, Nocardia, Listeria, Mycobacteria; you know “N” is NOT neisseria because

Gram Negative Cocci: Neisseria and Moraxella   

Organism  Physiology/Structure  Virulence  Epidemiology  Diseases  Diagnosis Neisseria Meningitidis 

Gram (­) Cocci  Diplococci with flattened sides  Oxidase (+)   Glu +, Maltose+  Facultative Intrallecular  Found in respiratory tract and causes meningitis 

Capsule – 5 different serotypes of capsule. B is the most common found in the US. It is NOT covered in the vaccine, but all others are.   IgA Protease – helps colonize the respiratory epithelium  Endotoxin = LPS  Pili for attachment   

Found in the human nasopharynx. About 5‐10% are carriers of the organism.   Usually transmitted through respiratory droplets that colonizes the pharynx and spreads to the menignese.   College Dorms, Military Recruits other close quarters 

Adult Meningitis Begins with a Stiff Neck, Photophobia  Petechial Rash. Once the rash starts, the patient declines rapidly.  Fulminant cases develop bruising, DIC, and death. This can happen in hours.     

Formerly Penicillin (which may still work).   Currently use doxycyline or cirpofloxain.  Vaccine is available that is a the polysaccharide capsular vaccine covering all types not B.  

Neiserria Gonorrhea  High‐Yield image is a gram stain of exudate from someone with gonnorhea with the gram negative diplococci INSIDE the PMNs 

Gram (­) Cocci  Diplococci with flattened sides  Oxidase (+)  Glu+ Maltose­  Facultative Intracellular  Found in the urogenital tract and causes gonorrhea  

No Capsule  Antigenic Variation – changes its antigen to avoid detection  Outer Membrane Proteins (OMP)   OMP 1 = Por Protein that decreases phagolysosome fusion in PMNs and increases transcytosis   OMP 2 = Opa = adhesion molecule  IgA Protease  ‐ evades mucosal epithelium defenses.   Pili  ‐ increase adhesion 

Human genital tract and is transmitted as an STD or to a child in birth.  

Gonorrhea  ‐ Males = urethritis and proctitis. 

Purulent yellow discharge with painful urination.  

‐ Females = variable symptoms including Pelvic Inflammatory Disease, Salpingitis, and Intramenstrual Bleeding. It may go unnoticed, and females are often the carriers 

‐ Infants  ‐ opthalmia and blindness if untreated 

Beta‐Lactamases are abundant, so we now use cephalosporins.   There is a special agar called Thayer­Martin Agar that is a chocolate agar + antibiotics that grows only gonorrhea 

Moraxella Catarrhalis  Previous low‐yield organism, that has been coming up on the boards 

Gram (­) Cocci  Diplococcus  

  Normal flora of the upper respiratory tract  Transmited through the respiratory droplets 

Otitis Media – strep pneumo is the most common cause, but Moraxella can cause ear aches  Sinusitis – same thing as Otitis Media  Bronchitis – especially in the older population 

Augementin or third generation cephalosporing 

 

 

 

 

 

 

Page 8: Gram Positive Cocci: Strep and Staph...Bacillus, Corynebacterium, Clostridium, Lactobacillus, Actinomyces, Nocardia, Listeria, Mycobacteria; you know “N” is NOT neisseria because

Gram Negative Rods – all gram negative bacteria have LPS, the endotoxin, which poses a risk of sepsis, shock, and death 

Organism  Physiology/Structure  Virulence  Epidemiology  Diseases  Diagnosis  Tx Yersinia Pestis  Gram (­) Rod  

 Bipolar Staining, they look like a safety pin or a dumbbell. There is staining at either end, but clear in the middle.   Facultative Intracellular – produces granulomas  

Coagulase (+)  F1 Antigen can inhibit phagocytosis  Type III Secretion System – molecular syringe that allows for toxins to be injected into host cell.  

Cause of the plague, the black death.  Common in the desert southwest.   Transmitted by the bite of a flea or by human‐human contact via respiratory droplets 

Pneumonic Plague =septic pulmonary embolus from the bubonic plague, or inhalation. This is highly contagious, highly fatal, and is a target of bioterrorism   Cutaneous = Bubonic Plaque = Black Death. This is from the flea bites that generate the axillary bubos and conjunctivitis. Its called the Black death because you get DIC and the extremities, without an adequate blood supply, necrose, turn black, and fall off.  

Aminoglycosides  Control the animals, the vector (the rats). Killing rodents is a bad idea, the fleas will all go to humans! 

Enterobacteriaciae family 

Gram (‐) Rods Catalase (+) Fermenters – at least Glu+ 

Endotoxin – all gram negative bacteria possess LPS or LOS.   Antigens:  O = Cell Wall  K = Kapsular  H = Flagella 

     

Escherlichia Coli (E.Coli) 

Same As Enterobacteriaciae family. 

Pili – attach and establish infection in the mucosa of the GI tract or the urinary tract.   Capsule ‐  

Normal flora of the human Gut.   There can be an engodenous displacement from the GI (such as in UTI) or can be exogenous (such as fecal oral)   

Most common cause of UTI.   Neonatal meningitis. This is the second most common cause of neonatal meningitides after Strep Agalactiae. K1 serotype implicated.   

Fluroquinolone  Third generation cephalosporin  

ETEC Enterotoxigenic E. Coli   

Same As Enterobacteriaciae family. 

Enterotoxins they are cyclic‐something inducers. One is cAMP, the other is cGMP. Regardless of the mechanism, they both cause watery diarrhea.      Heat Labile Toxin– (LT) causes ADP‐Ribosylation of Gαs that stimulates AC   cAMP   Heat Stabile Toxin– (ST) causes ADP‐Ribosylation of Guanine Cyclase increasing cGMP.  

Same as E. Coli  

Montezuma’s Revenge. ETEC causes Travler’s Diarrhea. This is a watery diarrhea because it is noninvasive.  

Usually Self Limiting. Replace fluids either IV or Oral.  

EHEC EnteroHemorrhagic  E. Coli  

Same As Enterobacteriaciae family.  Know the O157:H7 serotype is the most implicated.   Non­Sorbitol fermenter (most E.Coli are sorbitol 

Shigga­Like Toxin – a classic AB toxin that causes ADP­Robsylation of the 60s ribosome reducing affinity for EF­1. Called verotoxin. 

Same as E.Coli, but can also be from bovine feces or unpasteurized milk.   EHEC can be remembered as Hamburger (the Jack‐in‐the‐Box E. Coli outbreak).  

Dysentery. EHEC causes Hemorrhagic diarrhea. This is an exception to the rule. Normally bloody diarrhea means invasive organisms. This is non invasive. Therefore, there will be (+) Blood (­) Pus.   Hemolytic Uremic Syndrome (HUS). A sequella of EHEC is renal failure. 

DO NOT GIVE ANTIBIOTICS. Death of EHEC will release its toxin and LPS that increases the risk of HUS.  

Page 9: Gram Positive Cocci: Strep and Staph...Bacillus, Corynebacterium, Clostridium, Lactobacillus, Actinomyces, Nocardia, Listeria, Mycobacteria; you know “N” is NOT neisseria because

fermenter) EIEC & EPEC  Low‐yield without detail  They are in here to make you aware that it exists. Don’t know them for Tulane exams. Salmonella Enteriticus  

Gram (‐) Rods  Motile (like a salmon)  Lac –  Facultative Intracellular  

Acid Tolerance Response  Pili  LPS 

Does have an animal reservoir. Found on eggs, poultry, reptiles, including reptile feces.   This is the undercooked chicken disease  

Salmonellosis = Gastroenteritis potentially causes bloody diarrhea (it is invasive), but usually causes a watery diarrhea. Causes diarrhea by an increase in cAMP as a result of inflammation NOT a result of exotoxin.  Osteomyletis – most common cause of osteomyletis in those with sickle cell. Without sickle cell, the most common cause is Staph Aureus.  

Invasive disease fluroquinolone 

Salmonella Typhi  Gram (‐) Rods  Motile (like a salmon)  Lac –   Facultative Intracellular  

Acid Tolerance Response Gene. Decreases in pH cause the gene to turn on, increasing defense, decreasing virulence (it survives in, but does not infect, the stomach). Increases in pH cause the gene to turn off, decreasing defense, increasing virulence (it colonizes the intestines). This is also how it lives within the lysosome.   Vi Antigen (Typhi only). It is the Kapsular antigen, but given a special name in salmonella. Withstands phagocytosis and complement destruction.  Adhesins/Pili allow adhesion to the mucosal epithelium 

Has no animal reservoir, thus vaccines are available.  Humans have it in their GI tract, or survivors of Typhoid Fever contain it within  

Typhoid Fever – typhoid = typhus‐like. Organism is ingested with infection in the ileocecal region. This causes constipation. Travel + Constipation = Typhoid.   M cells take up the cells via phagocytosis. It is presented to macrophages where it survives within the phagolysosome. The macrophage transports it to lymph nodes and to the spleen, where it enters circulation.   It can reenter the GI tract through the Gall Bladder, where it can take up permanent infection and create a carrier state.  Systemic infections cause rose­pedal lesions which are pinpoint erythmatous lesions on the trunk or abdomen.  Septecemia is possible.  

If it is only local in the GI tract, don’t treat it.   If they go systemic, use Beta‐Lactams and Fluorquinolones.   There are vaccines available ‐ ViCPS = capsular vaccine, 

administered parenterally ‐ Ty2a1 = attenuated bacteria 

ingested many times to develop adequate resistance 

‐ Either are given to people traveling to endemic areas.  

Shigella  Gram (­) Rods  Nonmotile  No H2S  

Non‐Lactose Fermenters Facultative Intracellular 

Shigga Toxin – Classic AB toxin. ADP‐Ribosylates the 60s ribosome reducing the affinity for EF‐1  Invades M cells by phagocytosis, then migrates into neighboring cells intracellularly. It can also live within the macrophage by escaping the phagolysosome. When the macrophage finally lyses, shigella is able to get into epithelial cells via the basal surface  Hugely pathogenic, incredibly low infectious dose (1‐10 organisms) 

Shigella Soneii is the most common in US and is the least virulent.   Shigella Dysenteriae is the worst of the shigellas, but is uncommon in the US There are no animal carriers. The human colon is the only reservoir. Transmission is fecal‐oral, such as at day care 

Dysentery – aptly named Dysenteriae. Causes a bloody diarrhea. It is invasive and kills cells leading to the blood. The inflammation response causes the malabsorption and diarrhea.   Can lead to Hemolytic Uremic Syndrome, which is normally associated with EHEC. However, since the toxins are so similar, the possibility for HUS is present. 

Usually self‐limiting.   Antibiotics can be used, but multiple drug resistances make it challenging to eradicate.  

Klebsiella Pneumoniae 

Gram (­) rod, part of the enterobacteriacae 

Capsule – antiphagocytic and antigenic.  

Found in colon and upper respiratory tract.  

Number one cause of aspiration pneumonia  in alcoholics.  

Fluroquinilone or  

Page 10: Gram Positive Cocci: Strep and Staph...Bacillus, Corynebacterium, Clostridium, Lactobacillus, Actinomyces, Nocardia, Listeria, Mycobacteria; you know “N” is NOT neisseria because

 In culture will have a halo around cells, because of their capsule.   Lac+ 

 Endotoxin –LPS from it being Gram (‐)   

 Usually an endogenous transmission 

 Community acquired pneumonia. Common cause of community acquired. Strep Pneumo is the most common cause, but Klebsiella is still right there. Use the gram stain to separate.   Causes a thick like jelly, red sputum without a pungent odor (such as in the case of a aspiration pneumonia).  

Third generation Cephalosporin 

Pasturella Multocida  think CATS and CAT BITES 

Small Gram (­) Rods    Facultative Intracellular  facultative Anaerobe 

  Reservoir is the mouths of cats, transmitted from bites or licks. Don’t confuse this with Cat‐Scratch fever, which is caused by a scratch, not a lick or a bite like Pasturella 

Rapidly Spreading Cellulitis from the site of the lick or bite, there will be a cellulitis that will spread within hours.  

Amoxyclin and Augmentin  Because it is so rapid spreading, they give an IM injection of antibiotics.  

Bordetella Pertussis  Small gram (­) rod  Nonmitile  Strictly Aerobic  Grow Singly or in pairs  Encapsulated  Requires a long growth period on a special agar, called the  Bordet­Gengou   Bordet = Bordetella 

Pertussis Toxin – classic AB toxin that targets the ciliary cells. It is a cAMP toxin, causing edema and fluid. This causes increase in histamine sensitivity, leukocytosis and an increase in insulin, leading to hypoglycemia.   Dermonecrotic Toxin  Adenylate Cyclase Toxin – secreted AC that is taken up   Tracheal Cytotoxin  Filamentous Hemagglutin  Endotoxin 

Colonizes the respiratory epithelium and cab be spread via respiratory droplets (the coughing, sneezing, and hand‐to‐hand contact) 

Whooping Cough – comes in 3 phases after a week of incubation.  ‐ Catarrhal Stage – the highly 

infectious stage with nonspecific symptoms such as low grade fever, malaise, rhinitis. Weeks 2‐3 

‐ Paroxysmal Stage – this is the noninfectious, but stereotypical phase. This stage has frequent bouts that come and go (paroxysmal) of severe fits of coughing followed by a strong inspiration against a narrowed glottis causing the “whoop.” They can become cyanotic or vomit.  Weeks 3‐6 

‐ Convalescence Stage – the disease dies out, with lessening paroxysmal stage symptoms. Weeks 6‐on 

Erythromycin is drug of choice to give to household contacts and those in the catarrhal phase.   Isolate the catarrhal and early paroxysmal phases  Vaccinate with the DPT vaccine.  

Vibrio Cholera  Curved, Gram (­) Rod with polar flagella  Oxidase (+)  Grow on Alkaline but not Acidic   Motile 

Pilus – the Tcp Pilus allows for adhesion to mucosal epithelium  Flagella – makes it motile  Toxin – cholera toxin is a classic AB toxin. It activates Gαs  via ADP‐Ribosylation. It causes cAMP increases that leads to tremendous fluid extrusion 

The reservoir for cholera is the human colon. It is transmitted fecal‐oral, but often by contaminated water.  It requires a very high infectious dose.    El Tor strain causes epidemics  The classic strain has not been so bad 

Cholera – excessive diarrhea up to 20L/day. Causes rice water stools, looking white/clear like water while cooking rice.  

Treat with fluid and electrolyte replacement, both oral and IV.     Prevent cholera by boiling water and vegetables, cooking  your food 

Page 11: Gram Positive Cocci: Strep and Staph...Bacillus, Corynebacterium, Clostridium, Lactobacillus, Actinomyces, Nocardia, Listeria, Mycobacteria; you know “N” is NOT neisseria because

Helicobacter Pylori  Gram (­) curved rod with a Single polar flagella (sounds like Cholera)   Only organism that can grow and replicate in the stomach 

Urease converts urea and acid into bicarbonate and ammonia, which neutralizes the acid, allowing it to live in the stomach  Adhesins allow colonization and prevent dislodgement from gastric mucosa 

 Mucinase degrades the mucin protective barrier   Vacuolating Cytotoxin induces vacuoles in human cells.   Cytoxin Associated Gene encodes another cytotoxin. These HP are more virulent  

Humans are the only known reservoir and it is thought that it is transmitable fecal to oral or oral to oral.   The mode of transmission has not yet been established, despite its prominence in GI disease. 

Gastric/Duodenal Ulcer – the urease and mucinase degrades the protective lining of the stomach, allowing acid to reach the mucosal surface.   In addition, the cytotoxins cause autolysis of macrophages and neutrophils inducing a strong inflammatory reaction, also contributing to the disease.  Can lead to cancer. Either the reactive oxygen species damaging DNA post lysis and inflammation or through viral infection  of the epithelium from the compromised barrier, gastric tumors may result.   This is a Type 1 Carcinogenic Agent, a highly board relevant point. 

Serology can detect antibodies, but will only tell you if there ever was an infection.   Golden standard is the biopsy with culture.   Use the Urea Breath Test to determine if someone has HP. You feed the patient radioactive urea, and, if there is HP, they will expire radioactive CO2 (converted from the bicarb the HP made)  Endoscopy can be made to identify gastric ulcers.   Treat the ulcers with Proton Pump Inhibitors treating the symptoms.   Treat the bug with Amoxicillin + Clarithromycin 

Proteus Mirabillis and Vulgaris  Mirabillis = 90% of infection 

Small Gram (‐) Rods that are part of the enterobacteriacae family  Swarming Motility from its peritrichous flagella  Urease +  Nonlactose­Fermenting 

Extreme Motility   Urease  Endotoxin LPS from gram (‐) 

Pretty much ubiquitous in the environment and within the normal flora of the GI tract.   Most cases in humans are endogenous.    

UTI if there is a UTI via proteus (E Coli most common), there is an increased risk of kidney stones by reducing the pH of the urine.  

Fluroquinilone   Treat kidney stones with pain meds (for passing) or sonic disruption to remove stones.  

Legionella  Slender, pleomorphic,  G‐ve rods  Stains poorly w/common reagents – Use Silver Stain  Nutritionally fastidious ‐> L­cysteine and enhanced growth with iron salts  Non fermentative   

Capable of replication in ALVEOLAR MACROPHAGES (and amoebae in nature)  Prevents phagolysosome fusion 

Sporadic, epidemic, nosocomial infections  Aerosol Transmission (Air conditioning units, but no person to person)  Commonly found in natural bodies of water (rivers and streams)  Estimated btw 10k to 20k cases in US annually  High risk: compromised pulmonary function, pts with decreased cellular immunity (transplant) 

1. Legionnaires’ disease (legionellosis) incubation period of 2‐10 days systemic signs of acute illness appear abrupt Multiorgan disease (GI, CNS, liver, Kidneys) Primary manifestation – pneumonia (severe)  2. Pontiac fever  Self limiting, febrile illness Fevers, chills, myalgia, malaise, headache Symptoms develop over 12 hrs, last 2‐5 days  

Microscopy: insensitive DFA – fluorescence  Culture: Buffered charcoal yeast extract (BCYE) and Fe+Cys  Antigen tests: sensitive for L. pneumophila serogroup 1  Seroconversion: must be demonstrated ‐> 6 mo. To develop  PCR: Sensitivity and specificity approaching culture 

Page 12: Gram Positive Cocci: Strep and Staph...Bacillus, Corynebacterium, Clostridium, Lactobacillus, Actinomyces, Nocardia, Listeria, Mycobacteria; you know “N” is NOT neisseria because

Chlamydia  Gram (­) Rods  Obligate Intracellular Bacteria  Energy parasites  Really small, obligate intracellular = cannot see on a gram stain  

Reticulate Body vs Elementary Bodies  Elementary bodies are the metabolically inactive form that infects cells.   Reticulate bodies are the metabolically active form within infected cells.  

     

Chlamydia Trachomatis 

Gram (‐) rod  Obligate Intracellular (granuloma formation) 

  Reservoir is the genitalia and the eyes. It is can be transmitted via sexual intercourse, hand‐to‐face, or even via flies.  

Sexual Transmitted Diseases. Most common bacterial STD in the US. Urethritis, cervicitis, and damage to the fallopian tubes. This causes sterility. Serotypes D‐K  Lymphogranuloma Venereum – begins with L, so do the seroptypes. Not common in the US, but in developing countries. It is an STD that causes swollen lymph nodes that eventually results in blockage of lymph drainage and genitle elephantiasis.   Trachoma  ‐ Serotypes A‐C. Results in conjunctival scarring and blindness. It is the most common cause of preventable blindness.  

Doxycyline to treat disease  Erythromycin can be given prophylatically.  

Primary: Newer macrolides or fluoroquinolones  ie. Azithromycin, clarithromycin or ciprofloxacin, levoloxacin  Decreased environmental exposure to reduce risk of disease  Water: treat with hyperchlorination, superheating, copper‐silver ionization  Decontaminate air conditioning units.  

Chlamydia Pneumo             Treponema pallidum 

Gram (­) Spirochete  Really had to find on a gram stain.   Obligate Pathogen (we cannot culture it). It is NOT an obligate intracellular pathogen.    

  Human genital tract is the reservoir. It is a sexually transmitted disease that can be passed to the fetus. 

Syphillus – has 3 stages (1) Primary – non­tender chancer. There 

is no pain, the lesion is there, after a few weeks goes away. If you biopsy the lesion you could see the treponema. Serologic tests will stay negative.   

(2) Secondary – maculopapulo copper colored rash that is diffuse that includes palms and soles, with patchy alopecia. This rash is capable of transmitting disease. Condylamata looks like HPV with warts growing in the perianal region. Serology comes back positive. 

(3) Tertiary  ‐ syphilitic granunlomas (aortictitus, Tabes Dorsalis, and altered 

Two types of tests to do to diagnosis: (1) Screening: crossacting antibodies to cardiolipin. nonspecific, cardiolipin, VDRL (caution SLE which may yield false negative)  (2) Specific : immunofluorescence FTA­ABS     Penicillin is the treatment. Even if allergic, the treatment is penicillin.  

Page 13: Gram Positive Cocci: Strep and Staph...Bacillus, Corynebacterium, Clostridium, Lactobacillus, Actinomyces, Nocardia, Listeria, Mycobacteria; you know “N” is NOT neisseria because

mental states).   

Borrelia Burgdorferi 

Gram (­) Spirochete  It is invasive, and will infect the heart, joint, and CNS.  

Nymphs (on mice) and Ticks (on deer).   We usually here about this disease with deer ticks from Lyme CT. Ixodes is the genus of tick that spreads the organism. 

Lyme Disease –  This is the number 1 vector‐borne disease. You get a bulls­eye rash at the bite site. It starts out with flu‐like symptoms with swollen lymph.   Once the organism disseminates, then you see nerve effects (such as bell’s palsy).   Migratory Arthralgia develops from Type III hypersentivity reactions depositing into the joints.   Cardiac Arrythmias may result from the disease as well.  

Serology diagnoses the problem via ELISA or PCR.   Treatment is doxycycline  

 

Leptospira interrogans  Low yield Spirochete 

Gram (­) Spirochete, with little hooks at the end 

Unknown pathogenesis  Zoonotic disease with transmission through water contaminated with animal urine. You will see this in patients who jet ski or who work in sewers.  

Swineherd’s Disease or Mud Fever – gastrointestinal symptoms + flu‐like symptoms that may progress to hepatic or liver failure.  

 

Rickettsia           Rickettsia Ricketsii  Energy parasite. They need 

your ATP, and are an obligate intracellular parasite with leaky epithelium  Very tiny, so you wouldn’t see them on a gram stain, even though they are considered Gram (­) rods 

Invade the vascular endothelial cells causing vasculitis and permitting them to move through the blood strea, 

Reservoir is ticks. The vector is a tick bite.   Requires a long feeding time in order to transmit the bacteria. The bacteria may be passed to progeny.  

Rocky Mountain Spotted Fever. Rash is critical for the diagnosis. When not present, the disease is usually missed until too late, as this disease is rapidly fatal.   Confusion, N/V/D + headache. It looks like meningitis, but then the rash comes on. The rash is a maculopapular that turns petechial that starts on the hands and feet and moves to the trunk. Includes palms and soles 

Start treatment without confirmation from serological indirect antibody test.   Weil‐Felix is an old test, that might creep on the boards. 

Doxyclcine and protection against the vector. 

Rickettsia Prowazekii  Considered low yield for Boards 

Same as Ricketsii      Endemic Typhus     

Rickettsia Typhi  Considered low yield for Boards 

Same as Ricketsii           

Haemophilus (and related bacteria) 

Small, pleomorphic, G­ve rods or coccobacili  Facultative anaerobes, fermentative  Most species require X  (heme) and/or V (NAD) factor for growth  H. influenzae subdivided serologically (a to f), biochemically (biotypes I to 

H. influenze type b is clinically most virulent (PRP – polyribitol phosphate – in capsule)  PRP – ribose, ribitol, phosphate  Haemophilus adhere to host cells via pili and non‐pilus structures  IgA Protease 

Noncapsular Haemophilis commonly colonized in humans; encapsulated Haemophilis (H. influenze type b) UNCOMMON members of normal flora  Disease caused by H. influenze type b was primary a pediatric problem ‐> eliminated in immunized populations  

Haemophilis influenzae Meningitis: unimmunized children ‐> fever, severe headache, systemic signs Epiglottitis: unimmunized children ‐> initial pharyngitis, fever, difficulty breathing, progresses to cellulitis and swelling of supraglottic tissues ‐> obstruction of airway Pneumonia: inflammation and consolidation of lungs observed primarily in the ELDERLY with underlying chronic pulmonary disease; typically caused by nontypeable strains  Haemophilus ducreyi 

Microscopy – sensitive test in CSF, synovial fluid, lower respiratory specimens  Culture ‐> chocolate agar  Antigen tests‐> less useful for H. influenzae type b infections 

 

Page 14: Gram Positive Cocci: Strep and Staph...Bacillus, Corynebacterium, Clostridium, Lactobacillus, Actinomyces, Nocardia, Listeria, Mycobacteria; you know “N” is NOT neisseria because

VIII), and clinically (biogroup aegypticus)  Satellite Phenomena – you can grow Haemophilus next to staph because it is beta‐hemolytic and releases the heme and NAD into the medium on a blood agar.  

  H. ducreyi disease is uncommon in the US  With the exception of H. ducreyi, which is spread by sexual contact, most Haemophilus infections are cased by pts bacterial flora (endogenous infections) 

Chancroid: STD ‐> tender papule with an erythematous base ‐> progresses to painful ulceration and lympathadenopathy. This is a distractor with Syphilis (treponema) because they are both spirochetes, and both cause a chancer. Yoyu “do cry with ducreyi” meaning that it is a painful chancer.    

following vaccine   

Bacteroides Fragilis  Gram (­) Rod  Reduced Endotoxin  Capsule 

Normal part of the GI flora. Traumatic displacement (surgery) can permit movement into other compartments.  

Sepsis: weak, because the endotoxin is modified.  Peritonitis: This isn’t terribly high yield, but man you don’t want this kind of peritonitis. It will cause massive necrosis of the peritoneum and the intrabdominal contents  

   

Francisella Tularensis   (potentially low­yield accept it is a Bioterror agent) 

Zoonotic  Small Gram (­) Rod  Facultative Intracellular pathogens (cause granulomas) 

  Tick bite (the ulcero‐glandular form)  Associated with hunting and skinning Wabbits. This can cause a traumatic implanation or inhalation while you shred its flesh everywhere.   If you eat the rabbit without cooking it well, you could ingest it as well 

Tuleremia:  Ulcer at bite site and regional lymph swelling from tick. Traumatic Implantation from wabbit skinning can cause it as well.   If you inhale it or eat it, you will develop tularemia in the GI tract.  

Live Attenuated Vaccine   

broad‐spectrum cephalosporins, azithromycin, or fluoroquinolones  Many strains are resistant to ampicillin  Active immunization with conjugated PRP vaccines prevents most H. influenzae type b infections  Rifampin prophylaxis ‐> children at high risk for disease 

Brucella (potentially low­yield accept it is a Bioterror agent) 

Zoonotic  Small Gram (­) Rod  Facultative Intracellular pathogens (cause granulomas) 

Endotoxin – LPS in gram (‐)   

Passes readily between animals and humans. Usually contained in domestic livestock (large animal veterinarians)   Species depends on the animal it infects.   Abrotus = cattle Sewis = pigs Malatensis = goats 

Brucellosis – undulant fever because it goes up and down. They are flu‐like symptoms with profuse sweating.    

Serum Agglutination test is pretty much all you can do.   Rifampin & Doxycycline for 6 weeks (facultative intracellular are tough)  We can vaccinate cattle or high risk individuals.   Pasturization helps spread.  

 

Page 15: Gram Positive Cocci: Strep and Staph...Bacillus, Corynebacterium, Clostridium, Lactobacillus, Actinomyces, Nocardia, Listeria, Mycobacteria; you know “N” is NOT neisseria because

Gram Positive Cocci ‐ Staph = Aureus, Epidermis, ‐ Strep = Pyogenes, Agalactiae, Mutans (Viridans group), Pneumonia, Enterococcus  Gram Negative Cocci “Never mind about Moraxella” NM, The N and M that aren’t in the Ram Positive Rods.  ‐ Neisseria = Gonorrhea, Meningitidis ‐ Moraxella = Catarrhalis 

  Gram Positive Rods “BCC: LAN, LM”, “Send an email (BCC) over the network (LAN) to Lincoln Martin (LM)” ‐ Bacillus = Anthracis, Cereus        B of BCC ‐ Corynebacterium = Diphtheriae        C of BCC ‐ Clostridium = Tetani, Botulinum, Perfringes, Difficile   C of BCC ‐ Lactobacillus = Lactobacillus        La of LAN ‐ Actinomyces = Israelii          A of LAN ‐ Nocardia = Nocardia          N of LAN ‐ Listeria = Monocytogenes        Li of Lincoln, also think “listserv” ‐ Mycobacteria = Tuberculosis, Leprae      M of Martin     Gram Negative Rods   Everything else. Yep, that’s right. Everything. I hate memorizing lists (like all bacteria above), so here some categorizations to help you keep the bugs straight  

          

Respiratory Zoontic Opportunistic

Non‐Enteric Gram Negative Rods 

Haemophilus Influenzae Legionella Pneumophilia Bordetella Pertussis 

Francisella TularensisPasturella Multocida Brucella Spp. Yersinia Pestis Rickettsia Rickettsii Rickettsia Prowazekki Coxiella Bartonella 

Pseudomonas AeruginosaKlebsiella Pneumoniae 

Toxin Secreting 

cAMP 

Vibrio Cholera ETEC Bacillus Anthracis Bordertella Pertussis 

Protein Synthesis Inhibition 

Neurotoxins

Corynebacterium       Diphtheria EHEC Pseudomonas  Shigella 

Clostridium TetaniiClostridium Botulinum  

Page 16: Gram Positive Cocci: Strep and Staph...Bacillus, Corynebacterium, Clostridium, Lactobacillus, Actinomyces, Nocardia, Listeria, Mycobacteria; you know “N” is NOT neisseria because

 Enterobacteriaciae  

 Nonlactose Fermenters “ShYPS”          Lactose Fermenters – “CEEK” Shigella                Citrobacter – Tulane doesn’t discuss it Yersinia                Escherichia – E Coli Proteus                Enterobacter Salmonella              Klebsiella   Spore Formers “Start off the Gram Positive Rods” Bacillus Clostridium  Capsules: “Some Killers Have Pretty Nice Capsules” S – S. Pyogenes K – Klebsiella Pneumoniae H – Haemophilus Influenza P – Pseudomonas Aeruginosa N – Neisseria (Meningiditis only) C – Cryptococcus (fungus)   

Motile, H2S producing 

Non motile, non H2S producing 

Urease PositiveKlebsiella Pneumoniae Helicobacter Pylori Proteus  

Page 17: Gram Positive Cocci: Strep and Staph...Bacillus, Corynebacterium, Clostridium, Lactobacillus, Actinomyces, Nocardia, Listeria, Mycobacteria; you know “N” is NOT neisseria because

Toxins 

 

Intracellular Growth 

Facultative      Obligate Listeria Monocytogenes    Mycobacteria Leprae Salmonella Genus    Rickettsia Rickettsii Shigella Genus      Coxiella Burnetti Mycobacteria TB     Erlichia Brucella Genus      Chlamydia Species Bartonella  

 

The “ABCs” of Anaerobic bacteria  A – Actinomyces (gram +) B – Bacteroides C – Clostridium  (gram +) 

Acid Fast Bacteria Mycobacteria (TB and Leprosy) Nocardia  

Page 18: Gram Positive Cocci: Strep and Staph...Bacillus, Corynebacterium, Clostridium, Lactobacillus, Actinomyces, Nocardia, Listeria, Mycobacteria; you know “N” is NOT neisseria because