• Unidad taxonómica básica

• Cepa: población de organismos que desciende de un único organismo

• Grupo de cepas que tiene un alto grado de similitud en sus propiedades y que difieren en forma significativa de otros grupos de cepas

ESPECI

E

Ernst Mayr (1940)

Clasificación estructura los organismos en grupos (taxones) en base

a su similitud

Nomenclatura

asigna nombres a los taxones

Identificación determina a que taxones pertenece un organismo que

se aisla

TAXONOMÍA

del griego ταξις, taxis, "ordenamiento", y νομος, nomos, "norma" o "regla

Haeckel (1894) Tres reinos

Protista

Plantae

Animalia

Whittaker (1969) Cinco reinos

Protista Monera

Protista

Fungi

Plantae

Animalia

Woese (1977)seis reinos

Woese (1990)

Tres dominios

Eubacteria

Archeabacteria

Protista

Fungi

Plantae

Animalia

Bacteria

Archea

Eukarya

Una comparación de los sistemas de clasificación

• Dominio– Actualmente

considerado el nivel taxonómico más alto (super-reinos).

– 3 dominos: Bacteria, Archaea, Eukarya

Sistema de Woese (1990)

Taxonomía Actual

Clasificación de los microorganismos

Acelulares

Procariotes

Dominio Archaea

Dominio Bacteria

Eucariote

Dominio EukaryaT4 de E. coli FH de hiperhalóilas Mosaico del tabaco Virus del Edola

Bacteria Arqueas Plantas Animal

Viriones Priones

Virus

Bacteria Animal Hombre

Virioides PSTV cepas 263K Creutzfeldt-Jacob

Taxones: (unidad taxonómica , grupo de organismos con caracteriticas comunes)

importancia en estudios clínicos y ecológicos

Rangos taxonómicos en clasificación bacteriana

Taxones

Dominio

Phylum

Clase

Orden

Familia

Género

Especie

Sub-especie

Dominio Phylum Clase Orden Familia Genero Especie

Bacteria Proteobacteria Gamma Proteobacteria Zymobacteria Enterobacteriales Enterobacteriaceae Escherichia Escherichia coliEscherichia coli

• Serovariedad o serotipo (antígenos distintos)

• Fagovariedad (tipificación por fagos)

• Biovariedad (diferencias bioquímicas y fisiológicas)

• Patovariedad (patogenicidad)

• Morfovariedad (diferencias morfológicas)

• Genomovariedad (grupos con ADN similares)

Categorías de clasificación a nivel de sub-especie (tipificación)

Variedades o tipos

Dominio: Archaea

Procariotas:Dominio Archaea

Pyrodictium Cenarchaecotum Methanobacterium Halocccus

Crenarchaeota Euryarchaeota

Hipertermofilas Mesofilas Metanogenas Hiperhalofila

Dominio: Bacteria

Procariotas: Dominio Bacterias

Caulobacter Rhizobium Neisseria Nitrosomonas

Phylum: Gram (–) Proteobacterias

Clase: α-proteobacteria β-proteobacteria

Procariotas: Dominio Bacterias

Legionella Pseudomonas Escherichia Vibrio

Phylum: Gram (–) Proteobacterias

Clase: γ-proteobacteria

Procariotas: Dominio Bacterias

Myxococcus Desulfovibrio Camphylobacter Helicobacter

Phylum: Gram (–) Proteobacterias

Clase: δ-proteobacteria ε-proteobacteria

Procariotas: Dominio Bacterias

Nostoc Prochloron Treponema Chlamydia

Phylum: Gram (-) No proteobacterias

Cyanobacterias Prochlorales Spirochetes Chamydiales

Procariotas: Dominio Bacterias

Bacillus Clostridium Streptococcus Mycoplasma

Phylum: Gram (+) con bajo porcentaje de G+C

Esporulados No –Esporulados

Procariotas: Dominio Bacterias

Mycobacterium Corynebacterium Streptomyces Frankia

Phylum: Gram (+) con alto porcentaje de G+C

No Filamentosos Filamentosos

Taxonomía bacteriana

CLÁSICA

• Caracteres fenotípicos (morfología, nutrición, etc.)

• Algunos genotípicos: % G+C, hibridación ADN-ADN

• Ponderación de caracteres (llaves dicotómicas)

Taxonomía polifásica DNA

RNATotalPorcentaje de G +CTamaño del genomaPatrones de restricciónHibridación del DNAParcialSecuención del DNASonda de DNAPerfiles basado en PCR

Marcadores químicosÁcidos grasos celularesÁcido micólicos Lípidos polaresComponentes de la pared celularPolisacáridos Perfiles de proteínas totales

Información Genotípica

Perfiles LMW RNASecuenciación RNA

Información Fenotípica

Caracteres Expresados Morfología

Fisiología (Api 20, 50 Biolog…)

Enzimología (APIZYM)

Serología(Vandamme et al., 1996)

Características fenotípicas clásicas de valor taxonómico

Morfología: Forma, tamaño y tinción

Nutrición y fisiología: Fotótrofo, quimiótrofo, aerobio o anaerobio, temperatura y pH óptimos, fuentes alternativas de C, N y S

Movilidad: Tipo y disposición de flagelos

Otros: Pigmentos, inclusiones celulares, sensibilidad a antibióticos, patogenicidad

Los Hongos

Amanita muscaria

Unicelulares o pluricelulares

¿Cuál es su habitat?• Suelo, agua, entre 4 y 60 ºC• Desde el nivel del mar hasta

4000 msnm• Algunos son endémicos• Cosmopolitas

Pared celular formada por

Componentes Grupo taxonómico

Características

Celulosa - glicogeno Acrasiales Pseudoplasmodios

Celulosa – glucanos Oomycetes Zoosporas biflageladas

Celulosa – quitina Hyfocritidiomicetes Zoosporas uniflageladas

Quitosina – quitina Zygomycetes Zygosporas

Quitina – glucanos Critidiomycetes Zoosporas uniflageladas

Quitina – glucanos Ascomicetes Ascosporas

Quitina – glucanos Basidiomicetes Basidiosporas

Quitina – glucanos Deuteromicetes Conidiosporas

Mananos – glucanos Saccharomycetaceae

Ascosporas

Mananos – quitina Sporobolomicetaceae

Levaduras con pigmentos

Poligalactosamina – galactano Trichomycetes Parásitos de artrópodos

Cuerpo o talo

•Son heterótrofos •Utilizan sus hifas para poder nutrirse•Absorción•Tienen una gran cantidad de enzimas•Usan tres vías

Hifa

Formas de vida

Saprobios

Esencialmente son descomponedores

Utilizan materia orgánicas en descomposición

Parásitos

Simbiontes

Estructuras fúngicas vegetativas

Herrera y Ulloa, 1998

Somáticas• Esporas

Clamidosporas

Teliosporas

Esporas

Estructuras fúngicas

Herrera y Ulloa, 1998

Luz

Nematodos

Insectos

Bacterias

Protozoarios

HongosAgua

nutrientes

Temperatura

pH

Espacio

Hongos

EcológicaEcológica

Agronómica

Alternaria citri

Alernaria solani

Cladosporium sp.

BioherbicidasBioherbicidas

Castt Castt ® ® ((Alternaria cassiaeAlternaria cassiae)) CollegoCollego ®® ((C. gloeosporioidesC. gloeosporioides))

Melolontha melolontha

Bioinsecticida (Beauveria bassiana) Betel Melocont

O

N O

N

O

O

O

O

N

O

O

O

BiofungicidaTrichoderma harzianum

O

O

OHCH3

OH

OH

O

HO CH3

O Beauvericina

Oosporeina

Penicillium notatum

CH3H3C

O

O

H

H

O

H3C

HH

H

HO

H

H

H

Aspergillus terreusAspergillus terreus

40 % de los antibióticos conocidos 40 % de los antibióticos conocidos han sido producidos por hongos han sido producidos por hongos filamentosos filamentosos

Bills y cols., 2000. Symposium on Tropical mycology. Bills y cols., 2000. Symposium on Tropical mycology. Dreyfus y Chapela, 1994 y Herrera y Ulloa, 1998.Dreyfus y Chapela, 1994 y Herrera y Ulloa, 1998.

Farmacéutica

SandozSandoz

NorvatisNorvatis

Astra-ZenicalAstra-Zenical

Wyeth-Wyeth-AyerstAyerst,,

Sankyo Co., Sankyo Co., Ltd Ltd

Pharmaceutical Pharmaceutical ProductsProducts TAP, TAP,

MerckMerck

J. Webster Labs J. Webster Labs MID-CON MID-CON

CompañíaCompañíaComercialComercial

Borel, 1976Borel, 1976Sandimmune®Sandimmune®InmunosupresorInmunosupresorTolypocladium Tolypocladium inflatuminflatum

Ciclosporina Ciclosporina

Williams, 1968Williams, 1968Bentley, 2000Bentley, 2000

Myfortic®Myfortic®Antiviral y Antiviral y AntitumoralAntitumoral

Penicillium Penicillium brevicompactum brevicompactum P. critrinumP. critrinum

Acido MicofenólicoAcido Micofenólico

Carswell, Carswell, et alet al., 2002., 2002Crestor®Crestor®AnticolesteremicoAnticolesteremicoPenicillium Penicillium brevicompactum brevicompactum P. critrinumP. critrinum

RosuvastatinaRosuvastatina

Lee, Lee, et al. et al. 19871987Giles, Giles, et al., et al., 20032003

Mylotarg®Mylotarg®anticancerígenoanticancerígenoMicromonospora Micromonospora Echinospora Echinospora spp.spp.

Gemtuzumab Gemtuzumab ozogamicinaozogamicina

Bellotti, 1985Bellotti, 1985Siccanin®Siccanin®AntidermatofiticoAntidermatofiticoHelminthosporium Helminthosporium siccanssiccans

SicaninaSicanina

Darkes y Plosker, 2003Darkes y Plosker, 2003SpectracefSpectracef ® ®Antibacteriano Antibacteriano amplio espectroamplio espectro

CephalosporiumCephalosporium acremoniumacremonium

Cefditoreno de Cefditoreno de pivoxilopivoxilo

Shu, 1998Shu, 1998Patchett, 2002Patchett, 2002

Mevacor®Mevacor®HipolipemianteHipolipemianteAspergillusAspergillus terreusterreusLovastatinaLovastatina

Molina, Molina, et al., et al., 20022002FumidilB®FumidilB®AntifúngicoAntifúngicoAspergillus Aspergillus fumigatusfumigatus

FumagilinaFumagilina

ReferenciaReferenciaPresentaciónPresentaciónComercialComercial

ActividadActividadFuenteFuenteMetabolitoMetabolito

Metabolitos fúngicos con aplicación farmacéutica

Raghukumar y cols., 2000. Mycol. Res. y Wase y Forster, 1997.

Biorremediación

Alimenticia

Médica

Trichiphyton rubrum

Mucor sp.