Clase aminocidos y prote­nas - Facultad de .DERIVADOS DE AMINOACIDOS ... Su pI es de 6.02 y se

download Clase aminocidos y prote­nas - Facultad de .DERIVADOS DE AMINOACIDOS ... Su pI es de 6.02 y se

of 27

  • date post

    10-Aug-2018
  • Category

    Documents

  • view

    213
  • download

    0

Embed Size (px)

Transcript of Clase aminocidos y prote­nas - Facultad de .DERIVADOS DE AMINOACIDOS ... Su pI es de 6.02 y se

  • 12/04/2012

    1

    AMINOACIDOS

    Aminocidos:

    Molculas orgnicas sencillas, que

    representan la unidad estructural de las

    protenas.

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    2

    FORMULA GENERAL

    tomo carbono

    grupo amino grupo carboxilo

    cadena lateral

    NH2 COOH

    R

    H

    C

    20 aa

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

    CLASIFICACION (Segn polaridad a pH 6~7)

    AA

    NO POLARES

    POLARES

    ALIFATICOS

    AROMATICOS

    SIN CARGA

    CON CARGA

    BASICOS

    ACIDOS

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    3

    AA no polares, con grupo R aliftico

    *

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

    AA no polares, con grupo R aromtico

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    4

    AA polares, con grupo R sin carga

    AA no polares, con grupo R aromtico

    Glicina?

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

    AA polares, con grupo R con carga positiva

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    5

    AA polares, con grupo R con carga negativa

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

    AMINOACIDOS NO PRESENTES EN PROTEINAS

    cido AminobutricoGABA

    (Neurotransmisor) Ornitina Citrulina

    (Intermediarios del C. de la Urea)

    Tiroxina

    (Hormona tiroidea)Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    6

    DERIVADOS DE AMINOACIDOS

    Adrenalina (Mediador celular)

    Histamina (Mediador respuesta inmune)

    Serotonina (Neurotransmisos)

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

    ACTIVIDAD OPTICA

    Excepcin

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    7

    ISOMEROS OPTICOS El tomo de carbono es asimtrico, lo cual permite la formacin de dos ismeros

    de imgenes especulares: D y L

    Solamente los ismeros L son constituyentes de las

    protenas

    L-alanina D-alanina

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

    PROPIEDADES ACIDO-BASE

    Carcter anftero

    Presentan en la misma

    molcula grupos

    cidos y bsicos

    Puede ceder protones,

    comportndose como cido

    COOH COO- + H+

    Puede captar H+ ,

    comportndose como

    base NH2 + H+

    NH3+

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    8

    Iones dipolares En disolucin, a pH

    neutro:

    Iones dipolares

    disociado

    protonado

    Estado de ionizacin

    depende del pH del medio

    ZWITTERION

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

    En sc cida fuerte.... In dipolar En sc alcalina

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    9

    Punto isoelctrico (PI)

    Valor de pH (caracterstico

    de cada aminocido) en el

    cual la disociacin de cargas

    positivas y negativas se

    iguala

    Carga neta = 0

    Clculo del PI pk1 + pk2 2

    PI =

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

    ejemplo, para alanina (R = CH3)

    pKa1 es 2.34 (grupo-COOH)

    pKa2 es 9.69(grupo NH3+)

    Su pI es de 6.02 y se calcula por el promedio de los pKa's.

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    10

    Titulacin cido-base de un aminocido

    Curva de TITULACION

    PI = pH = 6,02

    COO-

    | C |

    R

    -H NH3

    +- pk2

    pk2

    La siguiente figura ilustra la curva de titulacin de alanina:

    buffer

    buffer

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    11

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    12

    ELECTROFORESIS

    Tcnica que se utiliza

    para separar e

    identificar aminocidos

    y protenas

    Se basa en la propiedad

    que tienen las molculas

    de adquirir diferente

    carga elctrica segn el

    pH del medio en el cual

    se encuentran disueltas

    Movilidad depende de:

    -PM

    -q elctrica Ctedra de Bioqumica - FOUBA

    1. Se realiza sobre un soporte

    slido o semislido, para mini-

    mizar efectos de difusin

    Muestra

    + -

    2. Se somete el conjunto a

    un campo elctrico constante,

    a un pH fijo; las protenas migran

    conforme a su carga elctrica

    3. Terminada la corrida electro-

    fortica, las protenas se tien

    con un colorante adecuado

    (p.e., Azul de Coomassie)

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    13

    PROTEINAS

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

    Clasificacin

    Por su composicin:

    Simples (Holoprotenas):

    Formadas slo por aminocidos. Ej.: albmina,

    insulina, miosina, fibrina, histonas, etc.

    Conjugadas (Heteroprotenas):

    Formadas por aminocidos unidos a algn

    componente orgnico o inorgnico. Ej.:

    hemoglobina, mioglobina, casena, etc.

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    14

    Por su forma:

    Fibrosas:

    Son de forma alargada como filamentos. Ej.:

    colgeno, queratina, elastina, etc.

    Globulares:

    Son de forma redondeada y compacta. Ej.: enzimas,

    globulinas, albminas, etc.

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

    ALGUNAS FUNCIONES DE LAS PROTEINAS

    Estructurales

    Transportadoras

    Enzimas

    Hormonas y Neurotransmisores

    Proteccin

    Reserva de a

    Contrctiles

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    15

    Polmeros cuya unidad bsica estructural son los aminocidos.

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

    Compuestas por 20 aa

    Sus propiedades fsicas y qumicas

    dependen del plegamiento de la cadena

    de aa en el espacio

    Informacin precisa para estructura proteica en

    3D

    Secuencia de aa

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    16

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

    ENLACE PEPTDICO Aminocido Aminocido

    Cadena Polipeptdica

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    17

    El enlace peptdico tiene carcter de doble enlace y

    una rotacin restringida

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

    El enlace peptdico tiene una geometra plana

    slo existe libre rotacin

    en torno al C Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    18

    ESTRUCTURA DE LAS PROTEINAS

    estructura estructura estructura estructura

    primaria secundaria terciaria cuaternaria

    secuencia -hlice plegamiento ensamblaje de

    aminocidos tridimensional de subunidades

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

    Tipo, Nmero y

    Orden de a

    ESTRUCTURA PRIMARIA: corresponde a la secuencia de aminocidos de una

    protena, y es mantenida por los enlaces peptdicos

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    19

    ESTRUCTURA PRIMARIA

    -N de aa

    -Identidad del aa, tipo

    -Secuencia, posicin Ctedra de Bioqumica - FOUBA

    La restriccin en las rotaciones del enlace peptdico favorece

    algunas conformaciones de la cadena polipeptdica

    ESTRUCTURAS SECUNDARIAS

    -hlice lmina plegada

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    20

    ESTRUCTURA SECUNDARIA

    -hlice

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

    La -hlice se estabiliza a travs de puentes de

    Hidrgeno entre un grupo C=O del enlace peptdico

    y un grupo N-H situado 4 lugares ms adelante

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    21

    Hlice de 3,6 aa por vuelta, con

    los grupos R al exterior.

    Estabilizada por puentes de H

    entre C=O de una vuelta y N-H de la

    superior.

    Los puentes de H son paralelos al

    eje central de la hlice.

    Pro interrumpe. Gly aa con grupos

    grandes o cargados desestabilizan.

    Es la estructura principal en

    protenas fibrosas como la -

    queratina.

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

    La presencia de prolina interrumpe la -hlice

    Su C no puede rotar libremente

    C GRUPO CARBOXILO

    GRUPO AMINO

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    22

    Estas formas extendidas se asocian formando lminas

    ESTRUCTURA SECUNDARIA

    Estructura : es una forma extendida de la cadena

    polipeptdica

    N---C-----C----N----C-----C----N---C------C-----N---C-----C

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

    Las lminas se estabilizan por puentes de H entre los

    grupos C=O y N-H de enlaces peptdicos de cadenas

    diferentes

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    23

    Los grupos R se alternan arriba y abajo del plano de la

    lmina.

    Los enlaces se dan por

    puentes de hidrgeno entre

    dos cadenas diferentes.

    Las cadenas pueden ir en el

    mismo sentido o en sentido

    contrario.

    La estructura es ms

    estable con aminocidos con

    R pequeos.

    Se presenta en protenas

    fibrosas o dominios de

    protenas globulares en su

    ncleo. Ctedra de Bioqumica - FOUBA

    Diagrama de una protena (enzima) cuya estructura

    secundaria incluye hoja beta plegadas (azul) y alfa

    hlices (roja).

    Ctedra de Bioqumica - FOUBA

  • 12/04/2012

    24

    Corresponde a plegamientos tridimensionales.

    La protena se pliega sobre s misma.

    En su mantenim