Clase 4- Fuentes de Variacion
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Fuentes de Variación
Clase 4
Varianza
• Herencia se estudia midiendo los componentes de variación genética
• Variación determina similitud entre parientes
IDAF
GF
• Varianza puede partirse en componentes de variación
• VA está dada en desviaciones
• Varianza al cuadrado
VVVVV IDAF
2
222
2222222
2
22
422
pqV
qpqppqV
qppqpqqpV
A
A
A
n
iiiA p
1
22 2
• Igual ocurre con la varianza de dominancia: VD
• Entonces VG es
2
22222
2433242
2
24
48
pqdV
qpqpdqpV
qpqppqdV
D
D
D
22 22
0),cov(
,cov2
pqdpqV
DA
DAVVV
G
DAG
• Cuando se trabaja con más de un gene puede haber interacción por EpístasisEpístasis
),cov(2 21
1221
21GGVVV
IGGG
GGG
• Interacción puede ser por “breeding values”, desviaciones dominancia o ambos
DDADAAI VVVV
Ejemplo
• Falconer: Ejercicio 7.7. Gránulos de pigmento.– Gene brown y extreme
dilution
– Calcular VG, VA, VD y VI
(bb) = 0.4, (cece)= 0.2
B- Bb
C- 1.44 0.77 0.67
cece 0.94 0.77 0.17
0.50 0.00
Heredabilidad• La heredabilidad mide
importancia relativa de variación genética
• h2 : proporción fenotipo que se debe a genes heredados por padres
• H2 : proporción rasgo sujeto a factores genéticos. Determinación genética
F
G
F
A
V
VH
V
Vh
2
2
Varianza Ambiental
• Efectos no genéticos– Desarrollo– Pos-natales– Maternales– Microambientales
• Induce variación• Cambios por ambiente pueden ser drásticos
– Renacuajos salamandra carnívoras densidad– Cambios morfología cladóceros alimento
Variación Ambiental
• Efectos ambientales generales (E)– Experimentado por grupos individuos
• Falconer (Eg)
• Efectos ambientales especiales (e)– Variación individual
• Consecuencia microambiente y desarrollo• Desv esperado genético y E• Falconer (Es)
• Interacción Genotipo-Ambiente (I)– Respuesta no paralela de genotipos en diferentes
ambientes
0
2
0)()()(
,,,
,22222
EeeIeG
EGeEIGP
ijkG
ijkjijiijk
z
eEIEEE
eEIGz
Efectos Especiales
• Variación interna o desarrollo
• Variación microambiente
• Impredecible
• Se estima por cambios en ambiente o variación interna dentro del individuo
Variación dentro del Individuo (ew)
• Medir simetría o mediciones repetidas
• Forma más eficaz de estimar var ambiental
• Ruido en desarrollo– Var especial dentro– Var especial entre
222eaewe
Asimetría
• Direccional– Siempre un lado
• Antisimetría– Asimetría es norma– No direccional ni fluctuante– Cangrejos violinistas
• Asimetría Fluctuante– Cambios en diferentes lados– E(FA)=0, ~N(0,
FA)
Asimetría
N
im
iiw e
N
lreVar
1
2
)var(2
)()(
Repetibilidad
• Variabilidad entre medidas del mismo individuo
• Efecto ambiental– Error de medición
• Repetibilidad estimativa máxima de heredabilidad– Mejor es esto que nada
(Falconer) 1
(Falconer) )(
),cov(
)var()var(
)var()var(
21
21
rV
V
V
VVr
zszs
zzr
ez
ezr
P
Es
P
EgG
F
m
w
Semejanza entre parientes• Es característica de rasgos cuantitativos
• Provee estimado de varianza aditiva
• Componentes de VF se denominan
– “Componentes Causales” (letra V)
• Partición de varianza por diseño– “Componentes observacionales” (ó s2)
• Modelo de análisis de variancia:
zij = µ + αi + εij
• donde α es un efecto de grupo y ε un error residual• Modelo apropiado para grupos de parientes (progenies,
poblaciones),sin relación causal entre grupos
s2(z) = s2(α) + s2(ε) + cov(α,ε)
• donde s2(α) es la variancia de los efectos de grupo y s2(ε) la variancia de los efectos residuales
• Varianza entre y dentro de grupos:
s2(α) = 2B
s2(ε) = 2W
• Similitud en un grupo implica diferencia entre grupos
22
2
)(),cov(),cov(
),cov(),cov(),cov(),cov(
;cov),cov(
),cov(
Bjiikij
ikijijiikiji
ikiijiikij
ikiikijiij
B
zz
zz
zz
ww
• Varianza entre grupos puede ser estimada a partir de tabla de análisis de varianza (ANDEVA)
• Se puede interpretar como una covariancia entre valores del mismo grupo
• También se calcula la correlación intraclase (t)
22
2
22
2
)()(
)(
WB
B
ss
st
Ejemplo• Varianza entre pares de gemelos es ambiental ya
que no hay diferencias genéticas• La variancia entre pares de gemelos, o
covarianza entre gemelos, es por varianza genética
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Total
85.7 121.7 66.5 129.5 183.1 119.7 118.0 24.2 27.0 135.4
108.1 85.3 106.0 181.3 172.9 116.2 148.2 29.8 64.0 176.8
z 193.8 207.0 172.5 310.8 356.0 235.9 266.2 54.0 91.0 312.2 2199.40
z)2 568673.4
z2 289443.1
Gem
elo
2