Amino Acids, Peptides and Proteins تادٌتببلاو ةٌنٌملأا ...

of 28/28
الرابـــعفصل الداتة والببتنمض احما اAmino Acids, Peptides and Proteins نات البروتعدن وة تحوي مجموعة أم عضو أحماضة عامة هنمض احما اةنمض احما أبسط أنواع ان منس الكنممض الحا ا. وجد حوال كما300 سانن جسم احظ ف منها فقطة عشرونع الطب فن حامض أم. كلةنمض احما اamino acid α– نعدا البرول ما. ن لغرضر متأ بشكل غنممض الحااوي لمب الك التركمثل غالبا ماللكاربوكسن وام اد على مجموعت التأك. موجودةةنمض احمار أن ا غندروج وعند رقم ه الجسم الح سوابلنة ف بصورة متأ غالب بشكلpH=7.0 . لمجموعةلمجاورةربون الكا بذرة امتصلةن المطلق على مجموعة انمل بمجموعة الكاربوكس اα . ةنة البروتنمض احماع ا وبما أن جم الموقعكل منها فلعابدة لن امة تكون مجموعة الشابع اα . حماض تعرف با لذاة ألفانم ا( α .) ةنمض احما من اً نوعا عشرونوجد حوالα أنواعع جم فنات البروت. ً نات عامةلبروتة لساسة انابلف الوحدات البت ت وه. وبهذا فهةنة البروتنمض احما تدعى با. اويمب الكلترك لً وذلك تبعالى مجموعاتة انمض احما تقسم المجموعة لR نممض الحالكاربون ل بذرة ا المرتبطة. وضحلتالجدول ا واللمجموعةة لاومعة الكلطبعة طبقا للشابة انة البروتنمض احما انواع اR لكاربون بذرة امتصلة الα ةنمت المجموعا وتكون انممض الحا لندروج عند الرقم الهحال هو النة كماة متأللكاربوكس وا( 6 - 7 .) COO- + NH 3 R C H R C H COOH NH 2 ن متأن حامض أمنرمتأ غن حامض أمن متأةنمض احمالعامة لغة ا الص ذرة كاربون
  • date post

    16-Oct-2021
  • Category

    Documents

  • view

    1
  • download

    0

Embed Size (px)

Transcript of Amino Acids, Peptides and Proteins تادٌتببلاو ةٌنٌملأا ...



.
. 300
. –amino acid α

.
. pH=7.0

. α

(.α)
α
. .
.
. R
R
α
(.7-6)
COO-
+NH3


C CH2
N H
H2C C


.
(° 200 )
.() ( )
Essential Amino Acids

:
.
The Rare Amino Acids of
Proteins
Non-Protein Amino Acids


aminoacids -α :
1. β - : B5 Pantothenic .
: Amino butyric acid-4 - 4 .2
.
4-hydroxyproline

:

.
Optical Activity of Amino Acids

. LD .
: L D


.
(+) L
. (-)

The Acid- Base Properties of Amino Acids

- NH2 COOH-
.
Amphoteric
H2N CH2CH2 COOH H2N CH2CH2CH2 COOH
-Alanine -aminobutyric acid
COO-
+NH3

. Zwitter ion
(pH)
()
(Isoelectric Point pI) pI R
.
Titration of Amino Acids ()


.
pK Handerson- Hasselbalch-
pH
pH= pK +log [salt]/[acid] or base:
pH= pK + log 1/1
()
.

:
Cation
( )
Zwitter ion pKs pI
:
pI= pK1 + pK2/ 2
: ((9.7 pK2 (2.3) pK1
pI= 2.3 + 9.7 /2
pI= 6.0

pK
:
: pI
pI= 2.0 + 4.0/ 2
pI= 3
+H
NH3) +
Cation
C C

NH3 +
.
/
pI pK1=2.18 pK2=8.95 pK3=10.5.

Colour reaction with ninhydrin - 1

. NH3 CO2
.
CO2 . CO2
.
NH2 COOH
.
:Van Slyke (Nitros acid) - 2

.
. N2
2 . / N2 =
1-Fluoro-2,4-dinitrobenzene (FDNB)Sanger
. -α

.



.
Phenyl Iso Thoicanate ( Edman reagent ) PITC

. - α
.
COOH
NH2
Decarboxylation - 5

.
Deamination - 6

.

.
.deaminase
CH3 C
Disulfide Bond Formation - 7

Cysteine Cystine.
β-mercaptoethanol:
Peptides
.
α :
α
.
C-N

.Polypeptide

tripeptide
. tetrapeptide
amino acid residues
.
amino
terminal . carboxyl terminal
.
5000
. 40
.
O
O
C
CH2
SH
CH
NH2 COOH
.
ala-gly-cys : /
The peptide of physiological activity

:
Glutathione - 1
)
GSH (

.
SH
. GSH
peroxidase (GP) H2O2 .
GSSG GSH
:
ROOH + 2GSH GP GSSG + ROH + H2O
Oxytocine and Vasopressin - 2

. .

.
9

.
:
Antibiotics - 3
Gramicidin :

.Pencillin Tryocidin
Proteins
.
% 50
3000 permeable membrane
)
. (
-α- L Polymers
amino acid
. 40
Cys Trp Phe Glu
Cys Trp Ile Glu
:
%53
%7
%23
%16
%1


Photosynthesis .
.N2
Proteins functions
: Catalysis - 1
Biocatalysts
:
.
.
Keratin
Fibrein .
.

.
.
: Hormones- 4

:
.
:Protective agents() - 5
. antigens
Thrombin immunoglobulines Fibrinogen
:Storage proteins - 6
casein
Ferritin
.

.myocin actin
Proteins:
pH
albumin .
: Source for energy - 9
)
.(
:Proteins Classification
:
: - 1
.
: - 2
.ovalbumin casein
:
: Simple protein - 1

:
.ovalbumin
Fibrinogen.
: Scleroprotein -
.
: Histone -

.

Prosthetic group

: .
+ =

:


lipoprotein

dehydrogenase
:Fibrous proteins - 1
enzymes :
. : .
.
: .

.
:Globular Proteins - 2

: .
.
.Protamine Histones
:Structural of Proteins

.
:
:Primary structure - 1


.

.
: Secondary structure - 2

.

:
-α - α
Keratin

. 3.6 . 1
.°A 5.4 °A 1.5 . 2
.( R ) °6A . 3
H2N
. 4
H-H

.
α-α- helix
: β- pleated sheet -

.
.( ) Fibroin
(zig- zag)
β- configuration.
.

Parallel β- Pleated sheets
COOH
COOH
COOH
H2N
H2N
H2N
H2N
COOH
HOOC
HOOC
COOH
COOHH2N
H2N
NH2
NH2
. Anti parallel β- pleated sheets
. R
: Tertiary Structure - 3
R groups


:
.Ionic bonds . 3
.Vander waals force . 5
Parallel -Sheets Anti parallel -Sheets
:Quaternary Structure - 4


Protein subunits
Oligomer
:
. Subunit . 1
. . 2
. 3

)
.(
:


(-) (+)
. R

=pI
Isoelectric point .
pH
pH pH pI
(+)
pH pI
. (-)

pI . Pro OH-Pro
.

.
(.Casein )

:
. . 1
.( pH) . 2
. . 3
. . 4
:
)
Slating out (
.
:
MgSO4 NaCl MgCl2 - 1
. 2SO4(NH4)
CuSO4 ZnSO4 - 2

.
.H2SO4 HNO3 - 3
Picric ( ) - 4
acid Trichloroacetic acid .
(.pI) - 5
( ) - 6
.
. - 8
72 °100 6N(HCl) : . 1

.
( 8-4) °100 4N(NaOH) : - 2
. .
. : - 3
Pepsin
Trpsin
Arg-Lys :
)
(
.
:
.
E Proteose Peptone
E Dipeptide 2 Amino acid E
:
. - 1
. - 2
. - 3
. - 4
SH - 5
.
:
. - 1
. - 2
. (U.V) - 3
.SDS - 4
. - 5
SDS: Sodium Dodecyl Sulfate
()
.
pH
(pI) )+(
pH .
(-) pI
.
pI= pH