a-amylase ( boucharef & Abbad)

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République Algérienne démocratique et populaire Université Mentouri Constantine Département de Biochimie et de microbiologie M2 Analyse Protéomique et santé

description

structure, fonction ,dosage ,pathologies

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République Algérienne démocratique et populaire

Université Mentouri Constantine

Département de Biochimie et de microbiologie

M2 Analyse Protéomique et santé

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L'α-amylase

une enzyme digestive glycosidase

hydrolase

Fig 1: structure 3D d’une alpha amylase humaine

INTRODUCTION:

http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?pdbId=1HNY

Rôle de α-Amylase:

hydrolyser les polysaccharides ( coupent les liaisons α-1,4 à l'intérieur des chaînes d’amidon et du glycogène ).

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L'α-amylase

une enzyme digestive glycosidase

hydrolase

Fig 1: structure 3D d’une alpha amylase humaine

INTRODUCTION:

EC: ( 3.2.1.1) 50 k Da496 acides amines

Demie vie plasmatique très courte: 2 h

http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?enzyme+3.2.1.1

http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?pdbId=1HNY

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Structure :

domaine A

domaine B

domaine c

ion de calcium

ion de chlorure

site actif

Comportant le site récepteur

monomérique

métalloenzyme

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L'α-amylase

50% 40%

Des valeurs négligeables

Répartition tissulaire

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Les iso-amylases:

Gène: AMY2A

chromosome 1p21.

Gène: AMY1A

Les iso-amylases

α-amylase S α-amylase P

AMY1B

AMY1C

http://www.uniprot.org/uniprot/P04745

http://www.uniprot.org/uniprot/P04746

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Les iso-amylases:

Les iso-amylases

α-amylase S 1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase 1

amylopectine

Amylose :(α-D-glucopyranosyl(1→4)α-D-glucopyranoside)n.

dextrose

maltose

maltriose

pH Optimum: 5.6–6.9

( glandes salivaire ,larme , sueur,lait maternelle , liquide amniotique, poumons, testicules, trompes de Fallope )

inactives pour un pH<4.5

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http://www.uniprot.org/uniprot/P04746

Les iso-amylases:

Les iso-amylases

α-amylase P1,4-alpha-D-glucanglucanohydrolase

Dans le duodénum, l’amylase P hydrolyse l'amidon et le glycogène et leurs produits de dégradation pour les transformer en D-glucose.

pH optimal : 6.7 - 7

L’amylase P réalise la digestion en 10 min

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Le dosage de l‘a-amylase :

SUBSTRAT DIRECT SUBSTRAT EPS

CNPG3 : 2-chloro-4-nitrophenyl-α-D-maltotrioside

CNP : 2-chloro-4-nitrophenol

La concentration catalytique est déterminée à partir de la vitesse de formation du CNP, mesuré à 405 nm

Immuno-inhibition

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Le dosage de l‘a-amylase :

SUBSTRAT DIRECT SUBSTRAT EPS

Le réactif de l’αmylase utilise 4-nitrophényl-maltohéptaoside-éthylidène comme substrat.

C50H77NO38

http://brenda-enzymes.org/php/ligand_flatfile.php4?brenda_ligand_id=214280

L’utilisation de l’éthylidène évite la dissociation du substrat par les exo-enzymes, donc, en l’absence d’ a-amylase, aucun changement de couleur n’est observé. Le substrat est également appelé communément EPS.

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Le dosage de l‘a-amylase :

SUBSTRAT EPS

(E-pNP-G7) : 4-nitrophényl-maltohéptaoside-éthylidène

pNP : p-nitrophénol.

G : Glucose

https://www.thermo.com/eThermo/CMA/PDFs/Various/File_28648.pdf

L’activité enzymatique est déterminée à partir de la vitesse de formation du p-nitrophénol, mesurée à405 nm

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Le dosage de l‘a-amylase :

SUBSTRAT DIRECT SUBSTRAT EPS Immuno-inhibition

α-amylase P

l’électrophorèsela chromatographie échangeuse d’ions

les dosages radio-immunologiques

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Le dosage de l‘a-amylase :Immuno-inhibition

http://www.thermo.com/eThermo/CMA/PDFs/Various/File_28411.pdf

Anticorps monoclonal antihumain suffisant pour inhiber jusqu’à 3000 U/L d’amylase de type S à 37°C.

l’amylase de type S est inhibée par deux anticorps monoclonaux différents.

L’activité enzymatique est déterminée à partir de la vitesse de formation du p-nitrophénol, mesurée à405 nm

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Le dosage de l‘a-amylase :

Comment interpréter les résultats?

Amylasémie : 5 à 82 U/L à 37°

Chez l’adulte :entre 10 à 45 UI/l

le sujet sein 1,5<S/P<2

http://www.docteurclic.com/examen/amylasemie.aspx

Amylasurie < 370 UI /l à 24h si dosage à 37 °C

< 160 UI /l à 24h si dosage à 30°C

Cas affection salivaire S/P>2

Cas affection pancréatique S/p<1,5

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Variations physiologiques:

hypoamylasémie

Elle est souvent associée à un taux élevé de triglycérides sanguins

Nouveau-né Enfance (< 1 an) Couché versus. Obésité

hyperamylasémie

Le tabagisme peut être diminuer alpha-amylase car l’acide aldéhydique dans la fumée sont capables de modifier la fonction et / ou la structure de l'enzyme alpha-amylase.

Vieillesse(>80 ans), Chirurgie abdominale (10 % - 15 % des patients).

les médicaments opaciés tels que la morphine ou la codéine et aussi aspirine, diurétiques, corticostéroïdes, contraceptifs oraux, indométacine, l’alcool.

http://www.labtestsonline.fr/tests/Amylase.html?tab=5

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Variations pathologiques:

hyperamylasémie

Dosage : amylasémieamylasurieLipasémie

+ hyperamylasurie+ hyperlipasémie

affections pancréatiques :

-Pancréatite aiguë ++-Pancréatite chronique à poussée subaiguë-Cancer du pancréas- lithiase

Affections digestives autres que pancréatiques:

-Ulcère perforé dans le pancréas.-Cholécystite-Obstruction intestinale-Appendicite-péritonite-Infarctus d’intestin grêle.

En cas de perforation abdominale, d’occlusion, d’infarctus ou d’inflammation

Élévation modérée (> 3 N) due à une absorption des enzymes à travers la paroi digestive dont la perméabilité a augmenté.

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Variations pathologiques:

hyperamylasémie

Dosage : amylasémieamylasurieLipasémie

+ hyperamylasurie+ hyperlipasémie

+ hyperamylasurieSans hyperlipasémie

-Alcoolisme chronique-Affections salivaires-Cancer du poumon, de la prostate, de l’ovaire et du pancréas.

Sans hyperamylasurieni hyperlipasémie

- macroamylasémie- Insuffisance rénale

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Variations pathologiques:

hyperamylasémie

affections pancréatiques :

Pancréatite aiguë

Une maladie inflammatoire aiguë du pancréas de gravité variable conduisant à une autodigestion de la glande.Cet inflammation peut aller du simple œdème à la nécrose hémorragique.

L'inflammation peut être localisée au pancréas ou s'étendre vers des tissus voisins et être responsable de défaillances viscérales multiples.

+ hyperamylasurie+ hyperlipasémie

Les principales causes des pancréatites aiguës sont la LITHIASE BILIAIRE (50 à 60 %) et L’ALCOOL (30 à 40 %).

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Variations pathologiques:

hyperamylasémie

affections pancréatiques:

Pancréatite aiguë

+ hyperamylasurie+ hyperlipasémie

la lipase est le marqueur précoce et spécifique de la pancréatite aigue.

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Variations pathologiques:

- l’aspiration gastrique (en cas de vomissements répétés).

-la rééquilibration hydroélectrolytique et énergétique.

- le traitement de la douleur avec des antalgiques morphinique (Nubain®, chlorhydrate de morphine) ou non (paracétamol , procaïne).

Le traitement médical:

ce traitement repose sur les mesures de réanimation symptomatique comportant :

Pancréatite aiguë

hyperamylasémie

affections pancréatiques:

+ hyperamylasurie+ hyperlipasémie

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Variations pathologiques:

hyperamylasémie

+ hyperamylasurie+ hyperlipasémie

+ hyperamylasurieSans hyperlipasémie

Affections salivaires

Parotidite suppurative

Oreillons

Calcul dans les glandes salivaires

Inflammation des parotides qui finissent par suppuration .

Maladie infectieuse virale aigue, extrêmement contagieuse infectant la glande parotide due à un virus (Myxovirus parotidis), frappant essentiellement l’enfant et le jeune adulte caractérisée par une parotidite bilatérale.

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Variations pathologiques:

hyperamylasémie

+ hyperamylasurie+ hyperlipasémie

+ hyperamylasurieSans hyperlipasémie

Cancer du poumon

Les homologies de séquences nucléotidiques d'ADNc entre cet amylase carcinoïde et AMY1A, AMY2A sont 97,5% et 98,2%, respectivement. La comparaison de la séquence nucléotidique suggère fortement que cet amylase est le produit du gène AMY2B qui a été détecté dans le génome humain.

Un type de l'alpha-amylase a été détectée dans un tissu du poumon carcinoïdeAnalyse de la séquence nucléotidique a montré que l'amylase exprimée dans cette tumeur carcinoïde a 13 et 6 substitutions d'acides aminés par rapport à l'amylase salivaire (AMY1A) et l'amylase pancréatique (AMY2A), respectivement.

1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase 2B

http://www.uniprot.org/uniprot/P19961

http://www.uniprot.org/citations/2701942

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hyperamylasémie

+ hyperamylasurie+ hyperlipasémie

+ hyperamylasurieSans hyperlipasémie

Variations pathologiques:

Sans hyperamylasurieni hyperlipasémie

- macroamylasémie- Insuffisance rénale Macroamylasémie

macro-amylases dues à la formation de complexes sanguins entre l’amylase et des immunoglobulines (IgA, IgG) .ces complexes ne s’éliminant pas par le rein. Le diagnostic fait par une précipitation par le polyéthylène-glycol et peut aussi se faire par électrophorèse qui permet de typer la macro-amylase.

Le dosage de l’activité amylase dans l’urine et le calcul de la clairance de (amylase/créatinine ) permettent de soupçonner la présence d’une macroamylase.

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Insuffisance rénale

l’hyperamylasémie est liée à un déficit de la filtration glomérulaire donc l’amylasurieest diminuée.

hyperamylasémie

+ hyperamylasurie+ hyperlipasémie

+ hyperamylasurieSans hyperlipasémie

Sans hyperamylasurieni hyperlipasémie

- macroamylasémie- Insuffisance rénale

Variations pathologiques:

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hypoamylasémie

Tumeur maligne du pancréas en phase terminale.

Maladie hépatique sévère.

Insuffisance pancréatique, pancréatectomie.

Variations pathologiques:

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Acarbose est un produit naturel obtenu par la fermentation et structurellement

lié au substrat d'oligosaccharide d'amylase.

Les inhibiteurs d' a-amylase ont un potentiel thérapeutique pour le traitement de l'obésité et diabète (type П )

Et son agoniste Octapeptide linéaire

Inhibiteurs de l’amylase

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L’alpha amylase recombinant

le micro-organisme utilisé : Bacillus megaterium

le vecteur utilisé: plasmidique pUB110

utilisation: anti-inflammatoire, anti-œdémateux

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CONCLUSION

L’alpha amylase c’est une métalloenzyme monomérique sécrétée par le pancréas et les glandes salivaires qui permet la digestion des sucres lents (amidon et le glycogène )

Deux groupes d’isoenzymes existent chez l’homme : le type pancréatique (P) et le type salivaire (S).

Pour la détermination des iso amylases, on utilise la technique d’immuno-inhibition sélective

Une variation pathologique de l’alpha amylase s’observe lors d’affections des glandes salivaires, de même que lors d’affections pancréatiques.

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http://www.biolabo.fr/biolabo/pdfs/noticesFR/biochimieFR/99523%20FT%20Amylase%20CNPG3.pdf

http://www.jle.com/e-docs/00/02/4A/AF/article.phtml

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22391145

http://www.chu.ulg.ac.be/jcms/c_498422/amylase

http://www.labtestsonline.fr/tests/Amylase.html?tab=2

Références :